Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB4391
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4391, 520 aa
1>>>pF1KB4391 520 - 520 aa - 520 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7983+/-0.00099; mu= 16.1706+/- 0.059
mean_var=83.2070+/-15.947, 0's: 0 Z-trim(105.9): 101 B-trim: 35 in 1/50
Lambda= 0.140603
statistics sampled from 8575 (8679) to 8575 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.634), E-opt: 0.2 (0.267), width: 16
Scan time: 2.970
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32265.1 USP3 gene_id:9960|Hs108|chr15 ( 520) 3589 738.2 5.4e-213
CCDS58370.1 USP3 gene_id:9960|Hs108|chr15 ( 476) 2913 601.0 9.6e-172
CCDS9053.1 USP44 gene_id:84101|Hs108|chr12 ( 712) 602 132.3 1.7e-30
CCDS58189.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 362) 487 108.8 1.1e-23
CCDS8423.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 396) 487 108.9 1.1e-23
CCDS8422.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 605) 487 109.0 1.6e-23
CCDS61632.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1012) 484 108.5 3.7e-23
CCDS10137.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1118) 484 108.5 4e-23
CCDS8963.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 ( 952) 479 107.5 7.2e-23
CCDS58251.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 ( 981) 479 107.5 7.3e-23
CCDS2794.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 ( 916) 466 104.8 4.3e-22
CCDS2793.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 ( 963) 466 104.8 4.5e-22
CCDS30920.1 USP21 gene_id:27005|Hs108|chr1 ( 565) 452 101.9 2.1e-21
CCDS680.1 USP33 gene_id:23032|Hs108|chr1 ( 828) 429 97.3 7.2e-20
CCDS679.1 USP33 gene_id:23032|Hs108|chr1 ( 911) 429 97.3 7.8e-20
CCDS678.1 USP33 gene_id:23032|Hs108|chr1 ( 942) 429 97.3 8e-20
CCDS43892.1 USP20 gene_id:10868|Hs108|chr9 ( 914) 424 96.3 1.6e-19
CCDS14277.1 USP11 gene_id:8237|Hs108|chrX ( 963) 422 95.9 2.2e-19
CCDS14370.1 USP51 gene_id:158880|Hs108|chrX ( 711) 410 93.4 9.2e-19
CCDS42285.1 USP22 gene_id:23326|Hs108|chr17 ( 525) 361 83.4 7.1e-16
CCDS65260.1 USP27X gene_id:389856|Hs108|chrX ( 438) 350 81.1 2.9e-15
CCDS42912.1 USP16 gene_id:10600|Hs108|chr21 ( 822) 344 80.1 1.1e-14
CCDS13583.1 USP16 gene_id:10600|Hs108|chr21 ( 823) 344 80.1 1.1e-14
CCDS81392.1 USP21 gene_id:27005|Hs108|chr1 ( 551) 339 78.9 1.6e-14
CCDS31952.1 USP12 gene_id:219333|Hs108|chr13 ( 370) 311 73.1 6e-13
CCDS47054.1 USP46 gene_id:64854|Hs108|chr4 ( 359) 296 70.1 4.8e-12
CCDS47053.1 USP46 gene_id:64854|Hs108|chr4 ( 366) 296 70.1 4.9e-12
>>CCDS32265.1 USP3 gene_id:9960|Hs108|chr15 (520 aa)
initn: 3589 init1: 3589 opt: 3589 Z-score: 3937.4 bits: 738.2 E(32554): 5.4e-213
Smith-Waterman score: 3589; 100.0% identity (100.0% similar) in 520 aa overlap (1-520:1-520)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MECPHLSSSVCIAPDSAKFPNGSPSSWCCSVCRSNKSPWVCLTCSSVHCGRYVNGHAKKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MECPHLSSSVCIAPDSAKFPNGSPSSWCCSVCRSNKSPWVCLTCSSVHCGRYVNGHAKKH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 YEDAQVPLTNHKKSEKQDKVQHTVCMDCSSYSTYCYRCDDFVVNDTKLGLVQKVREHLQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YEDAQVPLTNHKKSEKQDKVQHTVCMDCSSYSTYCYRCDDFVVNDTKLGLVQKVREHLQN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LENSAFTADRHKKRKLLENSTLNSKLLKVNGSTTAICATGLRNLGNTCFMNAILQSLSNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LENSAFTADRHKKRKLLENSTLNSKLLKVNGSTTAICATGLRNLGNTCFMNAILQSLSNI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 EQFCCYFKELPAVELRNGKTAGRRTYHTRSQGDNNVSLVEEFRKTLCALWQGSQTAFSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EQFCCYFKELPAVELRNGKTAGRRTYHTRSQGDNNVSLVEEFRKTLCALWQGSQTAFSPE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 SLFYVVWKIMPNFRGYQQQDAHEFMRYLLDHLHLELQGGFNGVSRSAILQENSTLSASNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SLFYVVWKIMPNFRGYQQQDAHEFMRYLLDHLHLELQGGFNGVSRSAILQENSTLSASNK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 CCINGASTVVTAIFGGILQNEVNCLICGTESRKFDPFLDLSLDIPSQFRSKRSKNQENGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CCINGASTVVTAIFGGILQNEVNCLICGTESRKFDPFLDLSLDIPSQFRSKRSKNQENGP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 VCSLRDCLRSFTDLEELDETELYMCHKCKKKQKSTKKFWIQKLPKVLCLHLKRFHWTAYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VCSLRDCLRSFTDLEELDETELYMCHKCKKKQKSTKKFWIQKLPKVLCLHLKRFHWTAYL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 RNKVDTYVEFPLRGLDMKCYLLEPENSGPESCLYDLAAVVVHHGSGVGSGHYTAYATHEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RNKVDTYVEFPLRGLDMKCYLLEPENSGPESCLYDLAAVVVHHGSGVGSGHYTAYATHEG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KB4 RWFHFNDSTVTLTDEETVVKAKAYILFYVEHQAKAGSDKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RWFHFNDSTVTLTDEETVVKAKAYILFYVEHQAKAGSDKL
490 500 510 520
>>CCDS58370.1 USP3 gene_id:9960|Hs108|chr15 (476 aa)
initn: 2913 init1: 2913 opt: 2913 Z-score: 3196.8 bits: 601.0 E(32554): 9.6e-172
Smith-Waterman score: 3170; 91.3% identity (91.3% similar) in 520 aa overlap (1-520:1-476)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MECPHLSSSVCIAPDSAKFPNGSPSSWCCSVCRSNKSPWVCLTCSSVHCGRYVNGHAKKH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS58 MECPHLSSSVCIAPDSAKFPNGSPSSWCCSVCRSNKSPWVCLTCSSVHCGSY--------
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 YEDAQVPLTNHKKSEKQDKVQHTVCMDCSSYSTYCYRCDDFVVNDTKLGLVQKVREHLQN
::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ------------------------------------RCDDFVVNDTKLGLVQKVREHLQN
60 70
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LENSAFTADRHKKRKLLENSTLNSKLLKVNGSTTAICATGLRNLGNTCFMNAILQSLSNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LENSAFTADRHKKRKLLENSTLNSKLLKVNGSTTAICATGLRNLGNTCFMNAILQSLSNI
80 90 100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 EQFCCYFKELPAVELRNGKTAGRRTYHTRSQGDNNVSLVEEFRKTLCALWQGSQTAFSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EQFCCYFKELPAVELRNGKTAGRRTYHTRSQGDNNVSLVEEFRKTLCALWQGSQTAFSPE
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 SLFYVVWKIMPNFRGYQQQDAHEFMRYLLDHLHLELQGGFNGVSRSAILQENSTLSASNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SLFYVVWKIMPNFRGYQQQDAHEFMRYLLDHLHLELQGGFNGVSRSAILQENSTLSASNK
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 CCINGASTVVTAIFGGILQNEVNCLICGTESRKFDPFLDLSLDIPSQFRSKRSKNQENGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CCINGASTVVTAIFGGILQNEVNCLICGTESRKFDPFLDLSLDIPSQFRSKRSKNQENGP
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 VCSLRDCLRSFTDLEELDETELYMCHKCKKKQKSTKKFWIQKLPKVLCLHLKRFHWTAYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VCSLRDCLRSFTDLEELDETELYMCHKCKKKQKSTKKFWIQKLPKVLCLHLKRFHWTAYL
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 RNKVDTYVEFPLRGLDMKCYLLEPENSGPESCLYDLAAVVVHHGSGVGSGHYTAYATHEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RNKVDTYVEFPLRGLDMKCYLLEPENSGPESCLYDLAAVVVHHGSGVGSGHYTAYATHEG
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520
pF1KB4 RWFHFNDSTVTLTDEETVVKAKAYILFYVEHQAKAGSDKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RWFHFNDSTVTLTDEETVVKAKAYILFYVEHQAKAGSDKL
440 450 460 470
>>CCDS9053.1 USP44 gene_id:84101|Hs108|chr12 (712 aa)
initn: 721 init1: 191 opt: 602 Z-score: 660.8 bits: 132.3 E(32554): 1.7e-30
Smith-Waterman score: 710; 32.2% identity (58.5% similar) in 482 aa overlap (109-520:218-687)
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 KVQHTVCMDCSSYSTYCYRCDDFVVNDTKLGLVQKVREHLQNLENSAFTADRHKKRKLLE
::.:.. .. ... : : : :.:
CCDS90 REVKKRRQELEYQVKAELESMPPRKSLRLQGLAQSTIIEIVSVQVPAQTPASPAKDKVLS
190 200 210 220 230 240
140 150 160 170 180
pF1KB4 NSTLNSKLLKVNGSTT------AICATGLRNLGNTCFMNAILQSLSNIEQF-CCYFK---
.: : ::. :.. . .::::::::::.::..:: ::.. : :..:
CCDS90 TSE-NEISQKVSDSSVKRRPIVTPGVTGLRNLGNTCYMNSVLQVLSHLLIFRQCFLKLDL
250 260 270 280 290 300
190 200
pF1KB4 ---------------ELPAVE----------------------------LRNGKTAGRRT
. : : : .: . ::.
CCDS90 NQWLAMTASEKTRSCKHPPVTDTVVYQMNECQEKDTGFVCSRQSSLSSGLSGGASKGRKM
310 320 330 340 350 360
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 --YHTRSQGDNNVSLVEEFRKTLCALWQGSQTAFSPESLFYVVWKIMPNFRGYQQQDAHE
. . .. .:: .:.. . ..:.:. . :: .... ::...: :::: ::::.:
CCDS90 ELIQPKEPTSQYISLCHELHTLFQVMWSGKWALVSPFAMLHSVWRLIPAFRGYAQQDAQE
370 380 390 400 410 420
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 FMRYLLDHLHLELQGGFNGVSRSAILQENSTLSASNKCCINGASTVVTAIFGGILQNEVN
:. :::... ::. .:.: :. . .:.. :. . .::. :: : : ..:.
CCDS90 FLCELLDKIQRELET--TGTSLPAL------IPTSQRKLIKQVLNVVNNIFHGQLLSQVT
430 440 450 460 470
330 340 350 360 370 380
pF1KB4 CLICGTESRKFDPFLDLSLDIPSQFRSKRSKNQENGPVCSLRDCLRSFTDLEELDETELY
:: : ..: ..:: ::::..: ... . .:. . : : . . : .::. : : : ..:
CCDS90 CLACDNKSNTIEPFWDLSLEFPERYQCS-GKDIASQP-CLVTEMLAKFTETEAL-EGKIY
480 490 500 510 520 530
390 400 410 420 430
pF1KB4 MCHKCKKKQK-----------STKKFWIQKLPKVLCLHLKRFHWTAYL-RNKVDTYVEFP
.: .:..:.. . :.. : .::.:: ::::::.:.. :.:. ..: :
CCDS90 VCDQCNSKRRRFSSKPVVLTEAQKQLMICHLPQVLRLHLKRFRWSGRNNREKIGVHVGFE
540 550 560 570 580 590
440 450 460 470 480
pF1KB4 -LRGLDMKCYLLEPENSGPESCLYDLAAVVVHHGSGVGSGHYTAYA--THEGRWFHFNDS
. ... : .. :: .:::.:::.:::.: :::::::: .. : : : :::
CCDS90 EILNMEPYCCRETLKSLRPECFIYDLSAVVMHHGKGFGSGHYTAYCYNSEGGFWVHCNDS
600 610 620 630 640 650
490 500 510 520
pF1KB4 TVTLTDEETVVKAKAYILFYVEHQAKAGSDKL
... . : ::.::::::... .. : .::
CCDS90 KLSMCTMDEVCKAQAYILFYTQRVTENGHSKLLPPELLLGSQHPNEDADTSSNEILS
660 670 680 690 700 710
>>CCDS58189.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 (362 aa)
initn: 672 init1: 235 opt: 487 Z-score: 539.0 bits: 108.8 E(32554): 1.1e-23
Smith-Waterman score: 687; 38.6% identity (59.2% similar) in 373 aa overlap (148-508:13-353)
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 LQNLENSAFTADRHKKRKLLENSTLNSKLLKVNGSTTAICATGLRNLGNTCFMNAILQSL
: ..: .: .::::::::::::.::: :
CCDS58 MLVPGSTRPYSKKRQNSKSAQGLAGLRNLGNTCFMNSILQCL
10 20 30 40
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 SNIEQFCCY-FKELPAVELRNGKTAGRRTYHTRSQGDNNVSLVEEFRKTLCALWQGSQT-
:: ... : ...: .:..:..: :: .::::: : . ..: .: .
CCDS58 SNTRELRDYCLQRLYMRDLHHGSNA-----HT--------ALVEEFAKLIQTIWTSSPND
50 60 70 80
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 AFSPESLFYVVWKIMPNFRGYQQQDAHEFMRYLLDHLHLELQGGFNGVS-RSAILQEN-S
. :: . . . : : ::.::::.::.:.::: :: :. : :. : :: .
CCDS58 VVSPSEFKTQIQRYAPRFVGYNQQDAQEFLRFLLDGLHNEV----NRVTLRPKSNPENLD
90 100 110 120 130 140
300 310 320 330 340
pF1KB4 TLSASNKC------CINGASTVVTAIFGGILQNEVNCLICGTESRKFDPFLDLSLDIPSQ
: ..: .. .. . .: : :.. ..: :: : :::: :::: :
CCDS58 HLPDDEKGRQMWRKYLEREDSRIGDLFVGQLKSSLTCTDCGYCSTVFDPFWDLSLPI---
150 160 170 180 190 200
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 FRSKRSKNQENGPVCSLRDCLRSFTDLEELDETELYMCHKCKKKQKSTKKFWIQKLPKVL
.::. : .: ::.: :: . :: : : .:. ... ::: ::..::.:
CCDS58 --AKRGY-----PEVTLMDCMRLFTKEDVLDGDEKPTCCRCRGRKRCIKKFSIQRFPKIL
210 220 230 240 250
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 CLHLKRFHWTAYLRNKVDTYVEFPLRGLDMKCYLLEPENSGPESCLYDLAAVVVHHGSGV
:::::: . .:. :.:.:::: ::.. . : : . .:.: :: : :. .
CCDS58 VLHLKRFSESRIRTSKLTTFVNFPLRDLDLREFASENTNHA----VYNLYAVSNHSGTTM
260 270 280 290 300 310
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 GSGHYTAY--ATHEGRWFHFNDSTVTLTDEETVVKAKAYILFYVEHQAKAGSDKL
: :::::: . :.: ::::.:: . : . ::.:::
CCDS58 G-GHYTAYCRSPGTGEWHTFNDSSVTPMSSSQVRTSDAYLLFYELASPPSRM
320 330 340 350 360
>>CCDS8423.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 (396 aa)
initn: 672 init1: 235 opt: 487 Z-score: 538.4 bits: 108.9 E(32554): 1.1e-23
Smith-Waterman score: 694; 38.2% identity (59.5% similar) in 385 aa overlap (136-508:35-387)
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 TKLGLVQKVREHLQNLENSAFTADRHKKRKLLENSTLNSKLLKVNGSTTAICATGLRNLG
:: .. .. : :...: .: .::::::
CCDS84 YTVTLPEDPPAAPFPALAKELRPRSPLSPSLLLSTFVGLLLNKAKNSKSAQGLAGLRNLG
10 20 30 40 50 60
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 NTCFMNAILQSLSNIEQFCCY-FKELPAVELRNGKTAGRRTYHTRSQGDNNVSLVEEFRK
::::::.::: ::: ... : ...: .:..:..: :: .::::: :
CCDS84 NTCFMNSILQCLSNTRELRDYCLQRLYMRDLHHGSNA-----HT--------ALVEEFAK
70 80 90 100 110
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 TLCALWQGSQT-AFSPESLFYVVWKIMPNFRGYQQQDAHEFMRYLLDHLHLELQGGFNGV
. ..: .: . . :: . . . : : ::.::::.::.:.::: :: :. : :
CCDS84 LIQTIWTSSPNDVVSPSEFKTQIQRYAPRFVGYNQQDAQEFLRFLLDGLHNEV----NRV
120 130 140 150 160
290 300 310 320 330
pF1KB4 S-RSAILQEN-STLSASNKC------CINGASTVVTAIFGGILQNEVNCLICGTESRKFD
. : :: . : ..: .. .. . .: : :.. ..: :: : ::
CCDS84 TLRPKSNPENLDHLPDDEKGRQMWRKYLEREDSRIGDLFVGQLKSSLTCTDCGYCSTVFD
170 180 190 200 210 220
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 PFLDLSLDIPSQFRSKRSKNQENGPVCSLRDCLRSFTDLEELDETELYMCHKCKKKQKST
:: :::: : .::. : .: ::.: :: . :: : : .:. ...
CCDS84 PFWDLSLPI-----AKRGY-----PEVTLMDCMRLFTKEDVLDGDEKPTCCRCRGRKRCI
230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 KKFWIQKLPKVLCLHLKRFHWTAYLRNKVDTYVEFPLRGLDMKCYLLEPENSGPESCLYD
::: ::..::.: :::::: . .:. :.:.:::: ::.. . : : . .:.
CCDS84 KKFSIQRFPKILVLHLKRFSESRIRTSKLTTFVNFPLRDLDLREFASENTNHA----VYN
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KB4 LAAVVVHHGSGVGSGHYTAY--ATHEGRWFHFNDSTVTLTDEETVVKAKAYILFYVEHQA
: :: : :. .: :::::: . :.: ::::.:: . : . ::.:::
CCDS84 LYAVSNHSGTTMG-GHYTAYCRSPGTGEWHTFNDSSVTPMSSSQVRTSDAYLLFYELASP
340 350 360 370 380 390
520
pF1KB4 KAGSDKL
CCDS84 PSRM
>>CCDS8422.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 (605 aa)
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.. : ...: .:..:..: :: .::::: : . ..: .: . . ::
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..: .. .. . .: : :.. ..: :: : :::: :::: : .:
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:::: . :.: ::::.:: . : . ::.:::
CCDS84 YTAYCRSPGTGEWHTFNDSSVTPMSSSQVRTSDAYLLFYELASPPSRM
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CCDS61 DQFAGYSQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADN---RKRYKEENNDHLDDFKAAEHAWQKHK
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pF1KB4 --ASTVVTAIFGGILQNEVNCLICGTESRKFDPFLDLSLDIPSQFRSKRSKNQENGPVCS
....:.: : ... :.:: : .:: :. :. ::: . : :: :.
CCDS61 QLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLAST--SK----------CT
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CCDS61 LQDCLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQK
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CCDS61 LQTSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKK---YNLFSVSNHYG-GLDGGHYTAYCKNAARQR
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CCDS61 WFKFDDHEVSDISVSSVKSSAAYILFYTSLGPRVTDVAT
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pF1KB4 VQHTVCMDCSSYSTYCYRCDDFVVNDTKLGLVQKVREHLQNLENSAFTADRHKKRKLL--
..: ..:. . . . :..:..:
CCDS10 TPPTHKAKPQIPAERDREPSKLKRSYSSPDITQAIQEEEKRKPTVTPTVNRENKPTCYPK
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pF1KB4 -ENSTLN-SKLLKVN----GSTTAICATGLRNLGNTCFMNAILQSLSNIEQFCCYFKELP
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CCDS10 AEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPAL--TGLRNLGNTCYMNSILQCLCNAPHLADYFN---
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pF1KB4 AVELRNG-KTAGRRTYHTRSQGDNNVSLVEEFRKTLCALWQGSQTAFSPESLFYVVWKIM
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CCDS10 ----RNCYQDDINRSNLLGHKGE----VAEEFGIIMKALWTGQYRYISPKDFKITIGKIN
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pF1KB4 PNFRGYQQQDAHEFMRYLLDHLHLELQGGFNGVSRSAILQENSTLSASNKCCING-----
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CCDS10 DQFAGYSQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADN---RKRYKEENNDHLDDFKAAEHAWQKHK
860 870 880 890 900 910
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pF1KB4 --ASTVVTAIFGGILQNEVNCLICGTESRKFDPFLDLSLDIPSQFRSKRSKNQENGPVCS
....:.: : ... :.:: : .:: :. :. ::: . : :: :.
CCDS10 QLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLAST--SK----------CT
920 930 940 950 960
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pF1KB4 LRDCLRSFTDLEELDETELYMCHKCKKKQKSTKKFWIQKLPKVLCLHLKRFHWTAYLRNK
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CCDS10 LQDCLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQK
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pF1KB4 VDTYVEFPLRGLDMKCYLLEPENSGPESCLYDLAAVVVHHGSGVGSGHYTAYATHEGR--
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CCDS10 LQTSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKK---YNLFSVSNHYG-GLDGGHYTAYCKNAARQR
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CCDS10 WFKFDDHEVSDISVSSVKSSAAYILFYTSLGPRVTDVAT
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CCDS89 DPDLKKRYFDENAAEDFEKHESVEYKPPKKPFVKLKDCIELFTTKEKLGAEDPWYCPNCK
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CCDS89 EHQQATKKLDLWSLPPVLVVHLKRFSYSRYMRDKLDTLVDFPINDLDMSEFLINP-NAGP
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CCDS89 --CRYNLIAVSNHYG-GMGGGHYTAFAKNKDDGKWYYFDDSSVSTASEDQIVSKAAYVLF
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pF1KB4 YVEHQAKAGSDKL
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CCDS89 YQRQDTFSGTGFFPLDRETKGASAATGIPLESDEDSNDNDNDIENENCMHTN
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CCDS58 DPDLKKRYFDENAAEDFEKHESVEYKPPKKPFVKLKDCIELFTTKEKLGAEDPWYCPNCK
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CCDS58 EHQQATKKLDLWSLPPVLVVHLKRFSYSRYMRDKLDTLVDFPINDLDMSEFLINP-NAGP
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CCDS58 --CRYNLIAVSNHYG-GMGGGHYTAFAKNKDDGKWYYFDDSSVSTASEDQIVSKAAYVLF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]