Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5591
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5591, 926 aa
1>>>pF1KB5591 926 - 926 aa - 926 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1974+/-0.000974; mu= 16.4600+/- 0.059
mean_var=78.5170+/-16.044, 0's: 0 Z-trim(105.6): 131 B-trim: 23 in 2/49
Lambda= 0.144741
statistics sampled from 8355 (8489) to 8355 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.62), E-opt: 0.2 (0.261), width: 16
Scan time: 3.780
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46496.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 926) 6426 1352.1 0
CCDS2364.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 931) 6406 1347.9 0
CCDS46498.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 901) 5631 1186.1 0
CCDS2365.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 906) 5631 1186.1 0
CCDS46497.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 909) 5631 1186.1 0
CCDS46499.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 555) 3791 801.8 0
CCDS7177.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 923) 2429 517.4 4.8e-146
CCDS31179.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 609) 2193 468.1 2.3e-131
CCDS81448.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 906) 2190 467.5 5e-131
CCDS31180.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 644) 2180 465.4 1.6e-130
CCDS58460.1 NETO2 gene_id:81831|Hs108|chr16 ( 518) 459 106.0 2e-22
CCDS44026.1 F8 gene_id:2157|Hs108|chrX ( 216) 438 101.5 1.9e-21
CCDS35457.1 F8 gene_id:2157|Hs108|chrX (2351) 438 101.8 1.6e-20
CCDS7113.1 CUBN gene_id:8029|Hs108|chr10 (3623) 438 101.9 2.4e-20
CCDS1281.1 F5 gene_id:2153|Hs108|chr1 (2224) 404 94.7 2.1e-18
CCDS7449.1 TLL2 gene_id:7093|Hs108|chr10 (1015) 381 89.8 2.9e-17
CCDS588.2 CDCP2 gene_id:200008|Hs108|chr1 ( 449) 370 87.4 6.8e-17
CCDS3811.1 TLL1 gene_id:7092|Hs108|chr4 (1013) 375 88.5 6.9e-17
CCDS64195.1 EDIL3 gene_id:10085|Hs108|chr5 ( 470) 361 85.5 2.6e-16
CCDS4062.1 EDIL3 gene_id:10085|Hs108|chr5 ( 480) 361 85.5 2.7e-16
CCDS46878.1 DCBLD2 gene_id:131566|Hs108|chr3 ( 775) 357 84.7 7.3e-16
CCDS34856.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 ( 730) 348 82.8 2.5e-15
CCDS6026.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 ( 986) 348 82.9 3.3e-15
CCDS81918.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15 ( 343) 341 81.3 3.6e-15
CCDS10347.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15 ( 387) 341 81.3 4e-15
CCDS12000.1 NETO1 gene_id:81832|Hs108|chr18 ( 533) 326 78.2 4.6e-14
CCDS10727.1 NETO2 gene_id:81831|Hs108|chr16 ( 525) 321 77.2 9.4e-14
CCDS5476.1 AEBP1 gene_id:165|Hs108|chr7 (1158) 324 77.9 1.2e-13
CCDS1241.1 DDR2 gene_id:4921|Hs108|chr1 ( 855) 322 77.4 1.3e-13
CCDS42444.1 NETO1 gene_id:81832|Hs108|chr18 ( 156) 306 73.8 2.8e-13
CCDS34522.1 DCBLD1 gene_id:285761|Hs108|chr6 ( 539) 311 75.1 4.1e-13
CCDS5700.1 PCOLCE gene_id:5118|Hs108|chr7 ( 449) 308 74.4 5.4e-13
CCDS14187.1 RS1 gene_id:6247|Hs108|chrX ( 224) 303 73.3 5.9e-13
CCDS73251.1 OVCH2 gene_id:341277|Hs108|chr11 ( 565) 308 74.4 6.6e-13
CCDS7637.1 CPXM2 gene_id:119587|Hs108|chr10 ( 756) 305 73.9 1.3e-12
CCDS55189.1 CSMD1 gene_id:64478|Hs108|chr8 (3564) 310 75.1 2.6e-12
CCDS7631.1 CUZD1 gene_id:50624|Hs108|chr10 ( 607) 298 72.4 3e-12
CCDS75419.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 767) 292 71.2 8.8e-12
CCDS4690.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 876) 292 71.2 9.9e-12
CCDS56411.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 894) 292 71.2 1e-11
CCDS34385.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 913) 292 71.2 1e-11
CCDS47396.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 919) 292 71.2 1e-11
CCDS380.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1 (3487) 294 71.8 2.6e-11
CCDS60082.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1 (3631) 294 71.8 2.7e-11
CCDS13033.1 CPXM1 gene_id:56265|Hs108|chr20 ( 734) 276 67.8 8.6e-11
>>CCDS46496.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 (926 aa)
initn: 6426 init1: 6426 opt: 6426 Z-score: 7246.1 bits: 1352.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6426; 100.0% identity (100.0% similar) in 926 aa overlap (1-926:1-926)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDMFPLTWVFLALYFSRHQVRGQPDPPCGGRLNSKDAGYITSPGYPQDYPSHQNCEWIVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MDMFPLTWVFLALYFSRHQVRGQPDPPCGGRLNSKDAGYITSPGYPQDYPSHQNCEWIVY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 APEPNQKIVLNFNPHFEIEKHDCKYDFIEIRDGDSESADLLGKHCGNIAPPTIISSGSML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 APEPNQKIVLNFNPHFEIEKHDCKYDFIEIRDGDSESADLLGKHCGNIAPPTIISSGSML
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 YIKFTSDYARQGAGFSLRYEIFKTGSEDCSKNFTSPNGTIESPGFPEKYPHNLDCTFTIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YIKFTSDYARQGAGFSLRYEIFKTGSEDCSKNFTSPNGTIESPGFPEKYPHNLDCTFTIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 AKPKMEIILQFLIFDLEHDPLQVGEGDCKYDWLDIWDGIPHVGPLIGKYCGTKTPSELRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AKPKMEIILQFLIFDLEHDPLQVGEGDCKYDWLDIWDGIPHVGPLIGKYCGTKTPSELRS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 STGILSLTFHTDMAVAKDGFSARYYLVHQEPLENFQCNVPLGMESGRIANEQISASSTYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 STGILSLTFHTDMAVAKDGFSARYYLVHQEPLENFQCNVPLGMESGRIANEQISASSTYS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DGRWTPQQSRLHGDDNGWTPNLDSNKEYLQVDLRFLTMLTAIATQGAISRETQNGYYVKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DGRWTPQQSRLHGDDNGWTPNLDSNKEYLQVDLRFLTMLTAIATQGAISRETQNGYYVKS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 YKLEVSTNGEDWMVYRHGKNHKVFQANNDATEVVLNKLHAPLLTRFVRIRPQTWHSGIAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YKLEVSTNGEDWMVYRHGKNHKVFQANNDATEVVLNKLHAPLLTRFVRIRPQTWHSGIAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 RLELFGCRVTDAPCSNMLGMLSGLIADSQISASSTQEYLWSPSAARLVSSRSGWFPRIPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RLELFGCRVTDAPCSNMLGMLSGLIADSQISASSTQEYLWSPSAARLVSSRSGWFPRIPQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 AQPGEEWLQVDLGTPKTVKGVIIQGARGGDSITAVEARAFVRKFKVSYSLNGKDWEYIQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AQPGEEWLQVDLGTPKTVKGVIIQGARGGDSITAVEARAFVRKFKVSYSLNGKDWEYIQD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 PRTQQPKLFEGNMHYDTPDIRRFDPIPAQYVRVYPERWSPAGIGMRLEVLGCDWTDSKPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PRTQQPKLFEGNMHYDTPDIRRFDPIPAQYVRVYPERWSPAGIGMRLEVLGCDWTDSKPT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 VETLGPTVKSEETTTPYPTEEEATECGENCSFEDDKDLQLPSGFNCNFDFLEEPCGWMYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VETLGPTVKSEETTTPYPTEEEATECGENCSFEDDKDLQLPSGFNCNFDFLEEPCGWMYD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 HAKWLRTTWASSSSPNDRTFPDDRNFLRLQSDSQREGQYARLISPPVHLPRSPVCMEFQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HAKWLRTTWASSSSPNDRTFPDDRNFLRLQSDSQREGQYARLISPPVHLPRSPVCMEFQY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 QATGGRGVALQVVREASQESKLLWVIREDQGGEWKHGRIILPSYDMEYQIVFEGVIGKGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QATGGRGVALQVVREASQESKLLWVIREDQGGEWKHGRIILPSYDMEYQIVFEGVIGKGR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB5 SGEIAIDDIRISTDVPLENCMEPISAFAVDIPEIHEREGYEDEIDDEYEVDWSNSSSATS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SGEIAIDDIRISTDVPLENCMEPISAFAVDIPEIHEREGYEDEIDDEYEVDWSNSSSATS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB5 GSGAPSTDKEKSWLYTLDPILITIIAMSSLGVLLGATCAGLLLYCTCSYSGLSSRSCTTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GSGAPSTDKEKSWLYTLDPILITIIAMSSLGVLLGATCAGLLLYCTCSYSGLSSRSCTTL
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KB5 ENYNFELYDGLKHKVKMNHQKCCSEA
::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ENYNFELYDGLKHKVKMNHQKCCSEA
910 920
>>CCDS2364.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 (931 aa)
initn: 5631 init1: 5631 opt: 6406 Z-score: 7223.5 bits: 1347.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6406; 99.5% identity (99.5% similar) in 931 aa overlap (1-926:1-931)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDMFPLTWVFLALYFSRHQVRGQPDPPCGGRLNSKDAGYITSPGYPQDYPSHQNCEWIVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 MDMFPLTWVFLALYFSRHQVRGQPDPPCGGRLNSKDAGYITSPGYPQDYPSHQNCEWIVY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 APEPNQKIVLNFNPHFEIEKHDCKYDFIEIRDGDSESADLLGKHCGNIAPPTIISSGSML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 APEPNQKIVLNFNPHFEIEKHDCKYDFIEIRDGDSESADLLGKHCGNIAPPTIISSGSML
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 YIKFTSDYARQGAGFSLRYEIFKTGSEDCSKNFTSPNGTIESPGFPEKYPHNLDCTFTIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 YIKFTSDYARQGAGFSLRYEIFKTGSEDCSKNFTSPNGTIESPGFPEKYPHNLDCTFTIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 AKPKMEIILQFLIFDLEHDPLQVGEGDCKYDWLDIWDGIPHVGPLIGKYCGTKTPSELRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 AKPKMEIILQFLIFDLEHDPLQVGEGDCKYDWLDIWDGIPHVGPLIGKYCGTKTPSELRS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 STGILSLTFHTDMAVAKDGFSARYYLVHQEPLENFQCNVPLGMESGRIANEQISASSTYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 STGILSLTFHTDMAVAKDGFSARYYLVHQEPLENFQCNVPLGMESGRIANEQISASSTYS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DGRWTPQQSRLHGDDNGWTPNLDSNKEYLQVDLRFLTMLTAIATQGAISRETQNGYYVKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 DGRWTPQQSRLHGDDNGWTPNLDSNKEYLQVDLRFLTMLTAIATQGAISRETQNGYYVKS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 YKLEVSTNGEDWMVYRHGKNHKVFQANNDATEVVLNKLHAPLLTRFVRIRPQTWHSGIAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 YKLEVSTNGEDWMVYRHGKNHKVFQANNDATEVVLNKLHAPLLTRFVRIRPQTWHSGIAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 RLELFGCRVTDAPCSNMLGMLSGLIADSQISASSTQEYLWSPSAARLVSSRSGWFPRIPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 RLELFGCRVTDAPCSNMLGMLSGLIADSQISASSTQEYLWSPSAARLVSSRSGWFPRIPQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 AQPGEEWLQVDLGTPKTVKGVIIQGARGGDSITAVEARAFVRKFKVSYSLNGKDWEYIQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 AQPGEEWLQVDLGTPKTVKGVIIQGARGGDSITAVEARAFVRKFKVSYSLNGKDWEYIQD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 PRTQQPKLFEGNMHYDTPDIRRFDPIPAQYVRVYPERWSPAGIGMRLEVLGCDWTDSKPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 PRTQQPKLFEGNMHYDTPDIRRFDPIPAQYVRVYPERWSPAGIGMRLEVLGCDWTDSKPT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 VETLGPTVKSEETTTPYPTEEEATECGENCSFEDDKDLQLPSGFNCNFDFLEEPCGWMYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 VETLGPTVKSEETTTPYPTEEEATECGENCSFEDDKDLQLPSGFNCNFDFLEEPCGWMYD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 HAKWLRTTWASSSSPNDRTFPDDRNFLRLQSDSQREGQYARLISPPVHLPRSPVCMEFQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 HAKWLRTTWASSSSPNDRTFPDDRNFLRLQSDSQREGQYARLISPPVHLPRSPVCMEFQY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 QATGGRGVALQVVREASQESKLLWVIREDQGGEWKHGRIILPSYDMEYQIVFEGVIGKGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 QATGGRGVALQVVREASQESKLLWVIREDQGGEWKHGRIILPSYDMEYQIVFEGVIGKGR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KB5 SGEIAIDDIRISTDVPLENCMEPISAFA-----VDIPEIHEREGYEDEIDDEYEVDWSNS
:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 SGEIAIDDIRISTDVPLENCMEPISAFAGENFKVDIPEIHEREGYEDEIDDEYEVDWSNS
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KB5 SSATSGSGAPSTDKEKSWLYTLDPILITIIAMSSLGVLLGATCAGLLLYCTCSYSGLSSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 SSATSGSGAPSTDKEKSWLYTLDPILITIIAMSSLGVLLGATCAGLLLYCTCSYSGLSSR
850 860 870 880 890 900
900 910 920
pF1KB5 SCTTLENYNFELYDGLKHKVKMNHQKCCSEA
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 SCTTLENYNFELYDGLKHKVKMNHQKCCSEA
910 920 930
>>CCDS46498.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 (901 aa)
initn: 5631 init1: 5631 opt: 5631 Z-score: 6349.1 bits: 1186.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5631; 100.0% identity (100.0% similar) in 808 aa overlap (1-808:1-808)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDMFPLTWVFLALYFSRHQVRGQPDPPCGGRLNSKDAGYITSPGYPQDYPSHQNCEWIVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MDMFPLTWVFLALYFSRHQVRGQPDPPCGGRLNSKDAGYITSPGYPQDYPSHQNCEWIVY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 APEPNQKIVLNFNPHFEIEKHDCKYDFIEIRDGDSESADLLGKHCGNIAPPTIISSGSML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 APEPNQKIVLNFNPHFEIEKHDCKYDFIEIRDGDSESADLLGKHCGNIAPPTIISSGSML
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 YIKFTSDYARQGAGFSLRYEIFKTGSEDCSKNFTSPNGTIESPGFPEKYPHNLDCTFTIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YIKFTSDYARQGAGFSLRYEIFKTGSEDCSKNFTSPNGTIESPGFPEKYPHNLDCTFTIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 AKPKMEIILQFLIFDLEHDPLQVGEGDCKYDWLDIWDGIPHVGPLIGKYCGTKTPSELRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AKPKMEIILQFLIFDLEHDPLQVGEGDCKYDWLDIWDGIPHVGPLIGKYCGTKTPSELRS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 STGILSLTFHTDMAVAKDGFSARYYLVHQEPLENFQCNVPLGMESGRIANEQISASSTYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 STGILSLTFHTDMAVAKDGFSARYYLVHQEPLENFQCNVPLGMESGRIANEQISASSTYS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DGRWTPQQSRLHGDDNGWTPNLDSNKEYLQVDLRFLTMLTAIATQGAISRETQNGYYVKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DGRWTPQQSRLHGDDNGWTPNLDSNKEYLQVDLRFLTMLTAIATQGAISRETQNGYYVKS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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CCDS46 GSGAPSTDKEKSWLYTLDPILITIIAMSSLGVLLGATCAGLLLYCTCSYSGLSSRSCTTL
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::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ENYNFELYDGLKHKVKMNHQKCCSEA
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CCDS46 APEPNQKIVLNFNPHFEIEKHDCKYDFIEIRDGDSESADLLGKHCGNIAPPTIISSGSML
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CCDS46 AKPKMEIILQFLIFDLEHDPLQVGEGDCKYDWLDIWDGIPHVGPLIGKYCGTKTPSELRS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 STGILSLTFHTDMAVAKDGFSARYYLVHQEPLENFQCNVPLGMESGRIANEQISASSTYS
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pF1KB5 YKLEVSTNGEDWMVYRHGKNHKVFQANNDATEVVLNKLHAPLLTRFVRIRPQTWHSGIAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YKLEVSTNGEDWMVYRHGKNHKVFQANNDATEVVLNKLHAPLLTRFVRIRPQTWHSGIAL
370 380 390 400 410 420
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pF1KB5 RLELFGCRVTDAPCSNMLGMLSGLIADSQISASSTQEYLWSPSAARLVSSRSGWFPRIPQ
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CCDS46 RLELFGCRVTDAPCSNMLGMLSGLIADSQISASSTQEYLWSPSAARLVSSRSGWFPRIPQ
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pF1KB5 AQPGEEWLQVDLGTPKTVKGVIIQGARGGDSITAVEARAFVRKFKVSYSLNGKDWEYIQD
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CCDS46 AQPGEEWLQVDLGTPKTVKGVIIQGARGGDSITAVEARAFVRKFKVSYSLNGKDWEYIQD
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CCDS46 PRTQQPKVGCSWRPL
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pF1KB5 MDMFPLTWVFLALYFSRHQVRGQPDPPCGGRLNSKDAGYITSPGYPQDYPSHQNCEWIVY
:: .. .. ::.::::::..: ..:::..
CCDS71 MERGLPLLCAVLALVLAPAGAFRNDKCGDTIKIESPGYLTSPGYPHSYHPSEKCEWLIQ
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pF1KB5 APEPNQKIVLNFNPHFEIEKHDCKYDFIEIRDGDSESADLLGKHCGNIAPPTIISSGSML
::.: :.:..::::::..: .:::::..:. ::..:.. . :: ::.:::: ..::: .:
CCDS71 APDPYQRIMINFNPHFDLEDRDCKYDYVEVFDGENENGHFRGKFCGKIAPPPVVSSGPFL
60 70 80 90 100 110
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pF1KB5 YIKFTSDYARQGAGFSLRYEIFKTGSEDCSKNFTSPNGTIESPGFPEKYPHNLDCTFTIL
.:::.::: .:::::.:::::: : : ::.:.:.:.:.:.:::::::::..:.::. ..
CCDS71 FIKFVSDYETHGAGFSIRYEIFKRGPE-CSQNYTTPSGVIKSPGFPEKYPNSLECTYIVF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB5 AKPKM-EIILQFLIFDLEHDPLQVGEGDCKYDWLDIWDGIPHVGPLIGKYCGTKTPSELR
. ::: ::::.: :::: : : :.:: :.::::.: ::: ::.::: :::...:
CCDS71 V-PKMSEIILEFESFDLEPDSNPPGGMFCRYDRLEIWDGFPDVGPHIGRYCGQKTPGRIR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 SSTGILSLTFHTDMAVAKDGFSARYYLVHQEPLENFQCNVPLGMESGRIANEQISASSTY
::.::::..:.:: :.::.:::: : .... :.:.: ::::::.: ..::.::: :
CCDS71 SSSGILSMVFYTDSAIAKEGFSANYSVLQSSVSEDFKCMEALGMESGEIHSDQITASSQY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SDGRWTPQQSRLHGDDNGWTPNLDSNKEYLQVDLRFLTMLTAIATQGAISRETQNGYYVK
: . :. ..:::. .:::::. :: .:..:::: .: ..::..::::::.::.. ::::
CCDS71 STN-WSAERSRLNYPENGWTPGEDSYREWIQVDLGLLRFVTAVGTQGAISKETKKKYYVK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 SYKLEVSTNGEDWMVYRHGKNHKVFQANNDATEVVLNKLHAPLLTRFVRIRPQTWHSGIA
.::..::.:::::.. ..:.. .::.:.. :.::. . ::.::::::.: ::..::.
CCDS71 TYKIDVSSNGEDWITIKEGNKPVLFQGNTNPTDVVVAVFPKPLITRFVRIKPATWETGIS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 LRLELFGCRVTDAPCSNMLGMLSGLIADSQISASSTQEYLWSPSAARLVSSRSGW-FPRI
.:.:..::..:: :::.::::.::::.::::..:. . : : :::.::::: .:
CCDS71 MRFEVYGCKITDYPCSGMLGMVSGLISDSQITSSNQGDRNWMPENIRLVTSRSGWALPPA
420 430 440 450 460 470
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:.. .: :::.::: : :.:.::::.. : ..:.::::..:: ::.::..:
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]