Result of FASTA (ccds) for
pFN21ASDF0136
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDF0136, 805 aa
1>>>pF1KSDF0136 805 - 805 aa - 805 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4334+/-0.000783; mu= 20.6918+/- 0.047
mean_var=77.7910+/-15.786, 0's: 0 Z-trim(109.3): 26 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.145415
statistics sampled from 10757 (10777) to 10757 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.692), E-opt: 0.2 (0.331), width: 16
Scan time: 4.340
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32748.1 TMC6 gene_id:11322|Hs108|chr17 ( 805) 5395 1141.6 0
CCDS10577.1 TMC5 gene_id:79838|Hs108|chr16 ( 760) 1126 246.0 1.8e-64
CCDS45431.1 TMC5 gene_id:79838|Hs108|chr16 (1006) 1126 246.1 2.2e-64
CCDS76837.1 TMC5 gene_id:79838|Hs108|chr16 ( 954) 902 199.0 3e-50
CCDS42126.1 TMC5 gene_id:79838|Hs108|chr16 ( 948) 862 190.7 1e-47
CCDS53992.1 TMC7 gene_id:79905|Hs108|chr16 ( 613) 456 105.3 3.1e-22
CCDS10573.1 TMC7 gene_id:79905|Hs108|chr16 ( 723) 456 105.4 3.5e-22
CCDS73837.1 TMC7 gene_id:79905|Hs108|chr16 ( 758) 417 97.2 1.1e-19
CCDS32749.1 TMC8 gene_id:147138|Hs108|chr17 ( 726) 370 87.4 9.6e-17
CCDS12882.1 TMC4 gene_id:147798|Hs108|chr19 ( 706) 363 85.9 2.6e-16
CCDS46174.1 TMC4 gene_id:147798|Hs108|chr19 ( 712) 363 85.9 2.6e-16
CCDS6643.1 TMC1 gene_id:117531|Hs108|chr9 ( 760) 289 70.4 1.3e-11
CCDS45324.1 TMC3 gene_id:342125|Hs108|chr15 (1100) 280 68.6 6.4e-11
>>CCDS32748.1 TMC6 gene_id:11322|Hs108|chr17 (805 aa)
initn: 5395 init1: 5395 opt: 5395 Z-score: 6110.8 bits: 1141.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5395; 100.0% identity (100.0% similar) in 805 aa overlap (1-805:1-805)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAQPLAFILDVPETPGDQGQGPSPYDESEVHDSFQQLIQEQSQCTAQEGLELQQREREVT
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CCDS32 MAQPLAFILDVPETPGDQGQGPSPYDESEVHDSFQQLIQEQSQCTAQEGLELQQREREVT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GSSQQTLWRPEGTQSTATLRILASMPSRTIGRSRGAIISQYYNRTVQLRCRSSRPLLGNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GSSQQTLWRPEGTQSTATLRILASMPSRTIGRSRGAIISQYYNRTVQLRCRSSRPLLGNF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VRSAWPSLRLYDLELDPTALEEEEKQSLLVKELQSLAVAQRDHMLRGMPLSLAEKRSLRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VRSAWPSLRLYDLELDPTALEEEEKQSLLVKELQSLAVAQRDHMLRGMPLSLAEKRSLRE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KSRTPRGKWRGQPGSGGVCSCCGRLRYACVLALHSLGLALLSALQALMPWRYALKRIGGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KSRTPRGKWRGQPGSGGVCSCCGRLRYACVLALHSLGLALLSALQALMPWRYALKRIGGQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FGSSVLSYFLFLKTLLAFNALLLLLLVAFIMGPQVAFPPALPGPAPVCTGLELLTGAGCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FGSSVLSYFLFLKTLLAFNALLLLLLVAFIMGPQVAFPPALPGPAPVCTGLELLTGAGCF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD THTVMYYGHYSNATLNQPCGSPLDGSQCTPRVGGLPYNMPLAYLSTVGVSFFITCITLVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 THTVMYYGHYSNATLNQPCGSPLDGSQCTPRVGGLPYNMPLAYLSTVGVSFFITCITLVY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SMAHSFGESYRVGSTSGIHAITVFCSWDYKVTQKRASRLQQDNIRTRLKELLAEWQLRHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SMAHSFGESYRVGSTSGIHAITVFCSWDYKVTQKRASRLQQDNIRTRLKELLAEWQLRHS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PRSVCGRLRQAAVLGLVWLLCLGTALGCAVAVHVFSEFMIQSPEAAGQEAVLLVLPLVVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PRSVCGRLRQAAVLGLVWLLCLGTALGCAVAVHVFSEFMIQSPEAAGQEAVLLVLPLVVG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LLNLGAPYLCRVLAALEPHDSPVLEVYVAICRNLILKLAILGTLCYHWLGRRVGVLQGQC
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CCDS32 LLNLGAPYLCRVLAALEPHDSPVLEVYVAICRNLILKLAILGTLCYHWLGRRVGVLQGQC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD WEDFVGQELYRFLVMDFVLMLLDTLFGELVWRIISEKKLKRRRKPEFDIARNVLELIYGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 WEDFVGQELYRFLVMDFVLMLLDTLFGELVWRIISEKKLKRRRKPEFDIARNVLELIYGQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD TLTWLGVLFSPLLPAVQIIKLLLVFYVKKTSLLANCQAPRRPWLASHMSTVFLTLLCFPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TLTWLGVLFSPLLPAVQIIKLLLVFYVKKTSLLANCQAPRRPWLASHMSTVFLTLLCFPA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD FLGAAVFLCYAVWQVKPSSTCGPFRTLDTMYEAGRVWVRHLEAAGPRVSWLPWVHRYLME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FLGAAVFLCYAVWQVKPSSTCGPFRTLDTMYEAGRVWVRHLEAAGPRVSWLPWVHRYLME
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD NTFFVFLVSALLLAVIYLNIQVVRGQRKVICLLKEQISNEGEDKIFLINKLHSIYERKER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NTFFVFLVSALLLAVIYLNIQVVRGQRKVICLLKEQISNEGEDKIFLINKLHSIYERKER
730 740 750 760 770 780
790 800
pF1KSD EERSRVGTTEEAAAPPALLTDEQDA
:::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EERSRVGTTEEAAAPPALLTDEQDA
790 800
>>CCDS10577.1 TMC5 gene_id:79838|Hs108|chr16 (760 aa)
initn: 1293 init1: 558 opt: 1126 Z-score: 1271.0 bits: 246.0 E(32554): 1.8e-64
Smith-Waterman score: 1391; 35.9% identity (66.0% similar) in 685 aa overlap (127-804:81-742)
100 110 120 130 140 150
pF1KSD IISQYYNRTVQLRCRSSRPLLGNFVRSAWPSLRLYDLE---LD-PTALEEEEKQSLLVKE
: :..:: .: : . .: . . :.
CCDS10 DVIDSQTVSKRNDQKGNQVLRFSTSLNESMSQTLHSLECMGIDTPGSSHETVQGQKLIAS
60 70 80 90 100 110
160 170 180 190 200 210
pF1KSD LQSLAVAQRDHMLRGMPLSLAEKRSLREKSRTPRGKWRGQPGSGGVC-SCCGRLRYACVL
: .. .: . .:..: .. :::.::. ..: . . . : .: . . :
CCDS10 LIPMTSRDRIKAIRNQPRTMEEKRNLRKIVDKEKSKQTHRILQLNCCIQCLNSISRAYRR
120 130 140 150 160 170
220 230 240 250 260 270
pF1KSD ALHSLGLALLSALQALMPWRYALKRIGGQFGSSVLSYFLFLKTLLAFNALLLLLLVAFIM
. .::. :... :. .:: :::.::.:::::: ::. :: :: . ..: .::.
CCDS10 SKNSLS----EILNSISLWQKTLKIIGGKFGTSVLSYFNFLRWLLKFNIFSFILNFSFII
180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KSD GPQVAFPPALPGPAPVCTGLELLTGAGCFTHTVMYYGHYSNATLNQPCGSPLDGSQCTPR
:: : : . ::::..::.: : :::::: :.:.:... :..
CCDS10 IPQ--FTVAKKNTLQF-TGLEFFTGVGYFRDTVMYYGFYTNSTIQH-------GNS----
230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KSD VGGLPYNMPLAYLSTVGVSFFITCITLVYSMAHSFGESYRVGST-SGIHAITVFCSWDYK
: ::: :::. :.:. . ..:..:::. : ... :: . .:: ::.
CCDS10 --GASYNMQLAYIFTIGACLTTCFFSLLFSMAKYFRNNFINPHIYSGGITKLIFC-WDFT
280 290 300 310 320
400 410 420 430 440 450
pF1KSD VTQKRASRLQQDNIRTRLKELLAEWQLRHSPRSVCGRLRQAAVLGLVWLLCLGTALGCAV
::...: .:.: :. :...: :.: . ..: . : . .. ..:.. :.:..: .
CCDS10 VTHEKAVKLKQKNLSTEIRENLSELRQENSKLTFNQLLTRFSAYMVAWVVSTGVAIACCA
330 340 350 360 370 380
460 470 480 490 500 510
pF1KSD AVHVFSEFMIQSPEAAGQEAVLLVLPLVVGLLNLGAPYLCRVLAALEPHDSPVLEVYVAI
::. ..:. .. .. .. ...:.::.::. .::..: . .. .: .. : :::: .
CCDS10 AVYYLAEYNLEFLKTHSNPGAVLLLPFVVSCINLAVPCIYSMFRLVERYEMPRHEVYVLL
390 400 410 420 430 440
520 530 540 550 560 570
pF1KSD CRNLILKLAILGTLCYHWLGRRVGVLQGQCWEDFVGQELYRFLVMDFVLMLLDTLFGELV
::..::..:.: :::.::. :.. .::: ..::..::.:.::::. :.....::..
CCDS10 IRNIFLKISIIGILCYYWLNT-VALSGEECWETLIGQDIYRLLLMDFVFSLVNSFLGEFL
450 460 470 480 490 500
580 590 600 610 620 630
pF1KSD WRIISEKKLKRRRKPEFDIARNVLELIYGQTLTWLGVLFSPLLPAVQIIKLLLVFYVKKT
:::. . . :::::::::::::.:::.:.:..: :::: .:.: :...:: :.
CCDS10 RRIIGMQLITSLGLQEFDIARNVLELIYAQTLVWIGIFFCPLLPFIQMIMLFIMFYSKNI
510 520 530 540 550 560
640 650 660 670 680 690
pF1KSD SLLANCQAPRRPWLASHMSTVFLTLLCFPAFLGAAVFLCYAVWQVKPSSTCGPFRTLDTM
::. : : : . : ::.: : :. :: ::.: :. : ..:..:::. ::::: : .
CCDS10 SLMMNFQPPSKAWRASQMMTFFIFLLFFPSFTGVLCTLAITIWRLKPSADCGPFRGLPLF
570 580 590 600 610 620
700 710 720 730 740 750
pF1KSD YEAGRVWVRHLEAAGPRVSWLPWVHRYLMENTFFVFLVSALLLAVIYLNIQVVRGQRKVI
.. :. : .. : :. :..: :. .. : :... ..: . :: :...:.. .:
CCDS10 IHSIYSWIDTL-STRPGYLWVVWIYRNLIGSVHFFFILTLIVLIITYLYWQITEGRKIMI
630 640 650 660 670 680
760 770 780 790 800
pF1KSD CLLKEQISNEGEDKIFLINKLHSIYE-RKEREERSRVGTTEEAAAPPALLTDEQDA
::.::: :::.::.:::.:: .. . .:. . : : .:. : :.:
CCDS10 RLLHEQIINEGKDKMFLIEKLIKLQDMEKKANPSSLVLERREVEQQGFLHLGEHDGSLDL
690 700 710 720 730 740
CCDS10 RSRRSVQEGNPRA
750 760
>>CCDS45431.1 TMC5 gene_id:79838|Hs108|chr16 (1006 aa)
initn: 1293 init1: 558 opt: 1126 Z-score: 1269.2 bits: 246.1 E(32554): 2.2e-64
Smith-Waterman score: 1388; 33.5% identity (62.1% similar) in 813 aa overlap (10-804:224-988)
10 20 30
pF1KSD MAQPLAFILDVPETPGDQG-----QGPSPYDESEVHDSF
: : . .:. . :. : . ::
CCDS45 RINPYADSLGKPDYPGADIQPNSPPFFGEPDYPSAEDNQNLPSTWREPDYSDAENGHDYG
200 210 220 230 240 250
40 50 60 70 80
pF1KSD QQLIQEQSQCTAQEGLELQQREREVTGSSQQTLW----RPEGTQSTATLRILASMP-SRT
.. .... . .. .: :. . . .:: ::: . .::: . .
CCDS45 SSETPKMTRGVLSRTSSIQPSFRHRSDDPVGSLWGENDYPEGIE-------MASMEMANS
260 270 280 290 300
90 100 110 120 130 140
pF1KSD IGRSR-GAIISQYYNRTVQLRCRSSRPL--LGNFVRSAWPSLRLYDLELDPTALEEEEKQ
:.: :: : : : . : :. :: : : : . .: . .
CCDS45 YGHSLPGAPGSGYVNPA---YVGESGPVHAYGN------PPLSECDWHKSPQGQK-----
310 320 330 340 350
150 160 170 180 190 200
pF1KSD SLLVKELQSLAVAQRDHMLRGMPLSLAEKRSLREKSRTPRGKWRGQPGSGGVC-SCCGRL
:. : .. .: . .:..: .. :::.::. ..: . . . : .: . .
CCDS45 --LIASLIPMTSRDRIKAIRNQPRTMEEKRNLRKIVDKEKSKQTHRILQLNCCIQCLNSI
360 370 380 390 400 410
210 220 230 240 250 260
pF1KSD RYACVLALHSLGLALLSALQALMPWRYALKRIGGQFGSSVLSYFLFLKTLLAFNALLLLL
: . .::. :... :. .:: :::.::.:::::: ::. :: :: . ..:
CCDS45 SRAYRRSKNSLS----EILNSISLWQKTLKIIGGKFGTSVLSYFNFLRWLLKFNIFSFIL
420 430 440 450 460
270 280 290 300 310 320
pF1KSD LVAFIMGPQVAFPPALPGPAPVCTGLELLTGAGCFTHTVMYYGHYSNATLNQPCGSPLDG
.::. :: : : . ::::..::.: : :::::: :.:.:... :
CCDS45 NFSFIIIPQ--FTVAKKNTLQF-TGLEFFTGVGYFRDTVMYYGFYTNSTIQH-------G
470 480 490 500 510
330 340 350 360 370 380
pF1KSD SQCTPRVGGLPYNMPLAYLSTVGVSFFITCITLVYSMAHSFGESY---RVGSTSGIHAIT
.. : ::: :::. :.:. . ..:..:::. : ... .. : .:: .
CCDS45 NS------GASYNMQLAYIFTIGACLTTCFFSLLFSMAKYFRNNFINPHIYS-GGITKL-
520 530 540 550 560
390 400 410 420 430 440
pF1KSD VFCSWDYKVTQKRASRLQQDNIRTRLKELLAEWQLRHSPRSVCGRLRQAAVLGLVWLLCL
.:: ::. ::...: .:.: :. :...: :.: . ..: . : . .. ..:..
CCDS45 IFC-WDFTVTHEKAVKLKQKNLSTEIRENLSELRQENSKLTFNQLLTRFSAYMVAWVVST
570 580 590 600 610 620
450 460 470 480 490 500
pF1KSD GTALGCAVAVHVFSEFMIQSPEAAGQEAVLLVLPLVVGLLNLGAPYLCRVLAALEPHDSP
:.:..: .::. ..:. .. .. .. ...:.::.::. .::..: . .. .: .. :
CCDS45 GVAIACCAAVYYLAEYNLEFLKTHSNPGAVLLLPFVVSCINLAVPCIYSMFRLVERYEMP
630 640 650 660 670 680
510 520 530 540 550 560
pF1KSD VLEVYVAICRNLILKLAILGTLCYHWLGRRVGVLQGQCWEDFVGQELYRFLVMDFVLMLL
:::: . ::..::..:.: :::.::. :.. .::: ..::..::.:.::::. :.
CCDS45 RHEVYVLLIRNIFLKISIIGILCYYWLNT-VALSGEECWETLIGQDIYRLLLMDFVFSLV
690 700 710 720 730 740
570 580 590 600 610 620
pF1KSD DTLFGELVWRIISEKKLKRRRKPEFDIARNVLELIYGQTLTWLGVLFSPLLPAVQIIKLL
....::.. :::. . . :::::::::::::.:::.:.:..: :::: .:.: :.
CCDS45 NSFLGEFLRRIIGMQLITSLGLQEFDIARNVLELIYAQTLVWIGIFFCPLLPFIQMIMLF
750 760 770 780 790 800
630 640 650 660 670 680
pF1KSD LVFYVKKTSLLANCQAPRRPWLASHMSTVFLTLLCFPAFLGAAVFLCYAVWQVKPSSTCG
..:: :. ::. : : : . : ::.: : :. :: ::.: :. : ..:..:::. ::
CCDS45 IMFYSKNISLMMNFQPPSKAWRASQMMTFFIFLLFFPSFTGVLCTLAITIWRLKPSADCG
810 820 830 840 850 860
690 700 710 720 730 740
pF1KSD PFRTLDTMYEAGRVWVRHLEAAGPRVSWLPWVHRYLMENTFFVFLVSALLLAVIYLNIQV
::: : . .. :. : .. : :. :..: :. .. : :... ..: . :: :.
CCDS45 PFRGLPLFIHSIYSWIDTL-STRPGYLWVVWIYRNLIGSVHFFFILTLIVLIITYLYWQI
870 880 890 900 910 920
750 760 770 780 790 800
pF1KSD VRGQRKVICLLKEQISNEGEDKIFLINKLHSIYE-RKEREERSRVGTTEEAAAPPALLTD
..:.. .: ::.::: :::.::.:::.:: .. . .:. . : : .:. :
CCDS45 TEGRKIMIRLLHEQIINEGKDKMFLIEKLIKLQDMEKKANPSSLVLERREVEQQGFLHLG
930 940 950 960 970 980
pF1KSD EQDA
:.:
CCDS45 EHDGSLDLRSRRSVQEGNPRA
990 1000
>>CCDS76837.1 TMC5 gene_id:79838|Hs108|chr16 (954 aa)
initn: 1211 init1: 558 opt: 902 Z-score: 1015.6 bits: 199.0 E(32554): 3e-50
Smith-Waterman score: 1216; 32.6% identity (58.1% similar) in 813 aa overlap (10-804:224-936)
10 20 30
pF1KSD MAQPLAFILDVPETPGDQG-----QGPSPYDESEVHDSF
: : . .:. . :. : . ::
CCDS76 RINPYADSLGKPDYPGADIQPNSPPFFGEPDYPSAEDNQNLPSTWREPDYSDAENGHDYG
200 210 220 230 240 250
40 50 60 70 80
pF1KSD QQLIQEQSQCTAQEGLELQQREREVTGSSQQTLW----RPEGTQSTATLRILASMP-SRT
.. .... . .. .: :. . . .:: ::: . .::: . .
CCDS76 SSETPKMTRGVLSRTSSIQPSFRHRSDDPVGSLWGENDYPEGIE-------MASMEMANS
260 270 280 290 300
90 100 110 120 130 140
pF1KSD IGRSR-GAIISQYYNRTVQLRCRSSRPL--LGNFVRSAWPSLRLYDLELDPTALEEEEKQ
:.: :: : : : . : :. :: : : : . .: . .
CCDS76 YGHSLPGAPGSGYVNPA---YVGESGPVHAYGN------PPLSECDWHKSPQGQK-----
310 320 330 340 350
150 160 170 180 190 200
pF1KSD SLLVKELQSLAVAQRDHMLRGMPLSLAEKRSLREKSRTPRGKWRGQPGSGGVC-SCCGRL
:. : .. .: . .:..: .. :::.::. ..: . . . : .: . .
CCDS76 --LIASLIPMTSRDRIKAIRNQPRTMEEKRNLRKIVDKEKSKQTHRILQLNCCIQCLNSI
360 370 380 390 400 410
210 220 230 240 250 260
pF1KSD RYACVLALHSLGLALLSALQALMPWRYALKRIGGQFGSSVLSYFLFLKTLLAFNALLLLL
: . .::. :... :. .:: :::.::.:::::: ::. :: :: . ..:
CCDS76 SRAYRRSKNSLS----EILNSISLWQKTLKIIGGKFGTSVLSYFNFLRWLLKFNIFSFIL
420 430 440 450 460
270 280 290 300 310 320
pF1KSD LVAFIMGPQVAFPPALPGPAPVCTGLELLTGAGCFTHTVMYYGHYSNATLNQPCGSPLDG
.::. :: : : . ::::..::.: : :::::: :.:.:... :
CCDS76 NFSFIIIPQ--FTVAKKNTLQF-TGLEFFTGVGYFRDTVMYYGFYTNSTIQH-------G
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pF1KSD SQCTPRVGGLPYNMPLAYLSTVGVSFFITCITLVYSMAHSFGESY---RVGSTSGIHAIT
.. : ::: :::. :.:. . ..:..:::. : ... .. : .:: .
CCDS76 NS------GASYNMQLAYIFTIGACLTTCFFSLLFSMAKYFRNNFINPHIYS-GGITKL-
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pF1KSD VFCSWDYKVTQKRASRLQQDNIRTRLKELLAEWQLRHSPRSVCGRLRQAAVLGLVWLLCL
.:: ::. ::...: .:.: :. :... : . ::
CCDS76 IFC-WDFTVTHEKAVKLKQKNLSTEIRFLKT-----HS----------------------
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450 460 470 480 490 500
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.: : .:.::.::. .::..: . .. .: .. :
CCDS76 -------------------NPGA------VLLLPFVVSCINLAVPCIYSMFRLVERYEMP
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510 520 530 540 550 560
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:::: . ::..::..:.: :::.::. :.. .::: ..::..::.:.::::. :.
CCDS76 RHEVYVLLIRNIFLKISIIGILCYYWLNT-VALSGEECWETLIGQDIYRLLLMDFVFSLV
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570 580 590 600 610 620
pF1KSD DTLFGELVWRIISEKKLKRRRKPEFDIARNVLELIYGQTLTWLGVLFSPLLPAVQIIKLL
....::.. :::. . . :::::::::::::.:::.:.:..: :::: .:.: :.
CCDS76 NSFLGEFLRRIIGMQLITSLGLQEFDIARNVLELIYAQTLVWIGIFFCPLLPFIQMIMLF
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630 640 650 660 670 680
pF1KSD LVFYVKKTSLLANCQAPRRPWLASHMSTVFLTLLCFPAFLGAAVFLCYAVWQVKPSSTCG
..:: :. ::. : : : . : ::.: : :. :: ::.: :. : ..:..:::. ::
CCDS76 IMFYSKNISLMMNFQPPSKAWRASQMMTFFIFLLFFPSFTGVLCTLAITIWRLKPSADCG
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690 700 710 720 730 740
pF1KSD PFRTLDTMYEAGRVWVRHLEAAGPRVSWLPWVHRYLMENTFFVFLVSALLLAVIYLNIQV
::: : . .. :. : .. : :. :..: :. .. : :... ..: . :: :.
CCDS76 PFRGLPLFIHSIYSWIDTL-STRPGYLWVVWIYRNLIGSVHFFFILTLIVLIITYLYWQI
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750 760 770 780 790 800
pF1KSD VRGQRKVICLLKEQISNEGEDKIFLINKLHSIYE-RKEREERSRVGTTEEAAAPPALLTD
..:.. .: ::.::: :::.::.:::.:: .. . .:. . : : .:. :
CCDS76 TEGRKIMIRLLHEQIINEGKDKMFLIEKLIKLQDMEKKANPSSLVLERREVEQQGFLHLG
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pF1KSD EQDA
:.:
CCDS76 EHDGSLDLRSRRSVQEGNPRA
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10 20 30
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: : . .:. . :. : . ::
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.. .... . .. .: :. . . .:: ::: . .::: . .
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:.: :: : : : . : :. :: : : : . .: . .
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:. : .. .: . .:..: .. :::.::. ..: . . . : .: . .
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: . .::. :... :. .:: :::.::.:::::: ::. :: :: . ..:
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.::. :: : : . ::::..::.: : :::::: :.:.:... :
CCDS42 NFSFIIIPQ--FTVAKKNTLQF-TGLEFFTGVGYFRDTVMYYGFYTNSTIQH-------G
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pF1KSD SQCTPRVGGLPYNMPLAYLSTVGVSFFITCITLVYSMAHSFGESY---RVGSTSGIHAIT
.. : ::: :::. :.:. . ..:..:::. : ... .. : .:: .
CCDS42 NS------GASYNMQLAYIFTIGACLTTCFFSLLFSMAKYFRNNFINPHIYS-GGITKL-
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pF1KSD VFCSWDYKVTQKRASRLQQDNIRTRLKELLAEWQLRHSPRSVCGRLRQAAVLGLVWLLCL
.:: ::. ::...: .:.: :. :...: :.: . ..: . : . .. ..:..
CCDS42 IFC-WDFTVTHEKAVKLKQKNLSTEIRENLSELRQENSKLTFNQLLTRFSAYMVAWVVST
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:.:..: .::. ..:. .. .. .. ...:.::.::. .::..: . .. .: .. :
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pF1KSD VLEVYVAICRNLILKLAILGTLCYHWLGRRVGVLQGQCWEDFVGQELYRFLVMDFVLMLL
:::: . ::..::..:.: :::.::. :.. .::: ..::..::.:.::::. :.
CCDS42 RHEVYVLLIRNIFLKISIIGILCYYWLNT-VALSGEECWETLIGQDIYRLLLMDFVFSLV
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570 580 590 600 610 620
pF1KSD DTLFGELVWRIISEKKLKRRRKPEFDIARNVLELIYGQTLTWLGVLFSPLLPAVQIIKLL
....::.. :::. . . :::::::::::::.:::.:.:..: :::: .:.: :.
CCDS42 NSFLGEFLRRIIGMQLITSLGLQEFDIARNVLELIYAQTLVWIGIFFCPLLPFIQMIMLF
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630 640 650 660 670 680
pF1KSD LVFYVKKTSLLANCQAPRRPWLASHMSTVFLTLLCFPAFLGAAVFLCYAVWQVKPSSTCG
..:: :. ::. : : : . : ::.: : :. :: ::.: :. : ..:..
CCDS42 IMFYSKNISLMMNFQPPSKAWRASQMMTFFIFLLFFPSFTGVLCTLAITIWRI-------
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pF1KSD PFRTLDTMYEAGRVWVRHLEAAGPRVSWLPWVHRYLMENTFFVFLVSALLLAVIYLNIQV
...: : :.
CCDS42 -------------------------ITYLYW---------------------------QI
860
750 760 770 780 790 800
pF1KSD VRGQRKVICLLKEQISNEGEDKIFLINKLHSIYE-RKEREERSRVGTTEEAAAPPALLTD
..:.. .: ::.::: :::.::.:::.:: .. . .:. . : : .:. :
CCDS42 TEGRKIMIRLLHEQIINEGKDKMFLIEKLIKLQDMEKKANPSSLVLERREVEQQGFLHLG
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pF1KSD EQDA
:.:
CCDS42 EHDGSLDLRSRRSVQEGNPRA
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...:.. ... : . . . . : :: :: .::
CCDS53 LVIFLIIFMLVLLPVLLTKYKITNSSFVLIPFKDMDKQCTVYPVSSSGLIYFYSYIIDLL
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CCDS53 SGTGFLEETSLFYGHYT-----------IDGV----KFQNFTYDLPLAYLLSTIASLALS
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. .: ...: . . : ... .: .::. .:.. . :.....: .:. :
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: ..:. . :. .: .. :. . : ::. . .. ::: : : . .
CCDS53 EEERMRQKIAERTSEETIRIYSLRLFLNCIVLAVLGACFYAIYVATVFSQEHMKKEIDKM
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:.. .: :: .:. : :. .:.. . : . :: .:. ..: : ....:: . .
CCDS53 VFGENLFILYLPSIVITLANFITPMIFAKIIRYEDY-SPGFEIRLTILRCVFMRLATICV
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: . :: .. : : ::: ::::.:.....::...: ::: ..
CCDS53 LVFT-LGSKITSCDDDTCDLCGYNQKLYPCWETQVGQEMYKLMIFDFIIILAVTLFVDFP
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... : : .. . :: : ::: ..::::. :.:..:::::::. .:....:
CCDS53 RKLLVTYCSSCKLIQCWGQQEFAIPDNVLGIVYGQTICWIGAFFSPLLPAIATLKFIIIF
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pF1KSD YVKKTSLLANCQAPRRPWLASHMSTVFLTLLCFPAFLGAAVFLCYAVWQVKPSSTCGPFR
:::. ::: .:. ::. ::. . :: .: . : : . : .. .. :..::::
CCDS53 YVKEWSLLYTCRPSPRPFRASNSNFFFLLVLLIGLCL-AIIPLTISISRIPSSKACGPFT
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pF1KSD TLDTMYEAGRVWVRHLEAAGPRVSWLPWVHRYLMENTFFVFLVSALLLAVIYLNIQVVRG
...: .:. . . .. : : ..: : .: : . . : ..:. : .. .
CCDS53 NFNTTWEV----IPKTVSTFPS-SLQSFIHGVTSE-AFAVPFFMIICLIMFYF-IALAGA
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pF1KSD QRKVICLLKEQISNEGEDKIFLINKLHSIYERKEREERSRVGTTEEAAAPPALLTDEQDA
...:. :.::.: :..:: .::.::
CCDS53 HKRVVIQLREQLSLESRDKCYLIQKLTEAQRDMRN
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CCDS10 IARRRTTVHSRDKQSGTLLKPTDSYSSQLEDRIAENLSSHSLRNYALNISEKRRLRDIQE
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CCDS10 T-QMKYLSEWDQWKRYSSKSWKRFLEKAREMTTHLEL---------WREDIRSIEGKFGT
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.. ::: ::. :. .: ...:.. ... : . . . . : ::
CCDS10 GIQSYFSFLRFLVLLNLVIFLIIFMLVLLPVLLTKYKITNSSFVLIPFKDMDKQCTVYPV
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:: .::.:.: . .: ..::::. .:: . .. :.
CCDS10 SSSGLIYFYSYIIDLLSGTGFLEETSLFYGHYT-----------IDGV----KFQNFTYD
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.::::: .. .:. .. . .: ...: . . : ... .: .::. .:..
CCDS10 LPLAYLLSTIASLALSLLWIVKRSVEGFKINL-IRSEEHFQSYCNKIFAGWDFCITNRSM
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. :.....: .:. : : ..:. . :. .: .. :. . : ::. . .
CCDS10 ADLKHSSLRYELRADLEEERMRQKIAERTSEETIRIYSLRLFLNCIVLAVLGACFYAIYV
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. ::: : : . . :.. .: :: .:. : :. .:.. . : . :: .:.
CCDS10 ATVFSQEHMKKEIDKMVFGENLFILYLPSIVITLANFITPMIFAKIIRYEDY-SPGFEIR
390 400 410 420 430 440
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..: : ....:: . .: . :: .. : : ::: ::::.:....
CCDS10 LTILRCVFMRLATICVLVFT-LGSKITSCDDDTCDLCGYNQKLYPCWETQVGQEMYKLMI
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pF1KSD MDFVLMLLDTLFGELVWRII-----SEKKLKRRRKPEFDIARNVLELIYGQTLTWLGVLF
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CCDS10 FDFIIILAVTLFVDFPRKLLVTYCSSCKLIQCWGQQEFAIPDNVLGIVYGQTICWIGAFF
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pF1KSD SPLLPAVQIIKLLLVFYVKKTSLLANCQAPRRPWLASHMSTVFLTLLCFPAFLGAAVFLC
::::::. .:....::::. ::: .:. ::. ::. . :: .: . : : . :
CCDS10 SPLLPAIATLKFIIIFYVKEWSLLYTCRPSPRPFRASNSNFFFLLVLLIGLCL-AIIPLT
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pF1KSD YAVWQVKPSSTCGPFRTLDTMYEAGRVWVRHLEAAGPRVSWLPWVHRYLMENTFFVFLVS
.. .. :..:::: ...: .:. . . .. : : ..: : .: : .
CCDS10 ISISRIPSSKACGPFTNFNTTWEV----IPKTVSTFPS-SLQSFIHGVTSE-AFAVPFFM
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pF1KSD ALLLAVIYLNIQVVRGQRKVICLLKEQISNEGEDKIFLINKLHSIYERKEREERSRVGTT
. : ..:. : .. ....:. :.::.: :..:: .::.::
CCDS10 IICLIMFYF-IALAGAHKRVVIQLREQLSLESRDKCYLIQKLTEAQRDMRN
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pF1KSD EEAAAPPALLTDEQDA
>>CCDS73837.1 TMC7 gene_id:79905|Hs108|chr16 (758 aa)
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pF1KSD TQSTATLRILASMPSRTIGRSRGAIISQYYNRTVQLRCRSSRPLLGNFVRSAWPSLRLYD
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CCDS73 MSESSGSALQPGRPSRQPAVHPENLSLDSSCFSSPPV--NFLQEL-PSYR--S
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pF1KSD LELDPTALEEEEKQS-LLVKELQSLAVAQRD--------HMLRGMPLSLAEKRSLREKSR
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CCDS73 IARRRTTVHSRDKQSGTLLKPTDSYSSQLEDRIAENLSSHSLRNYALNISEKRRLRDIQE
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pF1KSD TPRGKWRGQPGSGGVCSCCGRLRYACVLALHSLGLALLSALQALMPWRYALKRIGGQFGS
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CCDS73 T-QMKYLSEWDQWKRYSSKSWKRFLEKAREMTTHLEL---------WREDIRSIEGKFGT
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pF1KSD SVLSYFLFLKTLLAFNALLLLLLVAFIMGPQVAFPPALPGPAPV----------CT----
.. ::: ::. :. .: ...:.. ... : . . . . : ::
CCDS73 GIQSYFSFLRFLVLLNLVIFLIIFMLVLLPVLLTKYKITNSSFVLIPFKDMDKQCTVYPV
160 170 180 190 200 210
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pF1KSD ---GL--------ELLTGAGCFTHTVMYYGHYSNATLNQPCGSPLDGSQCTPRVGGLPYN
:: .::.:.: . .: ..::::. .:: . .. :.
CCDS73 SSSGLIYFYSYIIDLLSGTGFLEETSLFYGHYT-----------IDGV----KFQNFTYD
220 230 240 250 260
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pF1KSD MPLAYLSTVGVSFFITCITLVYSMAHSFGESYRVGSTSGIHAIT--VFCSWDYKVTQKRA
.::::: .. .:. .. . .: ...: . . : ... .: .::. .:..
CCDS73 LPLAYLLSTIASLALSLLWIVKRSVEGFKINL-IRSEEHFQSYCNKIFAGWDFCITNRSM
270 280 290 300 310 320
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pF1KSD SRLQQDNIRTRLKELLAEWQLRH--SPRSVCGRLRQAAV---LGLVWLLCLGTALGCAVA
. :.....: .:. : : ..:. . :. .: .. :. . : ::. . .
CCDS73 ADLKHSSLRYELRADLEEERMRQKIAERTSEETIRIYSLRLFLNCIVLAVLGACFYAIYV
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..: : ....:: . .: . :: .. : : ::: ::::.:....
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]