Result of FASTA (omim) for
pFN21ASDA1087
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1087, 921 aa
1>>>pF1KSDA1087 921 - 921 aa - 921 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0147+/-0.000331; mu= 18.9222+/- 0.021
mean_var=93.2208+/-18.858, 0's: 0 Z-trim(117.3): 114 B-trim: 28 in 1/51
Lambda= 0.132837
statistics sampled from 29126 (29241) to 29126 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.677), E-opt: 0.2 (0.343), width: 16
Scan time: 14.430
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055878 (OMIM: 601901) sodium/calcium exchanger ( 921) 6132 1185.7 0
XP_005259229 (OMIM: 601901) PREDICTED: sodium/calc ( 915) 6076 1175.0 0
XP_016877096 (OMIM: 607991) PREDICTED: sodium/calc ( 926) 4344 843.1 0
XP_016877095 (OMIM: 607991) PREDICTED: sodium/calc ( 927) 4332 840.8 0
NP_892114 (OMIM: 607991) sodium/calcium exchanger ( 927) 4332 840.8 0
NP_489479 (OMIM: 607991) sodium/calcium exchanger ( 924) 4323 839.1 0
XP_016877098 (OMIM: 607991) PREDICTED: sodium/calc ( 920) 4307 836.0 0
XP_016877097 (OMIM: 607991) PREDICTED: sodium/calc ( 921) 4295 833.7 0
NP_891977 (OMIM: 607991) sodium/calcium exchanger ( 921) 4295 833.7 0
NP_150287 (OMIM: 607991) sodium/calcium exchanger ( 925) 4243 823.7 0
XP_016877099 (OMIM: 607991) PREDICTED: sodium/calc ( 617) 2504 490.3 1.2e-137
XP_016882648 (OMIM: 601901) PREDICTED: sodium/calc ( 345) 2210 433.8 6.9e-121
XP_016860253 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 616) 2101 413.1 2.1e-114
XP_011531360 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 667) 2101 413.1 2.3e-114
NP_001106273 (OMIM: 182305) sodium/calcium exchang ( 937) 2101 413.2 3e-114
XP_005264571 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 937) 2101 413.2 3e-114
XP_016860252 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 938) 2101 413.2 3e-114
XP_016860251 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 938) 2101 413.2 3e-114
XP_016860248 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 945) 2101 413.2 3e-114
XP_016860250 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 945) 2101 413.2 3e-114
XP_016860249 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 945) 2101 413.2 3e-114
XP_016860247 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 960) 2101 413.2 3e-114
NP_001106272 (OMIM: 182305) sodium/calcium exchang ( 960) 2101 413.2 3e-114
XP_016860245 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 961) 2101 413.2 3e-114
XP_016860246 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 961) 2101 413.2 3e-114
XP_016860244 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 961) 2101 413.2 3e-114
XP_016860243 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 965) 2101 413.2 3.1e-114
NP_001239553 (OMIM: 182305) sodium/calcium exchang ( 965) 2101 413.2 3.1e-114
XP_011531352 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 966) 2101 413.2 3.1e-114
NP_001106271 (OMIM: 182305) sodium/calcium exchang ( 968) 2101 413.2 3.1e-114
XP_011531359 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 968) 2101 413.2 3.1e-114
XP_016860238 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 973) 2101 413.2 3.1e-114
XP_011531358 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 973) 2101 413.2 3.1e-114
XP_016860241 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 973) 2101 413.2 3.1e-114
XP_006712147 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 973) 2101 413.2 3.1e-114
XP_016860237 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 973) 2101 413.2 3.1e-114
XP_011531356 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 973) 2101 413.2 3.1e-114
XP_006712148 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 973) 2101 413.2 3.1e-114
XP_006712144 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 973) 2101 413.2 3.1e-114
XP_006712146 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 973) 2101 413.2 3.1e-114
XP_016860235 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 973) 2101 413.2 3.1e-114
XP_016860239 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 973) 2101 413.2 3.1e-114
NP_066920 (OMIM: 182305) sodium/calcium exchanger ( 973) 2101 413.2 3.1e-114
XP_016860242 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 973) 2101 413.2 3.1e-114
XP_011531357 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 973) 2101 413.2 3.1e-114
XP_016860240 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 973) 2101 413.2 3.1e-114
XP_006712145 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 973) 2101 413.2 3.1e-114
XP_016860236 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc ( 991) 2101 413.2 3.1e-114
XP_016860234 (OMIM: 182305) PREDICTED: sodium/calc (1003) 2101 413.2 3.1e-114
XP_006720303 (OMIM: 607991) PREDICTED: sodium/calc ( 304) 1681 332.4 2.1e-90
>>NP_055878 (OMIM: 601901) sodium/calcium exchanger 2 pr (921 aa)
initn: 6132 init1: 6132 opt: 6132 Z-score: 6347.3 bits: 1185.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6132; 100.0% identity (100.0% similar) in 921 aa overlap (1-921:1-921)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAPLALVGVTLLLAAPPCSGAATPTPSLPPPPANDSDTSTGGCQGSYRCQPGVLLPVWEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MAPLALVGVTLLLAAPPCSGAATPTPSLPPPPANDSDTSTGGCQGSYRCQPGVLLPVWEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DDPSLGDKAARAVVYFVAMVYMFLGVSIIADRFMAAIEVITSKEKEITITKANGETSVGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DDPSLGDKAARAVVYFVAMVYMFLGVSIIADRFMAAIEVITSKEKEITITKANGETSVGT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VRIWNETVSNLTLMALGSSAPEILLSVIEVCGHNFQAGELGPGTIVGSAAFNMFVVIAVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VRIWNETVSNLTLMALGSSAPEILLSVIEVCGHNFQAGELGPGTIVGSAAFNMFVVIAVC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD IYVIPAGESRKIKHLRVFFVTASWSIFAYVWLYLILAVFSPGVVQVWEALLTLVFFPVCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 IYVIPAGESRKIKHLRVFFVTASWSIFAYVWLYLILAVFSPGVVQVWEALLTLVFFPVCV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VFAWMADKRLLFYKYVYKRYRTDPRSGIIIGAEGDPPKSIELDGTFVGAEAPGELGGLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VFAWMADKRLLFYKYVYKRYRTDPRSGIIIGAEGDPPKSIELDGTFVGAEAPGELGGLGP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GPAEARELDASRREVIQILKDLKQKHPDKDLEQLVGIANYYALLHQQKSRAFYRIQATRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GPAEARELDASRREVIQILKDLKQKHPDKDLEQLVGIANYYALLHQQKSRAFYRIQATRL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD MTGAGNVLRRHAADASRRAAPAEGAGEDEDDGASRIFFEPSLYHCLENCGSVLLSVTCQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MTGAGNVLRRHAADASRRAAPAEGAGEDEDDGASRIFFEPSLYHCLENCGSVLLSVTCQG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GEGNSTFYVDYRTEDGSAKAGSDYEYSEGTLVFKPGETQKELRIGIIDDDIFEEDEHFFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GEGNSTFYVDYRTEDGSAKAGSDYEYSEGTLVFKPGETQKELRIGIIDDDIFEEDEHFFV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD RLLNLRVGDAQGMFEPDGGGRPKGRLVAPLLATVTILDDDHAGIFSFQDRLLHVSECMGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RLLNLRVGDAQGMFEPDGGGRPKGRLVAPLLATVTILDDDHAGIFSFQDRLLHVSECMGT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VDVRVVRSSGARGTVRLPYRTVDGTARGGGVHYEDACGELEFGDDETMKTLQVKIVDDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VDVRVVRSSGARGTVRLPYRTVDGTARGGGVHYEDACGELEFGDDETMKTLQVKIVDDEE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD YEKKDNFFIELGQPQWLKRGISALLLNQGDGDRKLTAEEEEARRIAEMGKPVLGENCRLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YEKKDNFFIELGQPQWLKRGISALLLNQGDGDRKLTAEEEEARRIAEMGKPVLGENCRLE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD VIIEESYDFKNTVDKLIKKTNLALVIGTHSWREQFLEAITVSAGDEEEEEDGSREERLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VIIEESYDFKNTVDKLIKKTNLALVIGTHSWREQFLEAITVSAGDEEEEEDGSREERLPS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD CFDYVMHFLTVFWKVLFACVPPTEYCHGWACFGVSILVIGLLTALIGDLASHFGCTVGLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 CFDYVMHFLTVFWKVLFACVPPTEYCHGWACFGVSILVIGLLTALIGDLASHFGCTVGLK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DSVNAVVFVALGTSIPDTFASKVAALQDQCADASIGNVTGSNAVNVFLGLGVAWSVAAVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DSVNAVVFVALGTSIPDTFASKVAALQDQCADASIGNVTGSNAVNVFLGLGVAWSVAAVY
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD WAVQGRPFEVRTGTLAFSVTLFTVFAFVGIAVLLYRRRPHIGGELGGPRGPKLATTALFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 WAVQGRPFEVRTGTLAFSVTLFTVFAFVGIAVLLYRRRPHIGGELGGPRGPKLATTALFL
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KSD GLWLLYILFASLEAYCHIRGF
:::::::::::::::::::::
NP_055 GLWLLYILFASLEAYCHIRGF
910 920
>>XP_005259229 (OMIM: 601901) PREDICTED: sodium/calcium (915 aa)
initn: 6084 init1: 4150 opt: 6076 Z-score: 6289.3 bits: 1175.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6076; 99.3% identity (99.3% similar) in 921 aa overlap (1-921:1-915)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAPLALVGVTLLLAAPPCSGAATPTPSLPPPPANDSDTSTGGCQGSYRCQPGVLLPVWEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MAPLALVGVTLLLAAPPCSGAATPTPSLPPPPANDSDTSTGGCQGSYRCQPGVLLPVWEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DDPSLGDKAARAVVYFVAMVYMFLGVSIIADRFMAAIEVITSKEKEITITKANGETSVGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DDPSLGDKAARAVVYFVAMVYMFLGVSIIADRFMAAIEVITSKEKEITITKANGETSVGT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VRIWNETVSNLTLMALGSSAPEILLSVIEVCGHNFQAGELGPGTIVGSAAFNMFVVIAVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VRIWNETVSNLTLMALGSSAPEILLSVIEVCGHNFQAGELGPGTIVGSAAFNMFVVIAVC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD IYVIPAGESRKIKHLRVFFVTASWSIFAYVWLYLILAVFSPGVVQVWEALLTLVFFPVCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IYVIPAGESRKIKHLRVFFVTASWSIFAYVWLYLILAVFSPGVVQVWEALLTLVFFPVCV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VFAWMADKRLLFYKYVYKRYRTDPRSGIIIGAEGDPPKSIELDGTFVGAEAPGELGGLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VFAWMADKRLLFYKYVYKRYRTDPRSGIIIGAEGDPPKSIELDGTFVGAEAPGELGGLGP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GPAEARELDASRREVIQILKDLKQKHPDKDLEQLVGIANYYALLHQQKSRAFYRIQATRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GPAEARELDASRREVIQILKDLKQKHPDKDLEQLVGIANYYALLHQQKSRAFYRIQATRL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD MTGAGNVLRRHAADASRRAAPAEGAGEDEDDGASRIFFEPSLYHCLENCGSVLLSVTCQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MTGAGNVLRRHAADASRRAAPAEGAGEDEDDGASRIFFEPSLYHCLENCGSVLLSVTCQG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GEGNSTFYVDYRTEDGSAKAGSDYEYSEGTLVFKPGETQKELRIGIIDDDIFEEDEHFFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GEGNSTFYVDYRTEDGSAKAGSDYEYSEGTLVFKPGETQKELRIGIIDDDIFEEDEHFFV
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pF1KSD RLLNLRVGDAQGMFEPDGGGRPKGRLVAPLLATVTILDDDHAGIFSFQDRLLHVSECMGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RLLNLRVGDAQGMFEPDGGGRPKGRLVAPLLATVTILDDDHAGIFSFQDRLLHVSECMGT
490 500 510 520 530 540
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pF1KSD VDVRVVRSSGARGTVRLPYRTVDGTARGGGVHYEDACGELEFGDDETMKTLQVKIVDDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VDVRVVRSSGARGTVRLPYRTVDGTARGGGVHYEDACGELEFGDDETMKTLQVKIVDDEE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD YEKKDNFFIELGQPQWLKRGISALLLNQGDGDRKLTAEEEEARRIAEMGKPVLGENCRLE
:::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YEKKDNFFIELGQPQWLKRGIS------GDGDRKLTAEEEEARRIAEMGKPVLGENCRLE
610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KSD VIIEESYDFKNTVDKLIKKTNLALVIGTHSWREQFLEAITVSAGDEEEEEDGSREERLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VIIEESYDFKNTVDKLIKKTNLALVIGTHSWREQFLEAITVSAGDEEEEEDGSREERLPS
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KSD CFDYVMHFLTVFWKVLFACVPPTEYCHGWACFGVSILVIGLLTALIGDLASHFGCTVGLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CFDYVMHFLTVFWKVLFACVPPTEYCHGWACFGVSILVIGLLTALIGDLASHFGCTVGLK
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DSVNAVVFVALGTSIPDTFASKVAALQDQCADASIGNVTGSNAVNVFLGLGVAWSVAAVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DSVNAVVFVALGTSIPDTFASKVAALQDQCADASIGNVTGSNAVNVFLGLGVAWSVAAVY
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KSD WAVQGRPFEVRTGTLAFSVTLFTVFAFVGIAVLLYRRRPHIGGELGGPRGPKLATTALFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WAVQGRPFEVRTGTLAFSVTLFTVFAFVGIAVLLYRRRPHIGGELGGPRGPKLATTALFL
840 850 860 870 880 890
910 920
pF1KSD GLWLLYILFASLEAYCHIRGF
:::::::::::::::::::::
XP_005 GLWLLYILFASLEAYCHIRGF
900 910
>>XP_016877096 (OMIM: 607991) PREDICTED: sodium/calcium (926 aa)
initn: 2144 init1: 2144 opt: 4344 Z-score: 4495.4 bits: 843.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4344; 72.2% identity (90.4% similar) in 887 aa overlap (43-921:48-926)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD LAAPPCSGAATPTPSLPPPPANDSDTSTGGCQGSYRCQPGVLLPVWEPDDPSLGDKAARA
:.:: :. ::.::.: :..:::::: ::.
XP_016 LVTFVLFLNGLRAEAGGSGDVPSTGQNNESCSGSSDCKEGVILPIWYPENPSLGDKIARV
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KSD VVYFVAMVYMFLGVSIIADRFMAAIEVITSKEKEITITKANGETSVGTVRIWNETVSNLT
.:::::..:::::::::::::::.::::::.:.:.:: : :::::. :.:.:::::::::
XP_016 IVYFVALIYMFLGVSIIADRFMASIEVITSQEREVTIKKPNGETSTTTIRVWNETVSNLT
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KSD LMALGSSAPEILLSVIEVCGHNFQAGELGPGTIVGSAAFNMFVVIAVCIYVIPAGESRKI
::::::::::::::.::::::.: ::.:::.:::::::::::..:..:.:::: ::.:::
XP_016 LMALGSSAPEILLSLIEVCGHGFIAGDLGPSTIVGSAAFNMFIIIGICVYVIPDGETRKI
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KSD KHLRVFFVTASWSIFAYVWLYLILAVFSPGVVQVWEALLTLVFFPVCVVFAWMADKRLLF
:::::::.::.::::::.:::.::::::::::::::.:::: ::::::..::.:::::::
XP_016 KHLRVFFITAAWSIFAYIWLYMILAVFSPGVVQVWEGLLTLFFFPVCVLLAWVADKRLLF
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KSD YKYVYKRYRTDPRSGIIIGAEGDPPKSIELDGTFVGAE-APGELGGLGPGPAEARELDAS
:::..:.:::: . :::: .::: ::.::.:: ..... :.: : :..:.: :
XP_016 YKYMHKKYRTDKHRGIIIETEGDHPKGIEMDGKMMNSHFLDGNLV-----PLEGKEVDES
260 270 280 290 300 310
320 330 340 350 360 370
pF1KSD RREVIQILKDLKQKHPDKDLEQLVGIANYYALLHQQKSRAFYRIQATRLMTGAGNVLRRH
:::.:.::::::::::.:::.::: .:::::: :::::::::::::::.::::::.:..:
XP_016 RREMIRILKDLKQKHPEKDLDQLVEMANYYALSHQQKSRAFYRIQATRMMTGAGNILKKH
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420 430
pF1KSD AADASRRAAPAEGAGEDE-DDGASRIFFEPSLYHCLENCGSVLLSVTCQGGEGNSTFYVD
::. ...:. . :: .: :..::.: :.::::::.:::.:. .::. ..:.:::
XP_016 AAEQAKKASSMSEVHTDEPEDFISKVFFDPCSYQCLENCGAVLLTVVRKGGDMSKTMYVD
380 390 400 410 420 430
440 450 460 470 480 490
pF1KSD YRTEDGSAKAGSDYEYSEGTLVFKPGETQKELRIGIIDDDIFEEDEHFFVRLLNLRVGDA
:.::::::.::.:::..:::.:.::::::::. .:::::::::::::::::: :.:. .
XP_016 YKTEDGSANAGADYEFTEGTVVLKPGETQKEFSVGIIDDDIFEEDEHFFVRLSNVRIEEE
440 450 460 470 480 490
500 510 520 530 540
pF1KSD Q---GMFEP---DGGGRPKGRLVAPLLATVTILDDDHAGIFSFQDRLLHVSECMGTVDVR
: :: : .. :.. :..: .::::::::::::::.:. .:::: .:...:.
XP_016 QPEEGM-PPAIFNSLPLPRAVLASPCVATVTILDDDHAGIFTFECDTIHVSESIGVMEVK
500 510 520 530 540 550
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VVRSSGARGTVRLPYRTVDGTARGGGVHYEDACGELEFGDDETMKTLQVKIVDDEEYEKK
:.:.::::::: .:.:::.:::.::: .::. ::::: .:::.::..:::::.::::..
XP_016 VLRTSGARGTVIVPFRTVEGTAKGGGEDFEDTYGELEFKNDETVKTIRVKIVDEEEYERQ
560 570 580 590 600 610
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pF1KSD DNFFIELGQPQWLKRGISALLLNQGDGDRKLTAEEEEARRIAEMGKPVLGENCRLEVIIE
.:::: ::.:.:..::::::::. ::::: :::::.::::::::::::. .::::::
XP_016 ENFFIALGEPKWMERGISALLLSPDVTDRKLTMEEEEAKRIAEMGKPVLGEHPKLEVIIE
620 630 640 650 660 670
670 680 690 700 710 720
pF1KSD ESYDFKNTVDKLIKKTNLALVIGTHSWREQFLEAITVSAGDEEEEEDGSREERLPSCFDY
:::.::.::::::::::::::.::::::.::.::::::::::.:.:.: ::::::::::
XP_016 ESYEFKTTVDKLIKKTNLALVVGTHSWRDQFMEAITVSAGDEDEDESG--EERLPSCFDY
680 690 700 710 720
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pF1KSD VMHFLTVFWKVLFACVPPTEYCHGWACFGVSILVIGLLTALIGDLASHFGCTVGLKDSVN
::::::::::::::::::::::::::::.::::.::.:::.:::::::::::.::::::.
XP_016 VMHFLTVFWKVLFACVPPTEYCHGWACFAVSILIIGMLTAIIGDLASHFGCTIGLKDSVT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD AVVFVALGTSIPDTFASKVAALQDQCADASIGNVTGSNAVNVFLGLGVAWSVAAVYWAVQ
::::::.:::.:::::::.::::: :::::::::::::::::::.:.::::::.:::.:
XP_016 AVVFVAFGTSVPDTFASKAAALQDVYADASIGNVTGSNAVNVFLGIGLAWSVAAIYWALQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD GRPFEVRTGTLAFSVTLFTVFAFVGIAVLLYRRRPHIGGELGGPRGPKLATTALFLGLWL
:. :.: .:::::::::::.:::: :.:::::::::.::::::::: ::::: ::..:::
XP_016 GQEFHVSAGTLAFSVTLFTIFAFVCISVLLYRRRPHLGGELGGPRGCKLATTWLFVSLWL
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KSD LYILFASLEAYCHIRGF
::::::.:::::.:.::
XP_016 LYILFATLEAYCYIKGF
910 920
>>XP_016877095 (OMIM: 607991) PREDICTED: sodium/calcium (927 aa)
initn: 3405 init1: 1319 opt: 4332 Z-score: 4482.9 bits: 840.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4332; 72.1% identity (90.3% similar) in 888 aa overlap (43-921:48-927)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD LAAPPCSGAATPTPSLPPPPANDSDTSTGGCQGSYRCQPGVLLPVWEPDDPSLGDKAARA
:.:: :. ::.::.: :..:::::: ::.
XP_016 LVTFVLFLNGLRAEAGGSGDVPSTGQNNESCSGSSDCKEGVILPIWYPENPSLGDKIARV
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KSD VVYFVAMVYMFLGVSIIADRFMAAIEVITSKEKEITITKANGETSVGTVRIWNETVSNLT
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XP_016 IVYFVALIYMFLGVSIIADRFMASIEVITSQEREVTIKKPNGETSTTTIRVWNETVSNLT
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KSD LMALGSSAPEILLSVIEVCGHNFQAGELGPGTIVGSAAFNMFVVIAVCIYVIPAGESRKI
::::::::::::::.::::::.: ::.:::.:::::::::::..:..:.:::: ::.:::
XP_016 LMALGSSAPEILLSLIEVCGHGFIAGDLGPSTIVGSAAFNMFIIIGICVYVIPDGETRKI
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KSD KHLRVFFVTASWSIFAYVWLYLILAVFSPGVVQVWEALLTLVFFPVCVVFAWMADKRLLF
:::::::.::.::::::.:::.::::::::::::::.:::: ::::::..::.:::::::
XP_016 KHLRVFFITAAWSIFAYIWLYMILAVFSPGVVQVWEGLLTLFFFPVCVLLAWVADKRLLF
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KSD YKYVYKRYRTDPRSGIIIGAEGDPPKSIELDGTFVGAE-APGELGGLGPGPAEARELDAS
:::..:.:::: . :::: .::: ::.::.:: ..... :.: : :..:.: :
XP_016 YKYMHKKYRTDKHRGIIIETEGDHPKGIEMDGKMMNSHFLDGNLV-----PLEGKEVDES
260 270 280 290 300 310
320 330 340 350 360 370
pF1KSD RREVIQILKDLKQKHPDKDLEQLVGIANYYALLHQQKSRAFYRIQATRLMTGAGNVLRRH
:::.:.::::::::::.:::.::: .:::::: :::::::::::::::.::::::.:..:
XP_016 RREMIRILKDLKQKHPEKDLDQLVEMANYYALSHQQKSRAFYRIQATRMMTGAGNILKKH
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420 430
pF1KSD AADASRRAAPAEGAGEDE-DDGASRIFFEPSLYHCLENCGSVLLSVTCQGGEGNSTFYVD
::. ...:. . :: .: :..::.: :.::::::.:::.:. .::. ..:.:::
XP_016 AAEQAKKASSMSEVHTDEPEDFISKVFFDPCSYQCLENCGAVLLTVVRKGGDMSKTMYVD
380 390 400 410 420 430
440 450 460 470 480 490
pF1KSD YRTEDGSAKAGSDYEYSEGTLVFKPGETQKELRIGIIDDDIFEEDEHFFVRLLNLRVGDA
:.::::::.::.:::..:::.:.::::::::. .:::::::::::::::::: :.:. .
XP_016 YKTEDGSANAGADYEFTEGTVVLKPGETQKEFSVGIIDDDIFEEDEHFFVRLSNVRIEEE
440 450 460 470 480 490
500 510 520 530 540
pF1KSD Q---GMFEP---DGGGRPKGRLVAPLLATVTILDDDHAGIFSFQDRLLHVSECMGTVDVR
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XP_016 QPEEGM-PPAIFNSLPLPRAVLASPCVATVTILDDDHAGIFTFECDTIHVSESIGVMEVK
500 510 520 530 540 550
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VVRSSGARGTVRLPYRTVDGTARGGGVHYEDACGELEFGDDETMKTLQVKIVDDEEYEKK
:.:.::::::: .:.:::.:::.::: .::. ::::: .:::.::..:::::.::::..
XP_016 VLRTSGARGTVIVPFRTVEGTAKGGGEDFEDTYGELEFKNDETVKTIRVKIVDEEEYERQ
560 570 580 590 600 610
610 620 630 640 650 660
pF1KSD DNFFIELGQPQWLKRGISALLLNQGDGDRKLTAEEEEARRIAEMGKPVLGENCRLEVIIE
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XP_016 ENFFIALGEPKWMERGISALLLSPDVTDRKLTMEEEEAKRIAEMGKPVLGEHPKLEVIIE
620 630 640 650 660 670
670 680 690 700 710 720
pF1KSD ESYDFKNTVDKLIKKTNLALVIGTHSWREQFLEAITVSA-GDEEEEEDGSREERLPSCFD
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XP_016 ESYEFKTTVDKLIKKTNLALVVGTHSWRDQFMEAITVSAAGDEDEDESG--EERLPSCFD
680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD YVMHFLTVFWKVLFACVPPTEYCHGWACFGVSILVIGLLTALIGDLASHFGCTVGLKDSV
:::::::::::::::::::::::::::::.::::.::.:::.:::::::::::.::::::
XP_016 YVMHFLTVFWKVLFACVPPTEYCHGWACFAVSILIIGMLTAIIGDLASHFGCTIGLKDSV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD NAVVFVALGTSIPDTFASKVAALQDQCADASIGNVTGSNAVNVFLGLGVAWSVAAVYWAV
.::::::.:::.:::::::.::::: :::::::::::::::::::.:.::::::.:::.
XP_016 TAVVFVAFGTSVPDTFASKAAALQDVYADASIGNVTGSNAVNVFLGIGLAWSVAAIYWAL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD QGRPFEVRTGTLAFSVTLFTVFAFVGIAVLLYRRRPHIGGELGGPRGPKLATTALFLGLW
::. :.: .:::::::::::.:::: :.:::::::::.::::::::: ::::: ::..::
XP_016 QGQEFHVSAGTLAFSVTLFTIFAFVCISVLLYRRRPHLGGELGGPRGCKLATTWLFVSLW
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KSD LLYILFASLEAYCHIRGF
:::::::.:::::.:.::
XP_016 LLYILFATLEAYCYIKGF
910 920
>>NP_892114 (OMIM: 607991) sodium/calcium exchanger 3 is (927 aa)
initn: 3405 init1: 1319 opt: 4332 Z-score: 4482.9 bits: 840.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4332; 72.1% identity (90.3% similar) in 888 aa overlap (43-921:48-927)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD LAAPPCSGAATPTPSLPPPPANDSDTSTGGCQGSYRCQPGVLLPVWEPDDPSLGDKAARA
:.:: :. ::.::.: :..:::::: ::.
NP_892 LVTFVLFLNGLRAEAGGSGDVPSTGQNNESCSGSSDCKEGVILPIWYPENPSLGDKIARV
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KSD VVYFVAMVYMFLGVSIIADRFMAAIEVITSKEKEITITKANGETSVGTVRIWNETVSNLT
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NP_892 IVYFVALIYMFLGVSIIADRFMASIEVITSQEREVTIKKPNGETSTTTIRVWNETVSNLT
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KSD LMALGSSAPEILLSVIEVCGHNFQAGELGPGTIVGSAAFNMFVVIAVCIYVIPAGESRKI
::::::::::::::.::::::.: ::.:::.:::::::::::..:..:.:::: ::.:::
NP_892 LMALGSSAPEILLSLIEVCGHGFIAGDLGPSTIVGSAAFNMFIIIGICVYVIPDGETRKI
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KSD KHLRVFFVTASWSIFAYVWLYLILAVFSPGVVQVWEALLTLVFFPVCVVFAWMADKRLLF
:::::::.::.::::::.:::.::::::::::::::.:::: ::::::..::.:::::::
NP_892 KHLRVFFITAAWSIFAYIWLYMILAVFSPGVVQVWEGLLTLFFFPVCVLLAWVADKRLLF
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KSD YKYVYKRYRTDPRSGIIIGAEGDPPKSIELDGTFVGAE-APGELGGLGPGPAEARELDAS
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NP_892 YKYMHKKYRTDKHRGIIIETEGDHPKGIEMDGKMMNSHFLDGNLV-----PLEGKEVDES
260 270 280 290 300 310
320 330 340 350 360 370
pF1KSD RREVIQILKDLKQKHPDKDLEQLVGIANYYALLHQQKSRAFYRIQATRLMTGAGNVLRRH
:::.:.::::::::::.:::.::: .:::::: :::::::::::::::.::::::.:..:
NP_892 RREMIRILKDLKQKHPEKDLDQLVEMANYYALSHQQKSRAFYRIQATRMMTGAGNILKKH
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420 430
pF1KSD AADASRRAAPAEGAGEDE-DDGASRIFFEPSLYHCLENCGSVLLSVTCQGGEGNSTFYVD
::. ...:. . :: .: :..::.: :.::::::.:::.:. .::. ..:.:::
NP_892 AAEQAKKASSMSEVHTDEPEDFISKVFFDPCSYQCLENCGAVLLTVVRKGGDMSKTMYVD
380 390 400 410 420 430
440 450 460 470 480 490
pF1KSD YRTEDGSAKAGSDYEYSEGTLVFKPGETQKELRIGIIDDDIFEEDEHFFVRLLNLRVGDA
:.::::::.::.:::..:::.:.::::::::. .:::::::::::::::::: :.:. .
NP_892 YKTEDGSANAGADYEFTEGTVVLKPGETQKEFSVGIIDDDIFEEDEHFFVRLSNVRIEEE
440 450 460 470 480 490
500 510 520 530 540
pF1KSD Q---GMFEP---DGGGRPKGRLVAPLLATVTILDDDHAGIFSFQDRLLHVSECMGTVDVR
: :: : .. :.. :..: .::::::::::::::.:. .:::: .:...:.
NP_892 QPEEGM-PPAIFNSLPLPRAVLASPCVATVTILDDDHAGIFTFECDTIHVSESIGVMEVK
500 510 520 530 540 550
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VVRSSGARGTVRLPYRTVDGTARGGGVHYEDACGELEFGDDETMKTLQVKIVDDEEYEKK
:.:.::::::: .:.:::.:::.::: .::. ::::: .:::.::..:::::.::::..
NP_892 VLRTSGARGTVIVPFRTVEGTAKGGGEDFEDTYGELEFKNDETVKTIRVKIVDEEEYERQ
560 570 580 590 600 610
610 620 630 640 650 660
pF1KSD DNFFIELGQPQWLKRGISALLLNQGDGDRKLTAEEEEARRIAEMGKPVLGENCRLEVIIE
.:::: ::.:.:..::::::::. ::::: :::::.::::::::::::. .::::::
NP_892 ENFFIALGEPKWMERGISALLLSPDVTDRKLTMEEEEAKRIAEMGKPVLGEHPKLEVIIE
620 630 640 650 660 670
670 680 690 700 710 720
pF1KSD ESYDFKNTVDKLIKKTNLALVIGTHSWREQFLEAITVSA-GDEEEEEDGSREERLPSCFD
:::.::.::::::::::::::.::::::.::.::::::: :::.:.:.: :::::::::
NP_892 ESYEFKTTVDKLIKKTNLALVVGTHSWRDQFMEAITVSAAGDEDEDESG--EERLPSCFD
680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD YVMHFLTVFWKVLFACVPPTEYCHGWACFGVSILVIGLLTALIGDLASHFGCTVGLKDSV
:::::::::::::::::::::::::::::.::::.::.:::.:::::::::::.::::::
NP_892 YVMHFLTVFWKVLFACVPPTEYCHGWACFAVSILIIGMLTAIIGDLASHFGCTIGLKDSV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD NAVVFVALGTSIPDTFASKVAALQDQCADASIGNVTGSNAVNVFLGLGVAWSVAAVYWAV
.::::::.:::.:::::::.::::: :::::::::::::::::::.:.::::::.:::.
NP_892 TAVVFVAFGTSVPDTFASKAAALQDVYADASIGNVTGSNAVNVFLGIGLAWSVAAIYWAL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD QGRPFEVRTGTLAFSVTLFTVFAFVGIAVLLYRRRPHIGGELGGPRGPKLATTALFLGLW
::. :.: .:::::::::::.:::: :.:::::::::.::::::::: ::::: ::..::
NP_892 QGQEFHVSAGTLAFSVTLFTIFAFVCISVLLYRRRPHLGGELGGPRGCKLATTWLFVSLW
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KSD LLYILFASLEAYCHIRGF
:::::::.:::::.:.::
NP_892 LLYILFATLEAYCYIKGF
910 920
>>NP_489479 (OMIM: 607991) sodium/calcium exchanger 3 is (924 aa)
initn: 3953 init1: 1319 opt: 4323 Z-score: 4473.6 bits: 839.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4323; 72.1% identity (90.3% similar) in 888 aa overlap (43-921:48-924)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD LAAPPCSGAATPTPSLPPPPANDSDTSTGGCQGSYRCQPGVLLPVWEPDDPSLGDKAARA
:.:: :. ::.::.: :..:::::: ::.
NP_489 LVTFVLFLNGLRAEAGGSGDVPSTGQNNESCSGSSDCKEGVILPIWYPENPSLGDKIARV
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KSD VVYFVAMVYMFLGVSIIADRFMAAIEVITSKEKEITITKANGETSVGTVRIWNETVSNLT
.:::::..:::::::::::::::.::::::.:.:.:: : :::::. :.:.:::::::::
NP_489 IVYFVALIYMFLGVSIIADRFMASIEVITSQEREVTIKKPNGETSTTTIRVWNETVSNLT
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KSD LMALGSSAPEILLSVIEVCGHNFQAGELGPGTIVGSAAFNMFVVIAVCIYVIPAGESRKI
::::::::::::::.::::::.: ::.:::.:::::::::::..:..:.:::: ::.:::
NP_489 LMALGSSAPEILLSLIEVCGHGFIAGDLGPSTIVGSAAFNMFIIIGICVYVIPDGETRKI
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KSD KHLRVFFVTASWSIFAYVWLYLILAVFSPGVVQVWEALLTLVFFPVCVVFAWMADKRLLF
:::::::.::.::::::.:::.::::::::::::::.:::: ::::::..::.:::::::
NP_489 KHLRVFFITAAWSIFAYIWLYMILAVFSPGVVQVWEGLLTLFFFPVCVLLAWVADKRLLF
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KSD YKYVYKRYRTDPRSGIIIGAEGDPPKSIELDGTFVGAE-APGELGGLGPGPAEARELDAS
:::..:.:::: . :::: .::: ::.::.:: ..... :.: : :..:.: :
NP_489 YKYMHKKYRTDKHRGIIIETEGDHPKGIEMDGKMMNSHFLDGNLV-----PLEGKEVDES
260 270 280 290 300 310
320 330 340 350 360 370
pF1KSD RREVIQILKDLKQKHPDKDLEQLVGIANYYALLHQQKSRAFYRIQATRLMTGAGNVLRRH
:::.:.::::::::::.:::.::: .:::::: :::::::::::::::.::::::.:..:
NP_489 RREMIRILKDLKQKHPEKDLDQLVEMANYYALSHQQKSRAFYRIQATRMMTGAGNILKKH
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420 430
pF1KSD AADASRRAAPAEGAGEDE-DDGASRIFFEPSLYHCLENCGSVLLSVTCQGGEGNSTFYVD
::. ...:. . :: .: :..::.: :.::::::.:::.:. .::. ..:.:::
NP_489 AAEQAKKASSMSEVHTDEPEDFISKVFFDPCSYQCLENCGAVLLTVVRKGGDMSKTMYVD
380 390 400 410 420 430
440 450 460 470 480 490
pF1KSD YRTEDGSAKAGSDYEYSEGTLVFKPGETQKELRIGIIDDDIFEEDEHFFVRLLNLRVGDA
:.::::::.::.:::..:::.:.::::::::. .:::::::::::::::::: :.:. .
NP_489 YKTEDGSANAGADYEFTEGTVVLKPGETQKEFSVGIIDDDIFEEDEHFFVRLSNVRIEEE
440 450 460 470 480 490
500 510 520 530 540
pF1KSD Q---GMFEP---DGGGRPKGRLVAPLLATVTILDDDHAGIFSFQDRLLHVSECMGTVDVR
: :: : .. :.. :..: .::::::::::::::.:. .:::: .:...:.
NP_489 QPEEGM-PPAIFNSLPLPRAVLASPCVATVTILDDDHAGIFTFECDTIHVSESIGVMEVK
500 510 520 530 540 550
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VVRSSGARGTVRLPYRTVDGTARGGGVHYEDACGELEFGDDETMKTLQVKIVDDEEYEKK
:.:.::::::: .:.:::.:::.::: .::. ::::: .:::.::..:::::.::::..
NP_489 VLRTSGARGTVIVPFRTVEGTAKGGGEDFEDTYGELEFKNDETVKTIRVKIVDEEEYERQ
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pF1KSD DNFFIELGQPQWLKRGISALLLNQGDGDRKLTAEEEEARRIAEMGKPVLGENCRLEVIIE
.:::: ::.:.:..::::::::. ::::: :::::.::::::::::::. .::::::
NP_489 ENFFIALGEPKWMERGISALLLSP---DRKLTMEEEEAKRIAEMGKPVLGEHPKLEVIIE
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pF1KSD ESYDFKNTVDKLIKKTNLALVIGTHSWREQFLEAITVSA-GDEEEEEDGSREERLPSCFD
:::.::.::::::::::::::.::::::.::.::::::: :::.:.:.: :::::::::
NP_489 ESYEFKTTVDKLIKKTNLALVVGTHSWRDQFMEAITVSAAGDEDEDESG--EERLPSCFD
670 680 690 700 710 720
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pF1KSD YVMHFLTVFWKVLFACVPPTEYCHGWACFGVSILVIGLLTALIGDLASHFGCTVGLKDSV
:::::::::::::::::::::::::::::.::::.::.:::.:::::::::::.::::::
NP_489 YVMHFLTVFWKVLFACVPPTEYCHGWACFAVSILIIGMLTAIIGDLASHFGCTIGLKDSV
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pF1KSD NAVVFVALGTSIPDTFASKVAALQDQCADASIGNVTGSNAVNVFLGLGVAWSVAAVYWAV
.::::::.:::.:::::::.::::: :::::::::::::::::::.:.::::::.:::.
NP_489 TAVVFVAFGTSVPDTFASKAAALQDVYADASIGNVTGSNAVNVFLGIGLAWSVAAIYWAL
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pF1KSD QGRPFEVRTGTLAFSVTLFTVFAFVGIAVLLYRRRPHIGGELGGPRGPKLATTALFLGLW
::. :.: .:::::::::::.:::: :.:::::::::.::::::::: ::::: ::..::
NP_489 QGQEFHVSAGTLAFSVTLFTIFAFVCISVLLYRRRPHLGGELGGPRGCKLATTWLFVSLW
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KSD LLYILFASLEAYCHIRGF
:::::::.:::::.:.::
NP_489 LLYILFATLEAYCYIKGF
910 920
>>XP_016877098 (OMIM: 607991) PREDICTED: sodium/calcium (920 aa)
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Smith-Waterman score: 4307; 71.7% identity (90.0% similar) in 887 aa overlap (43-921:48-920)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD LAAPPCSGAATPTPSLPPPPANDSDTSTGGCQGSYRCQPGVLLPVWEPDDPSLGDKAARA
:.:: :. ::.::.: :..:::::: ::.
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pF1KSD VVYFVAMVYMFLGVSIIADRFMAAIEVITSKEKEITITKANGETSVGTVRIWNETVSNLT
.:::::..:::::::::::::::.::::::.:.:.:: : :::::. :.:.:::::::::
XP_016 IVYFVALIYMFLGVSIIADRFMASIEVITSQEREVTIKKPNGETSTTTIRVWNETVSNLT
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::::::::::::::.::::::.: ::.:::.:::::::::::..:..:.:::: ::.:::
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:::::::.::.::::::.:::.::::::::::::::.:::: ::::::..::.:::::::
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pF1KSD YKYVYKRYRTDPRSGIIIGAEGDPPKSIELDGTFVGAE-APGELGGLGPGPAEARELDAS
:::..:.:::: . :::: .::: ::.::.:: ..... :.: : :..:.: :
XP_016 YKYMHKKYRTDKHRGIIIETEGDHPKGIEMDGKMMNSHFLDGNLV-----PLEGKEVDES
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:::.:.::::::::::.:::.::: .:::::: :::::::::::::::.::::::.:..:
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::. ...:. . :: .: :..::.: :.::::::.:::.:. .::. ..:.:::
XP_016 AAEQAKKASSMSEVHTDEPEDFISKVFFDPCSYQCLENCGAVLLTVVRKGGDMSKTMYVD
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pF1KSD YRTEDGSAKAGSDYEYSEGTLVFKPGETQKELRIGIIDDDIFEEDEHFFVRLLNLRVGDA
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XP_016 YKTEDGSANAGADYEFTEGTVVLKPGETQKEFSVGIIDDDIFEEDEHFFVRLSNVRIEEE
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pF1KSD Q---GMFEP---DGGGRPKGRLVAPLLATVTILDDDHAGIFSFQDRLLHVSECMGTVDVR
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XP_016 QPEEGM-PPAIFNSLPLPRAVLASPCVATVTILDDDHAGIFTFECDTIHVSESIGVMEVK
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pF1KSD VVRSSGARGTVRLPYRTVDGTARGGGVHYEDACGELEFGDDETMKTLQVKIVDDEEYEKK
:.:.::::::: .:.:::.:::.::: .::. ::::: .:::.::..:::::.::::..
XP_016 VLRTSGARGTVIVPFRTVEGTAKGGGEDFEDTYGELEFKNDETVKTIRVKIVDEEEYERQ
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XP_016 ENFFIALGEPKWMERGISDVT------DRKLTMEEEEAKRIAEMGKPVLGEHPKLEVIIE
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pF1KSD ESYDFKNTVDKLIKKTNLALVIGTHSWREQFLEAITVSAGDEEEEEDGSREERLPSCFDY
:::.::.::::::::::::::.::::::.::.::::::::::.:.:.: ::::::::::
XP_016 ESYEFKTTVDKLIKKTNLALVVGTHSWRDQFMEAITVSAGDEDEDESG--EERLPSCFDY
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pF1KSD VMHFLTVFWKVLFACVPPTEYCHGWACFGVSILVIGLLTALIGDLASHFGCTVGLKDSVN
::::::::::::::::::::::::::::.::::.::.:::.:::::::::::.::::::.
XP_016 VMHFLTVFWKVLFACVPPTEYCHGWACFAVSILIIGMLTAIIGDLASHFGCTIGLKDSVT
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::::::.:::.:::::::.::::: :::::::::::::::::::.:.::::::.:::.:
XP_016 AVVFVAFGTSVPDTFASKAAALQDVYADASIGNVTGSNAVNVFLGIGLAWSVAAIYWALQ
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pF1KSD GRPFEVRTGTLAFSVTLFTVFAFVGIAVLLYRRRPHIGGELGGPRGPKLATTALFLGLWL
:. :.: .:::::::::::.:::: :.:::::::::.::::::::: ::::: ::..:::
XP_016 GQEFHVSAGTLAFSVTLFTIFAFVCISVLLYRRRPHLGGELGGPRGCKLATTWLFVSLWL
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KSD LYILFASLEAYCHIRGF
::::::.:::::.:.::
XP_016 LYILFATLEAYCYIKGF
910 920
>>XP_016877097 (OMIM: 607991) PREDICTED: sodium/calcium (921 aa)
initn: 3544 init1: 1319 opt: 4295 Z-score: 4444.7 bits: 833.7 E(85289): 0
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20 30 40 50 60 70
pF1KSD LAAPPCSGAATPTPSLPPPPANDSDTSTGGCQGSYRCQPGVLLPVWEPDDPSLGDKAARA
:.:: :. ::.::.: :..:::::: ::.
XP_016 LVTFVLFLNGLRAEAGGSGDVPSTGQNNESCSGSSDCKEGVILPIWYPENPSLGDKIARV
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.:::::..:::::::::::::::.::::::.:.:.:: : :::::. :.:.:::::::::
XP_016 IVYFVALIYMFLGVSIIADRFMASIEVITSQEREVTIKKPNGETSTTTIRVWNETVSNLT
80 90 100 110 120 130
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::::::::::::::.::::::.: ::.:::.:::::::::::..:..:.:::: ::.:::
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140 150 160 170 180 190
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pF1KSD KHLRVFFVTASWSIFAYVWLYLILAVFSPGVVQVWEALLTLVFFPVCVVFAWMADKRLLF
:::::::.::.::::::.:::.::::::::::::::.:::: ::::::..::.:::::::
XP_016 KHLRVFFITAAWSIFAYIWLYMILAVFSPGVVQVWEGLLTLFFFPVCVLLAWVADKRLLF
200 210 220 230 240 250
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pF1KSD YKYVYKRYRTDPRSGIIIGAEGDPPKSIELDGTFVGAE-APGELGGLGPGPAEARELDAS
:::..:.:::: . :::: .::: ::.::.:: ..... :.: : :..:.: :
XP_016 YKYMHKKYRTDKHRGIIIETEGDHPKGIEMDGKMMNSHFLDGNLV-----PLEGKEVDES
260 270 280 290 300 310
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pF1KSD RREVIQILKDLKQKHPDKDLEQLVGIANYYALLHQQKSRAFYRIQATRLMTGAGNVLRRH
:::.:.::::::::::.:::.::: .:::::: :::::::::::::::.::::::.:..:
XP_016 RREMIRILKDLKQKHPEKDLDQLVEMANYYALSHQQKSRAFYRIQATRMMTGAGNILKKH
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420 430
pF1KSD AADASRRAAPAEGAGEDE-DDGASRIFFEPSLYHCLENCGSVLLSVTCQGGEGNSTFYVD
::. ...:. . :: .: :..::.: :.::::::.:::.:. .::. ..:.:::
XP_016 AAEQAKKASSMSEVHTDEPEDFISKVFFDPCSYQCLENCGAVLLTVVRKGGDMSKTMYVD
380 390 400 410 420 430
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pF1KSD YRTEDGSAKAGSDYEYSEGTLVFKPGETQKELRIGIIDDDIFEEDEHFFVRLLNLRVGDA
:.::::::.::.:::..:::.:.::::::::. .:::::::::::::::::: :.:. .
XP_016 YKTEDGSANAGADYEFTEGTVVLKPGETQKEFSVGIIDDDIFEEDEHFFVRLSNVRIEEE
440 450 460 470 480 490
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pF1KSD Q---GMFEP---DGGGRPKGRLVAPLLATVTILDDDHAGIFSFQDRLLHVSECMGTVDVR
: :: : .. :.. :..: .::::::::::::::.:. .:::: .:...:.
XP_016 QPEEGM-PPAIFNSLPLPRAVLASPCVATVTILDDDHAGIFTFECDTIHVSESIGVMEVK
500 510 520 530 540 550
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VVRSSGARGTVRLPYRTVDGTARGGGVHYEDACGELEFGDDETMKTLQVKIVDDEEYEKK
:.:.::::::: .:.:::.:::.::: .::. ::::: .:::.::..:::::.::::..
XP_016 VLRTSGARGTVIVPFRTVEGTAKGGGEDFEDTYGELEFKNDETVKTIRVKIVDEEEYERQ
560 570 580 590 600 610
610 620 630 640 650 660
pF1KSD DNFFIELGQPQWLKRGISALLLNQGDGDRKLTAEEEEARRIAEMGKPVLGENCRLEVIIE
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XP_016 ENFFIALGEPKWMERGISDVT------DRKLTMEEEEAKRIAEMGKPVLGEHPKLEVIIE
620 630 640 650 660
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pF1KSD ESYDFKNTVDKLIKKTNLALVIGTHSWREQFLEAITVSA-GDEEEEEDGSREERLPSCFD
:::.::.::::::::::::::.::::::.::.::::::: :::.:.:.: :::::::::
XP_016 ESYEFKTTVDKLIKKTNLALVVGTHSWRDQFMEAITVSAAGDEDEDESG--EERLPSCFD
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pF1KSD YVMHFLTVFWKVLFACVPPTEYCHGWACFGVSILVIGLLTALIGDLASHFGCTVGLKDSV
:::::::::::::::::::::::::::::.::::.::.:::.:::::::::::.::::::
XP_016 YVMHFLTVFWKVLFACVPPTEYCHGWACFAVSILIIGMLTAIIGDLASHFGCTIGLKDSV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD NAVVFVALGTSIPDTFASKVAALQDQCADASIGNVTGSNAVNVFLGLGVAWSVAAVYWAV
.::::::.:::.:::::::.::::: :::::::::::::::::::.:.::::::.:::.
XP_016 TAVVFVAFGTSVPDTFASKAAALQDVYADASIGNVTGSNAVNVFLGIGLAWSVAAIYWAL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD QGRPFEVRTGTLAFSVTLFTVFAFVGIAVLLYRRRPHIGGELGGPRGPKLATTALFLGLW
::. :.: .:::::::::::.:::: :.:::::::::.::::::::: ::::: ::..::
XP_016 QGQEFHVSAGTLAFSVTLFTIFAFVCISVLLYRRRPHLGGELGGPRGCKLATTWLFVSLW
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KSD LLYILFASLEAYCHIRGF
:::::::.:::::.:.::
XP_016 LLYILFATLEAYCYIKGF
910 920
>>NP_891977 (OMIM: 607991) sodium/calcium exchanger 3 is (921 aa)
initn: 3544 init1: 1319 opt: 4295 Z-score: 4444.7 bits: 833.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4295; 71.6% identity (89.9% similar) in 888 aa overlap (43-921:48-921)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD LAAPPCSGAATPTPSLPPPPANDSDTSTGGCQGSYRCQPGVLLPVWEPDDPSLGDKAARA
:.:: :. ::.::.: :..:::::: ::.
NP_891 LVTFVLFLNGLRAEAGGSGDVPSTGQNNESCSGSSDCKEGVILPIWYPENPSLGDKIARV
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KSD VVYFVAMVYMFLGVSIIADRFMAAIEVITSKEKEITITKANGETSVGTVRIWNETVSNLT
.:::::..:::::::::::::::.::::::.:.:.:: : :::::. :.:.:::::::::
NP_891 IVYFVALIYMFLGVSIIADRFMASIEVITSQEREVTIKKPNGETSTTTIRVWNETVSNLT
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KSD LMALGSSAPEILLSVIEVCGHNFQAGELGPGTIVGSAAFNMFVVIAVCIYVIPAGESRKI
::::::::::::::.::::::.: ::.:::.:::::::::::..:..:.:::: ::.:::
NP_891 LMALGSSAPEILLSLIEVCGHGFIAGDLGPSTIVGSAAFNMFIIIGICVYVIPDGETRKI
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KSD KHLRVFFVTASWSIFAYVWLYLILAVFSPGVVQVWEALLTLVFFPVCVVFAWMADKRLLF
:::::::.::.::::::.:::.::::::::::::::.:::: ::::::..::.:::::::
NP_891 KHLRVFFITAAWSIFAYIWLYMILAVFSPGVVQVWEGLLTLFFFPVCVLLAWVADKRLLF
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KSD YKYVYKRYRTDPRSGIIIGAEGDPPKSIELDGTFVGAE-APGELGGLGPGPAEARELDAS
:::..:.:::: . :::: .::: ::.::.:: ..... :.: : :..:.: :
NP_891 YKYMHKKYRTDKHRGIIIETEGDHPKGIEMDGKMMNSHFLDGNLV-----PLEGKEVDES
260 270 280 290 300 310
320 330 340 350 360 370
pF1KSD RREVIQILKDLKQKHPDKDLEQLVGIANYYALLHQQKSRAFYRIQATRLMTGAGNVLRRH
:::.:.::::::::::.:::.::: .:::::: :::::::::::::::.::::::.:..:
NP_891 RREMIRILKDLKQKHPEKDLDQLVEMANYYALSHQQKSRAFYRIQATRMMTGAGNILKKH
320 330 340 350 360 370
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pF1KSD AADASRRAAPAEGAGEDE-DDGASRIFFEPSLYHCLENCGSVLLSVTCQGGEGNSTFYVD
::. ...:. . :: .: :..::.: :.::::::.:::.:. .::. ..:.:::
NP_891 AAEQAKKASSMSEVHTDEPEDFISKVFFDPCSYQCLENCGAVLLTVVRKGGDMSKTMYVD
380 390 400 410 420 430
440 450 460 470 480 490
pF1KSD YRTEDGSAKAGSDYEYSEGTLVFKPGETQKELRIGIIDDDIFEEDEHFFVRLLNLRVGDA
:.::::::.::.:::..:::.:.::::::::. .:::::::::::::::::: :.:. .
NP_891 YKTEDGSANAGADYEFTEGTVVLKPGETQKEFSVGIIDDDIFEEDEHFFVRLSNVRIEEE
440 450 460 470 480 490
500 510 520 530 540
pF1KSD Q---GMFEP---DGGGRPKGRLVAPLLATVTILDDDHAGIFSFQDRLLHVSECMGTVDVR
: :: : .. :.. :..: .::::::::::::::.:. .:::: .:...:.
NP_891 QPEEGM-PPAIFNSLPLPRAVLASPCVATVTILDDDHAGIFTFECDTIHVSESIGVMEVK
500 510 520 530 540 550
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VVRSSGARGTVRLPYRTVDGTARGGGVHYEDACGELEFGDDETMKTLQVKIVDDEEYEKK
:.:.::::::: .:.:::.:::.::: .::. ::::: .:::.::..:::::.::::..
NP_891 VLRTSGARGTVIVPFRTVEGTAKGGGEDFEDTYGELEFKNDETVKTIRVKIVDEEEYERQ
560 570 580 590 600 610
610 620 630 640 650 660
pF1KSD DNFFIELGQPQWLKRGISALLLNQGDGDRKLTAEEEEARRIAEMGKPVLGENCRLEVIIE
.:::: ::.:.:..:::: . ::::: :::::.::::::::::::. .::::::
NP_891 ENFFIALGEPKWMERGISDVT------DRKLTMEEEEAKRIAEMGKPVLGEHPKLEVIIE
620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD ESYDFKNTVDKLIKKTNLALVIGTHSWREQFLEAITVSA-GDEEEEEDGSREERLPSCFD
:::.::.::::::::::::::.::::::.::.::::::: :::.:.:.: :::::::::
NP_891 ESYEFKTTVDKLIKKTNLALVVGTHSWRDQFMEAITVSAAGDEDEDESG--EERLPSCFD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD YVMHFLTVFWKVLFACVPPTEYCHGWACFGVSILVIGLLTALIGDLASHFGCTVGLKDSV
:::::::::::::::::::::::::::::.::::.::.:::.:::::::::::.::::::
NP_891 YVMHFLTVFWKVLFACVPPTEYCHGWACFAVSILIIGMLTAIIGDLASHFGCTIGLKDSV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD NAVVFVALGTSIPDTFASKVAALQDQCADASIGNVTGSNAVNVFLGLGVAWSVAAVYWAV
.::::::.:::.:::::::.::::: :::::::::::::::::::.:.::::::.:::.
NP_891 TAVVFVAFGTSVPDTFASKAAALQDVYADASIGNVTGSNAVNVFLGIGLAWSVAAIYWAL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD QGRPFEVRTGTLAFSVTLFTVFAFVGIAVLLYRRRPHIGGELGGPRGPKLATTALFLGLW
::. :.: .:::::::::::.:::: :.:::::::::.::::::::: ::::: ::..::
NP_891 QGQEFHVSAGTLAFSVTLFTIFAFVCISVLLYRRRPHLGGELGGPRGCKLATTWLFVSLW
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KSD LLYILFASLEAYCHIRGF
:::::::.:::::.:.::
NP_891 LLYILFATLEAYCYIKGF
910 920
>>NP_150287 (OMIM: 607991) sodium/calcium exchanger 3 is (925 aa)
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Smith-Waterman score: 4243; 71.0% identity (89.5% similar) in 889 aa overlap (43-921:48-925)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD LAAPPCSGAATPTPSLPPPPANDSDTSTGGCQGSYRCQPGVLLPVWEPDDPSLGDKAARA
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20 30 40 50 60 70
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pF1KSD VVYFVAMVYMFLGVSIIADRFMAAIEVITSKEKEITITKANGETSVGTVRIWNETVSNLT
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NP_150 IVYFVALIYMFLGVSIIADRFMASIEVITSQEREVTIKKPNGETSTTTIRVWNETVSNLT
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NP_150 KHLRVFFITAAWSIFAYIWLYMILAVFSPGVVQVWEGLLTLFFFPVCVLLAWVADKRLLF
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pF1KSD YKYVYKRYRTDPRSGIIIGAEGDPPKSIELDGTFVGAE-APGELGGLGPGPAEARELDAS
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NP_150 YKYMHKKYRTDKHRGIIIETEGDHPKGIEMDGKMMNSHFLDGNLV-----PLEGKEVDES
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pF1KSD RREVIQILKDLKQKHPDKDLEQLVGIANYYALLHQQKSRAFYRIQATRLMTGAGNVLRRH
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NP_150 RREMIRILKDLKQKHPEKDLDQLVEMANYYALSHQQKSRAFYRIQATRMMTGAGNILKKH
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pF1KSD AADASRRAAPAEGAGEDE-DDGASRIFFEPSLYHCLENCGSVLLSVTCQGGEGNSTFYVD
::. ...:. . :: .: :..::.: :.::::::.:::.:. .::. ..:.:::
NP_150 AAEQAKKASSMSEVHTDEPEDFISKVFFDPCSYQCLENCGAVLLTVVRKGGDMSKTMYVD
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pF1KSD YRTEDGSAKAGSDYEYSEGTLVFKPGETQKELRIGIIDDDIFEEDEHFFVRLLNLRVGDA
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NP_150 YKTEDGSANAGADYEFTEGTVVLKPGETQKEFSVGIIDDDIFEEDEHFFVRLSNVRIEEE
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pF1KSD Q---GMFEP---DGGGRPKGRLVAPLLATVTILDDDHAGIFSFQDRLLHVSECMGTVDVR
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NP_150 QPEEGM-PPAIFNSLPLPRAVLASPCVATVTILDDDHAGIFTFECDTIHVSESIGVMEVK
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pF1KSD VVRSSGARGTVRLPYRTVDGTARGGGVHYEDACGELEFGDDETMKTLQVKIVDDEEYEKK
:.:.::::::: .:.:::.:::.::: .::. ::::: .:::.::...:..::: :::.
NP_150 VLRTSGARGTVIVPFRTVEGTAKGGGEDFEDTYGELEFKNDETVKTIHIKVIDDEAYEKN
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pF1KSD DNFFIELGQPQWLKRGIS-ALLLNQGDGDRKLTAEEEEARRIAEMGKPVLGENCRLEVII
:.:::. :. . ... ::::. ::::: :::::.::::::::::::. .:::::
NP_150 KNYFIEMMGPRMVDMSFQKALLLSP---DRKLTMEEEEAKRIAEMGKPVLGEHPKLEVII
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pF1KSD EESYDFKNTVDKLIKKTNLALVIGTHSWREQFLEAITVSA-GDEEEEEDGSREERLPSCF
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NP_150 EESYEFKTTVDKLIKKTNLALVVGTHSWRDQFMEAITVSAAGDEDEDESG--EERLPSCF
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pF1KSD DYVMHFLTVFWKVLFACVPPTEYCHGWACFGVSILVIGLLTALIGDLASHFGCTVGLKDS
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NP_150 DYVMHFLTVFWKVLFACVPPTEYCHGWACFAVSILIIGMLTAIIGDLASHFGCTIGLKDS
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NP_150 VTAVVFVAFGTSVPDTFASKAAALQDVYADASIGNVTGSNAVNVFLGIGLAWSVAAIYWA
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NP_150 LQGQEFHVSAGTLAFSVTLFTIFAFVCISVLLYRRRPHLGGELGGPRGCKLATTWLFVSL
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910 920
pF1KSD WLLYILFASLEAYCHIRGF
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NP_150 WLLYILFATLEAYCYIKGF
910 920
921 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 04:55:44 2016 done: Thu Nov 3 04:55:46 2016
Total Scan time: 14.430 Total Display time: 0.370
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]