Result of FASTA (ccds) for
pFN21ASDA1951
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1951, 670 aa
1>>>pF1KSDA1951 670 - 670 aa - 670 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3541+/-0.000966; mu= 1.2451+/- 0.059
mean_var=368.9696+/-76.361, 0's: 0 Z-trim(118.0): 846 B-trim: 1584 in 2/51
Lambda= 0.066770
statistics sampled from 17939 (18869) to 17939 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.818), E-opt: 0.2 (0.58), width: 16
Scan time: 4.280
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12598.1 ZNF526 gene_id:116115|Hs108|chr19 ( 670) 4740 470.4 3.7e-132
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 751 86.1 1.8e-16
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 745 85.8 3.5e-16
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 745 85.8 3.6e-16
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 727 83.8 9e-16
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 727 83.9 9.4e-16
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 715 82.6 1.8e-15
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 717 82.9 1.8e-15
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 717 82.9 1.8e-15
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 720 83.3 1.9e-15
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 715 82.7 1.9e-15
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 715 82.7 1.9e-15
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 715 82.7 1.9e-15
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 714 82.6 2.2e-15
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 704 81.7 4.4e-15
CCDS12955.1 ZNF530 gene_id:348327|Hs108|chr19 ( 599) 697 80.9 5.9e-15
CCDS34357.1 ZNF311 gene_id:282890|Hs108|chr6 ( 666) 690 80.2 1e-14
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 692 80.6 1.1e-14
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 689 80.2 1.2e-14
CCDS32890.2 ZNF358 gene_id:140467|Hs108|chr19 ( 568) 685 79.7 1.3e-14
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 689 80.3 1.3e-14
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 689 80.3 1.3e-14
CCDS12632.1 ZNF45 gene_id:7596|Hs108|chr19 ( 682) 684 79.7 1.5e-14
CCDS2717.1 ZNF197 gene_id:10168|Hs108|chr3 (1029) 686 80.1 1.8e-14
CCDS12440.2 ZNF792 gene_id:126375|Hs108|chr19 ( 632) 678 79.1 2.2e-14
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 677 79.0 2.5e-14
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 591) 675 78.8 2.5e-14
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 676) 675 78.8 2.8e-14
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 671 78.3 2.8e-14
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 697) 675 78.8 2.8e-14
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 666 77.7 3.3e-14
CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 503) 668 78.0 3.6e-14
CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 819) 673 78.7 3.6e-14
CCDS42574.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 825) 673 78.7 3.6e-14
CCDS12972.1 ZNF329 gene_id:79673|Hs108|chr19 ( 541) 668 78.0 3.8e-14
CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 555) 668 78.0 3.9e-14
CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 564) 668 78.1 3.9e-14
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 666 77.8 4e-14
CCDS12956.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 577) 668 78.1 4e-14
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 675 79.1 4e-14
CCDS12846.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 731) 670 78.4 4.1e-14
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 666 77.8 4.1e-14
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 675 79.1 4.1e-14
CCDS82387.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 736) 670 78.4 4.1e-14
CCDS59418.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 742) 670 78.4 4.1e-14
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 669 78.2 4.2e-14
CCDS74468.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 616) 668 78.1 4.2e-14
CCDS46172.1 ZNF813 gene_id:126017|Hs108|chr19 ( 617) 668 78.1 4.2e-14
CCDS12966.1 ZNF256 gene_id:10172|Hs108|chr19 ( 627) 668 78.1 4.2e-14
CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 629) 668 78.1 4.2e-14
>>CCDS12598.1 ZNF526 gene_id:116115|Hs108|chr19 (670 aa)
initn: 4740 init1: 4740 opt: 4740 Z-score: 2486.2 bits: 470.4 E(32554): 3.7e-132
Smith-Waterman score: 4740; 100.0% identity (100.0% similar) in 670 aa overlap (1-670:1-670)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAEVVAEVAEMPTQMSPGAVEMSTPMSAEMMEMSTEVTEMTPGEALASSLFFQHHQFMCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAEVVAEVAEMPTQMSPGAVEMSTPMSAEMMEMSTEVTEMTPGEALASSLFFQHHQFMCS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ECGSLYNTLEEVLSHQEQHMLAVSEEEALTTQNVGLEPELVPGAEGPFQCGECSQLILSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ECGSLYNTLEEVLSHQEQHMLAVSEEEALTTQNVGLEPELVPGAEGPFQCGECSQLILSP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GELLAHQDAHLRESANQIQYQCWDCQELFPSPELWVAHRKAQHLSATVAEPPVPPPLPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GELLAHQDAHLRESANQIQYQCWDCQELFPSPELWVAHRKAQHLSATVAEPPVPPPLPPP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TPLPPPSPPSEVKMEPYECPECSTLCATPEEFLEHQGTHFDSLEKEERNGLEEEEEDDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TPLPPPSPPSEVKMEPYECPECSTLCATPEEFLEHQGTHFDSLEKEERNGLEEEEEDDEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD DEEDDEEMEDEEAMAEVGDDAVGGDESTAGWAQGCGDCPQHQPSAGARRQHRRTAHSPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DEEDDEEMEDEEAMAEVGDDAVGGDESTAGWAQGCGDCPQHQPSAGARRQHRRTAHSPAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ATHPFHCSQCQRSFSSANRLQAHGRAHVGGTHECTTCSKVFKKAASLEQHLRLHRGEARY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ATHPFHCSQCQRSFSSANRLQAHGRAHVGGTHECTTCSKVFKKAASLEQHLRLHRGEARY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LCVDCGRGFGTELTLVAHRRAHTANPLHRCRCGKTFSNMTKFLYHRRTHAGKSGAPPTGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LCVDCGRGFGTELTLVAHRRAHTANPLHRCRCGKTFSNMTKFLYHRRTHAGKSGAPPTGA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD TAPPAPAEPTPPPPPPAPPAQLPCPQCSKSFASASRLSRHRRAVHGPPERRHRCGVCGKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TAPPAPAEPTPPPPPPAPPAQLPCPQCSKSFASASRLSRHRRAVHGPPERRHRCGVCGKG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD FKKLIHVRNHLRTHTGERPFQCHSCGKTFASLANLSRHQLTHTGARPYQCLDCGKRFTQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FKKLIHVRNHLRTHTGERPFQCHSCGKTFASLANLSRHQLTHTGARPYQCLDCGKRFTQS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SNLQQHRRLHLRPVAFARAPRLPITGLYNKSPYYCGTCGRWFRAMAGLRLHQRVHARART
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SNLQQHRRLHLRPVAFARAPRLPITGLYNKSPYYCGTCGRWFRAMAGLRLHQRVHARART
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LTLQPPRSPSPAPPPPPEPQQTIMCTELGETIAIIETSQPLALEDTLQLCQAALGASEAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LTLQPPRSPSPAPPPPPEPQQTIMCTELGETIAIIETSQPLALEDTLQLCQAALGASEAG
610 620 630 640 650 660
670
pF1KSD GLLQLDTAFV
::::::::::
CCDS12 GLLQLDTAFV
670
>>CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 (688 aa)
initn: 2025 init1: 403 opt: 751 Z-score: 409.4 bits: 86.1 E(32554): 1.8e-16
Smith-Waterman score: 774; 27.4% identity (52.6% similar) in 565 aa overlap (49-601:159-671)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD AVEMSTPMSAEMMEMSTEVTEMTPGEALASSLFFQHHQFMCSECGSLYNTLEEVLSHQEQ
:. .. . :..::. .. .. ::.
CCDS12 HSRCHSTEKPYKCKECGKAFRRASHLTQHQSIHTGEKPYECKQCGKAFSRDSQLSLHQRL
130 140 150 160 170 180
80 90 100 110 120 130
pF1KSD HM----LAVSEE-EALTTQNVGLEPELVPGAEGPFQCGECSQLILSPGELLAHQDAHLRE
: : .: .:.: .. . . . .: :..: ::.. .. ..: :: .: :
CCDS12 HTGEKPYACKECGKAFTQSSQLILHHRIHTGEKPYKCEECGKAFIRSSQLTRHQKVHTGE
190 200 210 220 230 240
140 150 160 170 180 190
pF1KSD SANQIQYQCWDCQELFPSPELWVAHRKAQHLSATVAEPPVPPPLPPPTPLPPPSPPSEVK
. :.: .: . : . . :.. : . . : . ..
CCDS12 K----PYECKECGKAFTQNSQLTLHQRL-HTGEKLYECKECRKVFTQLSQLILHKRIHTG
250 260 270 280 290 300
200 210 220 230 240 250
pF1KSD MEPYECPECSTLCATPEEFLEHQGTHFDSLEKEERNGLEEEEEDDEEDEEDDEEMEDEEA
.:::: ::. .. .:: : :: :. : : ..
CCDS12 EKPYECKECGKAFICGSQLSQHQKIH---------NG----EKPYECKECGRAFIRGSLL
310 320 330 340 350
260 270 280 290 300 310
pF1KSD MAEVGDDAVGGDESTAGWAQGCGDCPQHQPSAGARRQHRRTAHSPASATHPFHCSQCQRS
: . . . :. : .: . .. ::.: :. .:..:..: .
CCDS12 MQH---QRIHTGEKP----YKCEECGKAFIRGSQLTQHQRI-HT---NEKPYECKECGKM
360 370 380 390
320 330 340 350 360 370
pF1KSD FSSANRLQAHGRAHVG-GTHECTTCSKVFKKAASLEQHLRLHRGEARYLCVDCGRGF--G
:: ...: : : :.: ..: :.:.:.... : .: :.: :: : : .::. : :
CCDS12 FSHGSQLTQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFNRGSLLTRHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRG
400 410 420 430 440 450
380 390 400 410 420
pF1KSD TELTLVAHRRAHTANPLHRCR-CGKTFSNMTKFLYHRRTHAGKSGAPPTGATAPPAPAEP
.::: :.: ::.. ..:. :::.: ... :.: :.:.. : : ..
CCDS12 SELT--QHERIHTGEKPYECKECGKSFIRGSQLTQHQRIHTGEK--PYECKECRMAFTQS
460 470 480 490 500 510
430 440 450 460 470 480
pF1KSD TP-PPPPPAPPAQLP--CPQCSKSFASASRLSRHRRAVHGPPERRHRCGVCGKGFKKLIH
. .. : : .:.:.:: . : .:.: : :. ..: :::.: . .
CCDS12 SHLSQHQRLHTGEKPYVCNECGKAFARGLLLIQHQRIHTG--EKPYQCKECGKAFIRGSQ
520 530 540 550 560 570
490 500 510 520 530 540
pF1KSD VRNHLRTHTGERPFQCHSCGKTFASLANLSRHQLTHTGARPYQCLDCGKRFTQSSNLQQH
. .: : ::::.:..:. :::.:. ..:. :: ::: .::.: .: : :::::.:..:
CCDS12 LTQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSHGSQLTLHQRIHTGEKPYECRECRKAFTQSSHLSRH
580 590 600 610 620 630
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RRLHLRPVAFARAPRLPITGLYNKSPYYCGTCGRWFRAMAGLRLHQRVHARARTLTLQPP
.:.: :: ..:: : ::. : . : :::.: ...
CCDS12 QRIH--------------TG---EKPYQCKECGKAFTRGSQLTQHQRIHISEKSFEYKEC
640 650 660 670
610 620 630 640 650 660
pF1KSD RSPSPAPPPPPEPQQTIMCTELGETIAIIETSQPLALEDTLQLCQAALGASEAGGLLQLD
CCDS12 GIDFSHGSQVYM
680
>>CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058 aa)
initn: 2837 init1: 379 opt: 745 Z-score: 403.9 bits: 85.8 E(32554): 3.5e-16
Smith-Waterman score: 829; 27.3% identity (55.4% similar) in 594 aa overlap (43-595:479-1055)
20 30 40 50 60
pF1KSD TQMSPGAVEMSTPMSAEMMEMSTEVTEMTPGEALAS-SLFFQHHQ-------FMCSECGS
:...:: : ..::.. . :.:::.
CCDS74 ECGKSFTFRSTRNRHQRIHTGEKPYNCKECGKSFASGSALLQHQRIHTGEKPYHCKECGK
450 460 470 480 490 500
70 80 90 100 110
pF1KSD LYNTLEEVLSHQEQHMLAVSEE-----EALTTQNVGLEPELVPGAEGPFQCGECSQLILS
.. ...:: : . ...:.... .. . . .: :..: ::.. .
CCDS74 SFTFRSGLIGHQAVHTGEKPYDCKECGKSFTSRSALIQHQRIHTGEKPYHCKECGKSFTV
510 520 530 540 550 560
120 130 140 150 160 170
pF1KSD PGELLAHQDAHLRESANQIQYQCWDCQELFPSPELWVAHRKAQHLSATVAEPPVPPPLPP
. :: ::. : :. :.: .: . : .: . : .:: . ..: :
CCDS74 GSTLLQHQQIHTGEKP----YDCKECGKAF---RLRL--RLTQHQQIHTGEKPYQCQECG
570 580 590 600 610
180 190 200 210 220
pF1KSD PTPLPPPSPPSEVKM----EPYECPECSTLCATPEEFLEHQGTHFDSLEKEER-------
. . . .. .. .:::::.:. . .:. : : .
CCDS74 KAFVSVSGLTQHHRIHTGEKPYECPDCGKAFRQRTYLNQHRRIHTGEKPYECKECGKSFT
620 630 640 650 660 670
230 240 250 260 270 280
pF1KSD --NGLEEEEEDDEEDEEDDEEMEDEEAMAEVGDDAVGGDESTAGWAQGCGDCPQHQPSAG
.:: ..... . ::. . : .... . . :. : .: . : .
CCDS74 FCSGLIQHQQN-HTDEKPYDGKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKPYDCKECGKSFTSHS
680 690 700 710 720 730
290 300 310 320 330 340
pF1KSD ARRQHRRTAHSPASATHPFHCSQCQRSFSSANRLQAHGRAHVG-GTHECTTCSKVFKKAA
. ::.. :. . . . :..: .::.: . : : :.: ..: :.: : .
CCDS74 TLIQHQQI-HT---GEKLYDCKECGKSFTSHSTLIQHQPLHTGEKPYHCKECGKSFTLRS
740 750 760 770 780 790
350 360 370 380 390 400
pF1KSD SLEQHLRLHRGEARYLCVDCGRGFGTELTLVAHRRAHTANPLHRCR-CGKTFSNMTKFLY
.: :: .: :: :: : .::..: .. ::. :.: ::.. ..:. :::.:. . ..
CCDS74 ALIQHRPVHTGEKRYSCKECGKSFTSRSTLIEHQRIHTGEKPYHCKECGKSFAFRSAIIQ
800 810 820 830 840 850
410 420 430 440 450 460
pF1KSD HRRTHAGKSGAP-PTGATAPPAPAEPTPPPPPPAPPAQLPCPQCSKSFASASRLSRHRRA
::: :.:.. . : .. : . : .:.:.:. : :..:. .
CCDS74 HRRIHTGEKPYDCKECGKAFRRRSKLTQHQRIHTGEKPYRCHECGKAFVRFSGLTKHH-S
860 870 880 890 900 910
470 480 490 500 510 520
pF1KSD VHGPPERRHRCGVCGKGFKKLIHVRNHLRTHTGERPFQCHSCGKTFASLANLSRHQLTHT
.: :. ..: .:::.:.. :. : : :::.::..:. :::.:. ..: ::: :::
CCDS74 IH-TGEKPYECKTCGKSFRQRTHLTLHQRIHTGDRPYECKECGKSFTCGSELIRHQRTHT
920 930 940 950 960 970
530 540 550 560 570
pF1KSD GARPYQCLDCGKRFTQSSNLQQHRRLHLRPVAFARAPR-----LPITGLY-------NKS
: .::.: .::: : :.:.::.:.: .. . :. . .:: ...
CCDS74 GEKPYDCKECGKAFRCPSQLSQHKRIHTGEKTY-QCPECGKAFFYASGLSRHQSVHTGEK
980 990 1000 1010 1020 1030
580 590 600 610 620 630
pF1KSD PYYCGTCGRWFRAMAGLRLHQRVHARARTLTLQPPRSPSPAPPPPPEPQQTIMCTELGET
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20 30 40 50 60
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.. ...:: : . ...:.... .. . . .: :..: ::.. .
CCDS59 SFTFRSGLIGHQAVHTGEKPYDCKECGKSFTSRSALIQHQRIHTGEKPYHCKECGKSFTV
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. :: ::. : :. :.: .: . : .: . : .:: . ..: :
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. . . .. .. .:::::.:. . .:. : : .
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.:: ..... . ::. . : .... . . :. : .: . : .
CCDS59 FCSGLIQHQQN-HTDEKPYDGKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKPYDCKECGKSFTSHS
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. ::.. :. . . . :..: .::.: . : : :.: ..: :.: : .
CCDS59 TLIQHQQI-HT---GEKLYDCKECGKSFTSHSTLIQHQPLHTGEKPYHCKECGKSFTLRS
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.: :: .: :: :: : .::..: .. ::. :.: ::.. ..:. :::.:. . ..
CCDS59 ALIQHRPVHTGEKRYSCKECGKSFTSRSTLIEHQRIHTGEKPYHCKECGKSFAFRSAIIQ
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pF1KSD HRRTHAGKSGAP-PTGATAPPAPAEPTPPPPPPAPPAQLPCPQCSKSFASASRLSRHRRA
::: :.:.. . : .. : . : .:.:.:. : :..:. .
CCDS59 HRRIHTGEKPYDCKECGKAFRRRSKLTQHQRIHTGEKPYRCHECGKAFVRFSGLTKHH-S
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pF1KSD VHGPPERRHRCGVCGKGFKKLIHVRNHLRTHTGERPFQCHSCGKTFASLANLSRHQLTHT
.: :. ..: .:::.:.. :. : : :::.::..:. :::.:. ..: ::: :::
CCDS59 IH-TGEKPYECKTCGKSFRQRTHLTLHQRIHTGDRPYECKECGKSFTCGSELIRHQRTHT
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pF1KSD GARPYQCLDCGKRFTQSSNLQQHRRLHLRPVAFARAPR-----LPITGLY-------NKS
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CCDS59 GEKPYDCKECGKAFRCPSQLSQHKRIHTGEKTY-QCPECGKAFFYASGLSRHQSVHTGEK
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pF1KSD PYYCGTCGRWFRAMAGLRLHQRVHARARTLTLQPPRSPSPAPPPPPEPQQTIMCTELGET
:: : :::. :. .. : :::.:
CCDS59 PYECKTCGKAFKQLTQLTRHQRIHDLT
1070 1080 1090
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30 40 50 60 70
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.. . .:. .. . . . .: :..:..:.. ..: ..: .:: .: : .
CCDS12 RSYICIECGQAFIQKTHLIAHRRIHTGEKPYECSNCGKSFISKSQLQVHQRVHTRVKP--
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: : . ..: . :.:.:.: . . . : . .. .::
CCDS12 --YICTEYGKVFSNNSNLVTHKKVQSREKSSICTECGKAFTYRSELIIHQRI-HTGEKPY
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200 210 220 230 240 250
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:: .:. . . :: : . :: . :: .. .. . : .
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260 270 280 290 300 310
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.. : .. .. . :. : . : .: : .. .. . . ::.:
CCDS12 GHCGKLFTSKSQLHVHKRIHTGEKPYMCNKCGKAFTNRSNLITHQKTHTGEKSYICSKCG
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320 330 340 350 360 370
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..:.. . : .: : :.: .::.::.:.: . . :. : ..: :: .: : .::..:.
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. :..:.. ::.. . : .::..: ..:. :.: :.:.. . . . . ..
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: . : .:.:.:.. : ::.:... : :. . :. ::: :.. ..
CCDS12 LLVHQPVHTGEKPYVCAECGKAFSGRSNLSKHQKTHTG--EKPYICSECGKTFRQKSELI
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.: : ::::.:..: .:::.:.. ..:. :: ::: .:: : .::: ::. :::..:.
CCDS12 THHRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQLQVHQRIHTGEKPYVCAECGKAFTDRSNLNKHQT
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550 560 570 580 590 600
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: :: .:: :: ::. : . . .:: ::
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30 40 50 60 70
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.::. :..::. .. . ::. :
CCDS74 GEKLYECSQCGKGFSYNSDLSIHEKIHTGERHHE--CTDCGKAFTQKSTLKMHQKIHTGE
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.. . .:. .. . . . .: :..:..:.. ..: ..: .:: .: : .
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: : . ..: . :.:.:.: . . . : . .. .::
CCDS74 --YICTEYGKVFSNNSNLVTHKKVQSREKSSICTECGKAFTYRSELIIHQRI-HTGEKPY
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:: .:. . . :: : . :: . :: .. .. . : .
CCDS74 ECSDCGKAFTQKSALTVHQRIH--TGEKSYICMKCGLAFIQKAHLIAHQIIHTGEKPHKC
390 400 410 420 430 440
260 270 280 290 300 310
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.. : .. .. . :. : . : .: : .. .. . . ::.:
CCDS74 GHCGKLFTSKSQLHVHKRIHTGEKPYMCNKCGKAFTNRSNLITHQKTHTGEKSYICSKCG
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..:.. . : .: : :.: .::.::.:.: . . :. : ..: :: .: : .::..:.
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. :..:.. ::.. . : .::..: ..:. :.: :.:.. . . . . ..
CCDS74 QKSILIVHQKIHTGEKPYVCTECGRAFIRKSNFITHQRIHTGEKPYECSDCGKSFTSKSQ
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: . : .:.:.:.. : ::.:... : :. . :. ::: :.. ..
CCDS74 LLVHQPVHTGEKPYVCAECGKAFSGRSNLSKHQKTHTG--EKPYICSECGKTFRQKSELI
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pF1KSD NHLRTHTGERPFQCHSCGKTFASLANLSRHQLTHTGARPYQCLDCGKRFTQSSNLQQHRR
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CCDS74 THHRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQLQVHQRIHTGEKPYVCAECGKAFTDRSNLNKHQT
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CCDS74 TH--------------TG---DKPYKCGICGKGFVQKSVFSVHQSSHA
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CCDS74 PMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTH--
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CCDS74 -------TG-----ERPYECHECLKGFRNSSALTK--HQRIHTGEKP----YKCTQCGRT
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CCDS74 FNQIAPLIQHQRT-H---TGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKA
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CCDS74 FRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQI
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pF1KSD TCGRWFRAMAGLRLHQRVHARARTLTLQPPRSPSPAPPPPPEPQQTIMCTELGETIAIIE
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CCDS74 QCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGK
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CCDS46 VTQEPSPEETSTKRSIKQNSNPVKKEKSCKCNECGKAFSYCSALIRHQRTHTGEKPYKCN
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CCDS46 ECEKAFSRSENLINHQRIHTGDKPYKCDQCGKGFIEGPSLTQHQRIHTGEKP----YKCD
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CCDS46 ECGKAFSQRTHLVQHQRI-HTGE----------------------------KPYTCNECG
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CCDS46 KAFSQRGHFMEHQKIH--TGEKPFKC------------DECDKTFTRSTHLTQ--HQKIH
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CCDS46 TGEKT----YKCNECGKAFNGPSTFIR--H----HMIHTGEKPYECNECGKAFSQHSNLT
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CCDS46 IHTREKPFECSECGKAFSYLSNLNQHQKTHTQEKAYECKECGKAFIRSSSLAKHERIHTG
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CCDS46 EKPYQ--CHECGKTFSYGSSLIQHRK-IH-TGERPYKCNECGRAFNQNIHLTQHKRIHTG
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CCDS46 AKPYECAECGKAFRHCSSLAQHQKTHTEEKPYQCNKCEKTFSQSSHLTQHQRIHTGEKPY
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pF1KSD -------AFARAPRLP--ITGLYNKSPYYCGTCGRWFRAMAGLRLHQRVHARARTLTLQP
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CCDS46 KCNECDKAFSRSTHLTEHQNTHTGEKPYNCNECRKTFSQSTYLIQHQRIHSGEKPFGCND
680 690 700 710 720 730
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CCDS46 CGKSFRYRSALNKHQRLHPGI
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30 40 50 60 70
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CCDS12 --YICTEYGKVFSNNSNLITHEKIQSREKSSICTECGKAFTYRSELIIHQRI-HTGEKPY
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:: .:. . . :: : . :: . :: .. .. . :
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.. : .. .. . :. : . : .: : .. .. . . ::.:
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..:.. . : .: : :.: .::.::.:.: . ..:. : ..: :: .: : .::..:.
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: . : .:.:.:.. : ::.:... : :. . :. ::: :.. ..
CCDS12 LLVHQPVHTGEKPYVCAECGKAFSGRSNLSKHQKTHTG--EKPYICSECGKTFRQKSELI
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.: : ::::.:..: .:::.:.. ..:. :: ::: .:: : .::: :.. :::..:.
CCDS12 THHRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQLQVHQRIHTGEKPYVCAECGKAFSNRSNLNKHQT
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]