Result of FASTA (ccds) for pFN21AB0031
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB0031, 915 aa
  1>>>pF1KB0031 915 - 915 aa - 915 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7620+/-0.00108; mu= 10.5088+/- 0.065
 mean_var=154.2122+/-30.797, 0's: 0 Z-trim(107.8): 131  B-trim: 68 in 1/52
 Lambda= 0.103280
 statistics sampled from 9687 (9819) to 9687 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.646), E-opt: 0.2 (0.302), width:  16
 Scan time:  4.580

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4195.1 FAM13B gene_id:51306|Hs108|chr5         ( 915) 5980 903.8       0
CCDS47269.1 FAM13B gene_id:51306|Hs108|chr5        ( 887) 4651 705.8 9.1e-203
CCDS47270.1 FAM13B gene_id:51306|Hs108|chr5        ( 791) 3534 539.3 1.1e-152
CCDS58912.1 FAM13A gene_id:10144|Hs108|chr4        ( 683) 1267 201.5 4.5e-51
CCDS43251.1 FAM13A gene_id:10144|Hs108|chr4        ( 697) 1266 201.3 5.1e-51
CCDS34029.1 FAM13A gene_id:10144|Hs108|chr4        (1023) 1267 201.6 6.2e-51
CCDS58911.1 FAM13A gene_id:10144|Hs108|chr4        ( 669) 1259 200.3   1e-50
CCDS58913.1 FAM13A gene_id:10144|Hs108|chr4        ( 669) 1089 175.0 4.3e-43
CCDS3611.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4       ( 655)  368 67.5 9.2e-11


>>CCDS4195.1 FAM13B gene_id:51306|Hs108|chr5              (915 aa)
 initn: 5980 init1: 5980 opt: 5980  Z-score: 4823.8  bits: 903.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5980; 100.0% identity (100.0% similar) in 915 aa overlap (1-915:1-915)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MRKSSSPSLSNCNSVLANKIFGIPLDELQQGGHPDNEVPFIVRHVVDYIEEHGGLEQQGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MRKSSSPSLSNCNSVLANKIFGIPLDELQQGGHPDNEVPFIVRHVVDYIEEHGGLEQQGL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 FQVNGNAETVEWLRQRYDSGEEVDLVKEADVPSAISLLRFFLQELPEPVIPGSLHIHLMQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FQVNGNAETVEWLRQRYDSGEEVDLVKEADVPSAISLLRFFLQELPEPVIPGSLHIHLMQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 LSQDYNNEDEFGRKLRFLLQQLPPVNYSLLKFLCRFLANVASHHEEIWSANSLAAVFGPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LSQDYNNEDEFGRKLRFLLQQLPPVNYSLLKFLCRFLANVASHHEEIWSANSLAAVFGPD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 VFHIYTDVEDMKEQEIVSRIMAGLLENYYEFFENEEEDFSSNDLSSITEQVNELSEEEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VFHIYTDVEDMKEQEIVSRIMAGLLENYYEFFENEEEDFSSNDLSSITEQVNELSEEEEE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 DEKLEHIEELPEEGAEKSNDMPEVVQLRMTENILESNSVTATSTHISPISILPASTDILE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DEKLEHIEELPEEGAEKSNDMPEVVQLRMTENILESNSVTATSTHISPISILPASTDILE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 RTIRAAVEQHLFDLQSSIDHDLKNLQQQSVVCNNEAESIHCDGEGSNNQIDIADDIINAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RTIRAAVEQHLFDLQSSIDHDLKNLQQQSVVCNNEAESIHCDGEGSNNQIDIADDIINAS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB0 ESNRDCSKPVASTNLDNEAMQQDCVFENEENTQSVGILLEPCSDRGDSEDGCLEREEYLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ESNRDCSKPVASTNLDNEAMQQDCVFENEENTQSVGILLEPCSDRGDSEDGCLEREEYLL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB0 FDSDKLSHLILDSSSKICDLNANTESEVPGGQSVGVQGEAACVSIPHLDLKNVSDGDKWE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FDSDKLSHLILDSSSKICDLNANTESEVPGGQSVGVQGEAACVSIPHLDLKNVSDGDKWE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB0 EPFPAFKSWQEDSESGEAQLSPQAGRMNHHPLEEDCPPVLSHRSLDFGQSQRFLHDPEKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EPFPAFKSWQEDSESGEAQLSPQAGRMNHHPLEEDCPPVLSHRSLDFGQSQRFLHDPEKL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB0 DSSSKALSFTRIRRSSFSSKDEKREDRTPYQLVKKLQKKIRQFEEQFERERNSKPSYSDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DSSSKALSFTRIRRSSFSSKDEKREDRTPYQLVKKLQKKIRQFEEQFERERNSKPSYSDI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB0 AANPKVLKWMTELTKLRKQIKDAKHKNSDGEFVPQTRPRSNTLPKSFGSSLDHEDEENED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AANPKVLKWMTELTKLRKQIKDAKHKNSDGEFVPQTRPRSNTLPKSFGSSLDHEDEENED
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB0 EPKVIQKEKKPSKEATLELILKRLKEKRIERCLPEDIKKMTKDHLVEEKASLQKSLLYYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EPKVIQKEKKPSKEATLELILKRLKEKRIERCLPEDIKKMTKDHLVEEKASLQKSLLYYE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB0 SQHGRPVTKEERHIVKPLYDRYRLVKQMLTRASITPVLGSPSTKRRGQMLQPIIEGETAH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SQHGRPVTKEERHIVKPLYDRYRLVKQMLTRASITPVLGSPSTKRRGQMLQPIIEGETAH
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB0 FFEEIKEEEEDGVNLSSELGDMLKTAVQVQSSLENSESDVEENQEKLALDLRLSSSRAAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FFEEIKEEEEDGVNLSSELGDMLKTAVQVQSSLENSESDVEENQEKLALDLRLSSSRAAS
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB0 MPELLEQLWKARAEKKKLRKTLREFEEAFYQQNGRNAQKEDRVPVLEEYREYKKIKAKLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MPELLEQLWKARAEKKKLRKTLREFEEAFYQQNGRNAQKEDRVPVLEEYREYKKIKAKLR
              850       860       870       880       890       900

              910     
pF1KB0 LLEVLISKQDSSKSI
       :::::::::::::::
CCDS41 LLEVLISKQDSSKSI
              910     

>>CCDS47269.1 FAM13B gene_id:51306|Hs108|chr5             (887 aa)
 initn: 5784 init1: 4621 opt: 4651  Z-score: 3753.8  bits: 705.8 E(32554): 9.1e-203
Smith-Waterman score: 5732; 96.9% identity (96.9% similar) in 915 aa overlap (1-915:1-887)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MRKSSSPSLSNCNSVLANKIFGIPLDELQQGGHPDNEVPFIVRHVVDYIEEHGGLEQQGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MRKSSSPSLSNCNSVLANKIFGIPLDELQQGGHPDNEVPFIVRHVVDYIEEHGGLEQQGL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 FQVNGNAETVEWLRQRYDSGEEVDLVKEADVPSAISLLRFFLQELPEPVIPGSLHIHLMQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FQVNGNAETVEWLRQRYDSGEEVDLVKEADVPSAISLLRFFLQELPEPVIPGSLHIHLMQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 LSQDYNNEDEFGRKLRFLLQQLPPVNYSLLKFLCRFLANVASHHEEIWSANSLAAVFGPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LSQDYNNEDEFGRKLRFLLQQLPPVNYSLLKFLCRFLANVASHHEEIWSANSLAAVFGPD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 VFHIYTDVEDMKEQEIVSRIMAGLLENYYEFFENEEEDFSSNDLSSITEQVNELSEEEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VFHIYTDVEDMKEQEIVSRIMAGLLENYYEFFENEEEDFSSNDLSSITEQVNELSEEEEE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 DEKLEHIEELPEEGAEKSNDMPEVVQLRMTENILESNSVTATSTHISPISILPASTDILE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DEKLEHIEELPEEGAEKSNDMPEVVQLRMTENILESNSVTATSTHISPISILPASTDILE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 RTIRAAVEQHLFDLQSSIDHDLKNLQQQSVVCNNEAESIHCDGEGSNNQIDIADDIINAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RTIRAAVEQHLFDLQSSIDHDLKNLQQQSVVCNNEAESIHCDGEGSNNQIDIADDIINAS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB0 ESNRDCSKPVASTNLDNEAMQQDCVFENEENTQSVGILLEPCSDRGDSEDGCLEREEYLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ESNRDCSKPVASTNLDNEAMQQDCVFENEENTQSVGILLEPCSDRGDSEDGCLEREEYLL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB0 FDSDKLSHLILDSSSKICDLNANTESEVPGGQSVGVQGEAACVSIPHLDLKNVSDGDKWE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FDSDKLSHLILDSSSKICDLNANTESEVPGGQSVGVQGEAACVSIPHLDLKNVSDGDKWE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB0 EPFPAFKSWQEDSESGEAQLSPQAGRMNHHPLEEDCPPVLSHRSLDFGQSQRFLHDPEKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EPFPAFKSWQEDSESGEAQLSPQAGRMNHHPLEEDCPPVLSHRSLDFGQSQRFLHDPEKL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB0 DSSSKALSFTRIRRSSFSSKDEKREDRTPYQLVKKLQKKIRQFEEQFERERNSKPSYSDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DSSSKALSFTRIRRSSFSSKDEKREDRTPYQLVKKLQKKIRQFEEQFERERNSKPSYSDI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB0 AANPKVLKWMTELTKLRKQIKDAKHKNSDGEFVPQTRPRSNTLPKSFGSSLDHEDEENED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AANPKVLKWMTELTKLRKQIKDAKHKNSDGEFVPQTRPRSNTLPKSFGSSLDHEDEENED
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB0 EPKVIQKEKKPSKEATLELILKRLKEKRIERCLPEDIKKMTKDHLVEEKASLQKSLLYYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                      
CCDS47 EPKVIQKEKKPSKEATLELILKRLKEKRIERCLPEDIK----------------------
              670       680       690                              

              730       740       750       760       770       780
pF1KB0 SQHGRPVTKEERHIVKPLYDRYRLVKQMLTRASITPVLGSPSTKRRGQMLQPIIEGETAH
             ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ------VTKEERHIVKPLYDRYRLVKQMLTRASITPVLGSPSTKRRGQMLQPIIEGETAH
            700       710       720       730       740       750  

              790       800       810       820       830       840
pF1KB0 FFEEIKEEEEDGVNLSSELGDMLKTAVQVQSSLENSESDVEENQEKLALDLRLSSSRAAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FFEEIKEEEEDGVNLSSELGDMLKTAVQVQSSLENSESDVEENQEKLALDLRLSSSRAAS
            760       770       780       790       800       810  

              850       860       870       880       890       900
pF1KB0 MPELLEQLWKARAEKKKLRKTLREFEEAFYQQNGRNAQKEDRVPVLEEYREYKKIKAKLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MPELLEQLWKARAEKKKLRKTLREFEEAFYQQNGRNAQKEDRVPVLEEYREYKKIKAKLR
            820       830       840       850       860       870  

              910     
pF1KB0 LLEVLISKQDSSKSI
       :::::::::::::::
CCDS47 LLEVLISKQDSSKSI
            880       

>>CCDS47270.1 FAM13B gene_id:51306|Hs108|chr5             (791 aa)
 initn: 3542 init1: 2379 opt: 3534  Z-score: 2855.0  bits: 539.3 E(32554): 1.1e-152
Smith-Waterman score: 4886; 93.9% identity (93.9% similar) in 819 aa overlap (119-915:1-791)

       90       100       110       120       130       140        
pF1KB0 ADVPSAISLLRFFLQELPEPVIPGSLHIHLMQLSQDYNNEDEFGRKLRFLLQQLPPVNYS
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47                               MQLSQDYNNEDEFGRKLRFLLQQLPPVNYS
                                             10        20        30

      150       160       170       180       190       200        
pF1KB0 LLKFLCRFLANVASHHEEIWSANSLAAVFGPDVFHIYTDVEDMKEQEIVSRIMAGLLENY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LLKFLCRFLANVASHHEEIWSANSLAAVFGPDVFHIYTDVEDMKEQEIVSRIMAGLLENY
               40        50        60        70        80        90

      210       220       230       240       250       260        
pF1KB0 YEFFENEEEDFSSNDLSSITEQVNELSEEEEEDEKLEHIEELPEEGAEKSNDMPEVVQLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YEFFENEEEDFSSNDLSSITEQVNELSEEEEEDEKLEHIEELPEEGAEKSNDMPEVVQLR
              100       110       120       130       140       150

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pF1KB0 MTENILESNSVTATSTHISPISILPASTDILERTIRAAVEQHLFDLQSSIDHDLKNLQQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MTENILESNSVTATSTHISPISILPASTDILERTIRAAVEQHLFDLQSSIDHDLKNLQQQ
              160       170       180       190       200       210

      330       340       350       360       370       380        
pF1KB0 SVVCNNEAESIHCDGEGSNNQIDIADDIINASESNRDCSKPVASTNLDNEAMQQDCVFEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SVVCNNEAESIHCDGEGSNNQIDIADDIINASESNRDCSKPVASTNLDNEAMQQDCVFEN
              220       230       240       250       260       270

      390       400       410       420       430       440        
pF1KB0 EENTQSVGILLEPCSDRGDSEDGCLEREEYLLFDSDKLSHLILDSSSKICDLNANTESEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EENTQSVGILLEPCSDRGDSEDGCLEREEYLLFDSDKLSHLILDSSSKICDLNANTESEV
              280       290       300       310       320       330

      450       460       470       480                            
pF1KB0 PGGQSVGVQGEAACVSIPHLDLKNVSDGDKWE----------------------EPFPAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::                      ::::::
CCDS47 PGGQSVGVQGEAACVSIPHLDLKNVSDGDKWEASCPITFPLIDFKTMHLQRDGEEPFPAF
              340       350       360       370       380       390

        490       500       510       520       530       540      
pF1KB0 KSWQEDSESGEAQLSPQAGRMNHHPLEEDCPPVLSHRSLDFGQSQRFLHDPEKLDSSSKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KSWQEDSESGEAQLSPQAGRMNHHPLEEDCPPVLSHRSLDFGQSQRFLHDPEKLDSSSKA
              400       410       420       430       440       450

        550       560       570       580       590       600      
pF1KB0 LSFTRIRRSSFSSKDEKREDRTPYQLVKKLQKKIRQFEEQFERERNSKPSYSDIAANPKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LSFTRIRRSSFSSKDEKREDRTPYQLVKKLQKKIRQFEEQFERERNSKPSYSDIAANPKV
              460       470       480       490       500       510

        610       620       630       640       650       660      
pF1KB0 LKWMTELTKLRKQIKDAKHKNSDGEFVPQTRPRSNTLPKSFGSSLDHEDEENEDEPKVIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LKWMTELTKLRKQIKDAKHKNSDGEFVPQTRPRSNTLPKSFGSSLDHEDEENEDEPKVIQ
              520       530       540       550       560       570

        670       680       690       700       710       720      
pF1KB0 KEKKPSKEATLELILKRLKEKRIERCLPEDIKKMTKDHLVEEKASLQKSLLYYESQHGRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::                            
CCDS47 KEKKPSKEATLELILKRLKEKRIERCLPEDIK----------------------------
              580       590       600                              

        730       740       750       760       770       780      
pF1KB0 VTKEERHIVKPLYDRYRLVKQMLTRASITPVLGSPSTKRRGQMLQPIIEGETAHFFEEIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VTKEERHIVKPLYDRYRLVKQMLTRASITPVLGSPSTKRRGQMLQPIIEGETAHFFEEIK
            610       620       630       640       650       660  

        790       800       810       820       830       840      
pF1KB0 EEEEDGVNLSSELGDMLKTAVQVQSSLENSESDVEENQEKLALDLRLSSSRAASMPELLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EEEEDGVNLSSELGDMLKTAVQVQSSLENSESDVEENQEKLALDLRLSSSRAASMPELLE
            670       680       690       700       710       720  

        850       860       870       880       890       900      
pF1KB0 QLWKARAEKKKLRKTLREFEEAFYQQNGRNAQKEDRVPVLEEYREYKKIKAKLRLLEVLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QLWKARAEKKKLRKTLREFEEAFYQQNGRNAQKEDRVPVLEEYREYKKIKAKLRLLEVLI
            730       740       750       760       770       780  

        910     
pF1KB0 SKQDSSKSI
       :::::::::
CCDS47 SKQDSSKSI
            790 

>>CCDS58912.1 FAM13A gene_id:10144|Hs108|chr4             (683 aa)
 initn: 1212 init1: 793 opt: 1267  Z-score: 1030.4  bits: 201.5 E(32554): 4.5e-51
Smith-Waterman score: 1673; 45.7% identity (70.7% similar) in 682 aa overlap (283-915:10-683)

            260       270       280       290       300       310  
pF1KB0 EGAEKSNDMPEVVQLRMTENILESNSVTATSTHISPISILPASTDILERTIRAAVEQHLF
                                     :.:.  .: . :. ..::::::.:::::::
CCDS58                      MACEIMPLQSAHVPQVSNVSATGELLERTIRSAVEQHLF
                                    10        20        30         

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pF1KB0 DL-----QSSIDHDLKNLQQQSVVC-------NNEAESI-HCDGEGSNNQIDIA------
       :.     ::: : .  .:. .:..        ..: . . :   .:  :. .        
CCDS58 DVNNSGGQSSEDSESGTLSASSATSARQRRRQSKEQDEVRHGRDKGLINKENTPSGFNHL
      40        50        60        70        80        90         

            360                 370          380       390         
pF1KB0 DD-IINASESNR------DC----SKPV---ASTNLDNEAMQQDCVFENEENTQSVGILL
       :: :.:..: ..       :    :::    .::.:..   .:: .  : :. .:.    
CCDS58 DDCILNTQEVEKVHKNTFGCAGERSKPKRQKSSTKLSELHDNQDGLV-NMESLNSTRSHE
     100       110       120       130       140        150        

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pF1KB0 EPCSDRGDSEDGCLEREEYLLFDSDKLSHLILDSSSKICDLNANTESEVPGGQSVGVQGE
       .   :  : :    ::.     :. . .:.  . . :: .  . ....   .:..: : :
CCDS58 RTGPD--DFEWMSDERKGNEK-DGGHTQHF-ESPTMKIQEHPSLSDTKQQRNQDAGDQEE
      160         170        180        190       200       210    

     460       470       480       490        500       510        
pF1KB0 AACVSIPHLDLKNVSDGDKWEEPFPAFKSWQ-EDSESGEAQLSPQAGRMNHHPLEEDCPP
       .    .:. ::  . :  .::::.:::.::: :.:.: ::.:::::::. .. :.::  :
CCDS58 SFVSEVPQSDLTALCDEKNWEEPIPAFSSWQRENSDSDEAHLSPQAGRLIRQLLDEDSDP
          220       230       240       250       260       270    

      520       530       540       550       560       570        
pF1KB0 VLSHRSLDFGQSQRFLHDPEKLDSSSKALSFTRIRRSSFSSKDEKREDRTPYQLVKKLQ-
       .:: :   .:::...: : :   :  .. :: : : ::..: :...:: :: ::....: 
CCDS58 MLSPRFYAYGQSRQYLDDTEVPPSPPNSHSFMRRRSSSLGSYDDEQEDLTPAQLTRRIQS
          280       290       300       310       320       330    

         580       590       600       610       620       630     
pF1KB0 --KKIRQFEEQFERERNSKPSYSDIAANPKVLKWMTELTKLRKQIKDAKHKNSDGEFVPQ
         ::::.::..::.:.. .::.:: ::::.:::: ..:.:.:.:.:..: : :. ...:.
CCDS58 LKKKIRKFEDRFEEEKKYRPSHSDKAANPEVLKWTNDLAKFRRQLKESKLKISEEDLTPR
          340       350       360       370       380       390    

         640       650       660       670       680       690     
pF1KB0 TRPRSNTLPKSFGSSLDHEDEENEDEPKVIQKEKKPSKEATLELILKRLKEKRIERCLPE
        : :::::::::::.:..:::....   ...:  ::: ::::: : ..:.::: :   ::
CCDS58 MRQRSNTLPKSFGSQLEKEDEKKQE---LVDKAIKPSVEATLESIQRKLQEKRAESSRPE
          400       410          420       430       440       450 

         700       710       720       730       740       750     
pF1KB0 DIKKMTKDHLVEEKASLQKSLLYYESQHGRPVTKEERHIVKPLYDRYRLVKQMLTRASIT
       ::: ::::....::..:::.:::::: :::::::.::...::::::::::::.:.::.  
CCDS58 DIKDMTKDQIANEKVALQKALLYYESIHGRPVTKNERQVMKPLYDRYRLVKQILSRANTI
             460       470       480       490       500       510 

         760       770       780       790          800       810  
pF1KB0 PVLGSPSTKRRGQMLQPIIEGETAHFFEEIKEEEE---DGVNLSSELGDMLKTAVQVQSS
       :..::::.:::. .:::::::::: ::.:::::::   :  :.. ..   :::  ...  
CCDS58 PIIGSPSSKRRSPLLQPIIEGETASFFKEIKEEEEGSEDDSNVKPDFMVTLKTDFSARCF
             520       530       540       550       560       570 

            820               830       840       850       860    
pF1KB0 LENSESDVE--------ENQEKLALDLRLSSSRAASMPELLEQLWKARAEKKKLRKTLRE
       :.. :.:..        .   : . :  ::. .:::.:::::.: . : :::..:: ::.
CCDS58 LDQFEDDADGFISPMDDKIPSKCSQDTGLSNLHAASIPELLEHLQEMREEKKRIRKKLRD
             580       590       600       610       620       630 

          870       880       890       900       910      
pF1KB0 FEEAFYQQNGRNAQKEDRVPVLEEYREYKKIKAKLRLLEVLISKQDS-SKSI
       ::. :..:::::.:::::.:. ::: :::.::::::::::::::.:. :::.
CCDS58 FEDNFFRQNGRNVQKEDRTPMAEEYSEYKHIKAKLRLLEVLISKRDTDSKSM
             640       650       660       670       680   

>>CCDS43251.1 FAM13A gene_id:10144|Hs108|chr4             (697 aa)
 initn: 1212 init1: 793 opt: 1266  Z-score: 1029.4  bits: 201.3 E(32554): 5.1e-51
Smith-Waterman score: 1676; 44.9% identity (70.1% similar) in 702 aa overlap (263-915:4-697)

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB0 ELSEEEEEDEKLEHIEELPEEGAEKSNDMPEVVQLRMTENILESNSVTATSTHISPISIL
                                     :.. :. ...  .  :    :.:.  .: .
CCDS43                            MACEIMPLQSSQEDERPLSPFYLSAHVPQVSNV
                                          10        20        30   

            300       310            320       330                 
pF1KB0 PASTDILERTIRAAVEQHLFDL-----QSSIDHDLKNLQQQSVVC-------NNEAESI-
        :. ..::::::.::::::::.     ::: : .  .:. .:..        ..: . . 
CCDS43 SATGELLERTIRSAVEQHLFDVNNSGGQSSEDSESGTLSASSATSARQRRRQSKEQDEVR
            40        50        60        70        80        90   

     340       350              360                 370            
pF1KB0 HCDGEGSNNQIDIA------DD-IINASESNR------DC----SKPV---ASTNLDNEA
       :   .:  :. .        :: :.:..: ..       :    :::    .::.:..  
CCDS43 HGRDKGLINKENTPSGFNHLDDCILNTQEVEKVHKNTFGCAGERSKPKRQKSSTKLSELH
           100       110       120       130       140       150   

     380       390       400       410       420       430         
pF1KB0 MQQDCVFENEENTQSVGILLEPCSDRGDSEDGCLEREEYLLFDSDKLSHLILDSSSKICD
        .:: .  : :. .:.    .   :  : :    ::.     :. . .:.  . . :: .
CCDS43 DNQDGLV-NMESLNSTRSHERTGPD--DFEWMSDERKGNEK-DGGHTQHF-ESPTMKIQE
           160        170         180       190         200        

     440       450       460       470       480       490         
pF1KB0 LNANTESEVPGGQSVGVQGEAACVSIPHLDLKNVSDGDKWEEPFPAFKSWQ-EDSESGEA
         . ....   .:..: : :.    .:. ::  . :  .::::.:::.::: :.:.: ::
CCDS43 HPSLSDTKQQRNQDAGDQEESFVSEVPQSDLTALCDEKNWEEPIPAFSSWQRENSDSDEA
      210       220       230       240       250       260        

      500       510       520       530       540       550        
pF1KB0 QLSPQAGRMNHHPLEEDCPPVLSHRSLDFGQSQRFLHDPEKLDSSSKALSFTRIRRSSFS
       .:::::::. .. :.::  :.:: :   .:::...: : :   :  .. :: : : ::..
CCDS43 HLSPQAGRLIRQLLDEDSDPMLSPRFYAYGQSRQYLDDTEVPPSPPNSHSFMRRRSSSLG
      270       280       290       300       310       320        

      560       570          580       590       600       610     
pF1KB0 SKDEKREDRTPYQLVKKLQ---KKIRQFEEQFERERNSKPSYSDIAANPKVLKWMTELTK
       : :...:: :: ::....:   ::::.::..::.:.. .::.:: ::::.:::: ..:.:
CCDS43 SYDDEQEDLTPAQLTRRIQSLKKKIRKFEDRFEEEKKYRPSHSDKAANPEVLKWTNDLAK
      330       340       350       360       370       380        

         620       630       640       650       660       670     
pF1KB0 LRKQIKDAKHKNSDGEFVPQTRPRSNTLPKSFGSSLDHEDEENEDEPKVIQKEKKPSKEA
       .:.:.:..: : :. ...:. : :::::::::::.:..:::....   ...:  ::: ::
CCDS43 FRRQLKESKLKISEEDLTPRMRQRSNTLPKSFGSQLEKEDEKKQE---LVDKAIKPSVEA
      390       400       410       420       430          440     

         680       690       700       710       720       730     
pF1KB0 TLELILKRLKEKRIERCLPEDIKKMTKDHLVEEKASLQKSLLYYESQHGRPVTKEERHIV
       ::: : ..:.::: :   ::::: ::::....::..:::.:::::: :::::::.::...
CCDS43 TLESIQRKLQEKRAESSRPEDIKDMTKDQIANEKVALQKALLYYESIHGRPVTKNERQVM
         450       460       470       480       490       500     

         740       750       760       770       780       790     
pF1KB0 KPLYDRYRLVKQMLTRASITPVLGSPSTKRRGQMLQPIIEGETAHFFEEIKEEEE---DG
       ::::::::::::.:.::.  :..::::.:::. .:::::::::: ::.:::::::   : 
CCDS43 KPLYDRYRLVKQILSRANTIPIIGSPSSKRRSPLLQPIIEGETASFFKEIKEEEEGSEDD
         510       520       530       540       550       560     

            800       810       820               830       840    
pF1KB0 VNLSSELGDMLKTAVQVQSSLENSESDVE--------ENQEKLALDLRLSSSRAASMPEL
        :.. ..   :::  ...  :.. :.:..        .   : . :  ::. .:::.:::
CCDS43 SNVKPDFMVTLKTDFSARCFLDQFEDDADGFISPMDDKIPSKCSQDTGLSNLHAASIPEL
         570       580       590       600       610       620     

          850       860       870       880       890       900    
pF1KB0 LEQLWKARAEKKKLRKTLREFEEAFYQQNGRNAQKEDRVPVLEEYREYKKIKAKLRLLEV
       ::.: . : :::..:: ::.::. :..:::::.:::::.:. ::: :::.::::::::::
CCDS43 LEHLQEMREEKKRIRKKLRDFEDNFFRQNGRNVQKEDRTPMAEEYSEYKHIKAKLRLLEV
         630       640       650       660       670       680     

          910      
pF1KB0 LISKQDS-SKSI
       ::::.:. :::.
CCDS43 LISKRDTDSKSM
         690       

>>CCDS34029.1 FAM13A gene_id:10144|Hs108|chr4             (1023 aa)
 initn: 1662 init1: 793 opt: 1267  Z-score: 1027.8  bits: 201.6 E(32554): 6.2e-51
Smith-Waterman score: 2102; 42.8% identity (68.5% similar) in 969 aa overlap (45-915:65-1023)

           20        30        40        50        60        70    
pF1KB0 VLANKIFGIPLDELQQGGHPDNEVPFIVRHVVDYIEEHGGLEQQGLFQVNGNAETVEWLR
                                     .:.:. .:: : :.:::.::::...:: ::
CCDS34 FTYQKLFGVSLQELERQGLTENGIPAVVWNIVEYLTQHG-LTQEGLFRVNGNVKVVEQLR
           40        50        60        70         80        90   

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pF1KB0 QRYDSGEEVDLVKEADVPSAISLLRFFLQELPEPVIPGSLHIHLMQLSQDYNNEDEFGRK
        ...::  :.: :..:: :: :::..::.:::. .: ..:. ...:: ::  : :    .
CCDS34 LKFESGVPVELGKDGDVCSAASLLKLFLRELPDSLITSALQPRFIQLFQDGRN-DVQESS
           100       110       120       130       140        150  

          140       150       160        170       180       190   
pF1KB0 LRFLLQQLPPVNYSLLKFLCRFLANVASHH-EEIWSANSLAAVFGPDVFHIYTDVEDMKE
       :: :...:: ..: :::.::.::..::.:: ..  ....::.::::. ::.   .: :::
CCDS34 LRDLIKELPDTHYCLLKYLCQFLTKVAKHHVQNRMNVHNLATVFGPNCFHVPPGLEGMKE
            160       170       180       190       200       210  

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pF1KB0 QEIVSRIMAGLLENYYEFFENE--EED-FSSNDLSS--ITEQVNE-------LSEEEEED
       :.. ..::: .::::  .:: :  :.: .  ..:.   :...:         :..  :.:
CCDS34 QDLCNKIMAKILENYNTLFEVEYTENDHLRCENLARLIIVKEVYYKNSLPILLTRGLERD
            220       230       240       250       260       270  

              250                   260        270            280  
pF1KB0 -EKLEHIEELPE---EGA---------EKSNDMPEV-VQLRMTENILES-NS----VTAT
         :     ..:.   ::.         : :. .:.. ..: . .  ::. ::    ..: 
CCDS34 MPKPPPKTKIPKSRSEGSIQAHRVLQPELSDGIPQLSLRLSYRKACLEDMNSAEGAISAK
            280       290       300       310       320       330  

                             290       300       310            320
pF1KB0 -----------------STHISPISILPASTDILERTIRAAVEQHLFDL-----QSSIDH
                        :.:.  .: . :. ..::::::.::::::::.     ::: : 
CCDS34 LVPSSQEDERPLSPFYLSAHVPQVSNVSATGELLERTIRSAVEQHLFDVNNSGGQSSEDS
            340       350       360       370       380       390  

              330               340       350              360     
pF1KB0 DLKNLQQQSVVC-------NNEAESI-HCDGEGSNNQIDIA------DD-IINASESNR-
       .  .:. .:..        ..: . . :   .:  :. .        :: :.:..: .. 
CCDS34 ESGTLSASSATSARQRRRQSKEQDEVRHGRDKGLINKENTPSGFNHLDDCILNTQEVEKV
            400       410       420       430       440       450  

                   370          380       390       400       410  
pF1KB0 -----DC----SKPV---ASTNLDNEAMQQDCVFENEENTQSVGILLEPCSDRGDSEDGC
             :    :::    .::.:..   .:: .  : :. .:.    .   :  : :   
CCDS34 HKNTFGCAGERSKPKRQKSSTKLSELHDNQDGLV-NMESLNSTRSHERTGPD--DFEWMS
            460       470       480        490       500           

            420       430       440       450       460       470  
pF1KB0 LEREEYLLFDSDKLSHLILDSSSKICDLNANTESEVPGGQSVGVQGEAACVSIPHLDLKN
        ::.     :. . .:.  . . :: .  . ....   .:..: : :.    .:. ::  
CCDS34 DERKGNEK-DGGHTQHF-ESPTMKIQEHPSLSDTKQQRNQDAGDQEESFVSEVPQSDLTA
     510        520        530       540       550       560       

            480       490        500       510       520       530 
pF1KB0 VSDGDKWEEPFPAFKSWQ-EDSESGEAQLSPQAGRMNHHPLEEDCPPVLSHRSLDFGQSQ
       . :  .::::.:::.::: :.:.: ::.:::::::. .. :.::  :.:: :   .:::.
CCDS34 LCDEKNWEEPIPAFSSWQRENSDSDEAHLSPQAGRLIRQLLDEDSDPMLSPRFYAYGQSR
       570       580       590       600       610       620       

             540       550       560       570          580        
pF1KB0 RFLHDPEKLDSSSKALSFTRIRRSSFSSKDEKREDRTPYQLVKKLQ---KKIRQFEEQFE
       ..: : :   :  .. :: : : ::..: :...:: :: ::....:   ::::.::..::
CCDS34 QYLDDTEVPPSPPNSHSFMRRRSSSLGSYDDEQEDLTPAQLTRRIQSLKKKIRKFEDRFE
       630       640       650       660       670       680       

      590       600       610       620       630       640        
pF1KB0 RERNSKPSYSDIAANPKVLKWMTELTKLRKQIKDAKHKNSDGEFVPQTRPRSNTLPKSFG
       .:.. .::.:: ::::.:::: ..:.:.:.:.:..: : :. ...:. : ::::::::::
CCDS34 EEKKYRPSHSDKAANPEVLKWTNDLAKFRRQLKESKLKISEEDLTPRMRQRSNTLPKSFG
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      650       660       670       680       690       700        
pF1KB0 SSLDHEDEENEDEPKVIQKEKKPSKEATLELILKRLKEKRIERCLPEDIKKMTKDHLVEE
       :.:..:::....   ...:  ::: ::::: : ..:.::: :   ::::: ::::....:
CCDS34 SQLEKEDEKKQE---LVDKAIKPSVEATLESIQRKLQEKRAESSRPEDIKDMTKDQIANE
       750          760       770       780       790       800    

      710       720       730       740       750       760        
pF1KB0 KASLQKSLLYYESQHGRPVTKEERHIVKPLYDRYRLVKQMLTRASITPVLGSPSTKRRGQ
       :..:::.:::::: :::::::.::...::::::::::::.:.::.  :..::::.:::. 
CCDS34 KVALQKALLYYESIHGRPVTKNERQVMKPLYDRYRLVKQILSRANTIPIIGSPSSKRRSP
          810       820       830       840       850       860    

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pF1KB0 MLQPIIEGETAHFFEEIKEEEE---DGVNLSSELGDMLKTAVQVQSSLENSESDVE----
       .:::::::::: ::.:::::::   :  :.. ..   :::  ...  :.. :.:..    
CCDS34 LLQPIIEGETASFFKEIKEEEEGSEDDSNVKPDFMVTLKTDFSARCFLDQFEDDADGFIS
          870       880       890       900       910       920    

                 830       840       850       860       870       
pF1KB0 ----ENQEKLALDLRLSSSRAASMPELLEQLWKARAEKKKLRKTLREFEEAFYQQNGRNA
           .   : . :  ::. .:::.:::::.: . : :::..:: ::.::. :..:::::.
CCDS34 PMDDKIPSKCSQDTGLSNLHAASIPELLEHLQEMREEKKRIRKKLRDFEDNFFRQNGRNV
          930       940       950       960       970       980    

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pF1KB0 QKEDRVPVLEEYREYKKIKAKLRLLEVLISKQDS-SKSI
       :::::.:. ::: :::.::::::::::::::.:. :::.
CCDS34 QKEDRTPMAEEYSEYKHIKAKLRLLEVLISKRDTDSKSM
          990      1000      1010      1020   

>>CCDS58911.1 FAM13A gene_id:10144|Hs108|chr4             (669 aa)
 initn: 1212 init1: 793 opt: 1259  Z-score: 1024.1  bits: 200.3 E(32554): 1e-50
Smith-Waterman score: 1646; 46.0% identity (70.6% similar) in 674 aa overlap (291-915:5-669)

              270       280       290       300       310          
pF1KB0 MPEVVQLRMTENILESNSVTATSTHISPISILPASTDILERTIRAAVEQHLFDL-----Q
                                     :.: .  .::::::.::::::::.     :
CCDS58                           MACEIMPLQR-LLERTIRSAVEQHLFDVNNSGGQ
                                         10         20        30   

         320       330               340       350              360
pF1KB0 SSIDHDLKNLQQQSVVC-------NNEAESI-HCDGEGSNNQIDIA------DD-IINAS
       :: : .  .:. .:..        ..: . . :   .:  :. .        :: :.:..
CCDS58 SSEDSESGTLSASSATSARQRRRQSKEQDEVRHGRDKGLINKENTPSGFNHLDDCILNTQ
            40        50        60        70        80        90   

                        370          380       390       400       
pF1KB0 ESNR------DC----SKPV---ASTNLDNEAMQQDCVFENEENTQSVGILLEPCSDRGD
       : ..       :    :::    .::.:..   .:: .  : :. .:.    .   :  :
CCDS58 EVEKVHKNTFGCAGERSKPKRQKSSTKLSELHDNQDGLV-NMESLNSTRSHERTGPD--D
           100       110       120       130        140         150

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pF1KB0 SEDGCLEREEYLLFDSDKLSHLILDSSSKICDLNANTESEVPGGQSVGVQGEAACVSIPH
        :    ::.     :. . .:.  . . :: .  . ....   .:..: : :.    .:.
CCDS58 FEWMSDERKGNEK-DGGHTQHF-ESPTMKIQEHPSLSDTKQQRNQDAGDQEESFVSEVPQ
              160        170        180       190       200        

       470       480       490        500       510       520      
pF1KB0 LDLKNVSDGDKWEEPFPAFKSWQ-EDSESGEAQLSPQAGRMNHHPLEEDCPPVLSHRSLD
        ::  . :  .::::.:::.::: :.:.: ::.:::::::. .. :.::  :.:: :   
CCDS58 SDLTALCDEKNWEEPIPAFSSWQRENSDSDEAHLSPQAGRLIRQLLDEDSDPMLSPRFYA
      210       220       230       240       250       260        

        530       540       550       560       570          580   
pF1KB0 FGQSQRFLHDPEKLDSSSKALSFTRIRRSSFSSKDEKREDRTPYQLVKKLQ---KKIRQF
       .:::...: : :   :  .. :: : : ::..: :...:: :: ::....:   ::::.:
CCDS58 YGQSRQYLDDTEVPPSPPNSHSFMRRRSSSLGSYDDEQEDLTPAQLTRRIQSLKKKIRKF
      270       280       290       300       310       320        

           590       600       610       620       630       640   
pF1KB0 EEQFERERNSKPSYSDIAANPKVLKWMTELTKLRKQIKDAKHKNSDGEFVPQTRPRSNTL
       :..::.:.. .::.:: ::::.:::: ..:.:.:.:.:..: : :. ...:. : :::::
CCDS58 EDRFEEEKKYRPSHSDKAANPEVLKWTNDLAKFRRQLKESKLKISEEDLTPRMRQRSNTL
      330       340       350       360       370       380        

           650       660       670       680       690       700   
pF1KB0 PKSFGSSLDHEDEENEDEPKVIQKEKKPSKEATLELILKRLKEKRIERCLPEDIKKMTKD
       ::::::.:..:::....   ...:  ::: ::::: : ..:.::: :   ::::: ::::
CCDS58 PKSFGSQLEKEDEKKQE---LVDKAIKPSVEATLESIQRKLQEKRAESSRPEDIKDMTKD
      390       400          410       420       430       440     

           710       720       730       740       750       760   
pF1KB0 HLVEEKASLQKSLLYYESQHGRPVTKEERHIVKPLYDRYRLVKQMLTRASITPVLGSPST
       ....::..:::.:::::: :::::::.::...::::::::::::.:.::.  :..::::.
CCDS58 QIANEKVALQKALLYYESIHGRPVTKNERQVMKPLYDRYRLVKQILSRANTIPIIGSPSS
         450       460       470       480       490       500     

           770       780       790          800       810       820
pF1KB0 KRRGQMLQPIIEGETAHFFEEIKEEEE---DGVNLSSELGDMLKTAVQVQSSLENSESDV
       :::. .:::::::::: ::.:::::::   :  :.. ..   :::  ...  :.. :.:.
CCDS58 KRRSPLLQPIIEGETASFFKEIKEEEEGSEDDSNVKPDFMVTLKTDFSARCFLDQFEDDA
         510       520       530       540       550       560     

                      830       840       850       860       870  
pF1KB0 E--------ENQEKLALDLRLSSSRAASMPELLEQLWKARAEKKKLRKTLREFEEAFYQQ
       .        .   : . :  ::. .:::.:::::.: . : :::..:: ::.::. :..:
CCDS58 DGFISPMDDKIPSKCSQDTGLSNLHAASIPELLEHLQEMREEKKRIRKKLRDFEDNFFRQ
         570       580       590       600       610       620     

            880       890       900       910      
pF1KB0 NGRNAQKEDRVPVLEEYREYKKIKAKLRLLEVLISKQDS-SKSI
       ::::.:::::.:. ::: :::.::::::::::::::.:. :::.
CCDS58 NGRNVQKEDRTPMAEEYSEYKHIKAKLRLLEVLISKRDTDSKSM
         630       640       650       660         

>>CCDS58913.1 FAM13A gene_id:10144|Hs108|chr4             (669 aa)
 initn: 1432 init1: 597 opt: 1089  Z-score: 887.2  bits: 175.0 E(32554): 4.3e-43
Smith-Waterman score: 1472; 42.2% identity (66.7% similar) in 699 aa overlap (263-915:4-669)

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB0 ELSEEEEEDEKLEHIEELPEEGAEKSNDMPEVVQLRMTENILESNSVTATSTHISPISIL
                                     :.. :. ...  .  :    :.:.  .: .
CCDS58                            MACEIMPLQSSQEDERPLSPFYLSAHVPQVSNV
                                          10        20        30   

            300       310            320       330                 
pF1KB0 PASTDILERTIRAAVEQHLFDL-----QSSIDHDLKNLQQQSVVC-------NNEAESI-
        :. ..::::::.::::::::.     ::: : .  .:. .:..        ..: . . 
CCDS58 SATGELLERTIRSAVEQHLFDVNNSGGQSSEDSESGTLSASSATSARQRRRQSKEQDEVR
            40        50        60        70        80        90   

     340       350              360                 370            
pF1KB0 HCDGEGSNNQIDIA------DD-IINASESNR------DC----SKPV---ASTNLDNEA
       :   .:  :. .        :: :.:..: ..       :    :::    .::.:..  
CCDS58 HGRDKGLINKENTPSGFNHLDDCILNTQEVEKVHKNTFGCAGERSKPKRQKSSTKLSELH
           100       110       120       130       140       150   

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pF1KB0 MQQDCVFENEENTQSVGILLEPCSDRGDSEDGCLEREEYLLFDSDKLSHLILDSSSKICD
        .:: .  : :. .:.    .   :  : :    ::.     :. . .:.  . . :: .
CCDS58 DNQDGLV-NMESLNSTRSHERTGPD--DFEWMSDERKGNEK-DGGHTQHF-ESPTMKIQE
           160        170         180       190         200        

     440       450       460       470       480       490         
pF1KB0 LNANTESEVPGGQSVGVQGEAACVSIPHLDLKNVSDGDKWEEPFPAFKSWQ-EDSESGEA
         . ....   .:..: : :.    .:. ::  . :  .::::.:::.::: :.:.: ::
CCDS58 HPSLSDTKQQRNQDAGDQEESFVSEVPQSDLTALCDEKNWEEPIPAFSSWQRENSDSDEA
      210       220       230       240       250       260        

      500       510       520       530       540       550        
pF1KB0 QLSPQAGRMNHHPLEEDCPPVLSHRSLDFGQSQRFLHDPEKLDSSSKALSFTRIRRSSFS
       .:::::::. .. :.::  :.:: :   .:::...: : :   :  .. :: : : ::..
CCDS58 HLSPQAGRLIRQLLDEDSDPMLSPRFYAYGQSRQYLDDTEVPPSPPNSHSFMRRRSSSLG
      270       280       290       300       310       320        

      560       570          580       590       600       610     
pF1KB0 SKDEKREDRTPYQLVKKLQ---KKIRQFEEQFERERNSKPSYSDIAANPKVLKWMTELTK
       : :...:: :: ::....:   ::::.::..::.:.. .::.:: ::::.:::: ..:.:
CCDS58 SYDDEQEDLTPAQLTRRIQSLKKKIRKFEDRFEEEKKYRPSHSDKAANPEVLKWTNDLAK
      330       340       350       360       370       380        

         620       630       640       650       660       670     
pF1KB0 LRKQIKDAKHKNSDGEFVPQTRPRSNTLPKSFGSSLDHEDEENEDEPKVIQKEKKPSKEA
       .:.:.:..: : :. ...:. : :::::::::::.:..:::....   ...:  ::: ::
CCDS58 FRRQLKESKLKISEEDLTPRMRQRSNTLPKSFGSQLEKEDEKKQE---LVDKAIKPSVEA
      390       400       410       420       430          440     

         680       690       700       710       720       730     
pF1KB0 TLELILKRLKEKRIERCLPEDIKKMTKDHLVEEKASLQKSLLYYESQHGRPVTKEERHIV
       ::: : ..:.::: :   ::::: ::::....::..:::.:::::: :::::::.::...
CCDS58 TLESIQRKLQEKRAESSRPEDIKDMTKDQIANEKVALQKALLYYESIHGRPVTKNERQVM
         450       460       470       480       490       500     

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pF1KB0 KPLYDRYRLVKQMLTRASITPVLGSPSTKRRGQMLQPIIEGETAHFFEEIKEEEEDGVNL
       ::::::::::::.:.::.                  :::: :         :  ::  :.
CCDS58 KPLYDRYRLVKQILSRANTI----------------PIIEEE---------EGSEDDSNV
         510       520                       530                540

         800       810       820               830       840       
pF1KB0 SSELGDMLKTAVQVQSSLENSESDVE--------ENQEKLALDLRLSSSRAASMPELLEQ
       . ..   :::  ...  :.. :.:..        .   : . :  ::. .:::.:::::.
CCDS58 KPDFMVTLKTDFSARCFLDQFEDDADGFISPMDDKIPSKCSQDTGLSNLHAASIPELLEH
              550       560       570       580       590       600

       850       860       870       880       890       900       
pF1KB0 LWKARAEKKKLRKTLREFEEAFYQQNGRNAQKEDRVPVLEEYREYKKIKAKLRLLEVLIS
       : . : :::..:: ::.::. :..:::::.:::::.:. ::: :::.:::::::::::::
CCDS58 LQEMREEKKRIRKKLRDFEDNFFRQNGRNVQKEDRTPMAEEYSEYKHIKAKLRLLEVLIS
              610       620       630       640       650       660

       910      
pF1KB0 KQDS-SKSI
       :.:. :::.
CCDS58 KRDTDSKSM
                

>>CCDS3611.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4            (655 aa)
 initn: 346 init1: 191 opt: 368  Z-score: 306.7  bits: 67.5 E(32554): 9.2e-11
Smith-Waterman score: 370; 23.5% identity (56.7% similar) in 635 aa overlap (3-587:23-636)

                                   10        20         30         
pF1KB0                     MRKSSSPSLSNCNSVLANKIFGIPL-DELQQGGHPDNEV-
                             :..   .. : : . . :::  : : ..   .  :.. 
CCDS36 MPEDRNSGGCPAGALASTPFIPKTTYRRIKRCFS-FRKGIFGQKLEDTVRYEKRYGNRLA
               10        20        30         40        50         

       40        50        60        70        80        90        
pF1KB0 PFIVRHVVDYIEEHGGLEQQGLFQVNGNAETVEWLRQRYDSGEEVDLVKEADVPSAISLL
       :..:.. ::.:...: :...:::.. :.:. :. :.. .: ::. .. ...:: .. :::
CCDS36 PMLVEQCVDFIRQRG-LKEEGLFRLPGQANLVKELQDAFDCGEKPSFDSNTDVHTVASLL
      60        70         80        90       100       110        

      100       110       120       130        140       150       
pF1KB0 RFFLQELPEPVIPGSLHIHLMQLSQDYNNEDEFG-RKLRFLLQQLPPVNYSLLKFLCRFL
       ...:.:::::::: . .  ... ..  ..:.: : ..:   ...:: :::.:::..::::
CCDS36 KLYLRELPEPVIPYAKYEDFLSCAKLLSKEEEAGVKELAKQVKSLPVVNYNLLKYICRFL
      120       130       140       150       160       170        

       160        170       180       190           200       210  
pF1KB0 ANVASHHE-EIWSANSLAAVFGPDVFHIYTDVED----MKEQEIVSRIMAGLLENYYEFF
        .: :.   .  :...::.::::..  .   :::    :.   .:...:. .. ..  .:
CCDS36 DEVQSYSGVNKMSVQNLATVFGPNI--LRPKVEDPLTIMEGTVVVQQLMSVMISKHDCLF
      180       190       200         210       220       230      

                   220       230       240       250               
pF1KB0 ENEEE-------DFSSNDLSSITEQVNELSEEEEEDEKLEHIEELPEEGAEK------SN
        .. :         :.:.  .    ...:...:... :    ..   . .:.      .:
CCDS36 PKDAELQSKPQDGVSNNNEIQKKATMGQLQNKENNNTKDSPSRQCSWDKSESPQRSSMNN
        240       250       260       270       280       290      

     260       270       280       290              300       310  
pF1KB0 DMPEVVQLRMTENILESNSVTATSTHISPISIL---PA----STDILERTIRAAVEQHLF
         : ...   :..   .:::   ..  ::  ..   ::    :  . . .. ..  . : 
CCDS36 GSPTALSGSKTNS--PKNSVHKLDVSRSPPLMVKKNPAFNKGSGIVTNGSFSSSNAEGLE
        300         310       320       330       340       350    

            320       330       340       350       360        370 
pF1KB0 DLQSSIDHDLKNLQQQSVVCNNEAESIHCDGEGSNNQIDIADDIINASESNRDCSK-PVA
         :.. . .:.  ...:.  ..   . :   .:.  .  . .: ..   . :. :  : .
CCDS36 KTQTTPNGSLQARRSSSLKVSGTKMGTHSVQNGTVRMGILNSDTLGNPTNVRNMSWLPNG
          360       370       380       390       400       410    

              380       390       400       410       420       430
pF1KB0 STNL-DNEAMQQDCVFENEENTQSVGILLEPCSDRGDSEDGCLEREEYLLFDSDKLSHLI
        ..: ::.  .:   . ...  ..   . .  :  . ..   ..   .    : .  .. 
CCDS36 YVTLRDNKQKEQAGELGQHNRLSTYDNVHQQFSMMNLDDKQSIDSATW----STSSCEIS
          420       430       440       450       460           470

              440         450         460        470           480 
pF1KB0 LDSSSKICDLNANT--ESEVPGG--QSVGVQGEAAC-VSIPHLDLKNVSD----GDKWEE
       :  .:. :  ...:  :..  ::  ..  ..:     .: :. : .. ::    : .  .
CCDS36 LPENSNSCRSSTTTCPEQDFFGGNFEDPVLDGPPQDDLSHPR-DYESKSDHRSVGGRSSR
              480       490       500       510        520         

                490       500           510        520       530   
pF1KB0 PFPAF---KSWQEDSESGEAQL----SPQAGRMNHHPLE-EDCPPVLSHRSLDFGQSQRF
          .    ...  .: :... :    :    .:... .: :.    : .:.: .   .  
CCDS36 ATSSSDNSETFVGNSSSNHSALHSLVSSLKQEMTKQKIEYESRIKSLEQRNLTLETEMMS
     530       540       550       560       570       580         

           540       550        560         570       580       590
pF1KB0 LHDPEKLDSSSKALSFTRIR-RSSFSSKD--EKREDRTPYQLVKKLQKKIRQFEEQFERE
       :::  .::.  : ... .:. :..  .:.  :::.:         :::...::   :   
CCDS36 LHD--ELDQERKKFTMIEIKMRNAERAKEDAEKRNDM--------LQKEMEQFFSTFGEL
     590         600       610       620               630         

              600       610       620       630       640       650
pF1KB0 RNSKPSYSDIAANPKVLKWMTELTKLRKQIKDAKHKNSDGEFVPQTRPRSNTLPKSFGSS
                                                                   
CCDS36 TVEPRRTERGNTIWIQ                                            
     640       650                                                 




915 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 11:32:20 2016 done: Thu Nov  3 11:32:21 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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