Result of FASTA (omim) for
pFN21ASDA1433
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1433, 639 aa
1>>>pF1KSDA1433 639 - 639 aa - 639 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.9743+/-0.000429; mu= -25.1749+/- 0.027
mean_var=468.9089+/-96.874, 0's: 0 Z-trim(123.5): 22 B-trim: 687 in 1/61
Lambda= 0.059228
statistics sampled from 43506 (43533) to 43506 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.79), E-opt: 0.2 (0.51), width: 16
Scan time: 12.870
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016857295 (OMIM: 615100) PREDICTED: CTTNBP2 N-t ( 639) 4105 365.1 4.3e-100
NP_061174 (OMIM: 615100) CTTNBP2 N-terminal-like p ( 639) 4105 365.1 4.3e-100
XP_011540083 (OMIM: 615100) PREDICTED: CTTNBP2 N-t ( 639) 4105 365.1 4.3e-100
XP_011514920 (OMIM: 609772) PREDICTED: cortactin-b ( 932) 833 85.6 8.9e-16
XP_016868196 (OMIM: 609772) PREDICTED: cortactin-b (1118) 833 85.6 1e-15
XP_011514918 (OMIM: 609772) PREDICTED: cortactin-b (1358) 833 85.6 1.2e-15
XP_016868195 (OMIM: 609772) PREDICTED: cortactin-b (1595) 833 85.7 1.4e-15
XP_005250691 (OMIM: 609772) PREDICTED: cortactin-b (1645) 833 85.7 1.5e-15
XP_011514917 (OMIM: 609772) PREDICTED: cortactin-b (1645) 833 85.7 1.5e-15
NP_219499 (OMIM: 609772) cortactin-binding protein (1663) 833 85.7 1.5e-15
XP_005248772 (OMIM: 607307) PREDICTED: filamin-A-i (1154) 503 57.4 3.3e-07
NP_001287795 (OMIM: 607307) filamin-A-interacting (1177) 503 57.4 3.4e-07
NP_056502 (OMIM: 607307) filamin-A-interacting pro (1213) 503 57.4 3.4e-07
XP_005248770 (OMIM: 607307) PREDICTED: filamin-A-i (1213) 503 57.4 3.4e-07
NP_001276916 (OMIM: 607307) filamin-A-interacting (1216) 503 57.4 3.5e-07
NP_001035924 (OMIM: 612993) filamin A-interacting (1133) 497 56.9 4.6e-07
NP_878913 (OMIM: 612993) filamin A-interacting pro (1135) 497 56.9 4.6e-07
>>XP_016857295 (OMIM: 615100) PREDICTED: CTTNBP2 N-termi (639 aa)
initn: 4105 init1: 4105 opt: 4105 Z-score: 1917.9 bits: 365.1 E(85289): 4.3e-100
Smith-Waterman score: 4105; 100.0% identity (100.0% similar) in 639 aa overlap (1-639:1-639)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MNLEKLSKPELLTLFSILEGELEARDLVIEALKAQHRDTFIEERYGKYNISDPLMALQRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MNLEKLSKPELLTLFSILEGELEARDLVIEALKAQHRDTFIEERYGKYNISDPLMALQRD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FETLKEKNDGEKQPVCTNPLSILKVVMKQCKNMQERMLSQLAAAESRHRKVILDLEEERQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FETLKEKNDGEKQPVCTNPLSILKVVMKQCKNMQERMLSQLAAAESRHRKVILDLEEERQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RHAQDTAEGDDVTYMLEKERERLTQQLEFEKSQVKKFEKEQKKLSSQLEEERSRHKQLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RHAQDTAEGDDVTYMLEKERERLTQQLEFEKSQVKKFEKEQKKLSSQLEEERSRHKQLSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD MLVLECKKATNKAAEEGQKAGELSLKLEKEKSRVSKLEEELAAERKRGLQTEAQVEKQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MLVLECKKATNKAAEEGQKAGELSLKLEKEKSRVSKLEEELAAERKRGLQTEAQVEKQLS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD EFDIEREQLRAKLNREENRTKTLKEEMESLKKIVKDLEASHQHSSPNEQLKKPVTVSKGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EFDIEREQLRAKLNREENRTKTLKEEMESLKKIVKDLEASHQHSSPNEQLKKPVTVSKGT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ATEPLMLMSVFCQTESFPAERTHGSNIAKMTNTGLPGPATPAYSYAKTNGHCDPEIQTTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ATEPLMLMSVFCQTESFPAERTHGSNIAKMTNTGLPGPATPAYSYAKTNGHCDPEIQTTR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ELTAGNNVENQVPPREKSVALAQEKPVENGGCPVGIETPVPMPSPLSSSGSSLSPSSTAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ELTAGNNVENQVPPREKSVALAQEKPVENGGCPVGIETPVPMPSPLSSSGSSLSPSSTAS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SSLTSSPCSSPVLTKRLLGSSASSPGYQSSYQVGINQRFHAARHKFQSQADQDQQASGLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSLTSSPCSSPVLTKRLLGSSASSPGYQSSYQVGINQRFHAARHKFQSQADQDQQASGLQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SPPSRDLSPTLIDNSAAKQLARNTVTQVLSRFTSQQGPIKPVSPNSSPFGTDYRNLANTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SPPSRDLSPTLIDNSAAKQLARNTVTQVLSRFTSQQGPIKPVSPNSSPFGTDYRNLANTA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD NPRGDTSHSPTPGKVSSPLSPLSPGIKSPTIPRAERGNPPPIPPKKPGLTPSPSATTPLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NPRGDTSHSPTPGKVSSPLSPLSPGIKSPTIPRAERGNPPPIPPKKPGLTPSPSATTPLT
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KSD KTHSQAASLTTAEDLASSCSSNTVVANGKDVELLLPTSS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KTHSQAASLTTAEDLASSCSSNTVVANGKDVELLLPTSS
610 620 630
>>NP_061174 (OMIM: 615100) CTTNBP2 N-terminal-like prote (639 aa)
initn: 4105 init1: 4105 opt: 4105 Z-score: 1917.9 bits: 365.1 E(85289): 4.3e-100
Smith-Waterman score: 4105; 100.0% identity (100.0% similar) in 639 aa overlap (1-639:1-639)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MNLEKLSKPELLTLFSILEGELEARDLVIEALKAQHRDTFIEERYGKYNISDPLMALQRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 MNLEKLSKPELLTLFSILEGELEARDLVIEALKAQHRDTFIEERYGKYNISDPLMALQRD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FETLKEKNDGEKQPVCTNPLSILKVVMKQCKNMQERMLSQLAAAESRHRKVILDLEEERQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 FETLKEKNDGEKQPVCTNPLSILKVVMKQCKNMQERMLSQLAAAESRHRKVILDLEEERQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RHAQDTAEGDDVTYMLEKERERLTQQLEFEKSQVKKFEKEQKKLSSQLEEERSRHKQLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 RHAQDTAEGDDVTYMLEKERERLTQQLEFEKSQVKKFEKEQKKLSSQLEEERSRHKQLSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD MLVLECKKATNKAAEEGQKAGELSLKLEKEKSRVSKLEEELAAERKRGLQTEAQVEKQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 MLVLECKKATNKAAEEGQKAGELSLKLEKEKSRVSKLEEELAAERKRGLQTEAQVEKQLS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD EFDIEREQLRAKLNREENRTKTLKEEMESLKKIVKDLEASHQHSSPNEQLKKPVTVSKGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 EFDIEREQLRAKLNREENRTKTLKEEMESLKKIVKDLEASHQHSSPNEQLKKPVTVSKGT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ATEPLMLMSVFCQTESFPAERTHGSNIAKMTNTGLPGPATPAYSYAKTNGHCDPEIQTTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 ATEPLMLMSVFCQTESFPAERTHGSNIAKMTNTGLPGPATPAYSYAKTNGHCDPEIQTTR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ELTAGNNVENQVPPREKSVALAQEKPVENGGCPVGIETPVPMPSPLSSSGSSLSPSSTAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 ELTAGNNVENQVPPREKSVALAQEKPVENGGCPVGIETPVPMPSPLSSSGSSLSPSSTAS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SSLTSSPCSSPVLTKRLLGSSASSPGYQSSYQVGINQRFHAARHKFQSQADQDQQASGLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 SSLTSSPCSSPVLTKRLLGSSASSPGYQSSYQVGINQRFHAARHKFQSQADQDQQASGLQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SPPSRDLSPTLIDNSAAKQLARNTVTQVLSRFTSQQGPIKPVSPNSSPFGTDYRNLANTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 SPPSRDLSPTLIDNSAAKQLARNTVTQVLSRFTSQQGPIKPVSPNSSPFGTDYRNLANTA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD NPRGDTSHSPTPGKVSSPLSPLSPGIKSPTIPRAERGNPPPIPPKKPGLTPSPSATTPLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 NPRGDTSHSPTPGKVSSPLSPLSPGIKSPTIPRAERGNPPPIPPKKPGLTPSPSATTPLT
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KSD KTHSQAASLTTAEDLASSCSSNTVVANGKDVELLLPTSS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 KTHSQAASLTTAEDLASSCSSNTVVANGKDVELLLPTSS
610 620 630
>>XP_011540083 (OMIM: 615100) PREDICTED: CTTNBP2 N-termi (639 aa)
initn: 4105 init1: 4105 opt: 4105 Z-score: 1917.9 bits: 365.1 E(85289): 4.3e-100
Smith-Waterman score: 4105; 100.0% identity (100.0% similar) in 639 aa overlap (1-639:1-639)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MNLEKLSKPELLTLFSILEGELEARDLVIEALKAQHRDTFIEERYGKYNISDPLMALQRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MNLEKLSKPELLTLFSILEGELEARDLVIEALKAQHRDTFIEERYGKYNISDPLMALQRD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FETLKEKNDGEKQPVCTNPLSILKVVMKQCKNMQERMLSQLAAAESRHRKVILDLEEERQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FETLKEKNDGEKQPVCTNPLSILKVVMKQCKNMQERMLSQLAAAESRHRKVILDLEEERQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RHAQDTAEGDDVTYMLEKERERLTQQLEFEKSQVKKFEKEQKKLSSQLEEERSRHKQLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RHAQDTAEGDDVTYMLEKERERLTQQLEFEKSQVKKFEKEQKKLSSQLEEERSRHKQLSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD MLVLECKKATNKAAEEGQKAGELSLKLEKEKSRVSKLEEELAAERKRGLQTEAQVEKQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MLVLECKKATNKAAEEGQKAGELSLKLEKEKSRVSKLEEELAAERKRGLQTEAQVEKQLS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD EFDIEREQLRAKLNREENRTKTLKEEMESLKKIVKDLEASHQHSSPNEQLKKPVTVSKGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EFDIEREQLRAKLNREENRTKTLKEEMESLKKIVKDLEASHQHSSPNEQLKKPVTVSKGT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ATEPLMLMSVFCQTESFPAERTHGSNIAKMTNTGLPGPATPAYSYAKTNGHCDPEIQTTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ATEPLMLMSVFCQTESFPAERTHGSNIAKMTNTGLPGPATPAYSYAKTNGHCDPEIQTTR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ELTAGNNVENQVPPREKSVALAQEKPVENGGCPVGIETPVPMPSPLSSSGSSLSPSSTAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ELTAGNNVENQVPPREKSVALAQEKPVENGGCPVGIETPVPMPSPLSSSGSSLSPSSTAS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SSLTSSPCSSPVLTKRLLGSSASSPGYQSSYQVGINQRFHAARHKFQSQADQDQQASGLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSLTSSPCSSPVLTKRLLGSSASSPGYQSSYQVGINQRFHAARHKFQSQADQDQQASGLQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SPPSRDLSPTLIDNSAAKQLARNTVTQVLSRFTSQQGPIKPVSPNSSPFGTDYRNLANTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SPPSRDLSPTLIDNSAAKQLARNTVTQVLSRFTSQQGPIKPVSPNSSPFGTDYRNLANTA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD NPRGDTSHSPTPGKVSSPLSPLSPGIKSPTIPRAERGNPPPIPPKKPGLTPSPSATTPLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NPRGDTSHSPTPGKVSSPLSPLSPGIKSPTIPRAERGNPPPIPPKKPGLTPSPSATTPLT
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KSD KTHSQAASLTTAEDLASSCSSNTVVANGKDVELLLPTSS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KTHSQAASLTTAEDLASSCSSNTVVANGKDVELLLPTSS
610 620 630
>>XP_011514920 (OMIM: 609772) PREDICTED: cortactin-bindi (932 aa)
initn: 1263 init1: 464 opt: 833 Z-score: 404.3 bits: 85.6 E(85289): 8.9e-16
Smith-Waterman score: 1314; 40.5% identity (63.9% similar) in 656 aa overlap (2-639:32-607)
10 20 30
pF1KSD MNLEKLSKPELLTLFSILEGELEARDLVIEA
... ::: :: :.:..:::::::::::::
XP_011 ATDGASCEPDLSRAPEDAAGAAAEAAKKEFDVDTLSKSELRMLLSVMEGELEARDLVIEA
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KSD LKAQHRDTFIEERYGKYNISDPLMALQRDFETLKEKNDGEKQPVCTNPLSILKVVMKQCK
:.:.....::.::::..:..::..:::::.:. .: ::.::::::::::..:: .::
XP_011 LRARRKEVFIQERYGRFNLNDPFLALQRDYEA--GAGDKEKKPVCTNPLSILEAVMAHCK
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KSD NMQERMLSQLAAAESRHRKVILDLEEERQRHAQDTAEGDDVTYMLEKERERLTQQLEFEK
.::::: .::::::::..: ::.::
XP_011 KMQERMSAQLAAAESRQKK------------------------------------LEMEK
120 130 140
160 170 180 190 200 210
pF1KSD SQVKKFEKEQKKLSSQLEEERSRHKQLSSMLVLECKKATNKAAEEGQKAGELSLKLEKEK
:.. .:.:.:::...:::::...::. ::: :::. ..:. ::.:: .. :::.::
XP_011 LQLQALEQEHKKLAARLEEERGKNKQVVLMLVKECKQLSGKVIEEAQKLEDVMAKLEEEK
150 160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KSD SRVSKLEEELAAERKRGLQTEAQVEKQLSEFDIEREQLRAKLNREENRTKTLKEEMESLK
.....:::::.::..:. . :::.:::::::: ::::::::::::: .: ::::.....
XP_011 KKTNELEEELSAEKRRSTEMEAQMEKQLSEFDTEREQLRAKLNREEAHTTDLKEEIDKMR
210 220 230 240 250 260
280 290 300 310 320
pF1KSD KIVKDLEASHQHSSPNEQLKKPVT----VSKGTATEPLMLMSVFCQTESFPAERTHGSNI
:....:. . . :.:. .: . . :: ...:: . :: :::. . : ...
XP_011 KMIEQLKRGSD-SKPSLSLPRKTKDRRLVSISVGTEGTVTRSVACQTDLVTENADHMKKL
270 280 290 300 310 320
330 340 350 360 370 380
pF1KSD AKMTNTGLPGPATPAYSYAKTNGHCDPEIQTT----RELTAGNNVENQVPPREKSVALAQ
.: :. ..: : .. : .. :. . :. . .:: :
XP_011 P-LTMPVKPSTGSPLVSANAKGSVCTSATMARPGIDRQASYGDLIGASVPAFPPPSA---
330 340 350 360 370
390 400 410 420 430 440
pF1KSD EKPVENGGCPVGIETPVPMPS--PLSSSGSSLSPSSTASSSLTSSPCSSPVLTKRLLGSS
.: ::: : :: : : :: :... : .. . ... . ..: . :
XP_011 NKIEENG--PSTGSTPDPTSSTPPLPSNAA---PPTAQTPGIAPQNSQAPPM------HS
380 390 400 410 420
450 460 470 480 490 500
pF1KSD ASSPGYQSSYQVGINQRFHAARHKFQSQA-DQDQQASGLQSPPSRDLSPTLIDNSAAKQL
:: ..: . :.: :..::: .::..: : ::... :::::::.::: :: .::::
XP_011 LHSPCANTSLHPGLNPRIQAARFRFQGNANDPDQNGNTTQSPPSRDVSPTSRDNLVAKQL
430 440 450 460 470 480
510 520 530 540 550
pF1KSD ARNTVTQVLSRFTSQQG--PIKPVSPNSSPFGTDYRNLANTANPRGDTSHSPTPGKVSSP
:::::::.:::::: :. : .: : : ::.. : :..:
XP_011 ARNTVTQALSRFTSPQAGAPSRPGVP-----------------PTGDVGTHPPVGRTS--
490 500 510 520
560 570 580 590 600 610
pF1KSD LSPLSPGIKSPTIPRAERGNPPPIPPKKPGLTPSPSATTPLTKT--HSQAASLTTAE-DL
.:. . :..::::::::::::::. .:: : :. :. :: : :. :
XP_011 -------LKTHGVARVDRGNPPPIPPKKPGLSQTPSPPHPQLKVIIDSSRASNTGAKVDN
530 540 550 560 570 580
620 630
pF1KSD ASSCSSNTVVANGKDV--ELLLPTSS
. :. . . .:. : : :: ::
XP_011 KTVASTPSSLPQGNRVINEENLPKSSSPQLPPKPSIDLTVAPAGCAVSALATSQVGAWPA
590 600 610 620 630 640
>>XP_016868196 (OMIM: 609772) PREDICTED: cortactin-bindi (1118 aa)
initn: 1263 init1: 464 opt: 833 Z-score: 403.0 bits: 85.6 E(85289): 1e-15
Smith-Waterman score: 1314; 40.5% identity (63.9% similar) in 656 aa overlap (2-639:32-607)
10 20 30
pF1KSD MNLEKLSKPELLTLFSILEGELEARDLVIEA
... ::: :: :.:..:::::::::::::
XP_016 ATDGASCEPDLSRAPEDAAGAAAEAAKKEFDVDTLSKSELRMLLSVMEGELEARDLVIEA
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KSD LKAQHRDTFIEERYGKYNISDPLMALQRDFETLKEKNDGEKQPVCTNPLSILKVVMKQCK
:.:.....::.::::..:..::..:::::.:. .: ::.::::::::::..:: .::
XP_016 LRARRKEVFIQERYGRFNLNDPFLALQRDYEA--GAGDKEKKPVCTNPLSILEAVMAHCK
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:.. .:.:.:::...:::::...::. ::: :::. ..:. ::.:: .. :::.::
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.....:::::.::..:. . :::.:::::::: ::::::::::::: .: ::::.....
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:....:. . . :.:. .: . . :: ...:: . :: :::. . : ...
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.: :. ..: : .. : .. :. . :. . .:: :
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.: ::: : :: : : :: :... : .. . ... . ..: . :
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:: ..: . :.: :..::: .::..: : ::... :::::::.::: :: .::::
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. :. . . .:. : : :: ::
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. :. . . .:. : : :: ::
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: :: ::
XP_005 NEENLPKSSSPQLPPKPSIDLTVAPAGCAVSALATSQVGAWPAATPGLNQPACSDSSLVI
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pF1KSD MNLEKLSKPELLTLFSILEGELEARDLVIEALKAQHRDTFIEERYGKY
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XP_011 MDGSPGFLKKKEFDVDTLSKSELRMLLSVMEGELEARDLVIEALRARRKEVFIQERYGRF
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XP_011 NLNDPFLALQRDYEA--GAGDKEKKPVCTNPLSILEAVMAHCKKMQERMSAQLAAAESRQ
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XP_011 KK------------------------------------LEMEKLQLQALEQEHKKLAARL
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pF1KSD EEERSRHKQLSSMLVLECKKATNKAAEEGQKAGELSLKLEKEKSRVSKLEEELAAERKRG
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XP_011 EEERGKNKQVVLMLVKECKQLSGKVIEEAQKLEDVMAKLEEEKKKTNELEEELSAEKRRS
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XP_011 TEMEAQMEKQLSEFDTEREQLRAKLNREEAHTTDLKEEIDKMRKMIEQLKRGSD-SKPSL
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pF1KSD QLKKPVT----VSKGTATEPLMLMSVFCQTESFPAERTHGSNIAKMTNTGLPGPATPAYS
.: . . :: ...:: . :: :::. . : ... .: :. ..: :
XP_011 SLPRKTKDRRLVSISVGTEGTVTRSVACQTDLVTENADHMKKLP-LTMPVKPSTGSPLVS
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.. : .. :. . :. . .:: : .: ::: : ::
XP_011 ANAKGSVCTSATMARPGIDRQASYGDLIGASVPAFPPPSA---NKIEENG--PSTGSTPD
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: : :: :... : .. . ... . ..: . : :: ..: . :.: :
XP_011 PTSSTPPLPSNAA---PPTAQTPGIAPQNSQAPPM------HSLHSPCANTSLHPGLNPR
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pF1KSD FHAARHKFQSQA-DQDQQASGLQSPPSRDLSPTLIDNSAAKQLARNTVTQVLSRFTSQQG
..::: .::..: : ::... :::::::.::: :: .:::::::::::.:::::: :.
XP_011 IQAARFRFQGNANDPDQNGNTTQSPPSRDVSPTSRDNLVAKQLARNTVTQALSRFTSPQA
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: :: ::
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:.:.....::.::::..:..::..:::::.:. .: ::.::::::::::..:: .::
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.: ::: : :: : : :: :... : .. . ... . ..: . :
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]