FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA1479, 1011 aa 1>>>pF1KSDA1479 1011 - 1011 aa - 1011 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7693+/-0.00109; mu= 5.3142+/- 0.065 mean_var=172.5085+/-34.638, 0's: 0 Z-trim(109.4): 61 B-trim: 174 in 1/51 Lambda= 0.097649 statistics sampled from 10808 (10865) to 10808 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.68), E-opt: 0.2 (0.334), width: 16 Scan time: 3.460 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS32224.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1011) 6882 982.6 0 CCDS32226.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1017) 6617 945.3 0 CCDS32228.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 597) 3747 540.8 3e-153 CCDS32227.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 998) 3746 540.8 5.2e-153 CCDS32225.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1073) 3742 540.3 8.2e-153 CCDS32229.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 476) 3220 466.6 5.6e-131 CCDS47256.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5 (1030) 2434 356.0 2.3e-97 CCDS75288.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5 (1047) 2434 356.0 2.4e-97 CCDS984.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 930) 2147 315.5 3.2e-85 CCDS12131.1 SEMA6B gene_id:10501|Hs108|chr19 ( 888) 2014 296.8 1.3e-79 CCDS53364.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 962) 2001 295.0 5.1e-79 CCDS53363.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 922) 1308 197.3 1.2e-49 CCDS5599.1 SEMA3A gene_id:10371|Hs108|chr7 ( 771) 923 143.1 2.2e-33 CCDS74941.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 749) 879 136.9 1.6e-31 CCDS74995.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1057) 879 136.9 2.1e-31 CCDS35491.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1151) 879 136.9 2.3e-31 CCDS58848.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1205) 879 137.0 2.4e-31 CCDS77744.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 748) 870 135.6 3.8e-31 CCDS55121.1 SEMA3E gene_id:9723|Hs108|chr7 ( 715) 859 134.0 1.1e-30 CCDS34674.1 SEMA3E gene_id:9723|Hs108|chr7 ( 775) 859 134.0 1.1e-30 CCDS3875.1 SEMA5A gene_id:9037|Hs108|chr5 (1074) 852 133.1 3e-30 CCDS47991.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9 ( 738) 822 128.8 4e-29 CCDS6685.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9 ( 862) 823 129.0 4.2e-29 CCDS82780.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 686) 768 121.2 7.4e-27 CCDS82779.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 754) 768 121.2 8e-27 CCDS2811.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 785) 768 121.2 8.3e-27 CCDS5596.1 SEMA3C gene_id:10512|Hs108|chr7 ( 751) 735 116.6 2e-25 CCDS77743.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 754) 722 114.7 7.2e-25 CCDS1132.1 SEMA4A gene_id:64218|Hs108|chr1 ( 761) 667 107.0 1.6e-22 CCDS34676.1 SEMA3D gene_id:223117|Hs108|chr7 ( 777) 656 105.4 4.6e-22 CCDS2029.1 SEMA4C gene_id:54910|Hs108|chr2 ( 833) 649 104.5 9.7e-22 CCDS2856.1 SEMA3G gene_id:56920|Hs108|chr3 ( 782) 603 98.0 8.2e-20 CCDS53378.1 SEMA4A gene_id:64218|Hs108|chr1 ( 629) 506 84.3 8.9e-16 CCDS45347.1 SEMA4B gene_id:10509|Hs108|chr15 ( 837) 483 81.1 1.1e-14 CCDS74529.1 SEMA4F gene_id:10505|Hs108|chr2 ( 737) 456 77.3 1.3e-13 CCDS77745.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 406) 444 75.4 2.6e-13 >>CCDS32224.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1011 aa) initn: 6882 init1: 6882 opt: 6882 Z-score: 5248.1 bits: 982.6 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6882; 100.0% identity (100.0% similar) in 1011 aa overlap (1-1011:1-1011) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KSD LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KSD FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KSD GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KSD AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KSD TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KSD KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KSD LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KSD NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KSD CGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCHGVRWEVQSGESNQMVHMN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 CGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCHGVRWEVQSGESNQMVHMN 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KSD VLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSCTDSSGSFAKLNGLFD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 VLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSCTDSSGSFAKLNGLFD 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KSD SPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPELAALPTPESTPVLHQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 SPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPELAALPTPESTPVLHQ 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KSD KTLQAMKSHSEKAHGHGASRKETPQFFPSSPPPHSPLSHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 KTLQAMKSHSEKAHGHGASRKETPQFFPSSPPPHSPLSHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFS 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KSD NSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLLKHLNDPNSNPKAIMGDIQM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 NSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLLKHLNDPNSNPKAIMGDIQM 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KSD AHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKRVDVPTTPGVPMTSLERQR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 AHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKRVDVPTTPGVPMTSLERQR 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 pF1KSD GYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPTGAKVDYIQGTPVSVHLQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 GYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPTGAKVDYIQGTPVSVHLQ 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 pF1KSD PSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTPSVRPLNKYTY ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 PSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTPSVRPLNKYTY 970 980 990 1000 1010 >>CCDS32226.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1017 aa) initn: 6637 init1: 3742 opt: 6617 Z-score: 5046.3 bits: 945.3 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6708; 96.9% identity (96.9% similar) in 1030 aa overlap (1-1011:1-1017) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KSD LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KSD FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KSD GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KSD AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KSD TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KSD KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KSD LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KSD NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KSD CGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCH------------------ ::::::::: :::::::::::::::::::: CCDS32 CGRVTPGML-------------AEGYEQDTEFGNTAHLGDCHEILPTSTTPDYKIFGGPT 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 pF1KSD -GVRWEVQSGESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAES ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 SGVRWEVQSGESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAES 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KSD AQSCTDSSGSFAKLNGLFDSPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 AQSCTDSSGSFAKLNGLFDSPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRG 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 pF1KSD QPPELAALPTPESTPVLHQKTLQAMKSHSEKAHGHGASRKETPQFFPSSPPPHSPLSHGH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 QPPELAALPTPESTPVLHQKTLQAMKSHSEKAHGHGASRKETPQFFPSSPPPHSPLSHGH 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 pF1KSD IPSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 IPSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLL 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 pF1KSD KHLNDPNSNPKAIMGDIQMAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 KHLNDPNSNPKAIMGDIQMAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTK 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 pF1KSD RVDVPTTPGVPMTSLERQRGYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 RVDVPTTPGVPMTSLERQRGYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPT 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 pF1KSD PTGAKVDYIQGTPVSVHLQPSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 PTGAKVDYIQGTPVSVHLQPSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTP 950 960 970 980 990 1000 1010 pF1KSD SVRPLNKYTY :::::::::: CCDS32 SVRPLNKYTY 1010 >>CCDS32228.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (597 aa) initn: 3874 init1: 3742 opt: 3747 Z-score: 2864.7 bits: 540.8 E(32554): 3e-153 Smith-Waterman score: 3864; 96.0% identity (96.8% similar) in 598 aa overlap (1-598:1-583) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KSD LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KSD FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KSD GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KSD AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KSD TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KSD KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KSD LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KSD NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KSD CGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCHGVRWEVQSGESNQMVHMN ::::::::: :::::::::::::::::::: . ::.:. . ::. CCDS32 CGRVTPGML-------------AEGYEQDTEFGNTAHLGDCHDM--EVSSSSVTTMVYDG 550 560 570 580 610 620 630 640 650 660 pF1KSD VLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSCTDSSGSFAKLNGLFD CCDS32 KSSLESPTRWST 590 >>CCDS32227.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (998 aa) initn: 6778 init1: 3742 opt: 3746 Z-score: 2860.5 bits: 540.8 E(32554): 5.2e-153 Smith-Waterman score: 6756; 98.7% identity (98.7% similar) in 1011 aa overlap (1-1011:1-998) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KSD LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KSD FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KSD GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KSD AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KSD TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KSD KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KSD LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KSD NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KSD CGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCHGVRWEVQSGESNQMVHMN ::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 CGRVTPGML-------------AEGYEQDTEFGNTAHLGDCHGVRWEVQSGESNQMVHMN 550 560 570 580 610 620 630 640 650 660 pF1KSD VLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSCTDSSGSFAKLNGLFD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 VLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSCTDSSGSFAKLNGLFD 590 600 610 620 630 640 670 680 690 700 710 720 pF1KSD SPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPELAALPTPESTPVLHQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 SPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPELAALPTPESTPVLHQ 650 660 670 680 690 700 730 740 750 760 770 780 pF1KSD KTLQAMKSHSEKAHGHGASRKETPQFFPSSPPPHSPLSHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 KTLQAMKSHSEKAHGHGASRKETPQFFPSSPPPHSPLSHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFS 710 720 730 740 750 760 790 800 810 820 830 840 pF1KSD NSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLLKHLNDPNSNPKAIMGDIQM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 NSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLLKHLNDPNSNPKAIMGDIQM 770 780 790 800 810 820 850 860 870 880 890 900 pF1KSD AHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKRVDVPTTPGVPMTSLERQR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 AHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKRVDVPTTPGVPMTSLERQR 830 840 850 860 870 880 910 920 930 940 950 960 pF1KSD GYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPTGAKVDYIQGTPVSVHLQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 GYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPTGAKVDYIQGTPVSVHLQ 890 900 910 920 930 940 970 980 990 1000 1010 pF1KSD PSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTPSVRPLNKYTY ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 PSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTPSVRPLNKYTY 950 960 970 980 990 >>CCDS32225.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1073 aa) initn: 6765 init1: 3742 opt: 3742 Z-score: 2857.0 bits: 540.3 E(32554): 8.2e-153 Smith-Waterman score: 6383; 91.7% identity (91.7% similar) in 1056 aa overlap (1-981:1-1043) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KSD LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KSD FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KSD GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KSD AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KSD TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KSD KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KSD LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KSD NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KSD CGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCH------------------ ::::::::: :::::::::::::::::::: CCDS32 CGRVTPGML-------------AEGYEQDTEFGNTAHLGDCHEILPTSTTPDYKIFGGPT 550 560 570 580 pF1KSD ---------------------------------------------------------GVR ::: CCDS32 SDMEVSSSSVTTMASIPEITPKVIDTWRPKLTSSRKFVVQDDPNTSDFTDPLSGIPKGVR 590 600 610 620 630 640 590 600 610 620 630 640 pF1KSD WEVQSGESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 WEVQSGESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSC 650 660 670 680 690 700 650 660 670 680 690 700 pF1KSD TDSSGSFAKLNGLFDSPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 TDSSGSFAKLNGLFDSPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPE 710 720 730 740 750 760 710 720 730 740 750 760 pF1KSD LAALPTPESTPVLHQKTLQAMKSHSEKAHGHGASRKETPQFFPSSPPPHSPLSHGHIPSA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 LAALPTPESTPVLHQKTLQAMKSHSEKAHGHGASRKETPQFFPSSPPPHSPLSHGHIPSA 770 780 790 800 810 820 770 780 790 800 810 820 pF1KSD IVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLLKHLN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 IVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLLKHLN 830 840 850 860 870 880 830 840 850 860 870 880 pF1KSD DPNSNPKAIMGDIQMAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKRVDV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 DPNSNPKAIMGDIQMAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKRVDV 890 900 910 920 930 940 890 900 910 920 930 940 pF1KSD PTTPGVPMTSLERQRGYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPTGA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 PTTPGVPMTSLERQRGYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPTGA 950 960 970 980 990 1000 950 960 970 980 990 1000 pF1KSD KVDYIQGTPVSVHLQPSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTPSVRP :::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 KVDYIQGTPVSVHLQPSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTPSVRP 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1010 pF1KSD LNKYTY CCDS32 LNKYTY 1070 >>CCDS32229.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (476 aa) initn: 3220 init1: 3220 opt: 3220 Z-score: 2465.0 bits: 466.6 E(32554): 5.6e-131 Smith-Waterman score: 3220; 100.0% identity (100.0% similar) in 476 aa overlap (1-476:1-476) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KSD LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KSD FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KSD GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KSD AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KSD TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KSD KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KSD LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAK 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 540 pF1KSD NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS >>CCDS47256.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5 (1030 aa) initn: 2791 init1: 1929 opt: 2434 Z-score: 1861.4 bits: 356.0 E(32554): 2.3e-97 Smith-Waterman score: 2952; 45.9% identity (70.1% similar) in 1074 aa overlap (1-1005:1-1025) 10 20 30 40 50 pF1KSD MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRG-RPSGNESQ-HRLD :: : :. :: .. ...::::.::.. .:..::::: : .:. : .: :::: CCDS47 MRSEALLLYFTLL---HFAGAGFPEDSEPISISHGNYTKQYPVFVGHKPGRNTTQRHRLD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KSD FQLMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDEC .:... . :::::.::..:::... :. .:::::.::: : ..: ::::::::: CCDS47 IQMIMIMNGTLYIAARDHIYTVDIDTSHTEEIYCSKKLTWKSRQADVDTCRMKGKHKDEC 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KSD HNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALF ::::::.. .::. .:::::::::: :: :...::: :.:.::.::::.::...::::: CCDS47 HNFIKVLLKKNDDALFVCGTNAFNPSCRNYKMDTLEPFGDEFSGMARCPYDAKHANVALF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KSD ADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFR ::::::::::.:::: :::::::.:.. .:::.:.::::.:::.:..:..::.:.::::: CCDS47 ADGKLYSATVTDFLAIDAVIYRSLGESPTLRTVKHDSKWLKEPYFVQAVDYGDYIYFFFR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KSD EIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQ :::::.:..::.:. :::..::::::::::::::.::::::::::::::::: :::..:: CCDS47 EIAVEYNTMGKVVFPRVAQVCKNDMGGSQRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHFYFNILQ 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KSD SITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVP ..::.:.::: .:...:.: ::::::::::..: :: .:: :::::::.:::.:: :: CCDS47 AVTDVIRINGRDVVLATFSTPYNSIPGSAVCAYDMLDIASVFTGRFKEQKSPDSTWTPVP 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KSD EDKVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVR ...:::::::::: . : : :: .:::.::.:::.::::: ::: : ..::: .: :: CCDS47 DERVPKPRPGCCAGSSSLERYATSNEFPDDTLNFIKTHPLMDEAVPSIFNRPWFLRTMVR 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KSD YRLTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAK--TSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAK :::: :.:: .::::::.::.:.::: :..:: ::. .: : ::::..:::. .:: : CCDS47 YRLTKIAVDTAAGPYQNHTVVFLGSEKGIILKFLARIGNSGF-LNDSLFLEEMSVYNSEK 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KSD CSAENEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWL :: .. :::.....:::. .::::::.:.:..::.::::.:.:::.:::::::::::. CCDS47 CSYDGVEDKRIMGMQLDRASSSLYVAFSTCVIKVPLGRCERHGKCKKTCIASRDPYCGWI 480 490 500 510 520 530 540 550 560 pF1KSD SQG-SCGRVTPGMLLLTED----------------FFAFHNHSA--------------EG ..: .:....:. : :. : :...::. :: CCDS47 KEGGACSHLSPNSRLTFEQDIERGNTDGLGDCHNSFVALNGHSSSLLPSTTTSDSTAQEG 540 550 560 570 580 590 570 580 590 600 pF1KSD YEQDTEFGNTAHLGDC------------H------GVRWEVQSGESNQMVHMNVLITCVF ::. . . :: : : :: : .:.: ...: :. CCDS47 YESRGGMLDWKHLLDSPDSTDPLGAVSSHNHQDKKGVIRESYLKGHDQLVPVTLLAIAVI 600 610 620 630 640 650 610 620 630 640 650 660 pF1KSD AAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKI--HKDAESAQSCTDSSGSFAKLNGLF-DSPVK :::.:: ..:..::: : ::. . .:. : ..: : .: .::.::: :. : CCDS47 LAFVMGAVFSGITVYCVCDHR-RKDVAVVQRKEKELTHSRRGSMSSVTKLSGLFGDTQSK 660 670 680 690 700 710 670 680 690 700 710 720 pF1KSD EYQ-QNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPELAALPTPESTPVLHQKTL . . . : .: .... :.. : :.: .:.. . .:.:::::::::.:.:: CCDS47 DPKPEAILTPLMHNGKLAT----P--GNTAKMLIKADQHHLDLTALPTPESTPTLQQKRK 720 730 740 750 760 730 740 750 760 770 pF1KSD QAMKSHSEKAHGH--GASRKETPQFFPSSPPPHSPL--SHGHIPSAIVLPNATHDYNTSF . :. . . . .: :. : . : :: : .::::..::: . . :. . CCDS47 PSRGSREWERNQNLINACTKDMPPMGSPVIPTDLPLRASPSHIPSVVVLPITQQGYQHEY 770 780 790 800 810 820 780 790 800 810 820 830 pF1KSD SNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLLKHLNDPNSNPKAIMGDIQ . . :.... . .... . ... .::.. . : CCDS47 VD------QPKMSEVAQMALEDQAATLEYKTIK---------EHLSSKSPN--------- 830 840 850 860 840 850 860 870 880 890 pF1KSD MAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKRVDVPTTPGVPMTSLERQ : ... . :. :::::.::::: : ..: ... .::... . . ... . CCDS47 --HGVNLVENLDSL---PPKVPQREASLGPPGASLSQTGLSKRLEMHHSSSY---GVDYK 870 880 890 900 910 900 910 920 930 940 950 pF1KSD RGYHKNSSQR-HSISAMPKN-LNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPTGAKVDYIQGTPVSV :.: :: : :. ... .: :: :. :::. :..:: : :. .:: :: : CCDS47 RSYPTNSLTRSHQATTLKRNNTNSSNSSHLSRNQSFGRGDN-PPPAPQRVDSIQ-----V 920 930 940 950 960 970 960 970 980 990 1000 1010 pF1KSD HL-QPS-----LSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTPSVRPLNKYTY : ::: .::: : .. ..: :.::::::::::::::::::.: . :..: CCDS47 HSSQPSGQAVTVSRQPSLNAYNSLTRSGLKRTPSLKPDVPPKPSFAPLSTSMKPNDACT 980 990 1000 1010 1020 1030 >>CCDS75288.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5 (1047 aa) initn: 2892 init1: 1929 opt: 2434 Z-score: 1861.3 bits: 356.0 E(32554): 2.4e-97 Smith-Waterman score: 2910; 45.2% identity (69.0% similar) in 1091 aa overlap (1-1005:1-1042) 10 20 30 40 50 pF1KSD MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRG-RPSGNESQ-HRLD :: : :. :: .. ...::::.::.. .:..::::: : .:. : .: :::: CCDS75 MRSEALLLYFTLL---HFAGAGFPEDSEPISISHGNYTKQYPVFVGHKPGRNTTQRHRLD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KSD FQLMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDEC .:... . :::::.::..:::... :. .:::::.::: : ..: ::::::::: CCDS75 IQMIMIMNGTLYIAARDHIYTVDIDTSHTEEIYCSKKLTWKSRQADVDTCRMKGKHKDEC 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KSD HNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALF ::::::.. .::. .:::::::::: :: :...::: :.:.::.::::.::...::::: CCDS75 HNFIKVLLKKNDDALFVCGTNAFNPSCRNYKMDTLEPFGDEFSGMARCPYDAKHANVALF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KSD ADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFR ::::::::::.:::: :::::::.:.. .:::.:.::::.:::.:..:..::.:.::::: CCDS75 ADGKLYSATVTDFLAIDAVIYRSLGESPTLRTVKHDSKWLKEPYFVQAVDYGDYIYFFFR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KSD EIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQ :::::.:..::.:. :::..::::::::::::::.::::::::::::::::: :::..:: CCDS75 EIAVEYNTMGKVVFPRVAQVCKNDMGGSQRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHFYFNILQ 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KSD SITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVP ..::.:.::: .:...:.: ::::::::::..: :: .:: :::::::.:::.:: :: CCDS75 AVTDVIRINGRDVVLATFSTPYNSIPGSAVCAYDMLDIASVFTGRFKEQKSPDSTWTPVP 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KSD EDKVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVR ...:::::::::: . : : :: .:::.::.:::.::::: ::: : ..::: .: :: CCDS75 DERVPKPRPGCCAGSSSLERYATSNEFPDDTLNFIKTHPLMDEAVPSIFNRPWFLRTMVR 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KSD YRLTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAK--TSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAK :::: :.:: .::::::.::.:.::: :..:: ::. .: : ::::..:::. .:: : CCDS75 YRLTKIAVDTAAGPYQNHTVVFLGSEKGIILKFLARIGNSGF-LNDSLFLEEMSVYNSEK 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KSD CSAENEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWL :: .. :::.....:::. .::::::.:.:..::.::::.:.:::.:::::::::::. CCDS75 CSYDGVEDKRIMGMQLDRASSSLYVAFSTCVIKVPLGRCERHGKCKKTCIASRDPYCGWI 480 490 500 510 520 530 540 550 560 pF1KSD SQG-SCGRVTPGMLLLTED----------------FFAFHN-----------------HS ..: .:....:. : :. : :... :: CCDS75 KEGGACSHLSPNSRLTFEQDIERGNTDGLGDCHNSFVALNDISTPLPDNEMSYNTVYGHS 540 550 560 570 580 590 570 580 590 pF1KSD A--------------EGYEQDTEFGNTAHLGDC------------H------GVRWEVQS . ::::. . . :: : : :: : CCDS75 SSLLPSTTTSDSTAQEGYESRGGMLDWKHLLDSPDSTDPLGAVSSHNHQDKKGVIRESYL 600 610 620 630 640 650 600 610 620 630 640 pF1KSD GESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKI--HKDAESAQSCTDS .:.: ...: :. :::.:: ..:..::: : ::. . .:. : ..: : CCDS75 KGHDQLVPVTLLAIAVILAFVMGAVFSGITVYCVCDHR-RKDVAVVQRKEKELTHSRRGS 660 670 680 690 700 710 650 660 670 680 690 700 pF1KSD SGSFAKLNGLF-DSPVKEYQ-QNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPEL .: .::.::: :. :. . . : .: .... :.. : :.: .:.. . .: CCDS75 MSSVTKLSGLFGDTQSKDPKPEAILTPLMHNGKLAT----P--GNTAKMLIKADQHHLDL 720 730 740 750 760 710 720 730 740 750 760 pF1KSD AALPTPESTPVLHQKTLQAMKSHSEKAHGH--GASRKETPQFFPSSPPPHSPL--SHGHI .:::::::::.:.:: . :. . . . .: :. : . : :: : .:: CCDS75 TALPTPESTPTLQQKRKPSRGSREWERNQNLINACTKDMPPMGSPVIPTDLPLRASPSHI 770 780 790 800 810 820 770 780 790 800 810 820 pF1KSD PSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLLK ::..::: . . :. . . . :.... . .... . ... . CCDS75 PSVVVLPITQQGYQHEYVD------QPKMSEVAQMALEDQAATLEYKTIK---------E 830 840 850 860 870 830 840 850 860 870 880 pF1KSD HLNDPNSNPKAIMGDIQMAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKR ::.. . : : ... . :. :::::.::::: : ..: ... .:: CCDS75 HLSSKSPN-----------HGVNLVENLDSL---PPKVPQREASLGPPGASLSQTGLSKR 880 890 900 910 920 890 900 910 920 930 940 pF1KSD VDVPTTPGVPMTSLERQRGYHKNSSQR-HSISAMPKN-LNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMP ... . . ... .:.: :: : :. ... .: :: :. :::. :..:: : CCDS75 LEMHHSSSY---GVDYKRSYPTNSLTRSHQATTLKRNNTNSSNSSHLSRNQSFGRGDN-P 930 940 950 960 970 950 960 970 980 990 pF1KSD TPTGAKVDYIQGTPVSVHL-QPS-----LSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKP :. .:: :: :: ::: .::: : .. ..: :.:::::::::::::::: CCDS75 PPAPQRVDSIQ-----VHSSQPSGQAVTVSRQPSLNAYNSLTRSGLKRTPSLKPDVPPKP 980 990 1000 1010 1020 1030 1000 1010 pF1KSD SFVPQTPSVRPLNKYTY ::.: . :..: CCDS75 SFAPLSTSMKPNDACT 1040 >>CCDS984.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 (930 aa) initn: 2125 init1: 1414 opt: 2147 Z-score: 1643.5 bits: 315.5 E(32554): 3.2e-85 Smith-Waterman score: 2208; 45.5% identity (69.8% similar) in 774 aa overlap (4-756:7-758) 10 20 30 40 50 pF1KSD MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRG-RPSGNESQHR :. .:::. ..::.: :: : . . ::: . .. .. CCDS98 MPRAPHFMPLLLLLLLLSLPHTQAAFPQDPLPLLISDLQGTSPLSWFRGLEDDAVAAELG 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KSD LDFQLMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTE-VIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHK :::: .: . :: .:.::.:.. .:. . : ..::: ::::: :: ::::..:: CCDS98 LDFQRFLTLNRTLLVAARDHVFSFDLQAEEEGEGLVPNKYLTWRS--QDVENCAVRGKLT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KSD DECHNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNV :::.:.:.:.:: ... ...::::.:.:.:: : ...:. .:::.:: ::::::: :.:: CCDS98 DECYNYIRVLVPWDSQTLLACGTNSFSPVCRSYGITSLQQEGEELSGQARCPFDATQSNV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KSD ALFADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYF :.::.:.:::::.::: :::::.:::.: ::. ::::::..::::..:.:.:..::: CCDS98 AIFAEGSLYSATAADFQASDAVVYRSLGPQPPLRSAKYDSKWLREPHFVQALEHGDHVYF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KSD FFREIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFD ::::..:: ::.. .:::::.:: ::::: :.:..::::::: :::::::::: :::: CCDS98 FFREVSVEDARLGRVQFSRVARVCKRDMGGSPRALDRHWTSFLKLRLNCSVPGDSTFYFD 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KSD VLQSITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWT :::..: ....: .. :::::: ::::::::::: .:.::. :.:.::::.. :..:: CCDS98 VLQALTGPVNLHGRSALFGVFTTQTNSIPGSAVCAFYLDEIERGFEGKFKEQRSLDGAWT 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KSD AVPEDKVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKT : ::.::.:::: :: : : ...: :.::..:.:::.:::.: ::::.. .: .: : CCDS98 PVSEDRVPSPRPGSCAGVGGAALFSSSRDLPDDVLTFIKAHPLLDPAVPPVTHQPLLTLT 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KSD RVRYRLTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHA : :: ..:: :::..: ::.:.::. : :::::. . . . .:::::.::. : CCDS98 S-RALLTQVAVDGMAGPHSNITVMFLGSNDGTVLKVLTPGGRSGGPEPILLEEIDAYSPA 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KSD KCSAEN--EEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYC .::.. . ...:.:.:: . : :.::::.::. .::::: :.:.:..::.::.:::: CCDS98 RCSGKRTAQTARRIIGLELDTEGHRLFVAFSGCIVYLPLSRCARHGACQRSCLASQDPYC 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KSD GWLSQGSCGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDC-HGVRWEVQSGE :: :. .: . : : . .. .: :: :. . :: .::: .. . CCDS98 GWHSSRGCVDIR-GSGGTDVDQAGNQESMEHGDCQDGATGSQSGPGDSAYGVRRDLPPAS 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KSD SNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSCTDSS-GS ... : . .:.. : :::.::: ..:. : : : .:. :: :. : : CCDS98 ASRSVPIPLLLASVAAAFALGASVSGLLVSC---ACRRAHRRRGKDIETPGLPRPLSLRS 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KSD FAKLNGLFDSPVKEYQQN--IDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPELAAL .:.:.: : ... ...:.::...: ::.: ::::: : CCDS98 LARLHGGGPEPPPPSKDGDAVQTPQLYTTFLP-----PPEGVP----------PPELACL 660 670 680 690 710 720 730 740 750 pF1KSD PTPESTPVLHQKTLQAM-------KSHSEKAHGHGASRK------ETPQFFPSSPPPHSP ::::::: : : :.: ..... .: : :: .:. . ::: : CCDS98 PTPESTPELPVKHLRAAGDPWEWNQNRNNAKEGPGRSRGGHAAGGPAPRVLVRPPPPGCP 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 pF1KSD LSHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNT CCDS98 GQAVEVTTLEELLRYLHGPQPPRKGAEPPAPLTSRALPPEPAPALLGGPSPRPHECASPL 760 770 780 790 800 810 >>CCDS12131.1 SEMA6B gene_id:10501|Hs108|chr19 (888 aa) initn: 1840 init1: 1413 opt: 2014 Z-score: 1542.6 bits: 296.8 E(32554): 1.3e-79 Smith-Waterman score: 2172; 44.9% identity (70.5% similar) in 786 aa overlap (10-765:15-777) 10 20 30 40 50 pF1KSD MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGN---- .:::... ... :::. ::... : .:::: : : CCDS12 MQTPRASPPRPALLLLLLLLGGAHGL-FPEEPPPLSVAPRDYLNHYPVFVGSGPGRLTPA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KSD ESQHRLDFQLMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMK :. :..: .:.. ::.:. ::..: :.:. .::. ..:::::: .: . : :: CCDS12 EGADDLNIQRVLRVNRTLFIGDRDNLYRVELEPPTSTELRYQRKLTWRSNPSDINVCRMK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KSD GKHKDECHNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDAR ::.. ::.::.::.. :.. .::::.:::::.: : ..::. :..:::.::::.: . CCDS12 GKQEGECRNFVKVLLLRDESTLFVCGSNAFNPVCANYSIDTLQPVGDNISGMARCPYDPK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KSD QTNVALFADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGN ..:::::.:: :..:::.:::: :::::::.:: .:::.:.::::.:::.:.::.:.:. CCDS12 HANVALFSDGMLFTATVTDFLAIDAVIYRSLGDRPTLRTVKHDSKWFKEPYFVHAVEWGS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KSD YVYFFFREIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSF .:::::::::.: : : :.: :::::.::::.::: :::::.::::::::::::::::: CCDS12 HVYFFFREIAMEFNYLEKVVVSRVARVCKNDVGGSPRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSH 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KSD FYFDVLQSITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPD :::.:::..: .....: :.:..::.: :::::::::::.. .. ::.:::.:::.:. CCDS12 FYFNVLQAVTGVVSLGGRPVVLAVFSTPSNSIPGSAVCAFDLTQVAAVFEGRFREQKSPE 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KSD SVWTAVPEDKVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPW :.:: ::::.::.::::::: :. :..: .::. :.:.:.::::: ::: .. :: CCDS12 SIWTPVPEDQVPRPRPGCCAAPGMQ--YNASSALPDDILNFVKTHPLMDEAVPSLGHAPW 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KSD FTKTRVRYRLTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVL----AKTSPFSLNDSVLLE . .: .:..:: ..:: .:::. : ::.:.::::: ::: : :.:: : . ::.:: CCDS12 ILRTLMRHQLTRVAVDVGAGPWGNQTVVFLGSEAGTVLKFLVRPNASTSGTS-GLSVFLE 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KSD EIEAYNHAKCSAEN--EEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSC :.:.: .:. . : ....::.:: .: .:: :..:.:..::..:..: :.: CCDS12 EFETYRPDRCGRPGGGETGQRLLSLELDAASGGLLAAFPRCVVRVPVARCQQYSGCMKNC 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KSD IASRDPYCGWLSQGSCGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCHGVR :.:.:::::: .::: ..:: . ..:::. ..:. :::: :. CCDS12 IGSQDPYCGWAPDGSCIFLSPG--------------TRAAFEQDVSGASTSGLGDCTGLL 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 pF1KSD WEVQSGESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAES--AQ : . .: .:.:.: ::::.:: ..: .: . . :.. .:: :. :. CCDS12 RASLSEDRAGLVSVNLLVTSSVAAFVVGAVVSGFSVGWFVGLRERRELARRKDKEAILAH 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KSD SCTDSSGSFAKLNGLF-DSPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQ . .. : ..:. ..: . . . . . : . : :: .:. .. .: CCDS12 GAGEAVLSVSRLGERRAQGPGGRGGGGGGGAGVPPEALLA--PLMQNGWAKATLL--QGG 650 660 670 680 690 710 720 730 740 pF1KSD PPELAA--LPTPESTPVLHQKTLQAMKSHSE----KA--HGHG---ASRKET-----PQF : .: . :::::.:: : :: : . . : . .: ::: :: . . : CCDS12 PHDLDSGLLPTPEQTP-LPQKRLPTPHPHPHALGPRAWDHGHPLLPASASSSLLLLAPAR 700 710 720 730 740 750 750 760 770 780 790 800 pF1KSD FPSSPP-PHSPLSHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKR : .:: : : :.. .: CCDS12 APEQPPAPGEPTPDGRLYAARPGRASHGDFPLTPHASPDRRRVVSAPTGPLDPASAADGL 760 770 780 790 800 810 1011 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 06:26:26 2016 done: Thu Nov 3 06:26:26 2016 Total Scan time: 3.460 Total Display time: 0.380 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]