Result of FASTA (ccds) for pFN21ASDA0924
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0924, 606 aa
  1>>>pF1KSDA0924 606 - 606 aa - 606 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6245+/-0.00106; mu= -2.1016+/- 0.064
 mean_var=380.7787+/-78.927, 0's: 0 Z-trim(115.1): 881  B-trim: 247 in 1/54
 Lambda= 0.065726
 statistics sampled from 14681 (15640) to 14681 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.769), E-opt: 0.2 (0.48), width:  16
 Scan time:  3.450

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS32677.1 ZNF652 gene_id:22834|Hs108|chr17       ( 606) 4206 412.9 5.9e-115
CCDS46805.2 ZBTB47 gene_id:92999|Hs108|chr3        ( 747) 1916 195.9 1.6e-49
CCDS32979.1 ZNF431 gene_id:170959|Hs108|chr19      ( 576)  748 85.0 2.9e-16
CCDS42532.1 ZNF253 gene_id:56242|Hs108|chr19       ( 499)  732 83.4 7.5e-16
CCDS46102.1 ZNF226 gene_id:7769|Hs108|chr19        ( 803)  734 83.8 9.1e-16
CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19        ( 738)  733 83.7 9.2e-16
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9       ( 699)  731 83.5   1e-15
CCDS12412.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19      ( 646)  727 83.1 1.2e-15
CCDS42536.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19      ( 774)  727 83.2 1.4e-15
CCDS54238.1 ZNF737 gene_id:100129842|Hs108|chr19   ( 536)  721 82.4 1.6e-15
CCDS46101.1 ZNF234 gene_id:10780|Hs108|chr19       ( 700)  723 82.7 1.7e-15
CCDS46990.1 ZNF732 gene_id:654254|Hs108|chr4       ( 585)  717 82.1 2.2e-15
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19         ( 595)  715 81.9 2.6e-15
CCDS12632.1 ZNF45 gene_id:7596|Hs108|chr19         ( 682)  714 81.9   3e-15
CCDS32978.1 ZNF430 gene_id:80264|Hs108|chr19       ( 570)  710 81.4 3.5e-15
CCDS42535.1 ZNF626 gene_id:199777|Hs108|chr19      ( 528)  709 81.3 3.5e-15
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19      ( 616)  710 81.5 3.7e-15
CCDS12637.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19        ( 907)  713 81.9   4e-15
CCDS54276.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19        ( 913)  713 81.9   4e-15
CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19      ( 616)  706 81.1 4.8e-15
CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19        ( 748)  708 81.3 4.8e-15
CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19      ( 647)  706 81.1 4.9e-15
CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19        ( 799)  708 81.4   5e-15
CCDS45984.2 ZNF878 gene_id:729747|Hs108|chr19      ( 531)  703 80.7 5.2e-15
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX          ( 779)  707 81.3 5.3e-15
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19        ( 620)  703 80.8 5.8e-15
CCDS33094.1 ZNF468 gene_id:90333|Hs108|chr19       ( 522)  701 80.5 5.9e-15
CCDS4441.1 ZNF454 gene_id:285676|Hs108|chr5        ( 522)  700 80.4 6.3e-15
CCDS54239.1 ZNF714 gene_id:148206|Hs108|chr19      ( 555)  700 80.5 6.6e-15
CCDS12099.1 ZNF77 gene_id:58492|Hs108|chr19        ( 545)  697 80.2 7.9e-15
CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19       ( 572)  695 80.0 9.3e-15
CCDS58659.1 ZNF382 gene_id:84911|Hs108|chr19       ( 549)  694 79.9 9.7e-15
CCDS33004.1 ZNF382 gene_id:84911|Hs108|chr19       ( 550)  694 79.9 9.7e-15
CCDS75609.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7        ( 510)  692 79.7 1.1e-14
CCDS47596.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7        ( 517)  692 79.7 1.1e-14
CCDS47357.2 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5        ( 867)  697 80.4 1.1e-14
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19       ( 970)  698 80.5 1.1e-14
CCDS75608.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7        ( 554)  692 79.7 1.1e-14
CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19        ( 819)  696 80.2 1.1e-14
CCDS54955.1 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5        ( 900)  697 80.4 1.1e-14
CCDS42574.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19        ( 825)  696 80.3 1.1e-14
CCDS34646.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7        ( 586)  692 79.7 1.2e-14
CCDS32981.1 ZNF675 gene_id:171392|Hs108|chr19      ( 568)  691 79.6 1.2e-14
CCDS75077.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4       ( 465)  686 79.1 1.5e-14
CCDS82335.1 ZNF529 gene_id:57711|Hs108|chr19       ( 458)  685 79.0 1.5e-14
CCDS12409.1 ZNF14 gene_id:7561|Hs108|chr19         ( 642)  688 79.4 1.6e-14
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19         (1159)  693 80.1 1.7e-14
CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4       ( 616)  686 79.2 1.8e-14
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19         (1191)  693 80.1 1.8e-14
CCDS54256.1 ZNF529 gene_id:57711|Hs108|chr19       ( 563)  685 79.0 1.8e-14


>>CCDS32677.1 ZNF652 gene_id:22834|Hs108|chr17            (606 aa)
 initn: 4206 init1: 4206 opt: 4206  Z-score: 2177.3  bits: 412.9 E(32554): 5.9e-115
Smith-Waterman score: 4206; 100.0% identity (100.0% similar) in 606 aa overlap (1-606:1-606)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSHTASSCQELVENCAVHVAGMAQEDSRRGQVPSSFYHGANQELDLSTKVYKRESGSPYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MSHTASSCQELVENCAVHVAGMAQEDSRRGQVPSSFYHGANQELDLSTKVYKRESGSPYS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD VLVDTKMSKPHLHETEEQPYFRETRAVSDVHAVKEDRENSDDTEEEEEEVSYKREQIIVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VLVDTKMSKPHLHETEEQPYFRETRAVSDVHAVKEDRENSDDTEEEEEEVSYKREQIIVE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD VNLNNQTLNVSKGEKGVSSQSKETPVLKTSSEEEEEESEEEATDDSNDYGENEKQKKKEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VNLNNQTLNVSKGEKGVSSQSKETPVLKTSSEEEEEESEEEATDDSNDYGENEKQKKKEK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD IVEKVSVTQRRTRRAASVAAATTSPTPRTTRGRRKSVEPPKRKKRATKEPKAPVQKAKCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IVEKVSVTQRRTRRAASVAAATTSPTPRTTRGRRKSVEPPKRKKRATKEPKAPVQKAKCE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD EKETLTCEKCPRVFNTRWYLEKHMNVTHRRMQICDKCGKKFVLESELSLHQQTDCEKNIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EKETLTCEKCPRVFNTRWYLEKHMNVTHRRMQICDKCGKKFVLESELSLHQQTDCEKNIQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD CVSCNKSFKKLWSLHEHIKIVHGYAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CVSCNKSFKKLWSLHEHIKIVHGYAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD TCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEKPFRCENCDERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEKPFRCENCDERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD DFNMKQYFDEHMKTHTGEKPFICEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DFNMKQYFDEHMKTHTGEKPFICEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD SNMLKAHKEKCFRVTSPVNVPPAVQIPLTTSPATPVPSVVNTATTPTPPINMNPVSTLPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SNMLKAHKEKCFRVTSPVNVPPAVQIPLTTSPATPVPSVVNTATTPTPPINMNPVSTLPP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD RPIPHPFSHLHIHPHPHHPHHLPIPPVPHLPPPPALFKSEPLNHRGQSEDNFLRHLAEKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RPIPHPFSHLHIHPHPHHPHHLPIPPVPHLPPPPALFKSEPLNHRGQSEDNFLRHLAEKN
              550       560       570       580       590       600

             
pF1KSD SSAQHH
       ::::::
CCDS32 SSAQHH
             

>>CCDS46805.2 ZBTB47 gene_id:92999|Hs108|chr3             (747 aa)
 initn: 2054 init1: 1776 opt: 1916  Z-score: 1002.7  bits: 195.9 E(32554): 1.6e-49
Smith-Waterman score: 1932; 55.7% identity (69.6% similar) in 560 aa overlap (42-579:218-735)

              20        30        40        50        60        70 
pF1KSD VENCAVHVAGMAQEDSRRGQVPSSFYHGANQELDLSTKVYKRESGSPYSVLVDTKMSKPH
                                     .::  :    .::...   ..:......  
CCDS46 FFKEEKEGGVEEAGGPPASLCKLEGGEELEEELGGSGTYSRREQSQ---IIVEVNLNNQT
       190       200       210       220       230          240    

              80        90           100       110       120       
pF1KSD LHETEEQPYFRETRAVSDVHAV--KED--RENSDDTEEEEEEVSYKREQIIVEVNLNNQT
       :: .   :  .   . : . .:  .::  ...::. ::..::   ..:.   : . ..  
CCDS46 LH-VSTGPEGKPGAGPSPATVVLGREDGLQRHSDEEEEDDEEEEEEEEE---EEGGGSGR
           250       260       270       280       290          300

       130       140       150       160       170        180      
pF1KSD LNVSKGEKGVSSQSKETPVLKTSSEEEEEESEEEATDDSNDYGENEKQKKKE-KIVEKVS
        .  . : : ... .:      : .::::: :::   . .:   .:... .: .   : .
CCDS46 EEEEEEEGGSQGEEEEEEEDGHSEQEEEEEEEEEEGPSEQDQESSEEEEGEEGEAGGKQG
              310       320       330       340       350       360

        190       200       210       220       230                
pF1KSD VTQRRTRRAASVAAATTSPTPRTTRGRRKSVEPPKRKKRATKEPKAPV------------
           :. ::     .  .   : .  :: . :: .  .:. :.:: :             
CCDS46 PRGSRSSRADPPPHSHMATRSRENARRRGTPEPEEAGRRGGKRPKPPPGVASASARGPPA
              370       380       390       400       410       420

               240       250       260       270       280         
pF1KSD -----QKAKCEEKETLTCEKCPRVFNTRWYLEKHMNVTHRRMQICDKCGKKFVLESELSL
             :.: :::.   :.:::::::.:::::::::::: ::::::.:::.:.::::: :
CCDS46 TDGLGAKVKLEEKQHHPCQKCPRVFNNRWYLEKHMNVTHSRMQICDQCGKRFLLESELLL
              430       440       450       460       470       480

     290       300       310       320       330       340         
pF1KSD HQQTDCEKNIQCVSCNKSFKKLWSLHEHIKIVHGYAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMV
       :.:::::.:::::.:.:.:::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HRQTDCERNIQCVTCGKAFKKLWSLHEHNKIVHGYAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMV
              490       500       510       520       530       540

     350       360       370       380       390       400         
pF1KSD AHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEKPFRCENCDERFQYKYQLRSHMSIHIG
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS46 AHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEKPFRCENCNERFQYKYQLRSHMSIHIG
              550       560       570       580       590       600

     410       420       430       440       450       460         
pF1KSD HKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPFICEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPY
       :::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPYICEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPY
              610       620       630       640       650       660

     470       480       490       500       510       520         
pF1KSD PCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVTSPVNVPPAVQIPLTTSPATPVPSVVNTATTPTPP
       :::::::::::::::::::::::::.              :  .  ::..      :  :
CCDS46 PCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVSH-------------TLAGDGVPAA------PGLP
              670       680                    690             700 

     530       540       550       560       570       580         
pF1KSD INMNPVSTLPPRPIPHPFSHLHIHPHPHHPHHLPIPPVPHLPPPPALFKSEPLNHRGQSE
                : .:  : .  :     :  :. :: :: ::::::: :: .          
CCDS46 ---------PTQPQAHALPLL-----PGLPQTLP-PP-PHLPPPPPLFPTTASPGGRMNA
                      710            720         730       740     

     590       600      
pF1KSD DNFLRHLAEKNSSAQHH
                        
CCDS46 NN               
                        

>>CCDS32979.1 ZNF431 gene_id:170959|Hs108|chr19           (576 aa)
 initn: 1037 init1: 591 opt: 748  Z-score: 405.5  bits: 85.0 E(32554): 2.9e-16
Smith-Waterman score: 748; 40.2% identity (65.2% similar) in 256 aa overlap (235-488:194-447)

          210       220       230       240       250       260    
pF1KSD PTPRTTRGRRKSVEPPKRKKRATKEPKAPVQKAKCEEKETLTCEKCPRVFNTRWYLEKHM
                                     .:..   :. . :.:: . :    .: .: 
CCDS32 LNQCLTTTQSKIFPCDKYVKVFHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHK
           170       180       190       200       210       220   

          270        280       290        300       310       320  
pF1KSD NVTHRRMQI-CDKCGKKFVLESELSLHQQTDC-EKNIQCVSCNKSFKKLWSLHEHIKIVH
        .  :. .  :..::: :   : :. :..    :: ..:  :.:.::.  .:  : ::.:
CCDS32 RIHIRENSYQCEECGKAFKWFSTLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTH-KIIH
           230       240       250       260       270        280  

            330       340       350       360       370       380  
pF1KSD GYAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGE
         .:: . :: : : :   .:.  : . :: . :. :: :::.:..: .:..:.. :.::
CCDS32 T-GEKPYRCEECGKAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGE
             290       300       310       320       330       340 

            390       400       410       420       430       440  
pF1KSD KPFRCENCDERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPFI
       ::..::.::. :.    : .:  :: :.:.. :. ::: :: .. . .: . ::::::. 
CCDS32 KPYKCEECDKAFNRFSYLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYK
             350       360       370       380       390       400 

            450       460       470       480       490       500  
pF1KSD CEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVTSPVNVPP
       ::.:::.:.   :.  :.  ::::::: :. ::. :  : .: :::              
CCDS32 CEVCGKAFNESSNLTTHKMIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEEC
             410       420       430       440       450       460 

            510       520       530       540       550       560  
pF1KSD AVQIPLTTSPATPVPSVVNTATTPTPPINMNPVSTLPPRPIPHPFSHLHIHPHPHHPHHL
                                                                   
CCDS32 GKAFSQSSILTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAF
             470       480       490       500       510       520 

>>CCDS42532.1 ZNF253 gene_id:56242|Hs108|chr19            (499 aa)
 initn: 1600 init1: 579 opt: 732  Z-score: 398.1  bits: 83.4 E(32554): 7.5e-16
Smith-Waterman score: 732; 42.2% identity (64.8% similar) in 244 aa overlap (247-488:202-443)

        220       230       240       250       260        270     
pF1KSD VEPPKRKKRATKEPKAPVQKAKCEEKETLTCEKCPRVFNTRWYLEKHMNV-THRRMQICD
                                     ::.: ..::    :  :  . : ..   :.
CCDS42 FKCIICGKAFKRSSTLTTHKKIHTGEKPYRCEECGKAFNQSANLTTHKRIHTGEKPYRCE
             180       190       200       210       220       230 

         280       290        300       310       320       330    
pF1KSD KCGKKFVLESELSLHQQTDC-EKNIQCVSCNKSFKKLWSLHEHIKIVHGYAEKKFSCEIC
       .::: :   :.:. :..    ::  .:  :.:.:..  .:  : ::::  .:: ..:: :
CCDS42 ECGKAFKQSSNLTTHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRSTDLTTH-KIVHT-GEKPYKCEEC
             240       250       260       270         280         

          340       350       360       370       380       390    
pF1KSD EKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEKPFRCENCDERF
        : :   .::  :   ::.  :..:: ::::::.  .: .:.  :.::::..::.: . :
CCDS42 GKAFKHPSHVTTHKKIHTRGKPYNCEECGKSFKHCSNLTIHKRIHTGEKPYKCEECGKAF
     290       300       310       320       330       340         

          400       410       420       430       440       450    
pF1KSD QYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPFICEICGKSFTSRP
       . . .: .:  .: :.: . :. ::: :: .  .  : : ::::::. :. :::.::   
CCDS42 HLSSHLTTHKILHTGEKPYRCRECGKAFNHSTTLFSHEKIHTGEKPYKCDECGKTFTWPS
     350       360       370       380       390       400         

          460       470       480       490       500       510    
pF1KSD NMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVTSPVNVPPAVQIPLTTSPAT
        ...:.::::::::: :. ::. :  :. : .::                          
CCDS42 ILSKHKRTHTGEKPYKCEECGKSFTASSTLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSDLNK
     410       420       430       440       450       460         

          520       530       540       550       560       570    
pF1KSD PVPSVVNTATTPTPPINMNPVSTLPPRPIPHPFSHLHIHPHPHHPHHLPIPPVPHLPPPP
                                                                   
CCDS42 HKKIHIERKPYIVKNVTDLLNVPPLLISIR                              
     470       480       490                                       

>>CCDS46102.1 ZNF226 gene_id:7769|Hs108|chr19             (803 aa)
 initn: 2732 init1: 573 opt: 734  Z-score: 396.5  bits: 83.8 E(32554): 9.1e-16
Smith-Waterman score: 734; 39.8% identity (68.0% similar) in 256 aa overlap (235-488:438-690)

          210       220       230       240       250       260    
pF1KSD PTPRTTRGRRKSVEPPKRKKRATKEPKAPVQKAKCEEKETLTCEKCPRVFNTRWYLEKHM
                                     :...  ::    ::.: . :.    :. :.
CCDS46 SHQRVHTGEKPYKCEECGKGFICSSNLYIHQRVHTGEKP-YKCEECGKGFSRPSSLQAHQ
       410       420       430       440        450       460      

           270       280       290        300       310       320  
pF1KSD NV-THRRMQICDKCGKKFVLESELSLHQQTDC-EKNIQCVSCNKSFKKLWSLHEHIKIVH
       .: : ..  ::  ::: :.: :.:. ::..   ::  .:  :.:::..  . : ....: 
CCDS46 GVHTGEKSYICTVCGKGFTLSSNLQAHQRVHTGEKPYKCNECGKSFRR--NSHYQVHLVV
        470       480       490       500       510         520    

            330       340       350       360       370       380  
pF1KSD GYAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGE
         .:: ..:::: : :   .... :. ::. . :: :: ::..:..:  :..:.: :.::
CCDS46 HTGEKPYKCEICGKGFSQSSYLQIHQKAHSIEKPFKCEECGQGFNQSSRLQIHQLIHTGE
          530       540       550       560       570       580    

            390       400       410       420       430       440  
pF1KSD KPFRCENCDERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPFI
       ::..::.: . :. . .:. :  :: :.: . :. ::: : . . .  :...:.::::: 
CCDS46 KPYKCEECGKGFSRRADLKIHCRIHTGEKPYNCEECGKVFRQASNLLAHQRVHSGEKPFK
          590       600       610       620       630       640    

            450       460       470       480       490       500  
pF1KSD CEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVTSPVNVPP
       :: :::::    ... :...:::.::: :: ::. :..:  :  :.              
CCDS46 CEECGKSFGRSAHLQAHQKVHTGDKPYKCDECGKGFKWSLNLDMHQRVHTGEKPYKCGEC
          650       660       670       680       690       700    

            510       520       530       540       550       560  
pF1KSD AVQIPLTTSPATPVPSVVNTATTPTPPINMNPVSTLPPRPIPHPFSHLHIHPHPHHPHHL
                                                                   
CCDS46 GKYFSQASSLQLHQSVHTGEKPYKCDVCGKVFSRSSQLQSHQRVHTGEKPYKCEICGKSF
          710       720       730       740       750       760    

>>CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19             (738 aa)
 initn: 1606 init1: 573 opt: 733  Z-score: 396.5  bits: 83.7 E(32554): 9.2e-16
Smith-Waterman score: 746; 31.4% identity (63.8% similar) in 389 aa overlap (103-488:221-590)

             80        90       100       110       120       130  
pF1KSD HETEEQPYFRETRAVSDVHAVKEDRENSDDTEEEEEEVSYKREQIIVEVNLNNQTLNVSK
                                     ........ .::...  . . ...::.:: 
CCDS33 TQNYQRSCKQTQMKNKLCIFAPYVDIFSCISHHHDDNIVHKRDKVHSNSDCGKDTLKVSP
              200       210       220       230       240       250

            140       150       160       170       180       190  
pF1KSD GEKGVSSQSKETPVLKTSSEEEEEESEEEATDDSNDYGENEKQKKKEKIVEKVSVTQRRT
           ....:     ..:...  . .  ::: .::..  : .:: .  :     :. .. :
CCDS33 ----LTQRS-----IHTGQKTYQGNECEEAFNDSSSL-ELHKQVHLGKKSPACSTHEKDT
                       260       270        280       290       300

            200       210        220       230       240       250 
pF1KSD RRAASVAAATTSPTPRTTR-GRRKSVEPPKRKKRATKEPKAPVQKAKCEEKETLTCEKCP
         ....      :. ...: :...       :  . .      :...  ::   ::..: 
CCDS33 SYSSGI------PVQQSVRTGKKRYWCHECGKGFSQSSNLQTHQRVHTGEKP-YTCHECG
                    310       320       330       340        350   

             260        270       280       290        300         
pF1KSD RVFNTRWYLEKHMNV-THRRMQICDKCGKKFVLESELSLHQQTDC-EKNIQCVSCNKSFK
       . ::   .:  :. . : ..   ::.::: :   ..:..: ..   ::  .:  :.:.: 
CCDS33 KSFNQSSHLYAHLPIHTGEKPYRCDSCGKGFSRSTDLNIHCRVHTGEKPYKCEVCGKGFT
           360       370       380       390       400       410   

     310       320       330       340       350       360         
pF1KSD KLWSLHEHIKIVHGYAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCETCGKSFKRS
       .   :. : .:  :  :: ..:  : :.:   .... :. .::.. :. :. ::: :. :
CCDS33 QRSHLQAHERIHTG--EKPYKCGDCGKRFSCSSNLHTHQRVHTEEKPYKCDECGKCFSLS
           420         430       440       450       460       470 

     370       380       390       400       410       420         
pF1KSD MSLKVHSLQHSGEKPFRCENCDERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGKDFNMKQYFD
       ..:. :.  :.::::..::.: . :.   ...::. .: :.: : :. ::: :....::.
CCDS33 FNLHSHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSSASSFQSHQRVHTGEKPFRCNVCGKGFSQSSYFQ
             480       490       500       510       520       530 

     430       440       450       460       470       480         
pF1KSD EHMKTHTGEKPFICEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRFSNMLKAHKE
        :...::::::. ::.::: :.   :.. :.:.::::::: :. ::. :  .. :.::. 
CCDS33 AHQRVHTGEKPYKCEVCGKRFNWSLNLHNHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSQASNLQAHQS
             540       550       560       570       580       590 

     490       500       510       520       530       540         
pF1KSD KCFRVTSPVNVPPAVQIPLTTSPATPVPSVVNTATTPTPPINMNPVSTLPPRPIPHPFSH
                                                                   
CCDS33 VHTGEKPFKCDACQKRFSQASHLQAHQRVHTGEKPYKCDTCGKAFSQRSNLQVHQIIHTG
             600       610       620       630       640       650 

>>CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9            (699 aa)
 initn: 3923 init1: 589 opt: 731  Z-score: 395.7  bits: 83.5 E(32554): 1e-15
Smith-Waterman score: 731; 40.9% identity (66.0% similar) in 259 aa overlap (235-488:385-637)

          210       220       230       240       250       260    
pF1KSD PTPRTTRGRRKSVEPPKRKKRATKEPKAPVQKAKCEEKETLTCEKCPRVFNTRWYLEKHM
                                     ::..  ::    : .: ..:. .  :.::.
CCDS35 VHQKVHIRAKPYEYNECGKSCSMNSHLIWPQKSHTGEKP-YECPECGKAFSEKSRLRKHQ
          360       370       380       390        400       410   

           270       280       290        300       310       320  
pF1KSD NV-THRRMQICDKCGKKFVLESELSLHQQTDC-EKNIQCVSCNKSFKKLWSLHEHIKIVH
        . : ..   :: : : :  .: : .::.:   :: ..:  :.:::.     .. : :::
CCDS35 RTHTGEKPYKCDGCDKAFSAKSGLRIHQRTHTGEKPFECHECGKSFN-----YKSILIVH
           420       430       440       450       460             

               330       340       350       360       370         
pF1KSD GYA---EKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQH
         .   :: : :. : :.:  :. .:.:  .:: . :. :. :::.:: . .:. :   :
CCDS35 QRTHTGEKPFECNECGKSFSHMSGLRNHRRTHTGERPYKCDECGKAFKLKSGLRKHHRTH
      470       480       490       500       510       520        

     380       390       400       410       420       430         
pF1KSD SGEKPFRCENCDERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEK
       .::::..:..: . :  : :::.:  :: :.: . :. ::. :..:. .  : .::::::
CCDS35 TGEKPYKCNQCGKAFGQKSQLRGHHRIHTGEKPYKCNHCGEAFSQKSNLRVHHRTHTGEK
      530       540       550       560       570       580        

     440       450       460       470       480       490         
pF1KSD PFICEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVTSPVN
       :. :: :::.: .. :.. :.::::::::: :. ::. :  ...:. :.           
CCDS35 PYQCEECGKTFRQKSNLRGHQRTHTGEKPYECNECGKAFSEKSVLRKHQRTHTGEKPYNC
      590       600       610       620       630       640        

     500       510       520       530       540       550         
pF1KSD VPPAVQIPLTTSPATPVPSVVNTATTPTPPINMNPVSTLPPRPIPHPFSHLHIHPHPHHP
                                                                   
CCDS35 NQCGEAFSQKSNLRVHQRTHTGEKPYKCDKCGRTFSQKSSLREHQKAHPGD         
      650       660       670       680       690                  

>>CCDS12412.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19           (646 aa)
 initn: 1080 init1: 567 opt: 727  Z-score: 394.1  bits: 83.1 E(32554): 1.2e-15
Smith-Waterman score: 727; 34.6% identity (61.5% similar) in 312 aa overlap (184-489:212-521)

           160       170       180       190       200       210   
pF1KSD EEEESEEEATDDSNDYGENEKQKKKEKIVEKVSVTQRRTRRAASVAAATTSPTPRTTRGR
                                     :.  :.....:      :    .  ::. :
CCDS12 GHKIIHNGEKPYKCEECGKAFSIFSTPTKHKIIHTEEKSHRCEEYCKAYKESSHLTTHKR
             190       200       210       220       230       240 

           220       230           240       250       260         
pF1KSD RKSVEPPKRKKRATKEPK--APVQKAKC--EEKETLTCEKCPRVFNTRWYLEKHMNV-TH
        .. : : . ..  :  .  . . : :    :...  ::.: ....   .:  :  . : 
CCDS12 IHTGEKPYKCEECGKAFSIFSTLTKHKIIHTEEKSHRCEECGKAYKESSHLTTHKRIHTG
             250       260       270       280       290       300 

      270       280       290        300       310       320       
pF1KSD RRMQICDKCGKKFVLESELSLHQQTDCE-KNIQCVSCNKSFKKLWSLHEHIKIVHGYAEK
       ..   :..::: : . : :. :.    : :  .:  :.:.::.  .: .: .:.:   ::
CCDS12 EKPYKCEECGKTFSVFSILTKHKIIHTEEKPYKCEECGKAFKRSSTLTKH-RIIHT-EEK
             310       320       330       340       350           

       330       340       350       360       370       380       
pF1KSD KFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEKPFRC
        ..:: : : :   . .  : . :: . :. :: :::.:::: .: .:.. :.::::..:
CCDS12 PYKCEECGKAFNQSSTLSIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKRSSTLTIHKMIHTGEKPYKC
     360       370       380       390       400       410         

       390       400       410       420       430       440       
pF1KSD ENCDERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPFICEICG
       :.: . :. . .: .:  :: ::: . :. :::.:.. . . .:   :: .::. :: ::
CCDS12 EECGKAFNRSSHLTTHKRIHTGHKPYKCKECGKSFSVFSTLTKHKIIHTDKKPYKCEECG
     420       430       440       450       460       470         

       450       460       470       480       490       500       
pF1KSD KSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVTSPVNVPPAVQIP
       :.:.    .. :.. ::::::: :. ::. :. :. : .::.                  
CCDS12 KAFNRSSILSIHKKIHTGEKPYKCEECGKAFKRSSHLAGHKQIHSVQKPYKCEECGKAFS
     480       490       500       510       520       530         

       510       520       530       540       550       560       
pF1KSD LTTSPATPVPSVVNTATTPTPPINMNPVSTLPPRPIPHPFSHLHIHPHPHHPHHLPIPPV
                                                                   
CCDS12 IFSTLTKHKIIHTEEKPYKCEKCGKTFYRFSNLNTHKIIHTGEKPCKCEECGKAFNHSSN
     540       550       560       570       580       590         

>>CCDS42536.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19           (774 aa)
 initn: 1080 init1: 567 opt: 727  Z-score: 393.1  bits: 83.2 E(32554): 1.4e-15
Smith-Waterman score: 727; 34.6% identity (61.5% similar) in 312 aa overlap (184-489:340-649)

           160       170       180       190       200       210   
pF1KSD EEEESEEEATDDSNDYGENEKQKKKEKIVEKVSVTQRRTRRAASVAAATTSPTPRTTRGR
                                     :.  :.....:      :    .  ::. :
CCDS42 GHKIIHNGEKPYKCEECGKAFSIFSTPTKHKIIHTEEKSHRCEEYCKAYKESSHLTTHKR
     310       320       330       340       350       360         

           220       230           240       250       260         
pF1KSD RKSVEPPKRKKRATKEPK--APVQKAKC--EEKETLTCEKCPRVFNTRWYLEKHMNV-TH
        .. : : . ..  :  .  . . : :    :...  ::.: ....   .:  :  . : 
CCDS42 IHTGEKPYKCEECGKAFSIFSTLTKHKIIHTEEKSHRCEECGKAYKESSHLTTHKRIHTG
     370       380       390       400       410       420         

      270       280       290        300       310       320       
pF1KSD RRMQICDKCGKKFVLESELSLHQQTDCE-KNIQCVSCNKSFKKLWSLHEHIKIVHGYAEK
       ..   :..::: : . : :. :.    : :  .:  :.:.::.  .: .: .:.:   ::
CCDS42 EKPYKCEECGKTFSVFSILTKHKIIHTEEKPYKCEECGKAFKRSSTLTKH-RIIHT-EEK
     430       440       450       460       470        480        

       330       340       350       360       370       380       
pF1KSD KFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEKPFRC
        ..:: : : :   . .  : . :: . :. :: :::.:::: .: .:.. :.::::..:
CCDS42 PYKCEECGKAFNQSSTLSIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKRSSTLTIHKMIHTGEKPYKC
       490       500       510       520       530       540       

       390       400       410       420       430       440       
pF1KSD ENCDERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPFICEICG
       :.: . :. . .: .:  :: ::: . :. :::.:.. . . .:   :: .::. :: ::
CCDS42 EECGKAFNRSSHLTTHKRIHTGHKPYKCKECGKSFSVFSTLTKHKIIHTDKKPYKCEECG
       550       560       570       580       590       600       

       450       460       470       480       490       500       
pF1KSD KSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVTSPVNVPPAVQIP
       :.:.    .. :.. ::::::: :. ::. :. :. : .::.                  
CCDS42 KAFNRSSILSIHKKIHTGEKPYKCEECGKAFKRSSHLAGHKQIHSVQKPYKCEECGKAFS
       610       620       630       640       650       660       

       510       520       530       540       550       560       
pF1KSD LTTSPATPVPSVVNTATTPTPPINMNPVSTLPPRPIPHPFSHLHIHPHPHHPHHLPIPPV
                                                                   
CCDS42 IFSTLTKHKIIHTEEKPYKCEKCGKTFYRFSNLNTHKIIHTGEKPCKCEECGKAFNHSSN
       670       680       690       700       710       720       

>>CCDS54238.1 ZNF737 gene_id:100129842|Hs108|chr19        (536 aa)
 initn: 568 init1: 568 opt: 721  Z-score: 392.1  bits: 82.4 E(32554): 1.6e-15
Smith-Waterman score: 721; 37.0% identity (62.3% similar) in 281 aa overlap (210-488:138-416)

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD KIVEKVSVTQRRTRRAASVAAATTSPTPRTTRGRRKSVEPPKRKKRATKEPKAPVQKAKC
                                     :  . :  .  :  :   :  ..  .: . 
CCDS54 HDNLQFKKGCESVDECKVHKRGYNGLNQYLTTTQSKIFQCDKYVKVIHKFSNSNRHKIRH
       110       120       130       140       150       160       

     240       250       260        270       280       290        
pF1KSD EEKETLTCEKCPRVFNTRWYLEKHMNV-THRRMQICDKCGKKFVLESELSLHQQTDC-EK
         :. . : .: ..::    :  : .. : ..   :..::: :   :.:. :..    ::
CCDS54 TGKKPFKCIECGKAFNQSSTLTTHKKIHTGEKPFKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEK
       170       180       190       200       210       220       

       300       310       320       330       340       350       
pF1KSD NIQCVSCNKSFKKLWSLHEHIKIVHGYAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPF
         .: .:.:.:...  :  : ::.:. .:: ..:: : : :   ...  : . :: . :.
CCDS54 RYKCEDCGKAFSRFSYLTAH-KIIHS-GEKPYKCEECGKAFKRSSNLTTHKIIHTGEKPY
       230       240        250        260       270       280     

       360       370       380       390       400       410       
pF1KSD TCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEKPFRCENCDERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQW
        :: :::.::::  : .:.. ::::::..::.: . :..   : .:  :: :.: . :. 
CCDS54 KCEECGKAFKRSSILTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKHPSVLTTHKRIHTGEKPYKCEE
         290       300       310       320       330       340     

       420       430       440       450       460       470       
pF1KSD CGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPFICEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQR
       ::. :.. . .  :   :.::::. :: :::.:.   ..  :.: ::::::: :. ::. 
CCDS54 CGRAFKYFSSLTTHKIIHSGEKPYKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGEA
         350       360       370       380       390       400     

       480       490       500       510       520       530       
pF1KSD FRFSNMLKAHKEKCFRVTSPVNVPPAVQIPLTTSPATPVPSVVNTATTPTPPINMNPVST
       :..:. : .::                                                 
CCDS54 FKYSSSLTTHKIIHTGQQPFKCEECGKAFKCFSILTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNSS
         410       420       430       440       450       460     




606 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 04:14:41 2016 done: Thu Nov  3 04:14:42 2016
 Total Scan time:  3.450 Total Display time:  0.070

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com