Result of FASTA (ccds) for pFN21AB4806
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4806, 1137 aa
  1>>>pF1KB4806 1137 - 1137 aa - 1137 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.1971+/-0.00108; mu= -7.8668+/- 0.065
 mean_var=383.1212+/-78.276, 0's: 0 Z-trim(115.1): 36  B-trim: 170 in 1/52
 Lambda= 0.065525
 statistics sampled from 15593 (15627) to 15593 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.77), E-opt: 0.2 (0.48), width:  16
 Scan time:  6.460

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS7791.1 ST5 gene_id:6764|Hs108|chr11            (1137) 7608 734.0 4.6e-211
CCDS7792.1 ST5 gene_id:6764|Hs108|chr11            ( 717) 4559 445.7 1.8e-124
CCDS43659.1 DENND2A gene_id:27147|Hs108|chr7       (1009) 2584 259.1 3.9e-68
CCDS58018.1 DENND2C gene_id:163259|Hs108|chr1      ( 928) 2338 235.8 3.6e-61
CCDS875.1 DENND2C gene_id:163259|Hs108|chr1        ( 871) 2318 233.9 1.3e-60
CCDS83233.1 DENND2A gene_id:27147|Hs108|chr7       ( 795) 1527 159.1 3.8e-38
CCDS60219.1 DENND2D gene_id:79961|Hs108|chr1       ( 468) 1237 131.5 4.5e-30
CCDS831.1 DENND2D gene_id:79961|Hs108|chr1         ( 471) 1237 131.5 4.5e-30


>>CCDS7791.1 ST5 gene_id:6764|Hs108|chr11                 (1137 aa)
 initn: 7608 init1: 7608 opt: 7608  Z-score: 3902.8  bits: 734.0 E(32554): 4.6e-211
Smith-Waterman score: 7608; 100.0% identity (100.0% similar) in 1137 aa overlap (1-1137:1-1137)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MTMTANKNSSITHGAGGTKAPRGTLSRSQSVSPPPVLSPPRSPIYPLSDSETSACRYPSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MTMTANKNSSITHGAGGTKAPRGTLSRSQSVSPPPVLSPPRSPIYPLSDSETSACRYPSH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 SSSRVLLKDRHPPAPSPQNPQDPSPDTSPPTCPFKTASFGYLDRSPSACKRDAQKESVQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SSSRVLLKDRHPPAPSPQNPQDPSPDTSPPTCPFKTASFGYLDRSPSACKRDAQKESVQG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 AAQDVAGVAACLPLAQSTPFPGPAAGPRGVLLTRTGTRAHSLGIREKISAWEGRREASPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AAQDVAGVAACLPLAQSTPFPGPAAGPRGVLLTRTGTRAHSLGIREKISAWEGRREASPR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 MSMCGEKREGSGSEWAASEGCPSLGCPSVVPSPCSSEKTFDFKGLRRMSRTFSECSYPET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MSMCGEKREGSGSEWAASEGCPSLGCPSVVPSPCSSEKTFDFKGLRRMSRTFSECSYPET
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 EEEGEALPVRDSFYRLEKRLGRSEPSAFLRGHGSRKESSAVLSRIQKIEQVLKEQPGRGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 EEEGEALPVRDSFYRLEKRLGRSEPSAFLRGHGSRKESSAVLSRIQKIEQVLKEQPGRGL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 PQLPSSCYSVDRGKRKTGTLGSLEEPAGGASVSAGSRAVGVAGVAGEAGPPPEREGSGST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PQLPSSCYSVDRGKRKTGTLGSLEEPAGGASVSAGSRAVGVAGVAGEAGPPPEREGSGST
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 KPGTPGNSPSSQRLPSKSSLDPAVNPVPKPKRTFEYEADKNPKSKPSNGLPPSPTPAAPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KPGTPGNSPSSQRLPSKSSLDPAVNPVPKPKRTFEYEADKNPKSKPSNGLPPSPTPAAPP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 PLPSTPAPPVTRRPKKDMRGHRKSQSRKSFEFEDASSLQSLYPSSPTENGTENQPKFGSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PLPSTPAPPVTRRPKKDMRGHRKSQSRKSFEFEDASSLQSLYPSSPTENGTENQPKFGSK
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 STLEENAYEDIVGDLPKENPYEDVDLKSRRAGRKSQQLSENSLDSLHRMWSPQDRKYNSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 STLEENAYEDIVGDLPKENPYEDVDLKSRRAGRKSQQLSENSLDSLHRMWSPQDRKYNSP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 PTQLSLKPNSQSLRSGNWSERKSHRLPRLPKRHSHDDMLLLAQLSLPSSPSSLNEDSLST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PTQLSLKPNSQSLRSGNWSERKSHRLPRLPKRHSHDDMLLLAQLSLPSSPSSLNEDSLST
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 TSELLSSRRARRIPKLVQRINSIYNAKRGKKRLKKLSMSSIETASLRDENSESESDSDDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TSELLSSRRARRIPKLVQRINSIYNAKRGKKRLKKLSMSSIETASLRDENSESESDSDDR
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 FKAHTQRLVHIQSMLKRAPSYRTLELELLEWQERELFEYFVVVSLKKKPSRNTYLPEVSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FKAHTQRLVHIQSMLKRAPSYRTLELELLEWQERELFEYFVVVSLKKKPSRNTYLPEVSY
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB4 QFPKLDRPTKQMREAEERLKAIPQFCFPDAKDWLPVSEYSSETFSFMLTGEDGSRRFGYC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QFPKLDRPTKQMREAEERLKAIPQFCFPDAKDWLPVSEYSSETFSFMLTGEDGSRRFGYC
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB4 RRLLPSGKGPRLPEVYCVISRLGCFGLFSKVLDEVERRRGISAALVYPFMRSLMESPFPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RRLLPSGKGPRLPEVYCVISRLGCFGLFSKVLDEVERRRGISAALVYPFMRSLMESPFPA
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB4 PGKTIKVKTFLPGAGNEVLELRRPMDSRLEHVDFECLFTCLSVRQLIRIFASLLLERRVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PGKTIKVKTFLPGAGNEVLELRRPMDSRLEHVDFECLFTCLSVRQLIRIFASLLLERRVI
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB4 FVADKLSTLSSCSHAVVALLYPFSWQHTFIPVLPASMIDIVCCPTPFLVGLLSSSLPKLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FVADKLSTLSSCSHAVVALLYPFSWQHTFIPVLPASMIDIVCCPTPFLVGLLSSSLPKLK
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB4 ELPVEEALMVNLGSDRFIRQMDDEDTLLPRKLQAALEQALERKNELISQDSDSDSDDECN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ELPVEEALMVNLGSDRFIRQMDDEDTLLPRKLQAALEQALERKNELISQDSDSDSDDECN
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB4 TLNGLVSEVFIRFFVETVGHYSLFLTQSEKGERAFQREAFRKSVASKSIRRFLEVFMESQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TLNGLVSEVFIRFFVETVGHYSLFLTQSEKGERAFQREAFRKSVASKSIRRFLEVFMESQ
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130       
pF1KB4 MFAGFIQDRELRKCRAKGLFEQRVEQYLEELPDTEQSGMNKFLRGLGNKMKFLHKKN
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MFAGFIQDRELRKCRAKGLFEQRVEQYLEELPDTEQSGMNKFLRGLGNKMKFLHKKN
             1090      1100      1110      1120      1130       

>>CCDS7792.1 ST5 gene_id:6764|Hs108|chr11                 (717 aa)
 initn: 4559 init1: 4559 opt: 4559  Z-score: 2347.9  bits: 445.7 E(32554): 1.8e-124
Smith-Waterman score: 4559; 99.1% identity (99.6% similar) in 699 aa overlap (439-1137:19-717)

      410       420       430       440       450       460        
pF1KB4 GLPPSPTPAAPPPLPSTPAPPVTRRPKKDMRGHRKSQSRKSFEFEDASSLQSLYPSSPTE
                                     .. : . :::::::::::::::::::::::
CCDS77             MTMTANKNSSITHGAGGTKAPRGTLSRKSFEFEDASSLQSLYPSSPTE
                           10        20        30        40        

      470       480       490       500       510       520        
pF1KB4 NGTENQPKFGSKSTLEENAYEDIVGDLPKENPYEDVDLKSRRAGRKSQQLSENSLDSLHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 NGTENQPKFGSKSTLEENAYEDIVGDLPKENPYEDVDLKSRRAGRKSQQLSENSLDSLHR
       50        60        70        80        90       100        

      530       540       550       560       570       580        
pF1KB4 MWSPQDRKYNSPPTQLSLKPNSQSLRSGNWSERKSHRLPRLPKRHSHDDMLLLAQLSLPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MWSPQDRKYNSPPTQLSLKPNSQSLRSGNWSERKSHRLPRLPKRHSHDDMLLLAQLSLPS
      110       120       130       140       150       160        

      590       600       610       620       630       640        
pF1KB4 SPSSLNEDSLSTTSELLSSRRARRIPKLVQRINSIYNAKRGKKRLKKLSMSSIETASLRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SPSSLNEDSLSTTSELLSSRRARRIPKLVQRINSIYNAKRGKKRLKKLSMSSIETASLRD
      170       180       190       200       210       220        

      650       660       670       680       690       700        
pF1KB4 ENSESESDSDDRFKAHTQRLVHIQSMLKRAPSYRTLELELLEWQERELFEYFVVVSLKKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ENSESESDSDDRFKAHTQRLVHIQSMLKRAPSYRTLELELLEWQERELFEYFVVVSLKKK
      230       240       250       260       270       280        

      710       720       730       740       750       760        
pF1KB4 PSRNTYLPEVSYQFPKLDRPTKQMREAEERLKAIPQFCFPDAKDWLPVSEYSSETFSFML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PSRNTYLPEVSYQFPKLDRPTKQMREAEERLKAIPQFCFPDAKDWLPVSEYSSETFSFML
      290       300       310       320       330       340        

      770       780       790       800       810       820        
pF1KB4 TGEDGSRRFGYCRRLLPSGKGPRLPEVYCVISRLGCFGLFSKVLDEVERRRGISAALVYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TGEDGSRRFGYCRRLLPSGKGPRLPEVYCVISRLGCFGLFSKVLDEVERRRGISAALVYP
      350       360       370       380       390       400        

      830       840       850       860       870       880        
pF1KB4 FMRSLMESPFPAPGKTIKVKTFLPGAGNEVLELRRPMDSRLEHVDFECLFTCLSVRQLIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FMRSLMESPFPAPGKTIKVKTFLPGAGNEVLELRRPMDSRLEHVDFECLFTCLSVRQLIR
      410       420       430       440       450       460        

      890       900       910       920       930       940        
pF1KB4 IFASLLLERRVIFVADKLSTLSSCSHAVVALLYPFSWQHTFIPVLPASMIDIVCCPTPFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 IFASLLLERRVIFVADKLSTLSSCSHAVVALLYPFSWQHTFIPVLPASMIDIVCCPTPFL
      470       480       490       500       510       520        

      950       960       970       980       990      1000        
pF1KB4 VGLLSSSLPKLKELPVEEALMVNLGSDRFIRQMDDEDTLLPRKLQAALEQALERKNELIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VGLLSSSLPKLKELPVEEALMVNLGSDRFIRQMDDEDTLLPRKLQAALEQALERKNELIS
      530       540       550       560       570       580        

     1010      1020      1030      1040      1050      1060        
pF1KB4 QDSDSDSDDECNTLNGLVSEVFIRFFVETVGHYSLFLTQSEKGERAFQREAFRKSVASKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QDSDSDSDDECNTLNGLVSEVFIRFFVETVGHYSLFLTQSEKGERAFQREAFRKSVASKS
      590       600       610       620       630       640        

     1070      1080      1090      1100      1110      1120        
pF1KB4 IRRFLEVFMESQMFAGFIQDRELRKCRAKGLFEQRVEQYLEELPDTEQSGMNKFLRGLGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 IRRFLEVFMESQMFAGFIQDRELRKCRAKGLFEQRVEQYLEELPDTEQSGMNKFLRGLGN
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     1130       
pF1KB4 KMKFLHKKN
       :::::::::
CCDS77 KMKFLHKKN
      710       

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                                     :.  : .::.:..::: :::..:. .:  :
CCDS43 LDMIISDPAAEASRAGKKQLRGVQNPCPSARARPRHKSLNIKDKISEWEGKKEVPTPAPS
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pF1KB4 MCGEKRE----GSGSEWAASEGCPSLGCPS---VVPSPCSSEKTFDFKGLRRMSRTFSEC
         .. .:    .:  :  .:.:  .    .   . :.  :.::  . ::   ..    : 
CCDS43 RRADGQEDYLPSSTVERRSSDGVRTQVTEAKNGMRPGTESTEKERN-KGAVNVGGQDPEP
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pF1KB4 SYPETEEEGEALPVRDSFYR-LEKRLGRSEPSAFLRGHGSRKESSAVLSRIQKIEQVLKE
       .   .. : :. :   :. :  : :::.      ::    ...  .::....:.::.::.
CCDS43 GQDLSQPEREVDP---SWGRGREPRLGK------LR---FQNDPLSVLKQVKKLEQALKD
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pF1KB4 QPGRGL-PQLPSSCYSVDRGKRKTGTLGSLEEPAGGASVSAGSRAVGVAGVAGEAGPPPE
         . :: ::::..:::      :. . ..: :  ::.: :  :. :  . . :.  : ::
CCDS43 GSA-GLDPQLPGTCYSPHCPPDKAEAGSTLPENLGGGSGSEVSQRVHPSDLEGRE-PTPE
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pF1KB4 --REGSGSTKPGTPGNSPSSQRLPSKSSLDPAVNPVPKPKRTFEYEADKNPKSKPSNG--
         .. .:: .     .  .  :    :   : .::.:::.:::.. .. .  .::. :  
CCDS43 LVEDRKGSCRRPWDRSLENVYRGSEGSPTKPFINPLPKPRRTFKHAGEGDKDGKPGIGFR
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pF1KB4 -----LPPSPTPAAPPPLPSTPAPPVTRRPKKDMRGHRKSQSRKSFEFEDASSLQSLYPS
            ::: :.   ::::::.: :  . :     : . ... :::.::::   :::   :
CCDS43 KEKRNLPPLPS-LPPPPLPSSPPPSSVNRRLWTGRQKSSADHRKSYEFEDL--LQSSSES
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pF1KB4 SPTENGTENQPKFGSKSTL-EENAYEDIVGDLPKENPYEDVDLKSRRAGRKSQQLSENSL
       : ..     : :.:   :: :::.::::.    :::::::..:..:  :.:         
CCDS43 SRVD--WYAQTKLGLTRTLSEENVYEDILDPPMKENPYEDIELHGRCLGKKC--------
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pF1KB4 DSLHRMWSPQDRKYNSPPTQLSLKPNSQSLRSGNWSERKSHRLPRLPKRHSHDDMLLLAQ
         :.   ::     .: :  :. .  :.     . :::.. .:    .. :.:     ..
CCDS43 -VLNFPASPT----SSIPDTLTKQSLSKPAFFRQNSERRNFKLLDT-RKLSRDGTGSPSK
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pF1KB4 LSLPSSPSSLNEDSLSTTSELLSSRRARRIPKLVQRINSIYNAKRGKKRLKKLSMSSIET
       .: ::.:::  .: . . ..  ..:. :.::::: :::.::...:::::.:.::.: .:.
CCDS43 ISPPSTPSS-PDDIFFNLGDPQNGRKKRKIPKLVLRINAIYEVRRGKKRVKRLSQS-MES
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pF1KB4 AS--LRDENSESESDSDDRFKAHTQRLVHIQSMLKRAPSYRTLELELLEWQERELFEYFV
        :  . ::::::.::.....:::.::::...: ::.:: : .:  ::.:.:::.::::::
CCDS43 NSGKVTDENSESDSDTEEKLKAHSQRLVNVKSRLKQAPRYPSLARELIEYQERQLFEYFV
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pF1KB4 VVSLKKKPSRNTYLPEVSYQFP-KLDRPTKQMREAEERLKAIPQFCFPDAKDWLPVSEYS
       ::::.:: .  .:.::.. ::: ::.:  : :::::..:::::::::::::::.::....
CCDS43 VVSLHKKQAGAAYVPELTQQFPLKLERSFKFMREAEDQLKAIPQFCFPDAKDWVPVQQFT
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pF1KB4 SETFSFMLTGEDGSRRFGYCRRLLPSGKGPRLPEVYCVISRLGCFGLFSKVLDEVERRRG
       ::::::.::::::::::::::::::.::: :::::::..::::::.:::..:::::.:::
CCDS43 SETFSFVLTGEDGSRRFGYCRRLLPGGKGKRLPEVYCIVSRLGCFSLFSRILDEVEKRRG
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pF1KB4 ISAALVYPFMRSLMESPFPAPGKTIKVKTFLPGAGNEVLELRRPMDSRLEHVDFECLFTC
       :: ::: :.:::.::.:::: :::: ::.::::.:.::.:: ::.:::::::::: ::. 
CCDS43 ISPALVQPLMRSVMEAPFPALGKTILVKNFLPGSGTEVIELCRPLDSRLEHVDFESLFSS
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pF1KB4 LSVRQLIRIFASLLLERRVIFVADKLSTLSSCSHAVVALLYPFSWQHTFIPVLPASMIDI
       ::::.:. .::::::::::::.::::: ::.: ::.:::.:::.::::.::::: .:.::
CCDS43 LSVRHLVCVFASLLLERRVIFIADKLSILSKCCHAMVALIYPFAWQHTYIPVLPPAMVDI
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pF1KB4 VCCPTPFLVGLLSSSLPKLKELPVEEALMVNLGSDRFIRQMDDEDTLLPRKLQAALEQAL
       :: :::::.:::::::: :.:::.::.:.:.: ..::.:::::::..::::::.:::. :
CCDS43 VCSPTPFLIGLLSSSLPLLRELPLEEVLVVDLVNSRFLRQMDDEDSILPRKLQVALEHIL
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pF1KB4 ERKNELISQDSDSDSDD----ECNTLNGLVSEVFIRFFVETVGHYSLFLTQSEKGERAFQ
       :..:::  .....  :     : . :: .:::.:.::::: :::::::::..:. ::..:
CCDS43 EQRNELACEQDEGPLDGRHGPESSPLNEVVSEAFVRFFVEIVGHYSLFLTSGEREERTLQ
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pF1KB4 REAFRKSVASKSIRRFLEVFMESQMFAGFIQDRELRKCRAKGLFEQRVEQYLEELPDTEQ
       ::::::.:.:::.:.:::::::.::: ::::.::::.  :::::: :...::: ::. :.
CCDS43 REAFRKAVSSKSLRHFLEVFMETQMFRGFIQERELRRQDAKGLFEVRAQEYLETLPSGEH
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       1120      1130       
pF1KB4 SGMNKFLRGLGNKMKFLHKKN
       ::.::::.:::::::::::: 
CCDS43 SGVNKFLKGLGNKMKFLHKK 
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CCDS58                     MDVGFSRTTVQTLSRSHCKNIKQKISQWEGRANGISNP--
                                   10        20        30          

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pF1KB4 SMCGEKREGSGSEWAASEGCPS-LGCPSVVPSPCSSEKTFDFKGL-RRMSRTFSECSYPE
           ::       :     ::. .:    :   : .:  .  . . .: :....  :   
CCDS58 ----EK-------W-----CPKDFG----VRYNCHQEIRLKKNPIAERKSKNLDVTS---
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     240       250       260       270         280       290       
pF1KB4 TEEEGEALPVRDSFYRLEKRLGRSEPSAFLRGH--GSRKESSAVLSRIQKIEQVLKE--Q
         .:. .: . ..    ..  ....   .   :   ...::. : ::...::.  ..  .
CCDS58 --RENVGLDINENTKSHDQSENENKKHEYDDTHFFKNESESNWVCSRVKEIESCKEDVLD
            80        90       100       110       120       130   

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pF1KB4 PGRGLPQLPSSCYSVDRGKRKTGTLGSLEEPAGGASVSAGSRAVGVAGVAGEAGPPPERE
       :  .::  :.. :. .   .:  .:     :              . ..: :     :.:
CCDS58 PETSLP--PGNFYTSQILWKKIEAL-----PPDK-----------LLNLALEHCDSSEKE
             140       150            160                  170     

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pF1KB4 GSGSTKPGTPGNSPSSQRL---PSKSSLDPAVNPVPKPKRTFEY--EADKNP-KSKPSNG
        .  .  .. : . : . .   :  .   :..::.:::.:::.:  :.  .: : .  . 
CCDS58 LNFRVLDSSYGITKSLENIYSEPEGQECGPSINPLPKPRRTFRYLSESGVTPYKERNCDK
         180       190       200       210       220       230     

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pF1KB4 LPPSPTPAAPPPLPSTPAPPVTRRPKK---DMRGHRKSQSRKSFEFEDASSLQSLYPSSP
            .  :   : :.  :    .:::    .::. :   :::::::: . ...   .. 
CCDS58 KYCENNSCAQSSLASSQEP----EPKKYGGKIRGRSK---RKSFEFEDIQHFRNRNSQTI
         240       250           260          270       280        

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pF1KB4 TENGTENQPKFGSKSTLEENAYEDIVGDLP-KENPYEDVDLKSRRAGRKSQQLSENSLDS
        :.  .:. .    .  :.: ::::.   : :::::::. .         : :       
CCDS58 REELGRNSGSALYYTQSEDNIYEDII--YPTKENPYEDIPV---------QPLP------
      290       300       310         320                330       

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pF1KB4 LHRMWSPQDRKYNSPPTQLSLKPNSQSLRSGNWSERKSHRLPRLPKRHSHDDMLLLAQLS
          ::          :.  .: : ...... .    : . : :   . ....  : ..:.
CCDS58 ---MWRS--------PSAWKLPPAKSAFKAPKLPP-KPQFLHRKTMEVKNSQAYLRSKLT
                        340       350        360       370         

          590       600       610       620       630       640    
pF1KB4 LPSS-PSSLNEDSLSTTSELLSSRRARRIPKLVQRINSIYNAKRGKKRLKKLSMSSIETA
         .. : .:.: .:  ..:. ...: . .:.:: .:..:...:::::..:  :... :  
CCDS58 KDTTLPVTLTEWKLFRAGEVANTKR-KNLPRLVLKIDDIFESKRGKKKVKLHSYTGKELP
     380       390       400        410       420       430        

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pF1KB4 SLRDENSESESDSDDRFKAHTQRLVHIQSMLKRAPSYRTLELELLEWQERELFEYFVVVS
         . :.: .:::..   : . .::...:   :: : :.::: .:.: ::..::: :::::
CCDS58 PTKGETSGNESDAEYLPKNRHKRLAQLQPSSKRNPHYQTLERDLIELQEQQLFELFVVVS
      440       450       460       470       480       490        

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pF1KB4 LKKKPSRNTYLPEVSYQFP-KLDRPTKQMREAEERLKAIPQFCFPDAKDWLPVSEYSSET
       :.::::  .:.:.:  ::: : :.  :: .. :::::.::.:::::.:::.:.:: .:::
CCDS58 LQKKPSGISYIPQVIQQFPGKDDHGYKQSKDMEERLKVIPKFCFPDSKDWMPTSELKSET
      500       510       520       530       540       550        

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pF1KB4 FSFMLTGEDGSRRFGYCRRLLPSGKGPRLPEVYCVISRLGCFGLFSKVLDEVERRRGISA
       :::.:::::::: ::::..::: ::: :::::::..::::::.::::.:::::.:: .: 
CCDS58 FSFVLTGEDGSRWFGYCKKLLPVGKGKRLPEVYCMVSRLGCFNLFSKILDEVEKRREMSP
      560       570       580       590       600       610        

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pF1KB4 ALVYPFMRSLMESPFPAPGKTIKVKTFLPGAGNEVLELRRPMDSRLEHVDFECLFTCLSV
       :::::::::.::.::::::.:: ::..:::::.: .:: ::.:::::::::.::: ::::
CCDS58 ALVYPFMRSVMEAPFPAPGRTITVKSYLPGAGDESIELCRPLDSRLEHVDFKCLFKCLSV
      620       630       640       650       660       670        

           890       900       910       920       930       940   
pF1KB4 RQLIRIFASLLLERRVIFVADKLSTLSSCSHAVVALLYPFSWQHTFIPVLPASMIDIVCC
        .:::. :::::::::::::..:::::.:.::::: ::::.::::.::::::::::::: 
CCDS58 CHLIRVCASLLLERRVIFVANSLSTLSKCGHAVVATLYPFTWQHTYIPVLPASMIDIVCS
      680       690       700       710       720       730        

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pF1KB4 PTPFLVGLLSSSLPKLKELPVEEALMVNLGSDRFIRQMDDEDTLLPRKLQAALEQALERK
       :::::.:.:: :::.:..::.::.:.:.: .:.:.....::: .:: :::::: : ::..
CCDS58 PTPFLIGILSCSLPQLQDLPIEEVLIVDLCADKFLQEVSDEDEILPPKLQAALMQILEER
      740       750       760       770       780       790        

          1010      1020      1030      1040      1050      1060   
pF1KB4 NELISQDSDSDSDDECNTLNGLVSEVFIRFFVETVGHYSLFLTQSEKGERAFQREAFRKS
       ::...:... ..:    :::.::::.:.::::: :::::: .: .:.:::.:::: ::::
CCDS58 NEILTQEQNFSQD---VTLNSLVSEAFVRFFVELVGHYSLNMTVTERGERVFQREPFRKS
      800       810          820       830       840       850     

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pF1KB4 VASKSIRRFLEVFMESQMFAGFIQDRELRKCRAKGLFEQRVEQYLEELPDTEQSGMNKFL
        .:.:.:.::..:::.::::::::::::::  .::::: :. :::: .:..: ::::..:
CCDS58 HTSRSVRHFLDLFMETQMFAGFIQDRELRKSGVKGLFEIRAIQYLETIPESEPSGMNRIL
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          1130       
pF1KB4 RGLGNKMKFLHKKN
       :.::.:::::.:: 
CCDS58 RSLGSKMKFLQKK 
         920         

>>CCDS875.1 DENND2C gene_id:163259|Hs108|chr1             (871 aa)
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           130       140       150       160       170         180 
pF1KB4 DVAGVAACLPLAQSTPFPGPAAGPRGVLLTRTGTRAHSLGIREKISAWEGRRE--ASPRM
                                     .: .:.:  .:..::: :::: .  ..:  
CCDS87                     MDVGFSRTTVQTLSRSHCKNIKQKISQWEGRANGISNP--
                                   10        20        30          

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pF1KB4 SMCGEKREGSGSEWAASEGCPS-LGCPSVVPSPCSSEKTFDFKGL-RRMSRTFSECSYPE
           ::       :     ::. .:    :   : .:  .  . . .: :....  :   
CCDS87 ----EK-------W-----CPKDFG----VRYNCHQEIRLKKNPIAERKSKNLDVTS---
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pF1KB4 TEEEGEALPVRDSFYRLEKRLGRSEPSAFLRGH--GSRKESSAVLSRIQKIEQVLKE--Q
         .:. .: . ..    ..  ....   .   :   ...::. : ::...::.  ..  .
CCDS87 --RENVGLDINENTKSHDQSENENKKHEYDDTHFFKNESESNWVCSRVKEIESCKEDVLD
            80        90       100       110       120       130   

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pF1KB4 PGRGLPQLPSSCYSVDRGKRKTGTLGSLEEPAGGASVSAGSRAVGVAGVAGEAGPPPERE
       :  .::  :.. :. .   .:  .:     :              . ..: :     :.:
CCDS87 PETSLP--PGNFYTSQILWKKIEAL-----PPDK-----------LLNLALEHCDSSEKE
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pF1KB4 GSGSTKPGTPGNSPSSQRL---PSKSSLDPAVNPVPKPKRTFEY--EADKNP-KSKPSNG
        .  .  .. : . : . .   :  .   :..::.:::.:::.:  :.  .: : .  . 
CCDS87 LNFRVLDSSYGITKSLENIYSEPEGQECGPSINPLPKPRRTFRYLSESGVTPYKERNCDK
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pF1KB4 LPPSPTPAAPPPLPSTPAPPVTRRPKK---DMRGHRKSQSRKSFEFEDASSLQSLYPSSP
            .  :   : :.  :    .:::    .::. :   :::::::: . ...   .. 
CCDS87 KYCENNSCAQSSLASSQEP----EPKKYGGKIRGRSK---RKSFEFEDIQHFRNRNSQTI
         240       250           260          270       280        

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pF1KB4 TENGTENQPKFGSKSTLEENAYEDIVGDLP-KENPYEDVDLKSRRAGRKSQQLSENSLDS
        :.  .:. .    .  :.: ::::.   : :::::::. .         : :       
CCDS87 REELGRNSGSALYYTQSEDNIYEDII--YPTKENPYEDIPV---------QPLP------
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pF1KB4 LHRMWSPQDRKYNSPPTQLSLKPNSQSLRSGNWSERKSHRLPRLPKRHSHDDMLLLAQLS
          ::        :: .               :      .::  :               
CCDS87 ---MWR-------SPSA---------------W------KLP--P---------------
                                            340                    

         590       600       610       620       630       640     
pF1KB4 LPSSPSSLNEDSLSTTSELLSSRRARRIPKLVQRINSIYNAKRGKKRLKKLSMSSIETAS
                            .. : . :::: .:..:...:::::..:  :... :   
CCDS87 ---------------------AKSAFKAPKLVLKIDDIFESKRGKKKVKLHSYTGKELPP
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pF1KB4 LRDENSESESDSDDRFKAHTQRLVHIQSMLKRAPSYRTLELELLEWQERELFEYFVVVSL
        . :.: .:::..   : . .::...:   :: : :.::: .:.: ::..::: ::::::
CCDS87 TKGETSGNESDAEYLPKNRHKRLAQLQPSSKRNPHYQTLERDLIELQEQQLFELFVVVSL
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pF1KB4 KKKPSRNTYLPEVSYQFP-KLDRPTKQMREAEERLKAIPQFCFPDAKDWLPVSEYSSETF
       .::::  .:.:.:  ::: : :.  :: .. :::::.::.:::::.:::.:.:: .::::
CCDS87 QKKPSGISYIPQVIQQFPGKDDHGYKQSKDMEERLKVIPKFCFPDSKDWMPTSELKSETF
            450       460       470       480       490       500  

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pF1KB4 SFMLTGEDGSRRFGYCRRLLPSGKGPRLPEVYCVISRLGCFGLFSKVLDEVERRRGISAA
       ::.:::::::: ::::..::: ::: :::::::..::::::.::::.:::::.:: .: :
CCDS87 SFVLTGEDGSRWFGYCKKLLPVGKGKRLPEVYCMVSRLGCFNLFSKILDEVEKRREMSPA
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pF1KB4 LVYPFMRSLMESPFPAPGKTIKVKTFLPGAGNEVLELRRPMDSRLEHVDFECLFTCLSVR
       ::::::::.::.::::::.:: ::..:::::.: .:: ::.:::::::::.::: :::: 
CCDS87 LVYPFMRSVMEAPFPAPGRTITVKSYLPGAGDESIELCRPLDSRLEHVDFKCLFKCLSVC
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pF1KB4 QLIRIFASLLLERRVIFVADKLSTLSSCSHAVVALLYPFSWQHTFIPVLPASMIDIVCCP
       .:::. :::::::::::::..:::::.:.::::: ::::.::::.::::::::::::: :
CCDS87 HLIRVCASLLLERRVIFVANSLSTLSKCGHAVVATLYPFTWQHTYIPVLPASMIDIVCSP
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pF1KB4 TPFLVGLLSSSLPKLKELPVEEALMVNLGSDRFIRQMDDEDTLLPRKLQAALEQALERKN
       ::::.:.:: :::.:..::.::.:.:.: .:.:.....::: .:: :::::: : ::..:
CCDS87 TPFLIGILSCSLPQLQDLPIEEVLIVDLCADKFLQEVSDEDEILPPKLQAALMQILEERN
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pF1KB4 ELISQDSDSDSDDECNTLNGLVSEVFIRFFVETVGHYSLFLTQSEKGERAFQREAFRKSV
       :...:... ..:    :::.::::.:.::::: :::::: .: .:.:::.:::: :::: 
CCDS87 EILTQEQNFSQD---VTLNSLVSEAFVRFFVELVGHYSLNMTVTERGERVFQREPFRKSH
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pF1KB4 ASKSIRRFLEVFMESQMFAGFIQDRELRKCRAKGLFEQRVEQYLEELPDTEQSGMNKFLR
       .:.:.:.::..:::.::::::::::::::  .::::: :. :::: .:..: ::::..::
CCDS87 TSRSVRHFLDLFMETQMFAGFIQDRELRKSGVKGLFEIRAIQYLETIPESEPSGMNRILR
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         1130       
pF1KB4 GLGNKMKFLHKKN
       .::.:::::.:: 
CCDS87 SLGSKMKFLQKK 
     860       870  

>>CCDS83233.1 DENND2A gene_id:27147|Hs108|chr7            (795 aa)
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Smith-Waterman score: 1941; 46.8% identity (68.7% similar) in 777 aa overlap (154-906:36-775)

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pF1KB4 DVAGVAACLPLAQSTPFPGPAAGPRGVLLTRTGTRAHSLGIREKISAWEGRREA-SPRMS
                                     :.  : .::.:..::: :::..:. .:  :
CCDS83 LDMIISDPAAEASRAGKKQLRGVQNPCPSARARPRHKSLNIKDKISEWEGKKEVPTPAPS
          10        20        30        40        50        60     

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pF1KB4 MCGEKRE----GSGSEWAASEGCPSLGCPS---VVPSPCSSEKTFDFKGLRRMSRTFSEC
         .. .:    .:  :  .:.:  .    .   . :.  :.::  . ::   ..    : 
CCDS83 RRADGQEDYLPSSTVERRSSDGVRTQVTEAKNGMRPGTESTEKERN-KGAVNVGGQDPEP
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pF1KB4 SYPETEEEGEALPVRDSFYR-LEKRLGRSEPSAFLRGHGSRKESSAVLSRIQKIEQVLKE
       .   .. : :. :   :. :  : :::.      ::    ...  .::....:.::.::.
CCDS83 GQDLSQPEREVDP---SWGRGREPRLGK------LR---FQNDPLSVLKQVKKLEQALKD
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pF1KB4 QPGRGL-PQLPSSCYSVDRGKRKTGTLGSLEEPAGGASVSAGSRAVGVAGVAGEAGPPPE
         . :: ::::..:::      :. . ..: :  ::.: :  :. :  . . :.  : ::
CCDS83 GSA-GLDPQLPGTCYSPHCPPDKAEAGSTLPENLGGGSGSEVSQRVHPSDLEGRE-PTPE
             180       190       200       210       220        230

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pF1KB4 --REGSGSTKPGTPGNSPSSQRLPSKSSLDPAVNPVPKPKRTFEYEADKNPKSKPSNG--
         .. .:: .     .  .  :    :   : .::.:::.:::.. .. .  .::. :  
CCDS83 LVEDRKGSCRRPWDRSLENVYRGSEGSPTKPFINPLPKPRRTFKHAGEGDKDGKPGIGFR
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pF1KB4 -----LPPSPTPAAPPPLPSTPAPPVTRRPKKDMRGHRKSQSRKSFEFEDASSLQSLYPS
            ::: :.   ::::::.: :  . :     : . ... :::.::::   :::   :
CCDS83 KEKRNLPPLPS-LPPPPLPSSPPPSSVNRRLWTGRQKSSADHRKSYEFEDL--LQSSSES
              300        310       320       330       340         

          470       480        490       500       510       520   
pF1KB4 SPTENGTENQPKFGSKSTL-EENAYEDIVGDLPKENPYEDVDLKSRRAGRKSQQLSENSL
       : ..     : :.:   :: :::.::::.    :::::::..:..:  :.:         
CCDS83 SRVD--WYAQTKLGLTRTLSEENVYEDILDPPMKENPYEDIELHGRCLGKKC--------
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           530       540       550       560       570        580  
pF1KB4 DSLHRMWSPQDRKYNSPPTQLSLKPNSQSLRSGNWSERKSHRLPRLPKRH-SHDDMLLLA
         :.   ::     .: :  :. .  :.     . :::.. .:  :  :. :.:     .
CCDS83 -VLNFPASPT----SSIPDTLTKQSLSKPAFFRQNSERRNFKL--LDTRKLSRDGTGSPS
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pF1KB4 QLSLPSSPSSLNEDSLSTTSELLSSRRARRIPKLVQRINSIYNAKRGKKRLKKLSMSSIE
       ..: ::.:::  .: . . ..  ..:. :.::::: :::.::...:::::.:.::.: .:
CCDS83 KISPPSTPSS-PDDIFFNLGDPQNGRKKRKIPKLVLRINAIYEVRRGKKRVKRLSQS-ME
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pF1KB4 TAS--LRDENSESESDSDDRFKAHTQRLVHIQSMLKRAPSYRTLELELLEWQERELFEYF
       . :  . ::::::.::.....:::.::::...: ::.:: : .:  ::.:.:::.:::::
CCDS83 SNSGKVTDENSESDSDTEEKLKAHSQRLVNVKSRLKQAPRYPSLARELIEYQERQLFEYF
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pF1KB4 VVVSLKKKPSRNTYLPEVSYQFP-KLDRPTKQMREAEERLKAIPQFCFPDAKDWLPVSEY
       :::::.:: .  .:.::.. ::: ::.:  : :::::..:::::::::::::::.::...
CCDS83 VVVSLHKKQAGAAYVPELTQQFPLKLERSFKFMREAEDQLKAIPQFCFPDAKDWVPVQQF
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pF1KB4 SSETFSFMLTGEDGSRRFGYCRRLLPSGKGPRLPEVYCVISRLGCFGLFSKVLDEVERRR
       .::::::.::::::::::::::::::.::: :::::::..::::::.:::..:::::.::
CCDS83 TSETFSFVLTGEDGSRRFGYCRRLLPGGKGKRLPEVYCIVSRLGCFSLFSRILDEVEKRR
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pF1KB4 GISAALVYPFMRSLMESPFPAPGKTIKVKTFLPGAGNEVLELRRPMDSRLEHVDFECLFT
       ::: ::: :.:::.::.:::: :::: ::.::::.:.::.:: ::.:::::::::: ::.
CCDS83 GISPALVQPLMRSVMEAPFPALGKTILVKNFLPGSGTEVIELCRPLDSRLEHVDFESLFS
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        ::::.:. .::::::::::::.::::                                 
CCDS83 SLSVRHLVCVFASLLLERRVIFIADKLRYPPWLLLLKRLNDSRSWTL             
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>>CCDS60219.1 DENND2D gene_id:79961|Hs108|chr1            (468 aa)
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       : .   . ..: :::: :::: :::::...:  ..::  :::::.::. ::::..:::::
CCDS60 KRENLLRGQQEEEERLLKAIPLFCFPDGNEWASLTEYPRETFSFVLTNVDGSRKIGYCRR
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       :::.: :::::.:::.:: .::::::::.:::::.:. :: :..::::..: :. :::::
CCDS60 LLPAGPGPRLPKVYCIISCIGCFGLFSKILDEVEKRHQISMAVIYPFMQGLREAAFPAPG
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       ::. .:.:.: .:.: . : ::.::.::::::  :. ::: .:...:::: .:::..::.
CCDS60 KTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFSSLLHCLSFEQILQIFASAVLERKIIFL
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       :. :::::.: ::..:::::::: ::.:::.: :..  :::::::.::.      .. . 
CCDS60 AEGLSTLSQCIHAAAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDS
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pF1KB4 PVEEALMVNLGSDRFIRQMDDEDTLLPRKLQAALEQALERK-NELISQDSDSDSDDECNT
       :.::.:.:::    :. .. ::  .:: :::  . ..: .  ::: . ..          
CCDS60 PMEEVLLVNLCEGTFLMSVGDEKDILPPKLQDDILDSLGQGINELKTAEQ----------
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       .:  ::  :..:::. ::::. .. .  .:.  ::...: :...::. :::.. :...:.
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CCDS60 FSLFIQEAEKSKNPPAGYFQQKILEYEEQKKQKKPREKTVK               
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>>CCDS831.1 DENND2D gene_id:79961|Hs108|chr1              (471 aa)
 initn: 1322 init1: 1114 opt: 1237  Z-score: 653.4  bits: 131.5 E(32554): 4.5e-30
Smith-Waterman score: 1431; 50.4% identity (76.4% similar) in 419 aa overlap (694-1110:51-459)

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CCDS83 RAGPPQDNSGEALKEPERAQEHSLPNFAGGQHFFEYLLVVSLKKKRSEDDYEPIITYQFP
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CCDS83 KRENLLRGQQEEEERLLKAIPLFCFPDGNEWASLTEYPRETFSFVLTNVDGSRKIGYCRR
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CCDS83 LLPAGPGPRLPKVYCIISCIGCFGLFSKILDEVEKRHQISMAVIYPFMQGLREAAFPAPG
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CCDS83 KTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFSSLLHCLSFEQILQIFASAVLERKIIFL
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       :. :::::.: ::..:::::::: ::.:::.: :..  :::::::.::.      .. . 
CCDS83 AEGLSTLSQCIHAAAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDS
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pF1KB4 PVEEALMVNLGSDRFIRQMDDEDTLLPRKLQAALEQALERK-NELISQDSDSDSDDECNT
       :.::.:.:::    :. .. ::  .:: :::  . ..: .  ::: . ..          
CCDS83 PMEEVLLVNLCEGTFLMSVGDEKDILPPKLQDDILDSLGQGINELKTAEQ----------
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pF1KB4 LNGLVSEVFIRFFVETVGHYSLFLTQSEKGERAFQREAFRKSVASKSIRRFLEVFMESQM
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CCDS83 INEHVSGPFVQFFVKIVGHYASYIKREANGQGHFQERSFCKALTSKTNRRFVKKFVKTQL
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1137 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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