Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA0606
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0606, 1205 aa
1>>>pF1KA0606 1205 - 1205 aa - 1205 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7194+/-0.00103; mu= 7.1972+/- 0.062
mean_var=194.0295+/-40.080, 0's: 0 Z-trim(111.1): 134 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.092075
statistics sampled from 11998 (12137) to 11998 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.373), width: 16
Scan time: 4.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45881.2 PHLPP1 gene_id:23239|Hs108|chr18 (1717) 8031 1080.5 0
CCDS32479.1 PHLPP2 gene_id:23035|Hs108|chr16 (1323) 4113 559.9 1.4e-158
CCDS73910.1 PHLPP2 gene_id:23035|Hs108|chr16 (1256) 1838 257.7 1.3e-67
CCDS58095.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10 ( 536) 511 81.2 7.6e-15
CCDS646.1 LRRC40 gene_id:55631|Hs108|chr1 ( 602) 444 72.3 4e-12
CCDS7568.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10 ( 582) 421 69.3 3.2e-11
CCDS4953.2 LRRC1 gene_id:55227|Hs108|chr6 ( 524) 409 67.6 8.9e-11
>>CCDS45881.2 PHLPP1 gene_id:23239|Hs108|chr18 (1717 aa)
initn: 8031 init1: 8031 opt: 8031 Z-score: 5771.4 bits: 1080.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8031; 99.9% identity (99.9% similar) in 1205 aa overlap (1-1205:513-1717)
10 20 30
pF1KA0 MDSEIGCLIRFYAGKPHSTGSSERIQLSGM
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LEAEEKPLQIQNDYLFQLGFGELWRVQEEGMDSEIGCLIRFYAGKPHSTGSSERIQLSGM
490 500 510 520 530 540
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 YNVRKGKMQLPVNRWTRRQVILCGTCLIVSSVKDSLTGKMHVLPLIGGKVEEVKKHQHCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YNVRKGKMQLPVNRWTRRQVILCGTCLIVSSVKDSLTGKMHVLPLIGGKVEEVKKHQHCL
550 560 570 580 590 600
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 AFSSSGPQSQTYYICFDTFTEYLRWLRQVSKVASQRISSVDLSCCSLEHLPANLFYSQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AFSSSGPQSQTYYICFDTFTEYLRWLRQVSKVASQRISSVDLSCCSLEHLPANLFYSQDL
610 620 630 640 650 660
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 THLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNHLGDFPLAVCSIPTLAELNVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 THLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNHLGDFPLAVCSIPTLAELNVS
670 680 690 700 710 720
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 CNALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQLSYLGLSFNEFTDIPEVLEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CNALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQLSYLGLSFNEFTDIPEVLEKL
730 740 750 760 770 780
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 TAVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TAVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNK
790 800 810 820 830 840
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 LGDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSNELVQLDVYPVPNYLSYMDVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LGDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSNELVQLDVYPVPNYLSYMDVS
850 860 870 880 890 900
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 RNRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLERT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RNRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLERT
910 920 930 940 950 960
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 SVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLSEETNSILQELYLTNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLSEETNSILQELYLTNN
970 980 990 1000 1010 1020
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 SLTDKCVPLLTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SLTDKCVPLLTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNC
1030 1040 1050 1060 1070 1080
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 SRMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPEIKCVDLSCNELSEVTLPENLPPKLQELDLTGNPRLV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RRMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPEIKCVDLSCNELSEVTLPENLPPKLQELDLTGNPRLV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 LDHKTLELLNNIRCFKIDQPSTGDASGAPAVWSHGYTEASGVKNKLCVAALSVNNFCDNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LDHKTLELLNNIRCFKIDQPSTGDASGAPAVWSHGYTEASGVKNKLCVAALSVNNFCDNR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 EALYGVFDGDRNVEVPYLLQCTMSDILAEELQKTKNEEEYMVNTFIVMQRKLGTAGQKLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EALYGVFDGDRNVEVPYLLQCTMSDILAEELQKTKNEEEYMVNTFIVMQRKLGTAGQKLG
1210 1220 1230 1240 1250 1260
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 GAAVLCHIKHDPVDPGGSFTLTSANVGKCQTVLCRNGKPLPLSRSYIMSCEEELKRIKQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GAAVLCHIKHDPVDPGGSFTLTSANVGKCQTVLCRNGKPLPLSRSYIMSCEEELKRIKQH
1270 1280 1290 1300 1310 1320
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 KAIITEDGKVNGVTESTRILGYTFLHPSVVPRPHVQSVLLTPQDEFFILGSKGLWDSLSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KAIITEDGKVNGVTESTRILGYTFLHPSVVPRPHVQSVLLTPQDEFFILGSKGLWDSLSV
1330 1340 1350 1360 1370 1380
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 EEAVEAVRNVPDALAAAKKLCTLAQSYGCHDSISAVVVQLSVTEDSFCCCELSAGGAVPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EEAVEAVRNVPDALAAAKKLCTLAQSYGCHDSISAVVVQLSVTEDSFCCCELSAGGAVPP
1390 1400 1410 1420 1430 1440
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 PSPGIFPPSVNMVIKDRPSDGLGVPSSSSGMASEISSELSTSEMSSEVGSTASDEPPPGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PSPGIFPPSVNMVIKDRPSDGLGVPSSSSGMASEISSELSTSEMSSEVGSTASDEPPPGA
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 LSENSPAYPSEQRCMLHPICLSNSFQRQLSSATFSSAFSDNGLDSDDEEPIEGVFTNGSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LSENSPAYPSEQRCMLHPICLSNSFQRQLSSATFSSAFSDNGLDSDDEEPIEGVFTNGSR
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 VEVEVDIHCSRAKEKEKQQHLLQVPAEASDEGIVISANEDEPGLPRKADFSAVGTIGRRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VEVEVDIHCSRAKEKEKQQHLLQVPAEASDEGIVISANEDEPGLPRKADFSAVGTIGRRR
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA0 ANGSVAPQERSHNVIEVATDAPLRKPGGYFAAPAQPDPDDQFIIPPELEEEVKEIMKHHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ANGSVAPQERSHNVIEVATDAPLRKPGGYFAAPAQPDPDDQFIIPPELEEEVKEIMKHHQ
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1180 1190 1200
pF1KA0 EQQQQQQPPPPPQLQPQLPRHYQLDQLPDYYDTPL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EQQQQQQPPPPPQLQPQLPRHYQLDQLPDYYDTPL
1690 1700 1710
>>CCDS32479.1 PHLPP2 gene_id:23035|Hs108|chr16 (1323 aa)
initn: 3627 init1: 1880 opt: 4113 Z-score: 2960.3 bits: 559.9 E(32554): 1.4e-158
Smith-Waterman score: 4343; 54.8% identity (80.1% similar) in 1207 aa overlap (2-1186:128-1315)
10 20 30
pF1KA0 MDSEIGCLIRFYAGKPHSTGSSERIQLSGMY
. ..::.::::. :: .:: :::.:
CCDS32 EPTERPLQIVYDYLSRLGFDDPVRIQEEATNPDLGCMIRFYGEKPCHMDRLDRILLSGIY
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 NVRKGKMQLPVNRWTRRQVILCGTCLIVSSVKDSLTGKMHVLPLIGGKVEEVKKHQHCLA
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CCDS32 NVRKGKTQL--HKWAERLVVLCGTCLIVSSVKDCQTGKMHILPLVGGKIEEVKRRQYSLA
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 FSSSGPQSQTYYICFDTFTEYLRWLRQVSKVASQRISSVDLSCCSLEHLPANLFYSQDLT
:::.: :.:::.. :.:..:: :: ::.:::.:::::.::::: :::..: .::::::.:
CCDS32 FSSAGAQAQTYHVSFETLAEYQRWQRQASKVVSQRISTVDLSCYSLEEVPEHLFYSQDIT
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 HLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNHLGDFPLAVCSIPTLAELNVSC
.:::..::.. : ::. : .:..::.::::.:.:: ::. .: : ::.:::.::
CCDS32 YLNLRHNFMQ----LERPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTLTELNLSC
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 NALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQLSYLGLSFNEFTDIPEVLEKLT
:.....:. .: . ::::. :::::: .:: :: :..::: ::.:::.:..:::: ::::
CCDS32 NGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIPEVYEKLT
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 AVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNKL
.:.. :.:::.:.: : .: .: ::::::::.: .. .. .... .:.:..:::::.:
CCDS32 MLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHVDLRDNRL
400 410 420 430 440 450
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 GDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSNELVQLDVYPVPNYLSYMDVSR
::: . ..: ::: :::: : . :. :..::::::.:. ..:::::. :...:.::
CCDS32 TDLDLSSLCSLEQLHCGRNQLRELTLSGFSLRTLYASSNRLTAVNVYPVPSLLTFLDLSR
460 470 480 490 500 510
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 NRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLERTS
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CCDS32 NLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLGHNHVQNLPTLVEHIP
520 530 540 550 560 570
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 VEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLSEETNSILQELYLTNNS
.::::.::: : .:: .:. :: .::.::::::.::::: : .::. :.:: ::::::
CCDS32 LEVLDLQHNALTRLPDTLFSKALNLRYLNASANSLESLPSACTGEESLSMLQLLYLTNNL
580 590 600 610 620 630
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 LTDKCVPLLTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNCS
:::.:.:.:.:: ::.:::.: :.::.:::::. :::.:::..:::::::.::::: ::.
CCDS32 LTDQCIPVLVGHLHLRILHLANNQLQTFPASKLNKLEQLEELNLSGNKLKTIPTTIANCK
640 650 660 670 680 690
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 RMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPEIKCVDLSCNELSEVTLPENLPPKLQELDLTGNPRLVL
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CCDS32 RLHTLVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDLTEILIPEALPATLQDLDLTGNTNLVL
700 710 720 730 740 750
640 650 660 670 680
pF1KA0 DHKTLELLNNIRCFKIDQ---PSTGDASGAPAVWSHGYTEASGVKNKLCVAALSVNNFCD
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CCDS32 EHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTT-DSTVTSTFWSHGLAEMAGQRNKLCVSALAMDSFAE
760 770 780 790 800 810
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 NREALYGVFDGDRNVEVPYLLQCTMSDILAEELQKTKNEEEYMVNTFIVMQRKLGTAGQK
. :.::.:::::: :.: ::::::.:.: ::.:.. :. .:.:::.: .:::: ::::
CCDS32 GVGAVYGMFDGDRNEELPRLLQCTMADVLLEEVQQSTNDTVFMANTFLVSHRKLGMAGQK
820 830 840 850 860 870
750 760 770 780 790 800
pF1KA0 LGGAAVLCHIKHDPVDPGGSFTLTSANVGKCQTVLCRNGKPLPLSRSYIMSCE-EELKRI
::..:.::.:. : .::..::.:: :::: ::.::::.:::.:::. . . . :: .:.
CCDS32 LGSSALLCYIRPDTADPASSFSLTVANVGTCQAVLCRGGKPVPLSKVFSLEQDPEEAQRV
880 890 900 910 920 930
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 KQHKAIITEDGKVNGVTESTRILGYTFLHPSVVPRPHVQSVLLTPQDEFFILGSKGLWDS
:..:::::::.:::::: ::.:: :.:.: ..:.::..:. :: :::..:::.:.::.
CCDS32 KDQKAIITEDNKVNGVTCCTRMLGCTYLYPWILPKPHISSTPLTIQDELLILGNKALWEH
940 950 960 970 980 990
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 LSVEEAVEAVRNVPDALAAAKKLCTLAQSYGCHDSISAVVVQLSVTEDSFCCCELSAGGA
:: :::.:::.: : ::::::::::::::::.:...:.:: :.. :.. : ::.. : .
CCDS32 LSYTEAVNAVRHVQDPLAAAKKLCTLAQSYGCQDNVGAMVVYLNIGEEG-CTCEMN-GLT
1000 1010 1020 1030 1040
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 VPPPSPGIFPPSVNMVIKDRPSDGLGVPSSSSGMASEISSELSTSEMSSEVGSTASDEPP
.: : :. . . .::: :. . .::::::.:::.:::.::::.:::::::::::
CCDS32 LPGPV-GF---ASTTTIKDAPKPA--TPSSSSGIASEFSSEMSTSEVSSEVGSTASDEHN
1050 1060 1070 1080 1090 1100
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 PGALSENSPAYPSEQRCMLHPICLSNSFQRQLSSATFSSAFSDNGLDSDDEEPIEGVFTN
:.:. : :.:: ::: :. :::: ::::::: :::::::::..:.:::.::
CCDS32 AGGLDTALLPRP-ERRCSLHPTPTSGLFQRQPSSATFSSNQSDNGLDSDDDQPVEGVITN
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1050 1060 1070 1080
pF1KA0 GSRVEVEVDIHCSRAKEKEKQQHLLQV-PAEASDE-----------------GIVISANE
::.::::::::: :... :.. :.. :. :.: :... ..
CCDS32 GSKVEVEVDIHCCRGRDLENSPPLIESSPTLCSEEHARGSCFGIRRQNSVNSGMLLPMSK
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 DEPGLPRKADFSAVGTIGRRRANGSVAPQERSHNVIEVATDAPLRKPGGYFAAPAQPDPD
:. : .. . : . :.. .:::..: : : :.:::::..: :: : :::::.: .:.
CCDS32 DRMELQKSPSTSCL--YGKKLSNGSIVPLEDSLNLIEVATEVPKRKTG-YFAAPTQMEPE
1230 1240 1250 1260 1270
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 DQFIIPPELEEEVKEIMKHHQEQQQQQQPPPPPQLQPQLPRHYQLDQLPDYYDTPL
:::..: .::::::: ::.::... . .: . .:
CCDS32 DQFVVPHDLEEEVKEQMKQHQDSRLEPEPHEEDRTEPPEEFDTAL
1280 1290 1300 1310 1320
>>CCDS73910.1 PHLPP2 gene_id:23035|Hs108|chr16 (1256 aa)
initn: 2843 init1: 1096 opt: 1838 Z-score: 1327.4 bits: 257.7 E(32554): 1.3e-67
Smith-Waterman score: 3900; 51.2% identity (75.3% similar) in 1207 aa overlap (2-1186:128-1248)
10 20 30
pF1KA0 MDSEIGCLIRFYAGKPHSTGSSERIQLSGMY
. ..::.::::. :: .:: :::.:
CCDS73 EPTERPLQIVYDYLSRLGFDDPVRIQEEATNPDLGCMIRFYGEKPCHMDRLDRILLSGIY
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 NVRKGKMQLPVNRWTRRQVILCGTCLIVSSVKDSLTGKMHVLPLIGGKVEEVKKHQHCLA
:::::: :: ..:..: :.::::::::::::: :::::.:::.:::.::::..:. ::
CCDS73 NVRKGKTQL--HKWAERLVVLCGTCLIVSSVKDCQTGKMHILPLVGGKIEEVKRRQYSLA
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 FSSSGPQSQTYYICFDTFTEYLRWLRQVSKVASQRISSVDLSCCSLEHLPANLFYSQDLT
:::.: :.:::.. :.:..:: :: ::.:::.:::::.::::: :::..: .::::::.:
CCDS73 FSSAGAQAQTYHVSFETLAEYQRWQRQASKVVSQRISTVDLSCYSLEEVPEHLFYSQDIT
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 HLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNHLGDFPLAVCSIPTLAELNVSC
.:::..::.. : ::. : .:..::.::::.:.:: ::. .: : ::.:::.::
CCDS73 YLNLRHNFMQ----LERPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTLTELNLSC
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 NALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQLSYLGLSFNEFTDIPEVLEKLT
:.....:. .: . ::::. :::::: .:: :: :..::: ::.:::.:..:::: ::::
CCDS73 NGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIPEVYEKLT
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 AVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNKL
.:.. :.:::.:.: : .: .: ::::::::.: .. .. .... .:.:..:::::.:
CCDS73 MLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHVDLRDNRL
400 410 420 430 440 450
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 GDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSNELVQLDVYPVPNYLSYMDVSR
::: . ..: ::: :::: : . :. :..::::::.:. ..:::::. :...:.::
CCDS73 TDLDLSSLCSLEQLHCGRNQLRELTLSGFSLRTLYASSNRLTAVNVYPVPSLLTFLDLSR
460 470 480 490 500 510
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 NRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLERTS
: :: ::.:.::..:.::::...: . :.:.:.. . :::::. :::.. :: .:.
CCDS73 NLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLGHNHVQNLPTLVEHIP
520 530 540 550 560 570
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 VEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLSEETNSILQELYLTNNS
.::::.::: : .:: .:. :: ::
CCDS73 LEVLDLQHNALTRLPDTLFSKA-----LN-------------------------------
580 590
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 LTDKCVPLLTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNCS
:. :::.:::..:::::::.::::: ::.
CCDS73 -------------------------------KLNKLEQLEELNLSGNKLKTIPTTIANCK
600 610 620
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 RMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPEIKCVDLSCNELSEVTLPENLPPKLQELDLTGNPRLVL
:.::..:::: : .:::..:::.:. ::::::.:.:. .:: :: ::.:::::: :::
CCDS73 RLHTLVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDLTEILIPEALPATLQDLDLTGNTNLVL
630 640 650 660 670 680
640 650 660 670 680
pF1KA0 DHKTLELLNNIRCFKIDQ---PSTGDASGAPAVWSHGYTEASGVKNKLCVAALSVNNFCD
.::::.....: .:::: :.: :.. . . :::: .: .: .:::::.::....: .
CCDS73 EHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTT-DSTVTSTFWSHGLAEMAGQRNKLCVSALAMDSFAE
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690 700 710 720 730 740
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. :.::.:::::: :.: ::::::.:.: ::.:.. :. .:.:::.: .:::: ::::
CCDS73 GVGAVYGMFDGDRNEELPRLLQCTMADVLLEEVQQSTNDTVFMANTFLVSHRKLGMAGQK
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750 760 770 780 790 800
pF1KA0 LGGAAVLCHIKHDPVDPGGSFTLTSANVGKCQTVLCRNGKPLPLSRSYIMSCE-EELKRI
::..:.::.:. : .::..::.:: :::: ::.::::.:::.:::. . . . :: .:.
CCDS73 LGSSALLCYIRPDTADPASSFSLTVANVGTCQAVLCRGGKPVPLSKVFSLEQDPEEAQRV
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810 820 830 840 850 860
pF1KA0 KQHKAIITEDGKVNGVTESTRILGYTFLHPSVVPRPHVQSVLLTPQDEFFILGSKGLWDS
:..:::::::.:::::: ::.:: :.:.: ..:.::..:. :: :::..:::.:.::.
CCDS73 KDQKAIITEDNKVNGVTCCTRMLGCTYLYPWILPKPHISSTPLTIQDELLILGNKALWEH
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870 880 890 900 910 920
pF1KA0 LSVEEAVEAVRNVPDALAAAKKLCTLAQSYGCHDSISAVVVQLSVTEDSFCCCELSAGGA
:: :::.:::.: : ::::::::::::::::.:...:.:: :.. :.. : ::.. : .
CCDS73 LSYTEAVNAVRHVQDPLAAAKKLCTLAQSYGCQDNVGAMVVYLNIGEEG-CTCEMN-GLT
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930 940 950 960 970 980
pF1KA0 VPPPSPGIFPPSVNMVIKDRPSDGLGVPSSSSGMASEISSELSTSEMSSEVGSTASDEPP
.: : :. . . .::: :. . .::::::.:::.:::.::::.:::::::::::
CCDS73 LPGPV-GF---ASTTTIKDAPKPA--TPSSSSGIASEFSSEMSTSEVSSEVGSTASDEHN
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990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 PGALSENSPAYPSEQRCMLHPICLSNSFQRQLSSATFSSAFSDNGLDSDDEEPIEGVFTN
:.:. : :.:: ::: :. :::: ::::::: :::::::::..:.:::.::
CCDS73 AGGLDTALLPRP-ERRCSLHPTPTSGLFQRQPSSATFSSNQSDNGLDSDDDQPVEGVITN
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1050 1060 1070 1080
pF1KA0 GSRVEVEVDIHCSRAKEKEKQQHLLQV-PAEASDE-----------------GIVISANE
::.::::::::: :... :.. :.. :. :.: :... ..
CCDS73 GSKVEVEVDIHCCRGRDLENSPPLIESSPTLCSEEHARGSCFGIRRQNSVNSGMLLPMSK
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pF1KA0 DEPGLPRKADFSAVGTIGRRRANGSVAPQERSHNVIEVATDAPLRKPGGYFAAPAQPDPD
:. : .. . : . :.. .:::..: : : :.:::::..: :: : :::::.: .:.
CCDS73 DRMELQKSPSTSCL--YGKKLSNGSIVPLEDSLNLIEVATEVPKRKTG-YFAAPTQMEPE
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 DQFIIPPELEEEVKEIMKHHQEQQQQQQPPPPPQLQPQLPRHYQLDQLPDYYDTPL
:::..: .::::::: ::.::... . .: . .:
CCDS73 DQFVVPHDLEEEVKEQMKQHQDSRLEPEPHEEDRTEPPEEFDTAL
1220 1230 1240 1250
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pF1KA0 LGDFPLAVCSIPTLAELNVSCNALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQL
. .: .. . :.:: . : :.:.:: :: . ::.:. :. : : ::: :.:.:.:
CCDS58 IHILPSSIKELTQLTELYLYSNKLQSLPAEVGCLVNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKL
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pF1KA0 SYLGLSFNEFTDIPEVLEKLTAVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKL
.: : :.. .:: :. .: .. : . : . :.. . .... ... ...: : :..:
CCDS58 RMLDLRHNKLREIPSVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVE-KDIKNLSKLSMLSIRENKIKQL
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pF1KA0 IADEVDFLQHVTQLDLRDNKLGDLDAMI--FNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYA-
: :. :. ...: :: :.:. . . . .: :. : :.. :: .:..:
CCDS58 PA-EIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIPRSLAKCSALEELNLENNNISTLPES--LLSSLVKL
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pF1KA0 SSNELVQ--LDVYPV--PNYLSY---MDVSRNRLENVPEWVCESRK-LEVLDIGHNQICE
.: :.. ...::: :. .: ... .::....: . : : :.. ::.
CCDS58 NSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTS
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pF1KA0 LPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLER-TSVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRF
:: . .:. .: . :::...:: . .:.::: . :.::. :. : . .::
CCDS58 LPLDFGTWTSMVELNLATNQLTKIPEDVSGLVSLEVL-ILSNNLLKKLPHGLGNLRKLRE
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:. ::::::: : :.. ::.: ::::.:: .: :: .: : .. :
CCDS58 LDLEENKLESLPNEIAYLKD-----LQKLVLTNNQLT--TLPRGIGHLTNLTHLGLGENL
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pF1KA0 LQSFPASKMAKLEELEEIDLSGN-KLKAIPTTIMNCSRMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPE
: .: ... ::.:::. :. : .:...: . ::.. .... ::
CCDS58 LTHLPE-EIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPFELALCSKL-SIMSIENCPLSHLPPQIVAG
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pF1KA0 IKCVDLSCNELSEVTLPENLPPKLQELDLTGNPRLVLDHKTLELLNNIRCFKIDQPSTGD
CCDS58 GPSFIIQFLKMQGPYRAMV
520 530
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CCDS64 NLKCLYLQHNELTCISEGFEQL---SNLEDLDLSNNHLTTVPASFSSLSSLVRLNLSSNE
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:.:.:: .. :. :. . ..:.:...: :: .:..: : : :.. .:: . . . .
CCDS64 LKSLPAEINRMKRLKHLDCNSNLLETIPPELAGMESLELLYLRRNKLRFLPE-FPSCSLL
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pF1KA0 DKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNKLGD
.: .. : .: :. . :... : .::: : . : . ::. .:. . .::: .: ...
CCDS64 KELHVGENQIEMLEAEHLKHLNSILVLDLRDNKL-KSVPDEIILLRSLERLDLSNNDISS
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pF1KA0 LDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSNELVQLDVYPVPNYL--SYMDVSR
: . : :: : : . : :... :... . : .:: . : .
CCDS64 LPYSLGN----LH-----LKFLALEGNPLRTI---RREIISKGTQEVLKYLRSKIKDDGP
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.. :.. : . ::: :..:: . .: .: ..: .:.. . ..
CCDS64 SQSESATETAMTLPSESRVNIHAIITLKILDYSDKQATLIPDEVFDAVKSNIVTSINFSK
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::: ..:.:. . : .:.. :.: . .: . ..: ::. : :.:::
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:: .:. :: . :. : . : .: .: :. . .. :.. : .:: .:.:
CCDS64 EEMESLVRLQTINLSFNRF--KMLPEVLYRIFTLETILISNNQVGSVDPQKMKMMENLTT
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.::..: : :: . :: ..:.. .: ..:
CCDS64 LDLQNNDLLQIPPELGNCVNLRTLLLDGNPFRVPRAAILMKGTAAILEYLRDRIPT
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pF1KA0 NLPPKLQELDLTGNPRLVLDHKTLELLNNIRCFKIDQPSTGDASGAPAVWSHGYTEASGV
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CCDS75 GKKDSSAAQPGVAFSVDNTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMR-LDLSKRS
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CCDS75 IHILPSSIKELTQLTELYLYSNKLQSLPAEVGCLVNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKL
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CCDS75 RMLDLRHNKLREIPSVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVE-KDIKNLSKLSMLSIRENKIKQL
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: :. : .. ::. :.: : :. .: .:...::. . :
CCDS75 PA-EIGELCNLITLDVAHNQLEHLPK------EIGNC--TQITNLDL----------QHN
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::..: :. . :: . . ::: .:. . . :: :.. .:.: :: :. .
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.: .: ..: :: . . ... :...::.. ..: ... .: : :: . :.:
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CCDS75 TSLP---LDFGTWTSMVELNLATNQLTK--IPEDVSGLVSLEVLILSNNLLKKLPHG-LG
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pF1KA0 KLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNCSRMHTVIAHSNCIEVFPE-VMQLPEIKCVDLSCNE
.:..:.:.:: :::...:. : . .. .. .: . ..:. . .: .. . :. :
CCDS75 NLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENL
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CCDS75 LTH--LPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPFELALCSKLSIMSIENCPLSHLPPQIVAG
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CCDS49 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEE
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: : : ::. : ... ...::..:.::.:.. .: . .. :.::.:: :
CCDS49 LLLDANQLRELP--------EQFFQLVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRN
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. .: ... . ::. ..:: : :: . ....:. :... . ..:: . .:
CCDS49 EIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRLPESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYN
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pF1KA0 VDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNKLG
. .: . : . : ..: .. .....:: : : .: . . : :. .: : :.:.
CCDS49 LASLELRENLLTYLP-DSLTQLRRLEELDLGNNEIYNL-PESIGALLHLKDLWLDGNQLS
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pF1KA0 DLDAMIFN--NIEVLHCERNQLVTL--DICGYF-LKALYASSNELVQL-DVYPVPNYLSY
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CCDS49 ELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEISGLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSI
220 230 240 250 260 270
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. :..::: ..:: : : ..: : . .::. :: . ..: .: : .:.:. ::..
CCDS49 LKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQLLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKE
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pF1KA0 LERT-SVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLSEETNSILQEL
. :. :. :. :.: ..: .. .: :. :....:.: :: :: : :. :
CCDS49 IGGCCSLTVFCVRDNRLTRIPAEV-SQATELHVLDVAGNRLLHLP---LSL-TALKLKAL
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pF1KA0 YLTNNSLTDKCVPLLTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEEIDLSGNKLKAIPT
.:..: . ::::
CCDS49 WLSDN----QSQPLLTFQTDTDYTTGEKILTCVLLPQLPSEPTCQENLPRCGALENLVND
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1205 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 09:53:15 2016 done: Thu Nov 3 09:53:16 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]