Result of FASTA (ccds) for
pFN21ASDB0042
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0042, 671 aa
1>>>pF1KSDB0042 671 - 671 aa - 671 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4046+/-0.00104; mu= 9.6641+/- 0.062
mean_var=118.7789+/-24.247, 0's: 0 Z-trim(107.2): 97 B-trim: 123 in 2/49
Lambda= 0.117681
statistics sampled from 9334 (9435) to 9334 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.647), E-opt: 0.2 (0.29), width: 16
Scan time: 3.530
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14472.1 SYTL4 gene_id:94121|Hs108|chrX ( 671) 4461 769.0 0
CCDS53688.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11 ( 934) 1040 188.2 4.5e-47
CCDS53689.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11 ( 935) 1040 188.2 4.5e-47
CCDS76461.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11 ( 902) 1026 185.8 2.3e-46
CCDS31652.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11 ( 376) 1002 181.6 1.8e-45
CCDS41698.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11 ( 365) 981 178.0 2.1e-44
CCDS31649.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11 ( 910) 972 176.7 1.3e-43
CCDS53687.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11 ( 336) 959 174.3 2.6e-43
CCDS34563.1 SYTL3 gene_id:94120|Hs108|chr6 ( 542) 750 138.9 1.9e-32
CCDS56458.1 SYTL3 gene_id:94120|Hs108|chr6 ( 610) 746 138.2 3.3e-32
CCDS14244.1 SYTL5 gene_id:94122|Hs108|chrX ( 730) 645 121.1 5.6e-27
CCDS55399.1 SYTL5 gene_id:94122|Hs108|chrX ( 752) 645 121.1 5.7e-27
CCDS298.1 SYTL1 gene_id:84958|Hs108|chr1 ( 550) 501 96.6 1e-19
CCDS53286.1 SYTL1 gene_id:84958|Hs108|chr1 ( 562) 501 96.6 1e-19
>>CCDS14472.1 SYTL4 gene_id:94121|Hs108|chrX (671 aa)
initn: 4461 init1: 4461 opt: 4461 Z-score: 4099.8 bits: 769.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4461; 99.9% identity (100.0% similar) in 671 aa overlap (1-671:1-671)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSELLDLSFLSEEEKDLILSVLQRDEEVRKADEKRIRRLKNELLEIKRKGAKRGSQHYSD
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CCDS14 MSELLDLSFLSEEEKDLILSVLQRDEEVRKADEKRIRRLKNELLEIKRKGAKRGSQHYSD
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD RTCARCQESLGRLSPKTNTCRGCNHLVCRDCRIQESNGTWRCKVCAKEIELKKATGDWFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RTCARCQESLGRLSPKTNTCRGCNHLVCRDCRIQESNGTWRCKVCAKEIELKKATGDWFY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DQKVNRFAYRTGSEIIRMSLRHKPAVSKRETVGQSLLHQTQMGDIWPGRKIIQERQKEPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DQKVNRFAYRTGSEIIRMSLRHKPAVSKRETVGQSLLHQTQMGDIWPGRKIIQERQKEPS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VLFEVPKLKSGKSALEAESESLDSFTADSDSTSRRDSLDKSGLFPEWKKMSAPKSQVEKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VLFEVPKLKSGKSALEAESESLDSFTADSDSTSRRDSLDKSGLFPEWKKMSAPKSQVEKE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TQPGGQNVVFVDEGEMIFKKNTRKILRPSEYTKSVIDLRPEDVVHESGSLGDRSKSVPGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TQPGGQNVVFVDEGEMIFKKNTRKILRPSEYTKSVIDLRPEDVVHESGSLGDRSKSVPGL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD NVDMEEEEEEEDIDHLVKLHRQKLARSSMQSGSSMSTIGSMMSIYSEAGDFGNIFVTGRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NVDMEEEEEEEDIDHLVKLHRQKLARSSMQSGSSMSTIGSMMSIYSEAGDFGNIFVTGRI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD AFSLKYEQQTQSLVVHVKECHQLAYADEAKKRSNPYVKTYLLPDKSRQGKRKTSIKRDTV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS14 AFSLKYEQQTQSLVVHVKECHQLAYADEAKKRSNPYVKTYLLPDKSRQGKRKTSIKRDTI
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430 440 450 460 470 480
pF1KSD NPLYDETLRYEIPESLLAQRTLQFSVWHHGRFGRNTFLGEAEIQMDSWKLDKKLDHCLPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NPLYDETLRYEIPESLLAQRTLQFSVWHHGRFGRNTFLGEAEIQMDSWKLDKKLDHCLPL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD HGKISAESPTGLPSHKGELVVSLKYIPASKTPVGGDRKKSKGGEGGELQVWIKEAKNLTA
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CCDS14 HGKISAESPTGLPSHKGELVVSLKYIPASKTPVGGDRKKSKGGEGGELQVWIKEAKNLTA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD AKAGGTSDSFVKGYLLPMRNKASKRKTPVMKKTLNPHYNHTFVYNGVRLEDLQHMCLELT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AKAGGTSDSFVKGYLLPMRNKASKRKTPVMKKTLNPHYNHTFVYNGVRLEDLQHMCLELT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD VWDREPLASNDFLGGVRLGVGTGISNGEVVDWMDSTGEEVSLWQKMRQYPGSWAEGTLQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VWDREPLASNDFLGGVRLGVGTGISNGEVVDWMDSTGEEVSLWQKMRQYPGSWAEGTLQL
610 620 630 640 650 660
670
pF1KSD RSSMAKQKLGL
:::::::::::
CCDS14 RSSMAKQKLGL
670
>>CCDS53688.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11 (934 aa)
initn: 865 init1: 438 opt: 1040 Z-score: 958.6 bits: 188.2 E(32554): 4.5e-47
Smith-Waterman score: 1040; 35.3% identity (64.2% similar) in 553 aa overlap (122-661:387-925)
100 110 120 130 140 150
pF1KSD RIQESNGTWRCKVCAKEIELKKATGDWFYDQKVNRFAYRTGSEIIRMSLRHKPAVSKRET
.: . : :.: . : :.: .:
CCDS53 SVLESDRLKNGMEDAGDTEEFQSDPKPSQYRKPSLFHQSTSSPYVSKSETHQPMTSGSFP
360 370 380 390 400 410
160 170 180 190 200
pF1KSD VGQSLLHQTQMGDIWPGRKIIQERQKEPS-VLFEVPKLKS--GKSALEAESESLDSFTAD
.. .: .... : . .::. :. .:.: .: . :. .. ..
CCDS53 IN-GLHSHSEVLTARPQSMENSPTINEPKDKSSELTRLESVLPRSPADELSHCVEPEPSQ
420 430 440 450 460 470
210 220 230 240 250 260
pF1KSD SDSTSRRDSLDKSGLFPEWKKMSAPKSQVEKETQPGGQNVVFVDEGEMIFKKNTRKILRP
. : :: . : : . .: ..: . . ... . .. .. ....:
CCDS53 VPGGSSRDRQQGSEEEPSPVLKTLERSAARKMPSKSLEDISSDSSNQAKVDNQPEELVRS
480 490 500 510 520 530
270 280 290 300 310 320
pF1KSD SEYTKSVIDLRPEDVVHESGSLGDRSKSVPGLNVDMEEEEEEEDI--DHLVKLHRQKLAR
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CCDS53 AEDV-STVPTQPDNPFSHPDKLKRMSKSVPAFLQD-ESDDRETDTASESSYQLSRHKKSP
540 550 560 570 580 590
330 340 350 360 370
pF1KSD SSM-----QSG-SSMSTI-GSMMSIYSEAGDFGNIFVTGRIAFSLKYEQQTQSLVVHVKE
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CCDS53 SSLTNLSSSSGMTSLSSVSGSVMSVYS--GDFGNLEVKGNIQFAIEYVESLKELHVFVAQ
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380 390 400 410 420 430
pF1KSD CHQLAYADEAKKRSNPYVKTYLLPDKSRQGKRKTSIKRDTVNPLYDETLRYEIPESLLAQ
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CCDS53 CKDLAAADVKKQRSDPYVKAYLLPDKGKMGKKKTLVVKKTLNPVYNEILRYKIEKQILKT
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440 450 460 470 480 490
pF1KSD RTLQFSVWHHGRFGRNTFLGEAEIQMDSWKLDKKLDHCLPLHGKISAESPTGLPS-HKGE
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CCDS53 QKLNLSIWHRDTFKRNSFLGEVELDLETWDWDNKQNKQLRWYPLKRKTAPVALEAENRGE
720 730 740 750 760 770
500 510 520 530 540 550
pF1KSD LVVSLKYIPASKTPVGGDRKKSKGGEGGELQVWIKEAKNLTAAKAGGTSDSFVKGYLLPM
. ..:.:.: :: : . . : :...:.:: .: . :. .:::: .::
CCDS53 MKLALQYVPE---PVPGKKLPTTG----EVHIWVKECLDLPLLR-GSHLNSFVKCTILPD
780 790 800 810 820
560 570 580 590 600 610
pF1KSD RNKASKRKTPVMKKTLNPHYNHTFVYNGVRLEDLQHMCLELTVWDREPLASNDFLGGVRL
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CCDS53 TSRKSRQKTRAVGKTTNPIFNHTMVYDGFRPEDLMEACVELTVWDHYKL-TNQFLGGLRI
830 840 850 860 870 880
620 630 640 650 660 670
pF1KSD GVGTGISNGEVVDWMDSTGEEVSLWQKMRQYPGSWAEGTLQLRSSMAKQKLGL
: ::: : : :::::::.:::.::.:: . :..: :.:: ::
CCDS53 GFGTGKSYGTEVDWMDSTSEEVALWEKMVNSPNTWIEATLPLRMLLIAKISK
890 900 910 920 930
>>CCDS53689.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11 (935 aa)
initn: 865 init1: 438 opt: 1040 Z-score: 958.6 bits: 188.2 E(32554): 4.5e-47
Smith-Waterman score: 1040; 35.3% identity (64.2% similar) in 553 aa overlap (122-661:388-926)
100 110 120 130 140 150
pF1KSD RIQESNGTWRCKVCAKEIELKKATGDWFYDQKVNRFAYRTGSEIIRMSLRHKPAVSKRET
.: . : :.: . : :.: .:
CCDS53 SVLESDRLKNGMEDAGDTEEFQSDPKPSQYRKPSLFHQSTSSPYVSKSETHQPMTSGSFP
360 370 380 390 400 410
160 170 180 190 200
pF1KSD VGQSLLHQTQMGDIWPGRKIIQERQKEPS-VLFEVPKLKS--GKSALEAESESLDSFTAD
.. .: .... : . .::. :. .:.: .: . :. .. ..
CCDS53 IN-GLHSHSEVLTARPQSMENSPTINEPKDKSSELTRLESVLPRSPADELSHCVEPEPSQ
420 430 440 450 460 470
210 220 230 240 250 260
pF1KSD SDSTSRRDSLDKSGLFPEWKKMSAPKSQVEKETQPGGQNVVFVDEGEMIFKKNTRKILRP
. : :: . : : . .: ..: . . ... . .. .. ....:
CCDS53 VPGGSSRDRQQGSEEEPSPVLKTLERSAARKMPSKSLEDISSDSSNQAKVDNQPEELVRS
480 490 500 510 520 530
270 280 290 300 310 320
pF1KSD SEYTKSVIDLRPEDVVHESGSLGDRSKSVPGLNVDMEEEEEEEDI--DHLVKLHRQKLAR
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CCDS53 AEDV-STVPTQPDNPFSHPDKLKRMSKSVPAFLQD-ESDDRETDTASESSYQLSRHKKSP
540 550 560 570 580 590
330 340 350 360 370
pF1KSD SSM-----QSG-SSMSTI-GSMMSIYSEAGDFGNIFVTGRIAFSLKYEQQTQSLVVHVKE
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CCDS53 SSLTNLSSSSGMTSLSSVSGSVMSVYS--GDFGNLEVKGNIQFAIEYVESLKELHVFVAQ
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380 390 400 410 420 430
pF1KSD CHQLAYADEAKKRSNPYVKTYLLPDKSRQGKRKTSIKRDTVNPLYDETLRYEIPESLLAQ
:..:: :: :.::.::::.::::::...::.:: . . :.::.:.: :::.: ...:
CCDS53 CKDLAAADVKKQRSDPYVKAYLLPDKGKMGKKKTLVVKKTLNPVYNEILRYKIEKQILKT
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pF1KSD RTLQFSVWHHGRFGRNTFLGEAEIQMDSWKLDKKLDHCLPLHGKISAESPTGLPS-HKGE
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CCDS53 QKLNLSIWHRDTFKRNSFLGEVELDLETWDWDNKQNKQLRWYPLKRKTAPVALEAENRGE
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pF1KSD LVVSLKYIPASKTPVGGDRKKSKGGEGGELQVWIKEAKNLTAAKAGGTSDSFVKGYLLPM
. ..:.:.: :: : . . : :...:.:: .: . :. .:::: .::
CCDS53 MKLALQYVPE---PVPGKKLPTTG----EVHIWVKECLDLPLLR-GSHLNSFVKCTILPD
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560 570 580 590 600 610
pF1KSD RNKASKRKTPVMKKTLNPHYNHTFVYNGVRLEDLQHMCLELTVWDREPLASNDFLGGVRL
.. :..:: .. :: :: .:::.::.: : :::.. :.::::::. : .:.::::.:.
CCDS53 TSRKSRQKTRAVGKTTNPIFNHTMVYDGFRPEDLMEACVELTVWDHYKL-TNQFLGGLRI
830 840 850 860 870 880
620 630 640 650 660 670
pF1KSD GVGTGISNGEVVDWMDSTGEEVSLWQKMRQYPGSWAEGTLQLRSSMAKQKLGL
: ::: : : :::::::.:::.::.:: . :..: :.:: ::
CCDS53 GFGTGKSYGTEVDWMDSTSEEVALWEKMVNSPNTWIEATLPLRMLLIAKISK
890 900 910 920 930
>>CCDS76461.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11 (902 aa)
initn: 691 init1: 438 opt: 1026 Z-score: 946.0 bits: 185.8 E(32554): 2.3e-46
Smith-Waterman score: 1026; 36.0% identity (65.5% similar) in 534 aa overlap (139-661:385-893)
110 120 130 140 150 160
pF1KSD IELKKATGDWFYDQKVNRFAYRTGSEIIRMSLRHKPAVSKRETVGQSLLHQTQMGDIWPG
:....:.... . .. : . .. :.
CCDS76 KSETHQPMTSGSFPINGLHSHSEVLTARPQSMENSPTINEPKDKSSELTRLESVLPRSPA
360 370 380 390 400 410
170 180 190 200 210 220
pF1KSD RKIIQERQKEPSVLFEVPKLKSGKSALEAESESLDSFTADSDSTSRRDSLDKSGLFPEWK
.. . . ::: .:: .: .: : . . :..:. . ...: .
CCDS76 DELSHCVEPEPS---QVPGGSSRDRQQGSEEEPSPVLKTLERSAARK--MPSKSL----E
420 430 440 450 460
230 240 250 260 270 280
pF1KSD KMSAPKS-QVEKETQPGGQNVVFVDEGEMIFKKNTRKILRPSEYTKSVIDLRPEDVVHES
.:. .: :.. ..:: ...: : . : . . . :.. .:.. .
CCDS76 DISSDSSNQAKVDNQP--EELVRSAEDDE--KPDQKPVTNECVPRISTVPTQPDNPFSHP
470 480 490 500 510 520
290 300 310 320 330
pF1KSD GSLGDRSKSVPGLNVDMEEEEEEEDI--DHLVKLHRQKLARSSM-----QSG-SSMSTI-
.: :::::.. : : ...: : . .: :.: . ::. .:: .:.:..
CCDS76 DKLKRMSKSVPAFLQD-ESDDRETDTASESSYQLSRHKKSPSSLTNLSSSSGMTSLSSVS
530 540 550 560 570 580
340 350 360 370 380 390
pF1KSD GSMMSIYSEAGDFGNIFVTGRIAFSLKYEQQTQSLVVHVKECHQLAYADEAKKRSNPYVK
::.::.:: :::::. : : : :...: .. . : : : .:..:: :: :.::.::::
CCDS76 GSVMSVYS--GDFGNLEVKGNIQFAIEYVESLKELHVFVAQCKDLAAADVKKQRSDPYVK
590 600 610 620 630
400 410 420 430 440 450
pF1KSD TYLLPDKSRQGKRKTSIKRDTVNPLYDETLRYEIPESLLAQRTLQFSVWHHGRFGRNTFL
.::::::...::.:: . . :.::.:.: :::.: ...: . :..:.::. : ::.::
CCDS76 AYLLPDKGKMGKKKTLVVKKTLNPVYNEILRYKIEKQILKTQKLNLSIWHRDTFKRNSFL
640 650 660 670 680 690
460 470 480 490 500 510
pF1KSD GEAEIQMDSWKLDKKLDHCLPLHGKISAESPTGLPS-HKGELVVSLKYIPASKTPVGGDR
::.:.....: :.: .. : . .:..: . ..::. ..:.:.: :: : .
CCDS76 GEVELDLETWDWDNKQNKQLRWYPLKRKTAPVALEAENRGEMKLALQYVPE---PVPGKK
700 710 720 730 740 750
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pF1KSD KKSKGGEGGELQVWIKEAKNLTAAKAGGTSDSFVKGYLLPMRNKASKRKTPVMKKTLNPH
. ::...:.:: .: . :. .:::: .:: .. :..:: .. :: ::
CCDS76 LPTT----GEVHIWVKECLDLPLLR-GSHLNSFVKCTILPDTSRKSRQKTRAVGKTTNPI
760 770 780 790 800 810
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pF1KSD YNHTFVYNGVRLEDLQHMCLELTVWDREPLASNDFLGGVRLGVGTGISNGEVVDWMDSTG
.:::.::.: : :::.. :.::::::. : .:.::::.:.: ::: : : :::::::.
CCDS76 FNHTMVYDGFRPEDLMEACVELTVWDHYKL-TNQFLGGLRIGFGTGKSYGTEVDWMDSTS
820 830 840 850 860
640 650 660 670
pF1KSD EEVSLWQKMRQYPGSWAEGTLQLRSSMAKQKLGL
:::.::.:: . :..: :.:: ::
CCDS76 EEVALWEKMVNSPNTWIEATLPLRMLLIAKISK
870 880 890 900
>>CCDS31652.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11 (376 aa)
initn: 691 init1: 438 opt: 1002 Z-score: 929.9 bits: 181.6 E(32554): 1.8e-45
Smith-Waterman score: 1002; 43.9% identity (71.7% similar) in 378 aa overlap (294-661:2-367)
270 280 290 300 310 320
pF1KSD KILRPSEYTKSVIDLRPEDVVHESGSLGDRSKSVPGLNVDMEEEEEEEDI--DHLVKLHR
:::::.. : : ...: : . .: :
CCDS31 MSKSVPAFLQD-ESDDRETDTASESSYQLSR
10 20 30
330 340 350 360 370
pF1KSD QKLARSSM-----QSG-SSMSTI-GSMMSIYSEAGDFGNIFVTGRIAFSLKYEQQTQSLV
.: . ::. .:: .:.:.. ::.::.:: :::::. : : : :...: .. . :
CCDS31 HKKSPSSLTNLSSSSGMTSLSSVSGSVMSVYS--GDFGNLEVKGNIQFAIEYVESLKELH
40 50 60 70 80
380 390 400 410 420 430
pF1KSD VHVKECHQLAYADEAKKRSNPYVKTYLLPDKSRQGKRKTSIKRDTVNPLYDETLRYEIPE
: : .:..:: :: :.::.::::.::::::...::.:: . . :.::.:.: :::.: .
CCDS31 VFVAQCKDLAAADVKKQRSDPYVKAYLLPDKGKMGKKKTLVVKKTLNPVYNEILRYKIEK
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pF1KSD SLLAQRTLQFSVWHHGRFGRNTFLGEAEIQMDSWKLDKKLDHCLPLHGKISAESPTGLPS
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CCDS31 QILKTQKLNLSIWHRDTFKRNSFLGEVELDLETWDWDNKQNKQLRWYPLKRKTAPVALEA
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pF1KSD -HKGELVVSLKYIPASKTPVGGDRKKSKGGEGGELQVWIKEAKNLTAAKAGGTSDSFVKG
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CCDS31 ENRGEMKLALQYVP---EPVPGKKLPTTG----EVHIWVKECLDLPLLR-GSHLNSFVKC
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560 570 580 590 600 610
pF1KSD YLLPMRNKASKRKTPVMKKTLNPHYNHTFVYNGVRLEDLQHMCLELTVWDREPLASNDFL
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CCDS31 TILPDTSRKSRQKTRAVGKTTNPIFNHTMVYDGFRPEDLMEACVELTVWDHYKL-TNQFL
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pF1KSD GGVRLGVGTGISNGEVVDWMDSTGEEVSLWQKMRQYPGSWAEGTLQLRSSMAKQKLGL
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CCDS31 GGLRIGFGTGKSYGTEVDWMDSTSEEVALWEKMVNSPNTWIEATLPLRMLLIAKISK
320 330 340 350 360 370
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: : . :. .: . ... . ....:.
CCDS41 MSDDRETDTASESSYQLSRHKKSPSSLTNLSSS
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340 350 360 370 380
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CCDS41 SGMTSLSSVSGSVMSVYS--GDFGNLEVKGNIQFAIEYVESLKELHVFVAQCKDLAAADV
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CCDS41 KKQRSDPYVKAYLLPDKGKMGKKKTLVVKKTLNPVYNEILRYKIEKQILKTQKLNLSIWH
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CCDS41 RDTFKRNSFLGEVELDLETWDWDNKQNKQLRWYPLKRKTAPVALEAENRGEMKLALQYVP
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CCDS41 E---PVPGKKLPTTG----EVHIWVKECLDLPLLR-GSHLNSFVKCTILPDTSRKSRQKT
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.. :: :: .:::.::.: : :::.. :.::::::. : .:.::::.:.: ::: : :
CCDS41 RAVGKTTNPIFNHTMVYDGFRPEDLMEACVELTVWDHYKL-TNQFLGGLRIGFGTGKSYG
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:::::::.:::.::.:: . :..: :.:: ::
CCDS41 TEVDWMDSTSEEVALWEKMVNSPNTWIEATLPLRMLLIAKISK
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CCDS31 ESDRLKNGMEDAGDTEEFQSDPKPSQYRKPSLFHQSTSS---PYVSKSETHQPMTSGSFP
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. :.: . .: :. .:... . .. .. . : . ...: : .. :. :::
CCDS31 INGLHSHSEVLTARPQSMENSPTINEPKDKSSELTRLESVLPRSPADELSHCVEPEPSQV
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pF1KSD E----KETQPGGQNVVFVDEGEMIFKKNTRKILR--PSEYTKSV---------IDLRPED
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CCDS31 PGGSSRDRQQGSE-----EEPSPVLKTLERSAARKMPSKSLEDISSDSSNQAKVDNQPEE
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CCDS31 LVR-SAEDDEKPDQKPVTNECVPRISTVPTQPDNPFSHPDKLKRMSKSVPAFLQDEVS--
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pF1KSD TIGSMMSIYSEAGDFGNIFVTGRIAFSLKYEQQTQSLVVHVKECHQLAYADEAKKRSNPY
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CCDS31 --GSVMSVYS--GDFGNLEVKGNIQFAIEYVESLKELHVFVAQCKDLAAADVKKQRSDPY
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CCDS31 VKAYLLPDKGKMGKKKTLVVKKTLNPVYNEILRYKIEKQILKTQKLNLSIWHRDTFKRNS
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pF1KSD FLGEAEIQMDSWKLDKKLDHCLPLHGKISAESPTGLPS-HKGELVVSLKYIPASKTPVGG
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CCDS31 FLGEVELDLETWDWDNKQNKQLRWYPLKRKTAPVALEAENRGEMKLALQYVP---EPVPG
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pF1KSD DRKKSKGGEGGELQVWIKEAKNLTAAKAGGTSDSFVKGYLLPMRNKASKRKTPVMKKTLN
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CCDS31 KKLPTTG----EVHIWVKECLDLPLLR-GSHLNSFVKCTILPDTSRKSRQKTRAVGKTTN
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pF1KSD PHYNHTFVYNGVRLEDLQHMCLELTVWDREPLASNDFLGGVRLGVGTGISNGEVVDWMDS
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CCDS31 PIFNHTMVYDGFRPEDLMEACVELTVWDHYKL-TNQFLGGLRIGFGTGKSYGTEVDWMDS
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pF1KSD TGEEVSLWQKMRQYPGSWAEGTLQLRSSMAKQKLGL
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CCDS31 TSEEVALWEKMVNSPNTWIEATLPLRMLLIAKISK
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CCDS53 SLKELHVFVAQCKDLAAADVKKQRSDPYVKAYLLPDKGKMGKKKTLVVKKTLNPVYNEIL
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pF1KSD RYEIPESLLAQRTLQFSVWHHGRFGRNTFLGEAEIQMDSWKLDKKLDHCLPLHGKISAES
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CCDS53 RYKIEKQILKTQKLNLSIWHRDTFKRNSFLGEVELDLETWDWDNKQNKQLRWYPLKRKTA
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CCDS53 PVALEAENRGEMKLALQYVPE---PVPGKKLPTTG----EVHIWVKECLDLPLLR-GSHL
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CCDS53 NSFVKCTILPDTSRKSRQKTRAVGKTTNPIFNHTMVYDGFRPEDLMEACVELTVWDHYKL
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pF1KSD ASNDFLGGVRLGVGTGISNGEVVDWMDSTGEEVSLWQKMRQYPGSWAEGTLQLRSSMAKQ
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CCDS53 -TNQFLGGLRIGFGTGKSYGTEVDWMDSTSEEVALWEKMVNSPNTWIEATLPLRMLLIAK
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670
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CCDS53 ISK
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CCDS34 YEERAKKF----------------PTGGKHETVGGQLLQSYQ-------------KLSKI
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CCDS34 SVVPPTPPPVS-------ESQC-------SRSPGR--------------KVSAPD-----
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CCDS34 -------------------------ILKP---------LNQED---------PKCSTNPI
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pF1KSD LNVDMEEEEEEEDIDHLVKLHRQKLARSSMQSGSSMSTIGSMMSIYS---EAGDFGNIFV
: ..... .. : :.. ::. ::..:: : : :.: : :
CCDS34 L--------KQQNLP-------SSPAPSTIFSGGFRH--GSLISIDSTCTEMGNFDNANV
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pF1KSD TGRIAFSLKYEQQTQSLVVHVKECHQLAYADEAKKRSNPYVKTYLLPDKSRQGKRKTSIK
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CCDS34 TGEIEFAIHYCFKTHSLEICIKACKNLAYGEEKKKKCNPYVKTYLLPDRSSQGKRKTGVQ
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CCDS34 RNTVDPTFQETLKYQVAPAQLVTRQLQVSVWHLGTLARRVFLGEVIIPLATWDFEDSTTQ
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. : . .::. ..:. .:::.: : . :. : :: ... :: :.
CCDS34 SFRWHPLRAKAEKYEDSVPQSNGELTVRAKLVLPSR-P----RKLQEAQEGTDQPSLHGQ
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CCDS34 LCLVVLGAKNLPV-RPDGTLNSFVKGCLTLPDQQKL-RLKSPVLRKQACPQWKHSFVFSG
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pF1KSD VRLEDLQHMCLELTVWDREPLASND-FLGGVRLGVGTGISNGEVVDWMDSTGEEVSLWQK
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CCDS34 VTPAQLRQSSLELTVWDQALFGMNDRLLGGTRLG-----SKGDTAVGGDACSLSKLQWQK
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pF1KSD MRQYPGSWAEGTLQLRSSMAKQKLGL
. . :. :.. :: :
CCDS34 VLSSPNLWTDMTLVLH
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CCDS56 MAQEIDLSALKELEREAILQVLYRDQAVQNTEEERTRKLKTHLQHLRWKGAKNTDWEHKE
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CCDS56 KCCARCQQVLGFLLHRGAVCRGCSHRVCAQCRVFLRGTHAWKCTVCFEDRNVKIKTGEWF
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CCDS56 YEERAKKF----------------PTGGKHETVGGQLLQSYQKLSKISVVPPTPPPVSES
130 140 150 160
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pF1KSD Q--KEPSVLFEVPKLKSGKSALEAESESLDSFTADSDSTSRRDSLDKSGLFPEWKKMSAP
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CCDS56 QCSRSPGRLQEFGQFRGFNKSVENLFLSLATHVK-KLSKSQNDMTSEKHLLATGPRQCV-
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pF1KSD KSQVEKETQPGGQNVVFVDEGEMIFKKNTRKILRPSEYTKSVIDLRPEDVVHESGSLGDR
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CCDS56 -GQTERRSQ--SDTAVNV---------TTRKVSAPDI-------LKP-------------
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pF1KSD SKSVPGLNVDMEEEEEEEDIDHLVKLHRQKLARSSMQSG--SSMSTIGSMMSIYS---EA
...:. . . . ..: .:.: : : :. ::..:: : :
CCDS56 ----------LNQEDPKCSTNPILK--QQNLPSSPAPSTIFSGGFRHGSLISIDSTCTEM
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CCDS56 GNFDNANVTGEIEFAIHYCFKTHSLEICIKACKNLAYGEEKKKKCNPYVKTYLLPDRSSQ
300 310 320 330 340 350
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CCDS56 GKRKTGVQRNTVDPTFQETLKYQVAPAQLVTRQLQVSVWHLGTLARRVFLGEVIIPLATW
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.. . . . : . .::. ..:. .:::.: : . :. : :: ... ::
CCDS56 DFEDSTTQSFRWHPLRAKAEKYEDSVPQSNGELTVRAKLVLPSR-P----RKLQEAQEGT
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:.: . . :::: . . :: .::::: : :: ..: . :.::..: :..
CCDS56 DQPSLHGQLCLVVLGAKNLPV-RPDGTLNSFVKGCLTLPDQQKL-RLKSPVLRKQACPQW
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CCDS56 KHSFVFSGVTPAQLRQSSLELTVWDQALFGMNDRLLGGTRLG-----SKGDTAVGGDACS
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CCDS56 LSKLQWQKVLSSPNLWTDMTLVLH
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671 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]