Result of FASTA (ccds) for
pFN21ASDA1599
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1599, 593 aa
1>>>pF1KSDA1599 593 - 593 aa - 593 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3918+/-0.000904; mu= 10.5035+/- 0.055
mean_var=120.3182+/-23.905, 0's: 0 Z-trim(110.2): 45 B-trim: 85 in 2/51
Lambda= 0.116925
statistics sampled from 11402 (11445) to 11402 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.687), E-opt: 0.2 (0.352), width: 16
Scan time: 2.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4825.1 CPNE5 gene_id:57699|Hs108|chr6 ( 593) 3970 680.7 1.4e-195
CCDS8733.1 CPNE8 gene_id:144402|Hs108|chr12 ( 564) 2439 422.5 7.4e-118
CCDS2574.2 CPNE9 gene_id:151835|Hs108|chr3 ( 553) 2379 412.3 8.1e-115
CCDS77695.1 CPNE9 gene_id:151835|Hs108|chr3 ( 503) 2085 362.7 6.3e-100
CCDS83078.1 CPNE5 gene_id:57699|Hs108|chr6 ( 301) 1982 345.2 6.9e-95
CCDS3072.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 ( 557) 1472 259.3 9.3e-69
CCDS75010.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 ( 575) 1472 259.3 9.5e-69
CCDS6243.1 CPNE3 gene_id:8895|Hs108|chr8 ( 537) 1453 256.1 8.3e-68
CCDS10774.1 CPNE2 gene_id:221184|Hs108|chr16 ( 548) 1444 254.6 2.4e-67
CCDS13260.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 ( 537) 1432 252.6 9.6e-67
CCDS46595.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 ( 542) 1432 252.6 9.7e-67
CCDS9607.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14 ( 557) 1406 248.2 2.1e-65
CCDS61413.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14 ( 612) 1406 248.2 2.3e-65
CCDS10981.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16 ( 558) 1375 243.0 7.8e-64
CCDS10980.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16 ( 633) 1366 241.5 2.5e-63
>>CCDS4825.1 CPNE5 gene_id:57699|Hs108|chr6 (593 aa)
initn: 3970 init1: 3970 opt: 3970 Z-score: 3624.8 bits: 680.7 E(32554): 1.4e-195
Smith-Waterman score: 3970; 100.0% identity (100.0% similar) in 593 aa overlap (1-593:1-593)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEQPEDMASLSEFDSLAGSIPATKVEITVSCRNLLDKDMFSKSDPLCVMYTQGMENKQWR
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CCDS48 MEQPEDMASLSEFDSLAGSIPATKVEITVSCRNLLDKDMFSKSDPLCVMYTQGMENKQWR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EFGRTEVIDNTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSKHDFLGQAFCTLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EFGRTEVIDNTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSKHDFLGQAFCTLG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD EIVGSPGSRLEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGGVPGKKCGTIILSAEELSNCRDVAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EIVGSPGSRLEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGGVPGKKCGTIILSAEELSNCRDVAT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD MQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMKNTLNPVWQTFSIPVRALC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMKNTLNPVWQTFSIPVRALC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD NGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARGQSQFNIYEVVNPKKKMKKKKYVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 NGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARGQSQFNIYEVVNPKKKMKKKKYVN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMSPYQLNAYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMSPYQLNAYA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGIDGILEAYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGIDGILEAYH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD RSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAAAVQDGSQYSVLLIITDGVISDMAQTKEAIVNAAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAAAVQDGSQYSVLLIITDGVISDMAQTKEAIVNAAK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDDVRISSRGKLAERDIVQFVPFRDYVDRTGNHVLSMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDDVRISSRGKLAERDIVQFVPFRDYVDRTGNHVLSMA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KSD RLARDVLAEIPDQLVSYMKAQGIRPRPPPAAPTHSPSQSPARTPPASPLHTHI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RLARDVLAEIPDQLVSYMKAQGIRPRPPPAAPTHSPSQSPARTPPASPLHTHI
550 560 570 580 590
>>CCDS8733.1 CPNE8 gene_id:144402|Hs108|chr12 (564 aa)
initn: 3141 init1: 2412 opt: 2439 Z-score: 2229.4 bits: 422.5 E(32554): 7.4e-118
Smith-Waterman score: 3106; 77.6% identity (90.4% similar) in 586 aa overlap (8-593:9-564)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEQPEDMASLSEFDSLAGSIPATKVEITVSCRNLLDKDMFSKSDPLCVMYTQGMENKQW
:.......:...::::.::..::::::::.: ::::::.::.:.::. ::.:
CCDS87 MDSRYNSTAGIGDLNQLSAAIPATRVEVSVSCRNLLDRDTFSKSDPICVLYVQGVGNKEW
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSKHDFLGQAFCTL
::::::::::::::::::::::.::::::..::::::::::::::.:::::::::.::::
CCDS87 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFILDYFFEERENLRFDLYDVDSKSPNLSKHDFLGQVFCTL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD GEIVGSPGSRLEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGGVPGKKCGTIILSAEELSNCRDVA
:::::: :::::::.. :.::::::::::.::::. :::..
CCDS87 GEIVGSQGSRLEKPIV--------------------GIPGKKCGTIILTAEELNCCRDAV
130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KSD TMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMKNTLNPVWQTFSIPVRAL
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::.:.: ::::
CCDS87 LMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGSFTICHKTEVVKNTLNPVWQAFKISVRAL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD CNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARGQSQFNIYEVVNPKKKMKKKKYV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::::::: :::::.
CCDS87 CNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELSRGQSQFNVYEVVNPKKKGKKKKYT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD NSGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMSPYQLNAY
:::::::::: ::.: .::::::::::::::::::::::::::.: ::::::.:::::::
CCDS87 NSGTVTLLSFLVETEVSFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPAQPTSLHYMNPYQLNAY
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KSD ALALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGIDGILEAY
..:: :::::.: :::::::::::::::::::::.:::: :::: .:: : ::.:..:::
CCDS87 GMALKAVGEIVQDYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRISHEFALNGNPQNPYCDGIEGVMEAY
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KSD HRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAAAVQDGSQYSVLLIITDGVISDMAQTKEAIVNAA
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CCDS87 YRSLKSVQLYGPTNFAPVINHVARYASSVKDGSQYFVLLIVTDGVISDMAQTKESIVNAS
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KSD KLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDDVRISSRGKLAERDIVQFVPFRDYVDRTGNHVLSM
:::::::::::: :::::::::::::::.::::: ::::::::::::::.::.:::.:::
CCDS87 KLPMSIIIVGVGPAEFDAMVELDGDDVRVSSRGKYAERDIVQFVPFRDYIDRSGNHILSM
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KSD ARLARDVLAEIPDQLVSYMKAQGIRPRPPPAAPTHSPSQSPARTPPASPLHTHI
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CCDS87 ARLAKDVLAEIPEQFLSYMRARGIKPSPAP----------PPYTPPTHVLQTQI
530 540 550 560
>>CCDS2574.2 CPNE9 gene_id:151835|Hs108|chr3 (553 aa)
initn: 2969 init1: 2363 opt: 2379 Z-score: 2174.9 bits: 412.3 E(32554): 8.1e-115
Smith-Waterman score: 2918; 76.1% identity (89.8% similar) in 568 aa overlap (19-585:10-553)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEQPEDMASLSEFDSLAGSIPATKVEITVSCRNLLDKDMFSKSDPLCVMYTQGMENKQWR
:.::::.::::::::::: : ::::::. :.:::. ...::
CCDS25 MSLGGASERSVPATKIEITVSCRNLLDLDTFSKSDPMVVLYTQSRASQEWR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KSD EFGRTEVIDNTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSK-HDFLGQAFCTL
::::::::::::::::::::..:::::::::::::.:.::::. ..:: .::::::: .:
CCDS25 EFGRTEVIDNTLNPDFVRKFVLDYFFEEKQNLRFDVYNVDSKT-NISKPKDFLGQAFLAL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD GEIVGSPGSRLEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGGVPGKKCGTIILSAEELSNCRDVA
::..:. :::.:. :: ::::::::::.:.:::::::::.:
CCDS25 GEVIGGQGSRVERTLT--------------------GVPGKKCGTILLTAEELSNCRDIA
120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KSD TMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMKNTLNPVWQTFSIPVRAL
:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::: ::::::::
CCDS25 TMQLCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVVKNTLNPVWQPFSIPVRAL
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD CNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARGQSQFNIYEVVNPKKKMKKKKYV
::::::::.:..:::::::::::::::::::::::...:.::..:::.::.:: ::::::
CCDS25 CNGDYDRTVKIDVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELSKAQNQFTVYEVLNPRKKCKKKKYV
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD NSGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMSPYQLNAY
::::::::::.:.:: ::.::::::::.::::::::::::::: : :::::::::::.::
CCDS25 NSGTVTLLSFSVDSEFTFVDYIKGGTQLNFTVAIDFTASNGNPLQPTSLHYMSPYQLSAY
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD ALALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGIDGILEAY
:.:: ::::::: :::::.::: ::::::::.::.::.::::.:.:.:.: ::.:.::.:
CCDS25 AMALKAVGEIIQDYDSDKLFPAYGFGAKLPPEGRISHQFPLNNNDEDPNCAGIEGVLESY
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD HRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAAAVQDGSQYSVLLIITDGVISDMAQTKEAIVNAA
.::::::::::: ::::...::: :: ..::::: :::::::::::::.:::::::.:.
CCDS25 FQSLRTVQLYGPTYFAPVINQVARAAAKISDGSQYYVLLIITDGVISDMTQTKEAIVSAS
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KSD KLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDDVRISSRGKLAERDIVQFVPFRDYVDRTGNHVLSM
.::::::::::: : :.:: ::::::::.::::. :::::::::::::::::.::.::::
CCDS25 SLPMSIIIVGVGPAMFEAMEELDGDDVRVSSRGRYAERDIVQFVPFRDYVDRSGNQVLSM
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KSD ARLARDVLAEIPDQLVSYMKAQGIRPRPPPAAPTHSPSQSPARTPPASPLHTHI
::::.:::::::.::.:::... :.::::: : .:: :: :
CCDS25 ARLAKDVLAEIPEQLLSYMRTRDIQPRPPPPA---NPSPIPAPEQP
520 530 540 550
>>CCDS77695.1 CPNE9 gene_id:151835|Hs108|chr3 (503 aa)
initn: 2659 init1: 2085 opt: 2085 Z-score: 1907.5 bits: 362.7 E(32554): 6.3e-100
Smith-Waterman score: 2624; 77.0% identity (90.5% similar) in 504 aa overlap (19-521:10-492)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEQPEDMASLSEFDSLAGSIPATKVEITVSCRNLLDKDMFSKSDPLCVMYTQGMENKQWR
:.::::.::::::::::: : ::::::. :.:::. ...::
CCDS77 MSLGGASERSVPATKIEITVSCRNLLDLDTFSKSDPMVVLYTQSRASQEWR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KSD EFGRTEVIDNTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSK-HDFLGQAFCTL
::::::::::::::::::::..:::::::::::::.:.::::. ..:: .::::::: .:
CCDS77 EFGRTEVIDNTLNPDFVRKFVLDYFFEEKQNLRFDVYNVDSKT-NISKPKDFLGQAFLAL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD GEIVGSPGSRLEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGGVPGKKCGTIILSAEELSNCRDVA
::..:. :::.:. :: ::::::::::.:.:::::::::.:
CCDS77 GEVIGGQGSRVERTLT--------------------GVPGKKCGTILLTAEELSNCRDIA
120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KSD TMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMKNTLNPVWQTFSIPVRAL
:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::: ::::::::
CCDS77 TMQLCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVVKNTLNPVWQPFSIPVRAL
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD CNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARGQSQFNIYEVVNPKKKMKKKKYV
::::::::.:..:::::::::::::::::::::::...:.::..:::.::.:: ::::::
CCDS77 CNGDYDRTVKIDVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELSKAQNQFTVYEVLNPRKKCKKKKYV
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD NSGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMSPYQLNAY
::::::::::.:.:: ::.::::::::.::::::::::::::: : :::::::::::.::
CCDS77 NSGTVTLLSFSVDSEFTFVDYIKGGTQLNFTVAIDFTASNGNPLQPTSLHYMSPYQLSAY
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD ALALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGIDGILEAY
:.:: ::::::: :::::.::: ::::::::.::.::.::::.:.:.:.: ::.:.::.:
CCDS77 AMALKAVGEIIQDYDSDKLFPAYGFGAKLPPEGRISHQFPLNNNDEDPNCAGIEGVLESY
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD HRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAAAVQDGSQYSVLLIITDGVISDMAQTKEAIVNAA
.::::::::::: ::::...::: :: ..::::: :::::::::::::.:::::::.:.
CCDS77 FQSLRTVQLYGPTYFAPVINQVARAAAKISDGSQYYVLLIITDGVISDMTQTKEAIVSAS
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KSD KLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDDVRISSRGKLAERDIVQFVPFRDYVDRTGNHVLSM
.::::::::::: : :.:: ::::::::.::::. :::::::
CCDS77 SLPMSIIIVGVGPAMFEAMEELDGDDVRVSSRGRYAERDIVQEGCCSLGTSVV
460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KSD ARLARDVLAEIPDQLVSYMKAQGIRPRPPPAAPTHSPSQSPARTPPASPLHTHI
>>CCDS83078.1 CPNE5 gene_id:57699|Hs108|chr6 (301 aa)
initn: 1982 init1: 1982 opt: 1982 Z-score: 1817.0 bits: 345.2 E(32554): 6.9e-95
Smith-Waterman score: 1982; 100.0% identity (100.0% similar) in 301 aa overlap (293-593:1-301)
270 280 290 300 310 320
pF1KSD FIGEFTTSYRELARGQSQFNIYEVVNPKKKMKKKKYVNSGTVTLLSFAVESECTFLDYIK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MKKKKYVNSGTVTLLSFAVESECTFLDYIK
10 20 30
330 340 350 360 370 380
pF1KSD GGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMSPYQLNAYALALTAVGEIIQHYDSDKMFPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMSPYQLNAYALALTAVGEIIQHYDSDKMFPAL
40 50 60 70 80 90
390 400 410 420 430 440
pF1KSD GFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGIDGILEAYHRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGIDGILEAYHRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVA
100 110 120 130 140 150
450 460 470 480 490 500
pF1KSD RNAAAVQDGSQYSVLLIITDGVISDMAQTKEAIVNAAKLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RNAAAVQDGSQYSVLLIITDGVISDMAQTKEAIVNAAKLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELD
160 170 180 190 200 210
510 520 530 540 550 560
pF1KSD GDDVRISSRGKLAERDIVQFVPFRDYVDRTGNHVLSMARLARDVLAEIPDQLVSYMKAQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GDDVRISSRGKLAERDIVQFVPFRDYVDRTGNHVLSMARLARDVLAEIPDQLVSYMKAQG
220 230 240 250 260 270
570 580 590
pF1KSD IRPRPPPAAPTHSPSQSPARTPPASPLHTHI
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 IRPRPPPAAPTHSPSQSPARTPPASPLHTHI
280 290 300
>>CCDS3072.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 (557 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KSD MEQPEDMASLSEFDSLAGSIPATKVEITVSCRNLLDKDMFSKSDPLCVMYTQGMENKQW
::::. :.:... :.: .:: :: .. :. . ::
CCDS30 MKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALSKPDPCVILKMQS--HGQW
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSKHDFLGQAFCTL
: ::::: . .:: . . : ::..::: : :::...:..:. :.. :::: :::
CCDS30 FEVDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNHNGLKEADFLGGMECTL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD GEIVGSPGSRLEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGGVPGKKCGTIILSAEELSNCRDVA
:.::.. .: : : ...:.. ::. :.: :::::. : .
CCDS30 GQIVSQ--RKLSKSL-----------------LKHGNTAGKSSITVI--AEELSGNDDYV
120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KSD TMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMKNTLNPVWQTFSIPVRAL
. : : ::: ::::.:::::: ..: :.:.: . :.:::. :.:.:.:..:.. : .:
CCDS30 ELAFNARKLDDKDFFSKSDPFLEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSL
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD CNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARG--QSQFNIYEVVNPKKKMKKKK
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CCDS30 CSGDPDRRLKCIVWDWDSNGKHDFIGEFTSTFKEM-RGAMEGKQVQWECINPKYKAKKKN
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD YVNSGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMSPYQLN
: ::::: : ... .::::: :: ::.::::::::::::.: .: ::::. ::: :
CCDS30 YKNSGTVILNLCKIHKMHSFLDYIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPN
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD AYALALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGIDGILE
: ::.::::: : :::::::::.::::..::. :::.: .: :..:: : ::.:..:
CCDS30 EYLKALVAVGEICQDYDSDKMFPAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVE
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD AYHRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAAA---VQDGSQYSVLLIITDGVISDMAQTKEA
::. : .:::::::.::.. .::..:. ....::: .:::.:::::.:::.:.::
CCDS30 AYQSCLPKLQLYGPTNIAPIIQKVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREA
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KSD IVNAAKLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDD-VRISSRGKLAERDIVQFVPFRDYVDRTG
::.:..::::.::::::.:.:. : ::::: . : .:. . ::::::::::..
CCDS30 IVHASHLPMSVIIVGVGNADFSDMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNF-----
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KSD NHVLSMARLARDVLAEIPDQLVSYMKAQGIRPRPPPAAPTHSPSQSPARTPPASPLHTHI
.:. : : ::..::::.:.:.:.:....::.:.
CCDS30 KHA-SPAALAKSVLAEVPNQVVDYYNGKGIKPKCSSEMYESSRTLAP
520 530 540 550
>>CCDS75010.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 (575 aa)
initn: 1542 init1: 653 opt: 1472 Z-score: 1347.7 bits: 259.3 E(32554): 9.5e-69
Smith-Waterman score: 1734; 50.2% identity (74.9% similar) in 550 aa overlap (23-566:42-561)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEQPEDMASLSEFDSLAGSIPATKVEITVSCRNLLDKDMFSKSDPLCVMYTQ
::::. :.:... :.: .:: :: .. :
CCDS75 KRRAGRRMKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALSKPDPCVILKMQ
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KSD GMENKQWREFGRTEVIDNTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSKHDFL
. . :: : ::::: . .:: . . : ::..::: : :::...:..:. :.. :::
CCDS75 S--HGQWFEVDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNHNGLKEADFL
80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD GQAFCTLGEIVGSPGSRLEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGGVPGKKCGTIILSAEEL
: ::::.::.. .: : : ...:.. ::. :.: ::::
CCDS75 GGMECTLGQIVSQ--RKLSKSL-----------------LKHGNTAGKSSITVI--AEEL
130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KSD SNCRDVATMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMKNTLNPVWQTF
:. : . . : : ::: ::::.:::::: ..: :.:.: . :.:::. :.:.:.:..:
CCDS75 SGNDDYVELAFNARKLDDKDFFSKSDPFLEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSF
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SIPVRALCNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARG--QSQFNIYEVVNPK
.. : .::.:: :: .: :.::: .:.::::::::....:. :: ... .: .:::
CCDS75 KVSVNSLCSGDPDRRLKCIVWDWDSNGKHDFIGEFTSTFKEM-RGAMEGKQVQWECINPK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD KKMKKKKYVNSGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHY
: :::.: ::::: : ... .::::: :: ::.::::::::::::.: .: ::::
CCDS75 YKAKKKNYKNSGTVILNLCKIHKMHSFLDYIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHY
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KSD MSPYQLNAYALALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCC
. ::: : : ::.::::: : :::::::::.::::..::. :::.: .: :..:: :
CCDS75 IHPYQPNEYLKALVAVGEICQDYDSDKMFPAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECA
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460
pF1KSD GIDGILEAYHRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAAA---VQDGSQYSVLLIITDGVISD
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CCDS75 GIQGVVEAYQSCLPKLQLYGPTNIAPIIQKVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITD
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KSD MAQTKEAIVNAAKLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDD-VRISSRGKLAERDIVQFVPFR
::.:.::::.:..::::.::::::.:.:. : ::::: . : .:. . ::::::::::
CCDS75 MADTREAIVHASHLPMSVIIVGVGNADFSDMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFR
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KSD DYVDRTGNHVLSMARLARDVLAEIPDQLVSYMKAQGIRPRPPPAAPTHSPSQSPARTPPA
.. .:. : : ::..::::.:.:.:.:....::.:.
CCDS75 NF-----KHA-SPAALAKSVLAEVPNQVVDYYNGKGIKPKCSSEMYESSRTLAP
530 540 550 560 570
590
pF1KSD SPLHTHI
>>CCDS6243.1 CPNE3 gene_id:8895|Hs108|chr8 (537 aa)
initn: 1178 init1: 677 opt: 1453 Z-score: 1330.9 bits: 256.1 E(32554): 8.3e-68
Smith-Waterman score: 1813; 52.1% identity (75.6% similar) in 553 aa overlap (23-570:7-531)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEQPEDMASLSEFDSLAGSIPATKVEITVSCRNLLDKDMFSKSDPLCVMYTQGMENKQWR
::: ..::: ::::::. ::::::::.. . ..::
CCDS62 MAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLN-TSGQQWY
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EFGRTEVIDNTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSKHDFLGQAFCTLG
: ::: : : :::.: . ::.::.:: :.:.: .::.:.:. .:: ::::. ::::
CCDS62 EVERTERIKNCLNPQFSKTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDFLGECECTLG
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KSD EIVGSPGSRLEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGGVPGKKCGTIILSAEELSNCRDVAT
.::.: ..: .::.. .::.: :: :.: .::::... : :.
CCDS62 QIVSS--KKLTRPLVM-------KTGRPA---------GK--GSITISAEEIKDNR-VVL
110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KSD MQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMKNTLNPVWQTFSIPVRALC
... : :::.::.::::::.: :.... ::.. . :.:::.::.:::::. :.: . .::
CCDS62 FEMEARKLDNKDLFGKSDPYLEFHKQTSDGNWLMVHRTEVVKNNLNPVWRPFKISLNSLC
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290
pF1KSD NGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARGQSQFNI-YEVVNPKKKMKKKKYV
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CCDS62 YGDMDKTIKVECYDYDNDGSHDLIGTFQTTMTKLKEASRSSPVEFECINEKKRQKKKSYK
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KSD NSGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMSPYQLNAY
:::.... . . :::::::: :: :.::::..:::.:::.: . ::::.:: .: :
CCDS62 NSGVISVKQCEITVECTFLDYIMGGCQLNFTVGVDFTGSNGDPRSPDSLHYISPNGVNEY
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KSD ALALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGIDGILEAY
:: .:: .:: ::.::::::.::::..::. .::::::.: : :: : ::.::.:::
CCDS62 LTALWSVGLVIQDYDADKMFPAFGFGAQIPPQWQVSHEFPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAY
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KSD HRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAAAV---QDGSQYSVLLIITDGVISDMAQTKEAIV
. : ..:::::::.:...:::: :::. : .::: ::::::::::.:. .:..:::
CCDS62 RSCLPQIKLYGPTNFSPIINHVARFAAAATQQQTASQYFVLLIITDGVITDLDETRQAIV
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KSD NAAKLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDDVRISSR-GKLAERDIVQFVPFRDYVDRTGNH
::..::::::::::: :.:.:: :::: . : :..: ::::::::::.. . .
CCDS62 NASRLPMSIIIVGVGGADFSAMEFLDGDGGSLRSPLGEVAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEA
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KSD VLSMARLARDVLAEIPDQLVSYMKAQGIRPRPPPAAPTHSPSQSPARTPPASPLHTHI
::. ::::::.:.:.:... . : ::
CCDS62 ------LAQCVLAEIPQQVVGYFNTYKLLPPKNPATKQQKQ
510 520 530
>>CCDS10774.1 CPNE2 gene_id:221184|Hs108|chr16 (548 aa)
initn: 1091 init1: 669 opt: 1444 Z-score: 1322.5 bits: 254.6 E(32554): 2.4e-67
Smith-Waterman score: 1787; 52.1% identity (75.9% similar) in 547 aa overlap (24-565:25-542)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEQPEDMASLSEFDSLAGSIPATKVEITVSCRNLLDKDMFSKSDPLCVMYTQGMENKQW
:::..:: .::::.:. :::::.::..:.. : .:
CCDS10 MAHIPSGGAPAAGAAPMGPQYCVCKVELSVSGQNLLDRDVTSKSDPFCVLFTEN--NGRW
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSKHDFLGQAFCTL
:. :::. :.::: : .::..:: ::: :.:.: :.: :..: :..:::::: :.:
CCDS10 IEYDRTETAINNLNPAFSKKFVLDYHFEEVQKLKFALFDQDKSSMRLDEHDFLGQFSCSL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD GEIVGSPGSRLEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGGVPGKKCGTIILSAEELSNCRDVA
: ::.: ... .:: . ::.. :: :: : : ..:.:::. : :
CCDS10 GTIVSS--KKITRPLLL----LNDK-----PA-------GK--GLITIAAQELSDNR-VI
120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KSD TMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMKNTLNPVWQTFSIPVRAL
:... . .:::::.:::::::: ::. ..:: . . :.:::.: ::.:::. :..:. .:
CCDS10 TLSLAGRRLDKKDLFGKSDPFLEFYKPGDDGKWMLVHRTEVIKYTLDPVWKPFTVPLVSL
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD CNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARGQSQFNI-YEVVNPKKKMKKKKY
:.::... :.: ::.: ::.::::::: :: .. ..... . .: .::::. :::.:
CCDS10 CDGDMEKPIQVMCYDYDNDGGHDFIGEFQTSVSQMCEARDSVPLEFECINPKKQRKKKNY
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD VNSGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMSPYQLNA
::: . : : .. . .::::: :: :. :::.:::::::::: . .::::..:. :
CCDS10 KNSGIIILRSCKINRDYSFLDYILGGCQLMFTVGIDFTASNGNPLDPSSLHYINPMGTNE
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD YALALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGIDGILEA
: :. :::.::: ::::::::::::::.:::: .::::: .: : :: : :.::: .:
CCDS10 YLSAIWAVGQIIQDYDSDKMFPALGFGAQLPPDWKVSHEFAINFNPTNPFCSGVDGIAQA
340 350 360 370 380 390
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pF1KSD YHRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAA-AVQD--GSQYSVLLIITDGVISDMAQTKEAI
: : ...::::::.:.:.:::: :: :.:. ..:: .:::::::::::: .:..:.
CCDS10 YSACLPHIRFYGPTNFSPIVNHVARFAAQATQQRTATQYFILLIITDGVISDMEETRHAV
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KSD VNAAKLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDDVRISSR-GKLAERDIVQFVPFRDYVDRTGN
:.:.::::::::::::.:.: :: ::::. . :. :. : ::::::::::.. .
CCDS10 VQASKLPMSIIIVGVGNADFAAMEFLDGDSRMLRSHTGEEAARDIVQFVPFREFRNA---
460 470 480 490 500 510
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pF1KSD HVLSMARLARDVLAEIPDQLVSYMKAQGIRPRPPPAAPTHSPSQSPARTPPASPLHTHI
. ::. ::::.:.:.:.:.: ... :
CCDS10 ---AKETLAKAVLAELPQQVVQYFKHKNLPPTNSEPA
520 530 540
>>CCDS13260.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 (537 aa)
initn: 1230 init1: 684 opt: 1432 Z-score: 1311.7 bits: 252.6 E(32554): 9.6e-67
Smith-Waterman score: 1739; 49.8% identity (74.1% similar) in 564 aa overlap (23-580:6-535)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEQPEDMASLSEFDSLAGSIPATKVEITVSCRNLLDKDMFSKSDPLCVMYTQGMENKQWR
: :....:: .:.:::. ::::::::. : . . .:
CCDS13 MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLL-QDVGGGSWA
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EFGRTEVIDNTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSKHDFLGQAFCTLG
:.:::: . : .:.: . . ..: :: :.::: .::.:.:.:.: :::: : :.::
CCDS13 ELGRTERVRNCSSPEFSKTLQLEYRFETVQKLRFGIYDIDNKTPELRDDDFLGGAECSLG
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KSD EIVGSPGSRLEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGGVPGKKCGTIILSAEELSNCRDVAT
.::.: . : :: . . ::: :. ::: .::.::.. : :.:
CCDS13 QIVSS--QVLTLPLML-------KPGKPA---------GR--GTITVSAQELKDNR-VVT
110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KSD MQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMKNTLNPVWQTFSIPVRALC
:. : .::::::.::::::: :.:.. :: . . ...::.::.:::.:. ::.::. .:
CCDS13 MEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQG-DGKWHLVYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPVQHFC
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KSD NGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARGQSQFNIYEVVNPKKKMKKKKYVN
.:. . :.:. :.: :::::.:: : :: ::. :. .: ..:.:..:::.: :
CCDS13 GGNPSTPIQVQCSDYDSDGSHDLIGTFHTS---LAQLQAVPAEFECIHPEKQQKKKSYKN
210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMSPYQLNAYA
:::. . ::.: .::::. :: ::::::..:::.:::.::. ::::.:: .: :
CCDS13 SGTIRVKICRVETEYSFLDYVMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYL
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGIDGILEAYH
.:: .:: ..: :::::.:::.::::..::: .::::: :: : :: : ::.::..::.
CCDS13 MALWSVGSVVQDYDSDKLFPAFGFGAQVPPDWQVSHEFALNFNPSNPYCAGIQGIVDAYR
320 330 340 350 360 370
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pF1KSD RSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAA-AVQDG--SQYSVLLIITDGVISDMAQTKEAIVN
..: :.:::::::::...:::: :: :...: ::: .::..:::...:. :.::.:
CCDS13 QALPQVRLYGPTNFAPIINHVARFAAQAAHQGTASQYFMLLLLTDGAVTDVEATREAVVR
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KSD AAKLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDDVRISSR-GKLAERDIVQFVPFRDYVDRTGNHV
:..::::.:::::: :.:.:: .::.: . .: :. : ::::::::.: . .
CCDS13 ASNLPMSVIIVGVGGADFEAMEQLDADGGPLHTRSGQAAARDIVQFVPYRRFQN------
440 450 460 470 480 490
540 550 560 570 580 590
pF1KSD LSMARLARDVLAEIPDQLVSYMKAQGIRP-RP-PPAAPTHSPSQSPARTPPASPLHTHI
::. ::::.: :::::..::: : .: ::.: ..:.:.:
CCDS13 APREALAQTVLAEVPTQLVSYFRAQGWAPLKPLPPSA--KDPAQAPQA
500 510 520 530
593 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 06:46:34 2016 done: Thu Nov 3 06:46:35 2016
Total Scan time: 2.400 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]