Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB4139
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4139, 436 aa
1>>>pF1KB4139 436 - 436 aa - 436 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9624+/-0.00167; mu= 10.6102+/- 0.099
mean_var=230.3115+/-46.746, 0's: 0 Z-trim(105.2): 946 B-trim: 6 in 1/50
Lambda= 0.084512
statistics sampled from 7276 (8298) to 7276 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.576), E-opt: 0.2 (0.255), width: 16
Scan time: 2.720
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS74348.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19 ( 540) 3193 403.3 3e-112
CCDS54257.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19 ( 563) 3193 403.3 3e-112
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1711 222.6 6.9e-58
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1650 215.3 1.5e-55
CCDS74387.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 540) 1579 206.5 5.1e-53
CCDS46097.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 679) 1579 206.7 5.9e-53
CCDS33005.1 ZFP30 gene_id:22835|Hs108|chr19 ( 519) 1569 205.3 1.2e-52
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1567 205.2 1.7e-52
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1555 204.0 5.8e-52
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1555 204.0 5.9e-52
CCDS12493.1 ZFP82 gene_id:284406|Hs108|chr19 ( 532) 1547 202.6 7.6e-52
CCDS12491.1 ZNF565 gene_id:147929|Hs108|chr19 ( 499) 1532 200.8 2.6e-51
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 1533 201.2 3.2e-51
CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 1533 201.2 3.2e-51
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1529 200.5 3.7e-51
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1529 200.5 3.9e-51
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1518 199.2 9.6e-51
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1518 199.2 1e-50
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1518 199.2 1e-50
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1518 199.2 1e-50
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1517 199.4 1.4e-50
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 1513 198.6 1.5e-50
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1513 198.6 1.5e-50
CCDS12946.1 ZFP28 gene_id:140612|Hs108|chr19 ( 868) 1505 197.8 3.5e-50
CCDS33026.2 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 641) 1494 196.3 7.5e-50
CCDS46079.1 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 642) 1494 196.3 7.5e-50
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 1487 195.4 1.3e-49
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1487 195.5 1.5e-49
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 1486 195.4 1.7e-49
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1481 194.5 1.9e-49
CCDS54259.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 695) 1483 195.0 2e-49
CCDS33006.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 696) 1483 195.0 2e-49
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1483 195.0 2.1e-49
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1483 195.1 2.2e-49
CCDS46077.1 ZNF780B gene_id:163131|Hs108|chr19 ( 833) 1483 195.1 2.2e-49
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1478 194.4 3.1e-49
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 1478 194.4 3.2e-49
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1477 194.3 3.5e-49
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 1473 193.5 3.7e-49
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1473 193.7 4.6e-49
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1468 193.0 6e-49
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1467 192.9 6.9e-49
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1468 193.1 7e-49
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1468 193.1 7e-49
CCDS33002.1 ZFP14 gene_id:57677|Hs108|chr19 ( 533) 1466 192.7 7.2e-49
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1467 193.0 7.4e-49
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1466 192.9 8.2e-49
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 1461 192.1 1.1e-48
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1463 192.7 1.2e-48
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1458 191.9 1.5e-48
>>CCDS74348.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19 (540 aa)
initn: 3193 init1: 3193 opt: 3193 Z-score: 2128.8 bits: 403.3 E(32554): 3e-112
Smith-Waterman score: 3193; 99.8% identity (100.0% similar) in 436 aa overlap (1-436:105-540)
10 20 30
pF1KB4 MEEFKSHSPERSIFSAIWEGNCHFEQHQGQ
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 WCPDLASRDEPQKLSPKRDIYETELSQWVNMEEFKSHSPERSIFSAIWEGNCHFEQHQGQ
80 90 100 110 120 130
40 50 60 70 80 90
pF1KB4 EEGYFRQLMINHENMPIFSQHTLLTQEFYDREKISECKKCRKIFSYHLFFSHHKRTHSKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 EEGYFRQLMINHENMPIFSQHTLLTQEFYDREKISECKKCRKIFSYHLFFSHHKRTHSKE
140 150 160 170 180 190
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 LSECKECTEIVNTPCLFKQQTIQNGDKCNECKECWKAFVHCSQLKHLRIHNGEKRYECNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LSECKECTEIVNTPCLFKQQTIQNGDKCNECKECWKAFVHCSQLKHLRIHNGEKRYECNE
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 CGKAFNYGSELTLHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQRSQLTQHQRLHTGEKPYECKQCGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 CGKAFNYGSELTLHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQRSQLTQHQRLHTGEKPYECKQCGKA
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 FIRGFQLTEHLRLHTGEKPYECKECGKTFRHRSHLTIHQRIHTGEEPYECRECGKAFSYH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS74 FIRGFQLTEHLRLHTGEKPYECKECGKTFRHRSHLTIHQRIHTGEKPYECRECGKAFSYH
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 SSFSHHQKIHSGKKPYECHECGKAFCDGLQLTLHQRIHTGEKPYECKECGKTFRQCSHLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SSFSHHQKIHSGKKPYECHECGKAFCDGLQLTLHQRIHTGEKPYECKECGKTFRQCSHLK
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 RHQRIHTGEKPHECMICGKAFRLHSHLIQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSYHSSFSHHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RHQRIHTGEKPHECMICGKAFRLHSHLIQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSYHSSFSHHQR
440 450 460 470 480 490
400 410 420 430
pF1KB4 IHSGKKPYQCGKAFNHRLQLNLHQTLHTGEKPVRFPLLPPHPSLAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 IHSGKKPYQCGKAFNHRLQLNLHQTLHTGEKPVRFPLLPPHPSLAS
500 510 520 530 540
>>CCDS54257.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19 (563 aa)
initn: 3193 init1: 3193 opt: 3193 Z-score: 2128.6 bits: 403.3 E(32554): 3e-112
Smith-Waterman score: 3193; 99.8% identity (100.0% similar) in 436 aa overlap (1-436:128-563)
10 20 30
pF1KB4 MEEFKSHSPERSIFSAIWEGNCHFEQHQGQ
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 INADLASRDEPQKLSPKRDIYETELSQWVNMEEFKSHSPERSIFSAIWEGNCHFEQHQGQ
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40 50 60 70 80 90
pF1KB4 EEGYFRQLMINHENMPIFSQHTLLTQEFYDREKISECKKCRKIFSYHLFFSHHKRTHSKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EEGYFRQLMINHENMPIFSQHTLLTQEFYDREKISECKKCRKIFSYHLFFSHHKRTHSKE
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 LSECKECTEIVNTPCLFKQQTIQNGDKCNECKECWKAFVHCSQLKHLRIHNGEKRYECNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LSECKECTEIVNTPCLFKQQTIQNGDKCNECKECWKAFVHCSQLKHLRIHNGEKRYECNE
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 CGKAFNYGSELTLHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQRSQLTQHQRLHTGEKPYECKQCGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CGKAFNYGSELTLHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQRSQLTQHQRLHTGEKPYECKQCGKA
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220 230 240 250 260 270
pF1KB4 FIRGFQLTEHLRLHTGEKPYECKECGKTFRHRSHLTIHQRIHTGEEPYECRECGKAFSYH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS54 FIRGFQLTEHLRLHTGEKPYECKECGKTFRHRSHLTIHQRIHTGEKPYECRECGKAFSYH
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 SSFSHHQKIHSGKKPYECHECGKAFCDGLQLTLHQRIHTGEKPYECKECGKTFRQCSHLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SSFSHHQKIHSGKKPYECHECGKAFCDGLQLTLHQRIHTGEKPYECKECGKTFRQCSHLK
400 410 420 430 440 450
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 RHQRIHTGEKPHECMICGKAFRLHSHLIQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSYHSSFSHHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RHQRIHTGEKPHECMICGKAFRLHSHLIQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSYHSSFSHHQR
460 470 480 490 500 510
400 410 420 430
pF1KB4 IHSGKKPYQCGKAFNHRLQLNLHQTLHTGEKPVRFPLLPPHPSLAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IHSGKKPYQCGKAFNHRLQLNLHQTLHTGEKPVRFPLLPPHPSLAS
520 530 540 550 560
>>CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 (488 aa)
initn: 6576 init1: 1390 opt: 1711 Z-score: 1152.7 bits: 222.6 E(32554): 6.9e-58
Smith-Waterman score: 1711; 58.0% identity (77.2% similar) in 429 aa overlap (1-422:1-425)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MEEFKSHSPERSIFSAIWEGNCHFEQHQGQEEGYFRQLMINHENMPIFS-QHTLLTQEFY
::.. .:: : : : . :: . .::..::..::.: ..... :.:: :: :: :...
CCDS12 MENLTKHSIECSSFRGDWECKNQFERKQGSQEGHFSEMIFTPEDMPTFSIQH----QRIH
10 20 30 40 50
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pF1KB4 DREKISECKKCRKIFSYHLFFSHHKRTHSKELS-ECKECTEIVNTPC-LFKQQTIQNGDK
::. :::.: : ::. . .:.: :. : ::::: . .. : .: :..:.:
CCDS12 TDEKLLECKECGKDFSFVSVLVRHQRIHTGEKPYECKECGKAFGSGANLAYHQRIHTGEK
60 70 80 90 100 110
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pF1KB4 CNECKECWKAFVHCSQL-KHLRIHNGEKRYECNECGKAFNYGSELTLHQRIHTGEKPYEC
::::: ::: :.: .: :::.::: :::.::::::..:: : :: ::.:::::::
CCDS12 PFECKECGKAFGSGSNLTHHQRIHTGEKPYECKECGKAFSFGSGLIRHQIIHSGEKPYEC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 KECGKAFRQRSQLTQHQRLHTGEKPYECKQCGKAFIRGFQLTEHLRLHTGEKPYECKECG
:::::.: .: : .:.:.::::::::: .::::: : .::.: :.:::::::::: ::
CCDS12 KECGKSFSFESALIRHHRIHTGEKPYECIDCGKAFGSGSNLTQHRRIHTGEKPYECKACG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 KTFRHRSHLTIHQRIHTGEEPYECRECGKAFSYHSSFSHHQKIHSGKKPYECHECGKAFC
.: : :: ::::::::.:: : :::::::. :....::.::.:.::: :.::::::
CCDS12 MAFSSGSALTRHQRIHTGEKPYICNECGKAFSFGSALTRHQRIHTGEKPYVCKECGKAFN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 DGLQLTLHQRIHTGEKPYECKECGKTFRQCSHLKRHQRIHTGEKPHECMICGKAFRLHSH
.: .:: :::::::::::::::: :.::. :.: .:::.::::::.:: :::.: :
CCDS12 SGSDLTQHQRIHTGEKPYECKECEKAFRSGSKLIQHQRMHTGEKPYECKECGKTFSSGSD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 LIQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSYHSSFSHHQRIHSGKKPYQC---GKAFNHRLQLNLH
: ::.::::::::::::::::::. :.. .:: ::.:..::.: ::.:. :: :
CCDS12 LTQHHRIHTGEKPYECKECGKAFGSGSKLIQHQLIHTGERPYECKECGKSFSSGSALNRH
360 370 380 390 400 410
420 430
pF1KB4 QTLHTGEKPVRFPLLPPHPSLAS
: .::::::
CCDS12 QRIHTGEKPYECKECGKAFYSGSSLTQHQRIHTGEKLYECKNCGKAYGRDSEFQQHKKSH
420 430 440 450 460 470
>>CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 (688 aa)
initn: 6746 init1: 1395 opt: 1650 Z-score: 1110.9 bits: 215.3 E(32554): 1.5e-55
Smith-Waterman score: 1686; 62.3% identity (79.6% similar) in 382 aa overlap (47-422:233-614)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 IWEGNCHFEQHQGQEEGYFRQLMINHENMPIFSQHTLLTQEFYDREKISECKKCRKIFSY
: :.. :. . :: :::.: : :.
CCDS12 AFTQSSQLILHHRIHTGEKPYKCEECGKAFIRSSQLTRHQKVHTGEKPYECKECGKAFTQ
210 220 230 240 250 260
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 HLFFSHHKRTHSKE-LSECKECTEI-VNTPCLFKQQTIQNGDKCNECKECWKAFVHCSQL
. .. :.: :. : : ::::: .. .. :. .. :..:.: ::::: :::. :::
CCDS12 NSQLTLHQRLHTGEKLYECKECRKVFTQLSQLILHKRIHTGEKPYECKECGKAFICGSQL
270 280 290 300 310 320
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 -KHLRIHNGEKRYECNECGKAFNYGSELTLHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQRSQLTQHQ
.: .:::::: :::.:::.:: :: : :::::::::::.:.:::::: . :::::::
CCDS12 SQHQKIHNGEKPYECKECGRAFIRGSLLMQHQRIHTGEKPYKCEECGKAFIRGSQLTQHQ
330 340 350 360 370 380
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 RLHTGEKPYECKQCGKAFIRGFQLTEHLRLHTGEKPYECKECGKTFRHRSHLTIHQRIHT
:.::.:::::::.::: : .: :::.: :.:::::::.::::::.: . : :: ::::::
CCDS12 RIHTNEKPYECKECGKMFSHGSQLTQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFNRGSLLTRHQRIHT
390 400 410 420 430 440
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 GEEPYECRECGKAFSYHSSFSHHQKIHSGKKPYECHECGKAFCDGLQLTLHQRIHTGEKP
::.::::.::::.:: : ...:..::.:.:::::.::::.: : ::: ::::::::::
CCDS12 GEKPYECKECGKTFSRGSELTQHERIHTGEKPYECKECGKSFIRGSQLTQHQRIHTGEKP
450 460 470 480 490 500
320 330 340 350 360 370
pF1KB4 YECKECGKTFRQCSHLKRHQRIHTGEKPHECMICGKAFRLHSHLIQHQRIHTGEKPYECK
:::::: .: : :::..:::.::::::. : ::::: ::::::::::::::.::
CCDS12 YECKECRMAFTQSSHLSQHQRLHTGEKPYVCNECGKAFARGLLLIQHQRIHTGEKPYQCK
510 520 530 540 550 560
380 390 400 410 420 430
pF1KB4 ECGKAFSYHSSFSHHQRIHSGKKPYQC---GKAFNHRLQLNLHQTLHTGEKPVRFPLLPP
:::::: :....:::::.:.:::.: ::::.: ::.::: .::::::
CCDS12 ECGKAFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSHGSQLTLHQRIHTGEKPYECRECRK
570 580 590 600 610 620
pF1KB4 HPSLAS
CCDS12 AFTQSSHLSRHQRIHTGEKPYQCKECGKAFTRGSQLTQHQRIHISEKSFEYKECGIDFSH
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pF1KB4 NHRLQLNLHQTLHTGEKPVRFPLLPPHPSLAS
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CCDS74 RLRLRLTQHQQIHTGEKPYQCQECGKAFVSVSGLTQHHRIHTGEKPYECPDCGKAFRQRT
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pF1KB4 WEGNCHFEQHQGQEEGYFRQLMINHENMPIFSQHTLLTQE--FYDREKISECKKCRKIFS
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CCDS74 KAFVSVSGLTQHHRIHTGEKPYECPDCGKAFRQRTYLNQHRRIHTGEKPYECKECGKSFT
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pF1KB4 YHLFFSHHKRTHSKELS-ECKECTE-IVNTPCLFKQQTIQNGDKCNECKECWKAFV-HCS
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CCDS74 FCSGLIQHQQNHTDEKPYDGKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKPYDCKECGKSFTSHST
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pF1KB4 QLKHLRIHNGEKRYECNECGKAFNYGSELTLHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQRSQLTQH
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CCDS74 LIQHQQIHTGEKLYDCKECGKSFTSHSTLIQHQPLHTGEKPYHCKECGKSFTLRSALIQH
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CCDS74 RPVHTGEKRYSCKECGKSFTSRSTLIEHQRIHTGEKPYHCKECGKSFAFRSAIIQHRRIH
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CCDS74 TGEKPYDCKECGKAFRRRSKLTQHQRIHTGEKPYRCHECGKAFVRFSGLTKHHSIHTGEK
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CCDS74 PYECKTCGKSFRQRTHLTLHQRIHTGDRPYECKECGKSFTCGSELIRHQRTHTGEKPYDC
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CCDS74 KECGKAFRCPSQLSQHKRIHTGEKTYQCPECGKAFFYASGLSRHQSVHTGEKPYECKTCG
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430
pF1KB4 PHPSLAS
CCDS74 KAFKQLTQLTRHQRIHDLT
1040 1050
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