Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB3467
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3467, 662 aa
1>>>pF1KB3467 662 - 662 aa - 662 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6868+/-0.00113; mu= 8.8188+/- 0.068
mean_var=165.3866+/-34.602, 0's: 0 Z-trim(108.1): 92 B-trim: 59 in 1/49
Lambda= 0.099730
statistics sampled from 9910 (10001) to 9910 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.657), E-opt: 0.2 (0.307), width: 16
Scan time: 3.890
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 662) 4462 654.8 1.1e-187
CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY ( 660) 4131 607.2 2.3e-173
CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 646) 4128 606.8 3.1e-173
CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 575) 1160 179.7 1e-44
CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 690) 1160 179.7 1.2e-44
CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 704) 1160 179.7 1.2e-44
CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 724) 1160 179.8 1.2e-44
CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 990 155.2 2.5e-37
CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 989 155.1 2.7e-37
CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 731) 989 155.2 3.1e-37
CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 729) 983 154.3 5.6e-37
CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5 ( 622) 851 135.2 2.6e-31
CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031) 834 133.0 2.1e-30
CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032) 834 133.0 2.1e-30
CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 ( 648) 814 129.9 1.1e-29
CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 ( 938) 767 123.3 1.5e-27
CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX ( 631) 756 121.6 3.4e-27
CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 ( 411) 655 106.9 5.8e-23
CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1 ( 619) 648 106.0 1.6e-22
CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 455) 606 99.9 8.4e-21
CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 ( 796) 599 99.1 2.6e-20
CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 ( 407) 573 95.1 2.1e-19
CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10 ( 737) 575 95.6 2.7e-19
CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 406) 569 94.5 3.1e-19
CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 715) 566 94.3 6.4e-19
CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 783) 566 94.3 6.8e-19
CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17 ( 599) 553 92.4 2e-18
CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 ( 428) 522 87.8 3.5e-17
CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 ( 427) 519 87.4 4.7e-17
CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11 ( 483) 519 87.4 5.1e-17
CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 881) 516 87.2 1.1e-16
CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 882) 516 87.2 1.1e-16
CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 ( 483) 504 85.2 2.3e-16
CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 ( 670) 475 81.2 5.3e-15
CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 ( 875) 471 80.7 9.7e-15
CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1 ( 824) 432 75.1 4.5e-13
CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 370) 423 73.5 6e-13
CCDS32475.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 448) 423 73.6 7e-13
CCDS58478.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 453) 423 73.6 7e-13
CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 479) 423 73.6 7.3e-13
CCDS82009.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 447) 422 73.4 7.7e-13
CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 478) 422 73.4 8.1e-13
CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 369) 420 73.1 8.1e-13
CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 483) 420 73.1 9.9e-13
CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 347) 384 67.9 2.8e-11
>>CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX (662 aa)
initn: 4462 init1: 4462 opt: 4462 Z-score: 3483.1 bits: 654.8 E(32554): 1.1e-187
Smith-Waterman score: 4462; 100.0% identity (100.0% similar) in 662 aa overlap (1-662:1-662)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSHVAVENALGLDQQFAGLDLNSSDNQSGGSTASKGRYIPPHLRNREATKGFYDKDSSGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MSHVAVENALGLDQQFAGLDLNSSDNQSGGSTASKGRYIPPHLRNREATKGFYDKDSSGW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SSSKDKDAYSSFGSRSDSRGKSSFFSDRGSGSRGRFDDRGRSDYDGIGSRGDRSGFGKFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSSKDKDAYSSFGSRSDSRGKSSFFSDRGSGSRGRFDDRGRSDYDGIGSRGDRSGFGKFE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 RGGNSRWCDKSDEDDWSKPLPPSERLEQELFSGGNTGINFEKYDDIPVEATGNNCPPHIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RGGNSRWCDKSDEDDWSKPLPPSERLEQELFSGGNTGINFEKYDDIPVEATGNNCPPHIE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 SFSDVEMGEIIMGNIELTRYTRPTPVQKHAIPIIKEKRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SFSDVEMGEIIMGNIELTRYTRPTPVQKHAIPIIKEKRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 QIYSDGPGEALRAMKENGRYGRRKQYPISLVLAPTRELAVQIYEEARKFSYRSRVRPCVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QIYSDGPGEALRAMKENGRYGRRKQYPISLVLAPTRELAVQIYEEARKFSYRSRVRPCVV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 YGGADIGQQIRDLERGCHLLVATPGRLVDMMERGKIGLDFCKYLVLDEADRMLDMGFEPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YGGADIGQQIRDLERGCHLLVATPGRLVDMMERGKIGLDFCKYLVLDEADRMLDMGFEPQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 IRRIVEQDTMPPKGVRHTMMFSATFPKEIQMLARDFLDEYIFLAVGRVGSTSENITQKVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IRRIVEQDTMPPKGVRHTMMFSATFPKEIQMLARDFLDEYIFLAVGRVGSTSENITQKVV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 WVEESDKRSFLLDLLNATGKDSLTLVFVETKKGADSLEDFLYHEGYACTSIHGDRSQRDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 WVEESDKRSFLLDLLNATGKDSLTLVFVETKKGADSLEDFLYHEGYACTSIHGDRSQRDR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 EEALHQFRSGKSPILVATAVAARGLDISNVKHVINFDLPSDIEEYVHRIGRTGRVGNLGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EEALHQFRSGKSPILVATAVAARGLDISNVKHVINFDLPSDIEEYVHRIGRTGRVGNLGL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 ATSFFNERNINITKDLLDLLVEAKQEVPSWLENMAYEHHYKGSSRGRSKSSRFSGGFGAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ATSFFNERNINITKDLLDLLVEAKQEVPSWLENMAYEHHYKGSSRGRSKSSRFSGGFGAR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 DYRQSSGASSSSFSSSRASSSRSGGGGHGSSRGFGGGGYGGFYNSDGYGGNYNSQGVDWW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DYRQSSGASSSSFSSSRASSSRSGGGGHGSSRGFGGGGYGGFYNSDGYGGNYNSQGVDWW
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 GN
::
CCDS43 GN
>>CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY (660 aa)
initn: 4132 init1: 3554 opt: 4131 Z-score: 3225.8 bits: 607.2 E(32554): 2.3e-173
Smith-Waterman score: 4131; 92.2% identity (98.0% similar) in 663 aa overlap (1-662:1-660)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MSHVAVENALGLDQQFAGLDLNSSDNQSGG-STASKGRYIPPHLRNREATKGFYDKDSSG
::::.:.: ::::.:.::::: ..:::: ::::::::::::::::::.:::.::::::
CCDS14 MSHVVVKNDPELDQQLANLDLNS-EKQSGGASTASKGRYIPPHLRNREASKGFHDKDSSG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 WSSSKDKDAYSSFGSRSDSRGKSSFFSDRGSGSRGRFDDRGRSDYDGIGSRGDRSGFGKF
:: ::::::::::::: ::::: ..::.:::::::::::::::::::::.: .: :::.:
CCDS14 WSCSKDKDAYSSFGSR-DSRGKPGYFSERGSGSRGRFDDRGRSDYDGIGNR-ERPGFGRF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 ERGGNSRWCDKSDEDDWSKPLPPSERLEQELFSGGNTGINFEKYDDIPVEATGNNCPPHI
::.:.::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS14 ERSGHSRWCDKSVEDDWSKPLPPSERLEQELFSGGNTGINFEKYDDIPVEATGSNCPPHI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 ESFSDVEMGEIIMGNIELTRYTRPTPVQKHAIPIIKEKRDLMACAQTGSGKTAAFLLPIL
:.:::..::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS14 ENFSDIDMGEIIMGNIELTRYTRPTPVQKHAIPIIKGKRDLMACAQTGSGKTAAFLLPIL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 SQIYSDGPGEALRAMKENGRYGRRKQYPISLVLAPTRELAVQIYEEARKFSYRSRVRPCV
::::.:::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SQIYTDGPGEALKAVKENGRYGRRKQYPISLVLAPTRELAVQIYEEARKFSYRSRVRPCV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 VYGGADIGQQIRDLERGCHLLVATPGRLVDMMERGKIGLDFCKYLVLDEADRMLDMGFEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VYGGADIGQQIRDLERGCHLLVATPGRLVDMMERGKIGLDFCKYLVLDEADRMLDMGFEP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 QIRRIVEQDTMPPKGVRHTMMFSATFPKEIQMLARDFLDEYIFLAVGRVGSTSENITQKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QIRRIVEQDTMPPKGVRHTMMFSATFPKEIQMLARDFLDEYIFLAVGRVGSTSENITQKV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 VWVEESDKRSFLLDLLNATGKDSLTLVFVETKKGADSLEDFLYHEGYACTSIHGDRSQRD
::::. ::::::::.:.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VWVEDLDKRSFLLDILGATGSDSLTLVFVETKKGADSLEDFLYHEGYACTSIHGDRSQRD
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 REEALHQFRSGKSPILVATAVAARGLDISNVKHVINFDLPSDIEEYVHRIGRTGRVGNLG
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 REEALHQFRSGKSPILVATAVAARGLDISNVRHVINFDLPSDIEEYVHRIGRTGRVGNLG
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 LATSFFNERNINITKDLLDLLVEAKQEVPSWLENMAYEHHYKGSSRGRSKSSRFSGGFGA
::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::::::
CCDS14 LATSFFNEKNMNITKDLLDLLVEAKQEVPSWLENMAYEHHYKGGSRGRSKSNRFSGGFGA
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 RDYRQSSGASSSSFSSSRASSSRSGGGGHGSSRGFGGGGYGGFYNSDGYGGNYNSQGVDW
::::::::.:::.:..::.:::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RDYRQSSGSSSSGFGASRGSSSRSGGGGYGNSRGFGGGGYGGFYNSDGYGGNYNSQGVDW
600 610 620 630 640 650
660
pF1KB3 WGN
:::
CCDS14 WGN
660
>>CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX (646 aa)
initn: 4128 init1: 4128 opt: 4128 Z-score: 3223.6 bits: 606.8 E(32554): 3.1e-173
Smith-Waterman score: 4300; 97.4% identity (97.6% similar) in 662 aa overlap (1-662:1-646)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSHVAVENALGLDQQFAGLDLNSSDNQSGGSTASKGRYIPPHLRNREATKGFYDKDSSGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::. :::::::::
CCDS55 MSHVAVENALGLDQQFAGLDLNSSDNQSGGSTASS----------------FYDKDSSGW
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SSSKDKDAYSSFGSRSDSRGKSSFFSDRGSGSRGRFDDRGRSDYDGIGSRGDRSGFGKFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SSSKDKDAYSSFGSRSDSRGKSSFFSDRGSGSRGRFDDRGRSDYDGIGSRGDRSGFGKFE
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 RGGNSRWCDKSDEDDWSKPLPPSERLEQELFSGGNTGINFEKYDDIPVEATGNNCPPHIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RGGNSRWCDKSDEDDWSKPLPPSERLEQELFSGGNTGINFEKYDDIPVEATGNNCPPHIE
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 SFSDVEMGEIIMGNIELTRYTRPTPVQKHAIPIIKEKRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SFSDVEMGEIIMGNIELTRYTRPTPVQKHAIPIIKEKRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILS
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 QIYSDGPGEALRAMKENGRYGRRKQYPISLVLAPTRELAVQIYEEARKFSYRSRVRPCVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QIYSDGPGEALRAMKENGRYGRRKQYPISLVLAPTRELAVQIYEEARKFSYRSRVRPCVV
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 YGGADIGQQIRDLERGCHLLVATPGRLVDMMERGKIGLDFCKYLVLDEADRMLDMGFEPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YGGADIGQQIRDLERGCHLLVATPGRLVDMMERGKIGLDFCKYLVLDEADRMLDMGFEPQ
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 IRRIVEQDTMPPKGVRHTMMFSATFPKEIQMLARDFLDEYIFLAVGRVGSTSENITQKVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IRRIVEQDTMPPKGVRHTMMFSATFPKEIQMLARDFLDEYIFLAVGRVGSTSENITQKVV
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 WVEESDKRSFLLDLLNATGKDSLTLVFVETKKGADSLEDFLYHEGYACTSIHGDRSQRDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 WVEESDKRSFLLDLLNATGKDSLTLVFVETKKGADSLEDFLYHEGYACTSIHGDRSQRDR
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 EEALHQFRSGKSPILVATAVAARGLDISNVKHVINFDLPSDIEEYVHRIGRTGRVGNLGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EEALHQFRSGKSPILVATAVAARGLDISNVKHVINFDLPSDIEEYVHRIGRTGRVGNLGL
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 ATSFFNERNINITKDLLDLLVEAKQEVPSWLENMAYEHHYKGSSRGRSKSSRFSGGFGAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ATSFFNERNINITKDLLDLLVEAKQEVPSWLENMAYEHHYKGSSRGRSKSSRFSGGFGAR
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 DYRQSSGASSSSFSSSRASSSRSGGGGHGSSRGFGGGGYGGFYNSDGYGGNYNSQGVDWW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DYRQSSGASSSSFSSSRASSSRSGGGGHGSSRGFGGGGYGGFYNSDGYGGNYNSQGVDWW
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 GN
::
CCDS55 GN
>>CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 (575 aa)
initn: 1283 init1: 927 opt: 1160 Z-score: 916.4 bits: 179.7 E(32554): 1e-44
Smith-Waterman score: 1519; 47.2% identity (72.1% similar) in 570 aa overlap (62-618:14-565)
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 TASKGRYIPPHLRNREATKGFYDKDSSGWSSSKDKDAYSSFGSRSDSRGKSSFFSDRG-S
::.: . . . ..:: ... :. .
CCDS54 MGSRNLFLTNSPESSNDCEDNPTRNRGFSKRGDNDLDPDECMQ
10 20 30 40
100 110 120 130 140
pF1KB3 GSRGRFDDRGRSDYDGIGSRGD----RSGFGKFERGGNSRWCDKSDEDDWSKPL-----P
. : : .: : .: :. :: ::: :. :: . . . .. .: . : :
CCDS54 RTGGLFGSR-RPVLSGTGN-GDTSQSRSGSGS-ERDSWKSEAEGGESSDTQGPKVTYIPP
50 60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
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. :::::..:::: ::::::::::::::::::::::.... :: . : .:.
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.. : : ...::::::. ::: ::::::. . :: :.:::...:..::.. .::..:
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::::::.:.. . :::: :::::::::::::::: :...... :: : :.:.::
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:::::.::: :: .:: ..:.:.:::.::.. ... : :. : . .:: :...: :
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: :.::::::: :: . :: .: . ::::::: ::.::.:: .:: :: :.::::.:
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.:. .. : : ...::::::. ::: ::::::. . :: :.:::...:..::..
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... :. .:..:.:.::.:::..:. . : : : .... :. . : :.. : ..
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CCDS39 VGQFSKREKLVEILRNIG-DERTMVFVETKKKADFIATFLCQEKISTTSIHGDREQRERE
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CCDS39 QALGDFRFGKCPVLVATSVAARGLDIENVQHVINFDLPSTIDEYVHRIGRTGRCGNTGRA
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CCDS39 ISFFDLESDNHLAQPLVKVLTDAQQDVPAWLEEIAFSTYIPGFSGSTRGNV--------F
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CCDS39 ASVDTRKGKSTLNTAGFSSSQAPNPVDDESWD
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CCDS11 MSGYSSDR---DRGR--DRGFGAPRFGGSRA
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CCDS11 GPLSG-KKFGNPGEKLVKKKWNLDE----LPKFEKNFYQEHPDLARRTAQEVETYRRSKE
30 40 50 60 70 80
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CCDS11 ITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTG
90 100 110 120 130 140
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CCDS11 SGKTLSYLLPAIVHI-NHQP------------FLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAA
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CCDS11 EYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLD
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CCDS11 EADRMLDMGFEPQIRKIVDQ--IRPD--RQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGA
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CCDS11 LELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRD
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CCDS11 GWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSED
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CCDS11 YIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLV-EDRGSGRS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]