Result of FASTA (ccds) for pFN21ASDB0068
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDB0068, 1032 aa
  1>>>pF1KSDB0068 1032 - 1032 aa - 1032 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.6938+/-0.00177; mu= -7.1314+/- 0.104
 mean_var=450.9376+/-94.502, 0's: 0 Z-trim(107.1): 184  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.060397
 statistics sampled from 9215 (9356) to 9215 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.614), E-opt: 0.2 (0.287), width:  16
 Scan time:  4.870

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS8945.1 KIF5A gene_id:3798|Hs108|chr12          (1032) 6605 591.7 2.6e-168
CCDS74586.1 KIF5C gene_id:3800|Hs108|chr2          ( 957) 4656 421.9 3.2e-117
CCDS7171.1 KIF5B gene_id:3799|Hs108|chr10          ( 963) 4384 398.2 4.4e-110
CCDS75296.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5         ( 726)  969 100.5 1.4e-20
CCDS13200.1 KIF3B gene_id:9371|Hs108|chr20         ( 747)  953 99.1 3.7e-20
CCDS75295.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5         ( 702)  948 98.6 4.8e-20
CCDS34235.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5         ( 699)  931 97.2 1.3e-19
CCDS34042.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4          (2701)  925 97.2 4.9e-19
CCDS47324.1 KIF4B gene_id:285643|Hs108|chr5        (1234)  910 95.6   7e-19
CCDS14401.1 KIF4A gene_id:24137|Hs108|chrX         (1232)  899 94.6 1.4e-18
CCDS68768.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4          (2580)  873 92.7 1.1e-17
CCDS44079.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1         (1028)  859 91.1 1.3e-17
CCDS213.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1           (1029)  859 91.1 1.3e-17
CCDS33744.1 KIF15 gene_id:56992|Hs108|chr3         (1388)  816 87.4 2.2e-16
CCDS112.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1           (1153)  746 81.3 1.3e-14
CCDS7867.1 KIF18A gene_id:81930|Hs108|chr11        ( 898)  743 80.9 1.3e-14
CCDS111.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1           (1770)  746 81.4 1.8e-14
CCDS45709.2 KIF18B gene_id:146909|Hs108|chr17      ( 852)  733 80.0 2.4e-14
CCDS45494.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16         ( 687)  724 79.1 3.5e-14
CCDS81988.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16         ( 724)  724 79.1 3.7e-14
CCDS45493.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16         ( 826)  724 79.2   4e-14
CCDS10789.2 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16         ( 833)  724 79.2   4e-14
CCDS81989.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16         ( 848)  724 79.2 4.1e-14
CCDS58555.1 KIF18B gene_id:146909|Hs108|chr17      ( 833)  721 78.9 4.8e-14
CCDS4844.1 KIF6 gene_id:221458|Hs108|chr6          ( 814)  717 78.6 6.1e-14
CCDS81987.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16         ( 684)  712 78.1 7.2e-14
CCDS32718.2 KIF19 gene_id:124602|Hs108|chr17       ( 998)  710 78.1 1.1e-13
CCDS72722.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1         ( 929)  695 76.7 2.5e-13
CCDS58444.1 KIF22 gene_id:3835|Hs108|chr16         ( 597)  672 74.5 7.4e-13
CCDS7422.1 KIF11 gene_id:3832|Hs108|chr10          (1056)  678 75.3 7.7e-13
CCDS10653.1 KIF22 gene_id:3835|Hs108|chr16         ( 665)  672 74.6   8e-13
CCDS2751.1 KIF9 gene_id:64147|Hs108|chr3           ( 725)  645 72.3 4.3e-12
CCDS2752.1 KIF9 gene_id:64147|Hs108|chr3           ( 790)  645 72.3 4.6e-12


>>CCDS8945.1 KIF5A gene_id:3798|Hs108|chr12               (1032 aa)
 initn: 6605 init1: 6605 opt: 6605  Z-score: 3135.3  bits: 591.7 E(32554): 2.6e-168
Smith-Waterman score: 6605; 99.9% identity (100.0% similar) in 1032 aa overlap (1-1032:1-1032)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRGDKFIPIFQGDDSVVIGGKPYVFDRVFPPNTTQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRGDKFIPIFQGDDSVVIGGKPYVFDRVFPPNTTQE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD QVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIARDIFNHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 QVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIARDIFNHI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD YSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTNLSVHEDKNRVPFVKGCTERFVSSPEEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 YSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTNLSVHEDKNRVPFVKGCTERFVSSPEEI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD LDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENMETEQKLSGKLYLVDLAGSEKVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 LDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENMETEQKLSGKLYLVDLAGSEKVS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD KTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 KTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD FICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKYEKEKEKTKAQKETI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 FICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKYEKEKEKTKAQKETI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD AKLEAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALGAELCEETPVNDNSSIVVRIAPEERQKYEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 AKLEAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALGAELCEETPVNDNSSIVVRIAPEERQKYEEE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD IRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQSENDAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 IRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQSENDAA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD KDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQRLQEVS
       :::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 KDEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQRLQEVS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD GHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVARLYISKIKSEVKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 GHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVARLYISKIKSEVKS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD VVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELSSCQLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKKRHLEES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 VVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELSSCQLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKKRHLEES
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD YDSLSDELAKLQAQETVHEVALKDKEPDTQDADEVKKALELQMESHREAHHRQLARLRDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 YDSLSDELAKLQAQETVHEVALKDKEPDTQDADEVKKALELQMESHREAHHRQLARLRDE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD INEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQADYEKLKSEEHEKSTKLQELTFLYERHEQSKQDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 INEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQADYEKLKSEEHEKSTKLQELTFLYERHEQSKQDL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD KGLEETVARELQTLHNLRKLFVQDVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQKQKISFLENNLEQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 KGLEETVARELQTLHNLRKLFVQDVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQKQKISFLENNLEQL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD TKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALEGALKEAKEGAMKDKRRYQQEVDRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 TKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALEGALKEAKEGAMKDKRRYQQEVDRI
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD KEAVRYKSSGKRGHSAQIAKPVRPGHYPASSPTNPYGTRSPECISYTNSLFQNYQNLYLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 KEAVRYKSSGKRGHSAQIAKPVRPGHYPASSPTNPYGTRSPECISYTNSLFQNYQNLYLQ
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD ATPSSTSDMYFANSCTSSGATSSGGPLASYQKANMDNGNATDINDNRSDLPCGYEAEDQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 ATPSSTSDMYFANSCTSSGATSSGGPLASYQKANMDNGNATDINDNRSDLPCGYEAEDQA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030  
pF1KSD KLFPLHQETAAS
       ::::::::::::
CCDS89 KLFPLHQETAAS
             1030  

>>CCDS74586.1 KIF5C gene_id:3800|Hs108|chr2               (957 aa)
 initn: 4634 init1: 3190 opt: 4656  Z-score: 2217.9  bits: 421.9 E(32554): 3.2e-117
Smith-Waterman score: 4656; 75.3% identity (92.4% similar) in 952 aa overlap (7-952:6-956)

               10        20        30        40         50         
pF1KSD MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRGDKFIPIFQGDDSVVIG-GKPYVFDRVFPPNTTQ
             ::::::.:::::::.::::::::::: :.::..:::: :::::::::.::::::
CCDS74  MADPAECSIKVMCRFRPLNEAEILRGDKFIPKFKGDETVVIGQGKPYVFDRVLPPNTTQ
                10        20        30        40        50         

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD EQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIARDIFNH
       ::::.::: ::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:
CCDS74 EQVYNACAKQIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIAHDIFDH
      60        70        80        90       100       110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD IYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTNLSVHEDKNRVPFVKGCTERFVSSPEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:::::::::.::::::::::::::
CCDS74 IYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLAVHEDKNRVPYVKGCTERFVSSPEE
     120       130       140       150       160       170         

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD ILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENMETEQKLSGKLYLVDLAGSEKV
       ..:::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::
CCDS74 VMDVIDEGKANRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENVETEKKLSGKLYLVDLAGSEKV
     180       190       200       210       220       230         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KSD SKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::::
CCDS74 SKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKTHVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTT
     240       250       260       270       280       290         

     300       310       320       330       340       350         
pF1KSD MFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKYEKEKEKTKAQKET
       . :::::: .:.:::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::.:. :..
CCDS74 IVICCSPSVFNEAETKSTLMFGQRAKTIKNTVSVNLELTAEEWKKKYEKEKEKNKTLKNV
     300       310       320       330       340       350         

     360       370       380       390       400        410        
pF1KSD IAKLEAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALGAELCEETPVNDN-SSIVVRIAPEERQKYE
       : .:: ::.:::::: ::: :......   . : :..::. :: . .:. :. ::..::.
CCDS74 IQHLEMELNRWRNGEAVPEDEQISAKDQK-NLEPCDNTPIIDNIAPVVAGISTEEKEKYD
     360       370       380        390       400       410        

      420       430       440       450       460       470        
pF1KSD EEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQSEND
       :::  ::.::::::::::::::: ::::::::::.:::.::: : ::.:.::..:: ::.
CCDS74 EEISSLYRQLDDKDDEINQQSQLAEKLKQQMLDQDELLASTRRDYEKIQEELTRLQIENE
      420       430       440       450       460       470        

      480       490       500       510       520       530        
pF1KSD AAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQRLQE
       :::::::::::.::::::::::::::::.:.. :. :.:::.::..:. . . ::..:::
CCDS74 AAKDEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEDKTRANEQLTDELAQKTTTLTTTQRELSQLQE
      480       490       500       510       520       530        

      540       550       560       570       580       590        
pF1KSD VSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVARLYISKIKSEV
       .:.::.:: .:.:: :.:::.:.. :.:....:  ....:.::::::.:::::::.::::
CCDS74 LSNHQKKRATEILNLLLKDLGEIGGIIGTNDVKTLADVNGVIEEEFTMARLYISKMKSEV
      540       550       560       570       580       590        

      600       610       620       630       640       650        
pF1KSD KSVVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELSSCQLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKKRHLE
       ::.:.: .:::. :.. .:::... :::..::::::::::::.:::.:::..: :.:.::
CCDS74 KSLVNRSKQLESAQMDSNRKMNASERELAACQLLISQHEAKIKSLTDYMQNMEQKRRQLE
      600       610       620       630       640       650        

      660       670       680           690       700       710    
pF1KSD ESYDSLSDELAKLQAQETVHEVALKDKEPD----TQDADEVKKALELQMESHREAHHRQL
       :: ::::.:::::.::: .:::...::: .     :::.:.::::: :::::::::..::
CCDS74 ESQDSLSEELAKLRAQEKMHEVSFQDKEKEHLTRLQDAEEMKKALEQQMESHREAHQKQL
      660       670       680       690       700       710        

          720       730       740       750       760       770    
pF1KSD ARLRDEINEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQADYEKLKSEEHEKSTKLQELTFLYERHE
       .::::::.:::: :::..::::::::: :::..::.::: :..:.  ::..: .: ...:
CCDS74 SRLRDEIEEKQKIIDEIRDLNQKLQLEQEKLSSDYNKLKIEDQEREMKLEKLLLLNDKRE
      720       730       740       750       760       770        

          780       790       800       810       820       830    
pF1KSD QSKQDLKGLEETVARELQTLHNLRKLFVQDVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQKQKISFLE
       :...:::::::::.::::::::::::::::.:::::::.:.. .:.::  .:::::::::
CCDS74 QAREDLKGLEETVSRELQTLHNLRKLFVQDLTTRVKKSVELDNDDGGGSAAQKQKISFLE
      780       790       800       810       820       830        

          840       850       860       870       880       890    
pF1KSD NNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALEGALKEAKEGAMKDKRRYQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::.:..:::
CCDS74 NNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALESALKEAKENAMRDRKRYQ
      840       850       860       870       880       890        

          900       910       920       930       940       950    
pF1KSD QEVDRIKEAVRYKSSGKRGHSAQIAKPVRPGHYPASSPTNPYGTRSPECISYTNSLFQNY
       ::::::::::: :. ..:.::::::::.:::::::::::  .. :.    : ... .:  
CCDS74 QEVDRIKEAVRAKNMARRAHSAQIAKPIRPGHYPASSPTAVHAIRGGGGSSSNSTHYQK 
      900       910       920       930       940       950        

          960       970       980       990      1000      1010    
pF1KSD QNLYLQATPSSTSDMYFANSCTSSGATSSGGPLASYQKANMDNGNATDINDNRSDLPCGY

>>CCDS7171.1 KIF5B gene_id:3799|Hs108|chr10               (963 aa)
 initn: 4366 init1: 1521 opt: 4384  Z-score: 2089.7  bits: 398.2 E(32554): 4.4e-110
Smith-Waterman score: 4384; 72.0% identity (90.4% similar) in 939 aa overlap (7-939:6-941)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRGDKFIPIFQGDDSVVIGGKPYVFDRVFPPNTTQE
             ::.:::.:::::::..:. ::::.:  :::.:.:::..:::.:::::  .:.::
CCDS71  MADLAECNIKVMCRFRPLNESEVNRGDKYIAKFQGEDTVVIASKPYAFDRVFQSSTSQE
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD QVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIARDIFNHI
       :::. :: .:::::: :::::::::::::::::::::::::::. :::::::..::::.:
CCDS71 QVYNDCAKKIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPEGMGIIPRIVQDIFNYI
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD YSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTNLSVHEDKNRVPFVKGCTERFVSSPEEI
       :::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::: ::.:.
CCDS71 YSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLSVHEDKNRVPYVKGCTERFVCSPDEV
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD LDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENMETEQKLSGKLYLVDLAGSEKVS
       .:.:::::::::::::::::::::::::::::.:::: .:::::::::::::::::::::
CCDS71 MDTIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINVKQENTQTEQKLSGKLYLVDLAGSEKVS
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD KTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::. .::::::::::::::::::::::::.
CCDS71 KTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGS-TYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTI
     240       250       260       270        280       290        

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD FICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKYEKEKEKTKAQKETI
        :::::::::..::::::.:::::::::::. ::.:::::::::::::::::.:  ..::
CCDS71 VICCSPSSYNESETKSTLLFGQRAKTIKNTVCVNVELTAEQWKKKYEKEKEKNKILRNTI
      300       310       320       330       340       350        

              370       380       390         400           410    
pF1KSD AKLEAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALGAELCEE--TPVNDNSSIVVRI----APEER
         :: ::.::::::.::  :..  :.: : :   ..  : .::. . .. .    .  ::
CCDS71 QWLENELNRWRNGETVPIDEQFDKEKANLEAFTVDKDITLTNDKPATAIGVIGNFTDAER
      360       370       380       390       400       410        

          420       430       440       450       460       470    
pF1KSD QKYEEEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQ
       .: :::: .:::::::::.::::::::.:::: :::::::::.::: :....: ::..::
CCDS71 RKCEEEIAKLYKQLDDKDEEINQQSQLVEKLKTQMLDQEELLASTRRDQDNMQAELNRLQ
      420       430       440       450       460       470        

          480       490       500       510       520       530    
pF1KSD SENDAAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQ
       .::::.:.:::::::.::::::::::::::::.:... .:: :::.:: ::. :...:::
CCDS71 AENDASKEEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEDKTKEYELLSDELNQKSATLASIDAELQ
      480       490       500       510       520       530        

          540       550       560       570       580       590    
pF1KSD RLQEVSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVARLYISKI
       .:.:...::.:: ::.. .:.:::.:... :::...: : : .: :.::::::::::::.
CCDS71 KLKEMTNHQKKRAAEMMASLLKDLAEIGIAVGNNDVKQP-EGTGMIDEEFTVARLYISKM
      540       550       560       570        580       590       

          600       610       620       630       640       650    
pF1KSD KSEVKSVVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELSSCQLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKK
       :::::..::::.:::. :.: ..::: . .::..::: ::::::::.:::::.:.:: ::
CCDS71 KSEVKTMVKRCKQLESTQTESNKKMEENEKELAACQLRISQHEAKIKSLTEYLQNVEQKK
       600       610       620       630       640       650       

          660       670       680       690       700       710    
pF1KSD RHLEESYDSLSDELAKLQAQETVHEVALKDKEPDTQDADEVKKALELQMESHREAHHRQL
       :.:::: :.::.::..:.::: :::.  :..   .: :.:::.:.: :..::::.:..:.
CCDS71 RQLEESVDALSEELVQLRAQEKVHEME-KEHLNKVQTANEVKQAVEQQIQSHRETHQKQI
       660       670       680        690       700       710      

          720       730       740       750       760       770    
pF1KSD ARLRDEINEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQADYEKLKSEEHEKSTKLQELTFLYERHE
       . ::::.. : : : .:.: :::..:: :.:....::::. ..::: ::.::: . .:.:
CCDS71 SSLRDEVEAKAKLITDLQDQNQKMMLEQERLRVEHEKLKATDQEKSRKLHELTVMQDRRE
        720       730       740       750       760       770      

          780       790       800       810       820       830    
pF1KSD QSKQDLKGLEETVARELQTLHNLRKLFVQDVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQKQKISFLE
       :..:::::::::::.:::::::::::::::..::::::::.. .:.::  .:::::::::
CCDS71 QARQDLKGLEETVAKELQTLHNLRKLFVQDLATRVKKSAEIDSDDTGGSAAQKQKISFLE
        780       790       800       810       820       830      

          840       850       860       870       880       890    
pF1KSD NNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALEGALKEAKEGAMKDKRRYQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.: .:..:::
CCDS71 NNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALESALKEAKENASRDRKRYQ
        840       850       860       870       880       890      

          900       910       920       930       940       950    
pF1KSD QEVDRIKEAVRYKSSGKRGHSAQIAKPVRPGHYPASSPTNPYGTRSPECISYTNSLFQNY
       ::::::::::: :. ..::::::::::.:::..::.:::.: . :               
CCDS71 QEVDRIKEAVRSKNMARRGHSAQIAKPIRPGQHPAASPTHPSAIRGGGAFVQNSQPVAVR
        900       910       920       930       940       950      

          960       970       980       990      1000      1010    
pF1KSD QNLYLQATPSSTSDMYFANSCTSSGATSSGGPLASYQKANMDNGNATDINDNRSDLPCGY
                                                                   
CCDS71 GGGGKQV                                                     
        960                                                        

>>CCDS75296.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5              (726 aa)
 initn: 881 init1: 407 opt: 969  Z-score: 483.1  bits: 100.5 E(32554): 1.4e-20
Smith-Waterman score: 1002; 32.8% identity (60.2% similar) in 716 aa overlap (2-676:6-699)

                    10        20                    30        40   
pF1KSD     MAETNNEC-SIKVLCRFRPLNQAEI------------LRGDKFIPIFQGDDSVVIG
            .:  . : ..::. : ::::. :             .::   : . . :.:    
CCDS75 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGT--ITVHKTDSSNE-P
               10        20        30        40          50        

            50        60        70        80        90       100   
pF1KSD GKPYVFDRVFPPNTTQEQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDP
        : ..:: :: :.. : .::.  :  :. .:: ::::::::::::..::: ::::    :
CCDS75 PKTFTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIP
        60        70        80        90       100       110       

           110       120       130       140       150        160  
pF1KSD QLMGIIPRIARDIFNHIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTN-LSVHEDKNR
       .: ::::     ::.:: . . . .: ..:::.::: ...::::   .:. : :.:  . 
CCDS75 ELRGIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDV
       120       130       140       150       160       170       

            170       180       190       200       210         220
pF1KSD VPFVKGCTERFVSSPEEILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIK--QENMET
         ..:  .   :.. ...  ..  :..:: :..:::::::::::.:: :.:.  ..... 
CCDS75 GVYIKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDG
       180       190       200       210       220       230       

               230       240       250       260       270         
pF1KSD EQKLS-GKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPY
       ....  :::.::::::::. .:::: :  : :: .:: :::.::::::::..: ...:::
CCDS75 NMHVRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPY
       240       250       260       270       280       290       

     280       290       300       310       320       330         
pF1KSD RDSKMTRILQDSLGGNCRTTMFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTA
       :.::.::.:::::::: .: :    .:..::  :: ::: ...:::.::: : .: :   
CCDS75 RNSKLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETISTLRYANRAKNIKNKARIN-EDPK
       300       310       320       330       340       350       

     340       350       360                370       380       390
pF1KSD EQWKKKYEKEKEKTKAQKETIAKL---------EAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALG
       .   ....:: :. : . :   ..         : .  . . ::.  . ..  :  .. .
CCDS75 DALLRQFQKEIEELKKKLEEGEEISGSDISGSEEDDDEEGEVGEDGEKRKKRRGSSSSSS
        360       370       380       390       400       410      

                 400          410           420       430       440
pF1KSD AE-LCE--ETPVND---NSSIVVRIAP----EERQKYEEEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQ
       ..  :   : :..    :..   ...:    : . : .:: . :  .:: ...: :.   
CCDS75 SDSTCSVIEKPLDKFLPNQAGKKKVSPDKMIEMQAKIDEERKALETKLDMEEEERNKARA
        420       430       440       450       460       470      

              450       460       470       480       490       500
pF1KSD LIEKLKQQMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQSENDAAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQ
        .:: ....:  ..       ..... ..:: :  :. .    : ..:   ::     ..
CCDS75 ELEKREKDLLKAQQ-------EHQSLLEKLSAL--EKKVIVGGV-DLLAKAEEQEKLLEE
        480       490              500         510        520      

              510       520       530       540       550       560
pF1KSD KSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQRLQEVSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSE
       ...:.::. .. . :  :: .:    :..: .   ::: .  . :.. .: . ::   ::
CCDS75 SNMELEERRKRAEQLRRELEEKEQERLDIEEKYTSLQEEAQGKTKKLKKVWTMLMAAKSE
        530       540       550       560       570       580      

              570       580        590       600       610         
pF1KSD FSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVAR-LYISKIKSEVKSVVKRCRQLENLQVECHRKM
       .. .    . .   :: : .:.   ..: : .. .   . . . :  : : ..   : . 
CCDS75 MADL----QQEHQREIEGLLENIRQLSRELRLQMLI--IDNFIPRDYQ-EMIENYVHWNE
        590           600       610         620        630         

     620       630       640           650       660       670     
pF1KSD EVTGRELSSCQLLISQHEAKIRSLTEYMQS----VELKKRHLEESYDSLSDELAKLQAQE
       .. :.   .:    ...  :   . .  ..    :.:.. .:  . .:: . : ::.  .
CCDS75 DI-GEWQLKCVAYTGNNMRKQTPVPDKKEKDPFEVDLSHVYLAYTEESLRQSLMKLERPR
     640        650       660       670       680       690        

         680       690       700       710       720       730     
pF1KSD TVHEVALKDKEPDTQDADEVKKALELQMESHREAHHRQLARLRDEINEKQKTIDELKDLN
       :                                                           
CCDS75 TSKGKARPKTGRRKRSAKPETVIDSLLQ                                
      700       710       720                                      

>>CCDS13200.1 KIF3B gene_id:9371|Hs108|chr20              (747 aa)
 initn: 806 init1: 416 opt: 953  Z-score: 475.4  bits: 99.1 E(32554): 3.7e-20
Smith-Waterman score: 1014; 33.1% identity (62.9% similar) in 726 aa overlap (1-692:1-702)

               10        20         30        40                 50
pF1KSD MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRG-DKFIPIFQGDDSVVIGG---------KPYVFD
       :.. ..  :..:. : ::.:  :   . :: . .     .: . .         : ..::
CCDS13 MSKLKSSESVRVVVRCRPMNGKEKAASYDKVVDVDVKLGQVSVKNPKGTAHEMPKTFTFD
               10        20        30        40        50        60

               60        70        80        90       100       110
pF1KSD RVFPPNTTQEQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIP
        :.  :. : ..:      .: .:: :.::::::::::..:::.::::   ::.  :.::
CCDS13 AVYDWNAKQFELYDETFRPLVDSVLQGFNGTIFAYGQTGTGKTYTMEGIRGDPEKRGVIP
               70        80        90       100       110       120

              120       130       140       150        160         
pF1KSD RIARDIFNHIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTN-LSVHEDKNRVPFVKGC
            ::.:: : ..: .. ...::.::: ..:::::.  .:. : ..:  .   .::  
CCDS13 NSFDHIFTHI-SRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKDQTKRLELKERPDTGVYVKDL
              130        140       150       160       170         

     170       180       190       200       210         220       
pF1KSD TERFVSSPEEILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIK--QENMETEQKLS-G
       .   ..: .::  :.. :..:: :..:::::::::::.::.:.:.  . ... :...  :
CCDS13 SSFVTKSVKEIEHVMNVGNQNRSVGATNMNEHSSRSHAIFVITIECSEVGLDGENHIRVG
     180       190       200       210       220       230         

        230       240       250       260       270       280      
pF1KSD KLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPYRDSKMTR
       :: ::::::::. .::::.:  : :: .:: ::::::::::::..: ....::::::.::
CCDS13 KLNLVDLAGSERQAKTGAQGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGKSTHIPYRDSKLTR
     240       250       260       270       280       290         

        290       300       310       320       330       340      
pF1KSD ILQDSLGGNCRTTMFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKY
       .:::::::: .:.:    .:.:::  :: .:: ...:::.:::   :: :   .   ...
CCDS13 LLQDSLGGNAKTVMVANVGPASYNVEETLTTLRYANRAKNIKNKPRVN-EDPKDALLREF
     300       310       320       330       340        350        

        350         360       370         380       390       400  
pF1KSD EKEKEKTKAQ--KETIAKLEAELSRWRNGENVP--ETERLAGEEAALGAELCEETPVNDN
       ..:  . :::  :..:.. . . .: ..: .    : :.  :::.   ..  ..   ...
CCDS13 QEEIARLKAQLEKRSIGRRKRREKRREGGGSGGGGEEEEEEGEEGEEEGDDKDDYWREQQ
      360       370       380       390       400       410        

              410       420       430       440       450          
pF1KSD SSIVV--RIAPEERQKYEEEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQE-ELLVST
        .. .  :   :...   ::  :: :. . : ... ....  : :  ..  .: .:::. 
CCDS13 EKLEIEKRAIVEDHSLVAEEKMRLLKEKEKKMEDLRREKDAAEMLGAKIKAMESKLLVGG
      420       430       440       450       460       470        

     460           470       480       490       500       510     
pF1KSD RG----DNEKVQRELSHLQSENDAAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLL
       ..     ::. :. : . ..:    : . .:. : .:    . :... :..:  .. :  
CCDS13 KNIVDHTNEQ-QKILEQKRQEIAEQKRREREIQQQME----SRDEETLELKETYSSLQQE
      480        490       500       510           520       530   

         520           530       540       550       560       570 
pF1KSD VDELSQKVATMLS----LESELQRLQEVSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIK
       ::  ..:.  ..:    ...:.. :::   ..:... .. : : ..:.   .:. :    
CCDS13 VDIKTKKLKKLFSKLQAVKAEIHDLQEEHIKERQELEQTQNELTRELKLKHLIIENF---
           540       550       560       570       580       590   

             580       590       600       610       620           
pF1KSD LPVEISGAIEEEFTVARLYISKIKSEVKSVVKRCRQLENLQVECHRKMEVTG--RELSSC
       .:.:     :.   . : .... ... :  ..   .::: :.  .: . ..:  : ::. 
CCDS13 IPLE-----EKSKIMNRAFFDEEEDHWK--LHPITRLENQQMM-KRPVSAVGYKRPLSQH
                   600       610         620        630       640  

       630       640       650       660        670       680      
pF1KSD --QLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKKRHLEESYDSLSDELA-KLQAQETVHEVALKDKE
         . .. . ::. :. .  .  ... .:    . :  .  .: :.::   . ..::.:..
CCDS13 ARMSMMIRPEARYRAENIVLLELDMPSR---TTRDYEGPAIAPKVQA---ALDAALQDED
            650       660       670          680          690      

        690       700       710       720       730       740      
pF1KSD PDTQDADEVKKALELQMESHREAHHRQLARLRDEINEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQ
           ::                                                      
CCDS13 EIQVDASSFESTANKKSKARPKSGRKSGSSSSSSGTPASQLYPQSRGLVPK         
        700       710       720       730       740                

>>CCDS75295.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5              (702 aa)
 initn: 881 init1: 407 opt: 948  Z-score: 473.4  bits: 98.6 E(32554): 4.8e-20
Smith-Waterman score: 1018; 33.5% identity (60.8% similar) in 701 aa overlap (2-676:6-675)

                    10        20                    30        40   
pF1KSD     MAETNNEC-SIKVLCRFRPLNQAEI------------LRGDKFIPIFQGDDSVVIG
            .:  . : ..::. : ::::. :             .::   : . . :.:    
CCDS75 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGT--ITVHKTDSSNE-P
               10        20        30        40          50        

            50        60        70        80        90       100   
pF1KSD GKPYVFDRVFPPNTTQEQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDP
        : ..:: :: :.. : .::.  :  :. .:: ::::::::::::..::: ::::    :
CCDS75 PKTFTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIP
        60        70        80        90       100       110       

           110       120       130       140       150        160  
pF1KSD QLMGIIPRIARDIFNHIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTN-LSVHEDKNR
       .: ::::     ::.:: . . . .: ..:::.::: ...::::   .:. : :.:  . 
CCDS75 ELRGIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDV
       120       130       140       150       160       170       

            170       180       190       200       210         220
pF1KSD VPFVKGCTERFVSSPEEILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIK--QENMET
         ..:  .   :.. ...  ..  :..:: :..:::::::::::.:: :.:.  ..... 
CCDS75 GVYIKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDG
       180       190       200       210       220       230       

               230       240       250       260       270         
pF1KSD EQKLS-GKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPY
       ....  :::.::::::::. .:::: :  : :: .:: :::.::::::::..: ...:::
CCDS75 NMHVRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPY
       240       250       260       270       280       290       

     280       290       300       310       320       330         
pF1KSD RDSKMTRILQDSLGGNCRTTMFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTA
       :.::.::.:::::::: .: :    .:..::  :: ::: ...:::.::: : .: :   
CCDS75 RNSKLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETISTLRYANRAKNIKNKARIN-EDPK
       300       310       320       330       340       350       

     340       350       360       370       380       390         
pF1KSD EQWKKKYEKEKEKTKAQKETIAKLEAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALGAELCEETPV
       .   ....:: :. : . :       :.:    : ..  .:.   ::. .: .  ..   
CCDS75 DALLRQFQKEIEELKKKLEE----GEEIS----GSDISGSEEDDDEEGEVGEDGEKRKKR
        360       370           380           390       400        

     400       410           420       430       440       450     
pF1KSD NDNSSIVVRIAP----EERQKYEEEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEEL
        :...   ...:    : . : .:: . :  .:: ...: :.    .:: ....:  .. 
CCDS75 RDQAGKK-KVSPDKMIEMQAKIDEERKALETKLDMEEEERNKARAELEKREKDLLKAQQ-
      410        420       430       440       450       460       

         460       470       480       490       500       510     
pF1KSD LVSTRGDNEKVQRELSHLQSENDAAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLL
             ..... ..:: :  :. .    : ..:   ::     .....:.::. .. . :
CCDS75 ------EHQSLLEKLSAL--EKKVIVGGV-DLLAKAEEQEKLLEESNMELEERRKRAEQL
              470         480        490       500       510       

         520       530       540       550       560       570     
pF1KSD VDELSQKVATMLSLESELQRLQEVSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVE
         :: .:    :..: .   ::: .  . :.. .: . ::   ::.. .    . .   :
CCDS75 RRELEEKEQERLDIEEKYTSLQEEAQGKTKKLKKVWTMLMAAKSEMADL----QQEHQRE
       520       530       540       550       560           570   

         580        590       600       610       620       630    
pF1KSD ISGAIEEEFTVAR-LYISKIKSEVKSVVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELSSCQLLIS
       : : .:.   ..: : .. .   . . . :  : : ..   : . .. :.   .:    .
CCDS75 IEGLLENIRQLSRELRLQMLI--IDNFIPRDYQ-EMIENYVHWNEDI-GEWQLKCVAYTG
           580       590         600        610        620         

          640           650       660       670       680       690
pF1KSD QHEAKIRSLTEYMQS----VELKKRHLEESYDSLSDELAKLQAQETVHEVALKDKEPDTQ
       ..  :   . .  ..    :.:.. .:  . .:: . : ::.  .:              
CCDS75 NNMRKQTPVPDKKEKDPFEVDLSHVYLAYTEESLRQSLMKLERPRTSKGKARPKTGRRKR
     630       640       650       660       670       680         

              700       710       720       730       740       750
pF1KSD DADEVKKALELQMESHREAHHRQLARLRDEINEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQADYE
                                                                   
CCDS75 SAKPETVIDSLLQ                                               
     690       700                                                 

>>CCDS34235.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5              (699 aa)
 initn: 881 init1: 407 opt: 931  Z-score: 465.4  bits: 97.2 E(32554): 1.3e-19
Smith-Waterman score: 1016; 33.4% identity (60.5% similar) in 697 aa overlap (2-676:6-672)

                    10        20                    30        40   
pF1KSD     MAETNNEC-SIKVLCRFRPLNQAEI------------LRGDKFIPIFQGDDSVVIG
            .:  . : ..::. : ::::. :             .::   : . . :.:    
CCDS34 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGT--ITVHKTDSSNE-P
               10        20        30        40          50        

            50        60        70        80        90       100   
pF1KSD GKPYVFDRVFPPNTTQEQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDP
        : ..:: :: :.. : .::.  :  :. .:: ::::::::::::..::: ::::    :
CCDS34 PKTFTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIP
        60        70        80        90       100       110       

           110       120       130       140       150        160  
pF1KSD QLMGIIPRIARDIFNHIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTN-LSVHEDKNR
       .: ::::     ::.:: . . . .: ..:::.::: ...::::   .:. : :.:  . 
CCDS34 ELRGIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDV
       120       130       140       150       160       170       

            170       180       190       200       210         220
pF1KSD VPFVKGCTERFVSSPEEILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIK--QENMET
         ..:  .   :.. ...  ..  :..:: :..:::::::::::.:: :.:.  ..... 
CCDS34 GVYIKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDG
       180       190       200       210       220       230       

               230       240       250       260       270         
pF1KSD EQKLS-GKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPY
       ....  :::.::::::::. .:::: :  : :: .:: :::.::::::::..: ...:::
CCDS34 NMHVRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPY
       240       250       260       270       280       290       

     280       290       300       310       320       330         
pF1KSD RDSKMTRILQDSLGGNCRTTMFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTA
       :.::.::.:::::::: .: :    .:..::  :: ::: ...:::.::: : .: :   
CCDS34 RNSKLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETISTLRYANRAKNIKNKARIN-EDPK
       300       310       320       330       340       350       

     340       350       360       370       380       390         
pF1KSD EQWKKKYEKEKEKTKAQKETIAKLEAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALGAELCEETPV
       .   ....:: :. : . :       :.:    : ..  .:.   ::. .: .  ..   
CCDS34 DALLRQFQKEIEELKKKLEE----GEEIS----GSDISGSEEDDDEEGEVGEDGEKRKKR
        360       370           380           390       400        

     400       410       420       430       440       450         
pF1KSD NDNSSIVVRIAPEERQKYEEEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEELLVST
         ....      : . : .:: . :  .:: ...: :.    .:: ....:  ..     
CCDS34 RGKKKVSPDKMIEMQAKIDEERKALETKLDMEEEERNKARAELEKREKDLLKAQQ-----
      410       420       430       440       450       460        

     460       470       480       490       500       510         
pF1KSD RGDNEKVQRELSHLQSENDAAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLLVDEL
         ..... ..:: :  :. .    : ..:   ::     .....:.::. .. . :  ::
CCDS34 --EHQSLLEKLSAL--EKKVIVGGV-DLLAKAEEQEKLLEESNMELEERRKRAEQLRREL
             470         480        490       500       510        

     520       530       540       550       560       570         
pF1KSD SQKVATMLSLESELQRLQEVSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVEISGA
        .:    :..: .   ::: .  . :.. .: . ::   ::.. .    . .   :: : 
CCDS34 EEKEQERLDIEEKYTSLQEEAQGKTKKLKKVWTMLMAAKSEMADL----QQEHQREIEGL
      520       530       540       550       560           570    

     580        590       600       610       620       630        
pF1KSD IEEEFTVAR-LYISKIKSEVKSVVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELSSCQLLISQHEA
       .:.   ..: : .. .   . . . :  : : ..   : . .. :.   .:    ...  
CCDS34 LENIRQLSRELRLQMLI--IDNFIPRDYQ-EMIENYVHWNEDI-GEWQLKCVAYTGNNMR
          580       590         600        610        620       630

      640           650       660       670       680       690    
pF1KSD KIRSLTEYMQS----VELKKRHLEESYDSLSDELAKLQAQETVHEVALKDKEPDTQDADE
       :   . .  ..    :.:.. .:  . .:: . : ::.  .:                  
CCDS34 KQTPVPDKKEKDPFEVDLSHVYLAYTEESLRQSLMKLERPRTSKGKARPKTGRRKRSAKP
              640       650       660       670       680       690

          700       710       720       730       740       750    
pF1KSD VKKALELQMESHREAHHRQLARLRDEINEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQADYEKLKS
                                                                   
CCDS34 ETVIDSLLQ                                                   
                                                                   

>>CCDS34042.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4               (2701 aa)
 initn: 762 init1: 207 opt: 925  Z-score: 455.2  bits: 97.2 E(32554): 4.9e-19
Smith-Waterman score: 967; 29.1% identity (59.1% similar) in 976 aa overlap (1-902:1-936)

               10        20        30        40           50       
pF1KSD MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRGDKFIPIFQGDDSVVI---GGKPYVFDRVFPPNT
       :::   : .. :  : ::::. :   :.     .. :..:.    :.: . :::::  : 
CCDS34 MAE---EGAVAVCVRVRPLNSREESLGETAQVYWKTDNNVIYQVDGSKSFNFDRVFHGNE
                  10        20        30        40        50       

        60        70        80        90       100       110       
pF1KSD TQEQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIARDIF
       : ..::.  :  :. ... ::::::::::::.::::.:: :   . . .:.:::  .:::
CCDS34 TTKNVYEEIAAPIIDSAIQGYNGTIFAYGQTASGKTYTMMG---SEDHLGVIPRAIHDIF
        60        70        80        90          100       110    

       120       130       140       150         160       170     
pF1KSD NHIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTN--LSVHEDKNRVPFVKGCTERFVS
       ..: .. .  :: ..:::.::: . : :::  :.    : ..:: ::  .:   ::. : 
CCDS34 QKIKKFPDR-EFLLRVSYMEIYNETITDLLCGTQKMKPLIIREDVNRNVYVADLTEEVVY
          120        130       140       150       160       170   

         180       190       200       210             220         
pF1KSD SPEEILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQE------NMETEQKLSGKLY
       . :  :  : .:...:: . :.::..:::::.:: . ....      : :   :.: .: 
CCDS34 TSEMALKWITKGEKSRHYGETKMNQRSSRSHTIFRMILESREKGEPSNCEGSVKVS-HLN
           180       190       200       210       220        230  

     230       240       250       260       270        280        
pF1KSD LVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEG-TKSYVPYRDSKMTRIL
       ::::::::....::: :. : :. :::.::  ::.::. :..: . ... :::::.::::
CCDS34 LVDLAGSERAAQTGAAGVRLKEGCNINRSLFILGQVIKKLSDGQVGGFINYRDSKLTRIL
            240       250       260       270       280       290  

      290       300       310       320       330       340        
pF1KSD QDSLGGNCRTTMFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKYEK
       :.::::: .: ..   .: :..  :: ..:.:.. :: .:::  ::   : :   :.:.:
CCDS34 QNSLGGNAKTRIICTITPVSFD--ETLTALQFASTAKYMKNTPYVNEVSTDEALLKRYRK
            300       310         320       330       340       350

          350                 360         370       380         390
pF1KSD E----KEK-------TKAQ---KETIAKL--EAELSRWRNGENVPETERL--AGEEAALG
       :    :..       :.::   :. .:.:  : .: .  ..:.. .  :.  ..   .: 
CCDS34 EIMDLKKQLEEVSLETRAQAMEKDQLAQLLEEKDLLQKVQNEKIENLTRMLVTSSSLTLQ
              360       370       380       390       400       410

                               400       410       420       430   
pF1KSD AEL----------C-------EETPVNDNSSIVVRIAPEERQKYEEEIRRLYKQLDDKDD
        ::          :       ...   :. .: . :. . ..   . .:.. ... ...:
CCDS34 QELKAKRKRRVTWCLGKINKMKNSNYADQFNIPTNITTKTHKLSINLLREIDESVCSESD
              420       430       440       450       460       470

           440           450          460       470       480      
pF1KSD EINQQSQLIEKLKQ----QMLDQEEL---LVSTRGDNEKVQRELSHLQSENDAAKDEVKE
        ...  . . ...     ..:.::..   : : :.: ...  .  .:..:..  . ..::
CCDS34 VFSNTLDTLSEIEWNPATKLLNQENIESELNSLRADYDNLVLDYEQLRTEKEEMELKLKE
              480       490       500       510       520       530

          490         500       510                 520       530  
pF1KSD V--LQVLEELA--VNYDQKSQEVEEKSQ----------QNQLLVDELSQKVATMLSLESE
          :. .: :   .. ::. : ..: :.           :: : .:::.::  .   :..
CCDS34 KNDLDEFEALERKTKKDQEMQLIHEISNLKNLVKHAEVYNQDLENELSSKVELLREKEDQ
              540       550       560       570       580       590

            540       550       560       570       580       590  
pF1KSD LQRLQEVSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVARLYIS
       ...:::    :.      :...  ::: .:.      :. : ... .. .  :::     
CCDS34 IKKLQEYIDSQK------LENIKMDLS-YSL----ESIEDPKQMKQTLFDAETVA-----
              600             610            620       630         

            600       610       620        630       640           
pF1KSD KIKSEVKSVVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGREL-SSCQLLISQHEAKIR---SLTEYMQ
        . .. .:.  : ..:: :. :  ... .: ... .. ::  :: ::: .   .: . .:
CCDS34 -LDAKRESAFLRSENLE-LK-EKMKELATTYKQMENDIQLYQSQLEAKKKMQVDLEKELQ
           640       650         660       670       680       690 

      650       660         670       680       690       700      
pF1KSD SVELKKRHLEESYDSL--SDELAKLQAQETVHEVALKDKEPDTQDADEVKKALELQMESH
       :.  .  .:    :.   .: : .:. .  . ..  :. . .... . ...  :. . :.
CCDS34 SAFNEITKLTSLIDGKVPKDLLCNLELEGKITDLQ-KELNKEVEENEALRE--EVILLSE
             700       710       720        730       740          

        710       720       730       740       750       760      
pF1KSD REAHHRQLARLRDEINEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQADYEKLKSEEHEKSTKLQEL
        ..   .. ::: ::..:.. .  . . ..::  :. . ..  . :  :  . .  :   
CCDS34 LKSLPSEVERLRKEIQDKSEELHIITSEKDKLFSEVVHKESRVQGLLEEIGKTKDDLATT
      750       760       770       780       790       800        

        770       780       790       800       810       820      
pF1KSD TFLYERHEQSKQDLKGLEETVARELQTLHNLRKLFVQDVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQ
          :.  .:  :..: :.    .. . . .  . . :..   :. : : .  ::. . . 
CCDS34 QSNYKSTDQEFQNFKTLHMDFEQKYKMVLEENERMNQEI---VNLSKEAQKFDSS-LGAL
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pF1KSD KQKISFLENNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALEGALKEAKEGA
       : ..:.  ..:.. :.  .. . .  .:. .: . .. :. :.:: :.:   . :  . .
CCDS34 KTELSYKTQELQEKTREVQERLNEMEQLKEQLENRDSTLQ-TVEREKTL---ITEKLQQT
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        890       900       910       920       930       940      
pF1KSD MKDKRRYQQEVDRIKEAVRYKSSGKRGHSAQIAKPVRPGHYPASSPTNPYGTRSPECISY
       ... .   :: : .:.                                            
CCDS34 LEEVKTLTQEKDDLKQLQESLQIERDQLKSDIHDTVNMNIDTQEQLRNALESLKQHQETI
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>>CCDS47324.1 KIF4B gene_id:285643|Hs108|chr5             (1234 aa)
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pF1KSD MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRGDK----FIPIFQGDDSVVIG-GKPYVFDRVFPP
       : :  .   ..:  : :::   :: .: .    :.:   :. .::.:  : ...: :: :
CCDS47 MKEEVKGIPVRVALRCRPLVPKEISEGCQMCLSFVP---GETQVVVGTDKSFTYDFVFDP
               10        20        30           40        50       

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pF1KSD NTTQEQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQ----LMGIIPR
        : ::.:..  .  ..: .. :::.:..:::::.::::..: :     :     .:::::
CCDS47 CTEQEEVFNKAVAPLIKGIFKGYNATVLAYGQTGSGKTYSMGGAYTAEQENEPTVGIIPR
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pF1KSD IARDIFNHIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLL--DVTKTNLSVHEDKNRVPFVKGC
       . . .:..: .   ..:: .::::.::: ..: :::  .  :......:: ..   . : 
CCDS47 VIQLLFKEI-DKKSDFEFTLKVSYLEIYNEEILDLLCPSREKAQINIREDPKEGIKIVGL
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pF1KSD TERFVSSPEEILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENMETEQ-KLSGKL
       ::. :    . .. ...:...: :: : :: .:::::.:: :.:.:..   .. .. .::
CCDS47 TEKTVLVALDTVSCLEQGNNSRTVASTAMNSQSSRSHAIFTISIEQRKKSDKNCSFRSKL
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pF1KSD YLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTK-SYVPYRDSKMTRI
       .::::::::. .:: :::  : :. :::..:  ::::::::..  : :.:::::::.::.
CCDS47 HLVDLAGSERQKKTKAEGDRLKEGININRGLLCLGNVISALGDDKKGSFVPYRDSKLTRL
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pF1KSD LQDSLGGNCRTTMFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLE-LTAEQWKKKY
       :::::::: .: :. : ::.. :  :: ::: ...::. :::   ::..  :::  . : 
CCDS47 LQDSLGGNSHTLMIACVSPADSNLEETLSTLRYADRARKIKNKPIVNIDPHTAELNHLKQ
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pF1KSD EKEKEKT---KAQKETI-AKLEAELSRWRNGENVPE-TERLAGEEAALGAELCEETPVND
       . .. ..   .:.  :. ....:: :.  : ... : .. :. :.  :.   :    ...
CCDS47 QVQQLQVLLLQAHGGTLPGSINAEPSE--NLQSLMEKNQSLVEENEKLSR--CLSKAAGQ
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pF1KSD NSSIVVRIAPEER--QKYEEEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEELLVST
       ..... ::   :.  .: . ....: ...  : :     ..:.: :..: : ..  .. .
CCDS47 TAQMLERIILTEQVNEKLNAKLEELRQHVACKLD----LQKLVETLEDQELKENVEIICN
            420       430       440           450       460        

     460       470       480       490        500       510        
pF1KSD RGDNEKVQRELSHLQSENDAAKDEVKEVLQVLEELAVNYD-QKSQEVEEKSQQNQLLVDE
             .:. ...:..:. :    . ..  : ::  :. . . :.  .  . :. :   .
CCDS47 ------LQQLITQLSDETVACTAAAIDT-AVEEEAQVETSPETSRSSDAFTTQHALHQAQ
            470       480       490        500       510       520 

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pF1KSD LSQKVATM---LSLESELQRLQEVSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVE
       .:..:. .   :.:.  : : .  . .: . :    .  .:.: :. ::  . : .  :.
CCDS47 MSKEVVELNNALALKEALVRKMTQNDNQLQPIQFQYQDNIKNL-ELEVINLQKEKEELVR
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pF1KSD ISGAIEEEFTVARL--YISKIKSEVKSVVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELSSCQ---
          . ... . :.:  .  :. .:... .   ..  : : .  .  : : : .:. .   
CCDS47 ELQTAKKNVNQAKLSEHRHKLLQELEGQIADLKKKLNEQSKLLKLKESTERTVSKLNQEI
              590       600       610       620       630       640

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pF1KSD -LLISQHEAKIRSLTEYMQS------------VELKKRHLEESYDSLSDELAKLQAQETV
        .. .:.   .:.. :  ..            ..::.:  ...:. :. :  ..: : .:
CCDS47 WMMKNQRVQLMRQMKEDAEKFRQWKQKKDKEVIQLKERDRKRQYELLKLE-RNFQKQSSV
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pF1KSD HEVALKDKEPDTQDADE-VKKALELQME-----SHREAHHRQ--LARLRDEINEKQKTID
           :. :  ..  :.. .: ::. : :     .. ..: ..   ::.:. .... ... 
CCDS47 ----LRRKTEEAAAANKRLKDALQKQREVTDKRKETQSHGKEGIAARVRNWLGNEIEVMV
         700       710       720       730       740       750     

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pF1KSD ELKDLNQKLQ--LELEKLQA-DYEKLKSEEHEKST---KLQELTF-LYERHEQSKQDLKG
         .. ...:.  :: .:. : :  .:: ... . .   ::.. :: : : : :  ..   
CCDS47 STEEAKRHLNDLLEDRKILAQDVVQLKEKKESRENPPPKLRKCTFSLSEVHGQVLES---
         760       770       780       790       800       810     

            790       800       810       820       830       840  
pF1KSD LEETVARELQTLHNLRKLFVQDVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQKQKISFLENNLEQLTK
        :. .......:..  .:   ...   .:  . : ::       ::    . . ::    
CCDS47 -EDCITKQIESLETEMELRSAQIADLQQKLLDAESED-----RPKQCWENIATILEAKCA
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pF1KSD VHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALEGALKEAKEGAMKDKRRYQQEVDRIKE
       . : :. . .. . .. :::. :: .      ..  : : ..   . . . : :. :...
CCDS47 L-KYLIGELVSSKIHVTKLENSLRQSKASCADMQKMLFEEQNHFSEIETELQAELVRMEQ
         870       880       890       900       910       920     

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pF1KSD AVRYKSSGKRGHSAQIAKPVRPGHYPASSPTNPYGTRSPECISYTNSLFQNYQNLYLQAT
                                                                   
CCDS47 QHQEKVLYLVSQLQESQMAEKQLEKSASEKEQQLVSTLQCQDEELEKMREVCEQNQQLLQ
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>>CCDS14401.1 KIF4A gene_id:24137|Hs108|chrX              (1232 aa)
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pF1KSD MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRGDK----FIPIFQGDDSVVIG-GKPYVFDRVFPP
       : :  .   ..:  : :::   :: .: .    :.:   :. .::.:  : ...: :: :
CCDS14 MKEEVKGIPVRVALRCRPLVPKEISEGCQMCLSFVP---GEPQVVVGTDKSFTYDFVFDP
               10        20        30           40        50       

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pF1KSD NTTQEQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQ----LMGIIPR
       .: ::.:... .  ..: :. :::.:..:::::.::::..: :     :     .:.:::
CCDS14 STEQEEVFNTAVAPLIKGVFKGYNATVLAYGQTGSGKTYSMGGAYTAEQENEPTVGVIPR
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pF1KSD IARDIFNHIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLL--DVTKTNLSVHEDKNRVPFVKGC
       . . .:..: .   ..:: .::::.::: ..: :::  .  :......:: ..   . : 
CCDS14 VIQLLFKEI-DKKSDFEFTLKVSYLEIYNEEILDLLCPSREKAQINIREDPKEGIKIVGL
       120        130       140       150       160       170      

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pF1KSD TERFVSSPEEILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQ-ENMETEQKLSGKL
       ::. :    . .. ...:...: :: : :: .:::::.:: :...: .. . .... .::
CCDS14 TEKTVLVALDTVSCLEQGNNSRTVASTAMNSQSSRSHAIFTISLEQRKKSDKNSSFRSKL
        180       190       200       210       220       230      

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pF1KSD YLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKS-YVPYRDSKMTRI
       .::::::::. .:: :::  : :. :::..:  ::::::::..  :. .:::::::.::.
CCDS14 HLVDLAGSERQKKTKAEGDRLKEGININRGLLCLGNVISALGDDKKGGFVPYRDSKLTRL
        240       250       260       270       280       290      

       290       300       310       320       330        340      
pF1KSD LQDSLGGNCRTTMFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLE-LTAEQWKKKY
       :::::::: .: :. : ::.. :  :: .:: ...::. :::   ::..  :::  . : 
CCDS14 LQDSLGGNSHTLMIACVSPADSNLEETLNTLRYADRARKIKNKPIVNIDPQTAELNHLKQ
        300       310       320       330       340       350      

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pF1KSD EKEKEKT---KAQKETI-AKLEAELSR------WRNGENVPETERLA---GEEAALGAEL
       . .. ..   .:.  :. ... .: :.       .:   : :.:.:.   .: :.  :..
CCDS14 QVQQLQVLLLQAHGGTLPGSITVEPSENLQSLMEKNQSLVEENEKLSRGLSEAAGQTAQM
        360       370       380       390       400       410      

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pF1KSD CEETPVNDNSSIVVRIAPEERQKYEE---EIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQ---
        :.  ......  .    :: ...     ....: . :.:.  :.... ..: .:.:   
CCDS14 LERIILTEQANEKMNAKLEELRQHAACKLDLQKLVETLEDQ--ELKENVEIICNLQQLIT
        420       430       440       450         460       470    

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pF1KSD QMLDQEELLVSTRGDN---EKVQRELS-------------HLQSENDAAKD--EVKEVLQ
       :. :.    ...  :.   ...: : :             :   . . .:.  :....: 
CCDS14 QLSDETVACMAAAIDTAVEQEAQVETSPETSRSSDAFTTQHALRQAQMSKELVELNKALA
          480       490       500       510       520       530    

     490       500       510       520       530       540         
pF1KSD VLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQRLQEVSGHQRKRIAE
       . : :: .. :......  . : :  . ::  .: . :. :.:   :.  ....    :.
CCDS14 LKEALARKMTQNDSQLQPIQYQYQDNIKELELEVIN-LQKEKEELVLELQTAKKDANQAK
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CCDS14 LSERRRKRLQELEGQIADLKKKLN-EQSKLLKLKESTERT-VSKLNQEI-------RMMK
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       : .:.  :.:.  .... . .   .... .. .: :  .. . .  .::..... :. : 
CCDS14 NQRVQLMRQMKEDAEKFRQWK---QKKDKEVIQLKERDRKRQYELLKLERNFQKQSNVLR
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       .   . .. .  :::     ... . .:  : : .. . .  :    : .::.   .: .
CCDS14 RKTEEAAAANKRLKDALQKQREVADKRK--ETQSRGMEGTAARVKNWLGNEIEVMVSTEE
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CCDS14 AKRHLNDLLE-DRKILAQDVAQLK-EKKESGENPPPKLRRRTFSLTEVRGQVSES----E
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       .........:..  ..   ...   .:  . : ::       ::.   . . ::    . 
CCDS14 DSITKQIESLETEMEFRSAQIADLQQKLLDAESED-----RPKQRWENIATILEAKCAL-
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pF1KSD KQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALEGALKEAKEGAMKDKRRYQQEVDRIKEAV
       : :. . .. . .. :::. :. .      ..  : : ..   . . . : :. :...  
CCDS14 KYLIGELVSSKIQVSKLESSLKQSKTSCADMQKMLFEERNHFAEIETELQAELVRMEQQH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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