Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5184
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5184, 606 aa
1>>>pF1KB5184 606 - 606 aa - 606 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7627+/-0.000979; mu= 9.3468+/- 0.059
mean_var=162.8276+/-32.709, 0's: 0 Z-trim(110.0): 51 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.100510
statistics sampled from 11269 (11319) to 11269 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.688), E-opt: 0.2 (0.348), width: 16
Scan time: 4.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14362.1 MAGED2 gene_id:10916|Hs108|chrX ( 606) 3842 569.4 4.7e-162
CCDS43959.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1431) 1431 220.1 1.6e-56
CCDS59528.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1034) 1368 210.8 7.1e-54
CCDS43958.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 706) 1273 196.9 7.3e-50
CCDS59527.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 309) 1210 187.5 2.2e-47
CCDS14337.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 778) 1208 187.5 5.4e-47
CCDS35279.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 834) 1208 187.5 5.8e-47
CCDS59529.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 962) 1179 183.4 1.2e-45
CCDS35281.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 739) 1073 167.9 4.1e-41
CCDS48116.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX ( 739) 1073 167.9 4.1e-41
CCDS14338.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 741) 1073 167.9 4.1e-41
CCDS56602.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 757) 785 126.2 1.6e-28
CCDS65261.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX ( 757) 785 126.2 1.6e-28
CCDS10023.1 NSMCE3 gene_id:56160|Hs108|chr15 ( 304) 739 119.2 7.8e-27
CCDS3269.1 MAGEF1 gene_id:64110|Hs108|chr3 ( 307) 737 118.9 9.6e-27
CCDS73700.1 MAGEL2 gene_id:54551|Hs108|chr15 (1249) 686 112.0 4.8e-24
CCDS14433.1 MAGEE1 gene_id:57692|Hs108|chrX ( 957) 670 109.6 2e-23
CCDS10014.1 NDN gene_id:4692|Hs108|chr15 ( 321) 650 106.3 6.2e-23
CCDS35221.1 MAGEB10 gene_id:139422|Hs108|chrX ( 347) 627 103.0 6.7e-22
CCDS14221.1 MAGEB4 gene_id:4115|Hs108|chrX ( 346) 609 100.4 4.1e-21
CCDS59524.1 MAGEB17 gene_id:645864|Hs108|chrX ( 336) 601 99.2 8.9e-21
CCDS14220.1 MAGEB3 gene_id:4114|Hs108|chrX ( 346) 601 99.2 9.1e-21
CCDS14219.1 MAGEB2 gene_id:4113|Hs108|chrX ( 319) 600 99.1 9.4e-21
CCDS14216.1 MAGEB18 gene_id:286514|Hs108|chrX ( 343) 595 98.4 1.6e-20
CCDS43927.1 MAGEB16 gene_id:139604|Hs108|chrX ( 324) 591 97.8 2.4e-20
CCDS14222.1 MAGEB1 gene_id:4112|Hs108|chrX ( 347) 572 95.0 1.7e-19
CCDS14705.1 MAGEA10 gene_id:4109|Hs108|chrX ( 369) 571 94.9 1.9e-19
CCDS48180.1 MAGEA11 gene_id:4110|Hs108|chrX ( 429) 563 93.8 4.9e-19
CCDS14692.1 MAGEA8 gene_id:4107|Hs108|chrX ( 318) 533 89.4 7.9e-18
CCDS14217.1 MAGEB6 gene_id:158809|Hs108|chrX ( 407) 531 89.1 1.2e-17
CCDS35417.1 MAGEC1 gene_id:9947|Hs108|chrX (1142) 537 90.3 1.4e-17
CCDS76051.1 MAGEA1 gene_id:4100|Hs108|chrX ( 309) 522 87.8 2.3e-17
CCDS14677.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 346) 503 85.0 1.7e-16
CCDS14702.1 MAGEA4 gene_id:4103|Hs108|chrX ( 317) 499 84.4 2.4e-16
CCDS14678.1 MAGEC2 gene_id:51438|Hs108|chrX ( 373) 493 83.6 5e-16
CCDS65233.1 MAGEB5 gene_id:347541|Hs108|chrX ( 275) 480 81.6 1.5e-15
CCDS35423.1 MAGEA9B gene_id:728269|Hs108|chrX ( 315) 477 81.2 2.2e-15
CCDS14691.1 MAGEA9 gene_id:4108|Hs108|chrX ( 315) 477 81.2 2.2e-15
CCDS14431.1 MAGEE2 gene_id:139599|Hs108|chrX ( 523) 479 81.7 2.7e-15
CCDS76045.1 MAGEA3 gene_id:4102|Hs108|chrX ( 314) 471 80.4 4e-15
CCDS76050.1 MAGEA6 gene_id:4105|Hs108|chrX ( 314) 468 79.9 5.4e-15
CCDS76048.1 MAGEA12 gene_id:4111|Hs108|chrX ( 314) 455 78.0 2e-14
CCDS76049.1 MAGEA2 gene_id:4101|Hs108|chrX ( 314) 446 76.7 4.9e-14
CCDS76046.1 MAGEA2B gene_id:266740|Hs108|chrX ( 314) 446 76.7 4.9e-14
CCDS14369.1 MAGEH1 gene_id:28986|Hs108|chrX ( 219) 412 71.7 1.1e-12
>>CCDS14362.1 MAGED2 gene_id:10916|Hs108|chrX (606 aa)
initn: 3842 init1: 3842 opt: 3842 Z-score: 3022.8 bits: 569.4 E(32554): 4.7e-162
Smith-Waterman score: 3842; 100.0% identity (100.0% similar) in 606 aa overlap (1-606:1-606)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSDTSESGAGLTRFQAEASEKDSSSMMQTLLTVTQNVEVPETPKASKALEVSEDVKVSKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MSDTSESGAGLTRFQAEASEKDSSSMMQTLLTVTQNVEVPETPKASKALEVSEDVKVSKA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SGVSKATEVSKTPEAREAPATQASSTTQLTDTQVLAAENKSLAADTKKQNADPQAVTMPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SGVSKATEVSKTPEAREAPATQASSTTQLTDTQVLAAENKSLAADTKKQNADPQAVTMPA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 TETKKVSHVADTKVNTKAQETEAAPSQAPADEPEPESAAAQSQENQDTRPKVKAKKARKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TETKKVSHVADTKVNTKAQETEAAPSQAPADEPEPESAAAQSQENQDTRPKVKAKKARKV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KHLDGEEDGSSDQSQASGTTGGRRVSKALMASMARRASRGPIAFWARRASRTRLAAWARR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KHLDGEEDGSSDQSQASGTTGGRRVSKALMASMARRASRGPIAFWARRASRTRLAAWARR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 ALLSLRSPKARRGKARRRAAKLQSSQEPEAPPPRDVALLQGRANDLVKYLLAKDQTKIPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ALLSLRSPKARRGKARRRAAKLQSSQEPEAPPPRDVALLQGRANDLVKYLLAKDQTKIPI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 KRSDMLKDIIKEYTDVYPEIIERAGYSLEKVFGIQLKEIDKNDHLYILLSTLEPTDAGIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KRSDMLKDIIKEYTDVYPEIIERAGYSLEKVFGIQLKEIDKNDHLYILLSTLEPTDAGIL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 GTTKDSPKLGLLMVLLSIIFMNGNRSSEAVIWEVLRKLGLRPGIHHSLFGDVKKLITDEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GTTKDSPKLGLLMVLLSIIFMNGNRSSEAVIWEVLRKLGLRPGIHHSLFGDVKKLITDEF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 VKQKYLDYARVPNSNPPEYEFFWGLRSYYETSKMKVLKFACKVQKKDPKEWAAQYREAME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VKQKYLDYARVPNSNPPEYEFFWGLRSYYETSKMKVLKFACKVQKKDPKEWAAQYREAME
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 ADLKAAAEAAAEAKARAEIRARMGIGLGSENAAGPCNWDEADIGPWAKARIQAGAEAKAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ADLKAAAEAAAEAKARAEIRARMGIGLGSENAAGPCNWDEADIGPWAKARIQAGAEAKAK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 AQESGSASTGASTSTNNSASASASTSGGFSAGASLTATLTFGLFAGLGGAGASTSGSSGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AQESGSASTGASTSTNNSASASASTSGGFSAGASLTATLTFGLFAGLGGAGASTSGSSGA
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 CGFSYK
::::::
CCDS14 CGFSYK
>>CCDS43959.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1431 aa)
initn: 1633 init1: 893 opt: 1431 Z-score: 1128.1 bits: 220.1 E(32554): 1.6e-56
Smith-Waterman score: 1468; 45.8% identity (70.4% similar) in 612 aa overlap (30-605:175-759)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MSDTSESGAGLTRFQAEASEKDSSSMMQTLLTVTQNVEVPETPKASKALEVSEDVKVSK
: ...::...: . ..... . ..: .:
CCDS43 VTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQLKSPLQVLKLPVISQNIHAPIANESASSQALITSIKPKK
150 160 170 180 190 200
60 70 80 90 100
pF1KB5 AS--------GVSKATEVSKTPEAREAPATQASSTTQLTDTQVLAAENKSLAADTKKQ--
:: ....::::: . : .. .::.. :.. .. .. :: .. :. ..
CCDS43 ASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITNETASIHTTAASIRTKKASKARKTI
210 220 230 240 250 260
110 120 130 140 150
pF1KB5 ----NADPQ-----AVTMPATETKKVSHVADTKVNTKAQETEAAPSQAPADEPEPESA--
:.: . :: ::. ..: :: . : .. . : :..: . : :
CCDS43 AKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVA---IRPKKSKGKKAASRGPNSVSEISEAPL
270 280 290 300 310 320
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 AAQSQENQDTRPKVKAKKARKVKHLDGEEDGSSDQSQASGTTGGRRVSKALMASMARRAS
:.: :: ...:.. .... . . . .::. .. : ..: .:: .:
CCDS43 ATQIVTNQALAATLRVKRGSRARK--AATKARATESQTPNADQG---AQAKIASAQTNVS
330 340 350 360 370
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 RGPIAFWARRASRTRLAAWARRALLSLRSPKARRGKARRRAAKLQSSQEP-----EAP--
:. .. :. .. : : :::. ::: :.. .:..... . :
CCDS43 ----ALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDERSGSNYRRIPWG
380 390 400 410 420 430
280 290 300 310 320
pF1KB5 ----PPRDVALLQGRANDLVKYLLAKDQTKIPIKRSDMLKDIIKEYTDVYPEIIERAGYS
::::::.:: ::: ::::::.::::::::::::::.:.:.:: . .:::::::.:.
CCDS43 RRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYT
440 450 460 470 480 490
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 LEKVFGIQLKEIDKNDHLYILLSTLEPTDAGILGTTKDSPKLGLLMVLLSIIFMNGNRSS
:::.: ..::::::.. ::::.:: : ..:::::::::.::::::::.::.::::::..:
CCDS43 LEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQE-SSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKAS
500 510 520 530 540 550
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 EAVIWEVLRKLGLRPGIHHSLFGDVKKLITDEFVKQKYLDYARVPNSNPPEYEFFWGLRS
::::::::::::::::..:::::.:.:::::::::::::.: ::::: ::::::::::::
CCDS43 EAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRS
560 570 580 590 600 610
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 YYETSKMKVLKFACKVQKKDPKEWAAQYREAMEADLKAAAEAAAEAKARAEIRARMGIGL
:.::::::::::::.:::::::.::.:::::.: ...::: :.:::.:::: ::.::::
CCDS43 YHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEARAQMGIG-
620 630 640 650 660 670
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 GSENAAGPCNWDEADIGPWAKARIQAGAEAKAKAQES----GSASTGASTSTNNSASASA
: .::: :::. :: .: . : .:.: .. : . :. .:..::: . : .:
CCDS43 -EEAVAGPWNWDDMDID--CLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTNVNFSRGA
680 690 700 710 720
570 580 590 600
pF1KB5 STSGGFSAGASLTATLTFGLFAGLGGAGASTSGSSGACGFSYK
:: .::: :::.. ..:: .:..: ::. :...
CCDS43 STRAGFSDGASIS----------FNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISF
730 740 750 760 770
CCDS43 GGTLSTSSSFSSAASISFGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLST
780 790 800 810 820 830
>>CCDS59528.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1034 aa)
initn: 1633 init1: 893 opt: 1368 Z-score: 1080.8 bits: 210.8 E(32554): 7.1e-54
Smith-Waterman score: 1373; 62.7% identity (82.2% similar) in 359 aa overlap (251-605:24-362)
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 PIAFWARRASRTRLAAWARRALLSLRSPKARRGKARRRAAKLQSSQEPEAPPPRDVALLQ
: :. :: . ...: ::::::.::
CCDS59 MDRRNDYGYRVPLFQSKHLNGDERSGSNYRR---IPWGRRPA--PPRDVAILQ
10 20 30 40
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 GRANDLVKYLLAKDQTKIPIKRSDMLKDIIKEYTDVYPEIIERAGYSLEKVFGIQLKEID
::: ::::::.::::::::::::::.:.:.:: . .:::::::.:.:::.: ..:::::
CCDS59 ERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEID
50 60 70 80 90 100
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 KNDHLYILLSTLEPTDAGILGTTKDSPKLGLLMVLLSIIFMNGNRSSEAVIWEVLRKLGL
:.. ::::.:: : ..:::::::::.::::::::.::.::::::..::::::::::::::
CCDS59 KQSSLYILISTQE-SSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGL
110 120 130 140 150 160
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 RPGIHHSLFGDVKKLITDEFVKQKYLDYARVPNSNPPEYEFFWGLRSYYETSKMKVLKFA
:::..:::::.:.:::::::::::::.: ::::: :::::::::::::.:::::::::::
CCDS59 RPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFA
170 180 190 200 210 220
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 CKVQKKDPKEWAAQYREAMEADLKAAAEAAAEAKARAEIRARMGIGLGSENAAGPCNWDE
:.:::::::.::.:::::.: ...::: :.:::.:::: ::.::: : : .::: :::.
CCDS59 CRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEARAQMGI--GEEAVAGPWNWDD
230 240 250 260 270 280
530 540 550 560 570
pF1KB5 ADIGPWAKARIQAGAEAKAKAQES----GSASTGASTSTNNSASASASTSGGFSAGASLT
:: .: . : .:.: .. : . :. .:..::: . : .::: .::: :::..
CCDS59 MDID--CLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTNVNFSRGASTRAGFSDGASIS
290 300 310 320 330 340
580 590 600
pF1KB5 ATLTFGLFAGLGGAGASTSGSSGACGFSYK
..:: .:..: ::. :...
CCDS59 ----------FNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGTLSTSSSFSSA
350 360 370 380 390
>>CCDS43958.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (706 aa)
initn: 905 init1: 825 opt: 1273 Z-score: 1008.6 bits: 196.9 E(32554): 7.3e-50
Smith-Waterman score: 1305; 46.1% identity (70.7% similar) in 529 aa overlap (30-526:175-687)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MSDTSESGAGLTRFQAEASEKDSSSMMQTLLTVTQNVEVPETPKASKALEVSEDVKVSK
: ...::...: . ..... . ..: .:
CCDS43 VTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQLKSPLQVLKLPVISQNIHAPIANESASSQALITSIKPKK
150 160 170 180 190 200
60 70 80 90 100
pF1KB5 AS--------GVSKATEVSKTPEAREAPATQASSTTQLTDTQVLAAENKSLAADTKKQ--
:: ....::::: . : .. .::.. :.. .. .. :: .. :. ..
CCDS43 ASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITNETASIHTTAASIRTKKASKARKTI
210 220 230 240 250 260
110 120 130 140 150
pF1KB5 ----NADPQ-----AVTMPATETKKVSHVADTKVNTKAQETEAAPSQAPADEPEPESA--
:.: . :: ::. ..: :: . : .. . : :..: . : :
CCDS43 AKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVA---IRPKKSKGKKAASRGPNSVSEISEAPL
270 280 290 300 310 320
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 AAQSQENQDTRPKVKAKKARKVKHLDGEEDGSSDQSQASGTTGGRRVSKALMASMARRAS
:.: :: ...:.. .... . . . .::. .. : ..: .:: .:
CCDS43 ATQIVTNQALAATLRVKRGSRARK--AATKARATESQTPNADQG---AQAKIASAQTNVS
330 340 350 360 370
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 RGPIAFWARRASRTRLAAWARRALLSLRSPKARRGKARRRAAKLQSSQEP-----EAP--
:. .. :. .. : : :::. ::: :.. .:..... . :
CCDS43 ----ALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDERSGSNYRRIPWG
380 390 400 410 420 430
280 290 300 310 320
pF1KB5 ----PPRDVALLQGRANDLVKYLLAKDQTKIPIKRSDMLKDIIKEYTDVYPEIIERAGYS
::::::.:: ::: ::::::.::::::::::::::.:.:.:: . .:::::::.:.
CCDS43 RRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYT
440 450 460 470 480 490
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 LEKVFGIQLKEIDKNDHLYILLSTLEPTDAGILGTTKDSPKLGLLMVLLSIIFMNGNRSS
:::.: ..::::::.. ::::.:: : ..:::::::::.::::::::.::.::::::..:
CCDS43 LEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQE-SSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKAS
500 510 520 530 540 550
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 EAVIWEVLRKLGLRPGIHHSLFGDVKKLITDEFVKQKYLDYARVPNSNPPEYEFFWGLRS
::::::::::::::::..:::::.:.:::::::::::::.: ::::: ::::::::::::
CCDS43 EAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRS
560 570 580 590 600 610
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 YYETSKMKVLKFACKVQKKDPKEWAAQYREAMEADLKAAAEAAAEAKARAEIRARMGIGL
:.::::::::::::.:::::::.::.:::::.: ...::: :.:::.::::: . . .
CCDS43 YHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEIYSPC-LQI
620 630 640 650 660 670
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 GSENAAGPCNWDEADIGPWAKARIQAGAEAKAKAQESGSASTGASTSTNNSASASASTSG
: ..: . : . ::
CCDS43 PLINCSSPSHG--AKVHPWNLCPHSSQGSYGQSAEGVM
680 690 700
>>CCDS59527.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (309 aa)
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230 240 250 260 270 280
pF1KB5 PIAFWARRASRTRLAAWARRALLSLRSPKARRGKARRRAAKLQSSQEPEAPPPRDVALLQ
: :. :: . ...: ::::::.::
CCDS59 MDRRNDYGYRVPLFQSKHLNGDERSGSNYRR---IPWGRRPA--PPRDVAILQ
10 20 30 40
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 GRANDLVKYLLAKDQTKIPIKRSDMLKDIIKEYTDVYPEIIERAGYSLEKVFGIQLKEID
::: ::::::.::::::::::::::.:.:.:: . .:::::::.:.:::.: ..:::::
CCDS59 ERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEID
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350 360 370 380 390 400
pF1KB5 KNDHLYILLSTLEPTDAGILGTTKDSPKLGLLMVLLSIIFMNGNRSSEAVIWEVLRKLGL
:.. ::::.:: : ..:::::::::.::::::::.::.::::::..::::::::::::::
CCDS59 KQSSLYILISTQE-SSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGL
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410 420 430 440 450 460
pF1KB5 RPGIHHSLFGDVKKLITDEFVKQKYLDYARVPNSNPPEYEFFWGLRSYYETSKMKVLKFA
:::..:::::.:.:::::::::::::.: ::::: :::::::::::::.:::::::::::
CCDS59 RPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFA
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pF1KB5 CKVQKKDPKEWAAQYREAMEADLKAAAEAAAEAKARAEIRAR-MGIGLGSENAAGPCNWD
:.:::::::.::.:::::.: ...::: :.:::.::::: . . : : : ..: .
CCDS59 CRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEIYSPCLQIPLI--NCSSPSH--
230 240 250 260 270 280
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 EADIGPWAKARIQAGAEAKAKAQESGSASTGASTSTNNSASASASTSGGFSAGASLTATL
: . ::
CCDS59 GAKVHPWNLCPHSSQGSYGQSAEGVM
290 300
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230 240 250 260 270 280
pF1KB5 RRASRTRLAAWARRALLSLRSPKARRGKARRRAAKLQSSQEPEAPPPRDVALLQGRANDL
: . . ..::.: : :::::::: ::: :
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pF1KB5 VKYLLAKDQTKIPIKRSDMLKDIIKEYTDVYPEIIERAGYSLEKVFGIQLKEIDKNDHLY
::::. :: ::.:::::.::.:::.::::::::::::: . ::: ::::::::::..:::
CCDS14 VKYLMLKDYTKVPIKRSEMLRDIIREYTDVYPEIIERACFVLEKKFGIQLKEIDKEEHLY
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pF1KB5 ILLSTLEPTDAGILGTTKDSPKLGLLMVLLSIIFMNGNRSSEAVIWEVLRKLGLRPGIHH
::.:: : :::::::::.::::::.:.:..:::::::.::::.::.:::.:::::..:
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pF1KB5 SLFGDVKKLITDEFVKQKYLDYARVPNSNPPEYEFFWGLRSYYETSKMKVLKFACKVQKK
:.::..::.: :::::::::: ::::::::::::.::::::.::::::::.: .:::.
CCDS14 PLLGDLRKLLTYEFVKQKYLDYRRVPNSNPPEYEFLWGLRSYHETSKMKVLRFIAEVQKR
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pF1KB5 DPKEWAAQYREAMEADLKAAAEAAAEAKARAEIRARMGIGLGSENAAGPCNWD-------
::..:.::. :: . : : :::::.:::: :.::::: .: ..:: .::
CCDS14 DPRDWTAQFMEAADEALDALDAAAAEAEARAEARTRMGIG--DEAVSGPWSWDDIEFELL
660 670 680 690 700 710
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 ----EADIG-PWAKARIQAGAEAKAKAQESGSASTGASTSTNNSASASASTSGGFSAGAS
:.:.: ::.. . :. . .:. : .: :. . ...:::. ...:.:
CCDS14 TWDEEGDFGDPWSRIPFTFWARYHQNAR-SRFPQTFAGPIIGPGGTASANFAANFGAIGF
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580 590 600
pF1KB5 LTATLTFGLFAGLGGAGASTSGSSGACGFSYK
CCDS14 FWVE
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pF1KB5 RRASRTRLAAWARRALLSLRSPKARRGKARRRAAKLQSSQEPEAPPPRDVALLQGRANDL
: . . ..::.: : :::::::: ::: :
CCDS35 PTDWPLPPDWIPADWPIPPDWQNLRPSPNLRPSPNSRASQNPGAAQPRDVALLQERANKL
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290 300 310 320 330 340
pF1KB5 VKYLLAKDQTKIPIKRSDMLKDIIKEYTDVYPEIIERAGYSLEKVFGIQLKEIDKNDHLY
::::. :: ::.:::::.::.:::.::::::::::::: . ::: ::::::::::..:::
CCDS35 VKYLMLKDYTKVPIKRSEMLRDIIREYTDVYPEIIERACFVLEKKFGIQLKEIDKEEHLY
540 550 560 570 580 590
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pF1KB5 ILLSTLEPTDAGILGTTKDSPKLGLLMVLLSIIFMNGNRSSEAVIWEVLRKLGLRPGIHH
::.:: : :::::::::.::::::.:.:..:::::::.::::.::.:::.:::::..:
CCDS35 ILISTPESL-AGILGTTKDTPKLGLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLRPGVRH
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pF1KB5 SLFGDVKKLITDEFVKQKYLDYARVPNSNPPEYEFFWGLRSYYETSKMKVLKFACKVQKK
:.::..::.: :::::::::: ::::::::::::.::::::.::::::::.: .:::.
CCDS35 PLLGDLRKLLTYEFVKQKYLDYRRVPNSNPPEYEFLWGLRSYHETSKMKVLRFIAEVQKR
660 670 680 690 700 710
470 480 490 500 510
pF1KB5 DPKEWAAQYREAMEADLKAAAEAAAEAKARAEIRARMGIGLGSENAAGPCNWD-------
::..:.::. :: . : : :::::.:::: :.::::: .: ..:: .::
CCDS35 DPRDWTAQFMEAADEALDALDAAAAEAEARAEARTRMGIG--DEAVSGPWSWDDIEFELL
720 730 740 750 760 770
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pF1KB5 ----EADIG-PWAKARIQAGAEAKAKAQESGSASTGASTSTNNSASASASTSGGFSAGAS
:.:.: ::.. . :. . .:. : .: :. . ...:::. ...:.:
CCDS35 TWDEEGDFGDPWSRIPFTFWARYHQNAR-SRFPQTFAGPIIGPGGTASANFAANFGAIGF
780 790 800 810 820 830
580 590 600
pF1KB5 LTATLTFGLFAGLGGAGASTSGSSGACGFSYK
CCDS35 FWVE
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pF1KB5 DVALLQGRANDLVKYLLAKDQTKIPIKRSDMLKDIIKEYTDVYPEIIERAGYSLEKVFGI
::.:.:.:: . .:::::::.:.:::.: .
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pF1KB5 QLKEIDKNDHLYILLSTLEPTDAGILGTTKDSPKLGLLMVLLSIIFMNGNRSSEAVIWEV
.::::::.. ::::.:: : ..:::::::::.::::::::.::.::::::..::::::::
CCDS59 NLKEIDKQSSLYILISTQE-SSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEV
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pF1KB5 LRKLGLRPGIHHSLFGDVKKLITDEFVKQKYLDYARVPNSNPPEYEFFWGLRSYYETSKM
:::::::::..:::::.:.:::::::::::::.: ::::: :::::::::::::.:::::
CCDS59 LRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKM
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pF1KB5 KVLKFACKVQKKDPKEWAAQYREAMEADLKAAAEAAAEAKARAEIRARMGIGLGSENAAG
:::::::.:::::::.::.:::::.: ...::: :.:::.:::: ::.::: : : .::
CCDS59 KVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEARAQMGI--GEEAVAG
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pF1KB5 PCNWDEADIGPWAKARIQAGAEAKAKAQES----GSASTGASTSTNNSASASASTSGGFS
: :::. :: .: . : .:.: .. : . :. .:..::: . : .::: .:::
CCDS59 PWNWDDMDID--CLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTNVNFSRGASTRAGFS
210 220 230 240 250 260
580 590 600
pF1KB5 AGASLTATLTFGLFAGLGGAGASTSGSSGACGFSYK
:::.. ..:: .:..: ::. :...
CCDS59 DGASIS----------FNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGTLSTS
270 280 290 300 310
CCDS59 SSFSSAASISFGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSATFSGG
320 330 340 350 360 370
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:. . : .: . . . ::... .::.:
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pF1KB5 ASKALEVSEDVKVSKASGVSKATEVSKTPEAREAPATQASSTTQLTDTQVL----AAENK
.: ... .. . . : :.: :..: :::. :.. : :. : ...:. : .
CCDS35 TSAQSQTGSPAQEAATEGPSSACAFSQAPCAREVDANRPS-TAFLGQNDVFDFTQPAGVS
190 200 210 220 230 240
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pF1KB5 SLAADTKKQNADPQ-AVTMPATETKKVSHVADTK--VNTKAQETEAAPSQAPADEPEPES
..: :. : : :.: . .. : ... . . :. . :... . : . ::..
CCDS35 GMAFPRPKRPAPAQEAATEGPSAASGVPQTGPGREVAATRPKTTKSGKALAKTRWVEPQN
250 260 270 280 290 300
160 170 180 190 200 210
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..: . .::: : .. . .: .....: . ::.:..:.
CCDS35 VVAAAA--------AKAKMATSIPEPEGAAAATAQHSAEPWARMGGKRTKKSKHLDDEYE
310 320 330 340 350
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 ASMARRASRGPIAFWARRASRTRLAAWARRALLSLRSPKARRGKARRRAAKLQSSQEPEA
.: .: . . : :::. :.. :: :. : : : :.. :..
CCDS35 SSEEERETPAVPPTW--RASQPSLTV---RAQLAPRPPMAPRSQI--------PSRHVLC
360 370 380 390 400
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pF1KB5 PPPRDVALLQGRANDLVKYLLAKDQTKIPIKRSDMLKDIIKEYTDVYPEIIERAGYSLEK
:::.:.::: ::: :::::. :: ::::::.:::::.:.:: . .::::::: :.:::
CCDS35 LPPRNVTLLQERANKLVKYLMIKDYKKIPIKRADMLKDVIREYDEHFPEIIERATYTLEK
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pF1KB5 VFGIQLKEIDKNDHLYILLSTLEPTDAGILGTTKDSPKLGLLMVLLSIIFMNGNRSSEAV
:::.::::::..:::::. : . ..: .:: :::.:.:.::.:.:..:::::::.::::
CCDS35 KFGIHLKEIDKEEHLYILVCTRD-SSARLLGKTKDTPRLSLLLVILGVIFMNGNRASEAV
470 480 490 500 510 520
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pF1KB5 IWEVLRKLGLRPGIHHSLFGDVKKLITDEFVKQKYLDYARVPNSNPPEYEFFWGLRSYYE
.::.:::.:::::..: ..::..:::::.:::::::.: ..::::::::::.::::. .:
CCDS35 LWEALRKMGLRPGVRHPFLGDLRKLITDDFVKQKYLEYKKIPNSNPPEYEFLWGLRARHE
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460 470 480 490 500 510
pF1KB5 TSKMKVLKFACKVQKKDPKEWAAQYREAMEADLKAAAEAAAEAKARAEIRARMGIGLGSE
::::.::.: . :..::.:: :.. ::.. .:. :: .:::..::.:.: :.:
CCDS35 TSKMRVLRFIAQNQNRDPREWKAHFLEAVDDAFKTMDVDMAEEHARAQMRAQMNI--GDE
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pF1KB5 NAAGPCNWDE-----------ADIGP-WAK------ARIQAGAEAKAKAQESGSASTGAS
: .::. .:.: ::. :: . . .:.. .. .:.:
CCDS35 ALIGRWSWDDIQVELLTWDEDGDFGDAWARIPFAFWARYHQYILNSNRANRRATWRAGVS
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pF1KB5 TSTNNSASASASTSGGFSAGASLTATLTFGLFAGLGGAGASTSGSSGACGFSYK
..::..::.:
CCDS35 SGTNGGASTSVLDGPSTSSTIRTRNAARAGASFFSWIQ
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Smith-Waterman score: 1169; 39.0% identity (66.6% similar) in 580 aa overlap (15-562:157-711)
10 20 30 40
pF1KB5 MSDTSESGAGLTRFQAEASEKDSSSMMQTLLTVTQNVEVPETPK
:. . : .: . . . ::... .::.:
CCDS48 AFSQVVASHRVATPQVSGEDTQPTTYAAEAQGPTPEPPLASPQTSQMLVTSKMAAPEAPA
130 140 150 160 170 180
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 ASKALEVSEDVKVSKASGVSKATEVSKTPEAREAPATQASSTTQLTDTQVL----AAENK
.: ... .. . . : :.: :..: :::. :.. : :. : ...:. : .
CCDS48 TSAQSQTGSPAQEAATEGPSSACAFSQAPCAREVDANRPS-TAFLGQNDVFDFTQPAGVS
190 200 210 220 230 240
110 120 130 140 150
pF1KB5 SLAADTKKQNADPQ-AVTMPATETKKVSHVADTK--VNTKAQETEAAPSQAPADEPEPES
..: :. : : :.: . .. : ... . . :. . :... . : . ::..
CCDS48 GMAFPRPKRPAPAQEAATEGPSAASGVPQTGPGREVAATRPKTTKSGKALAKTRWVEPQN
250 260 270 280 290 300
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 AAAQSQENQDTRPKVKAKKARKVKHLDGEEDGSSDQSQAS-GTTGGRRVSKA------LM
..: . .::: : .. . .: .....: . ::.:..:.
CCDS48 VVAAAA--------AKAKMATSIPEPEGAAAATAQHSAEPWARMGGKRTKKSKHLDDEYE
310 320 330 340 350
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pF1KB5 ASMARRASRGPIAFWARRASRTRLAAWARRALLSLRSPKARRGKARRRAAKLQSSQEPEA
.: .: . . : :::. :.. :: :. : : : :.. :..
CCDS48 SSEEERETPAVPPTW--RASQPSLTV---RAQLAPRPPMAPRSQI--------PSRHVLC
360 370 380 390 400
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pF1KB5 PPPRDVALLQGRANDLVKYLLAKDQTKIPIKRSDMLKDIIKEYTDVYPEIIERAGYSLEK
:::.:.::: ::: :::::. :: ::::::.:::::.:.:: . .::::::: :.:::
CCDS48 LPPRNVTLLQERANKLVKYLMIKDYKKIPIKRADMLKDVIREYDEHFPEIIERATYTLEK
410 420 430 440 450 460
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pF1KB5 VFGIQLKEIDKNDHLYILLSTLEPTDAGILGTTKDSPKLGLLMVLLSIIFMNGNRSSEAV
:::.::::::..:::::. : . ..: .:: :::.:.:.::.:.:..:::::::.::::
CCDS48 KFGIHLKEIDKEEHLYILVCTRD-SSARLLGKTKDTPRLSLLLVILGVIFMNGNRASEAV
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pF1KB5 IWEVLRKLGLRPGIHHSLFGDVKKLITDEFVKQKYLDYARVPNSNPPEYEFFWGLRSYYE
.::.:::.:::::..: ..::..:::::.:::::::.: ..::::::::::.::::. .:
CCDS48 LWEALRKMGLRPGVRHPFLGDLRKLITDDFVKQKYLEYKKIPNSNPPEYEFLWGLRARHE
530 540 550 560 570 580
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 TSKMKVLKFACKVQKKDPKEWAAQYREAMEADLKAAAEAAAEAKARAEIRARMGIGLGSE
::::.::.: . :..::.:: :.. ::.. .:. :: .:::..::.:.: :.:
CCDS48 TSKMRVLRFIAQNQNRDPREWKAHFLEAVDDAFKTMDVDMAEEHARAQMRAQMNI--GDE
590 600 610 620 630 640
520 530 540 550
pF1KB5 NAAGPCNWDE-----------ADIGP-WAK------ARIQAGAEAKAKAQESGSASTGAS
: .::. .:.: ::. :: . . .:.. .. .:.:
CCDS48 ALIGRWSWDDIQVELLTWDEDGDFGDAWARIPFAFWARYHQYILNSNRANRRATWRAGVS
650 660 670 680 690 700
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..::..::.:
CCDS48 SGTNGGASTSVLDGPSTSSTIRTRNAARAGASFFSWIQ
710 720 730
606 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]