Result of FASTA (ccds) for
pFN21ASDA1388
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1388, 582 aa
1>>>pF1KSDA1388 582 - 582 aa - 582 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0771+/-0.00104; mu= 4.7471+/- 0.063
mean_var=306.4331+/-60.358, 0's: 0 Z-trim(115.2): 915 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.073267
statistics sampled from 14796 (15787) to 14796 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.77), E-opt: 0.2 (0.485), width: 16
Scan time: 4.110
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32462.1 ZNF319 gene_id:57567|Hs108|chr16 ( 582) 4259 463.8 2.6e-130
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CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1167 137.1 7.9e-32
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1167 137.2 8e-32
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 1167 137.3 1e-31
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 1167 137.3 1e-31
CCDS12632.1 ZNF45 gene_id:7596|Hs108|chr19 ( 682) 1153 135.6 2e-31
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1123 132.4 1.8e-30
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1118 131.8 2.4e-30
CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19 ( 572) 1117 131.7 2.5e-30
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1118 131.9 2.5e-30
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1118 131.9 2.5e-30
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1118 131.9 2.6e-30
CCDS46167.1 ZNF808 gene_id:388558|Hs108|chr19 ( 903) 1113 131.5 4.5e-30
CCDS46032.1 ZNF492 gene_id:57615|Hs108|chr19 ( 531) 1108 130.7 4.5e-30
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 1104 130.3 5.8e-30
CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 808) 1105 130.6 7.4e-30
CCDS46101.1 ZNF234 gene_id:10780|Hs108|chr19 ( 700) 1103 130.3 7.8e-30
CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 924) 1105 130.7 8.1e-30
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1100 129.9 9e-30
CCDS6354.1 ZNF572 gene_id:137209|Hs108|chr8 ( 529) 1098 129.7 9.4e-30
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1099 130.1 1.4e-29
CCDS54239.1 ZNF714 gene_id:148206|Hs108|chr19 ( 555) 1089 128.7 1.9e-29
CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19 ( 569) 1089 128.7 1.9e-29
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 1093 129.4 2e-29
CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 819) 1085 128.5 3.3e-29
CCDS42574.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 825) 1085 128.5 3.3e-29
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1081 128.0 4.1e-29
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 1076 127.5 5.7e-29
CCDS12856.1 ZNF600 gene_id:162966|Hs108|chr19 ( 722) 1074 127.3 6.7e-29
CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 630) 1072 127.0 7.1e-29
CCDS65109.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 631) 1072 127.0 7.1e-29
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 645) 1072 127.0 7.2e-29
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 1078 128.0 7.3e-29
CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 748) 1072 127.1 7.9e-29
CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 799) 1072 127.1 8.3e-29
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 1063 125.9 1.1e-28
CCDS46030.1 ZNF257 gene_id:113835|Hs108|chr19 ( 563) 1064 126.1 1.2e-28
CCDS33026.2 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 641) 1060 125.7 1.7e-28
CCDS46079.1 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 642) 1060 125.7 1.7e-28
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 591) 1055 125.2 2.4e-28
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1058 125.6 2.4e-28
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1058 125.6 2.4e-28
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 676) 1055 125.2 2.6e-28
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 697) 1055 125.2 2.6e-28
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 1054 125.2 3e-28
CCDS59370.1 ZNF728 gene_id:388523|Hs108|chr19 ( 622) 1051 124.8 3.3e-28
CCDS6755.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 584) 1050 124.6 3.4e-28
CCDS65096.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 612) 1050 124.6 3.5e-28
CCDS6754.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 626) 1050 124.7 3.5e-28
>>CCDS32462.1 ZNF319 gene_id:57567|Hs108|chr16 (582 aa)
initn: 4259 init1: 4259 opt: 4259 Z-score: 2452.9 bits: 463.8 E(32554): 2.6e-130
Smith-Waterman score: 4259; 100.0% identity (100.0% similar) in 582 aa overlap (1-582:1-582)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSESWQQPPQTQPQQPQPPQPQHHAEPPPALAEHTLPPGTAENPLGCAVYGILLQPDPGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MSESWQQPPQTQPQQPQPPQPQHHAEPPPALAEHTLPPGTAENPLGCAVYGILLQPDPGL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD QPPQHAPLQAAGEPGPKCGVCGHDLAHLSSPHEHQCLAGHDRSFQCTQCLKIFHQATDLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QPPQHAPLQAAGEPGPKCGVCGHDLAHLSSPHEHQCLAGHDRSFQCTQCLKIFHQATDLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD EHQCVQAEQKPFVCGVCKMGFSLLTSLAQHHSSHSGLVKCSICEKTYKPAEAAEPATTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EHQCVQAEQKPFVCGVCKMGFSLLTSLAQHHSSHSGLVKCSICEKTYKPAEAAEPATTAA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD PSLPAAPAPSTVTPAEQADKPYSCPICQKPFKHLSELSRHERIHTGEKPYKCTLCDKSFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PSLPAAPAPSTVTPAEQADKPYSCPICQKPFKHLSELSRHERIHTGEKPYKCTLCDKSFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QSSHLVHHKRTHSSERPYKCAVCEKTFKHRSHLVRHMYAHSGEHHLFRCNVCELHFKESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QSSHLVHHKRTHSSERPYKCAVCEKTFKHRSHLVRHMYAHSGEHHLFRCNVCELHFKESS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ELLQHPCTPSGERPFRCGECQKAFKRPSDLRQHERTHSAERPFKCDLCPMGFKQQYALMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ELLQHPCTPSGERPFRCGECQKAFKRPSDLRQHERTHSAERPFKCDLCPMGFKQQYALMR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD HRRTHKTEEPFKCGLCEKGFGQPSHLLYHQHVHTLETLFKCPVCQKGFDQSAELLRHKCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HRRTHKTEEPFKCGLCEKGFGQPSHLLYHQHVHTLETLFKCPVCQKGFDQSAELLRHKCL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PGAAERPFKCPVCNKAYKRASALQKHQLAHCAAAEKPLRCTLCERRFFSSSEFVQHRCDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PGAAERPFKCPVCNKAYKRASALQKHQLAHCAAAEKPLRCTLCERRFFSSSEFVQHRCDP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD AREKPLKCPDCEKRFKYASDLQRHRRVHTGEKPYKCPNCDKAFKQREHLNKHQGVHAREQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AREKPLKCPDCEKRFKYASDLQRHRRVHTGEKPYKCPNCDKAFKQREHLNKHQGVHAREQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KSD QFKCVWCGERFLDVALLQEHSAQHSAAAAAAEGAYQVAACLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QFKCVWCGERFLDVALLQEHSAQHSAAAAAAEGAYQVAACLP
550 560 570 580
>>CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 (803 aa)
initn: 1595 init1: 342 opt: 1167 Z-score: 684.9 bits: 137.1 E(32554): 7.9e-32
Smith-Waterman score: 1301; 36.8% identity (64.4% similar) in 508 aa overlap (72-565:276-779)
50 60 70 80 90 100
pF1KSD ENPLGCAVYGILLQPDPGLQPPQHAPLQAAGEPGPKCGVCGHDLAHLSSPHEHQCLAGHD
:: :: :.. . . :. ::. . .
CCDS59 YTRYKLYKCEECGKAFNKSSILTTHKIIRTGEKFYKCKECAKAFNQSSNLTEHKKIHPGE
250 260 270 280 290 300
110 120 130 140 150
pF1KSD RSFQCTQCLKIFHQATDLLEHQCVQAEQKPFVCGVCKMGFSLLTSLAQHHSSHSG--LVK
. ..: .: : :. . : .:. ... .::..: : .:. ...:. :. :.. . :
CCDS59 KPYKCEECGKAFNWPSTLTKHKRIHTGEKPYTCEECGKAFNQFSNLTTHKRIHTAEKFYK
310 320 330 340 350 360
160 170 180 190 200
pF1KSD CSICEKTY-KPAEAAEPATTAAPSLP--------AAPAPSTVTP---AEQADKPYSCPIC
:. : ... . .. .. . . : : : .: .. ..:::.: :
CCDS59 CTECGEAFSRSSNLTKHKKIHTEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKLTHTGEKPYKCEEC
370 380 390 400 410 420
210 220 230 240 250 260
pF1KSD QKPFKHLSELSRHERIHTGEKPYKCTLCDKSFSQSSHLVHHKRTHSSERPYKCAVCEKTF
: :. : :..:.::::::::::: .: :.:.: :.:. ::: :..:.:::: : :.:
CCDS59 GKAFNWPSTLTKHNRIHTGEKPYKCEVCGKAFNQFSNLTTHKRIHTAEKPYKCEECGKAF
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270 280 290 300 310 320
pF1KSD KHRSHLVRHMYAHSGEHHLFRCNVCELHFKESSELLQHPCTPSGERPFRCGECQKAFKRP
.. :.:..: : :.. ..:. : :: ::.: .: : .::.:..: :: :::..
CCDS59 SRSSNLTKHKKIHI-EKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKITHTGEKPYKCEECGKAFNHF
490 500 510 520 530 540
330 340 350 360 370 380
pF1KSD SDLRQHERTHSAERPFKCDLCPMGFKQQYALMRHRRTHKTEEPFKCGLCEKGFGQPSHLL
: : .:.: :..:.:.::. : .: :. : :.. : :. .:: : :.: : :.:
CCDS59 SILTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGEKFYKCEECGKAFTQSSNLT
550 560 570 580 590 600
390 400 410 420 430 440
pF1KSD YHQHVHTLETLFKCPVCQKGFDQSAELLRHKCLPGAAERPFKCPVCNKAYKRASALQKHQ
:...:: .:: : :.:.: . : .:: . . :.:.:: :.::.: .:.: ::.
CCDS59 THKKIHTGGKPYKCEECGKAFNQFSTLTKHKIIH-TEEKPYKCEECGKAFKWSSTLTKHK
610 620 630 640 650 660
450 460 470 480 490 500
pF1KSD LAHCAAAEKPLRCTLCERRFFSSSEFVQHRCDPAREKPLKCPDCEKRFKYASDLQRHRRV
. : ..::: .: : . : :: . :. . ::: :: : : :. .:.: .:...
CCDS59 IIH--TGEKPYKCEECGKAFKLSSTLSTHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFNRSSNLIEHKKI
670 680 690 700 710 720
510 520 530 540 550 560
pF1KSD HTGEKPYKCPNCDKAFKQREHLNKHQGVHAREQQFKCVWCGERFLDVALLQEHSAQHSAA
::::.:::: .: :::. ::: :. .:..:: .:: ::. : . . : :. :.
CCDS59 HTGEQPYKCEECGKAFNYSSHLNTHKRIHTKEQPYKCKECGKAFNQYSNLTTHNKIHTGE
730 740 750 760 770 780
570 580
pF1KSD AAAAEGAYQVAACLP
CCDS59 KLYKPEDVTVILTTPQTFSNIK
790 800
>>CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 (809 aa)
initn: 1595 init1: 342 opt: 1167 Z-score: 684.9 bits: 137.1 E(32554): 7.9e-32
Smith-Waterman score: 1301; 36.8% identity (64.4% similar) in 508 aa overlap (72-565:282-785)
50 60 70 80 90 100
pF1KSD ENPLGCAVYGILLQPDPGLQPPQHAPLQAAGEPGPKCGVCGHDLAHLSSPHEHQCLAGHD
:: :: :.. . . :. ::. . .
CCDS12 YTRYKLYKCEECGKAFNKSSILTTHKIIRTGEKFYKCKECAKAFNQSSNLTEHKKIHPGE
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110 120 130 140 150
pF1KSD RSFQCTQCLKIFHQATDLLEHQCVQAEQKPFVCGVCKMGFSLLTSLAQHHSSHSG--LVK
. ..: .: : :. . : .:. ... .::..: : .:. ...:. :. :.. . :
CCDS12 KPYKCEECGKAFNWPSTLTKHKRIHTGEKPYTCEECGKAFNQFSNLTTHKRIHTAEKFYK
320 330 340 350 360 370
160 170 180 190 200
pF1KSD CSICEKTY-KPAEAAEPATTAAPSLP--------AAPAPSTVTP---AEQADKPYSCPIC
:. : ... . .. .. . . : : : .: .. ..:::.: :
CCDS12 CTECGEAFSRSSNLTKHKKIHTEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKLTHTGEKPYKCEEC
380 390 400 410 420 430
210 220 230 240 250 260
pF1KSD QKPFKHLSELSRHERIHTGEKPYKCTLCDKSFSQSSHLVHHKRTHSSERPYKCAVCEKTF
: :. : :..:.::::::::::: .: :.:.: :.:. ::: :..:.:::: : :.:
CCDS12 GKAFNWPSTLTKHNRIHTGEKPYKCEVCGKAFNQFSNLTTHKRIHTAEKPYKCEECGKAF
440 450 460 470 480 490
270 280 290 300 310 320
pF1KSD KHRSHLVRHMYAHSGEHHLFRCNVCELHFKESSELLQHPCTPSGERPFRCGECQKAFKRP
.. :.:..: : :.. ..:. : :: ::.: .: : .::.:..: :: :::..
CCDS12 SRSSNLTKHKKIHI-EKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKITHTGEKPYKCEECGKAFNHF
500 510 520 530 540 550
330 340 350 360 370 380
pF1KSD SDLRQHERTHSAERPFKCDLCPMGFKQQYALMRHRRTHKTEEPFKCGLCEKGFGQPSHLL
: : .:.: :..:.:.::. : .: :. : :.. : :. .:: : :.: : :.:
CCDS12 SILTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGEKFYKCEECGKAFTQSSNLT
560 570 580 590 600 610
390 400 410 420 430 440
pF1KSD YHQHVHTLETLFKCPVCQKGFDQSAELLRHKCLPGAAERPFKCPVCNKAYKRASALQKHQ
:...:: .:: : :.:.: . : .:: . . :.:.:: :.::.: .:.: ::.
CCDS12 THKKIHTGGKPYKCEECGKAFNQFSTLTKHKIIH-TEEKPYKCEECGKAFKWSSTLTKHK
620 630 640 650 660
450 460 470 480 490 500
pF1KSD LAHCAAAEKPLRCTLCERRFFSSSEFVQHRCDPAREKPLKCPDCEKRFKYASDLQRHRRV
. : ..::: .: : . : :: . :. . ::: :: : : :. .:.: .:...
CCDS12 IIH--TGEKPYKCEECGKAFKLSSTLSTHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFNRSSNLIEHKKI
670 680 690 700 710 720
510 520 530 540 550 560
pF1KSD HTGEKPYKCPNCDKAFKQREHLNKHQGVHAREQQFKCVWCGERFLDVALLQEHSAQHSAA
::::.:::: .: :::. ::: :. .:..:: .:: ::. : . . : :. :.
CCDS12 HTGEQPYKCEECGKAFNYSSHLNTHKRIHTKEQPYKCKECGKAFNQYSNLTTHNKIHTGE
730 740 750 760 770 780
570 580
pF1KSD AAAAEGAYQVAACLP
CCDS12 KLYKPEDVTVILTTPQTFSNIK
790 800
>>CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 (818 aa)
initn: 1595 init1: 342 opt: 1167 Z-score: 684.8 bits: 137.2 E(32554): 8e-32
Smith-Waterman score: 1301; 36.8% identity (64.4% similar) in 508 aa overlap (72-565:291-794)
50 60 70 80 90 100
pF1KSD ENPLGCAVYGILLQPDPGLQPPQHAPLQAAGEPGPKCGVCGHDLAHLSSPHEHQCLAGHD
:: :: :.. . . :. ::. . .
CCDS74 YTRYKLYKCEECGKAFNKSSILTTHKIIRTGEKFYKCKECAKAFNQSSNLTEHKKIHPGE
270 280 290 300 310 320
110 120 130 140 150
pF1KSD RSFQCTQCLKIFHQATDLLEHQCVQAEQKPFVCGVCKMGFSLLTSLAQHHSSHSG--LVK
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CCDS74 KPYKCEECGKAFNWPSTLTKHKRIHTGEKPYTCEECGKAFNQFSNLTTHKRIHTAEKFYK
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160 170 180 190 200
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CCDS74 CTECGEAFSRSSNLTKHKKIHTEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKLTHTGEKPYKCEEC
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210 220 230 240 250 260
pF1KSD QKPFKHLSELSRHERIHTGEKPYKCTLCDKSFSQSSHLVHHKRTHSSERPYKCAVCEKTF
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CCDS74 GKAFNWPSTLTKHNRIHTGEKPYKCEVCGKAFNQFSNLTTHKRIHTAEKPYKCEECGKAF
450 460 470 480 490 500
270 280 290 300 310 320
pF1KSD KHRSHLVRHMYAHSGEHHLFRCNVCELHFKESSELLQHPCTPSGERPFRCGECQKAFKRP
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CCDS74 SRSSNLTKHKKIHI-EKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKITHTGEKPYKCEECGKAFNHF
510 520 530 540 550
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CCDS74 SILTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGEKFYKCEECGKAFTQSSNLT
560 570 580 590 600 610
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pF1KSD YHQHVHTLETLFKCPVCQKGFDQSAELLRHKCLPGAAERPFKCPVCNKAYKRASALQKHQ
:...:: .:: : :.:.: . : .:: . . :.:.:: :.::.: .:.: ::.
CCDS74 THKKIHTGGKPYKCEECGKAFNQFSTLTKHKIIH-TEEKPYKCEECGKAFKWSSTLTKHK
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CCDS74 IIH--TGEKPYKCEECGKAFKLSSTLSTHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFNRSSNLIEHKKI
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CCDS74 HTGEQPYKCEECGKAFNYSSHLNTHKRIHTKEQPYKCKECGKAFNQYSNLTTHNKIHTGE
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pF1KSD AAAAEGAYQVAACLP
CCDS74 KLYKPEDVTVILTTPQTFSNIK
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CCDS74 T-GEKPYKCEECGKAFRQSSTLTKHKIIHTGEKPYKFEECGKAFRQSLTLNKHKIIHSRE
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CCDS74 KPYKCKECGKAFKQFSTLTTHKIIHAGKKLYKCEECGKAFNHSSSLSTHKIIHTGEKSYK
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CCDS74 CEECGKAFLWSSTLRRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSHSSALAKHKRIHTGEKPYKCKEC
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CCDS74 GKAFSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKECDKTFKRLSTLTKHKIIHAGEK-LYKCEECGKA
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CCDS74 STLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSRSSTLTKHKTIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSALA
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CCDS74 KHKIIH-AGEKLYKCEECGKAFNQSSNLTTHKIIH--TKEKPSKSEECDKAFIWSSTLTE
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CCDS74 HKRIHTREKTYKCEECGKAFSQPSHLTTHKRMHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKII
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CCDS74 HTGEKPYKCEECGKAFRKSSTLTEHKIIHTG-----EKPYKCEECGKAFSQSSTLTRHTR
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CCDS74 MHTGEKPYKCEECGKAFNRSSKLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFISSSTLNGHKRIHTR
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:: . . : :: .. . . : :
CCDS74 LENYRNLAFLGICPHFPQDFWPEQSMEDSFQKVLLRKYEKCGHENLQLRKGCKSVDEC-K
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... . ... : .. . ..:. :.: . . :: :.:.. :.:. : :
CCDS74 VHKEGYNKLNQCLTTAQSKVFQCGKYLKVFYKFLNSNRHTIRHTGKK-CFKCKKCVKSFC
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CCDS74 IRLHKTQHKCVYITEKSCKCKECEKTFHWSSTLTNHKEIHTEDKPYKCEECGKAFKQLST
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CCDS74 LTTHKIICAKEKIYKCEECGKAFLWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSHSSTLAKH
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CCDS74 KRIH-TGEKPYKCEECGKAFSRSSTLAKHKRIH--TGEKPYKCKECGKAFSNSSTLANHK
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CCDS74 ITHTEEKPYKCKECDKAFKRLSTLTKHKIIHAGEKLYKCEECGKAFNRSSNLTIHKFIHT
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CCDS74 GEKPYKCEECGKAFNWSSSLTKHKRFHTREKPFKCKECGKAFIWSSTLTRHKRIHTGEKP
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CCDS42 IHTGEKPYKCEECGKAFNWSSSLTKHKRFHTREKPFKCKECGKAFIWSSTLT--RHKRIH
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. :: :: ::. . . :. .:. . .. .. .: : :.:. : .:. .....
CCDS42 T-GEKPYKCEECGKAFRQSSTLTKHKIIHTGEKPYKFEECGKAFRQSLTLNKHKIIHSRE
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::. : : .:. ...:. :. :.: : :: : : :.: ...: .
CCDS42 KPYKCKECGKAFKQFSTLTTHKIIHAGKKLYKCEECGKAFNHSSSLSTHKIIHTGEKSYK
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pF1KSD AAPSLPAAPAPSTVTPAEQ---ADKPYSCPICQKPFKHLSELSRHERIHTGEKPYKCTLC
: ::. .. ..:::.: : : :.: : :..:.::::::::::: :
CCDS42 CEECGKAFLWSSTLRRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSHSSALAKHKRIHTGEKPYKCKEC
610 620 630 640 650 660
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pF1KSD DKSFSQSSHLVHHKRTHSSERPYKCAVCEKTFKHRSHLVRHMYAHSGEHHLFRCNVCELH
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CCDS42 GKAFSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKECDKTFKRLSTLTKHKIIHAGEK-LYKCEECGKA
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:..::.: : .::.:..: :: :::. :.: .:.: :. :.:::: : .: .
CCDS42 FNRSSNLTIHKFIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSSLTKHKRIHTREKPFKCKECGKAFIWS
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pF1KSD YALMRHRRTHKTEEPFKCGLCEKGFGQPSHLLYHQHVHTLETLFKCPVCQKGFDQSAELL
.: ::.: : :.:.:: : :.:.. : : :. .:: : .:: : :.: .:. :
CCDS42 STLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSRSSTLTKHKTIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSALA
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pF1KSD RHKCLPGAAERPFKCPVCNKAYKRASALQKHQLAHCAAAEKPLRCTLCERRFFSSSEFVQ
.:: . :.:. .:: :.::....: : :.. : . ::: . :.. :. :: ...
CCDS42 KHKIIH-AGEKLYKCEECGKAFNQSSNLTTHKIIH--TKEKPSKSEECDKAFIWSSTLTE
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pF1KSD HRCDPAREKPLKCPDCEKRFKYASDLQRHRRVHTGEKPYKCPNCDKAFKQREHLNKHQGV
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CCDS42 HKRIHTREKTYKCEECGKAFSQPSHLTTHKRMHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKII
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:. :. .:: ::. : . : ::. :.. : :. :
CCDS42 HTGEKPYKCEECGKAFRKSSTLTEHKIIHTG-----EKPYKCEECGKAFSQSSTLTRHTR
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CCDS42 MHTGEKPYKCEECGKAFNRSSKLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFISSSTLNGHKRIHTR
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initn: 1276 init1: 350 opt: 560 Z-score: 336.1 bits: 73.2 E(32554): 2.1e-12
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pF1KSD PHEHQCLAGHDRSFQCTQCLKIFHQATDLLEHQCVQAEQKPFVCGVCKMGFSLLTSLAQH
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CCDS42 MPGTPGSLEMGLLTFRDVAIEFSPEEWQCLDTAQQNLYRNVMLENYRNLAFLGIA
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pF1KSD HSSHSGLVKCSICEKTYKPAEAAEPATTAAPSLPAAPAPSTVTPAEQADKPYSCPICQKP
:. :. . :. .: . . . :. :. : .. . . ::
CCDS42 LSK-PDLI--TYLEQGKEPWNMKQHEMVDEPTGICPHFPQDFWPEQSMEDSF-----QKV
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. . : :: .. . . : : ... . ... : .. . ..:. :.: .
CCDS42 LLRKYEKCGHENLQLRKGCKSVDEC-KVHKEGYNKLNQCLTTAQSKVFQCGKYLKVFYKF
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. :: :.:.. :.:. : : . :: :. :. .: ::.:.:. : :
CCDS42 LNSNRHTIRHTGKK-CFKCKKCVKSFCIRLHKTQHKCVYITEKSCKCKECEKTFHWSSTL
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pF1KSD RQHERTHSAERPFKCDLCPMGFKQQYALMRHRRTHKTEEPFKCGLCEKGFGQPSHLLYHQ
.:.. :. ..:.::. : .::: .: :. :. .:: : :.: : : :.
CCDS42 TNHKEIHTEDKPYKCEECGKAFKQLSTLTTHKIICAKEKIYKCEECGKAFLWSSTLTRHK
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..:: : .:: : :.:..:. : .:: . ..:.:.:: :.::..:.:.: ::. :
CCDS42 RIHTGEKPYKCEECGKAFSHSSTLAKHKRIH-TGEKPYKCEECGKAFSRSSTLAKHKRIH
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pF1KSD CAAAEKPLRCTLCERRFFSSSEFVQHRCDPAREKPLKCPDCEKRFKYASDLQRHRRVHTG
..::: .: : . : .:: ...:. ..::: :: .:.: :: : : .:. .:.:
CCDS42 --TGEKPYKCKECGKAFSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKECDKAFKRLSTLTKHKIIHAG
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pF1KSD EKPYKCPNCDKAFKQREHLNKHQGVHAREQQFKCVWCGERFLDVALLQEHSAQHSAAAAA
:: ::: .: :::.. .:
CCDS42 EKLYKCEECGKAFNRSSNLTIHKFIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSSLTKHKRFHTREKPF
410 420 430 440 450 460
>>CCDS12632.1 ZNF45 gene_id:7596|Hs108|chr19 (682 aa)
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:: . : : :.. : . ::.
CCDS12 HEELFCSQIWQQITRELIKYQDSVVNIQRTGCQLEKRDDLHYKDEGFSN-QSSHLQVHRV
100 110 120 130 140 150
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pF1KSD -AGEPGPKCGVCGHDLAHLSSPHEHQCLAGHDRSFQCTQCLKIFHQATDLLEHQCVQAEQ
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CCDS12 HTGEKPYKGEHCVKSFSWSSHLQINQRAHAGEKPYKCEKCDNAFRRFSSLQAHQRVHSRA
160 170 180 190 200 210
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: .. . .:: . : .:. .: :. :: : .. . .. ::
CCDS12 KSYTNDASYRSFSQRSHLPHHQRVPTG-------ENPYKYEECGRNVGKSSHC----QAP
220 230 240 250 260
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pF1KSD STVTPAEQADKPYSCPICQKPFKHLSELSRHERIHTGEKPYKCTLCDKSFSQSSHLVHHK
: .: :::.: : :.. : :. : ..:::.::::: : :::: :.: :.
CCDS12 LIVHTGE---KPYKCEECGVGFSQRSYLQVHLKVHTGKKPYKCEECGKSFSWRSRLQAHE
270 280 290 300 310 320
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pF1KSD RTHSSERPYKCAVCEKTFKHRSHLVRHMYAHSGEHHLFRCNVCELHFKESSELLQHPCTP
: :..:.:::: .: :.:.. ::: : :.::. ..:. : :. .:.: : .
CCDS12 RIHTGEKPYKCNACGKSFSYSSHLNIHCRIHTGEKP-YKCEECGKGFSVGSHLQAHQISH
330 340 350 360 370 380
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pF1KSD SGERPFRCGECQKAFKRPSDLRQHERTHSAERPFKCDLCPMGFKQQYALMRHRRTHKTEE
.::.:..: :: :.: : :.: .:.: :..:.:..:: : ::... . : :.: :.
CCDS12 TGEKPYKCEECGKGFCRASNLLDHQRGHTGEKPYQCDACGKGFSRSSDFNIHFRVHTGEK
390 400 410 420 430 440
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PFKCGLCEKGFGQPSHLLYHQHVHTLETLFKCPVCQKGFDQSAELLRHKCLPGAAERPFK
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CCDS12 PYKCEECGKGFSQASNLLAHQRGHTGEKPYKCGTCGKGFSRSSDLNVH-CRIHTGEKPYK
450 460 470 480 490 500
430 440 450 460 470 480
pF1KSD CPVCNKAYKRASALQKHQLAHCAAAEKPLRCTLCERRFFSSSEFVQH-RCDPAREKPLKC
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CCDS12 CERCGKAFSQFSSLQVHQRVH--TGEKPYQCAECGKGFSVGSQLQAHQRCHTG-EKPYQC
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490 500 510 520 530 540
pF1KSD PDCEKRFKYASDLQRHRRVHTGEKPYKCPNCDKAFKQREHLNKHQGVHAREQQFKCVWCG
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CCDS12 EECGKGFCRASNFLAHRGVHTGEKPYRCDVCGKRFRQRSYLQAHQRVHTGERPYKCEECG
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550 560 570 580
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CCDS12 KVFSWSSYLQAHQRVHTG-----EKPYKCEECGKGFSWSSSLIIHQRVHADDEGDKDFPS
620 630 640 650 660 670
CCDS12 SEDSHRKTR
680
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CCDS33 SYIKQIFPMEERIFNFHTDKKSLKTHSVVKKHKQDRGEKKLLKCNDCEKIFSKISTLTLH
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CCDS33 QRIHTGEKPYECIECGKAFSQSAHLAQHQRIHTG-------EKPFECTECGKAFSQNAHL
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CCDS33 VQHQRVHT-------GEKPYQCKQCNKAFSQLAHLAQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSDC
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CCDS33 SSLAHHRRIHTGKRPYECIDCGKAFRQNASLIRHRRYYHTGEKP-FDCIDCGKAFTDHIG
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CCDS33 LIQHKRTHTGERPYKCNVCGKAFSHGSSLTVHQRIHTGEKPYECNICEKAFSHRGSLTLH
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370 380 390 400 410 420
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CCDS33 QRVHTGEKPYECKECGKAFRQSTHLAHHQRIHTGEKPYECKECSKTFSQNAHLAQHQKIH
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CCDS33 -TGEKPYECKECGKAFSQIAHLVQHQRVH--TGEKPYECIECGKAFSDGSYLVQHQRLHS
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CCDS33 GKRPYECLECGKAFRQRASLICHQRCHTGEKPYECNVCGKAFSHRKSLTLHQRIHTGEKP
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CCDS33 YECKECSKAFSQVAHLTLHKRIHTG-----ERPYECKECGKAFRQSVHLAHHQRIHTGES
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CCDS33 SVILSSALPYHQVL
710
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CCDS74 SLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKR--
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CCDS74 -EKPDLNVL----QKTCV--KEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLK
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140 150 160 170 180 190
pF1KSD GFSLLTSLAQHHSSHSGL--VKCSICEKTYKPAEAAEPATTAAPSLPAAPAPSTVTPAEQ
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CCDS74 GFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIA------------PLIQHQRTHT----
210 220 230 240 250
200 210 220 230 240 250
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CCDS74 GEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKP
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260 270 280 290 300 310
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CCDS74 YQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKP-YECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYEC
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320 330 340 350 360 370
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CCDS74 GECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCG
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380 390 400 410 420 430
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CCDS74 KAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIH-TGEKPYECNQCGRAF
440 450 460 470 480
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CCDS74 SQLAPLIQHQRIH--TGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSH
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CCDS74 SSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSL
550 560 570 580 590 600
560 570 580
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CCDS74 TKHQRTHTG
610
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CCDS46 KKCGRENLQLRKYCKSMDECKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQYDKYVKVFHKFSNSNRH
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pF1KSD QCVQAEQKPFVCGVCKMGFSLLTSLAQHHSSHSGLVKCSICEKTYKPAEAAEPATTAAPS
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CCDS46 KIGHTGKKSFKCKECEKSFCMLSHLAQHKRIHSG-------EKPYKCKECGK-AYNEASN
180 190 200 210 220
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CCDS46 L------STHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQS
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pF1KSD SHLVHHKRTHSSERPYKCAVCEKTFKHRSHLVRHMYAHSGEHHLFRCNVCELHFKESSEL
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CCDS46 ANLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTAHKIIHAGEKP-YKCEECGKAFSQSSTL
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pF1KSD LQHPCTPSGERPFRCGECQKAFKRPSDLRQHERTHSAERPFKCDLCPMGFKQQYALMRHR
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CCDS46 TTHKIIHTGEKFYKCEECGKAFSRLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHK
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CCDS46 RIHAGEKFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIH-
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pF1KSD AAERPFKCPVCNKAYKRASALQKHQLAHCAAAEKPLRCTLCERRFFSSSEFVQHRCDPAR
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CCDS46 TGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSKHKVIH--TGEKPYKCEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTG
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CCDS46 EKPYKCEECGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]