Result of FASTA (omim) for
pFN21ASDB0068
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0068, 1032 aa
1>>>pF1KSDB0068 1032 - 1032 aa - 1032 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.2169+/-0.000798; mu= -15.2094+/- 0.049
mean_var=616.0664+/-126.778, 0's: 0 Z-trim(115.0): 372 B-trim: 238 in 1/54
Lambda= 0.051673
statistics sampled from 24786 (25157) to 24786 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.615), E-opt: 0.2 (0.295), width: 16
Scan time: 15.770
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004975 (OMIM: 602821,604187) kinesin heavy chai (1032) 6605 509.3 4.4e-143
XP_016859551 (OMIM: 604593,615282) PREDICTED: kine ( 957) 4656 364.0 2.3e-99
NP_004513 (OMIM: 604593,615282) kinesin heavy chai ( 957) 4656 364.0 2.3e-99
NP_004512 (OMIM: 602809) kinesin-1 heavy chain [Ho ( 963) 4384 343.7 2.9e-93
XP_016871713 (OMIM: 602809) PREDICTED: kinesin-1 h ( 869) 3920 309.1 7e-83
XP_011509459 (OMIM: 604593,615282) PREDICTED: kine ( 725) 3231 257.6 1.8e-67
XP_006714589 (OMIM: 604683) PREDICTED: kinesin-lik ( 724) 969 89.0 1e-16
NP_001287720 (OMIM: 604683) kinesin-like protein K ( 726) 969 89.0 1e-16
NP_004789 (OMIM: 603754) kinesin-like protein KIF3 ( 747) 953 87.8 2.4e-16
XP_016864484 (OMIM: 604683) PREDICTED: kinesin-lik ( 700) 948 87.4 3e-16
NP_001287721 (OMIM: 604683) kinesin-like protein K ( 702) 948 87.4 3e-16
XP_016864485 (OMIM: 604683) PREDICTED: kinesin-lik ( 697) 931 86.1 7.2e-16
NP_008985 (OMIM: 604683) kinesin-like protein KIF3 ( 699) 931 86.1 7.2e-16
XP_016863148 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2551) 925 86.3 2.4e-15
XP_011529851 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2553) 925 86.3 2.4e-15
XP_011529850 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2604) 925 86.3 2.4e-15
XP_011529849 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2605) 925 86.3 2.4e-15
XP_011529848 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2633) 925 86.3 2.4e-15
XP_011529847 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2648) 925 86.3 2.4e-15
NP_001804 (OMIM: 117143,616051) centromere-associa (2701) 925 86.3 2.5e-15
NP_001092763 (OMIM: 609184) chromosome-associated (1234) 910 84.8 3.2e-15
NP_036442 (OMIM: 300521,300923) chromosome-associa (1232) 899 84.0 5.6e-15
NP_001273663 (OMIM: 117143,616051) centromere-asso (2580) 873 82.4 3.5e-14
XP_011529846 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2676) 873 82.4 3.6e-14
XP_005246008 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik ( 984) 859 80.9 3.8e-14
XP_005246007 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik ( 985) 859 80.9 3.8e-14
XP_011540147 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik ( 992) 859 80.9 3.8e-14
XP_011540146 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik ( 997) 859 80.9 3.8e-14
XP_011540145 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1017) 859 80.9 3.9e-14
NP_001116291 (OMIM: 605037) kinesin-like protein K (1028) 859 80.9 3.9e-14
NP_065867 (OMIM: 605037) kinesin-like protein KIF1 (1029) 859 80.9 3.9e-14
XP_011540144 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1031) 859 80.9 3.9e-14
XP_011540143 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1038) 859 81.0 3.9e-14
XP_011540142 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1042) 859 81.0 3.9e-14
XP_011540141 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1043) 859 81.0 3.9e-14
XP_011540140 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1062) 859 81.0 4e-14
XP_011540139 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1063) 859 81.0 4e-14
NP_112494 (OMIM: 611271) kinesin-like protein KIF1 ( 898) 743 72.2 1.4e-11
XP_016873868 (OMIM: 611271) PREDICTED: kinesin-lik ( 898) 743 72.2 1.4e-11
NP_904325 (OMIM: 118210,171300,256700,605995) kine (1153) 746 72.6 1.4e-11
NP_055889 (OMIM: 118210,171300,256700,605995) kine (1770) 746 72.8 1.9e-11
NP_001252506 (OMIM: 614570) kinesin-like protein K ( 852) 733 71.5 2.3e-11
XP_011522690 (OMIM: 614570) PREDICTED: kinesin-lik ( 861) 733 71.5 2.3e-11
XP_011522693 (OMIM: 614570) PREDICTED: kinesin-lik ( 437) 721 70.3 2.7e-11
NP_001305643 (OMIM: 604535) kinesin-like protein K ( 687) 724 70.7 3.2e-11
NP_001123571 (OMIM: 604535) kinesin-like protein K ( 687) 724 70.7 3.2e-11
NP_001305644 (OMIM: 604535) kinesin-like protein K ( 687) 724 70.7 3.2e-11
XP_011521381 (OMIM: 604535) PREDICTED: kinesin-lik ( 694) 724 70.7 3.2e-11
XP_011521380 (OMIM: 604535) PREDICTED: kinesin-lik ( 694) 724 70.7 3.2e-11
NP_001305641 (OMIM: 604535) kinesin-like protein K ( 724) 724 70.7 3.3e-11
>>NP_004975 (OMIM: 602821,604187) kinesin heavy chain is (1032 aa)
initn: 6605 init1: 6605 opt: 6605 Z-score: 2689.8 bits: 509.3 E(85289): 4.4e-143
Smith-Waterman score: 6605; 99.9% identity (100.0% similar) in 1032 aa overlap (1-1032:1-1032)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRGDKFIPIFQGDDSVVIGGKPYVFDRVFPPNTTQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRGDKFIPIFQGDDSVVIGGKPYVFDRVFPPNTTQE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD QVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIARDIFNHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIARDIFNHI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD YSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTNLSVHEDKNRVPFVKGCTERFVSSPEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 YSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTNLSVHEDKNRVPFVKGCTERFVSSPEEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENMETEQKLSGKLYLVDLAGSEKVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENMETEQKLSGKLYLVDLAGSEKVS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD FICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKYEKEKEKTKAQKETI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKYEKEKEKTKAQKETI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD AKLEAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALGAELCEETPVNDNSSIVVRIAPEERQKYEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AKLEAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALGAELCEETPVNDNSSIVVRIAPEERQKYEEE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD IRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQSENDAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 IRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQSENDAA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQRLQEVS
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KDEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQRLQEVS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD GHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVARLYISKIKSEVKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVARLYISKIKSEVKS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD VVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELSSCQLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKKRHLEES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELSSCQLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKKRHLEES
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD YDSLSDELAKLQAQETVHEVALKDKEPDTQDADEVKKALELQMESHREAHHRQLARLRDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 YDSLSDELAKLQAQETVHEVALKDKEPDTQDADEVKKALELQMESHREAHHRQLARLRDE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD INEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQADYEKLKSEEHEKSTKLQELTFLYERHEQSKQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 INEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQADYEKLKSEEHEKSTKLQELTFLYERHEQSKQDL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD KGLEETVARELQTLHNLRKLFVQDVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQKQKISFLENNLEQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KGLEETVARELQTLHNLRKLFVQDVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQKQKISFLENNLEQL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD TKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALEGALKEAKEGAMKDKRRYQQEVDRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALEGALKEAKEGAMKDKRRYQQEVDRI
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD KEAVRYKSSGKRGHSAQIAKPVRPGHYPASSPTNPYGTRSPECISYTNSLFQNYQNLYLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KEAVRYKSSGKRGHSAQIAKPVRPGHYPASSPTNPYGTRSPECISYTNSLFQNYQNLYLQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD ATPSSTSDMYFANSCTSSGATSSGGPLASYQKANMDNGNATDINDNRSDLPCGYEAEDQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ATPSSTSDMYFANSCTSSGATSSGGPLASYQKANMDNGNATDINDNRSDLPCGYEAEDQA
970 980 990 1000 1010 1020
1030
pF1KSD KLFPLHQETAAS
::::::::::::
NP_004 KLFPLHQETAAS
1030
>>XP_016859551 (OMIM: 604593,615282) PREDICTED: kinesin (957 aa)
initn: 4634 init1: 3190 opt: 4656 Z-score: 1905.0 bits: 364.0 E(85289): 2.3e-99
Smith-Waterman score: 4656; 75.3% identity (92.4% similar) in 952 aa overlap (7-952:6-956)
10 20 30 40 50
pF1KSD MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRGDKFIPIFQGDDSVVIG-GKPYVFDRVFPPNTTQ
::::::.:::::::.::::::::::: :.::..:::: :::::::::.::::::
XP_016 MADPAECSIKVMCRFRPLNEAEILRGDKFIPKFKGDETVVIGQGKPYVFDRVLPPNTTQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD EQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIARDIFNH
::::.::: ::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:
XP_016 EQVYNACAKQIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIAHDIFDH
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD IYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTNLSVHEDKNRVPFVKGCTERFVSSPEE
::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:::::::::.::::::::::::::
XP_016 IYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLAVHEDKNRVPYVKGCTERFVSSPEE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENMETEQKLSGKLYLVDLAGSEKV
..:::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::
XP_016 VMDVIDEGKANRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENVETEKKLSGKLYLVDLAGSEKV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::::
XP_016 SKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKTHVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD MFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKYEKEKEKTKAQKET
. :::::: .:.:::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::.:. :..
XP_016 IVICCSPSVFNEAETKSTLMFGQRAKTIKNTVSVNLELTAEEWKKKYEKEKEKNKTLKNV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD IAKLEAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALGAELCEETPVNDN-SSIVVRIAPEERQKYE
: .:: ::.:::::: ::: :...... . : :..::. :: . .:. :. ::..::.
XP_016 IQHLEMELNRWRNGEAVPEDEQISAKDQK-NLEPCDNTPIIDNIAPVVAGISTEEKEKYD
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD EEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQSEND
::: ::.::::::::::::::: ::::::::::.:::.::: : ::.:.::..:: ::.
XP_016 EEISSLYRQLDDKDDEINQQSQLAEKLKQQMLDQDELLASTRRDYEKIQEELTRLQIENE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD AAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQRLQE
:::::::::::.::::::::::::::::.:.. :. :.:::.::..:. . . ::..:::
XP_016 AAKDEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEDKTRANEQLTDELAQKTTTLTTTQRELSQLQE
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD VSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVARLYISKIKSEV
.:.::.:: .:.:: :.:::.:.. :.:....: ....:.::::::.:::::::.::::
XP_016 LSNHQKKRATEILNLLLKDLGEIGGIIGTNDVKTLADVNGVIEEEFTMARLYISKMKSEV
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD KSVVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELSSCQLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKKRHLE
::.:.: .:::. :.. .:::... :::..::::::::::::.:::.:::..: :.:.::
XP_016 KSLVNRSKQLESAQMDSNRKMNASERELAACQLLISQHEAKIKSLTDYMQNMEQKRRQLE
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KSD ESYDSLSDELAKLQAQETVHEVALKDKEPD----TQDADEVKKALELQMESHREAHHRQL
:: ::::.:::::.::: .:::...::: . :::.:.::::: :::::::::..::
XP_016 ESQDSLSEELAKLRAQEKMHEVSFQDKEKEHLTRLQDAEEMKKALEQQMESHREAHQKQL
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KSD ARLRDEINEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQADYEKLKSEEHEKSTKLQELTFLYERHE
.::::::.:::: :::..::::::::: :::..::.::: :..:. ::..: .: ...:
XP_016 SRLRDEIEEKQKIIDEIRDLNQKLQLEQEKLSSDYNKLKIEDQEREMKLEKLLLLNDKRE
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KSD QSKQDLKGLEETVARELQTLHNLRKLFVQDVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQKQKISFLE
:...:::::::::.::::::::::::::::.:::::::.:.. .:.:: .:::::::::
XP_016 QAREDLKGLEETVSRELQTLHNLRKLFVQDLTTRVKKSVELDNDDGGGSAAQKQKISFLE
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KSD NNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALEGALKEAKEGAMKDKRRYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::.:..:::
XP_016 NNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALESALKEAKENAMRDRKRYQ
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KSD QEVDRIKEAVRYKSSGKRGHSAQIAKPVRPGHYPASSPTNPYGTRSPECISYTNSLFQNY
::::::::::: :. ..:.::::::::.::::::::::: .. :. : ... .:
XP_016 QEVDRIKEAVRAKNMARRAHSAQIAKPIRPGHYPASSPTAVHAIRGGGGSSSNSTHYQK
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960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD QNLYLQATPSSTSDMYFANSCTSSGATSSGGPLASYQKANMDNGNATDINDNRSDLPCGY
>>NP_004513 (OMIM: 604593,615282) kinesin heavy chain is (957 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KSD MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRGDKFIPIFQGDDSVVIG-GKPYVFDRVFPPNTTQ
::::::.:::::::.::::::::::: :.::..:::: :::::::::.::::::
NP_004 MADPAECSIKVMCRFRPLNEAEILRGDKFIPKFKGDETVVIGQGKPYVFDRVLPPNTTQ
10 20 30 40 50
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pF1KSD EQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIARDIFNH
::::.::: ::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:
NP_004 EQVYNACAKQIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIAHDIFDH
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD IYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTNLSVHEDKNRVPFVKGCTERFVSSPEE
::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:::::::::.::::::::::::::
NP_004 IYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLAVHEDKNRVPYVKGCTERFVSSPEE
120 130 140 150 160 170
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..:::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::
NP_004 VMDVIDEGKANRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENVETEKKLSGKLYLVDLAGSEKV
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::::
NP_004 SKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKTHVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTT
240 250 260 270 280 290
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pF1KSD MFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKYEKEKEKTKAQKET
. :::::: .:.:::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::.:. :..
NP_004 IVICCSPSVFNEAETKSTLMFGQRAKTIKNTVSVNLELTAEEWKKKYEKEKEKNKTLKNV
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pF1KSD IAKLEAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALGAELCEETPVNDN-SSIVVRIAPEERQKYE
: .:: ::.:::::: ::: :...... . : :..::. :: . .:. :. ::..::.
NP_004 IQHLEMELNRWRNGEAVPEDEQISAKDQK-NLEPCDNTPIIDNIAPVVAGISTEEKEKYD
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pF1KSD EEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQSEND
::: ::.::::::::::::::: ::::::::::.:::.::: : ::.:.::..:: ::.
NP_004 EEISSLYRQLDDKDDEINQQSQLAEKLKQQMLDQDELLASTRRDYEKIQEELTRLQIENE
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pF1KSD AAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQRLQE
:::::::::::.::::::::::::::::.:.. :. :.:::.::..:. . . ::..:::
NP_004 AAKDEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEDKTRANEQLTDELAQKTTTLTTTQRELSQLQE
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NP_004 LSNHQKKRATEILNLLLKDLGEIGGIIGTNDVKTLADVNGVIEEEFTMARLYISKMKSEV
540 550 560 570 580 590
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pF1KSD KSVVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELSSCQLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKKRHLE
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NP_004 KSLVNRSKQLESAQMDSNRKMNASERELAACQLLISQHEAKIKSLTDYMQNMEQKRRQLE
600 610 620 630 640 650
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pF1KSD ESYDSLSDELAKLQAQETVHEVALKDKEPD----TQDADEVKKALELQMESHREAHHRQL
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NP_004 ESQDSLSEELAKLRAQEKMHEVSFQDKEKEHLTRLQDAEEMKKALEQQMESHREAHQKQL
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pF1KSD ARLRDEINEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQADYEKLKSEEHEKSTKLQELTFLYERHE
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NP_004 SRLRDEIEEKQKIIDEIRDLNQKLQLEQEKLSSDYNKLKIEDQEREMKLEKLLLLNDKRE
720 730 740 750 760 770
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pF1KSD QSKQDLKGLEETVARELQTLHNLRKLFVQDVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQKQKISFLE
:...:::::::::.::::::::::::::::.:::::::.:.. .:.:: .:::::::::
NP_004 QAREDLKGLEETVSRELQTLHNLRKLFVQDLTTRVKKSVELDNDDGGGSAAQKQKISFLE
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pF1KSD NNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALEGALKEAKEGAMKDKRRYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::.:..:::
NP_004 NNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALESALKEAKENAMRDRKRYQ
840 850 860 870 880 890
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pF1KSD QEVDRIKEAVRYKSSGKRGHSAQIAKPVRPGHYPASSPTNPYGTRSPECISYTNSLFQNY
::::::::::: :. ..:.::::::::.::::::::::: .. :. : ... .:
NP_004 QEVDRIKEAVRAKNMARRAHSAQIAKPIRPGHYPASSPTAVHAIRGGGGSSSNSTHYQK
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD QNLYLQATPSSTSDMYFANSCTSSGATSSGGPLASYQKANMDNGNATDINDNRSDLPCGY
>>NP_004512 (OMIM: 602809) kinesin-1 heavy chain [Homo s (963 aa)
initn: 4366 init1: 1521 opt: 4384 Z-score: 1795.3 bits: 343.7 E(85289): 2.9e-93
Smith-Waterman score: 4384; 72.0% identity (90.4% similar) in 939 aa overlap (7-939:6-941)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRGDKFIPIFQGDDSVVIGGKPYVFDRVFPPNTTQE
::.:::.:::::::..:. ::::.: :::.:.:::..:::.::::: .:.::
NP_004 MADLAECNIKVMCRFRPLNESEVNRGDKYIAKFQGEDTVVIASKPYAFDRVFQSSTSQE
10 20 30 40 50
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pF1KSD QVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIARDIFNHI
:::. :: .:::::: :::::::::::::::::::::::::::. :::::::..::::.:
NP_004 QVYNDCAKKIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPEGMGIIPRIVQDIFNYI
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD YSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTNLSVHEDKNRVPFVKGCTERFVSSPEEI
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::: ::.:.
NP_004 YSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLSVHEDKNRVPYVKGCTERFVCSPDEV
120 130 140 150 160 170
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pF1KSD LDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENMETEQKLSGKLYLVDLAGSEKVS
.:.:::::::::::::::::::::::::::::.:::: .:::::::::::::::::::::
NP_004 MDTIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINVKQENTQTEQKLSGKLYLVDLAGSEKVS
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pF1KSD KTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTM
::::::::::::::::::::::::::::::::. .::::::::::::::::::::::::.
NP_004 KTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGS-TYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTI
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pF1KSD FICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKYEKEKEKTKAQKETI
:::::::::..::::::.:::::::::::. ::.:::::::::::::::::.: ..::
NP_004 VICCSPSSYNESETKSTLLFGQRAKTIKNTVCVNVELTAEQWKKKYEKEKEKNKILRNTI
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD AKLEAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALGAELCEE--TPVNDNSSIVVRI----APEER
:: ::.::::::.:: :.. :.: : : .. : .::. . .. . . ::
NP_004 QWLENELNRWRNGETVPIDEQFDKEKANLEAFTVDKDITLTNDKPATAIGVIGNFTDAER
360 370 380 390 400 410
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pF1KSD QKYEEEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQ
.: :::: .:::::::::.::::::::.:::: :::::::::.::: :....: ::..::
NP_004 RKCEEEIAKLYKQLDDKDEEINQQSQLVEKLKTQMLDQEELLASTRRDQDNMQAELNRLQ
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pF1KSD SENDAAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQ
.::::.:.:::::::.::::::::::::::::.:... .:: :::.:: ::. :...:::
NP_004 AENDASKEEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEDKTKEYELLSDELNQKSATLASIDAELQ
480 490 500 510 520 530
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pF1KSD RLQEVSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVARLYISKI
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NP_004 KLKEMTNHQKKRAAEMMASLLKDLAEIGIAVGNNDVKQP-EGTGMIDEEFTVARLYISKM
540 550 560 570 580 590
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pF1KSD KSEVKSVVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELSSCQLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKK
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NP_004 KSEVKTMVKRCKQLESTQTESNKKMEENEKELAACQLRISQHEAKIKSLTEYLQNVEQKK
600 610 620 630 640 650
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pF1KSD RHLEESYDSLSDELAKLQAQETVHEVALKDKEPDTQDADEVKKALELQMESHREAHHRQL
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NP_004 RQLEESVDALSEELVQLRAQEKVHEME-KEHLNKVQTANEVKQAVEQQIQSHRETHQKQI
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pF1KSD ARLRDEINEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQADYEKLKSEEHEKSTKLQELTFLYERHE
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NP_004 SSLRDEVEAKAKLITDLQDQNQKMMLEQERLRVEHEKLKATDQEKSRKLHELTVMQDRRE
720 730 740 750 760 770
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pF1KSD QSKQDLKGLEETVARELQTLHNLRKLFVQDVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQKQKISFLE
:..:::::::::::.:::::::::::::::..::::::::.. .:.:: .:::::::::
NP_004 QARQDLKGLEETVAKELQTLHNLRKLFVQDLATRVKKSAEIDSDDTGGSAAQKQKISFLE
780 790 800 810 820 830
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pF1KSD NNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALEGALKEAKEGAMKDKRRYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.: .:..:::
NP_004 NNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALESALKEAKENASRDRKRYQ
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KSD QEVDRIKEAVRYKSSGKRGHSAQIAKPVRPGHYPASSPTNPYGTRSPECISYTNSLFQNY
::::::::::: :. ..::::::::::.:::..::.:::.: . :
NP_004 QEVDRIKEAVRSKNMARRGHSAQIAKPIRPGQHPAASPTHPSAIRGGGAFVQNSQPVAVR
900 910 920 930 940 950
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pF1KSD QNLYLQATPSSTSDMYFANSCTSSGATSSGGPLASYQKANMDNGNATDINDNRSDLPCGY
NP_004 GGGGKQV
960
>>XP_016871713 (OMIM: 602809) PREDICTED: kinesin-1 heavy (869 aa)
initn: 3902 init1: 1159 opt: 3920 Z-score: 1608.9 bits: 309.1 E(85289): 7e-83
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70 80 90 100 110 120
pF1KSD CAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIARDIFNHIYSMDE
::::::::. :::::::..::::.::::::
XP_016 MEGKLHDPEGMGIIPRIVQDIFNYIYSMDE
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130 140 150 160 170 180
pF1KSD NLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTNLSVHEDKNRVPFVKGCTERFVSSPEEILDVID
::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::: ::.:..:.::
XP_016 NLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLSVHEDKNRVPYVKGCTERFVCSPDEVMDTID
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pF1KSD EGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENMETEQKLSGKLYLVDLAGSEKVSKTGAE
:::::::::::::::::::::::::::.:::: .::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINVKQENTQTEQKLSGKLYLVDLAGSEKVSKTGAE
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTMFICCS
:::::::::::::::::::::::::::. .::::::::::::::::::::::::. ::::
XP_016 GAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGS-TYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTIVICCS
160 170 180 190 200
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pF1KSD PSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKYEKEKEKTKAQKETIAKLEA
:::::..::::::.:::::::::::. ::.:::::::::::::::::.: ..:: ::
XP_016 PSSYNESETKSTLLFGQRAKTIKNTVCVNVELTAEQWKKKYEKEKEKNKILRNTIQWLEN
210 220 230 240 250 260
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pF1KSD ELSRWRNGENVPETERLAGEEAALGAELCEE--TPVNDNSSIVVRI----APEERQKYEE
::.::::::.:: :.. :.: : : .. : .::. . .. . . ::.: ::
XP_016 ELNRWRNGETVPIDEQFDKEKANLEAFTVDKDITLTNDKPATAIGVIGNFTDAERRKCEE
270 280 290 300 310 320
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pF1KSD EIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQSENDA
:: .:::::::::.::::::::.:::: :::::::::.::: :....: ::..::.::::
XP_016 EIAKLYKQLDDKDEEINQQSQLVEKLKTQMLDQEELLASTRRDQDNMQAELNRLQAENDA
330 340 350 360 370 380
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pF1KSD AKDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQRLQEV
.:.:::::::.::::::::::::::::.:... .:: :::.:: ::. :...:::.:.:.
XP_016 SKEEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEDKTKEYELLSDELNQKSATLASIDAELQKLKEM
390 400 410 420 430 440
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pF1KSD SGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVARLYISKIKSEVK
..::.:: ::.. .:.:::.:... :::...: : : .: :.::::::::::::.:::::
XP_016 TNHQKKRAAEMMASLLKDLAEIGIAVGNNDVKQP-EGTGMIDEEFTVARLYISKMKSEVK
450 460 470 480 490 500
600 610 620 630 640 650
pF1KSD SVVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELSSCQLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKKRHLEE
..::::.:::. :.: ..::: . .::..::: ::::::::.:::::.:.:: :::.:::
XP_016 TMVKRCKQLESTQTESNKKMEENEKELAACQLRISQHEAKIKSLTEYLQNVEQKKRQLEE
510 520 530 540 550 560
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pF1KSD SYDSLSDELAKLQAQETVHEVALKDKEPDTQDADEVKKALELQMESHREAHHRQLARLRD
: :.::.::..:.::: :::. :.. .: :.:::.:.: :..::::.:..:.. :::
XP_016 SVDALSEELVQLRAQEKVHEME-KEHLNKVQTANEVKQAVEQQIQSHRETHQKQISSLRD
570 580 590 600 610 620
720 730 740 750 760 770
pF1KSD EINEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQADYEKLKSEEHEKSTKLQELTFLYERHEQSKQD
:.. : : : .:.: :::..:: :.:....::::. ..::: ::.::: . .:.::..::
XP_016 EVEAKAKLITDLQDQNQKMMLEQERLRVEHEKLKATDQEKSRKLHELTVMQDRREQARQD
630 640 650 660 670 680
780 790 800 810 820 830
pF1KSD LKGLEETVARELQTLHNLRKLFVQDVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQKQKISFLENNLEQ
:::::::::.:::::::::::::::..::::::::.. .:.:: .::::::::::::::
XP_016 LKGLEETVAKELQTLHNLRKLFVQDLATRVKKSAEIDSDDTGGSAAQKQKISFLENNLEQ
690 700 710 720 730 740
840 850 860 870 880 890
pF1KSD LTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALEGALKEAKEGAMKDKRRYQQEVDR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.: .:..::::::::
XP_016 LTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALESALKEAKENASRDRKRYQQEVDR
750 760 770 780 790 800
900 910 920 930 940 950
pF1KSD IKEAVRYKSSGKRGHSAQIAKPVRPGHYPASSPTNPYGTRSPECISYTNSLFQNYQNLYL
:::::: :. ..::::::::::.:::..::.:::.: . :
XP_016 IKEAVRSKNMARRGHSAQIAKPIRPGQHPAASPTHPSAIRGGGAFVQNSQPVAVRGGGGK
810 820 830 840 850 860
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD QATPSSTSDMYFANSCTSSGATSSGGPLASYQKANMDNGNATDINDNRSDLPCGYEAEDQ
XP_016 QV
>>XP_011509459 (OMIM: 604593,615282) PREDICTED: kinesin (725 aa)
initn: 3211 init1: 1978 opt: 3231 Z-score: 1332.3 bits: 257.6 E(85289): 1.8e-67
Smith-Waterman score: 3231; 70.2% identity (90.5% similar) in 719 aa overlap (239-952:7-724)
210 220 230 240 250 260
pF1KSD FLINIKQENMETEQKLSGKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISA
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MATYIHVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISA
10 20 30
270 280 290 300 310 320
pF1KSD LAEGTKSYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTMFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIK
::::::..:::::::::::::::::::::::. :::::: .:.:::::::::::::::::
XP_011 LAEGTKTHVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTIVICCSPSVFNEAETKSTLMFGQRAKTIK
40 50 60 70 80 90
330 340 350 360 370 380
pF1KSD NTASVNLELTAEQWKKKYEKEKEKTKAQKETIAKLEAELSRWRNGENVPETERLAGEEAA
::.:::::::::.:::::::::::.:. :..: .:: ::.:::::: ::: :......
XP_011 NTVSVNLELTAEEWKKKYEKEKEKNKTLKNVIQHLEMELNRWRNGEAVPEDEQISAKDQK
100 110 120 130 140 150
390 400 410 420 430 440
pF1KSD LGAELCEETPVNDN-SSIVVRIAPEERQKYEEEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQ
. : :..::. :: . .:. :. ::..::.::: ::.::::::::::::::: :::::
XP_011 -NLEPCDNTPIIDNIAPVVAGISTEEKEKYDEEISSLYRQLDDKDDEINQQSQLAEKLKQ
160 170 180 190 200 210
450 460 470 480 490 500
pF1KSD QMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQSENDAAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEE
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XP_011 QMLDQDELLASTRRDYEKIQEELTRLQIENEAAKDEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVED
220 230 240 250 260 270
510 520 530 540 550 560
pF1KSD KSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQRLQEVSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGN
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XP_011 KTRANEQLTDELAQKTTTLTTTQRELSQLQELSNHQKKRATEILNLLLKDLGEIGGIIGT
280 290 300 310 320 330
570 580 590 600 610 620
pF1KSD GEIKLPVEISGAIEEEFTVARLYISKIKSEVKSVVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELS
...: ....:.::::::.:::::::.::::::.:.: .:::. :.. .:::... :::.
XP_011 NDVKTLADVNGVIEEEFTMARLYISKMKSEVKSLVNRSKQLESAQMDSNRKMNASERELA
340 350 360 370 380 390
630 640 650 660 670 680
pF1KSD SCQLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKKRHLEESYDSLSDELAKLQAQETVHEVALKDKEP
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XP_011 ACQLLISQHEAKIKSLTDYMQNMEQKRRQLEESQDSLSEELAKLRAQEKMHEVSFQDKEK
400 410 420 430 440 450
690 700 710 720 730 740
pF1KSD D----TQDADEVKKALELQMESHREAHHRQLARLRDEINEKQKTIDELKDLNQKLQLELE
. :::.:.::::: :::::::::..::.::::::.:::: :::..::::::::: :
XP_011 EHLTRLQDAEEMKKALEQQMESHREAHQKQLSRLRDEIEEKQKIIDEIRDLNQKLQLEQE
460 470 480 490 500 510
750 760 770 780 790 800
pF1KSD KLQADYEKLKSEEHEKSTKLQELTFLYERHEQSKQDLKGLEETVARELQTLHNLRKLFVQ
::..::.::: :..:. ::..: .: ...::...:::::::::.:::::::::::::::
XP_011 KLSSDYNKLKIEDQEREMKLEKLLLLNDKREQAREDLKGLEETVSRELQTLHNLRKLFVQ
520 530 540 550 560 570
810 820 830 840 850 860
pF1KSD DVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQKQKISFLENNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEK
:.:::::::.:.. .:.:: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DLTTRVKKSVELDNDDGGGSAAQKQKISFLENNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEK
580 590 600 610 620 630
870 880 890 900 910 920
pF1KSD RLRATAERVKALEGALKEAKEGAMKDKRRYQQEVDRIKEAVRYKSSGKRGHSAQIAKPVR
:::::::::::::.:::::::.::.:..:::::::::::::: :. ..:.::::::::.:
XP_011 RLRATAERVKALESALKEAKENAMRDRKRYQQEVDRIKEAVRAKNMARRAHSAQIAKPIR
640 650 660 670 680 690
930 940 950 960 970 980
pF1KSD PGHYPASSPTNPYGTRSPECISYTNSLFQNYQNLYLQATPSSTSDMYFANSCTSSGATSS
:::::::::: .. :. : ... .:
XP_011 PGHYPASSPTAVHAIRGGGGSSSNSTHYQK
700 710 720
>>XP_006714589 (OMIM: 604683) PREDICTED: kinesin-like pr (724 aa)
initn: 881 init1: 407 opt: 969 Z-score: 421.0 bits: 89.0 E(85289): 1e-16
Smith-Waterman score: 1002; 32.8% identity (60.2% similar) in 716 aa overlap (2-676:6-699)
10 20 30 40
pF1KSD MAETNNEC-SIKVLCRFRPLNQAEI------------LRGDKFIPIFQGDDSVVIG
.: . : ..::. : ::::. : .:: : . . :.:
XP_006 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGT--ITVHKTDSSNE-P
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KSD GKPYVFDRVFPPNTTQEQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDP
: ..:: :: :.. : .::. : :. .:: ::::::::::::..::: :::: :
XP_006 PKTFTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD QLMGIIPRIARDIFNHIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTN-LSVHEDKNR
.: :::: ::.:: . . . .: ..:::.::: ...:::: .:. : :.: .
XP_006 ELRGIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD VPFVKGCTERFVSSPEEILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIK--QENMET
..: . :.. ... .. :..:: :..:::::::::::.:: :.:. .....
XP_006 GVYIKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KSD EQKLS-GKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPY
.... :::.::::::::. .:::: : : :: .:: :::.::::::::..: ...:::
XP_006 NMHVRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPY
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD RDSKMTRILQDSLGGNCRTTMFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTA
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XP_006 RNSKLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETISTLRYANRAKNIKNKARIN-EDPK
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KSD EQWKKKYEKEKEKTKAQKETIAKL---------EAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALG
. ....:: :. : . : .. : . . . ::. . .. : .. .
XP_006 DALLRQFQKEIEELKKKLEEGEEISGSDISGSEEDDDEEGEVGEDGEKRKKRRGSSSSSS
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440
pF1KSD AE-LCE--ETPVND---NSSIVVRIAP----EERQKYEEEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQ
.. : : :.. :.. ...: : . : .:: . : .:: ...: :.
XP_006 SDSTCSVIEKPLDKFLPNQAGKKKVSPDKMIEMQAKIDEERKALETKLDMEEEERNKARA
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KSD LIEKLKQQMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQSENDAAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQ
.:: ....: .. ..... ..:: : :. . : ..: :: ..
XP_006 ELEKREKDLLKAQQ-------EHQSLLEKLSAL--EKKVIVGGV-DLLAKAEEQEKLLEE
480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KSD KSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQRLQEVSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSE
...:.::. .. . : :: .: :..: . ::: . . :.. .: . :: ::
XP_006 SNMELEERRKRAEQLRRELEEKEQERLDIEEKYTSLQEEAQGKTKKLKKVWTMLMAAKSE
530 540 550 560 570 580
570 580 590 600 610
pF1KSD FSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVAR-LYISKIKSEVKSVVKRCRQLENLQVECHRKM
.. . . . :: : .:. ..: : .. . . . . : : : .. : .
XP_006 MADL----QQEHQREIEGLLENIRQLSRELRLQMLI--IDNFIPRDYQ-EMIENYVHWNE
590 600 610 620 630
620 630 640 650 660 670
pF1KSD EVTGRELSSCQLLISQHEAKIRSLTEYMQS----VELKKRHLEESYDSLSDELAKLQAQE
.. :. .: ... : . . .. :.:.. .: . .:: . : ::. .
XP_006 DI-GEWQLKCVAYTGNNMRKQTPVPDKKEKDPFEVDLSHVYLAYTEESLRQSLMKLERPR
640 650 660 670 680 690
680 690 700 710 720 730
pF1KSD TVHEVALKDKEPDTQDADEVKKALELQMESHREAHHRQLARLRDEINEKQKTIDELKDLN
:
XP_006 TSKGKARPKTGRSSGAMVSSFIKRYH
700 710 720
>>NP_001287720 (OMIM: 604683) kinesin-like protein KIF3A (726 aa)
initn: 881 init1: 407 opt: 969 Z-score: 421.0 bits: 89.0 E(85289): 1e-16
Smith-Waterman score: 1002; 32.8% identity (60.2% similar) in 716 aa overlap (2-676:6-699)
10 20 30 40
pF1KSD MAETNNEC-SIKVLCRFRPLNQAEI------------LRGDKFIPIFQGDDSVVIG
.: . : ..::. : ::::. : .:: : . . :.:
NP_001 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGT--ITVHKTDSSNE-P
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KSD GKPYVFDRVFPPNTTQEQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDP
: ..:: :: :.. : .::. : :. .:: ::::::::::::..::: :::: :
NP_001 PKTFTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD QLMGIIPRIARDIFNHIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTN-LSVHEDKNR
.: :::: ::.:: . . . .: ..:::.::: ...:::: .:. : :.: .
NP_001 ELRGIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD VPFVKGCTERFVSSPEEILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIK--QENMET
..: . :.. ... .. :..:: :..:::::::::::.:: :.:. .....
NP_001 GVYIKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KSD EQKLS-GKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPY
.... :::.::::::::. .:::: : : :: .:: :::.::::::::..: ...:::
NP_001 NMHVRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPY
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD RDSKMTRILQDSLGGNCRTTMFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTA
:.::.::.:::::::: .: : .:..:: :: ::: ...:::.::: : .: :
NP_001 RNSKLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETISTLRYANRAKNIKNKARIN-EDPK
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KSD EQWKKKYEKEKEKTKAQKETIAKL---------EAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALG
. ....:: :. : . : .. : . . . ::. . .. : .. .
NP_001 DALLRQFQKEIEELKKKLEEGEEISGSDISGSEEDDDEEGEVGEDGEKRKKRRGSSSSSS
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440
pF1KSD AE-LCE--ETPVND---NSSIVVRIAP----EERQKYEEEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQ
.. : : :.. :.. ...: : . : .:: . : .:: ...: :.
NP_001 SDSTCSVIEKPLDKFLPNQAGKKKVSPDKMIEMQAKIDEERKALETKLDMEEEERNKARA
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KSD LIEKLKQQMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQSENDAAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQ
.:: ....: .. ..... ..:: : :. . : ..: :: ..
NP_001 ELEKREKDLLKAQQ-------EHQSLLEKLSAL--EKKVIVGGV-DLLAKAEEQEKLLEE
480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KSD KSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQRLQEVSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSE
...:.::. .. . : :: .: :..: . ::: . . :.. .: . :: ::
NP_001 SNMELEERRKRAEQLRRELEEKEQERLDIEEKYTSLQEEAQGKTKKLKKVWTMLMAAKSE
530 540 550 560 570 580
570 580 590 600 610
pF1KSD FSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVAR-LYISKIKSEVKSVVKRCRQLENLQVECHRKM
.. . . . :: : .:. ..: : .. . . . . : : : .. : .
NP_001 MADL----QQEHQREIEGLLENIRQLSRELRLQMLI--IDNFIPRDYQ-EMIENYVHWNE
590 600 610 620 630
620 630 640 650 660 670
pF1KSD EVTGRELSSCQLLISQHEAKIRSLTEYMQS----VELKKRHLEESYDSLSDELAKLQAQE
.. :. .: ... : . . .. :.:.. .: . .:: . : ::. .
NP_001 DI-GEWQLKCVAYTGNNMRKQTPVPDKKEKDPFEVDLSHVYLAYTEESLRQSLMKLERPR
640 650 660 670 680 690
680 690 700 710 720 730
pF1KSD TVHEVALKDKEPDTQDADEVKKALELQMESHREAHHRQLARLRDEINEKQKTIDELKDLN
:
NP_001 TSKGKARPKTGRRKRSAKPETVIDSLLQ
700 710 720
>>NP_004789 (OMIM: 603754) kinesin-like protein KIF3B [H (747 aa)
initn: 806 init1: 416 opt: 953 Z-score: 414.4 bits: 87.8 E(85289): 2.4e-16
Smith-Waterman score: 1014; 33.1% identity (62.9% similar) in 726 aa overlap (1-692:1-702)
10 20 30 40 50
pF1KSD MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRG-DKFIPIFQGDDSVVIGG---------KPYVFD
:.. .. :..:. : ::.: : . :: . . .: . . : ..::
NP_004 MSKLKSSESVRVVVRCRPMNGKEKAASYDKVVDVDVKLGQVSVKNPKGTAHEMPKTFTFD
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD RVFPPNTTQEQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIP
:. :. : ..: .: .:: :.::::::::::..:::.:::: ::. :.::
NP_004 AVYDWNAKQFELYDETFRPLVDSVLQGFNGTIFAYGQTGTGKTYTMEGIRGDPEKRGVIP
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pF1KSD RIARDIFNHIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTN-LSVHEDKNRVPFVKGC
::.:: : ..: .. ...::.::: ..:::::. .:. : ..: . .::
NP_004 NSFDHIFTHI-SRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKDQTKRLELKERPDTGVYVKDL
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD TERFVSSPEEILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIK--QENMETEQKLS-G
. ..: .:: :.. :..:: :..:::::::::::.::.:.:. . ... :... :
NP_004 SSFVTKSVKEIEHVMNVGNQNRSVGATNMNEHSSRSHAIFVITIECSEVGLDGENHIRVG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD KLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPYRDSKMTR
:: ::::::::. .::::.: : :: .:: ::::::::::::..: ....::::::.::
NP_004 KLNLVDLAGSERQAKTGAQGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGKSTHIPYRDSKLTR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD ILQDSLGGNCRTTMFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKY
.:::::::: .:.: .:.::: :: .:: ...:::.::: :: : . ...
NP_004 LLQDSLGGNAKTVMVANVGPASYNVEETLTTLRYANRAKNIKNKPRVN-EDPKDALLREF
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD EKEKEKTKAQ--KETIAKLEAELSRWRNGENVP--ETERLAGEEAALGAELCEETPVNDN
..: . ::: :..:.. . . .: ..: . : :. :::. .. .. ...
NP_004 QEEIARLKAQLEKRSIGRRKRREKRREGGGSGGGGEEEEEEGEEGEEEGDDKDDYWREQQ
360 370 380 390 400 410
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pF1KSD SSIVV--RIAPEERQKYEEEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQE-ELLVST
.. . : :... :: :: :. . : ... .... : : .. .: .:::.
NP_004 EKLEIEKRAIVEDHSLVAEEKMRLLKEKEKKMEDLRREKDAAEMLGAKIKAMESKLLVGG
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KSD RG----DNEKVQRELSHLQSENDAAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLL
.. ::. :. : . ..: : . .:. : .: . :... :..: .. :
NP_004 KNIVDHTNEQ-QKILEQKRQEIAEQKRREREIQQQME----SRDEETLELKETYSSLQQE
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KSD VDELSQKVATMLS----LESELQRLQEVSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIK
:: ..:. ..: ...:.. ::: ..:... .. : : ..:. .:. :
NP_004 VDIKTKKLKKLFSKLQAVKAEIHDLQEEHIKERQELEQTQNELTRELKLKHLIIENF---
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620
pF1KSD LPVEISGAIEEEFTVARLYISKIKSEVKSVVKRCRQLENLQVECHRKMEVTG--RELSSC
.:.: :. . : .... ... : .. .::: :. .: . ..: : ::.
NP_004 IPLE-----EKSKIMNRAFFDEEEDHWK--LHPITRLENQQMM-KRPVSAVGYKRPLSQH
600 610 620 630 640
630 640 650 660 670 680
pF1KSD --QLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKKRHLEESYDSLSDELA-KLQAQETVHEVALKDKE
. .. . ::. :. . . ... .: . : . .: :.:: . ..::.:..
NP_004 ARMSMMIRPEARYRAENIVLLELDMPSR---TTRDYEGPAIAPKVQA---ALDAALQDED
650 660 670 680 690
690 700 710 720 730 740
pF1KSD PDTQDADEVKKALELQMESHREAHHRQLARLRDEINEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQ
::
NP_004 EIQVDASSFESTANKKSKARPKSGRKSGSSSSSSGTPASQLYPQSRGLVPK
700 710 720 730 740
>>XP_016864484 (OMIM: 604683) PREDICTED: kinesin-like pr (700 aa)
initn: 881 init1: 407 opt: 948 Z-score: 412.7 bits: 87.4 E(85289): 3e-16
Smith-Waterman score: 1018; 33.5% identity (60.8% similar) in 701 aa overlap (2-676:6-675)
10 20 30 40
pF1KSD MAETNNEC-SIKVLCRFRPLNQAEI------------LRGDKFIPIFQGDDSVVIG
.: . : ..::. : ::::. : .:: : . . :.:
XP_016 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGT--ITVHKTDSSNE-P
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KSD GKPYVFDRVFPPNTTQEQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDP
: ..:: :: :.. : .::. : :. .:: ::::::::::::..::: :::: :
XP_016 PKTFTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD QLMGIIPRIARDIFNHIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTN-LSVHEDKNR
.: :::: ::.:: . . . .: ..:::.::: ...:::: .:. : :.: .
XP_016 ELRGIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD VPFVKGCTERFVSSPEEILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIK--QENMET
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