Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5090
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5090, 769 aa
1>>>pF1KB5090 769 - 769 aa - 769 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5271+/-0.00121; mu= 9.4608+/- 0.072
mean_var=131.3211+/-27.222, 0's: 0 Z-trim(104.6): 54 B-trim: 14 in 1/50
Lambda= 0.111920
statistics sampled from 7978 (8005) to 7978 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.606), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16
Scan time: 3.320
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32657.1 STAT3 gene_id:6774|Hs108|chr17 ( 769) 5134 841.4 0
CCDS32656.1 STAT3 gene_id:6774|Hs108|chr17 ( 770) 5122 839.5 0
CCDS59288.1 STAT3 gene_id:6774|Hs108|chr17 ( 722) 4753 779.9 0
CCDS2309.1 STAT1 gene_id:6772|Hs108|chr2 ( 750) 2643 439.2 1.2e-122
CCDS42793.1 STAT1 gene_id:6772|Hs108|chr2 ( 712) 2614 434.5 2.9e-121
CCDS2310.1 STAT4 gene_id:6775|Hs108|chr2 ( 748) 2360 393.5 6.7e-109
CCDS8917.1 STAT2 gene_id:6773|Hs108|chr12 ( 851) 1445 245.8 2.2e-64
CCDS55836.1 STAT2 gene_id:6773|Hs108|chr12 ( 847) 1396 237.9 5.3e-62
CCDS11424.1 STAT5A gene_id:6776|Hs108|chr17 ( 794) 913 159.9 1.5e-38
CCDS11423.1 STAT5B gene_id:6777|Hs108|chr17 ( 787) 907 158.9 2.9e-38
CCDS74067.1 STAT5A gene_id:6776|Hs108|chr17 ( 764) 827 146.0 2.2e-34
CCDS53804.1 STAT6 gene_id:6778|Hs108|chr12 ( 737) 603 109.8 1.7e-23
CCDS8931.1 STAT6 gene_id:6778|Hs108|chr12 ( 847) 603 109.8 1.9e-23
CCDS74066.1 STAT5A gene_id:6776|Hs108|chr17 ( 763) 399 76.8 1.4e-13
>>CCDS32657.1 STAT3 gene_id:6774|Hs108|chr17 (769 aa)
initn: 5134 init1: 5134 opt: 5134 Z-score: 4489.1 bits: 841.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5134; 100.0% identity (100.0% similar) in 769 aa overlap (1-769:1-769)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LGEIDQQYSRFLQESNVLYQHNLRRIKQFLQSRYLEKPMEIARIVARCLWEESRLLQTAA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TAAQQGGQANHPTAAVVTEKQQMLEQHLQDVRKRVQDLEQKMKVVENLQDDFDFNYKTLK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SQGDMQDLNGNNQSVTRQKMQQLEQMLTALDQMRRSIVSELAGLLSAMEYVQKTLTDEEL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ADWKRRQQIACIGGPPNICLDRLENWITSLAESQLQTRQQIKKLEELQQKVSYKGDPIVQ
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310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HRPMLEERIVELFRNLMKSAFVVERQPCMPMHPDRPLVIKTGVQFTTKVRLLVKFPELNY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QLKIKVCIDKDSGDVAALRGSRKFNILGTNTKVMNMEESNNGSLSAEFKHLTLREQRCGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QLKIKVCIDKDSGDVAALRGSRKFNILGTNTKVMNMEESNNGSLSAEFKHLTLREQRCGN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 GGRANCDASLIVTEELHLITFETEVYHQGLKIDLETHSLPVVVISNICQMPNAWASILWY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GGRANCDASLIVTEELHLITFETEVYHQGLKIDLETHSLPVVVISNICQMPNAWASILWY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 NMLTNNPKNVNFFTKPPIGTWDQVAEVLSWQFSSTTKRGLSIEQLTTLAEKLLGPGVNYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NMLTNNPKNVNFFTKPPIGTWDQVAEVLSWQFSSTTKRGLSIEQLTTLAEKLLGPGVNYS
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550 560 570 580 590 600
pF1KB5 GCQITWAKFCKENMAGKGFSFWVWLDNIIDLVKKYILALWNEGYIMGFISKERERAILST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GCQITWAKFCKENMAGKGFSFWVWLDNIIDLVKKYILALWNEGYIMGFISKERERAILST
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 KPPGTFLLRFSESSKEGGVTFTWVEKDISGKTQIQSVEPYTKQQLNNMSFAEIIMGYKIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KPPGTFLLRFSESSKEGGVTFTWVEKDISGKTQIQSVEPYTKQQLNNMSFAEIIMGYKIM
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670 680 690 700 710 720
pF1KB5 DATNILVSPLVYLYPDIPKEEAFGKYCRPESQEHPEADPGAAPYLKTKFICVTPTTCSNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DATNILVSPLVYLYPDIPKEEAFGKYCRPESQEHPEADPGAAPYLKTKFICVTPTTCSNT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KB5 IDLPMSPRTLDSLMQFGNNGEGAEPSAGGQFESLTFDMELTSECATSPM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IDLPMSPRTLDSLMQFGNNGEGAEPSAGGQFESLTFDMELTSECATSPM
730 740 750 760
>>CCDS32656.1 STAT3 gene_id:6774|Hs108|chr17 (770 aa)
initn: 4751 init1: 4675 opt: 5122 Z-score: 4478.7 bits: 839.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5122; 99.9% identity (99.9% similar) in 770 aa overlap (1-769:1-770)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAQWNQLQQLDTRYLEQLHQLYSDSFPMELRQFLAPWIESQDWAYAASKESHATLVFHNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MAQWNQLQQLDTRYLEQLHQLYSDSFPMELRQFLAPWIESQDWAYAASKESHATLVFHNL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LGEIDQQYSRFLQESNVLYQHNLRRIKQFLQSRYLEKPMEIARIVARCLWEESRLLQTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LGEIDQQYSRFLQESNVLYQHNLRRIKQFLQSRYLEKPMEIARIVARCLWEESRLLQTAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 TAAQQGGQANHPTAAVVTEKQQMLEQHLQDVRKRVQDLEQKMKVVENLQDDFDFNYKTLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 SQGDMQDLNGNNQSVTRQKMQQLEQMLTALDQMRRSIVSELAGLLSAMEYVQKTLTDEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SQGDMQDLNGNNQSVTRQKMQQLEQMLTALDQMRRSIVSELAGLLSAMEYVQKTLTDEEL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 ADWKRRQQIACIGGPPNICLDRLENWITSLAESQLQTRQQIKKLEELQQKVSYKGDPIVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ADWKRRQQIACIGGPPNICLDRLENWITSLAESQLQTRQQIKKLEELQQKVSYKGDPIVQ
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pF1KB5 HRPMLEERIVELFRNLMKSAFVVERQPCMPMHPDRPLVIKTGVQFTTKVRLLVKFPELNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HRPMLEERIVELFRNLMKSAFVVERQPCMPMHPDRPLVIKTGVQFTTKVRLLVKFPELNY
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pF1KB5 QLKIKVCIDKDSGDVAALRGSRKFNILGTNTKVMNMEESNNGSLSAEFKHLTLREQRCGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QLKIKVCIDKDSGDVAALRGSRKFNILGTNTKVMNMEESNNGSLSAEFKHLTLREQRCGN
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430 440 450 460 470 480
pF1KB5 GGRANCDASLIVTEELHLITFETEVYHQGLKIDLETHSLPVVVISNICQMPNAWASILWY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GGRANCDASLIVTEELHLITFETEVYHQGLKIDLETHSLPVVVISNICQMPNAWASILWY
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pF1KB5 NMLTNNPKNVNFFTKPPIGTWDQVAEVLSWQFSSTTKRGLSIEQLTTLAEKLLGPGVNYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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550 560 570 580 590 600
pF1KB5 GCQITWAKFCKENMAGKGFSFWVWLDNIIDLVKKYILALWNEGYIMGFISKERERAILST
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CCDS32 GCQITWAKFCKENMAGKGFSFWVWLDNIIDLVKKYILALWNEGYIMGFISKERERAILST
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 KPPGTFLLRFSESSKEGGVTFTWVEKDISGKTQIQSVEPYTKQQLNNMSFAEIIMGYKIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KPPGTFLLRFSESSKEGGVTFTWVEKDISGKTQIQSVEPYTKQQLNNMSFAEIIMGYKIM
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670 680 690 700 710
pF1KB5 DATNILVSPLVYLYPDIPKEEAFGKYCRPESQEHPEADPG-AAPYLKTKFICVTPTTCSN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS32 DATNILVSPLVYLYPDIPKEEAFGKYCRPESQEHPEADPGSAAPYLKTKFICVTPTTCSN
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720 730 740 750 760
pF1KB5 TIDLPMSPRTLDSLMQFGNNGEGAEPSAGGQFESLTFDMELTSECATSPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TIDLPMSPRTLDSLMQFGNNGEGAEPSAGGQFESLTFDMELTSECATSPM
730 740 750 760 770
>>CCDS59288.1 STAT3 gene_id:6774|Hs108|chr17 (722 aa)
initn: 4751 init1: 4675 opt: 4753 Z-score: 4157.1 bits: 779.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4753; 99.9% identity (99.9% similar) in 715 aa overlap (1-714:1-715)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAQWNQLQQLDTRYLEQLHQLYSDSFPMELRQFLAPWIESQDWAYAASKESHATLVFHNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB5 LGEIDQQYSRFLQESNVLYQHNLRRIKQFLQSRYLEKPMEIARIVARCLWEESRLLQTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LGEIDQQYSRFLQESNVLYQHNLRRIKQFLQSRYLEKPMEIARIVARCLWEESRLLQTAA
70 80 90 100 110 120
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CCDS59 TAAQQGGQANHPTAAVVTEKQQMLEQHLQDVRKRVQDLEQKMKVVENLQDDFDFNYKTLK
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pF1KB5 SQGDMQDLNGNNQSVTRQKMQQLEQMLTALDQMRRSIVSELAGLLSAMEYVQKTLTDEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SQGDMQDLNGNNQSVTRQKMQQLEQMLTALDQMRRSIVSELAGLLSAMEYVQKTLTDEEL
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250 260 270 280 290 300
pF1KB5 ADWKRRQQIACIGGPPNICLDRLENWITSLAESQLQTRQQIKKLEELQQKVSYKGDPIVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ADWKRRQQIACIGGPPNICLDRLENWITSLAESQLQTRQQIKKLEELQQKVSYKGDPIVQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 HRPMLEERIVELFRNLMKSAFVVERQPCMPMHPDRPLVIKTGVQFTTKVRLLVKFPELNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 HRPMLEERIVELFRNLMKSAFVVERQPCMPMHPDRPLVIKTGVQFTTKVRLLVKFPELNY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QLKIKVCIDKDSGDVAALRGSRKFNILGTNTKVMNMEESNNGSLSAEFKHLTLREQRCGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QLKIKVCIDKDSGDVAALRGSRKFNILGTNTKVMNMEESNNGSLSAEFKHLTLREQRCGN
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430 440 450 460 470 480
pF1KB5 GGRANCDASLIVTEELHLITFETEVYHQGLKIDLETHSLPVVVISNICQMPNAWASILWY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GGRANCDASLIVTEELHLITFETEVYHQGLKIDLETHSLPVVVISNICQMPNAWASILWY
430 440 450 460 470 480
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pF1KB5 NMLTNNPKNVNFFTKPPIGTWDQVAEVLSWQFSSTTKRGLSIEQLTTLAEKLLGPGVNYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NMLTNNPKNVNFFTKPPIGTWDQVAEVLSWQFSSTTKRGLSIEQLTTLAEKLLGPGVNYS
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pF1KB5 GCQITWAKFCKENMAGKGFSFWVWLDNIIDLVKKYILALWNEGYIMGFISKERERAILST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GCQITWAKFCKENMAGKGFSFWVWLDNIIDLVKKYILALWNEGYIMGFISKERERAILST
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 KPPGTFLLRFSESSKEGGVTFTWVEKDISGKTQIQSVEPYTKQQLNNMSFAEIIMGYKIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KPPGTFLLRFSESSKEGGVTFTWVEKDISGKTQIQSVEPYTKQQLNNMSFAEIIMGYKIM
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KB5 DATNILVSPLVYLYPDIPKEEAFGKYCRPESQEHPEADPG-AAPYLKTKFICVTPTTCSN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS59 DATNILVSPLVYLYPDIPKEEAFGKYCRPESQEHPEADPGSAAPYLKTKFICVTPFIDAV
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760
pF1KB5 TIDLPMSPRTLDSLMQFGNNGEGAEPSAGGQFESLTFDMELTSECATSPM
CCDS59 WK
>>CCDS2309.1 STAT1 gene_id:6772|Hs108|chr2 (750 aa)
initn: 2088 init1: 911 opt: 2643 Z-score: 2315.6 bits: 439.2 E(32554): 1.2e-122
Smith-Waterman score: 2643; 53.2% identity (81.3% similar) in 739 aa overlap (1-731:1-732)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAQWNQLQQLDTRYLEQLHQLYSDSFPMELRQFLAPWIESQDWAYAASKESHATLVFHNL
:.:: .:::::...:::.::::.::::::.::.:: :.:.::: .::. : ::. ::.:
CCDS23 MSQWYELQQLDSKFLEQVHQLYDDSFPMEIRQYLAQWLEKQDWEHAANDVSFATIRFHDL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LGEIDQQYSRFLQESNVLYQHNLRRIKQFLQSRYLEKPMEIARIVARCLWEESRLLQTAA
:...:.::::: :.: : :::.:. :. ::. . : :.... :. :: :: ..:..:
CCDS23 LSQLDDQYSRFSLENNFLLQHNIRKSKRNLQDNFQEDPIQMSMIIYSCLKEERKILENAQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 TAAQQGGQANHPTAAVVTEKQQMLEQHLQDVRKRVQDLEQKMKVVENLQDDFDFNYKTLK
: .:... ..:. .::. :......:. .:. .:...: .:.:::..::. :::
CCDS23 RFNQ--AQSGNIQSTVMLDKQKELDSKVRNVKDKVMCIEHEIKSLEDLQDEYDFKCKTL-
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 SQGDMQDLNGNNQSVTRQKMQQLEQMLTALDQMRRSIVSELAGLLSAMEYVQKTLTDEEL
:. .. :: .: .:.. :..: ::. :. .: .. ::.. : .:..: ..::
CCDS23 -QNREHETNGVAKSDQKQEQLLLKKMYLMLDNKRKEVVHKIIELLNVTELTQNALINDEL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 ADWKRRQQIACIGGPPNICLDRLENWITSLAESQLQTRQQIKKLEELQQKVSYKGDPIVQ
..:::::: :::::::: :::.:.::.: .::: :.:::.::::::.:: .:. :::..
CCDS23 VEWKRRQQSACIGGPPNACLDQLQNWFTIVAESLQQVRQQLKKLEELEQKYTYEHDPITK
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 HRPMLEERIVELFRNLMKSAFVVERQPCMPMHPDRPLVIKTGVQFTTKVRLLVKFPELNY
.. .: .: ::..:..:.:::::::::: ::.::::.:::::::.:.:::::. ::::
CCDS23 NKQVLWDRTFSLFQQLIQSSFVVERQPCMPTHPQRPLVLKTGVQFTVKLRLLVKLQELNY
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QLKIKVCIDKDSGDVAALRGSRKFNILGTNTKVMNMEESNNGSLSAEFKHLTLREQRCGN
.::.:: .::: .. ...: ::::::::.:::::::::.::::.:::.:: :.::. :
CCDS23 NLKVKVLFDKDVNERNTVKGFRKFNILGTHTKVMNMEESTNGSLAAEFRHLQLKEQK--N
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 GGRANCDASLIVTEELHLITFETEVYHQGLKIDLETHSLPVVVISNICQMPNAWASILWY
.: . .. :::::::: ..:::.. . :: ::::: :::::::::. :.:..:::::::
CCDS23 AGTRTNEGPLIVTEELHSLSFETQLCQPGLVIDLETTSLPVVVISNVSQLPSGWASILWY
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 NMLTNNPKNVNFFTKPPIGTWDQVAEVLSWQFSSTTKRGLSIEQLTTLAEKLLGPGVNYS
:::. .:.:..:: :: . : :..:::::::::.:::::...::. :.::::::... .
CCDS23 NMLVAEPRNLSFFLTPPCARWAQLSEVLSWQFSSVTKRGLNVDQLNMLGEKLLGPNASPD
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550 560 570 580 590 600
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]