Result of FASTA (ccds) for
pFN21ASDA0694
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0694, 593 aa
1>>>pF1KSDA0694 593 - 593 aa - 593 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1349+/-0.000894; mu= 14.8880+/- 0.054
mean_var=77.0813+/-15.476, 0's: 0 Z-trim(106.5): 41 B-trim: 2 in 1/51
Lambda= 0.146083
statistics sampled from 8977 (9008) to 8977 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.636), E-opt: 0.2 (0.277), width: 16
Scan time: 2.930
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46528.1 DOCK10 gene_id:55619|Hs108|chr2 (2186) 3712 792.2 0
CCDS74661.1 DOCK10 gene_id:55619|Hs108|chr2 (2180) 3460 739.1 1.3e-212
CCDS35373.1 DOCK11 gene_id:139818|Hs108|chrX (2073) 612 138.9 6.2e-32
CCDS45063.1 DOCK9 gene_id:23348|Hs108|chr13 (1253) 548 125.3 4.6e-28
CCDS76645.1 DOCK9 gene_id:23348|Hs108|chr13 (1254) 548 125.3 4.6e-28
CCDS45062.1 DOCK9 gene_id:23348|Hs108|chr13 (2068) 548 125.4 7.1e-28
>>CCDS46528.1 DOCK10 gene_id:55619|Hs108|chr2 (2186 aa)
initn: 3712 init1: 3712 opt: 3712 Z-score: 4217.3 bits: 792.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3712; 99.8% identity (99.8% similar) in 564 aa overlap (1-564:1-564)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAGERTRRFTRSLLRPGQAAELRHSAASAAAVAVSSRQQQRQEKPRLLEPLDYETVIEEL
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CCDS46 MAGERTRRFTRSLLRPGQAAELRHSAASAAAVAVSSRQQQRQEKPRLLEPLDYETVIEEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EKTYRNDPLQDLLFFPSDDFSAATVSWDIRTLYSTVPEDAEHKAENLLVKEACKFYSSQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EKTYRNDPLQDLLFFPSDDFSAATVSWDIRTLYSTVPEDAEHKAENLLVKEACKFYSSQW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD HVVNYKYEQYSGDIRQLPRAEYKPEKLPSHSFEIDHEDADKDEDTTSHSSSKGGGGAGGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HVVNYKYEQYSGDIRQLPRAEYKPEKLPSHSFEIDHEDADKDEDTTSHSSSKGGGGAGGT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GVFKSGWLYKGNFNSTVNNTVTVRSFKKRYFQLTQLPDNSYIMNFYKDEKISKEPKGCIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GVFKSGWLYKGNFNSTVNNTVTVRSFKKRYFQLTQLPDNSYIMNFYKDEKISKEPKGCIF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LDSCTGVVQNNRLRKYAFELKMNDLTYFVLAAETESDMDEWIHTLNRILQISPEGPLQGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LDSCTGVVQNNRLRKYAFELKMNDLTYFVLAAETESDMDEWIHTLNRILQISPEGPLQGR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD RSTELTDLGLDSLDNSVTCECTPEETDSSENNLHADFAKYLTETEDTVKTTRNMERLNLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RSTELTDLGLDSLDNSVTCECTPEETDSSENNLHADFAKYLTETEDTVKTTRNMERLNLF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SLDPDIDTLKLQKKDLLEPESVIKPFEEKAAKRIMIICKALNSNLQGCVTENENDPITNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SLDPDIDTLKLQKKDLLEPESVIKPFEEKAAKRIMIICKALNSNLQGCVTENENDPITNI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EPFFVSVALYDLRDSRKISADFHVDLNHAAVRQMLLGASVALENGNIDTITPRQSEEPHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EPFFVSVALYDLRDSRKISADFHVDLNHAAVRQMLLGASVALENGNIDTITPRQSEEPHI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KGLPEEWLKFPKQAVFSVSNPHSEIVLVAKIEKVLMGNIASGAEPYIKNPDSNKYAQKIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KGLPEEWLKFPKQAVFSVSNPHSEIVLVAKIEKVLMGNIASGAEPYIKNPDSNKYAQKIL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KSD KSNRQFCSKLGKYRMPFAWAVRYVDSCSQQTRNTFNGGIGSFSFERFCVAYYF
:::::::::::::::::::::: :
CCDS46 KSNRQFCSKLGKYRMPFAWAVRSVFKDNQGNVDRDSRFSPLFRQESSKISTEDLVKLVSD
550 560 570 580 590 600
>>CCDS74661.1 DOCK10 gene_id:55619|Hs108|chr2 (2180 aa)
initn: 3460 init1: 3460 opt: 3460 Z-score: 3930.3 bits: 739.1 E(32554): 1.3e-212
Smith-Waterman score: 3460; 99.8% identity (99.8% similar) in 523 aa overlap (42-564:36-558)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD SLLRPGQAAELRHSAASAAAVAVSSRQQQRQEKPRLLEPLDYETVIEELEKTYRNDPLQD
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KVFKREPSEFWKKRRTVRRVNQEEIHRFSSQEKPRLLEPLDYETVIEELEKTYRNDPLQD
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KSD LLFFPSDDFSAATVSWDIRTLYSTVPEDAEHKAENLLVKEACKFYSSQWHVVNYKYEQYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LLFFPSDDFSAATVSWDIRTLYSTVPEDAEHKAENLLVKEACKFYSSQWHVVNYKYEQYS
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KSD GDIRQLPRAEYKPEKLPSHSFEIDHEDADKDEDTTSHSSSKGGGGAGGTGVFKSGWLYKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GDIRQLPRAEYKPEKLPSHSFEIDHEDADKDEDTTSHSSSKGGGGAGGTGVFKSGWLYKG
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KSD NFNSTVNNTVTVRSFKKRYFQLTQLPDNSYIMNFYKDEKISKEPKGCIFLDSCTGVVQNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NFNSTVNNTVTVRSFKKRYFQLTQLPDNSYIMNFYKDEKISKEPKGCIFLDSCTGVVQNN
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KSD RLRKYAFELKMNDLTYFVLAAETESDMDEWIHTLNRILQISPEGPLQGRRSTELTDLGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RLRKYAFELKMNDLTYFVLAAETESDMDEWIHTLNRILQISPEGPLQGRRSTELTDLGLD
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
pF1KSD SLDNSVTCECTPEETDSSENNLHADFAKYLTETEDTVKTTRNMERLNLFSLDPDIDTLKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SLDNSVTCECTPEETDSSENNLHADFAKYLTETEDTVKTTRNMERLNLFSLDPDIDTLKL
310 320 330 340 350 360
380 390 400 410 420 430
pF1KSD QKKDLLEPESVIKPFEEKAAKRIMIICKALNSNLQGCVTENENDPITNIEPFFVSVALYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QKKDLLEPESVIKPFEEKAAKRIMIICKALNSNLQGCVTENENDPITNIEPFFVSVALYD
370 380 390 400 410 420
440 450 460 470 480 490
pF1KSD LRDSRKISADFHVDLNHAAVRQMLLGASVALENGNIDTITPRQSEEPHIKGLPEEWLKFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LRDSRKISADFHVDLNHAAVRQMLLGASVALENGNIDTITPRQSEEPHIKGLPEEWLKFP
430 440 450 460 470 480
500 510 520 530 540 550
pF1KSD KQAVFSVSNPHSEIVLVAKIEKVLMGNIASGAEPYIKNPDSNKYAQKILKSNRQFCSKLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KQAVFSVSNPHSEIVLVAKIEKVLMGNIASGAEPYIKNPDSNKYAQKILKSNRQFCSKLG
490 500 510 520 530 540
560 570 580 590
pF1KSD KYRMPFAWAVRYVDSCSQQTRNTFNGGIGSFSFERFCVAYYF
::::::::::: :
CCDS74 KYRMPFAWAVRSVFKDNQGNVDRDSRFSPLFRQESSKISTEDLVKLVSDYRRADRISKMQ
550 560 570 580 590 600
>>CCDS35373.1 DOCK11 gene_id:139818|Hs108|chrX (2073 aa)
initn: 1601 init1: 438 opt: 612 Z-score: 686.8 bits: 138.9 E(32554): 6.2e-32
Smith-Waterman score: 1695; 48.9% identity (74.1% similar) in 560 aa overlap (7-564:5-534)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAGERTRRFTRSLLRPGQAAELRHSAASAAAVAVSSRQQQRQEKPRLLEPLDYETVIEEL
:.::. : .:: :::::.:.. :. : . :: ...::::::.:: .
CCDS35 MAEVRKFTKRLSKPGTAAELRQSVSEAV------RGSVVLEKAKVVEPLDYENVIAQR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EKTYRNDPLQDLLFFPSDDFSAATVSWDIRTLYSTVPEDAEHKAENLLVKEACKFYSSQW
. .:::.:::.:: .:.: .... . ::. ::::::::..:..:.::: : ::..:
CCDS35 KTQIYSDPLRDLLMFPMEDISISVIGRQRRTVQSTVPEDAEKRAQSLFVKECIKTYSTDW
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD HVVNYKYEQYSGDIRQLPRAEYKPEKLPSHSFEIDHEDADKDEDTTSHSSSKGGGGAGGT
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CCDS35 HVVNYKYEDFSGDFRMLPCKSLRPEKIPNHVFEID-EDCEKDEDSSSLCSQKG-------
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GVFKSGWLYKGNFNSTVNNTVTVRSFKKRYFQLTQLPDNSYIMNFYKDEKISKEPKGCIF
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CCDS35 GVIKQGWLHKANVNSTI--TVTMKVFKRRYFYLTQLPDGSYILNSYKDEKNSKESKGCIY
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LDSCTGVVQNNRLRKYAFELKMNDLTYFVLAAETESDMDEWIHTLNRILQISPEGPLQGR
::.: ::: ..:..:::::: : ::::::..:.::. ::..:.::. .. .: .
CCDS35 LDACIDVVQCPKMRRHAFELKMLDKYSHYLAAETEQEMEEWLITLKKIIQINTDSLVQEK
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KSD RSTELTDLGLDSLDNSVTCECTPEETDSS-ENNLHADFAKYLTETEDTVKTTRNMERLNL
. : : . :. .. . :. .: : ..: .. :: :::. : .:. : ::
CCDS35 KETVET-----AQDDETSSQGKAENIMASLERSMHPELMKYGRETEQLNKLSRGDGRQNL
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD FSLDPDIDTLKLQKKDLLEPESVIKPFEEKAAKRIMIICKALNSNLQGCVTENENDPITN
::.: ... : .. .::. ::::::: ::... :. :. :. : . .: . : ::
CCDS35 FSFDSEVQRLDFSG---IEPD--IKPFEEKCNKRFLVNCHDLTFNILGQIGDNAKGPPTN
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD IEPFFVSVALYDLRDSRKISADFHVDLNHAAVRQMLLGASVALENGNIDTITPR-QSEEP
.::::...::.:.... ::::::::::: .::.:: :.:. : . . .:. .: :
CCDS35 VEPFFINLALFDVKNNCKISADFHVDLNPPSVREMLWGSSTQLASDG----SPKGSSPES
400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KSD HIKGLPEEWLKFPKQAVFSVSNPHSEIVLVAKIEKVLMGNIASGAEPYIKNPDSNKYAQK
.:.:. : :.. .:..:::.::: :: :::.:::::.:::. ::::::: : : :::
CCDS35 YIHGIAESQLRYIQQGIFSVTNPHPEIFLVARIEKVLQGNITHCAEPYIKNSDPVKTAQK
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KSD ILKSNRQFCSKLGKYRMPFAWAVRYVDSCSQQTRNTFNGGIGSFSFERFCVAYYF
. .. .: ::.::.::::::::.: .
CCDS35 VHRTAKQVCSRLGQYRMPFAWAARPIFKDTQGSLDLDGRFSPLYKQDSSKLSSEDILKLL
510 520 530 540 550 560
>>CCDS45063.1 DOCK9 gene_id:23348|Hs108|chr13 (1253 aa)
initn: 1525 init1: 449 opt: 548 Z-score: 617.4 bits: 125.3 E(32554): 4.6e-28
Smith-Waterman score: 1622; 47.2% identity (71.6% similar) in 578 aa overlap (1-573:1-542)
10 20 30 40 50
pF1KSD MAGERTRRFTRSLLRPGQA-AELRHSAASAAAVAVSSRQQQRQEKPRLLEPLDYETVIEE
: ... : .::. . . :... :. . : . : ::.:.::::::.:: .
CCDS45 MQADKCRTSSRSVKKELVIESPLQYKDAAQGEVEAES-PGPVPAKPKLIEPLDYENVIVQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD LEKTYRNDPLQDLLFFPSDDFSAATVSWDIRTLYSTVPEDAEHKAENLLVKEACKFYSSQ
. :: :...:.:: :::..: . . : . :::: ::..:..:.: : : :.:.
CCDS45 KKTQILNDCLREMLLFPYDDFQTAILRRQGRYICSTVPAKAEEEAQSLFVTECIKTYNSD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD WHVVNYKYEQYSGDIRQLPRAEYKPEKLPSHSFEIDHEDADKDEDTTSHSSSKGGGGAGG
::.::::::.:::..:::: : .::: : .:.: :..:::::..: .:.:::
CCDS45 WHLVNYKYEDYSGEFRQLPNKVVKLDKLPVHVYEVD-EEVDKDEDAASLGSQKGG-----
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD TGVFKSGWLYKGNFNSTVNNTVTVRSFKKRYFQLTQLPDNSYIMNFYKDEKISKEPKGCI
. : :::::::.::.. .::.::::.:.:.: :: :.:: .:::::::::::::: :
CCDS45 --ITKHGWLYKGNMNSAI--SVTMRSFKRRFFHLIQLGDGSYNLNFYKDEKISKEPKGSI
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD FLDSCTGVVQNNRLRKYAFELKMNDLTYFVLAAETESDMDEWIHTLNRILQISPEGPLQG
::::: ::::::..:..::::::.: . ..:::..: .:.::: ::.:::.. :. .:
CCDS45 FLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKILQLNFEAAMQE
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD RRSTELTDLGLDSLDNSVTCECTPEETDSSENNLHADFAKYLTETEDTVKTTRNMERLNL
.:. :: ... . : . :. .. ..:: :.: .:. :..:
CCDS45 KRNG-------DSHEDDEQSKL--EGSGSGLDSYLPELAKSAREAEIKLKSES---RVKL
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD FSLDPDIDTLKLQKKDLLEPESVIKPFEEKAAKRIMIICKALNSNLQGCVTENENDPITN
: :::: :: :. : .: :::: .:::.. :. :. ::: ::.:::. : ::
CCDS45 FYLDPDA-----QKLDFSSAEPEVKSFEEKFGKRILVKCNDLSFNLQCCVAENEEGPTTN
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD IEPFFVSVALYDLRDSRKISADFHVDLNHAAVRQMLLGASVALENGNIDTITPRQSEEPH
.:::::...:.:.. .::::::::::::: .::::: .: :: ::. .. :
CCDS45 VEPFFVTLSLFDIKYNRKISADFHVDLNHFSVRQMLATTSPALMNGS--------GQSPS
400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KSD I-KG-LPEEWLKFPKQAVFSVSNPHSEIVLVAKIEKVLMGNIASGAEPYIKNPDSNKYAQ
. :: : : ...:::..:::. :: .: :::.:::::.:.:. ::::.:. ::.: ::
CCDS45 VLKGILHEAAMQYPKQGIFSVTCPHPDIFLVARIEKVLQGSITHCAEPYMKSSDSSKVAQ
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KSD KILKSNRQFCSKLGKYRMPFAWAVR--YVDSCSQQTRNTFNGGIGSFSFERFCVAYYF
:.::. .: :..::.::::::::.: . :. .. .:
CCDS45 KVLKNAKQACQRLGQYRMPFAWAARTLFKDASGNLDKNARFSAIYRQDSNKLSNDDMLKL
510 520 530 540 550 560
CCDS45 LADFRKPEKMAKLPVILGNLDITIDNVSSDFPNYVNSSYIPTKQFETCSKTPITFEVEEF
570 580 590 600 610 620
>>CCDS76645.1 DOCK9 gene_id:23348|Hs108|chr13 (1254 aa)
initn: 1604 init1: 449 opt: 548 Z-score: 617.4 bits: 125.3 E(32554): 4.6e-28
Smith-Waterman score: 1688; 48.8% identity (72.9% similar) in 576 aa overlap (2-573:9-543)
10 20 30 40 50
pF1KSD MAGERTRRFTRSLLRPGQAAELRHSAASAAAVAVSSRQQQRQEKPRLLEPLDY
:. .::.:::.: .:: :::::.:.. .. : . ::.:.:::::
CCDS76 MSQPPLLPASAETRKFTRALSKPGTAAELRQSVSEVV------RGSVLLAKPKLIEPLDY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD ETVIEELEKTYRNDPLQDLLFFPSDDFSAATVSWDIRTLYSTVPEDAEHKAENLLVKEAC
:.:: . . :: :...:.:: :::..: . . : . :::: ::..:..:.: :
CCDS76 ENVIVQKKTQILNDCLREMLLFPYDDFQTAILRRQGRYICSTVPAKAEEEAQSLFVTECI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD KFYSSQWHVVNYKYEQYSGDIRQLPRAEYKPEKLPSHSFEIDHEDADKDEDTTSHSSSKG
: :.:.::.::::::.:::..:::: : .::: : .:.: :..:::::..: .:.::
CCDS76 KTYNSDWHLVNYKYEDYSGEFRQLPNKVVKLDKLPVHVYEVD-EEVDKDEDAASLGSQKG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD GGGAGGTGVFKSGWLYKGNFNSTVNNTVTVRSFKKRYFQLTQLPDNSYIMNFYKDEKISK
: . : :::::::.::.. .::.::::.:.:.: :: :.:: .::::::::::
CCDS76 G-------ITKHGWLYKGNMNSAI--SVTMRSFKRRFFHLIQLGDGSYNLNFYKDEKISK
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD EPKGCIFLDSCTGVVQNNRLRKYAFELKMNDLTYFVLAAETESDMDEWIHTLNRILQISP
:::: :::::: ::::::..:..::::::.: . ..:::..: .:.::: ::.:::..
CCDS76 EPKGSIFLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKILQLNF
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD EGPLQGRRSTELTDLGLDSLDNSVTCECTPEETDSSENNLHADFAKYLTETEDTVKTTRN
:. .: .:. :: ... . : . :. .. ..:: :.: .:.
CCDS76 EAAMQEKRNG-------DSHEDDEQSKL--EGSGSGLDSYLPELAKSAREAEIKLKSES-
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD MERLNLFSLDPDIDTLKLQKKDLLEPESVIKPFEEKAAKRIMIICKALNSNLQGCVTENE
:..:: :::: :: :. : .: :::: .:::.. :. :. ::: ::.:::
CCDS76 --RVKLFYLDPDA-----QKLDFSSAEPEVKSFEEKFGKRILVKCNDLSFNLQCCVAENE
340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KSD NDPITNIEPFFVSVALYDLRDSRKISADFHVDLNHAAVRQMLLGASVALENGNIDTITPR
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CCDS76 EGPTTNVEPFFVTLSLFDIKYNRKISADFHVDLNHFSVRQMLATTSPALMNGS-------
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