Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5346
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5346, 618 aa
1>>>pF1KB5346 618 - 618 aa - 618 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9420+/-0.00121; mu= 2.3514+/- 0.072
mean_var=194.1988+/-39.514, 0's: 0 Z-trim(107.8): 29 B-trim: 12 in 1/50
Lambda= 0.092035
statistics sampled from 9770 (9788) to 9770 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.645), E-opt: 0.2 (0.301), width: 16
Scan time: 3.680
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45168.1 KLC1 gene_id:3831|Hs108|chr14 ( 618) 4011 545.7 6.5e-155
CCDS41996.1 KLC1 gene_id:3831|Hs108|chr14 ( 573) 3600 491.1 1.6e-138
CCDS32165.1 KLC1 gene_id:3831|Hs108|chr14 ( 560) 3590 489.8 4e-138
CCDS4883.1 KLC4 gene_id:89953|Hs108|chr6 ( 619) 2688 370.1 4.9e-102
CCDS4882.1 KLC4 gene_id:89953|Hs108|chr6 ( 637) 2688 370.1 5e-102
CCDS8130.1 KLC2 gene_id:64837|Hs108|chr11 ( 622) 2614 360.2 4.5e-99
CCDS75459.1 KLC4 gene_id:89953|Hs108|chr6 ( 542) 2060 286.7 5.6e-77
CCDS44653.1 KLC2 gene_id:64837|Hs108|chr11 ( 545) 2055 286.0 8.9e-77
CCDS12660.2 KLC3 gene_id:147700|Hs108|chr19 ( 504) 1691 237.6 2.9e-62
CCDS47429.1 KLC4 gene_id:89953|Hs108|chr6 ( 315) 1323 188.7 1e-47
CCDS3078.1 NPHP3 gene_id:27031|Hs108|chr3 (1330) 464 75.0 7.2e-13
>>CCDS45168.1 KLC1 gene_id:3831|Hs108|chr14 (618 aa)
initn: 4011 init1: 4011 opt: 4011 Z-score: 2894.7 bits: 545.7 E(32554): 6.5e-155
Smith-Waterman score: 4011; 100.0% identity (100.0% similar) in 618 aa overlap (1-618:1-618)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 PNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 EDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 NNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 YYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 DENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 EAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYESGPDGGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYESGPDGGE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 EVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASLAEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASLAEP
550 560 570 580 590 600
610
pF1KB5 LFVENDSSSSGLEDATAN
::::::::::::::::::
CCDS45 LFVENDSSSSGLEDATAN
610
>>CCDS41996.1 KLC1 gene_id:3831|Hs108|chr14 (573 aa)
initn: 3600 init1: 3600 opt: 3600 Z-score: 2600.3 bits: 491.1 E(32554): 1.6e-138
Smith-Waterman score: 3600; 97.0% identity (98.1% similar) in 571 aa overlap (1-571:1-571)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 PNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 EDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 NNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 YYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 YYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 DENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 EAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYESGPDGGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYESGPDGGE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 EVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASLAEP
:::::::::: .: . :. .. . ::
CCDS41 EVSMSVEWNGGVSGRASFCGKRQQQQWPGRRHR
550 560 570
610
pF1KB5 LFVENDSSSSGLEDATAN
>>CCDS32165.1 KLC1 gene_id:3831|Hs108|chr14 (560 aa)
initn: 3590 init1: 3590 opt: 3590 Z-score: 2593.2 bits: 489.8 E(32554): 4e-138
Smith-Waterman score: 3590; 100.0% identity (100.0% similar) in 550 aa overlap (1-550:1-550)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 PNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 EDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 NNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 YYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 DENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 EAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYESGPDGGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYESGPDGGE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 EVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASLAEP
::::::::::
CCDS32 EVSMSVEWNGMRKMKLGLVN
550 560
>>CCDS4883.1 KLC4 gene_id:89953|Hs108|chr6 (619 aa)
initn: 1982 init1: 1452 opt: 2688 Z-score: 1945.3 bits: 370.1 E(32554): 4.9e-102
Smith-Waterman score: 2688; 68.3% identity (88.6% similar) in 615 aa overlap (5-613:1-603)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKL--EKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKK
:: .: ..:. ..:.:.::...:. : ::::::..::...:::: .:..::..
CCDS48 MSGLVLGQRDEPAGHRLSQEEILGSTRLVSQGLEALRSEHQAVLQSLSQTIECLQQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 DD-ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQEN
: .::.::. ..:.:.: .::::::::::.::..::..:::::::::::::::::::
CCDS48 GGHEEGLVHEKARQLRRSMENIELGLSEAQVMLALASHLSTVESEKQKLRAQVRRLCQEN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 QWLRDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLD
::::::::.:::.::.:::.:::::::::::::..::..::.: ::.:. :.::. ::
CCDS48 QWLRDELAGTQQRLQRSEQAVAQLEEEKKHLEFLGQLRQYDEDGHTSEEKEGDATKDSLD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 DLFPNDED-DPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLC
:::::.:. ::..:... ...:.::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS48 DLFPNEEEEDPSNGLSR--GQGATAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYAAQGRYEVAVPLC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 KQALEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAV
::::::::.:::. ::::::::::::::::::::::.::.::::::.:::.::: :::::
CCDS48 KQALEDLERTSGRGHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALSIRESTLGPDHPAV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 AATLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYE
::::::::::::::::::::::::.::::::::::: .::::::::::::::::::::::
CCDS48 AATLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCQRALEIREKVLGTNHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 EVEYYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREF
:: :::::: ::. .::::.::::.::::::::::::::. .::::::::::::: .::
CCDS48 AVERYYQRALAIYEGQLGPDNPNVARTKNNLASCYLKQGKYAEAETLYKEILTRAHVQEF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 GSVDDENKPIWMHAEEREE-CKGKQKDG-TSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALY
:::::..:::::::::::: :.....: : ..:::::::::::.::::.:::.::::::
CCDS48 GSVDDDHKPIWMHAEEREEMSKSRHHEGGTPYAEYGGWYKACKVSSPTVNTTLRNLGALY
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 RRQGKFEAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYES
:::::.:::::::: :.:::.:: : . . .:::.:.. .. .: :.:. . : ::.:
CCDS48 RRQGKLEAAETLEECALRSRRQGTDPISQTKVAELLGESDG--RRTSQEGPG-DSVKFE-
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 GPDGGEEVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPG
:::..:..:::.:::.:.:.::::..:.: .::::: :::::.: : .:.. .
CCDS48 ---GGEDASVAVEWSGDGSGTLQRSGSLGKIRDVLRRSSELLVRKLQG---TEPRPSSSN
540 550 560 570 580
600 610
pF1KB5 ASLAEPLFVENDSSSSGLEDATAN
. : : :. :.. :.
CCDS48 MKRAASLNYLNQPSAAPLQVSRGLSASTMDLSSSS
590 600 610
>>CCDS4882.1 KLC4 gene_id:89953|Hs108|chr6 (637 aa)
initn: 1982 init1: 1452 opt: 2688 Z-score: 1945.1 bits: 370.1 E(32554): 5e-102
Smith-Waterman score: 2688; 68.3% identity (88.6% similar) in 615 aa overlap (5-613:19-621)
10 20 30 40
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKL--EKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNS
:: .: ..:. ..:.:.::...:. : ::::::..::..
CCDS48 MEVTGFGVTRPGKVPQARMSGLVLGQRDEPAGHRLSQEEILGSTRLVSQGLEALRSEHQA
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 ILQSLLETLKCLKKDD-ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEK
.:::: .:..::.. : .::.::. ..:.:.: .::::::::::.::..::..:::::
CCDS48 VLQSLSQTIECLQQGGHEEGLVHEKARQLRRSMENIELGLSEAQVMLALASHLSTVESEK
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 QKLRAQVRRLCQENQWLRDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISP
::::::::::::::::::::::.:::.::.:::.:::::::::::::..::..::.:
CCDS48 QKLRAQVRRLCQENQWLRDELAGTQQRLQRSEQAVAQLEEEKKHLEFLGQLRQYDEDGHT
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 SEDKDTDSTKEPLDDLFPNDED-DPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQ
::.:. :.::. :::::::.:. ::..:... ...:.::::::::::::::::::::::
CCDS48 SEEKEGDATKDSLDDLFPNEEEEDPSNGLSR--GQGATAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQ
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 YASQGRYEVAVPLCKQALEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDAL
::.:::::::::::::::::::.:::. ::::::::::::::::::::::.::.::::::
CCDS48 YAAQGRYEVAVPLCKQALEDLERTSGRGHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDAL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 AIREKTLGKDHPAVAATLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQL
.:::.::: :::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::: .::::::::
CCDS48 SIRESTLGPDHPAVAATLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCQRALEIREKVLGTNHPDVAKQL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 NNLALLCQNQGKYEEVEYYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAET
:::::::::::::: :: :::::: ::. .::::.::::.::::::::::::::. .:::
CCDS48 NNLALLCQNQGKYEAVERYYQRALAIYEGQLGPDNPNVARTKNNLASCYLKQGKYAEAET
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 LYKEILTRAHEREFGSVDDENKPIWMHAEEREE-CKGKQKDG-TSFGEYGGWYKACKVDS
:::::::::: .:::::::..:::::::::::: :.....: : ..:::::::::::.:
CCDS48 LYKEILTRAHVQEFGSVDDDHKPIWMHAEEREEMSKSRHHEGGTPYAEYGGWYKACKVSS
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 PTVTTTLKNLGALYRRQGKFEAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRR
:::.:::.:::::::::::.:::::::: :.:::.:: : . . .:::.:.. .. .:
CCDS48 PTVNTTLRNLGALYRRQGKLEAAETLEECALRSRRQGTDPISQTKVAELLGESDG--RRT
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 SRESLNVDVVKYESGPDGGEEVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKL
:.:. . : ::.: :::..:..:::.:::.:.:.::::..:.: .::::: :::::
CCDS48 SQEGPG-DSVKFE----GGEDASVAVEWSGDGSGTLQRSGSLGKIRDVLRRSSELLVRKL
540 550 560 570 580 590
590 600 610
pF1KB5 KGGSSRESEPKNPGASLAEPLFVENDSSSSGLEDATAN
.: : .:.. . . : : :. :.. :.
CCDS48 QG---TEPRPSSSNMKRAASLNYLNQPSAAPLQVSRGLSASTMDLSSSS
600 610 620 630
>>CCDS8130.1 KLC2 gene_id:64837|Hs108|chr11 (622 aa)
initn: 2557 init1: 1778 opt: 2614 Z-score: 1892.2 bits: 360.2 E(32554): 4.5e-99
Smith-Waterman score: 2625; 69.1% identity (85.1% similar) in 606 aa overlap (5-607:1-589)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
:. ::. .: :::.::::. :: ::::::.:..:: ..: :. . .
CCDS81 MAMMVFPRE---EKLSQDEIVLGTKAVIQGLETLRGEHRALLAPLVAP----EAGE
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
.:. ..:.::: .::::.::::..:::.::.:::::::::::::::: ::::::
CCDS81 AEPGSQERCILLRRSLEAIELGLGEAQVILALSSHLGAVESEKQKLRAQVRRLVQENQWL
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
:.:::.::::::.:::.::::::::.:: ::.:..: :.: ::.:.: : :. :::::
CCDS81 REELAGTQQKLQRSEQAVAQLEEEKQHLLFMSQIRKLDEDASPNEEKG-DVPKDTLDDLF
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KB5 PN-DEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQA
:: ::..:. . ... ...:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PNEDEQSPAPS----PGGGDVSGQHGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
:::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::
CCDS81 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVE
:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::.::::::::::: ::::
CCDS81 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKFHPDVAKQLSNLALLCQNQGKAEEVE
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 YYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSV
:::.:::::: :.::::::::::::::::::::::::...::::::::::::::.:::::
CCDS81 YYYRRALEIYATRLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKYQDAETLYKEILTRAHEKEFGSV
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 DDENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGK
. .::::::::::::: : :..:.. .::::.::::::::::::.:::..::::::::::
CCDS81 NGDNKPIWMHAEEREESKDKRRDSAPYGEYGSWYKACKVDSPTVNTTLRSLGALYRRQGK
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 FEAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENM--EKRRSRESLNVDVVKYESGPD
.:::.:::. : :.:::::: . . .:.:.:.: . ..: ::. . . ::
CCDS81 LEAAHTLEDCASRNRKQGLDPASQTKVVELLKDGSGRRGDRRSSRDMAGGAGPRSESDL-
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 GGEEVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASL
:.:. ..::::::.:::.:::::.::: ..::::: ::.::.::. . :: :: .
CCDS81 --EDVGPTAEWNGDGSGSLRRSGSFGKLRDALRRSSEMLVKKLQGGTPQ--EPPNPRMKR
530 540 550 560 570
600 610
pF1KB5 AEPLFVENDSSSSGLEDATAN
: : : :
CCDS81 ASSLNFLNKSVEEPTQPGGTGLSDSRTLSSSSMDLSRRSSLVG
580 590 600 610 620
>>CCDS75459.1 KLC4 gene_id:89953|Hs108|chr6 (542 aa)
initn: 2125 init1: 1390 opt: 2060 Z-score: 1495.5 bits: 286.7 E(32554): 5.6e-77
Smith-Waterman score: 2119; 58.5% identity (76.6% similar) in 615 aa overlap (5-613:1-526)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKL--EKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKK
:: .: ..:. ..:.:.::...:. : ::::::..::...:::: .:..::..
CCDS75 MSGLVLGQRDEPAGHRLSQEEILGSTRLVSQGLEALRSEHQAVLQSLSQTIECLQQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 DD-ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQEN
: .::.::. ..:.:.: .::::::::
CCDS75 GGHEEGLVHEKARQLRRSMENIELGLSEAQ------------------------------
60 70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 QWLRDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLD
:.:. :.::. ::
CCDS75 -----------------------------------------------EEKEGDATKDSLD
90
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 DLFPNDED-DPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLC
:::::.:. ::..:... ...:.::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS75 DLFPNEEEEDPSNGLSR--GQGATAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYAAQGRYEVAVPLC
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 KQALEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAV
::::::::.:::. ::::::::::::::::::::::.::.::::::.:::.::: :::::
CCDS75 KQALEDLERTSGRGHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALSIRESTLGPDHPAV
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 AATLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYE
::::::::::::::::::::::::.::::::::::: .::::::::::::::::::::::
CCDS75 AATLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCQRALEIREKVLGTNHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYE
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 EVEYYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREF
:: :::::: ::. .::::.::::.::::::::::::::. .::::::::::::: .::
CCDS75 AVERYYQRALAIYEGQLGPDNPNVARTKNNLASCYLKQGKYAEAETLYKEILTRAHVQEF
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 GSVDDENKPIWMHAEEREE-CKGKQKDG-TSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALY
:::::..:::::::::::: :.....: : ..:::::::::::.::::.:::.::::::
CCDS75 GSVDDDHKPIWMHAEEREEMSKSRHHEGGTPYAEYGGWYKACKVSSPTVNTTLRNLGALY
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 RRQGKFEAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYES
:::::.:::::::: :.:::.:: : . . .:::.:.. .. .: :.:. . : ::.:
CCDS75 RRQGKLEAAETLEECALRSRRQGTDPISQTKVAELLGESDG--RRTSQEGPG-DSVKFE-
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 GPDGGEEVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPG
:::..:..:::.:::.:.:.::::..:.: .::::: :::::.: : .:.. .
CCDS75 ---GGEDASVAVEWSGDGSGTLQRSGSLGKIRDVLRRSSELLVRKLQG---TEPRPSSSN
460 470 480 490 500
600 610
pF1KB5 ASLAEPLFVENDSSSSGLEDATAN
. : : :. :.. :.
CCDS75 MKRAASLNYLNQPSAAPLQVSRGLSASTMDLSSSS
510 520 530 540
>>CCDS44653.1 KLC2 gene_id:64837|Hs108|chr11 (545 aa)
initn: 2147 init1: 1778 opt: 2055 Z-score: 1491.9 bits: 286.0 E(32554): 8.9e-77
Smith-Waterman score: 2073; 59.6% identity (73.1% similar) in 606 aa overlap (5-607:1-512)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
:. ::. .: :::.::::. :: ::::::.:..:: ..: :. . .
CCDS44 MAMMVFPRE---EKLSQDEIVLGTKAVIQGLETLRGEHRALLAPLVAP----EAGE
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
.:. ..:.::: .::::.:::
CCDS44 AEPGSQERCILLRRSLEAIELGLGEAQ---------------------------------
50 60 70
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
::: : :. :::::
CCDS44 ----------------------EEKG-----------------------DVPKDTLDDLF
80 90
190 200 210 220 230
pF1KB5 PN-DEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQA
:: ::..:. . ... ...:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PNEDEQSPA----PSPGGGDVSGQHGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQA
100 110 120 130 140
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
:::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::
CCDS44 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
150 160 170 180 190 200
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVE
:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::.::::::::::: ::::
CCDS44 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKFHPDVAKQLSNLALLCQNQGKAEEVE
210 220 230 240 250 260
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 YYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSV
:::.:::::: :.::::::::::::::::::::::::...::::::::::::::.:::::
CCDS44 YYYRRALEIYATRLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKYQDAETLYKEILTRAHEKEFGSV
270 280 290 300 310 320
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 DDENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGK
. .::::::::::::: : :..:.. .::::.::::::::::::.:::..::::::::::
CCDS44 NGDNKPIWMHAEEREESKDKRRDSAPYGEYGSWYKACKVDSPTVNTTLRSLGALYRRQGK
330 340 350 360 370 380
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 FEAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENM--EKRRSRESLNVDVVKYESGPD
.:::.:::. : :.:::::: . . .:.:.:.: . ..: ::. . . ::
CCDS44 LEAAHTLEDCASRNRKQGLDPASQTKVVELLKDGSGRRGDRRSSRDMAGGAGPRSESDL-
390 400 410 420 430 440
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 GGEEVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASL
:.:. ..::::::.:::.:::::.::: ..::::: ::.::.::. . :: :: .
CCDS44 --EDVGPTAEWNGDGSGSLRRSGSFGKLRDALRRSSEMLVKKLQGGTPQ--EPPNPRMKR
450 460 470 480 490 500
600 610
pF1KB5 AEPLFVENDSSSSGLEDATAN
: : : :
CCDS44 ASSLNFLNKSVEEPTQPGGTGLSDSRTLSSSSMDLSRRSSLVG
510 520 530 540
>>CCDS12660.2 KLC3 gene_id:147700|Hs108|chr19 (504 aa)
initn: 2148 init1: 1168 opt: 1691 Z-score: 1231.2 bits: 237.6 E(32554): 2.9e-62
Smith-Waterman score: 1691; 66.2% identity (87.1% similar) in 396 aa overlap (17-410:16-404)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
:.:. .:.. .:.::.::::::. ::... : :.:
CCDS12 MSVQVAAPGSAGLGPERLSPEELVRQTRQVVQGLEALRAEHHGLAGHLAEALAGQGPAA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
...:::.... .::: .::::.::::..::: :..:.:.:::.::.:.::: ::: ::
CCDS12 GLEMLEEKQQVVSHSLEAIELGLGEAQVLLALSAHVGALEAEKQRLRSQARRLAQENVWL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB5 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDST--KEPLDD
:.:: .::..:. ::.:::::::::.::::..::..:: :.:.....: .. : .
CCDS12 REELEETQRRLRASEESVAQLEEEKRHLEFLGQLRQYDP---PAESQQSESPPRRDSLAS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LFPNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQ
:::..:.. .: ....::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.:
CCDS12 LFPSEEEER-KG---PEAAGAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYAGQGRYEVAVPLCRQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 ALEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAA
::::::..::: ::::::::::::::::::::::.:..::.::: :::.::: .::::::
CCDS12 ALEDLERSSGHCHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEATDLLHDALQIREQTLGPEHPAVAA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 TLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEV
:::::::::::::.:.::::::.::::::::::: :::::::::::::::::::::.:.:
CCDS12 TLNNLAVLYGKRGRYREAEPLCQRALEIREKVLGADHPDVAKQLNNLALLCQNQGKFEDV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 EYYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGS
: .: ::: ::.. :: ::::::::::::: ::::.:..::: :::::: .
CCDS12 ERHYARALSIYEALGGPHDPNVAKTKNNLASAYLKQNKYQQAEELYKEILHKEDLPAPLG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 VDDENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQG
CCDS12 APNTGTAGDAEQALRRSSSLSKIRESIRRGSEKLVSRLRGEAAAGAAGMKRAMSLNTLNV
420 430 440 450 460 470
>>CCDS47429.1 KLC4 gene_id:89953|Hs108|chr6 (315 aa)
initn: 1669 init1: 618 opt: 1323 Z-score: 970.1 bits: 188.7 E(32554): 1e-47
Smith-Waterman score: 1323; 69.0% identity (91.6% similar) in 297 aa overlap (5-297:1-295)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKL--EKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKK
:: .: ..:. ..:.:.::...:. : ::::::..::...:::: .:..::..
CCDS47 MSGLVLGQRDEPAGHRLSQEEILGSTRLVSQGLEALRSEHQAVLQSLSQTIECLQQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 DD-ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQEN
: .::.::. ..:.:.: .::::::::::.::..::..:::::::::::::::::::
CCDS47 GGHEEGLVHEKARQLRRSMENIELGLSEAQVMLALASHLSTVESEKQKLRAQVRRLCQEN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 QWLRDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLD
::::::::.:::.::.:::.:::::::::::::..::..::.: ::.:. :.::. ::
CCDS47 QWLRDELAGTQQRLQRSEQAVAQLEEEKKHLEFLGQLRQYDEDGHTSEEKEGDATKDSLD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 DLFPNDED-DPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLC
:::::.:. ::..:... ...:.::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS47 DLFPNEEEEDPSNGLSR--GQGATAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYAAQGRYEVAVPLC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 KQALEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAV
::::::::.:::. ::::::::::::::::::::::.::.::::::.:::.::: :::::
CCDS47 KQALEDLERTSGRGHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALSIRESTLGPDHPAV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 AATLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYE
.
CCDS47 SIPCPPHPTPRTPHHCCFGLS
300 310
618 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 17:14:19 2016 done: Thu Nov 3 17:14:19 2016
Total Scan time: 3.680 Total Display time: 0.130
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]