Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA0599
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0599, 1340 aa
1>>>pF1KA0599 1340 - 1340 aa - 1340 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5082+/-0.000952; mu= 4.5999+/- 0.058
mean_var=227.9600+/-45.594, 0's: 0 Z-trim(113.8): 98 B-trim: 163 in 1/52
Lambda= 0.084946
statistics sampled from 14271 (14369) to 14271 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.747), E-opt: 0.2 (0.441), width: 16
Scan time: 5.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS76690.1 PLEKHG3 gene_id:26030|Hs108|chr14 (1219) 5004 627.1 9.2e-179
CCDS34552.1 PLEKHG1 gene_id:57480|Hs108|chr6 (1385) 1537 202.2 8.1e-51
CCDS33022.2 PLEKHG2 gene_id:64857|Hs108|chr19 (1386) 1128 152.1 1e-35
CCDS42754.1 ARHGEF4 gene_id:50649|Hs108|chr2 ( 670) 487 73.3 2.5e-12
CCDS2165.1 ARHGEF4 gene_id:50649|Hs108|chr2 ( 690) 487 73.3 2.5e-12
CCDS55430.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX ( 463) 445 68.1 6.5e-11
CCDS83477.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX ( 495) 441 67.6 9.6e-11
CCDS35315.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX ( 516) 441 67.6 1e-10
>>CCDS76690.1 PLEKHG3 gene_id:26030|Hs108|chr14 (1219 aa)
initn: 5004 init1: 5004 opt: 5004 Z-score: 3322.9 bits: 627.1 E(32554): 9.2e-179
Smith-Waterman score: 7853; 90.9% identity (90.9% similar) in 1340 aa overlap (1-1340:1-1219)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MPVSTSLHQDGSQERPVSLTSTTSSSGSSCDSRSAMEEPSSSEAPAKNGAGSLRSRHLPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MPVSTSLHQDGSQERPVSLTSTTSSSGSSCDSRSAMEEPSSSEAPAKNGAGSLRSRHLPN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 SNNNSSSWLNVKGPLSPFNSRAAAGPAHHKLSYLGRVVREIVETERMYVQDLRSIVEDYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SNNNSSSWLNVKGPLSPFNSRAAAGPAHHKLSYLGRVVREIVETERMYVQDLRSIVEDYL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LKIIDTPGLLKPEQVSALFGNIENIYALNSQLLRDLDSCNSDPVAVASCFVERSQEFDIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LKIIDTPGLLKPEQVSALFGNIENIYALNSQLLRDLDSCNSDPVAVASCFVERSQEFDIY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 TQYCNNYPNSVAALTECMRDKQQAKFFRDRQELLQHSLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 TQYCNNYPNSVAALTECMRDKQQAKFFRDRQELLQHSLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLQE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 IAKHFDEEEDGFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKRRHEHAVRLQEIQSLLINWKGPDLTTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 IAKHFDEEEDGFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKRRHEHAVRLQEIQSLLINWKGPDLTTY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 GELVLEGTFRVHRVRNERTFFLFDKTLLITKKRGDHFVYKGNIPCSSLMLIESTRDSLCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GELVLEGTFRVHRVRNERTFFLFDKTLLITKKRGDHFVYKGNIPCSSLMLIESTRDSLCF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 TVTHYKHSKQQYSIQAKTVEEKRNWTHHIKRLILENHHATIPQKAKEAILEMDSYYPNRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 TVTHYKHSKQQYSIQAKTVEEKRNWTHHIKRLILENHHATIPQKAKEAILEMDSYYPNRY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 RCSPERLKKAWSSQDEVSTNVRQGRRQSEPTKHLLRQLNEKARAAGMKHAGSAGTLLDFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RCSPERLKKAWSSQDEVSTNVRQGRRQSEPTKHLLRQLNEKARAAGMK------------
430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 QPSRTRGLQPEAEGATQEEEEEEEEVVEEEEEEEEEEQAFQVSLEDLTGHEGNEKGAGPE
CCDS76 ------------------------------------------------------------
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 PPGSEEEEEEQEESLAVAEQVADFASSLLAALHCWHYRANALLFSRGAMGKGRRESESSR
:::::::::::
CCDS76 -------------------------------------------------GKGRRESESSR
470
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 SSRRPSGRSPTSTEKRMSFESISSLPEVEPDPEAGSEQEVFSAVEGPSAEETPSDTESPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SSRRPSGRSPTSTEKRMSFESISSLPEVEPDPEAGSEQEVFSAVEGPSAEETPSDTESPE
480 490 500 510 520 530
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 VLETQLDAHQGLLGMDPPGDMVDFVAAESTEDLKALSSEEEEEMGGAAQEPESLLPPSVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VLETQLDAHQGLLGMDPPGDMVDFVAAESTEDLKALSSEEEEEMGGAAQEPESLLPPSVL
540 550 560 570 580 590
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 DQASVIAERFVSSFSRRSSVAQEDSKSSGFGSPRLVSRSSSVLSLEGSEKGLARHGSATD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DQASVIAERFVSSFSRRSSVAQEDSKSSGFGSPRLVSRSSSVLSLEGSEKGLARHGSATD
600 610 620 630 640 650
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 SLSCQLSPEVDISVGVATEDSPSVNGMEPPSPGCPVEPDRSSCKKKESALSTRDRLLLDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SLSCQLSPEVDISVGVATEDSPSVNGMEPPSPGCPVEPDRSSCKKKESALSTRDRLLLDK
660 670 680 690 700 710
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 IKSYYENAEHHDAGFSVRRRESLSYIPKGLVRNSISRFNSLPRPDPEPVPPVGSKRQVGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 IKSYYENAEHHDAGFSVRRRESLSYIPKGLVRNSISRFNSLPRPDPEPVPPVGSKRQVGS
720 730 740 750 760 770
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 RPTSWALFELPGPSQAVKGDPPPISDAEFRPSSEIVKIWEGMESSGGSPGKGPGQGQANG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RPTSWALFELPGPSQAVKGDPPPISDAEFRPSSEIVKIWEGMESSGGSPGKGPGQGQANG
780 790 800 810 820 830
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 FDLHEPLFILEEHELGAITEESATASPESSSPTEGRSPAHLARELKELVKELSSSTQGEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 FDLHEPLFILEEHELGAITEESATASPESSSPTEGRSPAHLARELKELVKELSSSTQGEL
840 850 860 870 880 890
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 VAPLHPRIVQLSHVMDSHVSERVKNKVYQLARQYSLRIKSNKPVMARPPLQWEKVAPERD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VAPLHPRIVQLSHVMDSHVSERVKNKVYQLARQYSLRIKSNKPVMARPPLQWEKVAPERD
900 910 920 930 940 950
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 GKSPTVPCLQEEAGEPLGGKGKRKPVLSLFDYEQLMAQEHSPPKPSSAGEMSPQRFFFNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GKSPTVPCLQEEAGEPLGGKGKRKPVLSLFDYEQLMAQEHSPPKPSSAGEMSPQRFFFNP
960 970 980 990 1000 1010
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 SAVSQRTTSPGGRPSAWSPLSPTETFSWPDVRELCSKYASRDEARRAGGGRPRGPPVNRS
:::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SAVSQRTTSPGGRPSARSPLSPTETFSWPDVRELCSKYASRDEARRAGGGRPRGPPVNRS
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 HSVPENMVEPPLSGRVGRCRSLSTKRGRGGGEAAQSPGPLPQSKPDGGETLYVTADLTLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 HSVPENMVEPPLSGRVGRCRSLSTKRGRGGGEAAQSPGPLPQSKPDGGETLYVTADLTLE
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 DNRRVIVMEKGPLPSPTAGLEESSGQGPSSPVALLGQVQDFQQSAECQPKEEGSRDPADP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DNRRVIVMEKGPLPSPTAGLEESSGQGPSSPVALLGQVQDFQQSAECQPKEEGSRDPADP
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1330 1340
pF1KA0 SQQGRVRNLREKFQALNSVG
::::::::::::::::::::
CCDS76 SQQGRVRNLREKFQALNSVG
1200 1210
>>CCDS34552.1 PLEKHG1 gene_id:57480|Hs108|chr6 (1385 aa)
initn: 1816 init1: 1114 opt: 1537 Z-score: 1025.8 bits: 202.2 E(32554): 8.1e-51
Smith-Waterman score: 1633; 32.2% identity (57.9% similar) in 1342 aa overlap (14-1278:7-1262)
10 20 30 40
pF1KA0 MPVSTSLHQDGSQERPVSLTSTTSSSGSSCDSR----SAMEEPSSSEA------------
.::::. :: :::.:: ::. : : :.:.
CCDS34 MELSDSDRPVSFGST-SSSASSRDSHGSFGSRMTLVSNSHMGLFNQDKEVGAI
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
pF1KA0 -----PAKNGAGSLRSRHLPNSNNNSSSWLNVKGPLSPFNSRAAAGP-------AHHKLS
::. ..: .: : ....... . . : . . . ..: . ::
CCDS34 KLELIPARPFSSSELQRDNPATGQQNADEGSERPPRAQWRVDSNGAPKTIADSATSPKLL
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 YLGRVVREIVETERMYVQDLRSIVEDYLLKIIDTPGL-LKPEQVSALFGNIENIYALNSQ
:. :::.::.:::: :::::.::::::: : : : : :. :::::::..:: .::.
CCDS34 YVDRVVQEILETERTYVQDLKSIVEDYLDCIRDQTKLPLGTEERSALFGNIQDIYHFNSE
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 LLRDLDSCNSDPVAVASCFVERSQEFDIYTQYCNNYPNSVAALTECMRDKQQAKFFRDRQ
::.::..:..::::.: ::: .:.:: ::::::.::: :::.::::::.: :::::.::
CCDS34 LLQDLENCENDPVAIAECFVSKSEEFHIYTQYCTNYPRSVAVLTECMRNKILAKFFRERQ
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 ELLQHSLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLQEIAKHFDEEEDGFEVVEDAIDTMTCVAWYIND
: :.:::::::::::::::::::::::.:: .:.:.. .:..:: :::::: :::.:::
CCDS34 ETLKHSLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLHEIENHLDKDTEGYDVVLDAIDTMQRVAWHIND
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 MKRRHEHAVRLQEIQSLLINWKGPDLTTYGELVLEGTFRVHRVRNERTFFLFDKTLLITK
:::.:::::::::::::: ::::::::.:::::::::::..:..::::.::::: :::::
CCDS34 MKRKHEHAVRLQEIQSLLTNWKGPDLTSYGELVLEGTFRIQRAKNERTLFLFDKLLLITK
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 KRGDHFVYKGNIPCSSLMLIEST-RDSLCFTVTHYKHSKQQYSIQAKTVEEKRNWTHHIK
:: : :.::..: :..:::.: .. : :.: :::. : :...:::. ..:: :. :.:
CCDS34 KRDDTFTYKAHILCGNLMLVEVIPKEPLSFSVFHYKNPKLQHTVQAKSQQDKRLWVLHLK
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 RLILENHHATIPQKAKEAILEMDSYYPNRYRCSPERLKKAWSSQDEVSTNVRQGRRQSEP
::::::: : :: :::.::::::. . . ::: :: .. : :. : ::.:::
CCDS34 RLILENHAAKIPAKAKQAILEMDAIHHPGFCYSPEGGTKALFGSKEGSAPYRL-RRKSEP
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490
pF1KA0 TKHLLRQLNEKARAAGMKHAGSA-GT-LLDFGQPSRT-RGLQP---------EAEGATQE
... . :. . : ..... :. :. ..:: . :. :: .: :: ..
CCDS34 SSRSHKVLKTSETAQDIQKVSREEGSPQLSSARPSPAQRNSQPSSSTMISVLRAGGALRN
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540
pF1KA0 --EEEEEEEVV-------EEEEEEEEEEQAF--QVSLEDLTGHEGNEKGAGPEPPGSEEE
... .... .:.:..:.. : : . : ::.. . : ... .: . .
CCDS34 IWTDHQIRQALFPSRRSPQENEDDEDDYQMFVPSFSSSDLNSTRLCEDSTSSRPCSWHMG
540 550 560 570 580 590
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EEEQEESLAVAEQVADFASSLLAALHCWHYRANALLFSRGAMGKGRRESESSRSSRRPSG
. :. :. . ..... ::: . : .: . : : . : . .
CCDS34 QMESTETSSSGHRIVRRASSAGESNTC-----------PPEIGTSDRTRELQNSPKTEGQ
600 610 620 630 640
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 R--SPTSTEKRMSFESISSLPE---VEPDPEAGSEQEVFSAVEGPSAEETPSDTESPEVL
. .: .. ......:. . . : ...: .. . ::... .::.
CCDS34 EEMTPFGSSIELTIDDIDHVYDNISYEDLKLMVAKREEAESTPSKSARDSVRPKSTPELA
650 660 670 680 690 700
670 680 690 700 710
pF1KA0 ETQLDA-H-QGLLGMDPPGDMVDFVAA-ESTEDLKALSSEEEEEMGGAAQEPESLLPPSV
:. .: : .: : . : . :. .::..:.:. ::.. . :. :::.
CCDS34 FTKRQAGHSKGSLYAQTDGTLSGGEASSQSTHELQAV----EENIYDTIGLPD---PPSL
710 720 730 740 750
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 LDQASVIAERFVSSFSRRSSVAQEDSKSSGFGSPR-LVSRSSSVLSLEGSEKGLARHGSA
. : . . ..::. .. : : .::.. ::. :: : ..
CCDS34 GFKCSSLKR------AKRSTFLGLEADFVCCDSLRPFVSQD----SLQLSEDEAPYHQAT
760 770 780 790 800
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 TDSLSCQLSPEVDISVGVATEDSPSVNGMEPPSPGCPVEPDRSSCKKKESALSTRDRLLL
: .: :::: : : .: :. : . : .
CCDS34 PDHGYLSL-----------LYDSPSGNLSMPHKP----VSDKLSEEVDE---------IW
810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 DKIKSYYENAEHHDAGFSVRRRESLSYIPKGLVRNSISRFNSLPRPDPEPVPPVGSKRQV
. ...: .. : . : . :. .: .:. . : : .: .. :.:
CCDS34 NDLENYIKKNEDKA------RDRLLAAFP-------VSKDDVPDRLHAESTPELS--RDV
840 850 860 870 880
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 GSRPTSWALFELPGPSQAVKGDPPPISDAEFRPSSEIVKIWEGMESSGGSPGKGPGQGQA
: .. .: : :::. :... : : . : . :. :: . . :
CCDS34 GRSVSTLSLPE----SQALL---TPVKSRAGRASRANCPFEEDLISKEGSFMSLNRLSLA
890 900 910 920 930
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 NGFDLHEPLFILEEHELGAITEESATASPESSSPTEGRSPAHLARELKELVKELSSSTQG
. . : . . : . :. :. . :... :..: .::. .. .:. .. .
CCDS34 SEMPLMDNPYDLANSGLSQTDPENPDLGMEATDKTKSRV-FMMARQYSQKIKKANQLLKV
940 950 960 970 980 990
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 ELVAPLHPRIVQLSHVMDSHVSERVKNKVYQLARQYSLRIKSNKPVMARPPLQWEKVAPE
. . .: : .. : . .. ...: : . . :: . .. . .. . .
CCDS34 KSLELEQPPASQHQKSMHKDLAAILEEK-KQGGPAIGARIAEYSQLYDQIVFRESPLKIQ
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 RDG-KSPTVPCLQEEAGEPLGGKGKRKPVLSLFDYEQLMAQEHSPPKPSSAGEMSPQRFF
.:: :: : . .. .:. .: . .:. ::. . ... : :
CCDS34 KDGWASPQESSLLRSVSPSQVHHGSGDWLLHSTYSNGELADFCLPPEQDLRSRY-PT-FE
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA0 FNPSAVSQRTTSPGGRPSAWS--PLSPTE-----TFSWPDVRELCSKYASRDEARRAGGG
.: ... .. .. . :: . :: . . : :. .. :. . . .:. :
CCDS34 INTKSTPRQLSAACSVPSLQTSDPLPGSVQRCSVVVSQPNKENWCQDHLYNSLGRK--GI
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1200 1210 1220 1230 1240
pF1KA0 RPRGPPVNRSHSVPENMVEPPLSG-----RVGRCRSLSTKRGRGGGEAAQSPGP-LPQSK
.. : .::.: ... ... ::. . :: .:. . :. :. : . .:.
CCDS34 SAKSQPYHRSQSSSSVLINKSMDSINYPSDVGKQQLLSLHRS-SRCESHQDLLPDIADSH
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KA0 PDGGETLYVTADLTLEDNRRVIVMEKG-PLPSPTAGLEESSGQGPSSPVALLGQVQDFQQ
.: : : .::::.:...:.:.... :: . :
CCDS34 QQGTEKL---SDLTLQDSQKVVVVNRNLPLNAQIATQNYFSNFKETDGDEDDYVEIKSEE
1240 1250 1260 1270 1280
1310 1320 1330 1340
pF1KA0 SAECQPKEEGSRDPADPSQQGRVRNLREKFQALNSVG
CCDS34 DESELELSHNRRRKSDSKFVDADFSDNVCSGNTLHSLNSPRTPKKPVNSKLGLSPYLTPY
1290 1300 1310 1320 1330 1340
>>CCDS33022.2 PLEKHG2 gene_id:64857|Hs108|chr19 (1386 aa)
initn: 1176 init1: 441 opt: 1128 Z-score: 754.9 bits: 152.1 E(32554): 1e-35
Smith-Waterman score: 1306; 29.4% identity (53.1% similar) in 1354 aa overlap (27-1230:29-1347)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MPVSTSLHQDGSQERPVSLTSTTSSSGSSCDSRSAMEEPSSSEAPAKNGAGSLRSRHL
:. :..:.: :.. . :.:: :
CCDS33 MPEGAQGLSLSKPSPSLGCGRRGEVCDCGTVCETRTA---PAAPTMASPRGSGSSTSLST
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KA0 ----------PNSNNNSSSWLNVKGPLSPFNSRAAAGPAHHKLSYLGRVVREIVETERMY
:. ..: . :: .. .. :. . : : ::.:::::::: :
CCDS33 VGSEGDPAPGPTPACSASRPEPLPGPPIRLHLSPVGIPGSARPSRLERVAREIVETERAY
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 VQDLRSIVEDYLLKIIDTPGL-LKPEQVSALFGNIENIYALNSQLLRDLDSCNSDPVAVA
:.:::::::::: ..: : :. :::..::.:::.:: ..:.::.::.. .:. ..:
CCDS33 VRDLRSIVEDYLGPLLDGGVLGLSVEQVGTLFANIEDIYEFSSELLEDLEN-SSSAGGIA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 SCFVERSQEFDIYTQYCNNYPNSVAALTECMRDKQQAKFFRDRQELLQHSLPLGSYLLKP
:::.::..::::: :: :::.:.: : : . : ....:: :.::::: :.::::
CCDS33 ECFVQRSEDFDIYTLYCMNYPSSLALLRELSLSPPAALWLQERQAQLRHSLPLQSFLLKP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 VQRILKYHLLLQEIAKHFDEEED--GFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKRRHEHAVRLQEI
:::::::::::::..::. : : :.::.:: .:: ::::::::::..:::.::::.
CCDS33 VQRILKYHLLLQELGKHWAEGPGTGGREMVEEAIVSMTAVAWYINDMKRKQEHAARLQEV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KA0 QSLLINWKGPDLTTYGELVLEGTFRVH-----RVRN-ERTFFLFDKTLLITKKRGDHFVY
: : .: ::.:...:::::::.:: :.:. :: .:::.. ::..:.:: ...:
CCDS33 QRRLGGWTGPELSAFGELVLEGAFRGGGGGGPRLRGGERLLFLFSRMLLVAKRRGLEYTY
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 KGNIPCSSLMLIESTRDSLCFTVTHYKHSKQQYSIQAKTVEEKRNWTHHIKRLILENHHA
::.: : .: . :: :: : : :. :... .:::. :::: : : ..::..::: :
CCDS33 KGHIFCCNLSVSESPRDPLGFKVSDLTIPKHRHLLQAKNQEEKRLWIHCLQRLFFENHPA
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430
pF1KA0 TIPQKAKEAILE-------------------MDSYYPNRYRC-SPERLKKAWSSQDEVST
.:: :::...:: . : : : .: : . : : :
CCDS33 SIPAKAKQVLLENSLHCAPKSKPVLEPLTPPLGSPRPRDARSFTPGRRNTAPSPGPSV--
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 NVRQGRRQSEPTKHLLRQLNEKARAAGMKHAGSAGTLLD-FGQPSRTRGLQPEA-EGATQ
.:.:::::::.: .. ..:. :.::::: : : .:: . . :: : :
CCDS33 -IRRGRRQSEPVKDPYVMFPQNAKP-GFKHAGSEGELYPPESQPPVSGSAPPEDLEDAGP
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540
pF1KA0 EEEEEEEEVVEEEEEEEEEEQAFQ---VSLEDLTGHEGNEKGAGPEP-------PG--SE
. . :: : ...... : .:. :. . : :. :
CCDS33 PTLDPSGTSITEEILELLNQRGLRDPGPSTHDIPKFPGDSQVPGDSETLTFQALPSRDSS
540 550 560 570 580 590
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EEEEEQEESLAVAEQVADFASSLLAALHCWHYRANALLFSRGAMGKGRRESESSRSSRR-
:::::.::.: . :. . : : .:. . : . : . : . . :
CCDS33 EEEEEEEEGLEMDER----GPSPLHVLEGLESSIAAEMPSIPCLTKIPDVPNLPEIPSRC
600 610 620 630 640
610 620 630 640 650
pF1KA0 --PSG-RSPTSTEKRMSFE--SISSLPEVEPDPEAGSEQEVF--SAVEGPSAEETPSDTE
: : : :. .. :: . ..: : : .: . : ..:: : . . .
CCDS33 EIPEGSRLPSLSDISDVFEMPCLPAIPSVPNTPSLSSTPTLSCDSWLQGPLQEPAEAPAT
650 660 670 680 690 700
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 SPEVLETQLDAHQGLLGMDPPGDMVDFVAAESTEDLKALSSEEEEEMGGAAQEPESLLPP
:.. .. : :: : : :: :.:: .. . .:...
CCDS33 RRELFS---GSNPGKLGEPPSGG-------------KAGPEEDEEGVSFTDFQPQDVTQH
710 720 730 740 750
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 SVLDQASVIAERFVSSF-SRRSSVAQEDSKSSGFGSPRLVSRSSSVLSLEGSEKGLARHG
. . . .: : : . : ... : . :: : :. ..:.. . :: :. : .
CCDS33 QGFPDE--LAFRSCSEIRSAWQALEQGQLARPGFPEPLLILEDSDLGGDSGSGKAGAPSS
760 770 780 790 800 810
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 SATDSLSCQLSPEVDISVGVATEDSPSVNGMEPPS-PGCPVEPDRSSCKKKESA----LS
: : .:. . . . ... : : ..:. : : .:.: :
CCDS33 ERTASRVRELARLYSERIQQMQRAETRASANAPRRRPRVLAQPQPSPCLPQEQAEPGLLP
820 830 840 850 860 870
840 850 860 870 880
pF1KA0 TRDRLLLDKIKSYYENAEHH-DAGFSVRRRESLSYIPKGLVRNSIS-RFNSLPRPDPEPV
. ..:. .. :.. : .: . .. .: .. . . ..::. : .
CCDS33 AFGHVLVCELAFPLTCAQESVPLGPAVWVQAAIPLSKQGGSPDGQGLHVSNLPKQDLPGI
880 890 900 910 920 930
890 900 910 920 930
pF1KA0 --------PPVGSKRQVGSRPTSWALFELPGPSQAVKGDPPPISDA---EFR-P-SSEIV
: :..:.: . :.. : . :: . .:: :.. : .. .
CCDS33 HVSAATLLPEQGGSRHVQA-PAATPLPKQEGPLHLQVPALTTFSDQGHPEIQVPATTPLP
940 950 960 970 980
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 KIWEGMESSGGSPGKGPGQGQANGFDLHEPLFILEEHELGA-ITEESATASPESSSPTEG
. : . : . : ::. :.: : .:. . .: .: :.. . ..
CCDS33 EHRSHMVIPAPSTAFCPEQGHCA--DIHVPTTPALPKEICSDFTVSVTTPVPKQEGHLDS
990 1000 1010 1020 1030 1040
1000 1010 1020 1030
pF1KA0 RSPAHL-------ARELK-------ELVKELS---SSTQ----GELVAPLHPRIVQLS--
.::... .:... . .. :: :: . :. . :: .. .:.
CCDS33 ESPTNIPLTKQGGSRDVQGPDPVCSQPIQPLSWHGSSLDPQGPGDTLPPLPCHLPDLQIP
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 -----HVMDSHVSERVK-NKVYQLARQY-SLRIKSNKPVMARPPLQ---WEKVAPE--RD
. ::...:. : .:... . .. .. : . : . : .. : ..
CCDS33 GTSPLPAHGSHLDHRIPANAPLSLSQELPDTQVPATTP-LPLPQVLTDIWVQALPTSPKQ
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 GKSPTV--PCLQEEAGEPLGGKGKRKPVLSLFDYEQLMAQEHSP---PKPSSAGEMSPQR
:. : . : :: . . . .. ..:. . : : : : .: .. :
CCDS33 GSLPDIQGPAAAPPLPEPSLTDTQVQKLTPSLEQKSLI-DAHVPAATPLPERGGSLDIQG
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1140 1150 1160 1170
pF1KA0 FFFNPSAVSQRTTSPGGRPSAW------SPLSPTET-------FSWPDV----RELCSKY
. .: ... ..::: .. : :.: .. . :.. : : ..:
CCDS33 LSPTPVQTTMVLSKPGGSLASHVARLESSDLTPPHSPPPSSRQLLGPNAAALSRYLAASY
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KA0 ASRDEARRAG--GGRP---RGP----PVNRSHSVP-ENMVEPPLSGRVGRCRSLSTKRGR
:.. ::: : :: : :: :..:. : : . . :: . :.. ... . :
CCDS33 ISQSLARRQGPGGGAPAASRGSWSSAPTSRASSPPPQPQPPPPPARRLSYATTVNIHVGG
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KA0 GGGEAAQSPGPLPQSKPDGGETLYVTADLTLEDNRRVIVMEKGPLPSPTAGLEESSGQGP
::
CCDS33 GGRLRPAKAQVRLNHPALLASTQESMGLHRAQGAPDAPFHM
1350 1360 1370 1380
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CCDS42 ILSTERDYIKHLRDICEGYVRQCRKRADMFSEEQLRTIFGNIEDIYRCQKAFVKALEQRF
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: . : ...::.:.. .:.::..::::.::. . :.. . .. . :: . .:::.
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360 370 380 390 400 410
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pF1KA0 --SLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLQEIAKHFDEEEDGFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKR
.. : ..:: :::.: :: : : :. :. .. :. :: :. .: :: ::. ::
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420 430 440 450 460 470
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pF1KA0 RHEHAVRLQEIQSLLINWKGPDLTTYG-ELVLEGTF-RVHRVR---NERTFFLFDKTLLI
: :. .. . :: . .:.: :: . . ::. : . :: . . ..: :::::. :.
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pF1KA0 TKK---RGDHFVYKGNIPCSSLMLI--ESTRD-SLCFTVT-----HYKHSKQQYSIQAKT
:: : : . ::: . ..: .. :. .: .: .. : . ... . ..
CCDS42 CKKDLLRRDVLYYKGRLDMDGLEVVDLEDGKDRDLHVSIKNAFRLHRGATGDSHLLCTRK
540 550 560 570 580 590
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 VEEKRNWTHHIKRLILENHHATIPQKAKEAILEMDSYYPNRYRCSPERLKKAWSSQDEVS
:.:. : .: . : ... . :.. .: :. .: . ... .
CCDS42 PEQKQRW---LKAFAREREQVQLDQETGFSITEL------------QRKQAMLNASKQQV
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440 450 460 470 480 490
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:. .::: . : .:
CCDS42 TGKPKGRRTAAPPPRLPGPYPADIIPFSEPQSQAS
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pF1KA0 IVETERMYVQDLRSIVEDYLLKIIDTPGLLKPEQVSALFGNIENIYALNSQLLRDLDS-C
:. ::: :.. ::.: : :. . ... ::. ..:::::.:: .. ... :..
CCDS21 ILSTERDYIKHLRDICEGYVRQCRKRADMFSEEQLRTIFGNIEDIYRCQKAFVKALEQRF
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pF1KA0 NSD-P--VAVASCFVERSQEFDIYTQYCNNYPNSVAALTECMRDKQQAKFFRDRQELLQH
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CCDS21 NRERPHLSELGACFLEHQADFQIYSEYCNNHPNACVELSRLTKLSKYVYFF-EACRLLQK
360 370 380 390 400 410
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pF1KA0 --SLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLQEIAKHFDEEEDGFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKR
.. : ..:: :::.: :: : : :. :. .. :. :: :. .: :: ::. ::
CCDS21 MIDISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKDVEAALHAMKNVAQLINERKR
420 430 440 450 460 470
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pF1KA0 RHEHAVRLQEIQSLLINWKGPDLTTYG-ELVLEGTF-RVHRVR---NERTFFLFDKTLLI
: :. .. . :: . .:.: :: . . ::. : . :: . . ..: :::::. :.
CCDS21 RLENIDKIAQWQSSIEDWEGEDLLVRSSELIYSGELTRVTQPQAKSQQRMFFLFDHQLIY
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:: : : . ::: . ..: .. :. .: .: .. : . ... . ..
CCDS21 CKKDLLRRDVLYYKGRLDMDGLEVVDLEDGKDRDLHVSIKNAFRLHRGATGDSHLLCTRK
540 550 560 570 580 590
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 VEEKRNWTHHIKRLILENHHATIPQKAKEAILEMDSYYPNRYRCSPERLKKAWSSQDEVS
:.:. : .: . : ... . :.. .: :.
CCDS21 PEQKQRW---LKAFAREREQVQLDQETGFSITELQRKQAMLNASKQQVTGKPKAVGRPCY
600 610 620 630 640
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pF1KA0 TNVRQGRRQSEPTKHLLRQLNEKARAAGMKHAGSAGTLLDFGQPSRTRGLQPEAEGATQE
CCDS21 LTRQKHPALPSNRPQQQVLVLAEPRRKPSTFWHSISRLAPFRK
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CCDS55 MQWIRGGSGMLWVNQEDEVEEGPSDVQN--GHLD
10 20 30
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: .. : : ... .. . :. ::. ::: :.. :..: : :: . ... ::.
CCDS55 PNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQL
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 SALFGNIENIYALNSQLLRDLDS--CNSDP--VAVASCFVERSQEFDIYTQYCNNYPNSV
...:::::.:: .. ..:::.. :.:: .. ::.:... : ::..::::. ..
CCDS55 KVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDAC
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240
pF1KA0 AALTECMRDKQQAKFFRDRQELLQH--SLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLQEIAKHFDEEE
:.. :.:.. .:: . .:::. .. . ..:: :::.: :: : : :. :. ...
CCDS55 MELSKLMKDSRYQHFF-EACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDH
160 170 180 190 200 210
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pF1KA0 DGFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKRRHEHAVRLQEIQSLLINWKGPD-LTTYGELVLEGT
. .. : :. .: :. ::. ::: :. .. . :. ...:.: : : .::. :
CCDS55 SDYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGE
220 230 240 250 260 270
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pF1KA0 ----FRVHRVRNERTFFLFDKTLLITKK---RGDHFVYKGNIPCSSLML--IESTRDSLC
.. . ..:.:::::. ... :: : : . ::: : .. . ::. ::.
CCDS55 MAWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDD-
280 290 300 310 320 330
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pF1KA0 FTVT-------HYKHSKQQYSIQAKTVEEKRNWTHHIKRLILENHHATIPQKAKEAILEM
:.:. : :.... . . :: .::: :
CCDS55 FNVSMKNAFKLHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAFREERKMVQEDEKIGFEISENQKR
340 350 360 370 380 390
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pF1KA0 DSYYPNRYRCSPERLKKAWSSQDEVSTNVRQGRRQSEPTKHLLRQLNEKARAAGMKHAGS
CCDS55 QAAMTVRKVPKQKGVNSARSVPPSYPPPQDPLNHGQYLVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSP
400 410 420 430 440 450
>>CCDS83477.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX (495 aa)
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: :.: .. : : ... .. . :. ::
CCDS83 DEEGWFPASFVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEI
40 50 60 70 80 90
110 120 130 140 150
pF1KA0 VETERMYVQDLRSIVEDYLLKIIDTPGLLKPEQVSALFGNIENIYALNSQLLRDLDS--C
. ::: :.. :..: : :: . ... ::....:::::.:: .. ..:::..
CCDS83 MSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYN
100 110 120 130 140 150
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 NSDP--VAVASCFVERSQEFDIYTQYCNNYPNSVAALTECMRDKQQAKFFRDRQELLQH-
:.:: .. ::.:... : ::..::::. .. :.. :.:.. .:: . .:::.
CCDS83 NDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMKDSRYQHFF-EACRLLQQM
160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 -SLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLQEIAKHFDEEEDGFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKRR
.. . ..:: :::.: :: : : :. :. .... .. : :. .: :. ::. :::
CCDS83 IDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRR
210 220 230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 HEHAVRLQEIQSLLINWKGPD-LTTYGELVLEGT----FRVHRVRNERTFFLFDKTLLIT
:. .. . :. ...:.: : : .::. : .. . ..:.:::::. ...
CCDS83 LENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLC
270 280 290 300 310 320
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pF1KA0 KK---RGDHFVYKGNIPCSSLML--IESTRDSLCFTVT-------HYKHSKQQYSIQAKT
:: : : . ::: : .. . ::. ::. :.:. : :.... . . ::
CCDS83 KKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDD-FNVSMKNAFKLHNKETEEIHLFFAKK
330 340 350 360 370 380
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pF1KA0 VEEKRNWTHHIKRLILENHHATIPQKAKEAILEMDSYYPNRYRCSPERLKKAWSSQDEVS
.::: :
CCDS83 LEEKIRWLRAFREERKMVQEDEKIGFEISENQKRQAAMTVRKVPKQKGVNSARSVPPSYP
390 400 410 420 430 440
>>CCDS35315.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX (516 aa)
initn: 407 init1: 145 opt: 441 Z-score: 306.1 bits: 67.6 E(32554): 1e-10
Smith-Waterman score: 529; 32.0% identity (63.2% similar) in 337 aa overlap (73-385:82-416)
50 60 70 80 90 100
pF1KA0 EAPAKNGAGSLRSRHLPNSNNNSSSWLNVKGPLSPFNSRAAAG-PAHHKLSYLGRVVREI
: :.: .. : : ... .. . :. ::
CCDS35 DEEGWFPASFVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEI
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KA0 VETERMYVQDLRSIVEDYLLKIIDTPGLLKPEQVSALFGNIENIYALNSQLLRDLDS--C
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CCDS35 MSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYN
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