Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA1114
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1114, 1431 aa
1>>>pF1KA1114 1431 - 1431 aa - 1431 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0671+/-0.00146; mu= 7.2976+/- 0.088
mean_var=271.4253+/-54.614, 0's: 0 Z-trim(108.2): 144 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.077848
statistics sampled from 9923 (10061) to 9923 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.612), E-opt: 0.2 (0.309), width: 16
Scan time: 5.840
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43959.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1431) 9241 1053.1 0
CCDS59528.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1034) 6714 769.2 0
CCDS59529.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 962) 6326 725.6 1.7e-208
CCDS43958.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 706) 4157 481.9 2.9e-135
CCDS59527.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 309) 1630 197.7 4.4e-50
CCDS14362.1 MAGED2 gene_id:10916|Hs108|chrX ( 606) 1431 175.6 3.8e-43
CCDS14337.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 778) 1331 164.5 1.1e-39
CCDS35281.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 739) 1330 164.4 1.1e-39
CCDS48116.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX ( 739) 1330 164.4 1.1e-39
CCDS14338.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 741) 1330 164.4 1.1e-39
CCDS35279.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 834) 1331 164.5 1.2e-39
CCDS56602.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 757) 824 107.5 1.5e-22
CCDS65261.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX ( 757) 824 107.5 1.5e-22
CCDS10023.1 NSMCE3 gene_id:56160|Hs108|chr15 ( 304) 680 91.0 5.8e-18
CCDS3269.1 MAGEF1 gene_id:64110|Hs108|chr3 ( 307) 678 90.8 6.8e-18
CCDS14433.1 MAGEE1 gene_id:57692|Hs108|chrX ( 957) 648 87.9 1.6e-16
CCDS73700.1 MAGEL2 gene_id:54551|Hs108|chr15 (1249) 639 87.0 3.8e-16
CCDS10014.1 NDN gene_id:4692|Hs108|chr15 ( 321) 615 83.7 9.4e-16
CCDS35221.1 MAGEB10 gene_id:139422|Hs108|chrX ( 347) 609 83.1 1.6e-15
CCDS14221.1 MAGEB4 gene_id:4115|Hs108|chrX ( 346) 608 83.0 1.7e-15
CCDS14220.1 MAGEB3 gene_id:4114|Hs108|chrX ( 346) 598 81.8 3.7e-15
CCDS59524.1 MAGEB17 gene_id:645864|Hs108|chrX ( 336) 592 81.1 5.8e-15
CCDS14216.1 MAGEB18 gene_id:286514|Hs108|chrX ( 343) 587 80.6 8.8e-15
CCDS43927.1 MAGEB16 gene_id:139604|Hs108|chrX ( 324) 584 80.2 1.1e-14
CCDS48180.1 MAGEA11 gene_id:4110|Hs108|chrX ( 429) 564 78.1 6.1e-14
CCDS14219.1 MAGEB2 gene_id:4113|Hs108|chrX ( 319) 557 77.2 8.6e-14
CCDS14692.1 MAGEA8 gene_id:4107|Hs108|chrX ( 318) 555 77.0 1e-13
CCDS14705.1 MAGEA10 gene_id:4109|Hs108|chrX ( 369) 556 77.1 1e-13
CCDS14222.1 MAGEB1 gene_id:4112|Hs108|chrX ( 347) 544 75.8 2.5e-13
CCDS35417.1 MAGEC1 gene_id:9947|Hs108|chrX (1142) 543 76.2 6.3e-13
CCDS14217.1 MAGEB6 gene_id:158809|Hs108|chrX ( 407) 531 74.4 7.7e-13
CCDS59003.1 MUC22 gene_id:100507679|Hs108|chr6 (1773) 514 73.1 8.2e-12
CCDS65233.1 MAGEB5 gene_id:347541|Hs108|chrX ( 275) 495 70.2 9.7e-12
CCDS76051.1 MAGEA1 gene_id:4100|Hs108|chrX ( 309) 495 70.2 1e-11
CCDS14702.1 MAGEA4 gene_id:4103|Hs108|chrX ( 317) 495 70.2 1.1e-11
CCDS14677.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 346) 491 69.8 1.6e-11
CCDS35423.1 MAGEA9B gene_id:728269|Hs108|chrX ( 315) 484 69.0 2.5e-11
CCDS14691.1 MAGEA9 gene_id:4108|Hs108|chrX ( 315) 484 69.0 2.5e-11
CCDS14678.1 MAGEC2 gene_id:51438|Hs108|chrX ( 373) 480 68.6 3.9e-11
>>CCDS43959.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1431 aa)
initn: 9241 init1: 9241 opt: 9241 Z-score: 5623.8 bits: 1053.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9241; 100.0% identity (100.0% similar) in 1431 aa overlap (1-1431:1-1431)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MDRRNDYGYRVPLFQGPLPPPGSLGLPFPPDIQTETTEEDSVLLMHTLLAATKDSLAMDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MDRRNDYGYRVPLFQGPLPPPGSLGLPFPPDIQTETTEEDSVLLMHTLLAATKDSLAMDP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 PVVNRPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQISQALP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PVVNRPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQISQALP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 TTEVTNTQASSVTAQPKKANKMKRVTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQLKSPLQVLKLPVISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TTEVTNTQASSVTAQPKKANKMKRVTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQLKSPLQVLKLPVISQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 NIHAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NIHAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 ETASIHTTAASIRTKKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVAIRPKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ETASIHTTAASIRTKKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVAIRPKKS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 KGKKAASRGPNSVSEISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARATESQTPNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KGKKAASRGPNSVSEISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARATESQTPNA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 DQGAQAKIASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DQGAQAKIASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 RSGSNYRRIPWGRRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RSGSNYRRIPWGRRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 YFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVIL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 PEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEAR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 AEARAQMGIGEEAVAGPWNWDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AEARAQMGIGEEAVAGPWNWDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 VNFSRGASTRAGFSDGASISFNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VNFSRGASTRAGFSDGASISFNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 LSTSSSFSSAASISFGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LSTSSSFSSAASISFGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSAT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 FSGGASSGFGGTLSTTAGFSGVLSTSTSFGSAPTTSTVFSSALSTSTGFGGILSTSVCFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FSGGASSGFGGTLSTTAGFSGVLSTSTSFGSAPTTSTVFSSALSTSTGFGGILSTSVCFG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 GSPSSSGSFGGTLSTSICFGGSPCTSTGFGGTLSTSVSFGGSSSTSANFGGTLSTSICFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GSPSSSGSFGGTLSTSICFGGSPCTSTGFGGTLSTSVSFGGSSSTSANFGGTLSTSICFD
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 GSPSTGAGFGGALNTSASFGSVLNTSTGFGGAMSTSADFGGTLSTSVCFGGSPGTSVSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GSPSTGAGFGGALNTSASFGSVLNTSTGFGGAMSTSADFGGTLSTSVCFGGSPGTSVSFG
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 SALNTNAGYGGAVSTNTDFGGTLSTSVCFGGSPSTSAGFGGALNTNASFGCAVSTSASFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SALNTNAGYGGAVSTNTDFGGTLSTSVCFGGSPSTSAGFGGALNTNASFGCAVSTSASFS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 GAVSTSACFSGAPITNPGFGGAFSTSAGFGGALSTAADFGGTPSNSIGFGAAPSTSVSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GAVSTSACFSGAPITNPGFGGAFSTSAGFGGALSTAADFGGTPSNSIGFGAAPSTSVSFG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 GAHGTSLCFGGAPSTSLCFGSASNTNLCFGGPPSTSACFSGATSPSFCDGPSTSTGFSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GAHGTSLCFGGAPSTSLCFGSASNTNLCFGGPPSTSACFSGATSPSFCDGPSTSTGFSFG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 NGLSTNAGFGGGLNTSAGFGGGLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NGLSTNAGFGGGLNTSAGFGGGLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFG
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 GGLGTSAGFSGGLGTSAGFGGGLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GGLGTSAGFSGGLGTSAGFGGGLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFG
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 SRPNASFDRGLSTIIGFGSGSNTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SRPNASFDRGLSTIIGFGSGSNTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSG
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430
pF1KA1 PSTSGFSGGPSTGAGFGGGPNTGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PSTSGFSGGPSTGAGFGGGPNTGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
1390 1400 1410 1420 1430
>>CCDS59528.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1034 aa)
initn: 6714 init1: 6714 opt: 6714 Z-score: 4091.8 bits: 769.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6714; 99.9% identity (100.0% similar) in 1020 aa overlap (412-1431:15-1034)
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 VAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDERSGSNYRRIPWGRRPAPPRDV
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MDRRNDYGYRVPLFQSKHLNGDERSGSNYRRIPWGRRPAPPRDV
10 20 30 40
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 AILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRVNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRVNL
50 60 70 80 90 100
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 KEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVLRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVLRK
110 120 130 140 150 160
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 LGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMKVL
170 180 190 200 210 220
630 640 650 660 670 680
pF1KA1 KFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEARAQMGIGEEAVAGPWNWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEARAQMGIGEEAVAGPWNWD
230 240 250 260 270 280
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 DMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTNVNFSRGASTRAGFSDGASISF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTNVNFSRGASTRAGFSDGASISF
290 300 310 320 330 340
750 760 770 780 790 800
pF1KA1 NGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGTLSTSSSFSSAASISFGCAHST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGTLSTSSSFSSAASISFGCAHST
350 360 370 380 390 400
810 820 830 840 850 860
pF1KA1 STSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSATFSGGASSGFGGTLSTTAGFSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 STSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSATFSGGASSGFGGTLSTTAGFSG
410 420 430 440 450 460
870 880 890 900 910 920
pF1KA1 VLSTSTSFGSAPTTSTVFSSALSTSTGFGGILSTSVCFGGSPSSSGSFGGTLSTSICFGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VLSTSTSFGSAPTTSTVFSSALSTSTGFGGILSTSVCFGGSPSSSGSFGGTLSTSICFGG
470 480 490 500 510 520
930 940 950 960 970 980
pF1KA1 SPCTSTGFGGTLSTSVSFGGSSSTSANFGGTLSTSICFDGSPSTGAGFGGALNTSASFGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SPCTSTGFGGTLSTSVSFGGSSSTSANFGGTLSTSICFDGSPSTGAGFGGALNTSASFGS
530 540 550 560 570 580
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA1 VLNTSTGFGGAMSTSADFGGTLSTSVCFGGSPGTSVSFGSALNTNAGYGGAVSTNTDFGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VLNTSTGFGGAMSTSADFGGTLSTSVCFGGSPGTSVSFGSALNTNAGYGGAVSTNTDFGG
590 600 610 620 630 640
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KA1 TLSTSVCFGGSPSTSAGFGGALNTNASFGCAVSTSASFSGAVSTSACFSGAPITNPGFGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TLSTSVCFGGSPSTSAGFGGALNTNASFGCAVSTSASFSGAVSTSACFSGAPITNPGFGG
650 660 670 680 690 700
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KA1 AFSTSAGFGGALSTAADFGGTPSNSIGFGAAPSTSVSFGGAHGTSLCFGGAPSTSLCFGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AFSTSAGFGGALSTAADFGGTPSNSIGFGAAPSTSVSFGGAHGTSLCFGGAPSTSLCFGS
710 720 730 740 750 760
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KA1 ASNTNLCFGGPPSTSACFSGATSPSFCDGPSTSTGFSFGNGLSTNAGFGGGLNTSAGFGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ASNTNLCFGGPPSTSACFSGATSPSFCDGPSTSTGFSFGNGLSTNAGFGGGLNTSAGFGG
770 780 790 800 810 820
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KA1 GLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFGGGLGTSAGFSGGLGTSAGFGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFGGGLGTSAGFSGGLGTSAGFGG
830 840 850 860 870 880
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KA1 GLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFGSRPNASFDRGLSTIIGFGSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFGSRPNASFDRGLSTIIGFGSGS
890 900 910 920 930 940
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KA1 NTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSGPSTSGFSGGPSTGAGFGGGPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSGPSTSGFSGGPSTGAGFGGGPN
950 960 970 980 990 1000
1410 1420 1430
pF1KA1 TGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
1010 1020 1030
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Smith-Waterman score: 6326; 100.0% identity (100.0% similar) in 962 aa overlap (470-1431:1-962)
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 DVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRV
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRV
10 20 30
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 NLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVL
40 50 60 70 80 90
560 570 580 590 600 610
pF1KA1 RKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMK
100 110 120 130 140 150
620 630 640 650 660 670
pF1KA1 VLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEARAQMGIGEEAVAGPWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEARAQMGIGEEAVAGPWN
160 170 180 190 200 210
680 690 700 710 720 730
pF1KA1 WDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTNVNFSRGASTRAGFSDGASI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 WDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTNVNFSRGASTRAGFSDGASI
220 230 240 250 260 270
740 750 760 770 780 790
pF1KA1 SFNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGTLSTSSSFSSAASISFGCAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SFNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGTLSTSSSFSSAASISFGCAH
280 290 300 310 320 330
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pF1KA1 STSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSATFSGGASSGFGGTLSTTAGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 STSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSATFSGGASSGFGGTLSTTAGF
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pF1KA1 SGVLSTSTSFGSAPTTSTVFSSALSTSTGFGGILSTSVCFGGSPSSSGSFGGTLSTSICF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SGVLSTSTSFGSAPTTSTVFSSALSTSTGFGGILSTSVCFGGSPSSSGSFGGTLSTSICF
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920 930 940 950 960 970
pF1KA1 GGSPCTSTGFGGTLSTSVSFGGSSSTSANFGGTLSTSICFDGSPSTGAGFGGALNTSASF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GGSPCTSTGFGGTLSTSVSFGGSSSTSANFGGTLSTSICFDGSPSTGAGFGGALNTSASF
460 470 480 490 500 510
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KA1 GSVLNTSTGFGGAMSTSADFGGTLSTSVCFGGSPGTSVSFGSALNTNAGYGGAVSTNTDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GSVLNTSTGFGGAMSTSADFGGTLSTSVCFGGSPGTSVSFGSALNTNAGYGGAVSTNTDF
520 530 540 550 560 570
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KA1 GGTLSTSVCFGGSPSTSAGFGGALNTNASFGCAVSTSASFSGAVSTSACFSGAPITNPGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GGTLSTSVCFGGSPSTSAGFGGALNTNASFGCAVSTSASFSGAVSTSACFSGAPITNPGF
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1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KA1 GGAFSTSAGFGGALSTAADFGGTPSNSIGFGAAPSTSVSFGGAHGTSLCFGGAPSTSLCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GGAFSTSAGFGGALSTAADFGGTPSNSIGFGAAPSTSVSFGGAHGTSLCFGGAPSTSLCF
640 650 660 670 680 690
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KA1 GSASNTNLCFGGPPSTSACFSGATSPSFCDGPSTSTGFSFGNGLSTNAGFGGGLNTSAGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GSASNTNLCFGGPPSTSACFSGATSPSFCDGPSTSTGFSFGNGLSTNAGFGGGLNTSAGF
700 710 720 730 740 750
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KA1 GGGLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFGGGLGTSAGFSGGLGTSAGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GGGLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFGGGLGTSAGFSGGLGTSAGF
760 770 780 790 800 810
1280 1290 1300 1310 1320 1330
pF1KA1 GGGLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFGSRPNASFDRGLSTIIGFGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GGGLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFGSRPNASFDRGLSTIIGFGS
820 830 840 850 860 870
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KA1 GSNTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSGPSTSGFSGGPSTGAGFGGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GSNTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSGPSTSGFSGGPSTGAGFGGG
880 890 900 910 920 930
1400 1410 1420 1430
pF1KA1 PNTGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PNTGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
940 950 960
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10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MDRRNDYGYRVPLFQGPLPPPGSLGLPFPPDIQTETTEEDSVLLMHTLLAATKDSLAMDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MDRRNDYGYRVPLFQGPLPPPGSLGLPFPPDIQTETTEEDSVLLMHTLLAATKDSLAMDP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 PVVNRPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQISQALP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PVVNRPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQISQALP
70 80 90 100 110 120
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pF1KA1 TTEVTNTQASSVTAQPKKANKMKRVTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQLKSPLQVLKLPVISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TTEVTNTQASSVTAQPKKANKMKRVTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQLKSPLQVLKLPVISQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 NIHAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NIHAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 ETASIHTTAASIRTKKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVAIRPKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ETASIHTTAASIRTKKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVAIRPKKS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 KGKKAASRGPNSVSEISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARATESQTPNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KGKKAASRGPNSVSEISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARATESQTPNA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 DQGAQAKIASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DQGAQAKIASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 RSGSNYRRIPWGRRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RSGSNYRRIPWGRRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 YFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVIL
490 500 510 520 530 540
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pF1KA1 SVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 PEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEAR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 AEARAQMGIGEEAVAGPWNWDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTN
::
CCDS43 AEIYSPCLQIPLINCSSPSHGAKVHPWNLCPHSSQGSYGQSAEGVM
670 680 690 700
>>CCDS59527.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (309 aa)
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pF1KA1 VAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDERSGSNYRRIPWGRRPAPPRDV
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MDRRNDYGYRVPLFQSKHLNGDERSGSNYRRIPWGRRPAPPRDV
10 20 30 40
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 AILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRVNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRVNL
50 60 70 80 90 100
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 KEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVLRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVLRK
110 120 130 140 150 160
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 LGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMKVL
170 180 190 200 210 220
630 640 650 660 670 680
pF1KA1 KFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEARAQMGIGEEAVAGPWNWD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEIYSPCLQIPLINCSSPSHG
230 240 250 260 270 280
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 DMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTNVNFSRGASTRAGFSDGASISF
CCDS59 AKVHPWNLCPHSSQGSYGQSAEGVM
290 300
>>CCDS14362.1 MAGED2 gene_id:10916|Hs108|chrX (606 aa)
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150 160 170 180 190 200
pF1KA1 VTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQLKSPLQVLKLPVISQNIHAPIANESASSQALITSIKPKK
: ...::...: . .:.:: .: . :
CCDS14 MSDTSESGAGLTRFQAEASEKDSSSMMQTLLTVTQNVEVP--ETPKASKALEVS-EDVK
10 20 30 40 50
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 ASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITNETASIHTTAASIRTKKASKARKTI
.:::. ....::::: . : .. .::.. :.. .. .. :: .. :. ..
CCDS14 VSKAS-----GVSKATEVSKTPEAREAPATQASSTTQLTDTQVLAAENKSLAADTKKQ--
60 70 80 90 100
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 AKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVA---IRPKKSKGKKAASRGPNSVSEISEAPL
:.: . :: ::. ..: :: . : .. . : :..: . : :
CCDS14 ----NADPQ-----AVTMPATETKKVSHVADTKVNTKAQETEAAPSQAPADEPEPESA--
110 120 130 140 150
330 340 350 360 370
pF1KA1 ATQIVTNQALAATLRVKRGSRARK--AATKARATESQTPNADQG---AQAKIASAQTNVS
:.: :: ...:.. .... . . . .::. .. : ..: .:: .:
CCDS14 AAQSQENQDTRPKVKAKKARKVKHLDGEEDGSSDQSQASGTTGGRRVSKALMASMARRAS
160 170 180 190 200 210
380 390 400 410 420 430
pF1KA1 ----ALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDERSGSNYRRIPWG
:. .. :. .. : : :::. ::: :.. .:..... :
CCDS14 RGPIAFWARRASRTRLAAWARRALLSLRSPKARRGKARRRAAKLQSSQE--------P--
220 230 240 250 260
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 RRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYT
. ::::::.:: ::: ::::::.::::::::::::::.:.:.:: . .:::::::.:.
CCDS14 -EAPPPRDVALLQGRANDLVKYLLAKDQTKIPIKRSDMLKDIIKEYTDVYPEIIERAGYS
270 280 290 300 310 320
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 LEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQE-SSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKAS
:::.: ..::::::.. ::::.:: : ..:::::::::.::::::::.::.::::::..:
CCDS14 LEKVFGIQLKEIDKNDHLYILLSTLEPTDAGILGTTKDSPKLGLLMVLLSIIFMNGNRSS
330 340 350 360 370 380
560 570 580 590 600 610
pF1KA1 EAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRS
::::::::::::::::..:::::.:.:::::::::::::.: ::::: ::::::::::::
CCDS14 EAVIWEVLRKLGLRPGIHHSLFGDVKKLITDEFVKQKYLDYARVPNSNPPEYEFFWGLRS
390 400 410 420 430 440
620 630 640 650 660 670
pF1KA1 YHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEARAQMGIG-
:.::::::::::::.:::::::.::.:::::.: ...::: :.:::.:::: ::.::::
CCDS14 YYETSKMKVLKFACKVQKKDPKEWAAQYREAMEADLKAAAEAAAEAKARAEIRARMGIGL
450 460 470 480 490 500
680 690 700 710 720
pF1KA1 -EEAVAGPWNWDDMDID--CLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTNVNFSRGA
: .::: :::. :: .: . : .:.: .. : . :. .:..::: . : .:
CCDS14 GSENAAGPCNWDEADIGPWAKARIQAGAEAKAKAQES----GSASTGASTSTNNSASASA
510 520 530 540 550 560
730 740 750 760 770
pF1KA1 STRAGFSDGASIS----------FNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISF
:: .::: :::.. ..:: .:..: ::. :...
CCDS14 STSGGFSAGASLTATLTFGLFAGLGGAGASTSGSSGACGFSYK
570 580 590 600
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 GGTLSTSSSFSSAASISFGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLST
>>CCDS14337.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX (778 aa)
initn: 1444 init1: 1322 opt: 1331 Z-score: 826.0 bits: 164.5 E(32554): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 1365; 38.8% identity (61.2% similar) in 794 aa overlap (33-751:15-775)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 RRNDYGYRVPLFQGPLPPPGSLGLPFPPDIQTETTEEDSVLLMHTLLAATKDSLAMDPPV
:.:.. :::.:::.::. : . : : ::
CCDS14 MAQKMDCGAGLLGFQAEASVEDSALLMQTLMEAIQISEA--PP-
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KA1 VNRPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIA-------TNKPKITWQALNLPV----
:..: . :.: . :.:::.: . .:: .... : .
CCDS14 --------TNQAT----AAASPQSSQPPTANEMADIQVSAAAARPKSAFKVQNATTKGPN
50 60 70 80
120 130 140 150 160
pF1KA1 -ITQISQALPTTEVTNTQAS----SVTAQPKKANKMKRVTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQL
. ..::: . .: ::: . : .: :: : . :. : . . : . .
CCDS14 GVYDFSQAHNAKDVPNTQPKAAFKSQNATPKGPNAAYDFSQAATTGELAANKSE---MAF
90 100 110 120 130 140
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 KSPLQVLKL-PVISQNIHAPI-ANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSL
:. . :. : . :. . ::. :.: .:: :: . ..:: .. :...
CCDS14 KAQNATTKVGPNATYNFSQSLNANDLANS-------RPKTPFKAWNDTTKAPTADTQTQN
150 160 170 180 190
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 AATATHTATTQGQITNETASIHTTAASIRTKK-ASKARKTIAKVI--NTDTEHIEALNVT
. : . ::.:..: .. . . .:. .:. .:.:.. ...: . :..:. :::
CCDS14 VNQA-KMATSQADIETDPGISEPDGATAQTSADGSQAQNLESRTIIRGKRTRKINNLNVE
200 210 220 230 240 250
290 300 310 320 330
pF1KA1 DAATRQIEASVVAIRPKKSKGKKAASRGPNSVSE--ISEAPLATQIVTNQALAATLRVKR
. .. . . . .: .: .....: .. . ..::: : : . . ...
CCDS14 ENSSGDQRRAPLAAGTWRSAPVPVTTQNPPGAPPNVLWQTPLAWQ---NPSGWQNQTARQ
260 270 280 290 300 310
340 350 360 370
pF1KA1 GSRARKAATKARATES--QTPNADQGA---------QAKIA----------------SAQ
::.. :: : :.: : :. : . :
CCDS14 TPPARQSPP-ARQTPPAWQNPVAWQNPVIWPNPVIWQNPVIWPNPIVWPGPVVWPNPLAW
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420
pF1KA1 TNVSALET----QVAAAVQALAD-----DYL--AQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDE-
: . .: :. . :. : :. . : : . .:
CCDS14 QNPPGWQTPPGWQTPPGWQGPPDWQGPPDWPLPPDWPLPPDWPLPTDWPLPPDWIPADWP
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:: ..:: . .: :. : . :: .: . .. : :
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pF1KA1 DVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRV
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CCDS14 NVTLLQERANKLVKYLMIKDYKKIPIKRADMLKDVIREYDEHFPEIIERATYTLEKKFGI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]