Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB3223
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3223, 706 aa
1>>>pF1KB3223 706 - 706 aa - 706 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4684+/-0.000983; mu= -3.7677+/- 0.059
mean_var=237.3973+/-48.512, 0's: 0 Z-trim(113.1): 37 B-trim: 163 in 2/49
Lambda= 0.083241
statistics sampled from 13754 (13789) to 13754 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.742), E-opt: 0.2 (0.424), width: 16
Scan time: 3.700
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10160.1 TCF12 gene_id:6938|Hs108|chr15 ( 706) 4691 576.6 4.5e-164
CCDS76760.1 TCF12 gene_id:6938|Hs108|chr15 ( 536) 3397 421.1 2.1e-117
CCDS10159.1 TCF12 gene_id:6938|Hs108|chr15 ( 682) 2764 345.1 2e-94
CCDS76761.1 TCF12 gene_id:6938|Hs108|chr15 ( 446) 1842 234.3 3e-61
CCDS42042.1 TCF12 gene_id:6938|Hs108|chr15 ( 512) 1842 234.4 3.3e-61
CCDS82257.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 670) 1244 162.6 1.8e-39
CCDS58631.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 773) 1241 162.3 2.5e-39
CCDS42438.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 671) 1239 162.0 2.7e-39
CCDS58629.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 647) 1233 161.3 4.2e-39
CCDS58630.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 677) 1225 160.3 8.6e-39
CCDS82255.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 541) 1216 159.2 1.5e-38
CCDS58627.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 600) 1216 159.2 1.6e-38
CCDS59321.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 664) 1214 159.0 2.1e-38
CCDS58624.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 511) 1211 158.6 2.2e-38
CCDS11960.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 667) 1212 158.7 2.5e-38
CCDS77192.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 643) 1206 158.0 4e-38
CCDS58626.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 537) 1189 155.9 1.4e-37
CCDS77191.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 596) 1189 156.0 1.5e-37
CCDS58628.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 625) 1189 156.0 1.6e-37
CCDS58623.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 507) 1170 153.7 6.5e-37
CCDS58625.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 507) 1170 153.7 6.5e-37
CCDS12074.1 TCF3 gene_id:6929|Hs108|chr19 ( 654) 752 103.5 1e-21
CCDS45899.1 TCF3 gene_id:6929|Hs108|chr19 ( 651) 651 91.4 4.7e-18
>>CCDS10160.1 TCF12 gene_id:6938|Hs108|chr15 (706 aa)
initn: 4691 init1: 4691 opt: 4691 Z-score: 3059.2 bits: 576.6 E(32554): 4.5e-164
Smith-Waterman score: 4691; 100.0% identity (100.0% similar) in 706 aa overlap (1-706:1-706)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNPQQQRMAAIGTDKELSDLLDFSAMFSPPVNSGKTRPTTLGSSQFSGSGIDERGGTTSW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MNPQQQRMAAIGTDKELSDLLDFSAMFSPPVNSGKTRPTTLGSSQFSGSGIDERGGTTSW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 GTSGQPSPSYDSSRGFTDSPHYSDHLNDSRLGAHEGLSPTPFMNSNLMGKTSERGSFSLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GTSGQPSPSYDSSRGFTDSPHYSDHLNDSRLGAHEGLSPTPFMNSNLMGKTSERGSFSLY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SRDTGLPGCQSSLLRQDLGLGSPAQLSSSGKPGTAYYSFSATSSRRRPLHDSAALDPLQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SRDTGLPGCQSSLLRQDLGLGSPAQLSSSGKPGTAYYSFSATSSRRRPLHDSAALDPLQA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 KKVRKVPPGLPSSVYAPSPNSDDFNRESPSYPSPKPPTSMFASTFFMQDGTHNSSDLWSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KKVRKVPPGLPSSVYAPSPNSDDFNRESPSYPSPKPPTSMFASTFFMQDGTHNSSDLWSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 SNGMSQPGFGGILGTSTSHMSQSSSYGNLHSHDRLSYPPHSVSPTDINTSLPPMSSFHRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SNGMSQPGFGGILGTSTSHMSQSSSYGNLHSHDRLSYPPHSVSPTDINTSLPPMSSFHRG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 STSSSPYVAASHTPPINGSDSILGTRGNAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTSSSFPSNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 STSSSPYVAASHTPPINGSDSILGTRGNAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTSSSFPSNP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 STPVGSPSPLTGTSQWPRPGGQAPSSPSYENSLHSLKNRVEQQLHEHLQDAMSFLKDVCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 STPVGSPSPLTGTSQWPRPGGQAPSSPSYENSLHSLKNRVEQQLHEHLQDAMSFLKDVCE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 QSRMEDRLDRLDDAIHVLRNHAVGPSTSLPAGHSDIHSLLGPSHNAPIGSLNSNYGGSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QSRMEDRLDRLDDAIHVLRNHAVGPSTSLPAGHSDIHSLLGPSHNAPIGSLNSNYGGSSL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 VASSRSASMVGTHREDSVSLNGNHSVLSSTVTTSSTDLNHKTQENYRGGLQSQSGTVVTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VASSRSASMVGTHREDSVSLNGNHSVLSSTVTTSSTDLNHKTQENYRGGLQSQSGTVVTT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 EIKTENKEKDENLHEPPSSDDMKSDDESSQKDIKVSSRGRTSSTNEDEDLNPEQKIEREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EIKTENKEKDENLHEPPSSDDMKSDDESSQKDIKVSSRGRTSSTNEDEDLNPEQKIEREK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 ERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMCQLHLKSEKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMCQLHLKSEKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KB3 RNLNPKAACLKRREEEKVSAVSAEPPTTLPGTHPGLSETTNPMGHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RNLNPKAACLKRREEEKVSAVSAEPPTTLPGTHPGLSETTNPMGHM
670 680 690 700
>>CCDS76760.1 TCF12 gene_id:6938|Hs108|chr15 (536 aa)
initn: 3397 init1: 3397 opt: 3397 Z-score: 2221.2 bits: 421.1 E(32554): 2.1e-117
Smith-Waterman score: 3397; 99.8% identity (100.0% similar) in 514 aa overlap (193-706:23-536)
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 SSRRRPLHDSAALDPLQAKKVRKVPPGLPSSVYAPSPNSDDFNRESPSYPSPKPPTSMFA
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MYCAYPVPGMGSNSLMYYYNGKTVYAPSPNSDDFNRESPSYPSPKPPTSMFA
10 20 30 40 50
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 STFFMQDGTHNSSDLWSSSNGMSQPGFGGILGTSTSHMSQSSSYGNLHSHDRLSYPPHSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 STFFMQDGTHNSSDLWSSSNGMSQPGFGGILGTSTSHMSQSSSYGNLHSHDRLSYPPHSV
60 70 80 90 100 110
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 SPTDINTSLPPMSSFHRGSTSSSPYVAASHTPPINGSDSILGTRGNAAGSSQTGDALGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SPTDINTSLPPMSSFHRGSTSSSPYVAASHTPPINGSDSILGTRGNAAGSSQTGDALGKA
120 130 140 150 160 170
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 LASIYSPDHTSSSFPSNPSTPVGSPSPLTGTSQWPRPGGQAPSSPSYENSLHSLKNRVEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LASIYSPDHTSSSFPSNPSTPVGSPSPLTGTSQWPRPGGQAPSSPSYENSLHSLKNRVEQ
180 190 200 210 220 230
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 QLHEHLQDAMSFLKDVCEQSRMEDRLDRLDDAIHVLRNHAVGPSTSLPAGHSDIHSLLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 QLHEHLQDAMSFLKDVCEQSRMEDRLDRLDDAIHVLRNHAVGPSTSLPAGHSDIHSLLGP
240 250 260 270 280 290
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 SHNAPIGSLNSNYGGSSLVASSRSASMVGTHREDSVSLNGNHSVLSSTVTTSSTDLNHKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SHNAPIGSLNSNYGGSSLVASSRSASMVGTHREDSVSLNGNHSVLSSTVTTSSTDLNHKT
300 310 320 330 340 350
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 QENYRGGLQSQSGTVVTTEIKTENKEKDENLHEPPSSDDMKSDDESSQKDIKVSSRGRTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 QENYRGGLQSQSGTVVTTEIKTENKEKDENLHEPPSSDDMKSDDESSQKDIKVSSRGRTS
360 370 380 390 400 410
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 STNEDEDLNPEQKIEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMCQLHLKSEKPQTKLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 STNEDEDLNPEQKIEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMCQLHLKSEKPQTKLL
420 430 440 450 460 470
650 660 670 680 690 700
pF1KB3 ILHQAVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSAVSAEPPTTLPGTHPGLSETTNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ILHQAVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSAVSAEPPTTLPGTHPGLSETTNP
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 MGHM
::::
CCDS76 MGHM
>>CCDS10159.1 TCF12 gene_id:6938|Hs108|chr15 (682 aa)
initn: 2708 init1: 2708 opt: 2764 Z-score: 1808.7 bits: 345.1 E(32554): 2e-94
Smith-Waterman score: 4469; 96.6% identity (96.6% similar) in 706 aa overlap (1-706:1-682)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNPQQQRMAAIGTDKELSDLLDFSAMFSPPVNSGKTRPTTLGSSQFSGSGIDERGGTTSW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MNPQQQRMAAIGTDKELSDLLDFSAMFSPPVNSGKTRPTTLGSSQFSGSGIDERGGTTSW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 GTSGQPSPSYDSSRGFTDSPHYSDHLNDSRLGAHEGLSPTPFMNSNLMGKTSERGSFSLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GTSGQPSPSYDSSRGFTDSPHYSDHLNDSRLGAHEGLSPTPFMNSNLMGKTSERGSFSLY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SRDTGLPGCQSSLLRQDLGLGSPAQLSSSGKPGTAYYSFSATSSRRRPLHDSAALDPLQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SRDTGLPGCQSSLLRQDLGLGSPAQLSSSGKPGTAYYSFSATSSRRRPLHDSAALDPLQA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 KKVRKVPPGLPSSVYAPSPNSDDFNRESPSYPSPKPPTSMFASTFFMQDGTHNSSDLWSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KKVRKVPPGLPSSVYAPSPNSDDFNRESPSYPSPKPPTSMFASTFFMQDGTHNSSDLWSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 SNGMSQPGFGGILGTSTSHMSQSSSYGNLHSHDRLSYPPHSVSPTDINTSLPPMSSFHRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SNGMSQPGFGGILGTSTSHMSQSSSYGNLHSHDRLSYPPHSVSPTDINTSLPPMSSFHRG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 STSSSPYVAASHTPPINGSDSILGTRGNAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTSSSFPSNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 STSSSPYVAASHTPPINGSDSILGTRGNAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTSSSFPSNP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 STPVGSPSPLTGTSQWPRPGGQAPSSPSYENSLHSLKNRVEQQLHEHLQDAMSFLKDVCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 STPVGSPSPLTGTSQWPRPGGQAPSSPSYENSLHSL------------------------
370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 QSRMEDRLDRLDDAIHVLRNHAVGPSTSLPAGHSDIHSLLGPSHNAPIGSLNSNYGGSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QSRMEDRLDRLDDAIHVLRNHAVGPSTSLPAGHSDIHSLLGPSHNAPIGSLNSNYGGSSL
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 VASSRSASMVGTHREDSVSLNGNHSVLSSTVTTSSTDLNHKTQENYRGGLQSQSGTVVTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VASSRSASMVGTHREDSVSLNGNHSVLSSTVTTSSTDLNHKTQENYRGGLQSQSGTVVTT
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 EIKTENKEKDENLHEPPSSDDMKSDDESSQKDIKVSSRGRTSSTNEDEDLNPEQKIEREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EIKTENKEKDENLHEPPSSDDMKSDDESSQKDIKVSSRGRTSSTNEDEDLNPEQKIEREK
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 ERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMCQLHLKSEKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMCQLHLKSEKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRE
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700
pF1KB3 RNLNPKAACLKRREEEKVSAVSAEPPTTLPGTHPGLSETTNPMGHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RNLNPKAACLKRREEEKVSAVSAEPPTTLPGTHPGLSETTNPMGHM
640 650 660 670 680
>>CCDS76761.1 TCF12 gene_id:6938|Hs108|chr15 (446 aa)
initn: 1842 init1: 1842 opt: 1842 Z-score: 1213.2 bits: 234.3 E(32554): 3e-61
Smith-Waterman score: 2603; 94.4% identity (94.4% similar) in 431 aa overlap (276-706:40-446)
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 QPGFGGILGTSTSHMSQSSSYGNLHSHDRLSYPPHSVSPTDINTSLPPMSSFHRGSTSSS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 QIQMISTVNLLVIHLLSHQPVCSLALSLCKSYPPHSVSPTDINTSLPPMSSFHRGSTSSS
10 20 30 40 50 60
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 PYVAASHTPPINGSDSILGTRGNAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTSSSFPSNPSTPVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PYVAASHTPPINGSDSILGTRGNAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTSSSFPSNPSTPVG
70 80 90 100 110 120
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 SPSPLTGTSQWPRPGGQAPSSPSYENSLHSLKNRVEQQLHEHLQDAMSFLKDVCEQSRME
::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS76 SPSPLTGTSQWPRPGGQAPSSPSYENSLHSL------------------------QSRME
130 140 150 160
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 DRLDRLDDAIHVLRNHAVGPSTSLPAGHSDIHSLLGPSHNAPIGSLNSNYGGSSLVASSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DRLDRLDDAIHVLRNHAVGPSTSLPAGHSDIHSLLGPSHNAPIGSLNSNYGGSSLVASSR
170 180 190 200 210 220
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 SASMVGTHREDSVSLNGNHSVLSSTVTTSSTDLNHKTQENYRGGLQSQSGTVVTTEIKTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SASMVGTHREDSVSLNGNHSVLSSTVTTSSTDLNHKTQENYRGGLQSQSGTVVTTEIKTE
230 240 250 260 270 280
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 NKEKDENLHEPPSSDDMKSDDESSQKDIKVSSRGRTSSTNEDEDLNPEQKIEREKERRMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NKEKDENLHEPPSSDDMKSDDESSQKDIKVSSRGRTSSTNEDEDLNPEQKIEREKERRMA
290 300 310 320 330 340
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 NNARERLRVRDINEAFKELGRMCQLHLKSEKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRERNLNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NNARERLRVRDINEAFKELGRMCQLHLKSEKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRERNLNP
350 360 370 380 390 400
670 680 690 700
pF1KB3 KAACLKRREEEKVSAVSAEPPTTLPGTHPGLSETTNPMGHM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KAACLKRREEEKVSAVSAEPPTTLPGTHPGLSETTNPMGHM
410 420 430 440
>>CCDS42042.1 TCF12 gene_id:6938|Hs108|chr15 (512 aa)
initn: 1842 init1: 1842 opt: 1842 Z-score: 1212.3 bits: 234.4 E(32554): 3.3e-61
Smith-Waterman score: 3175; 95.1% identity (95.3% similar) in 514 aa overlap (193-706:23-512)
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 SSRRRPLHDSAALDPLQAKKVRKVPPGLPSSVYAPSPNSDDFNRESPSYPSPKPPTSMFA
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MYCAYPVPGMGSNSLMYYYNGKTVYAPSPNSDDFNRESPSYPSPKPPTSMFA
10 20 30 40 50
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 STFFMQDGTHNSSDLWSSSNGMSQPGFGGILGTSTSHMSQSSSYGNLHSHDRLSYPPHSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 STFFMQDGTHNSSDLWSSSNGMSQPGFGGILGTSTSHMSQSSSYGNLHSHDRLSYPPHSV
60 70 80 90 100 110
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 SPTDINTSLPPMSSFHRGSTSSSPYVAASHTPPINGSDSILGTRGNAAGSSQTGDALGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SPTDINTSLPPMSSFHRGSTSSSPYVAASHTPPINGSDSILGTRGNAAGSSQTGDALGKA
120 130 140 150 160 170
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 LASIYSPDHTSSSFPSNPSTPVGSPSPLTGTSQWPRPGGQAPSSPSYENSLHSLKNRVEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LASIYSPDHTSSSFPSNPSTPVGSPSPLTGTSQWPRPGGQAPSSPSYENSLHSL------
180 190 200 210 220
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 QLHEHLQDAMSFLKDVCEQSRMEDRLDRLDDAIHVLRNHAVGPSTSLPAGHSDIHSLLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ------------------QSRMEDRLDRLDDAIHVLRNHAVGPSTSLPAGHSDIHSLLGP
230 240 250 260
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 SHNAPIGSLNSNYGGSSLVASSRSASMVGTHREDSVSLNGNHSVLSSTVTTSSTDLNHKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SHNAPIGSLNSNYGGSSLVASSRSASMVGTHREDSVSLNGNHSVLSSTVTTSSTDLNHKT
270 280 290 300 310 320
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 QENYRGGLQSQSGTVVTTEIKTENKEKDENLHEPPSSDDMKSDDESSQKDIKVSSRGRTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QENYRGGLQSQSGTVVTTEIKTENKEKDENLHEPPSSDDMKSDDESSQKDIKVSSRGRTS
330 340 350 360 370 380
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 STNEDEDLNPEQKIEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMCQLHLKSEKPQTKLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 STNEDEDLNPEQKIEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMCQLHLKSEKPQTKLL
390 400 410 420 430 440
650 660 670 680 690 700
pF1KB3 ILHQAVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSAVSAEPPTTLPGTHPGLSETTNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ILHQAVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSAVSAEPPTTLPGTHPGLSETTNP
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 MGHM
::::
CCDS42 MGHM
510
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10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNPQQQRMAAIGTDKELSDLLDFSAMFSPPVNSGKTRPTTLGSSQFSGSGIDERGGTTSW
.::::::.::::::::::::::::::::.:::. ::.:.:..:.::....:... ::
CCDS82 MHHQQRMAALGTDKELSDLLDFSAMFSPPVSSGKNGPTSLASGHFTGSNVEDRSSSGSW
10 20 30 40 50
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pF1KB3 GTSGQPSPSYDSSRGFTDSPHYSDHLNDSRLGAHEGLSPTPFMNSNLMGKTSERGSFSLY
:..:.:::: :.. :. : ::... ::.:..::: ::.:: ...:: ::::.: :
CCDS82 GNGGHPSPS----RNYGDGTPY-DHMTSRDLGSHDNLSP-PFVNSRIQSKT-ERGSYSSY
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pF1KB3 SRDTGLPGC-QSSLLRQDLGLGSPAQLSSSGKPGTAYYSFSATSSRRRPLHDSAALDPLQ
.:...: :: :.::: :. .:.:. :: . :::. ::..:... ::::::.:: .:
CCDS82 GRESNLQGCHQQSLLGGDMDMGNPGTLSPT-KPGSQYYQYSSNNPRRRPLHSSAM--EVQ
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 AKKVRKVPPGLPSSVYAPSPNSDDFNRESPSYPSPKPPTSMFASTFFMQDGTHNSSDLWS
.:::::::::::::::::: .. :.::.::.::: :: :: : :.:::::: :.::: ::
CCDS82 TKKVRKVPPGLPSSVYAPSASTADYNRDSPGYPSSKPATSTFPSSFFMQDG-HHSSDPWS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 SSNGMSQPGFGGILGTSTSHMSQSSSYGNLHSHDRLSYPPHSVSPTDINTSLPPMSSFHR
::.::.:::..:.::.: ::. ::::: .:: :.::::: : : .:::.::::::.:::
CCDS82 SSSGMNQPGYAGMLGNS-SHIPQSSSYCSLHPHERLSYPSH--SSADINSSLPPMSTFHR
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 GSTSSSPYVAASHTPPINGSDSILGTRGN-AAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTSSSFPS
..:. : ..: ::: ::.:::...::. ::::::::::::::::::::::::..:: :
CCDS82 SGTNH--YSTSSCTPPANGTDSIMANRGSGAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTNNSFSS
290 300 310 320 330 340
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pF1KB3 NPSTPVGSPSPLTGTSQWPRPGGQAPSSPSYENSLHSLKNRVEQQLHEHLQDAMSFLKDV
::::::::: :.::. : : :::: :::.::. ::::
CCDS82 NPSTPVGSPPSLSGTAVWSRNGGQASSSPNYEGPLHSL----------------------
350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 CEQSRMEDRLDRLDDAIHVLRNHAVGPSTSLPAGHSDIHSLLGPSHNAPIGSLNSNYGGS
:::.::::.::::::::::::::::::..:.::.:.:...:::::. .:.:.:.:: .
CCDS82 --QSRIEDRLERLDDAIHVLRNHAVGPSTAMPGGHGDMHGIIGPSHNGAMGGLGSGYG-T
390 400 410 420 430
480 490 500 510 520
pF1KB3 SLVASSRSASMVGTHREDSVSLNGNHSVLSSTV--------TTSSTDLNHKTQENYRG--
.:....: . ::::::::.:.: :.::.: . : ...: ::: :. :::
CCDS82 GLLSANRHSLMVGTHREDGVALRGSHSLLPNQVPVPQLPVQSATSPDLN-PPQDPYRGMP
440 450 460 470 480 490
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 -GLQSQSGTVVTTEIKTENKEKDENLHEPPSSDDMKSDDESSQKDIKVSSRGRTSSTNED
:::.:: . ..:::... : ::::.. ::.: : ::. .:::: .:.: ::.:.:
CCDS82 PGLQGQSVSSGSSEIKSDD-EGDENLQDTKSSEDKKLDDD--KKDIKSITRSR-SSNNDD
500 510 520 530 540 550
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 EDLNPEQKIEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMCQLHLKSEKPQTKLLILHQA
:::.:::: ::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::::::::::::
CCDS82 EDLTPEQKAEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMVQLHLKSDKPQTKLLILHQA
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pF1KB3 VAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSAVSAEPPTTLPGTHPGLSETTNPMGHM
:::::::::::::::::::::::::::::::: : :: .: : :::.....: ::.:
CCDS82 VAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVS--SEPPPLSLAGPHPGMGDASNHMGQM
620 630 640 650 660 670
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pF1KB3 MNPQQQRMAAIGTDKELSDLLDFSAMFSPPVNS
.::::::.::::::::::::::::::::.:
CCDS58 NIISWTGMVAHTCNPSTLGGQGLCDFAKMHHQQRMAALGTDKELSDLLDFSAMFSPPVSS
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pF1KB3 GKTRPTTLGSSQFSGSGIDERGGTTSWGTSGQPSPSYDSSRGFTDSPHYSDHLNDSRLGA
::. ::.:.:..:.::....:... :::..:.:::: :.. :. : ::... ::.
CCDS58 GKNGPTSLASGHFTGSNVEDRSSSGSWGNGGHPSPS----RNYGDGTPY-DHMTSRDLGS
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pF1KB3 HEGLSPTPFMNSNLMGKTSERGSFSLYSRDTGLPGC-QSSLLRQDLGLGSPAQLSSSGKP
:..::: ::.:: ...:: ::::.: :.:...: :: :.::: :. .:.:. :: . ::
CCDS58 HDNLSP-PFVNSRIQSKT-ERGSYSSYGRESNLQGCHQQSLLGGDMDMGNPGTLSPT-KP
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160 170 180 190 200 210
pF1KB3 GTAYYSFSATSSRRRPLHDSAALDPLQAKKVRKVPPGLPSSVYAPSPNSDDFNRESPSYP
:. ::..:... ::::::.:: .:.:::::::::::::::::: .. :.::.::.::
CCDS58 GSQYYQYSSNNPRRRPLHSSAM--EVQTKKVRKVPPGLPSSVYAPSASTADYNRDSPGYP
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220 230 240 250 260 270
pF1KB3 SPKPPTSMFASTFFMQDGTHNSSDLWSSSNGMSQPGFGGILGTSTSHMSQSSSYGNLHSH
: :: :: : :.:::::: :.::: ::::.::.:::..:.::.: ::. ::::: .:: :
CCDS58 SSKPATSTFPSSFFMQDG-HHSSDPWSSSSGMNQPGYAGMLGNS-SHIPQSSSYCSLHPH
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280 290 300 310 320 330
pF1KB3 DRLSYPPHSVSPTDINTSLPPMSSFHRGSTSSSPYVAASHTPPINGSDSILGTRGN-AAG
.::::: : : .:::.::::::.:::..:. : ..: ::: ::.:::...::. :::
CCDS58 ERLSYPSH--SSADINSSLPPMSTFHRSGTNH--YSTSSCTPPANGTDSIMANRGSGAAG
370 380 390 400 410
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 SSQTGDALGKALASIYSPDHTSSSFPSNPSTPVGSPSPLT-GTSQWPRPGGQAPSSPSYE
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CCDS58 SSQTGDALGKALASIYSPDHTNNSFSSNPSTPVGSPPSLSAGTAVWSRNGGQASSSPNYE
420 430 440 450 460 470
400 410 420 430 440 450
pF1KB3 NSLHSLKNRVEQQLHEHLQDAMSFLKDVCEQSRMEDRLDRLDDAIHVLRNHAVGPSTSLP
. :::: :::.::::.::::::::::::::::::..:
CCDS58 GPLHSL------------------------QSRIEDRLERLDDAIHVLRNHAVGPSTAMP
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pF1KB3 AGHSDIHSLLGPSHNAPIGSLNSNYGGSSLVASSRSASMVGTHREDSVSLNGNHSVLSST
.::.:.:...:::::. .:.:.:.:: ..:....: . ::::::::.:.: :.::.: .
CCDS58 GGHGDMHGIIGPSHNGAMGGLGSGYG-TGLLSANRHSLMVGTHREDGVALRGSHSLLPNQ
520 530 540 550 560 570
520 530 540 550
pF1KB3 V--------TTSSTDLNHKTQENYRG---GLQSQSGTVVTTEIKTENKEKDENLHEPPSS
: ...: ::: :. ::: :::.:: . ..:::... : ::::.. ::
CCDS58 VPVPQLPVQSATSPDLN-PPQDPYRGMPPGLQGQSVSSGSSEIKSDD-EGDENLQDTKSS
580 590 600 610 620 630
560 570 580 590 600 610
pF1KB3 DDMKSDDESSQKDIKVSSRGRTSSTNEDEDLNPEQKIEREKERRMANNARERLRVRDINE
.: : ::. .:::: .:.: ::.:.::::.:::: :::::::::::::::::::::::
CCDS58 EDKKLDDD--KKDIKSITRSR-SSNNDDEDLTPEQKAEREKERRMANNARERLRVRDINE
640 650 660 670 680
620 630 640 650 660 670
pF1KB3 AFKELGRMCQLHLKSEKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVS
:::::::: ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AFKELGRMVQLHLKSDKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVS
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680 690 700
pF1KB3 AVSAEPPTTLPGTHPGLSETTNPMGHM
: :: .: : :::.....: ::.:
CCDS58 --SEPPPLSLAGPHPGMGDASNHMGQM
750 760 770
>>CCDS42438.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 (671 aa)
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pF1KB3 MNPQQQRMAAIGTDKELSDLLDFSAMFSPPVNSGKTRPTTLGSSQFSGSGIDERGGTTSW
.::::::.::::::::::::::::::::.:::. ::.:.:..:.::....:... ::
CCDS42 MHHQQRMAALGTDKELSDLLDFSAMFSPPVSSGKNGPTSLASGHFTGSNVEDRSSSGSW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 GTSGQPSPSYDSSRGFTDSPHYSDHLNDSRLGAHEGLSPTPFMNSNLMGKTSERGSFSLY
:..:.:::: :.. :. : ::... ::.:..::: ::.:: ...:: ::::.: :
CCDS42 GNGGHPSPS----RNYGDGTPY-DHMTSRDLGSHDNLSP-PFVNSRIQSKT-ERGSYSSY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB3 SRDTGLPGC-QSSLLRQDLGLGSPAQLSSSGKPGTAYYSFSATSSRRRPLHDSAALDPLQ
.:...: :: :.::: :. .:.:. :: . :::. ::..:... ::::::.:: .:
CCDS42 GRESNLQGCHQQSLLGGDMDMGNPGTLSPT-KPGSQYYQYSSNNPRRRPLHSSAM--EVQ
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 AKKVRKVPPGLPSSVYAPSPNSDDFNRESPSYPSPKPPTSMFASTFFMQDGTHNSSDLWS
.:::::::::::::::::: .. :.::.::.::: :: :: : :.:::::: :.::: ::
CCDS42 TKKVRKVPPGLPSSVYAPSASTADYNRDSPGYPSSKPATSTFPSSFFMQDG-HHSSDPWS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 SSNGMSQPGFGGILGTSTSHMSQSSSYGNLHSHDRLSYPPHSVSPTDINTSLPPMSSFHR
::.::.:::..:.::.: ::. ::::: .:: :.::::: : : .:::.::::::.:::
CCDS42 SSSGMNQPGYAGMLGNS-SHIPQSSSYCSLHPHERLSYPSH--SSADINSSLPPMSTFHR
230 240 250 260 270 280
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pF1KB3 GSTSSSPYVAASHTPPINGSDSILGTRGN-AAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTSSSFPS
..:. : ..: ::: ::.:::...::. ::::::::::::::::::::::::..:: :
CCDS42 SGTNH--YSTSSCTPPANGTDSIMANRGSGAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTNNSFSS
290 300 310 320 330 340
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pF1KB3 NPSTPVGSPSPLT-GTSQWPRPGGQAPSSPSYENSLHSLKNRVEQQLHEHLQDAMSFLKD
::::::::: :. ::. : : :::: :::.::. ::::
CCDS42 NPSTPVGSPPSLSAGTAVWSRNGGQASSSPNYEGPLHSL---------------------
350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 VCEQSRMEDRLDRLDDAIHVLRNHAVGPSTSLPAGHSDIHSLLGPSHNAPIGSLNSNYGG
:::.::::.::::::::::::::::::..:.::.:.:...:::::. .:.:.:.::
CCDS42 ---QSRIEDRLERLDDAIHVLRNHAVGPSTAMPGGHGDMHGIIGPSHNGAMGGLGSGYG-
390 400 410 420 430
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pF1KB3 SSLVASSRSASMVGTHREDSVSLNGNHSVLSSTV--------TTSSTDLNHKTQENYRG-
..:....: . ::::::::.:.: :.::.: . : ...: ::: :. :::
CCDS42 TGLLSANRHSLMVGTHREDGVALRGSHSLLPNQVPVPQLPVQSATSPDLN-PPQDPYRGM
440 450 460 470 480 490
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 --GLQSQSGTVVTTEIKTENKEKDENLHEPPSSDDMKSDDESSQKDIKVSSRGRTSSTNE
:::.:: . ..:::... : ::::.. ::.: : ::. .:::: .:.: ::.:.
CCDS42 PPGLQGQSVSSGSSEIKSDD-EGDENLQDTKSSEDKKLDDD--KKDIKSITRSR-SSNND
500 510 520 530 540 550
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pF1KB3 DEDLNPEQKIEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMCQLHLKSEKPQTKLLILHQ
::::.:::: ::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.:::::::::::
CCDS42 DEDLTPEQKAEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMVQLHLKSDKPQTKLLILHQ
560 570 580 590 600 610
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pF1KB3 AVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSAVSAEPPTTLPGTHPGLSETTNPMGHM
::::::::::::::::::::::::::::::::: : :: .: : :::.....: ::.:
CCDS42 AVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVS--SEPPPLSLAGPHPGMGDASNHMGQM
620 630 640 650 660 670
>>CCDS58629.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 (647 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNPQQQRMAAIGTDKELSDLLDFSAMFSPPVNSGKTRPTTLGSSQFSGSGIDERGGTTSW
::::::.:::. ::.:.:..:.::....:... ::
CCDS58 MFSPPVSSGKNGPTSLASGHFTGSNVEDRSSSGSW
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 GTSGQPSPSYDSSRGFTDSPHYSDHLNDSRLGAHEGLSPTPFMNSNLMGKTSERGSFSLY
:..:.::: ::.. :. : ::... ::.:..::: ::.:: ...:: ::::.: :
CCDS58 GNGGHPSP----SRNYGDGTPY-DHMTSRDLGSHDNLSP-PFVNSRIQSKT-ERGSYSSY
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170
pF1KB3 SRDTGLPGC-QSSLLRQDLGLGSPAQLSSSGKPGTAYYSFSATSSRRRPLHDSAALDPLQ
.:...: :: :.::: :. .:.:. :: . :::. ::..:... ::::::.:: .:
CCDS58 GRESNLQGCHQQSLLGGDMDMGNPGTLSPT-KPGSQYYQYSSNNPRRRPLHSSAM--EVQ
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 AKKVRKVPPGLPSSVYAPSPNSDDFNRESPSYPSPKPPTSMFASTFFMQDGTHNSSDLWS
.:::::::::::::::::: .. :.::.::.::: :: :: : :.:::::: :.::: ::
CCDS58 TKKVRKVPPGLPSSVYAPSASTADYNRDSPGYPSSKPATSTFPSSFFMQDG-HHSSDPWS
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 SSNGMSQPGFGGILGTSTSHMSQSSSYGNLHSHDRLSYPPHSVSPTDINTSLPPMSSFHR
::.::.:::..:.::.: ::. ::::: .:: :.::::: : : .:::.::::::.:::
CCDS58 SSSGMNQPGYAGMLGNS-SHIPQSSSYCSLHPHERLSYPSH--SSADINSSLPPMSTFHR
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 GSTSSSPYVAASHTPPINGSDSILGTRGN-AAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTSSSFPS
..:. : ..: ::: ::.:::...::. ::::::::::::::::::::::::..:: :
CCDS58 SGTNH--YSTSSCTPPANGTDSIMANRGSGAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTNNSFSS
270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 NPSTPVGSPSPLT-GTSQWPRPGGQAPSSPSYENSLHSLKNRVEQQLHEHLQDAMSFLKD
::::::::: :. ::. : : :::: :::.::. ::::
CCDS58 NPSTPVGSPPSLSAGTAVWSRNGGQASSSPNYEGPLHSL---------------------
320 330 340 350
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 VCEQSRMEDRLDRLDDAIHVLRNHAVGPSTSLPAGHSDIHSLLGPSHNAPIGSLNSNYGG
:::.::::.::::::::::::::::::..:.::.:.:...:::::. .:.:.:.::
CCDS58 ---QSRIEDRLERLDDAIHVLRNHAVGPSTAMPGGHGDMHGIIGPSHNGAMGGLGSGYG-
360 370 380 390 400 410
480 490 500 510 520
pF1KB3 SSLVASSRSASMVGTHREDSVSLNGNHSVLSSTV--------TTSSTDLNHKTQENYRG-
..:....: . ::::::::.:.: :.::.: . : ...: ::: :. :::
CCDS58 TGLLSANRHSLMVGTHREDGVALRGSHSLLPNQVPVPQLPVQSATSPDLN-PPQDPYRGM
420 430 440 450 460 470
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 --GLQSQSGTVVTTEIKTENKEKDENLHEPPSSDDMKSDDESSQKDIKVSSRGRTSSTNE
:::.:: . ..:::... : ::::.. ::.: : ::. .:::: .:.: ::.:.
CCDS58 PPGLQGQSVSSGSSEIKSDD-EGDENLQDTKSSEDKKLDDD--KKDIKSITRSR-SSNND
480 490 500 510 520
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 DEDLNPEQKIEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMCQLHLKSEKPQTKLLILHQ
::::.:::: ::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.:::::::::::
CCDS58 DEDLTPEQKAEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMVQLHLKSDKPQTKLLILHQ
530 540 550 560 570 580
650 660 670 680 690 700
pF1KB3 AVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSAVSAEPPTTLPGTHPGLSETTNPMGHM
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CCDS58 AVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVS--SEPPPLSLAGPHPGMGDASNHMGQM
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