Result of FASTA (omim) for
pFN21ASDA1259
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1259, 1556 aa
1>>>pF1KSDA1259 1556 - 1556 aa - 1556 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8934+/-0.000491; mu= 8.1344+/- 0.031
mean_var=236.4361+/-49.211, 0's: 0 Z-trim(116.5): 260 B-trim: 979 in 1/57
Lambda= 0.083410
statistics sampled from 27395 (27676) to 27395 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.324), width: 16
Scan time: 18.860
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_060023 (OMIM: 610169) DNA helicase INO80 [Homo (1556) 10246 1247.8 0
XP_011519987 (OMIM: 610169) PREDICTED: DNA helicas (1209) 7760 948.5 0
XP_011519988 (OMIM: 610169) PREDICTED: DNA helicas ( 906) 5891 723.5 1.9e-207
NP_620614 (OMIM: 600014,601358) probable global tr (1572) 902 123.4 1.5e-26
NP_003061 (OMIM: 600014,601358) probable global tr (1590) 902 123.4 1.5e-26
NP_001276325 (OMIM: 600014,601358) probable global (1590) 902 123.4 1.5e-26
NP_001122320 (OMIM: 603254,613325,614609) transcri (1613) 897 122.8 2.4e-26
XP_016882657 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1613) 897 122.8 2.4e-26
XP_016882656 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1614) 897 122.8 2.4e-26
NP_001122319 (OMIM: 603254,613325,614609) transcri (1614) 897 122.8 2.4e-26
XP_016882655 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1616) 897 122.8 2.4e-26
NP_001122318 (OMIM: 603254,613325,614609) transcri (1616) 897 122.8 2.4e-26
NP_001122317 (OMIM: 603254,613325,614609) transcri (1617) 897 122.8 2.4e-26
XP_016882654 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1617) 897 122.8 2.4e-26
XP_016882653 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1645) 897 122.8 2.4e-26
XP_016882651 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1646) 897 122.8 2.4e-26
XP_016882652 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1646) 897 122.8 2.4e-26
NP_001122316 (OMIM: 603254,613325,614609) transcri (1647) 897 122.8 2.4e-26
NP_003063 (OMIM: 603254,613325,614609) transcripti (1647) 897 122.8 2.4e-26
XP_016882650 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1650) 897 122.8 2.4e-26
XP_016882649 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1678) 897 122.8 2.4e-26
NP_001122321 (OMIM: 603254,613325,614609) transcri (1679) 897 122.8 2.4e-26
XP_011526500 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1679) 897 122.8 2.4e-26
XP_006722909 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1679) 897 122.8 2.4e-26
XP_006722908 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1679) 897 122.8 2.4e-26
NP_006653 (OMIM: 136140,611421) helicase SRCAP [Ho (3230) 692 98.4 1.1e-18
NP_001276004 (OMIM: 603946,616911) lymphoid-specif ( 432) 600 86.5 5.1e-16
NP_001276003 (OMIM: 603946,616911) lymphoid-specif ( 477) 600 86.6 5.5e-16
NP_003592 (OMIM: 603375) SWI/SNF-related matrix-as (1052) 606 87.6 6e-16
NP_001276002 (OMIM: 603946,616911) lymphoid-specif ( 700) 600 86.7 7.3e-16
NP_001276001 (OMIM: 603946,616911) lymphoid-specif ( 708) 600 86.7 7.3e-16
NP_001276000 (OMIM: 603946,616911) lymphoid-specif ( 714) 600 86.7 7.4e-16
NP_001275999 (OMIM: 603946,616911) lymphoid-specif ( 740) 600 86.7 7.6e-16
NP_001275998 (OMIM: 603946,616911) lymphoid-specif ( 806) 600 86.8 8.1e-16
NP_001275997 (OMIM: 603946,616911) lymphoid-specif ( 822) 600 86.8 8.2e-16
NP_060533 (OMIM: 603946,616911) lymphoid-specific ( 838) 600 86.8 8.3e-16
NP_001275996 (OMIM: 603946,616911) lymphoid-specif ( 884) 600 86.8 8.7e-16
XP_016885240 (OMIM: 300012) PREDICTED: probable gl (1036) 601 87.0 9e-16
XP_016885239 (OMIM: 300012) PREDICTED: probable gl (1042) 601 87.0 9e-16
XP_006724845 (OMIM: 300012) PREDICTED: probable gl (1042) 601 87.0 9e-16
NP_001269804 (OMIM: 300012) probable global transc (1058) 601 87.0 9.1e-16
XP_011541414 (OMIM: 602118) PREDICTED: chromodomai (1552) 591 85.9 2.8e-15
XP_005271924 (OMIM: 602118) PREDICTED: chromodomai (1710) 591 86.0 3e-15
NP_001261 (OMIM: 602118) chromodomain-helicase-DNA (1710) 591 86.0 3e-15
XP_005271923 (OMIM: 602118) PREDICTED: chromodomai (1798) 591 86.0 3.1e-15
NP_001243266 (OMIM: 613039) chromodomain-helicase- ( 616) 563 82.2 1.4e-14
XP_016858349 (OMIM: 613039) PREDICTED: chromodomai ( 616) 563 82.2 1.4e-14
NP_001243267 (OMIM: 613039) chromodomain-helicase- ( 693) 563 82.3 1.6e-14
NP_001262 (OMIM: 602119,615369) chromodomain-helic (1828) 571 83.6 1.7e-14
XP_006711702 (OMIM: 613039) PREDICTED: chromodomai ( 784) 563 82.3 1.7e-14
>>NP_060023 (OMIM: 610169) DNA helicase INO80 [Homo sapi (1556 aa)
initn: 10246 init1: 10246 opt: 10246 Z-score: 6674.4 bits: 1247.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10246; 100.0% identity (100.0% similar) in 1556 aa overlap (1-1556:1-1556)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASELGARDDGGCTELAKPLYLQYLERALRLDHFLRQTSAIFNRNISSDDSEDGLDDSNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 MASELGARDDGGCTELAKPLYLQYLERALRLDHFLRQTSAIFNRNISSDDSEDGLDDSNP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LLPQSGDPLIQVKEEPPNSLLGETSGAGSSGMLNTYSLNGVLQSESKCDKGNLYNFSKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 LLPQSGDPLIQVKEEPPNSLLGETSGAGSSGMLNTYSLNGVLQSESKCDKGNLYNFSKLK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD KSRKWLKSILLSDESSEADSQSEDDDEEELNLSREELHNMLRLHKYKKLHQNKYSKDKEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 KSRKWLKSILLSDESSEADSQSEDDDEEELNLSREELHNMLRLHKYKKLHQNKYSKDKEL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QQYQYYSAGLLSTYDPFYEQQRHLLGPKKKKFKEEKKLKAKLKKVKKKRRRDEELSSEES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 QQYQYYSAGLLSTYDPFYEQQRHLLGPKKKKFKEEKKLKAKLKKVKKKRRRDEELSSEES
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PRRHHHQTKVFAKFSHDAPPPGTKKKHLSIEQLNARRRKVWLSIVKKELPKANKQKASAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 PRRHHHQTKVFAKFSHDAPPPGTKKKHLSIEQLNARRRKVWLSIVKKELPKANKQKASAR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD NLFLTNSRKLAHQCMKEVRRAALQAQKNCKETLPRARRLTKEMLLYWKKYEKVEKEHRKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 NLFLTNSRKLAHQCMKEVRRAALQAQKNCKETLPRARRLTKEMLLYWKKYEKVEKEHRKR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD AEKEALEQRKLDEEMREAKRQQRKLNFLITQTELYAHFMSRKRDMGHDGIQEEILRKLED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 AEKEALEQRKLDEEMREAKRQQRKLNFLITQTELYAHFMSRKRDMGHDGIQEEILRKLED
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SSTQRQIDIGGGVVVNITQEDYDSNHFKAQALKNAENAYHIHQARTRSFDEDAKESRAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 SSTQRQIDIGGGVVVNITQEDYDSNHFKAQALKNAENAYHIHQARTRSFDEDAKESRAAA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LRAANKSGTGFGESYSLANPSIRAGEDIPQPTIFNGKLKGYQLKGMNWLANLYEQGINGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 LRAANKSGTGFGESYSLANPSIRAGEDIPQPTIFNGKLKGYQLKGMNWLANLYEQGINGI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD LADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPASTLNNWHQEFTRFVPKFKVLPYWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 LADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPASTLNNWHQEFTRFVPKFKVLPYWG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD NPHDRKVIRRFWSQKTLYTQDAPFHVVITSYQLVVQDVKYFQRVKWQYMVLDEAQALKSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 NPHDRKVIRRFWSQKTLYTQDAPFHVVITSYQLVVQDVKYFQRVKWQYMVLDEAQALKSS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD SSVRWKILLQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLHFIMPTLFDSHEEFNEWFSKDIESH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 SSVRWKILLQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLHFIMPTLFDSHEEFNEWFSKDIESH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD AENKSAIDENQLSRLHMILKPFMLRRIKKDVENELSDKIEILMYCQLTSRQKLLYQALKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 AENKSAIDENQLSRLHMILKPFMLRRIKKDVENELSDKIEILMYCQLTSRQKLLYQALKN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD KISIEDLLQSSMGSTQQAQNTTSSLMNLVMQFRKVCNHPELFERQETWSPFHISLKPYHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 KISIEDLLQSSMGSTQQAQNTTSSLMNLVMQFRKVCNHPELFERQETWSPFHISLKPYHI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD SKFIYRHGQIRVFNHSRDRWLRVLSPFAPDYIQRSLFHRKGINEESCFSFLRFIDISPAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 SKFIYRHGQIRVFNHSRDRWLRVLSPFAPDYIQRSLFHRKGINEESCFSFLRFIDISPAE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD MANLMLQGLLARWLALFLSLKASYRLHQLRSWGAPEGESHQRYLRNKDFLLGVNFPLSFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 MANLMLQGLLARWLALFLSLKASYRLHQLRSWGAPEGESHQRYLRNKDFLLGVNFPLSFP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD NLCSCPLLKSLVFSSHCKAVSGYSDQVVHQRRSATSSLRRCLLTELPSFLCVASPRVTAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 NLCSCPLLKSLVFSSHCKAVSGYSDQVVHQRRSATSSLRRCLLTELPSFLCVASPRVTAV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD PLDSYCNDRSAEYERRVLKEGGSLAAKQCLLNGAPELAADWLNRRSQFFPEPAGGLWSIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 PLDSYCNDRSAEYERRVLKEGGSLAAKQCLLNGAPELAADWLNRRSQFFPEPAGGLWSIR
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD PQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRLKSQGHRVLIYSQMTRMIDLLEEYMVYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 PQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRLKSQGHRVLIYSQMTRMIDLLEEYMVYR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD KHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQNRNDIFVFLLSTRAGGLGINLTAADTVIFYDSDWNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 KHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQNRNDIFVFLLSTRAGGLGINLTAADTVIFYDSDWNP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD TVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERILQRAKEKSEIQRMVISGGNFKPDTLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 TVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERILQRAKEKSEIQRMVISGGNFKPDTLK
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD PKEVVSLLLDDEELEKKLRLRQEEKRQQEETNRVKERKRKREKYAEKKKKEDELDGKRRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 PKEVVSLLLDDEELEKKLRLRQEEKRQQEETNRVKERKRKREKYAEKKKKEDELDGKRRK
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD EGVNLVIPFVPSADNSNLSADGDDSFISVDSAMPSPFSEISISSELHTGSIPLDESSSDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 EGVNLVIPFVPSADNSNLSADGDDSFISVDSAMPSPFSEISISSELHTGSIPLDESSSDM
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD LVIVDDPASSAPQSRATNSPASITGSVSDTVNGISIQEMPAAGRGHSARSRGRPKGSGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 LVIVDDPASSAPQSRATNSPASITGSVSDTVNGISIQEMPAAGRGHSARSRGRPKGSGST
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD AKGAGKGRSRKSTAGSAAAMAGAKAGAAAASAAAYAAYGYNVSKGISASSPLQTSLVRPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 AKGAGKGRSRKSTAGSAAAMAGAKAGAAAASAAAYAAYGYNVSKGISASSPLQTSLVRPA
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550
pF1KSD GLADFGPSSASSPLSSPLSKGNNVPGNPKNLHMTSSLAPDSLVRKQGKGTNPSGGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 GLADFGPSSASSPLSSPLSKGNNVPGNPKNLHMTSSLAPDSLVRKQGKGTNPSGGR
1510 1520 1530 1540 1550
>>XP_011519987 (OMIM: 610169) PREDICTED: DNA helicase IN (1209 aa)
initn: 7823 init1: 7760 opt: 7760 Z-score: 5059.1 bits: 948.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7760; 99.7% identity (99.9% similar) in 1171 aa overlap (1-1171:1-1171)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASELGARDDGGCTELAKPLYLQYLERALRLDHFLRQTSAIFNRNISSDDSEDGLDDSNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MASELGARDDGGCTELAKPLYLQYLERALRLDHFLRQTSAIFNRNISSDDSEDGLDDSNP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LLPQSGDPLIQVKEEPPNSLLGETSGAGSSGMLNTYSLNGVLQSESKCDKGNLYNFSKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLPQSGDPLIQVKEEPPNSLLGETSGAGSSGMLNTYSLNGVLQSESKCDKGNLYNFSKLK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD KSRKWLKSILLSDESSEADSQSEDDDEEELNLSREELHNMLRLHKYKKLHQNKYSKDKEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KSRKWLKSILLSDESSEADSQSEDDDEEELNLSREELHNMLRLHKYKKLHQNKYSKDKEL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QQYQYYSAGLLSTYDPFYEQQRHLLGPKKKKFKEEKKLKAKLKKVKKKRRRDEELSSEES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QQYQYYSAGLLSTYDPFYEQQRHLLGPKKKKFKEEKKLKAKLKKVKKKRRRDEELSSEES
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PRRHHHQTKVFAKFSHDAPPPGTKKKHLSIEQLNARRRKVWLSIVKKELPKANKQKASAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PRRHHHQTKVFAKFSHDAPPPGTKKKHLSIEQLNARRRKVWLSIVKKELPKANKQKASAR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD NLFLTNSRKLAHQCMKEVRRAALQAQKNCKETLPRARRLTKEMLLYWKKYEKVEKEHRKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NLFLTNSRKLAHQCMKEVRRAALQAQKNCKETLPRARRLTKEMLLYWKKYEKVEKEHRKR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD AEKEALEQRKLDEEMREAKRQQRKLNFLITQTELYAHFMSRKRDMGHDGIQEEILRKLED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AEKEALEQRKLDEEMREAKRQQRKLNFLITQTELYAHFMSRKRDMGHDGIQEEILRKLED
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSTQRQIDIGGGVVVNITQEDYDSNHFKAQALKNAENAYHIHQARTRSFDEDAKESRAAA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LRAANKSGTGFGESYSLANPSIRAGEDIPQPTIFNGKLKGYQLKGMNWLANLYEQGINGI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPASTLNNWHQEFTRFVPKFKVLPYWG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NPHDRKVIRRFWSQKTLYTQDAPFHVVITSYQLVVQDVKYFQRVKWQYMVLDEAQALKSS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSVRWKILLQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLHFIMPTLFDSHEEFNEWFSKDIESH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AENKSAIDENQLSRLHMILKPFMLRRIKKDVENELSDKIEILMYCQLTSRQKLLYQALKN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KISIEDLLQSSMGSTQQAQNTTSSLMNLVMQFRKVCNHPELFERQETWSPFHISLKPYHI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SKFIYRHGQIRVFNHSRDRWLRVLSPFAPDYIQRSLFHRKGINEESCFSFLRFIDISPAE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MANLMLQGLLARWLALFLSLKASYRLHQLRSWGAPEGESHQRYLRNKDFLLGVNFPLSFP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NLCSCPLLKSLVFSSHCKAVSGYSDQVVHQRRSATSSLRRCLLTELPSFLCVASPRVTAV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PLDSYCNDRSAEYERRVLKEGGSLAAKQCLLNGAPELAADWLNRRSQFFPEPAGGLWSIR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRLKSQGHRVLIYSQMTRMIDLLEEYMVYR
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::::::::::::::::::::::::::.. .:
XP_011 KHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQNRTSEIVKESRCNSCHFKKLLNLLIIIQIYVSGREK
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XP_011 ENIPDSLYV
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: .. :. :::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PIQNTMAELWALLHFIMPTLFDSHEEFNEWFSKDIESHAENKSAIDENQLSRLHMILKPF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MLRRIKKDVENELSDKIEILMYCQLTSRQKLLYQALKNKISIEDLLQSSMGSTQQAQNTT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSLMNLVMQFRKVCNHPELFERQETWSPFHISLKPYHISKFIYRHGQIRVFNHSRDRWLR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VLSPFAPDYIQRSLFHRKGINEESCFSFLRFIDISPAEMANLMLQGLLARWLALFLSLKA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SYRLHQLRSWGAPEGESHQRYLRNKDFLLGVNFPLSFPNLCSCPLLKSLVFSSHCKAVSG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLAAKQCLLNGAPELAADWLNRRSQFFPEPAGGLWSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EEKRQQEETNRVKERKRKREKYAEKKKKEDELDGKRRKEGVNLVIPFVPSADNSNLSADG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DDSFISVDSAMPSPFSEISISSELHTGSIPLDESSSDMLVIVDDPASSAPQSRATNSPAS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ITGSVSDTVNGISIQEMPAAGRGHSARSRGRPKGSGSTAKGAGKGRSRKSTAGSAAAMAG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AKAGAAAASAAAYAAYGYNVSKGISASSPLQTSLVRPAGLADFGPSSASSPLSSPLSKGN
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pF1KSD NVPGNPKNLHMTSSLAPDSLVRKQGKGTNPSGGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NVPGNPKNLHMTSSLAPDSLVRKQGKGTNPSGGR
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: .:. :. . .. .: ...... .:
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::..:: . . ..: :. : :. : .. .: . ...: : ..
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.: : :. . ::: : :. :: : :.. : . :. : :
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: ....::. .: : . : : : . . :. : .:.:: :.. .
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.. . : . :.:... . . .:. .: . . . :.
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.. . .... : ::.. . . . :. : ..:: . .: . . ..:: :
NP_620 EEVSEKDAKQIIETAKQD-VDDEYSMQYSARG-SQSYYTVAHAISERVEKQSALLINGTL
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pF1KSD KGYQLKGMNWLANLYEQGINGILADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPAST
: :::.:..:...::....:::::::::::::.:.:::...: :.. . ::.::: : ::
NP_620 KHYQLQGLEWMVSLYNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIVPLST
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pF1KSD LNNWHQEFTRFVPKFKVLPYWGNPHDRK-VIRRFWSQKTLYTQDAPFHVVITSYQLVVQD
:.:: :: ...:. . : :.: :. .. .. : : :.:..:.:. ...:
NP_620 LSNWTYEFDKWAPSVVKISYKGTPAMRRSLVPQLRSGK--------FNVLLTTYEYIIKD
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pF1KSD VKYFQRVKWQYMVLDEAQALKSSSSVRWKIL-LQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLH
. . ...:.::..::.. .:. ..: .. :.::::::.:: . ::::::.
NP_620 KHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTHYVAPRRILLTGTPLQNKLPELWALLN
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pF1KSD FIMPTLFDSHEEFNEWFSKDIESHAENKSAIDENQL---SRLHMILKPFMLRRIKKDVEN
:..::.: : :..::. . .: . .:. . ::: .:.::.:::.::.::.
NP_620 FLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGERVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVES
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pF1KSD ELSDKIEILMYCQLTSRQKLLYQALKNKISIEDLLQSSMGSTQQAQNTTSSLMNLVMQFR
.: .:.: .. :.... ::.::. .. : .: :: .. . ..... ...::: .::.:
NP_620 QLPEKVEYVIKCDMSALQKILYRHMQAK-GI--LLTDGSEKDKKGKGGAKTLMNTIMQLR
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pF1KSD KVCNHPELFERQETWSPFHISLKPYHISKFIYRHGQIRVFNHSRDRWLRVLSPFAPDYIQ
:.:::: .:. ::
NP_620 KICNHPYMFQ--------HI----------------------------------------
1020
880 890 900 910 920 930
pF1KSD RSLFHRKGINEESCFSFLRFIDISPAEMANLMLQGLLARWLALFLSLKASYRLHQLRSWG
:::
NP_620 ----------EES-----------------------------------------------
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pF1KSD APEGESHQRYLRNKDFLLGVNFPLSFPNLCSCPLLKSLVFSSHCKAVSGYSDQVVHQRRS
:. : :::. :.
NP_620 ---------------------------------------FAEHL----GYSNGVI-----
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pF1KSD ATSSLRRCLLTELPSFLCVASPRVTAVPLDSYCNDRSAEYERRVLKEGGSLAAKQCLLNG
::
NP_620 ----------------------------------------------------------NG
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pF1KSD APELAADWLNRRSQFFPEPAGGLWSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRL
: : :::. :: .: .:
NP_620 AE----------------------------------------LYRASGKFELLDRILPKL
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pF1KSD KSQGHRVLIYSQMTRMIDLLEEYMVYRKHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQNR-NDIFVF
.. .::::.. ::: .. ..:.:...:. :.::::..: .: .. :.. .. :.:
NP_620 RATNHRVLLFCQMTSLMTIMEDYFAFRNFLYLRLDGTTKSEDRAALLKKFNEPGSQYFIF
1070 1080 1090 1100 1110 1120
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pF1KSD LLSTRAGGLGINLTAADTVIFYDSDWNPTVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEE
::::::::::.:: :::::...:::::: : ::.:::::.:: ..: : :: ...::
NP_620 LLSTRAGGLGLNLQAADTVVIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEE
1130 1140 1150 1160 1170 1180
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pF1KSD RILQRAKEKSEIQRMVISGGNF--KPDTLKPKEVVSLLLDDEELEKKLRLRQEEKRQQEE
.:: :: : .... ::..: : : .. . . .. .:. :: ... ..: ..:
NP_620 KILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEENEE----EDEVPDDET
1190 1200 1210 1220 1230
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pF1KSD TNRVKERKRKR----EKYAEKKKKEDELDGKRRKEGVNLVIPFVPSADNSNLSADGDDSF
:.. :.... .. ...:: . ::.
NP_620 LNQMIARREEEFDLFMRMDMDRRREDARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEE
1240 1250 1260 1270 1280 1290
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pF1KSD ISVDSAMPSPFSEISISSELHTGSIPLDESSSDMLVIVDDPASSAPQSRATNSPASITGS
NP_620 EEEKIFGRGSRQRRDVDYSDALTEKQWLRAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKDPAK
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>>NP_003061 (OMIM: 600014,601358) probable global transc (1590 aa)
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Smith-Waterman score: 966; 25.1% identity (49.3% similar) in 1143 aa overlap (210-1319:413-1271)
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pF1KSD LQQYQYYSAGLLSTYDPFYEQQRHLLGPKKKKFKEEKKLKAKLKKVKKKRRRDEELSSEE
: .:. :. . .. .: ...... .:
NP_003 LRLLNFQRQLRQEVVACMRRDTTLETALNSKAYKRSKRQTLREARMTEKLEKQQKIE-QE
390 400 410 420 430 440
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pF1KSD SPRRHHHQTKVFAKFSHDAPPPGTKKKHLSIE---QLNARRRKVWLSIVKKELPKANK--
::..:: . . ..: :. : :. : .. .: . ...: : ..
NP_003 RKRRQKHQEYLNSILQH---AKDFKEYHRSVAGKIQKLSKAVATWHANTEREQKKETERI
450 460 470 480 490
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QKASARNLFLTNS---RKLAHQCMKEVRRAALQAQKNCKETLPRARRLTKEMLLYWKKYE
.: : :. . ::: : :. :: : :.. : . :. : :
NP_003 EKERMRRLMAEDEEGYRKLIDQ--KKDRRLAYLLQQT-DEYVANLTNLVWEHKQAQAAKE
500 510 520 530 540 550
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pF1KSD KVEKEHRKRAEKEALE--QRKL--DEEMREAKRQQRKLNFLITQTE----LYAHFMSRKR
: ....::. .: : . : : : . . :. : .:.:: :.. .
NP_003 KKKRRRRKKKAEENAEGGESALGPDGEPIDESSQMSDLPVKVTHTETGKVLFGPEAPKAS
560 570 580 590 600 610
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pF1KSD DMG-----HDGIQEEILRKLEDSSTQRQIDIGGGVVVNITQEDYDSNHFKAQALKNAENA
.. . : . :.:... . . .:. .: . . . :.
NP_003 QLDAWLEMNPGYEVAPRSDSEESDSDYEEE---------DEEEESSRQETEEKILLDPNS
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pF1KSD YHIHQARTRSFDEDAKESRAAALRAANKSGTGFGESYSLANPSIRAGEDIPQPTIFNGKL
.. . .... : ::.. . . . :. : ..:: . .: . . ..:: :
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. . ...:.::..::.. .:. ..: .. :.::::::.:: . ::::::.
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:..::.: : :..::. . .: . .:. . ::: .:.::.:::.::.::.
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::
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.. .::::.. ::: .. ..:.:...:. :.::::..: .: .. :.. .. :.:
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: ....::. .: : . : : : . . :. : .:.:: :.. .
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.. .::::.. ::: .. ..:.:...:. :.::::..: .: .. :.. .. :.:
NP_001 RATNHRVLLFCQMTSLMTIMEDYFAFRNFLYLRLDGTTKSEDRAALLKKFNEPGSQYFIF
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.:: :: : .... ::..: : : .. . . .. .:. :: ... ..: ..:
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::..:: . . ..: :. : :. : .. .. . ...: : :.
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.: : :. . ::: : :. : : : : . : . .:... :
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: .:...:.::. . . : : . :. : . ..: . . : . :
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: :. . . : .:. . .:. . . . .: : ..
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. .. .: . :.::.. ... . :. :..:. .. : . . :: ::
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pF1KSD YQLKGMNWLANLYEQGINGILADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPASTLN
::.::..::..::....:::::::::::::.:.:::...: :.. : :::::: : :::.
NP_001 YQIKGLEWLVSLYNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLS
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. ...:.::..::.. .:. ..: .. ::::::::.:: . ::::::.:..
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::.: : :..::. . .: : ..:.. . ::: .:.::.:::.::.:: .:
NP_001 PTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGE-KVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQL
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.:.: .. :.... :..::. .. : .. :: .. . ..... :..::: .::.::.
NP_001 PEKVEYVIKCDMSALQRVLYRHMQAK-GV--LLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKI
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:::: .:. ::
NP_001 CNHPYMFQ--------HI------------------------------------------
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:::
NP_001 --------EES-------------------------------------------------
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:: : :.. .:.
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:: : :.
NP_001 --------------------------LDLY---RA-------------------------
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:::. :: .: .:..
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.:.::.. ::: .. ..:.:..:: :.::::..: .: .. :.. .. :.:::
NP_001 TNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTTKAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLL
1100 1110 1120 1130 1140 1150
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::::::::.:: .:::::..:::::: : ::.:::::.:: ..: : :: ...::.:
NP_001 STRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKI
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: :: : .... ::..: : : .. . . .. .:. :: ... . :
NP_001 LAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEQDEEEDEVPDDETVNQMIA
1220 1230 1240 1250 1260 1270
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:..:: . :. .:..: :.: .::::
NP_001 RHEEEFDLFMRMDLDRRREEARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMF
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NP_001 GRGSRHRKEVDYSDSLTEKQWLKAIEEGTLEEIEEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTS
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