Result of FASTA (omim) for
pFN21AB5691
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5691, 860 aa
1>>>pF1KB5691 860 - 860 aa - 860 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2789+/-0.000442; mu= -3.0125+/- 0.028
mean_var=238.8043+/-47.805, 0's: 0 Z-trim(117.9): 28 B-trim: 0 in 0/57
Lambda= 0.082995
statistics sampled from 30319 (30344) to 30319 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.699), E-opt: 0.2 (0.356), width: 16
Scan time: 14.480
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001017977 (OMIM: 610494) DDB1- and CUL4-associa ( 860) 5765 704.1 6.8e-202
XP_016857270 (OMIM: 610494) PREDICTED: DDB1- and C ( 713) 4759 583.7 1.1e-165
XP_005245390 (OMIM: 610494) PREDICTED: DDB1- and C ( 874) 4536 557.0 1.4e-157
NP_060912 (OMIM: 610494) DDB1- and CUL4-associated ( 880) 3167 393.1 3e-108
XP_005245389 (OMIM: 610494) PREDICTED: DDB1- and C ( 894) 3167 393.1 3.1e-108
XP_005245388 (OMIM: 610494) PREDICTED: DDB1- and C ( 937) 3123 387.8 1.2e-106
NP_001185885 (OMIM: 610494) DDB1- and CUL4-associa ( 951) 3123 387.8 1.3e-106
XP_016857269 (OMIM: 610494) PREDICTED: DDB1- and C ( 733) 2682 335.0 7.9e-91
NP_001185886 (OMIM: 610494) DDB1- and CUL4-associa ( 920) 2548 319.0 6.5e-86
XP_016857268 (OMIM: 610494) PREDICTED: DDB1- and C ( 804) 2117 267.3 2e-70
NP_056541 (OMIM: 610100,615820) DDB1- and CUL4-ass ( 597) 461 69.0 7.5e-11
>>NP_001017977 (OMIM: 610494) DDB1- and CUL4-associated (860 aa)
initn: 5765 init1: 5765 opt: 5765 Z-score: 3745.7 bits: 704.1 E(85289): 6.8e-202
Smith-Waterman score: 5765; 99.9% identity (100.0% similar) in 860 aa overlap (1-860:1-860)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSDNNNEKLSPKPGTGEPVLSLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSDNNNEKLSPKPGTGEPVLSLH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 YSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFVPQSSVQPPEGDSETKAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFVPQSSVQPPEGDSETKAP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 EESSEDATKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGERNDLNLDRSCGVPEESA
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EESSEDVTKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGERNDLNLDRSCGVPEESA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 SSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEETSTRDSALQDTDDSDDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEETSTRDSALQDTDDSDDD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 PVLIPGARYRAGPGDRRSAVARIQEFFRRRKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PVLIPGARYRAGPGDRRSAVARIQEFFRRRKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 TMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB5 IDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRAD
790 800 810 820 830 840
850 860
pF1KB5 RLEGDRSEGSGQENENEDEE
::::::::::::::::::::
NP_001 RLEGDRSEGSGQENENEDEE
850 860
>>XP_016857270 (OMIM: 610494) PREDICTED: DDB1- and CUL4- (713 aa)
initn: 4759 init1: 4759 opt: 4759 Z-score: 3095.9 bits: 583.7 E(85289): 1.1e-165
Smith-Waterman score: 4759; 99.9% identity (100.0% similar) in 713 aa overlap (148-860:1-713)
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 GVIFYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSC
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSC
10 20 30
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 TKEDCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TKEDCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGT
40 50 60 70 80 90
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 TGMVARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TGMVARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEE
100 110 120 130 140 150
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 RREELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RREELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEAS
160 170 180 190 200 210
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 EVAQSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EVAQSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTM
220 230 240 250 260 270
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 SAQAHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSDNNNEKLSPKPGTGEPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SAQAHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSDNNNEKLSPKPGTGEPVL
280 290 300 310 320 330
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 SLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFVPQSSVQPPEGDSET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFVPQSSVQPPEGDSET
340 350 360 370 380 390
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 KAPEESSEDATKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGERNDLNLDRSCGVPE
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KAPEESSEDVTKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGERNDLNLDRSCGVPE
400 410 420 430 440 450
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 ESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEETSTRDSALQDTDDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEETSTRDSALQDTDDS
460 470 480 490 500 510
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 DDDPVLIPGARYRAGPGDRRSAVARIQEFFRRRKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DDDPVLIPGARYRAGPGDRRSAVARIQEFFRRRKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHR
520 530 540 550 560 570
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 NSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILA
580 590 600 610 620 630
780 790 800 810 820 830
pF1KB5 SSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHI
640 650 660 670 680 690
840 850 860
pF1KB5 RADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
:::::::::::::::::::::::
XP_016 RADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
700 710
>>XP_005245390 (OMIM: 610494) PREDICTED: DDB1- and CUL4- (874 aa)
initn: 4563 init1: 4535 opt: 4536 Z-score: 2950.3 bits: 557.0 E(85289): 1.4e-157
Smith-Waterman score: 5727; 98.3% identity (98.4% similar) in 874 aa overlap (1-860:1-874)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSDNNNEKLSPKPGTGEPVLSLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSDNNNEKLSPKPGTGEPVLSLH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 YSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFVPQSSVQPPEGDSETKAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFVPQSSVQPPEGDSETKAP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 EESSEDATKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGERNDLNLDRSCGVPEESA
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EESSEDVTKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGERNDLNLDRSCGVPEESA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 SSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEETSTRDSALQDTDDSDDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEETSTRDSALQDTDDSDDD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KB5 PVLIPGARYRAGPGDR--------------RSAVARIQEFFRRRKERKEMEELDTLNIRR
:::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PVLIPGARYRAGPGDRFNIRGTTIGDRIMRRSAVARIQEFFRRRKERKEMEELDTLNIRR
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 PLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLLEADNHVVNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLLEADNHVVNC
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810 820
pF1KB5 LQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASF
790 800 810 820 830 840
830 840 850 860
pF1KB5 MLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
850 860 870
>>NP_060912 (OMIM: 610494) DDB1- and CUL4-associated fac (880 aa)
initn: 3161 init1: 3126 opt: 3167 Z-score: 2064.3 bits: 393.1 E(85289): 3e-108
Smith-Waterman score: 5715; 97.6% identity (97.7% similar) in 880 aa overlap (1-860:1-880)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KB5 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSD--------------------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSDSPSSVVNKQLGSMSLDEQQD
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_060 TVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEE
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650 660 670 680 690 700
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_005 ASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
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::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGD
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:::::::::::::::
XP_005 RSEGSGQENENEDEE
930
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_001 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSEFLRGPEIALLRKRLQQLRLK
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pF1KB5 --------------------------------------------------------DNNN
::::
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pF1KB5 EKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFV
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pF1KB5 PQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDATKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGE
:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDVTKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGE
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pF1KB5 RNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEE
670 680 690 700 710 720
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pF1KB5 TSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDR--------------RSAVARIQEFFRR
::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
NP_001 TSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDRFNIRGTTIGDRIMRRSAVARIQEFFRR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRH
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pF1KB5 TAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRN
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pF1KB5 ELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
NP_001 ELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
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>--
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pF1KB5 FDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRML
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRML
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pF1KB5 ASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
:::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
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Smith-Waterman score: 4709; 97.1% identity (97.3% similar) in 733 aa overlap (148-860:1-733)
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 GVIFYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSC
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSC
10 20 30
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 TKEDCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TKEDCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGT
40 50 60 70 80 90
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 TGMVARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TGMVARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEE
100 110 120 130 140 150
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 RREELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RREELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEAS
160 170 180 190 200 210
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 EVAQSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EVAQSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTM
220 230 240 250 260 270
420 430 440 450 460
pF1KB5 SAQAHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSD-----------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SAQAHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSDSPSSVVNKQLGSMSLDE
280 290 300 310 320 330
470 480 490 500 510
pF1KB5 ---NNNEKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QQDNNNEKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEG
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 QEESFVPQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDATKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPL
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QEESFVPQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDVTKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPL
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 DSNSGERNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DSNSGERNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATG
460 470 480 490 500 510
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 PSAHEETSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDRRSAVARIQEFFRRRKERKEME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PSAHEETSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDRRSAVARIQEFFRRRKERKEME
520 530 540 550 560 570
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pF1KB5 ELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLL
580 590 600 610 620 630
760 770 780 790 800 810
pF1KB5 EADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETR
640 650 660 670 680 690
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pF1KB5 NTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
700 710 720 730
>>NP_001185886 (OMIM: 610494) DDB1- and CUL4-associated (920 aa)
initn: 3798 init1: 2540 opt: 2548 Z-score: 1663.5 bits: 319.0 E(85289): 6.5e-86
Smith-Waterman score: 4911; 86.2% identity (86.3% similar) in 892 aa overlap (1-801:1-861)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCV------
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 -------------------------LTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
60 70 80
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pF1KB5 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
330 340 350 360 370 380
430 440 450
pF1KB5 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQS---------------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSEFLRGPEIALLRKRLQQLRLK
390 400 410 420 430 440
460
pF1KB5 --------------------------------------------------------DNNN
::::
NP_001 KAEQQRQQELAAHTQQQPSTSDQSSHEGSSQDPHASDSPSSVVNKQLGSMSLDEQQDNNN
450 460 470 480 490 500
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 EKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFV
510 520 530 540 550 560
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 PQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDATKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGE
:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDVTKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGE
570 580 590 600 610 620
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 RNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEE
630 640 650 660 670 680
650 660 670 680
pF1KB5 TSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDR--------------RSAVARIQEFFRR
::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
NP_001 TSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDRFNIRGTTIGDRIMRRSAVARIQEFFRR
690 700 710 720 730 740
690 700 710 720 730 740
pF1KB5 RKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRH
750 760 770 780 790 800
750 760 770 780 790 800
pF1KB5 TAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRN
810 820 830 840 850 860
810 820 830 840 850 860
pF1KB5 ELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
NP_001 ELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
870 880 890 900 910 920
>--
initn: 370 init1: 370 opt: 370 Z-score: 254.0 bits: 58.2 E(85289): 2.1e-07
Smith-Waterman score: 370; 100.0% identity (100.0% similar) in 59 aa overlap (802-860:862-920)
780 790 800 810 820 830
pF1KB5 FDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRML
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRML
840 850 860 870 880 890
840 850 860
pF1KB5 ASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
:::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
900 910 920
>>XP_016857268 (OMIM: 610494) PREDICTED: DDB1- and CUL4- (804 aa)
initn: 3367 init1: 2109 opt: 2117 Z-score: 1385.4 bits: 267.3 E(85289): 2e-70
Smith-Waterman score: 4187; 87.7% identity (87.8% similar) in 745 aa overlap (148-801:1-745)
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 GVIFYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSC
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSC
10 20 30
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 TKEDCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TKEDCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGT
40 50 60 70 80 90
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 TGMVARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TGMVARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEE
100 110 120 130 140 150
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 RREELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RREELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEAS
160 170 180 190 200 210
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 EVAQSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EVAQSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTM
220 230 240 250 260 270
420 430 440 450
pF1KB5 SAQAHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQS------------------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SAQAHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSEFLRGPEIALLRKRLQQL
280 290 300 310 320 330
460
pF1KB5 -----------------------------------------------------------D
:
XP_016 RLKKAEQQRQQELAAHTQQQPSTSDQSSHEGSSQDPHASDSPSSVVNKQLGSMSLDEQQD
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 NNNEKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NNNEKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEE
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 SFVPQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDATKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSN
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SFVPQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDVTKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSN
460 470 480 490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 SGERNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SGERNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSA
520 530 540 550 560 570
650 660 670 680
pF1KB5 HEETSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDR--------------RSAVARIQEF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
XP_016 HEETSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDRFNIRGTTIGDRIMRRSAVARIQEF
580 590 600 610 620 630
690 700 710 720 730 740
pF1KB5 FRRRKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FRRRKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIW
640 650 660 670 680 690
750 760 770 780 790 800
pF1KB5 DRHTAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DRHTAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVI
700 710 720 730 740 750
810 820 830 840 850 860
pF1KB5 TRNELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
XP_016 TRNELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
760 770 780 790 800
>--
initn: 370 init1: 370 opt: 370 Z-score: 254.9 bits: 58.2 E(85289): 1.8e-07
Smith-Waterman score: 370; 100.0% identity (100.0% similar) in 59 aa overlap (802-860:746-804)
780 790 800 810 820 830
pF1KB5 FDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRML
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRML
720 730 740 750 760 770
840 850 860
pF1KB5 ASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
:::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
780 790 800
860 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 18:00:50 2016 done: Thu Nov 3 18:00:52 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]