Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5205
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5205, 543 aa
1>>>pF1KB5205 543 - 543 aa - 543 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9895+/-0.00116; mu= 14.2994+/- 0.069
mean_var=65.5339+/-13.113, 0's: 0 Z-trim(101.0): 38 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.158431
statistics sampled from 6310 (6341) to 6310 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.55), E-opt: 0.2 (0.195), width: 16
Scan time: 3.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46336.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 543) 3495 808.3 0
CCDS54367.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 499) 3213 743.9 1.1e-214
CCDS54366.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 456) 2937 680.8 9.5e-196
CCDS42696.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 339) 2226 518.2 5.9e-147
CCDS8991.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 ( 535) 1012 240.8 3.1e-63
CCDS33206.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 ( 539) 1005 239.2 9.5e-63
CCDS1140.2 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 ( 545) 987 235.1 1.7e-61
CCDS55843.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 ( 488) 934 222.9 6.6e-58
CCDS5269.1 TCP1 gene_id:6950|Hs108|chr6 ( 556) 903 215.9 1e-55
CCDS3877.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 541) 895 214.0 3.5e-55
CCDS82988.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 520) 883 211.3 2.3e-54
CCDS77996.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 503) 866 207.4 3.3e-53
CCDS30888.1 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 ( 507) 832 199.6 7.2e-51
CCDS58711.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 ( 509) 762 183.6 4.7e-46
CCDS33528.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 548) 738 178.2 2.3e-44
CCDS5523.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 ( 531) 716 173.1 7.2e-43
CCDS68181.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 529) 714 172.7 9.8e-43
CCDS32617.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 530) 675 163.8 4.7e-40
CCDS82989.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 486) 599 146.4 7.4e-35
CCDS82990.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 448) 595 145.5 1.3e-34
CCDS43522.1 TCP1 gene_id:6950|Hs108|chr6 ( 401) 580 142.0 1.3e-33
CCDS68180.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 475) 569 139.5 8.4e-33
CCDS34640.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 ( 486) 481 119.4 9.8e-27
CCDS54105.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 485) 446 111.4 2.5e-24
CCDS13738.1 CCT8L2 gene_id:150160|Hs108|chr22 ( 557) 405 102.0 1.9e-21
CCDS54106.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 493) 404 101.8 2e-21
>>CCDS46336.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 (543 aa)
initn: 3495 init1: 3495 opt: 3495 Z-score: 4315.8 bits: 808.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3495; 100.0% identity (100.0% similar) in 543 aa overlap (1-543:1-543)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MMPTPVILLKEGTDSSQGIPQLVSNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKLIVDGRGKATISN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MMPTPVILLKEGTDSSQGIPQLVSNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKLIVDGRGKATISN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 DGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 IIRAFRTATQLAVNKIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQKAFFAKMVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IIRAFRTATQLAVNKIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQKAFFAKMVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DAVMMLDDLLQLKMIGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYHNPKIALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DAVMMLDDLLQLKMIGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYHNPKIALL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 NVELELKAEKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAKVVLSKLPIGDVAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NVELELKAEKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAKVVLSKLPIGDVAT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 QYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGRCQVFEETQIGGERYNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGRCQVFEETQIGGERYNF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 FTGCPKAKTCTFILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FTGCPKAKTCTFILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 RDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGTWYGVDIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGTWYGVDIN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 NEDIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKNPRSTVDAPTAAGRGRGRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NEDIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKNPRSTVDAPTAAGRGRGRG
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 RPH
:::
CCDS46 RPH
>>CCDS54367.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 (499 aa)
initn: 3213 init1: 3213 opt: 3213 Z-score: 3968.1 bits: 743.9 E(32554): 1.1e-214
Smith-Waterman score: 3213; 100.0% identity (100.0% similar) in 499 aa overlap (45-543:1-499)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 SSQGIPQLVSNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKLIVDGRGKATISNDGATILKLLDVVHP
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MDKLIVDGRGKATISNDGATILKLLDVVHP
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 AAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQIIIRAFRTATQLAVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQIIIRAFRTATQLAVN
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 KIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQKAFFAKMVVDAVMMLDDLLQLKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQKAFFAKMVVDAVMMLDDLLQLKM
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 IGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYHNPKIALLNVELELKAEKDNAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYHNPKIALLNVELELKAEKDNAE
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 IRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRV
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 PEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGRCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTFIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGRCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTFIL
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 RGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLL
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KB5 IGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGTWYGVDINNEDIADNFEAFVWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGTWYGVDINNEDIADNFEAFVWE
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540
pF1KB5 PAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKNPRSTVDAPTAAGRGRGRGRPH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKNPRSTVDAPTAAGRGRGRGRPH
460 470 480 490
>>CCDS54366.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 (456 aa)
initn: 2937 init1: 2937 opt: 2937 Z-score: 3627.8 bits: 680.8 E(32554): 9.5e-196
Smith-Waterman score: 2937; 100.0% identity (100.0% similar) in 454 aa overlap (90-543:3-456)
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 NDGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQ
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MMVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQ
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 IIIRAFRTATQLAVNKIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQKAFFAKMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IIIRAFRTATQLAVNKIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQKAFFAKMV
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 VDAVMMLDDLLQLKMIGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYHNPKIAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VDAVMMLDDLLQLKMIGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYHNPKIAL
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 LNVELELKAEKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAKVVLSKLPIGDVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LNVELELKAEKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAKVVLSKLPIGDVA
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 TQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGRCQVFEETQIGGERYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGRCQVFEETQIGGERYN
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 FFTGCPKAKTCTFILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FFTGCPKAKTCTFILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKY
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 LRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGTWYGVDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGTWYGVDI
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 NNEDIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKNPRSTVDAPTAAGRGRGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NNEDIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKNPRSTVDAPTAAGRGRGR
400 410 420 430 440 450
540
pF1KB5 GRPH
::::
CCDS54 GRPH
>>CCDS42696.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 (339 aa)
initn: 2226 init1: 2226 opt: 2226 Z-score: 2751.7 bits: 518.2 E(32554): 5.9e-147
Smith-Waterman score: 2226; 99.4% identity (99.7% similar) in 339 aa overlap (205-543:1-339)
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 FAKMVVDAVMMLDDLLQLKMIGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYHN
. ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MMDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYHN
10 20 30
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 PKIALLNVELELKAEKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAKVVLSKLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PKIALLNVELELKAEKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAKVVLSKLP
40 50 60 70 80 90
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 IGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGRCQVFEETQIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGRCQVFEETQIG
100 110 120 130 140 150
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 GERYNFFTGCPKAKTCTFILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GERYNFFTGCPKAKTCTFILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEM
160 170 180 190 200 210
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 ELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGTW
220 230 240 250 260 270
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 YGVDINNEDIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKNPRSTVDAPTAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 YGVDINNEDIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKNPRSTVDAPTAAG
280 290 300 310 320 330
540
pF1KB5 RGRGRGRPH
:::::::::
CCDS42 RGRGRGRPH
>>CCDS8991.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 (535 aa)
initn: 897 init1: 455 opt: 1012 Z-score: 1248.7 bits: 240.8 E(32554): 3.1e-63
Smith-Waterman score: 1012; 35.6% identity (67.2% similar) in 528 aa overlap (5-527:8-529)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MMPTPVILLKEGTDSSQG-IPQLVSNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKLIVD-GRGK
:: ..: :.: .. .:.: :.: .:.. :..::::.::::.... ::
CCDS89 MASLSLAPVNIFKAGADEERAETARLTSFIGAI-AIGDLVKSTLGPKGMDKILLSSGRDA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 AT-ISNDGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEE
. ..:::::::: . : .::::.:::... :: ::::::::::.::::.:.... . .
CCDS89 SLMVTNDGATILKNIGVDNPAAKVLVDMSRVQDDEVGDGTTSVTVLAAELLREAESLIAK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 GLHPQIIIRAFRTATQLAVNKIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQKAF
.::: :: ..: ::. : . . :: . .:.:. :. : . : :.:::::....:
CCDS89 KIHPQTIIAGWREATKAAREALLSSAVD-HGSDEVKFRQDLMNIAGTTLSSKLLTHHKDH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 FAKMVVDAVMMLDDLLQLKMIGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYHN
:.:..:.::. : .:. : : : ::.: :: : : . : .. :::. .:
CCDS89 FTKLAVEAVLRLKGSGNLEAIHIIKKLGGSLADSYLDEGFLLDKKIGVN----QPKRIEN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 PKIALLNVELEL-KAEKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAKVVLSKL
:: . :. .. : . ....:: .. : :: . . .:.:.: . : . ...
CCDS89 AKILIANTGMDTDKIKIFGSRVRVDSTAKVAEIEHAEKEKMKEKVERILKHGINCFINRQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 PIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGRCQVFEETQI
: . : :. .. .. ..: .. :: : .. . :: :...::..:
CCDS89 LIYNYPEQLFGAAGVMAIEHADFAGVERLALVTGGEIASTFDHPELVKLGSCKLIEEVMI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 GGERYNFFTGCPKAKTCTFILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIE
: .. :.: ...::..:::...:...:.:::::::. .. ...:.. .: ::: :
CCDS89 GEDKLIHFSGVALGEACTIVLRGATQQILDEAERSLHDALCVLAQTVKDSRTVYGGGCSE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 MELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGT
: ... . . . :::. . . .:::::...: . ::::.:..... .::: :..:.:
CCDS89 MLMAHAVTQLANRTPGKEAVAMESYAKALRMLPTIIADNAGYDSADLVAQLRAAHSEGNT
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 WYGVDINNEDIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKN-PRSTVDAPTA
:.:. . :.: . : .:. ..: .:.::: .:. ::. :: ::. :
CCDS89 TAGLDMREGTIGDMAILGITESFQVKRQVLLSAAEAAEVILRVDNIIKAAPRKRVPDHHP
480 490 500 510 520 530
540
pF1KB5 AGRGRGRGRPH
CCDS89 C
>>CCDS33206.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 (539 aa)
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10 20 30 40 50
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::::: ...:.:.::.:::.::::.: ::.
CCDS33 APRSGATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKMIQDGK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GKATISNDGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVE
: .::.:::::::: ..:.::::. ::...:.:: :.:::::::...:. .: . ..
CCDS33 GDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSCTKLLQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 EGLHPQIIIRAFRTATQLAVNKIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQKA
.:.:: :: ..:. : . ... . ... :. .: :. : . : :.:.::..:: ..
CCDS33 KGIHPTIISESFQKALEKGIEILTDMSRPVELSD----RETLLNSATTSLNSKVVSQYSS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
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... : :.::: . : ..:. : : : ::...: .:: :... . : .:.
CCDS33 LLSPMSVNAVMKVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGIT--
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 PKKYHNPKIALLNVELEL-KAEKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAK
. .. ::.:.. : :.. :: .: : ... .. : . . ...:...: .
CCDS33 --RVEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDN-QIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCN
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 VVLSKLPI-----GDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVL
:.: . : .:.: ... .. . .::.. . : . . .. ..::.:
CCDS33 VLLIQKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADML
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 GRCQVFEETQIGGE-RYNFFTGCPK-AKTCTFILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAI
: .. ::....: . .::: . .:: :...::. . .::.:::.:::. ..: .
CCDS33 GSAELAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLV
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 KNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNI
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CCDS33 KKRALIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPIST
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 LNKLRARHAQGGTWYGVDINNEDIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETI
...:: ::::: :... . :.. .: .: .: .: ..::: :.:.. :...:...
CCDS33 VTELRNRHAQGEKTAGINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVV
480 490 500 510 520 530
530 540
pF1KB5 KNPRSTVDAPTAAGRGRGRGRPH
: :
CCDS33 -NTR
>>CCDS1140.2 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 (545 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB5 MMPTPVILLKEGTDSSQGIPQLVSNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKLIVDGRGKATIS
: ::..:...: .: .::.: ..::. .:: :::..: :...: : ...
CCDS11 MMGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPMGGIVMT
10 20 30 40 50 60
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pF1KB5 NDGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQ
::: .::. ..: :::::....:...:: ::::::::: .::.:.:. .. ..:. .::
CCDS11 NDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQMHPT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 IIIRAFRTATQLAVNKIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQKAFFAKMV
..: :.: : . .. .:.:.. : .:. .. . .....: ::. ... ...
CCDS11 VVISAYRKALDDMISTLKKISIPVDISDS----DMMLNIINSSITTKAISRWSSLACNIA
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 VDAVMMLD-------DLLQLKMIGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKY
.::: :.. .. :. ..:. :: .::: .. :: ..: .. . ..:
CCDS11 LDAVKMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHP----RMRRY
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 -HNPKIALLNVELELKAEKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAKVVLS
.::.:.::. :: : .....:.. ::. :.. : . . . : : . ::..
CCDS11 IKNPRIVLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDVVIT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 KLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGR-CQVFEE
. :.:.: .:. .. :: . : .: :::. : . . : : .: ..:
CCDS11 EKGISDLAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVGTGAGLLEI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 TQIGGERYNFFTGCPKAKTCTFILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGG
.:: : ..:.: : :.::..:::...... :.::.:.::... : .. . ..: :::
CCDS11 KKIGDEYFTFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQLVPGGG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 AIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQ
: :: ... : . :... : .: : :.:::.::: : .: : .. .:..:::.:.:
CCDS11 ASEMAVAHALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTSLRAKHTQ
420 430 440 450 460 470
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pF1KB5 GG--TWYGVDINNEDIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKNPRSTVD
. :: ::. .. ..: : .::: :.... .: :.: :.. .:. ... .. :
CCDS11 ENCETW-GVNGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIVSGHKKKGD
480 490 500 510 520 530
530 540
pF1KB5 APTAAGRGRGRGRPH
. :
CCDS11 DQSRQGGAPDAGQE
540
>>CCDS55843.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 (488 aa)
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20 30 40 50 60 70
pF1KB5 SSQGIPQLVSNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKLIVD-GRGKAT-ISNDGATILKLLDVV
:::.... :: . ..:::::::: . :
CCDS55 MDKILLSSGRDASLMVTNDGATILKNIGVD
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 HPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQIIIRAFRTATQLA
.::::.:::... :: ::::::::::.::::.:.... . . .::: :: ..: ::. :
CCDS55 NPAAKVLVDMSRVQDDEVGDGTTSVTVLAAELLREAESLIAKKIHPQTIIAGWREATKAA
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 VNKIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQKAFFAKMVVDAVMMLDDLLQL
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CCDS55 REALLSSAVD-HGSDEVKFRQDLMNIAGTTLSSKLLTHHKDHFTKLAVEAVLRLKGSGNL
100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 KMIGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYHNPKIALLNVELEL-KAEKD
. : : : ::.: :: : : . : .. :::. .: :: . :. .. : .
CCDS55 EAIHIIKKLGGSLADSYLDEGFLLDKKIGVN----QPKRIENAKILIANTGMDTDKIKIF
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 NAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCA
....:: .. : :: . . .:.:.: . : . ... : . : :. ..
CCDS55 GSRVRVDSTAKVAEIEHAEKEKMKEKVERILKHGINCFINRQLIYNYPEQLFGAAGVMAI
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 GRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGRCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCT
.. ..: .. :: : .. . :: :...::..:: .. :.: ...::
CCDS55 EHADFAGVERLALVTGGEIASTFDHPELVKLGSCKLIEEVMIGEDKLIHFSGVALGEACT
270 280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 FILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQ
..:::...:...:.:::::::. .. ...:.. .: ::: :: ... . . . :::.
CCDS55 IVLRGATQQILDEAERSLHDALCVLAQTVKDSRTVYGGGCSEMLMAHAVTQLANRTPGKE
330 340 350 360 370 380
440 450 460 470 480 490
pF1KB5 QLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGTWYGVDINNEDIADNFEAF
. . .:::::...: . ::::.:..... .::: :..:.: :.:. . :.:
CCDS55 AVAMESYAKALRMLPTIIADNAGYDSADLVAQLRAAHSEGNTTAGLDMREGTIGDMAILG
390 400 410 420 430 440
500 510 520 530 540
pF1KB5 VWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKN-PRSTVDAPTAAGRGRGRGRPH
. : .:. ..: .:.::: .:. ::. :: ::. :
CCDS55 ITESFQVKRQVLLSAAEAAEVILRVDNIIKAAPRKRVPDHHPC
450 460 470 480
>>CCDS5269.1 TCP1 gene_id:6950|Hs108|chr6 (556 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MMPTPVILLKEGTDSSQGIPQLVSNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKLIVDGRGKATISN
: : : .:. : ::. :...::: :.::..:: : .::.:
CCDS52 MEGPLSVFGDRSTGETIRSQNVMAAASIANIVKSSLGPVGLDKMLVDDIGDVTITN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 DGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQI
:::::::::.: :::::.: ..: :: :::::::::...:::.::.. :.. .::
CCDS52 DGATILKLLEVEHPAAKVLCELADLQDKEVGDGTTSVVIIAAELLKNADELVKQKIHPTS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 IIRAFRTATQLAVNKIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQKAFFAKMVV
.: ..: : . :: :.: .. ..:.. : : . : :..:::.:. . :::.:::
CCDS52 VISGYRLACKEAVRYINENLIV--NTDEL-GRDCLINAAKTSMSSKIIGINGDFFANMVV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB5 DAVMMLD--DL-----LQLKMIGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYH
:::. . :. .. ..: :..: . .:.:..: :.. .: . .::.
CCDS52 DAVLAIKYTDIRGQPRYPVNSVNILKAHGRSQMESMLISGYALN---CVVGSQGMPKRIV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 NPKIALLNVELELKAEKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAKVVLSKL
: ::: :. :. : .... . : . : . : .: ....:: .::.:.:.
CCDS52 NAKIACLDFSLQKTKMKLGVQVVITDPEKLDQIRQRESDITKERIQKILATGANVILTTG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB5 PIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALS------ADVLGRCQV
: :. .::.. . . :: ..:::: : :..: ... : : .::. .
CCDS52 GIDDMCLKYFVEAGAMAVRRVLKRDLKRIAKASGATILSTLANLEGEETFEAAMLGQAEE
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 FEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTFILRGGAEQFM-EETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVV
. .: .. .. . ::.: . :. ::..:: .: :::::::. .:.:.... :::
CCDS52 VVQERICDDELILIKNT-KARTSASIILRGANDFMCDEMERSLHDALCVVKRVLESKSVV
360 370 380 390 400
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pF1KB5 AGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRA
::::.: :: ::..:. .. ...:: :. .:..: .:: : ::. :.:... ::::
CCDS52 PGGGAVEAALSIYLENYATSMGSREQLAIAEFARSLLVIPNTLAVNAAQDSTDLVAKLRA
410 420 430 440 450 460
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pF1KB5 RHAQGGT--------WYGVDINNEDIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDE
: .. . : :.:..: :: .: :.::..:....: :.::: :. .:.
CCDS52 FHNEAQVNPERKNLKWIGLDLSNGKPRDNKQAGVFEPTIVKVKSLKFATEAAITILRIDD
470 480 490 500 510 520
520 530 540
pF1KB5 TIK-NPRSTVDAPTAAGRGRGRGRPH
:: .:.: :
CCDS52 LIKLHPESKDDKHGSYEDAVHSGALND
530 540 550
>>CCDS3877.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 (541 aa)
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10 20 30 40
pF1KB5 MMPTPVILLKEGTDSSQ--GIPQLVSNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKL
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CCDS38 MASMGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKM
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 IVDGRGKATISNDGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQV
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CCDS38 MVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEA
70 80 90 100 110 120
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pF1KB5 KPYVEEGLHPQIIIRAFRTATQLAVNKIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLI
. ...:.:: : ... :...:.... .:. .: .: ... . : . : :.:.::..
CCDS38 EQLLDRGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVL-VD-IKDTEPLIQTAKTTLGSKVV
130 140 150 160 170
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pF1KB5 SQQKAFFAKMVVDAVMMLDDL----LQLKMIGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAG
.. . .:...:.::. . :. .....: .. :: :::..:. :: : ::.
CCDS38 NSCHRQMAEIAVNAVLTVADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHP-
180 190 200 210 220 230
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pF1KB5 FEMQPKKYHNPKIALLNVELELKAEKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHS
..::: .. :::.:. .: : . .. : .::::.:. : . . . ...:...
CCDS38 --QMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKET
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 GAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGR
::.... . . : :.. . . .. . : ... .: :: : . :.:. ::
CCDS38 GANLAICQWGFDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGF
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 CQVFEETQIGGERYNFFT--GCPKAKTCTFILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKN
. .: ..: . .... : .... :...::: ....::..::::::. ..: :..
CCDS38 AGLVQEISFGTTKDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRD
360 370 380 390 400 410
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pF1KB5 DSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILN
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CCDS38 NRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMT
420 430 440 450 460 470
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pF1KB5 KLRARHAQG-GTWYGVDINNEDIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIK
..:::... . :.: .. : . : : . . . .. :.. . .:...:. :.
CCDS38 EVRARQVKEMNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDD-IR
480 490 500 510 520 530
530 540
pF1KB5 NPRSTVDAPTAAGRGRGRGRPH
.:
CCDS38 KPGESEE
540
543 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 16:19:24 2016 done: Thu Nov 3 16:19:25 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]