Result of FASTA (omim) for pFN21AB5485
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5485, 517 aa
  1>>>pF1KB5485 517 - 517 aa - 517 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4614+/-0.000412; mu= 16.9223+/- 0.025
 mean_var=61.8474+/-12.353, 0's: 0 Z-trim(110.6): 74  B-trim: 42 in 1/54
 Lambda= 0.163085
 statistics sampled from 18880 (18957) to 18880 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.585), E-opt: 0.2 (0.222), width:  16
 Scan time:  8.460

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_000681 (OMIM: 100650,610251) aldehyde dehydroge ( 517) 3456 822.2       0
NP_001191818 (OMIM: 100650,610251) aldehyde dehydr ( 470) 2652 633.0 5.9e-181
NP_000683 (OMIM: 100670) aldehyde dehydrogenase X, ( 517) 2569 613.5 4.9e-175
XP_011516104 (OMIM: 100670) PREDICTED: aldehyde de ( 517) 2569 613.5 4.9e-175
NP_003879 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 i ( 518) 2371 566.9 5.2e-161
NP_000680 (OMIM: 100640) retinal dehydrogenase 1 [ ( 501) 2352 562.4 1.1e-159
NP_001193826 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase  ( 497) 2345 560.7 3.5e-159
NP_000684 (OMIM: 600463,615113) aldehyde dehydroge ( 512) 2254 539.3 9.9e-153
NP_733798 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 i ( 422) 2083 499.1 1.1e-140
XP_011536288 (OMIM: 613584) PREDICTED: mitochondri ( 777) 1525 367.9 6.2e-101
XP_016874378 (OMIM: 613584) PREDICTED: mitochondri ( 777) 1525 367.9 6.2e-101
NP_001029345 (OMIM: 613584) mitochondrial 10-formy ( 923) 1525 367.9 7.2e-101
NP_001257294 (OMIM: 600249) cytosolic 10-formyltet ( 801) 1521 367.0 1.2e-100
XP_011510657 (OMIM: 600249) PREDICTED: cytosolic 1 ( 902) 1521 367.0 1.3e-100
XP_006713544 (OMIM: 600249) PREDICTED: cytosolic 1 ( 902) 1521 367.0 1.3e-100
NP_036322 (OMIM: 600249) cytosolic 10-formyltetrah ( 902) 1521 367.0 1.3e-100
NP_001257293 (OMIM: 600249) cytosolic 10-formyltet ( 912) 1521 367.0 1.4e-100
NP_001280744 (OMIM: 600463,615113) aldehyde dehydr ( 405) 1347 325.9 1.4e-88
NP_000687 (OMIM: 602733) 4-trimethylaminobutyralde ( 518) 1262 305.9 1.8e-82
NP_733797 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 i ( 480) 1201 291.6 3.6e-78
XP_011507596 (OMIM: 602733) PREDICTED: 4-trimethyl ( 424) 1191 289.2 1.6e-77
NP_072090 (OMIM: 606467) aldehyde dehydrogenase fa ( 487) 1135 276.1 1.7e-73
XP_016861103 (OMIM: 600249) PREDICTED: cytosolic 1 ( 828) 1116 271.7 6.1e-72
XP_016861102 (OMIM: 600249) PREDICTED: cytosolic 1 ( 838) 1116 271.7 6.1e-72
NP_001071 (OMIM: 271980,610045) succinate-semialde ( 535)  906 222.2 3.1e-57
NP_001180409 (OMIM: 606467) aldehyde dehydrogenase ( 437)  741 183.3 1.2e-45
NP_005580 (OMIM: 603178,614105) methylmalonate-sem ( 535)  716 177.5 8.8e-44
NP_001188306 (OMIM: 107323,266100) alpha-aminoadip ( 511)  706 175.1 4.3e-43
NP_001173 (OMIM: 107323,266100) alpha-aminoadipic  ( 539)  706 175.1 4.5e-43
NP_001265522 (OMIM: 603178,614105) methylmalonate- ( 522)  624 155.8 2.8e-37
XP_016864982 (OMIM: 107323,266100) PREDICTED: alph ( 404)  608 152.0 3.1e-36
XP_011541719 (OMIM: 107323,266100) PREDICTED: alph ( 404)  608 152.0 3.1e-36
NP_001265523 (OMIM: 603178,614105) methylmalonate- ( 381)  606 151.6   4e-36
XP_016876820 (OMIM: 603178,614105) PREDICTED: meth ( 381)  606 151.6   4e-36
NP_733936 (OMIM: 271980,610045) succinate-semialde ( 548)  602 150.7 1.1e-35
XP_011536290 (OMIM: 613584) PREDICTED: mitochondri ( 622)  562 141.3 8.1e-33
NP_001128639 (OMIM: 100660) aldehyde dehydrogenase ( 453)  555 139.6 1.9e-32
NP_001128640 (OMIM: 100660) aldehyde dehydrogenase ( 453)  555 139.6 1.9e-32
NP_000682 (OMIM: 100660) aldehyde dehydrogenase, d ( 453)  555 139.6 1.9e-32
NP_001317079 (OMIM: 100660) aldehyde dehydrogenase ( 380)  504 127.6 6.7e-29
XP_011522033 (OMIM: 100660) PREDICTED: aldehyde de ( 380)  504 127.6 6.7e-29
XP_011524743 (OMIM: 613358) PREDICTED: aldehyde de ( 773)  495 125.5 5.5e-28
XP_011524744 (OMIM: 613358) PREDICTED: aldehyde de ( 773)  495 125.5 5.5e-28
NP_699160 (OMIM: 613358) aldehyde dehydrogenase fa ( 802)  495 125.6 5.7e-28
XP_005256579 (OMIM: 100660) PREDICTED: aldehyde de ( 570)  437 111.9 5.4e-24
XP_005256580 (OMIM: 100660) PREDICTED: aldehyde de ( 570)  437 111.9 5.4e-24
XP_005256581 (OMIM: 100660) PREDICTED: aldehyde de ( 570)  437 111.9 5.4e-24
NP_001154976 (OMIM: 239510,606811) delta-1-pyrroli ( 503)  432 110.7 1.1e-23
NP_003739 (OMIM: 239510,606811) delta-1-pyrroline- ( 563)  432 110.7 1.2e-23
NP_733844 (OMIM: 239510,606811) delta-1-pyrroline- ( 563)  432 110.7 1.2e-23


>>NP_000681 (OMIM: 100650,610251) aldehyde dehydrogenase  (517 aa)
 initn: 3456 init1: 3456 opt: 3456  Z-score: 4391.4  bits: 822.2 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3456; 100.0% identity (100.0% similar) in 517 aa overlap (1-517:1-517)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MLRAAARFGPRLGRRLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKTFPTVNPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MLRAAARFGPRLGRRLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKTFPTVNPS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 TGEVICQVAEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TGEVICQVAEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 ALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 QIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 FGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 DWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQGP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 QVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 VMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       
pF1KB5 PFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
              490       500       510       

>>NP_001191818 (OMIM: 100650,610251) aldehyde dehydrogen  (470 aa)
 initn: 3134 init1: 2652 opt: 2652  Z-score: 3369.7  bits: 633.0 E(85289): 5.9e-181
Smith-Waterman score: 3044; 90.9% identity (90.9% similar) in 517 aa overlap (1-517:1-470)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MLRAAARFGPRLGRRLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKTFPTVNPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLRAAARFGPRLGRRLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKTFPTVNPS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 TGEVICQVAEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLA
       :::::::::::::                                               
NP_001 TGEVICQVAEGDK-----------------------------------------------
               70                                                  

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 ALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCG
            80        90       100       110       120       130   

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 QIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPG
           140       150       160       170       180       190   

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 FGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADM
           200       210       220       230       240       250   

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 DWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQGP
           260       270       280       290       300       310   

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 QVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGP
           320       330       340       350       360       370   

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 VMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQS
           380       390       400       410       420       430   

              490       500       510       
pF1KB5 PFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
           440       450       460       470

>>NP_000683 (OMIM: 100670) aldehyde dehydrogenase X, mit  (517 aa)
 initn: 2565 init1: 2565 opt: 2569  Z-score: 3263.5  bits: 613.5 E(85289): 4.9e-175
Smith-Waterman score: 2569; 73.6% identity (89.2% similar) in 518 aa overlap (7-517:3-517)

                10              20        30        40        50   
pF1KB5 MLRAAARF-GPRL----GR--RLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKT
             :: .:::    ::  :  ::::   .:.:  .:..  ::.::::::.::::.::
NP_000     MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAA---LPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKT
                   10        20           30        40        50   

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB5 FPTVNPSTGEVICQVAEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIE
       ::::::.::::: .:::::. :::.:::::: ::.:::::::::::.:::::::::::.:
NP_000 FPTVNPTTGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNRLADLVE
            60        70        80        90       100       110   

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB5 RDRTYLAALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRH
       :::.:::.:::::::::.  :: .::: :.:  ::.::::::.::::::.::. : .:::
NP_000 RDRVYLASLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRH
           120       130       140       150       160       170   

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB5 EPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPG
       ::::::::::::::::.::.:::.:::::::.:::::::::::.:::.:.::::::::::
NP_000 EPVGVCGQIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPG
           180       190       200       210       220       230   

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB5 VVNIVPGFGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNI
       ::::. :.:::::::::.: ::::::::::::.:..:: :::.:::::::::::::::.:
NP_000 VVNIITGYGPTAGAAIAQHVDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSI
           240       250       260       270       280       290   

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB5 IMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFD
       ...::::. :::: : :::::.::::::::::::.:.::.::.::.: .::.: :::::.
NP_000 VLADADMEHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFE
           300       310       320       330       340       350   

           360       370       380       390       400       410   
pF1KB5 SKTEQGPQVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIA
         :.::::::. ::...::::. :..:::::::::   ..::.::.::::: ::: : ::
NP_000 LDTQQGPQVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIA
           360       370       380       390       400       410   

           420       430       440       450       460       470   
pF1KB5 KEEIFGPVMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCY
       ::::::::. ..::: ::::: ::::. :::::::::.::::: :..::::::::::: :
NP_000 KEEIFGPVQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTY
           420       430       440       450       460       470   

           480       490       500       510       
pF1KB5 DVFGAQSPFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
       ..   ..::::.: ::.:::::: ::.:::::::::.:::::::
NP_000 NIVTCHTPFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
           480       490       500       510       

>>XP_011516104 (OMIM: 100670) PREDICTED: aldehyde dehydr  (517 aa)
 initn: 2565 init1: 2565 opt: 2569  Z-score: 3263.5  bits: 613.5 E(85289): 4.9e-175
Smith-Waterman score: 2569; 73.6% identity (89.2% similar) in 518 aa overlap (7-517:3-517)

                10              20        30        40        50   
pF1KB5 MLRAAARF-GPRL----GR--RLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKT
             :: .:::    ::  :  ::::   .:.:  .:..  ::.::::::.::::.::
XP_011     MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAA---LPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKT
                   10        20           30        40        50   

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB5 FPTVNPSTGEVICQVAEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIE
       ::::::.::::: .:::::. :::.:::::: ::.:::::::::::.:::::::::::.:
XP_011 FPTVNPTTGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNRLADLVE
            60        70        80        90       100       110   

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB5 RDRTYLAALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRH
       :::.:::.:::::::::.  :: .::: :.:  ::.::::::.::::::.::. : .:::
XP_011 RDRVYLASLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRH
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pF1KB5 EPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPG
       ::::::::::::::::.::.:::.:::::::.:::::::::::.:::.:.::::::::::
XP_011 EPVGVCGQIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPG
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pF1KB5 VVNIVPGFGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNI
       ::::. :.:::::::::.: ::::::::::::.:..:: :::.:::::::::::::::.:
XP_011 VVNIITGYGPTAGAAIAQHVDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSI
           240       250       260       270       280       290   

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB5 IMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFD
       ...::::. :::: : :::::.::::::::::::.:.::.::.::.: .::.: :::::.
XP_011 VLADADMEHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFE
           300       310       320       330       340       350   

           360       370       380       390       400       410   
pF1KB5 SKTEQGPQVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIA
         :.::::::. ::...::::. :..:::::::::   ..::.::.::::: ::: : ::
XP_011 LDTQQGPQVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIA
           360       370       380       390       400       410   

           420       430       440       450       460       470   
pF1KB5 KEEIFGPVMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCY
       ::::::::. ..::: ::::: ::::. :::::::::.::::: :..::::::::::: :
XP_011 KEEIFGPVQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTY
           420       430       440       450       460       470   

           480       490       500       510       
pF1KB5 DVFGAQSPFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
       ..   ..::::.: ::.:::::: ::.:::::::::.:::::::
XP_011 NIVTCHTPFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
           480       490       500       510       

>>NP_003879 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 isofo  (518 aa)
 initn: 2347 init1: 2347 opt: 2371  Z-score: 3011.7  bits: 566.9 E(85289): 5.2e-161
Smith-Waterman score: 2371; 67.3% identity (89.0% similar) in 498 aa overlap (20-517:21-518)

                10        20        30        40        50         
pF1KB5  MLRAAARFGPRLGRRLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKTFPTVNP
                           :. . .:.:. . :.  ..:::::::... : ..::. ::
NP_003 MTSSKIEMPGEVKADPAALMASLHLLPSPTPNLEIKYTKIFINNEWQNSESGRVFPVYNP
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB5 STGEVICQVAEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYL
       .::: .:.: :.:: :.::::.::: ::.::: :::::::.:::::..::::.::::. :
NP_003 ATGEQVCEVQEADKADIDKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVL
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB5 AALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVC
       :..:.:..:::.. .. :::. :.: .::::::::: :: :::.:::.:..:::::.:::
NP_003 ATMESLNGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVC
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB5 GQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVP
       :::::::::::: :::..:::  ::.::.: ::::::.:::.. :::::::::::.::.:
NP_003 GQIIPWNFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEAGFPPGVINILP
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB5 GFGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDAD
       :.:::::::::::  .::.:::::::.:..:: ::: ::::::::::::::::::..:::
NP_003 GYGPTAGAAIASHIGIDKIAFTGSTEVGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADAD
              250       260       270       280       290       300

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB5 MDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQG
       .:.:::::: ..:::::::: :::: ::.:.::.:::.::: ::: ::::.:::  ::::
NP_003 LDYAVEQAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQG
              310       320       330       340       350       360

     360       370       380       390       400       410         
pF1KB5 PQVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFG
       ::.:. :..:::  :..:  ::::: :::   . .:.::.::::..: : : ::::::::
NP_003 PQIDKKQYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFG
              370       380       390       400       410       420

     420       430       440       450       460       470         
pF1KB5 PVMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQ
       ::..::.:::..::. ::::: .::.:::::.:..::  .:.:.::::::.:::....::
NP_003 PVQEILRFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQ
              430       440       450       460       470       480

     480       490       500       510       
pF1KB5 SPFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
       :::::.::::.:::.::.::. :.::::::::.:::::
NP_003 SPFGGFKMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
              490       500       510        

>>NP_000680 (OMIM: 100640) retinal dehydrogenase 1 [Homo  (501 aa)
 initn: 2344 init1: 2344 opt: 2352  Z-score: 2987.8  bits: 562.4 E(85289): 1.1e-159
Smith-Waterman score: 2352; 68.1% identity (86.8% similar) in 501 aa overlap (17-517:1-501)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MLRAAARFGPRLGRRLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKTFPTVNPS
                       .:...:  .:.   . ..  ..:::::::::.:: : ::. ::.
NP_000                 MSSSGTPDLPVLLTDLKIQYTKIFINNEWHDSVSGKKFPVFNPA
                               10        20        30        40    

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 TGEVICQVAEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLA
       : : .::: ::::::::::::::: :::.::::: ::::.::::: .:::::::::  ::
NP_000 TEEELCQVEEGDKEDVDKAVKAARQAFQIGSPWRTMDASERGRLLYKLADLIERDRLLLA
           50        60        70        80        90       100    

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 ALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCG
       ..:....:: :  .:: ::   .: ::: :::::: .:.::::::.::.::::::.::::
NP_000 TMESMNGGKLYSNAYLNDLAGCIKTLRYCAGWADKIQGRTIPIDGNFFTYTRHEPIGVCG
          110       120       130       140       150       160    

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 QIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPG
       :::::::::.:  ::.::::. ::.::.: :::::::::.::.:::::::::::::::::
NP_000 QIIPWNFPLVMLIWKIGPALSCGNTVVVKPAEQTPLTALHVASLIKEAGFPPGVVNIVPG
          170       180       190       200       210       220    

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 FGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADM
       .::::::::.:: :.::::::::::.:..:. :::.::::::::::::::: :...:::.
NP_000 YGPTAGAAISSHMDIDKVAFTGSTEVGKLIKEAAGKSNLKRVTLELGGKSPCIVLADADL
          230       240       250       260       270       280    

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 DWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQGP
       : ::: :: ..:..::::: :.:: ::.:.::::::.::: :::. ..:::.   . :::
NP_000 DNAVEFAHHGVFYHQGQCCIAASRIFVEESIYDEFVRRSVERAKKYILGNPLTPGVTQGP
          290       300       310       320       330       340    

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 QVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGP
       :.:. :. :::  :..::.::::: ::::  ...:::.:::::..: : : :::::::::
NP_000 QIDKEQYDKILDLIESGKKEGAKLECGGGPWGNKGYFVQPTVFSNVTDEMRIAKEEIFGP
          350       360       370       380       390       400    

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 VMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQS
       :.::.:::....:. ::::. :::.:.:::::.:::  .:.:::::::::::: : .:: 
NP_000 VQQIMKFKSLDDVIKRANNTFYGLSAGVFTKDIDKAITISSALQAGTVWVNCYGVVSAQC
          410       420       430       440       450       460    

              490       500       510       
pF1KB5 PFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
       ::::.::::.::::::::.. ::::::::::. ::::
NP_000 PFGGFKMSGNGRELGEYGFHEYTEVKTVTVKISQKNS
          470       480       490       500 

>>NP_001193826 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 is  (497 aa)
 initn: 2345 init1: 2345 opt: 2345  Z-score: 2978.9  bits: 560.7 E(85289): 3.5e-159
Smith-Waterman score: 2345; 69.1% identity (89.8% similar) in 479 aa overlap (39-517:19-497)

       10        20        30        40        50        60        
pF1KB5 GPRLGRRLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKTFPTVNPSTGEVICQV
                                     :::::::... : ..::. ::.::: .:.:
NP_001             MKNQCETVWLKSPIKLKLIFINNEWQNSESGRVFPVYNPATGEQVCEV
                           10        20        30        40        

       70        80        90       100       110       120        
pF1KB5 AEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNG
        :.:: :.::::.::: ::.::: :::::::.:::::..::::.::::. ::..:.:..:
NP_001 QEADKADIDKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVLATMESLNGG
       50        60        70        80        90       100        

      130       140       150       160       170       180        
pF1KB5 KPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFP
       ::.. .. :::. :.: .::::::::: :: :::.:::.:..:::::.::::::::::::
NP_001 KPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVCGQIIPWNFP
      110       120       130       140       150       160        

      190       200       210       220       230       240        
pF1KB5 LLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTAGAA
       ::: :::..:::  ::.::.: ::::::.:::.. :::::::::::.::.::.:::::::
NP_001 LLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEAGFPPGVINILPGYGPTAGAA
      170       180       190       200       210       220        

      250       260       270       280       290       300        
pF1KB5 IASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADMDWAVEQAH
       ::::  .::.:::::::.:..:: ::: ::::::::::::::::::..:::.:.::::::
NP_001 IASHIGIDKIAFTGSTEVGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADADLDYAVEQAH
      230       240       250       260       270       280        

      310       320       330       340       350       360        
pF1KB5 FALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQGPQVDETQFK
        ..:::::::: :::: ::.:.::.:::.::: ::: ::::.:::  ::::::.:. :..
NP_001 QGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQGPQIDKKQYN
      290       300       310       320       330       340        

      370       380       390       400       410       420        
pF1KB5 KILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGPVMQILKFK
       :::  :..:  ::::: :::   . .:.::.::::..: : : ::::::::::..::.::
NP_001 KILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFGPVQEILRFK
      350       360       370       380       390       400        

      430       440       450       460       470       480        
pF1KB5 TIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQSPFGGYKMS
       :..::. ::::: .::.:::::.:..::  .:.:.::::::.:::....:::::::.:::
NP_001 TMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQSPFGGFKMS
      410       420       430       440       450       460        

      490       500       510       
pF1KB5 GSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
       :.:::.::.::. :.::::::::.:::::
NP_001 GNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
      470       480       490       

>>NP_000684 (OMIM: 600463,615113) aldehyde dehydrogenase  (512 aa)
 initn: 2236 init1: 2236 opt: 2254  Z-score: 2863.0  bits: 539.3 E(85289): 9.9e-153
Smith-Waterman score: 2254; 66.1% identity (86.4% similar) in 493 aa overlap (24-516:19-511)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MLRAAARFGPRLGRRLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKTFPTVNPS
                              :.: : .. ::  ..::::::::.. : : : : :::
NP_000      MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNPS
                    10        20        30        40        50     

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 TGEVICQVAEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLA
       : : ::.: :::: ::::::.::..::: ::::::.::  :::::..::::.::::. ::
NP_000 TREQICEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATLA
          60        70        80        90       100       110     

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 ALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCG
       ::::.:.:::.. ....::.  .. :::.:::::: .::::: : .   .:::::.::::
NP_000 ALETMDTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVCG
         120       130       140       150       160       170     

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 QIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPG
        : :::::::: .:::.:::  ::..:.: ::::::::::...:::::::::::::::::
NP_000 AITPWNFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVPG
         180       190       200       210       220       230     

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 FGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADM
       ::::.::::.:: ...:.:::::::.:.... ::. :::::::::::::.: :. .:::.
NP_000 FGPTVGAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADADL
         240       250       260       270       280       290     

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 DWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQGP
       : ::: :: ..:::::::: :.::.::.:..:.:::.:::  ::.: ::.::: ::::::
NP_000 DLAVECAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGP
         300       310       320       330       340       350     

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 QVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGP
       :.:. :: :::  :..::.::::: :::.   :.: ::.::::..: :.: :::::::::
NP_000 QIDQKQFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGP
         360       370       380       390       400       410     

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 VMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQS
       :. :::::.::::. :::.. :::.::::::.::::  :..::..::::.:::... ::.
NP_000 VQPILKFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQA
         420       430       440       450       460       470     

              490       500       510       
pF1KB5 PFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
       ::::.::::.:::::::.:  ::::::::.:. .:: 
NP_000 PFGGFKMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
         480       490       500       510  

>>NP_733798 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 isofo  (422 aa)
 initn: 2083 init1: 2083 opt: 2083  Z-score: 2646.9  bits: 499.1 E(85289): 1.1e-140
Smith-Waterman score: 2083; 69.9% identity (90.3% similar) in 422 aa overlap (96-517:1-422)

          70        80        90       100       110       120     
pF1KB5 CQVAEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETL
                                     ::::.:::::..::::.::::. ::..:.:
NP_733                               MDASERGRLLDKLADLVERDRAVLATMESL
                                             10        20        30

         130       140       150       160       170       180     
pF1KB5 DNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPW
       ..:::.. .. :::. :.: .::::::::: :: :::.:::.:..:::::.:::::::::
NP_733 NGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVCGQIIPW
               40        50        60        70        80        90

         190       200       210       220       230       240     
pF1KB5 NFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTA
       :::::: :::..:::  ::.::.: ::::::.:::.. :::::::::::.::.::.::::
NP_733 NFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEAGFPPGVINILPGYGPTA
              100       110       120       130       140       150

         250       260       270       280       290       300     
pF1KB5 GAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADMDWAVE
       :::::::  .::.:::::::.:..:: ::: ::::::::::::::::::..:::.:.:::
NP_733 GAAIASHIGIDKIAFTGSTEVGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADADLDYAVE
              160       170       180       190       200       210

         310       320       330       340       350       360     
pF1KB5 QAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQGPQVDET
       ::: ..:::::::: :::: ::.:.::.:::.::: ::: ::::.:::  ::::::.:. 
NP_733 QAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQGPQIDKK
              220       230       240       250       260       270

         370       380       390       400       410       420     
pF1KB5 QFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGPVMQIL
       :..:::  :..:  ::::: :::   . .:.::.::::..: : : ::::::::::..::
NP_733 QYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFGPVQEIL
              280       290       300       310       320       330

         430       440       450       460       470       480     
pF1KB5 KFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQSPFGGY
       .:::..::. ::::: .::.:::::.:..::  .:.:.::::::.:::....:::::::.
NP_733 RFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQSPFGGF
              340       350       360       370       380       390

         490       500       510       
pF1KB5 KMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
       ::::.:::.::.::. :.::::::::.:::::
NP_733 KMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
              400       410       420  

>>XP_011536288 (OMIM: 613584) PREDICTED: mitochondrial 1  (777 aa)
 initn: 1521 init1: 894 opt: 1525  Z-score: 1933.1  bits: 367.9 E(85289): 6.2e-101
Smith-Waterman score: 1525; 48.8% identity (76.9% similar) in 480 aa overlap (38-511:298-776)

        10        20        30        40        50        60       
pF1KB5 FGPRLGRRLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKTFPTVNPSTGEVICQ
                                     : :::... :: . ::. :.::. : .::.
XP_011 RKLRGEDQEVELVVDYISKEVNEIMVKMPYQCFINGQFTDADDGKTYDTINPTDGSTICK
       270       280       290       300       310       320       

        70        80        90       100       110       120       
pF1KB5 VAEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDN
       :. ..  :::::: ::. ::. :  : ::.: .::::. :::::.:...  ::..:.::.
XP_011 VSYASLADVDKAVAAAKDAFENGE-WGRMNARERGRLMYRLADLLEENQEELATIEALDS
       330       340       350        360       370       380      

       130       140       150       160           170       180   
pF1KB5 GKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPID----GDFFSYTRHEPVGVCGQII
       :  :...  . . : .. .::.::: :: .:.::::.    .  ...:..::.:::. ::
XP_011 GAVYTLALKTHIGMSVQTFRYFAGWCDKIQGSTIPINQARPNRNLTFTKKEPLGVCAIII
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