Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB3818
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3818, 416 aa
1>>>pF1KB3818 416 - 416 aa - 416 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6675+/-0.00129; mu= -8.2533+/- 0.074
mean_var=419.9473+/-96.478, 0's: 0 Z-trim(110.6): 170 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.062586
statistics sampled from 11560 (11702) to 11560 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.718), E-opt: 0.2 (0.359), width: 16
Scan time: 2.770
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13970.1 CSNK1E gene_id:1454|Hs108|chr22 ( 416) 2791 266.7 3e-71
CCDS11806.1 CSNK1D gene_id:1453|Hs108|chr17 ( 409) 2359 227.6 1.7e-59
CCDS11805.1 CSNK1D gene_id:1453|Hs108|chr17 ( 415) 2309 223.1 3.8e-58
CCDS64291.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5 ( 325) 1575 156.7 2.9e-38
CCDS47303.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5 ( 337) 1575 156.8 3e-38
CCDS9363.1 CSNK1A1L gene_id:122011|Hs108|chr13 ( 337) 1512 151.1 1.5e-36
CCDS59491.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 ( 424) 1242 126.8 3.9e-29
CCDS43355.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 ( 455) 1231 125.8 8.1e-29
CCDS4135.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 ( 447) 1229 125.7 9.1e-29
CCDS34218.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 ( 423) 1225 125.3 1.1e-28
CCDS12077.1 CSNK1G2 gene_id:1455|Hs108|chr19 ( 415) 1203 123.3 4.4e-28
CCDS10192.2 CSNK1G1 gene_id:53944|Hs108|chr15 ( 422) 1202 123.2 4.7e-28
CCDS59492.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 ( 348) 1095 113.4 3.4e-25
CCDS59493.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 ( 311) 977 102.7 5e-22
CCDS47304.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5 ( 365) 844 90.8 2.3e-18
CCDS34455.1 TTBK1 gene_id:84630|Hs108|chr6 (1321) 604 69.7 1.8e-11
>>CCDS13970.1 CSNK1E gene_id:1454|Hs108|chr22 (416 aa)
initn: 2791 init1: 2791 opt: 2791 Z-score: 1392.6 bits: 266.7 E(32554): 3e-71
Smith-Waterman score: 2791; 100.0% identity (100.0% similar) in 416 aa overlap (1-416:1-416)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MELRVGNKYRLGRKIGSGSFGDIYLGANIASGEEVAIKLECVKTKHPQLHIESKFYKMMQ
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CCDS13 MELRVGNKYRLGRKIGSGSFGDIYLGANIASGEEVAIKLECVKTKHPQLHIESKFYKMMQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 GGVGIPSIKWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GGVGIPSIKWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 SINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 CKGYPSEFSTYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNMLKFGAARN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CKGYPSEFSTYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNMLKFGAARN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 PEDVDRERREHEREERMGQLRGSATRALPPGPPTGATANRLRSAAEPVASTPASRIQPAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PEDVDRERREHEREERMGQLRGSATRALPPGPPTGATANRLRSAAEPVASTPASRIQPAG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB3 NTSPRAISRVDRERKVSMRLHRGAPANVSSSDLTGRQEVSRIPASQTSVPFDHLGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NTSPRAISRVDRERKVSMRLHRGAPANVSSSDLTGRQEVSRIPASQTSVPFDHLGK
370 380 390 400 410
>>CCDS11806.1 CSNK1D gene_id:1453|Hs108|chr17 (409 aa)
initn: 2032 init1: 2032 opt: 2359 Z-score: 1181.8 bits: 227.6 E(32554): 1.7e-59
Smith-Waterman score: 2359; 84.4% identity (94.2% similar) in 416 aa overlap (1-416:1-409)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MELRVGNKYRLGRKIGSGSFGDIYLGANIASGEEVAIKLECVKTKHPQLHIESKFYKMMQ
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CCDS11 MELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIESKIYKMMQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 GGVGIPSIKWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIH
::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 SINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 CKGYPSEFSTYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNMLKFGAARN
::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS11 CKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNMLKFGASRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 PEDVDRERREHEREERMGQLRGSATRALPPGPPTGATANRLRSAAEPVASTPASRIQPAG
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CCDS11 ADDAERERRD--REERLRHSRNPATRGLP-----STASGRLRGTQEVAPPTPLTPTSHTA
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KB3 NTSPRAISRVDRERKVSMRLHRGAPANVSSSDLTGRQEVSRIPASQTSVPFDHLGK
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CCDS11 NTSPRPVSGMERERKVSMRLHRGAPVNISSSDLTGRQDTSRMSTSQNSIPFEHHGK
360 370 380 390 400
>>CCDS11805.1 CSNK1D gene_id:1453|Hs108|chr17 (415 aa)
initn: 2032 init1: 2032 opt: 2309 Z-score: 1157.4 bits: 223.1 E(32554): 3.8e-58
Smith-Waterman score: 2309; 85.0% identity (94.3% similar) in 406 aa overlap (1-406:1-399)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MELRVGNKYRLGRKIGSGSFGDIYLGANIASGEEVAIKLECVKTKHPQLHIESKFYKMMQ
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CCDS11 MELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIESKIYKMMQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 GGVGIPSIKWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIH
::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 SINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 CKGYPSEFSTYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNMLKFGAARN
::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS11 CKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNMLKFGASRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 PEDVDRERREHEREERMGQLRGSATRALPPGPPTGATANRLRSAAEPVASTPASRIQPAG
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CCDS11 ADDAERERRD--REERLRHSRNPATRGLP-----STASGRLRGTQEVAPPTPLTPTSHTA
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KB3 NTSPRAISRVDRERKVSMRLHRGAPANVSSSDLTGRQEVSRIPASQTSVPFDHLGK
::::: .: ..::::::::::::::.:.:::::::::..::. .::
CCDS11 NTSPRPVSGMERERKVSMRLHRGAPVNISSSDLTGRQDTSRMSTSQIPGRVASSGLQSVV
360 370 380 390 400 410
CCDS11 HR
>>CCDS64291.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5 (325 aa)
initn: 1572 init1: 1572 opt: 1575 Z-score: 800.5 bits: 156.7 E(32554): 2.9e-38
Smith-Waterman score: 1575; 75.5% identity (91.6% similar) in 298 aa overlap (2-299:10-307)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MELRVGNKYRLGRKIGSGSFGDIYLGANIASGEEVAIKLECVKTKHPQLHIE
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CCDS64 MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 SKFYKMMQGGVGIPSIKWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQM
::.::..::::::: :.: : : ::::.::.:::::::::::::::.:..::::.:::::
CCDS64 SKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 ISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKN
::::::.:.:::::::.::::::::.:.. : ...::::::::::: ::.:::::::.::
CCDS64 ISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 LTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKK
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CCDS64 LTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 MSTPIEVLCKGYPSEFSTYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNM
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CCDS64 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 LKFGAARNPEDVDRERREHEREERMGQLRGSATRALPPGPPTGATANRLRSAAEPVASTP
:: ::.
CCDS64 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGF
310 320
>>CCDS47303.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5 (337 aa)
initn: 1572 init1: 1572 opt: 1575 Z-score: 800.3 bits: 156.8 E(32554): 3e-38
Smith-Waterman score: 1575; 75.5% identity (91.6% similar) in 298 aa overlap (2-299:10-307)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MELRVGNKYRLGRKIGSGSFGDIYLGANIASGEEVAIKLECVKTKHPQLHIE
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CCDS47 MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 SKFYKMMQGGVGIPSIKWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQM
::.::..::::::: :.: : : ::::.::.:::::::::::::::.:..::::.:::::
CCDS47 SKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 ISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKN
::::::.:.:::::::.::::::::.:.. : ...::::::::::: ::.:::::::.::
CCDS47 ISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 LTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKK
:::::::::::.:::::::::::.::::::::::: ::::::::::::.::::.:::::
CCDS47 LTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 MSTPIEVLCKGYPSEFSTYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNM
::::.::::::.:.::. :::.::.:::.. ::: ::::::: ::. . .:::.:::.:
CCDS47 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 LKFGAARNPEDVDRERREHEREERMGQLRGSATRALPPGPPTGATANRLRSAAEPVASTP
:: ::.
CCDS47 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGKQTDKTKSNMKGF
310 320 330
>>CCDS9363.1 CSNK1A1L gene_id:122011|Hs108|chr13 (337 aa)
initn: 1512 init1: 1512 opt: 1512 Z-score: 769.5 bits: 151.1 E(32554): 1.5e-36
Smith-Waterman score: 1512; 71.8% identity (89.6% similar) in 298 aa overlap (2-299:10-307)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MELRVGNKYRLGRKIGSGSFGDIYLGANIASGEEVAIKLECVKTKHPQLHIE
:: ::.::.: ::::::::::.::: . ..::.::.::: :.::::: :
CCDS93 MTNNSGSKAELVVGGKYKLVRKIGSGSFGDVYLGITTTNGEDVAVKLESQKVKHPQLLYE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 SKFYKMMQGGVGIPSIKWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQM
::.: ..::::::: ..: : : : ::.::.:::::::::::::::.:..::::.:::::
CCDS93 SKLYTILQGGVGIPHMHWYGQEKDNNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 ISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKN
::::::.:.:::.:::.:::::::: :.. : ...::::::::::: ::.:::::::.:.
CCDS93 ISRIEYVHTKNFLHRDIKPDNFLMGTGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 LTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKK
: ::.::::::.:::::::::::.::::::.:::: :::::::.: ::.::::.:::::
CCDS93 LIGTVRYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVFMYFNRTSLPWQGLRAMTKKQKYEKISEKK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 MSTPIEVLCKGYPSEFSTYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNM
::::.::::::.:.::. :::.::.:::.. ::: ::::::: ::. . .:::.:::.:
CCDS93 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEVPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 LKFGAARNPEDVDRERREHEREERMGQLRGSATRALPPGPPTGATANRLRSAAEPVASTP
:: ::.
CCDS93 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTQTGKQTEKNKNNVKDN
310 320 330
>>CCDS59491.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 (424 aa)
initn: 1243 init1: 663 opt: 1242 Z-score: 636.6 bits: 126.8 E(32554): 3.9e-29
Smith-Waterman score: 1242; 51.2% identity (77.2% similar) in 369 aa overlap (3-361:37-405)
10 20 30
pF1KB3 MELRVGNKYRLGRKIGSGSFGDIYLGANIASG
: :: ..:.:.::: :.::.. :: :. ..
CCDS59 DKDKSDDRMARPSGRSGHNTRGTGSSSSGVLMVGPNFRVGKKIGCGNFGELRLGKNLYTN
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 EEVAIKLECVKTKHPQLHIESKFYKMMQGGVGIPSIKWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDL
: :::::: .:.. ::::.: .:::.. .: :::.. . : : ::.::.::::::::::
CCDS59 EYVAIKLEPMKSRAPQLHLEYRFYKQLGSGDGIPQVYYFGPCGKYNAMVLELLGPSLEDL
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 FNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGL--GKKGNLVYIIDF
:..:.: :::::::..: :.:::.::.::::.:.:::::.:::.: .: ....::::
CCDS59 FDLCDRTFSLKTVLMIAIQLISRMEYVHSKNLIYRDVKPENFLIGRPGNKTQQVIHIIDF
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 GLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGS
::::.: : .:..::::::.:.::::::: ::::::: :::::::::.::...::: ::
CCDS59 GLAKEYIDPETKKHIPYREHKSLTGTARYMSINTHLGKEQSRRDDLEALGHMFMYFLRGS
190 200 210 220 230 240
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]