Result of FASTA (omim) for
pFN21ASDA0420
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0420, 696 aa
1>>>pF1KSDA0420 696 - 696 aa - 696 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6002+/-0.000358; mu= 18.7278+/- 0.022
mean_var=72.7758+/-14.596, 0's: 0 Z-trim(114.3): 39 B-trim: 190 in 1/49
Lambda= 0.150342
statistics sampled from 24097 (24136) to 24097 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.283), width: 16
Scan time: 10.540
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001137473 (OMIM: 601504) SEC14-like protein 1 i ( 681) 2392 528.3 3.6e-149
NP_002994 (OMIM: 601504) SEC14-like protein 1 isof ( 715) 2392 528.4 3.8e-149
NP_001137470 (OMIM: 601504) SEC14-like protein 1 i ( 715) 2392 528.4 3.8e-149
NP_001137471 (OMIM: 601504) SEC14-like protein 1 i ( 715) 2392 528.4 3.8e-149
NP_001191339 (OMIM: 601504) SEC14-like protein 1 i ( 715) 2392 528.4 3.8e-149
NP_001034662 (OMIM: 601504) SEC14-like protein 1 i ( 719) 2392 528.4 3.8e-149
NP_001191337 (OMIM: 601504) SEC14-like protein 1 i ( 719) 2392 528.4 3.8e-149
NP_203740 (OMIM: 607558) SEC14-like protein 2 isof ( 392) 685 158.0 6.5e-38
NP_036561 (OMIM: 607558) SEC14-like protein 2 isof ( 403) 684 157.8 7.7e-38
NP_001154840 (OMIM: 612825) SEC14-like protein 4 i ( 360) 670 154.7 5.8e-37
NP_777637 (OMIM: 612825) SEC14-like protein 4 isof ( 406) 670 154.7 6.4e-37
XP_016884276 (OMIM: 612825) PREDICTED: SEC14-like ( 465) 648 150.0 2e-35
NP_777635 (OMIM: 612824) SEC14-like protein 3 isof ( 400) 642 148.6 4.2e-35
XP_011528430 (OMIM: 612824) PREDICTED: SEC14-like ( 412) 642 148.7 4.3e-35
NP_001278861 (OMIM: 607558) SEC14-like protein 2 i ( 349) 591 137.6 8.1e-32
XP_016884280 (OMIM: 612825) PREDICTED: SEC14-like ( 352) 577 134.5 6.7e-31
XP_016884278 (OMIM: 612825) PREDICTED: SEC14-like ( 352) 577 134.5 6.7e-31
XP_006724298 (OMIM: 612825) PREDICTED: SEC14-like ( 352) 577 134.5 6.7e-31
XP_011528466 (OMIM: 612825) PREDICTED: SEC14-like ( 391) 558 130.4 1.3e-29
NP_001244308 (OMIM: 612824) SEC14-like protein 3 i ( 341) 534 125.2 4.2e-28
NP_001244311 (OMIM: 612824) SEC14-like protein 3 i ( 341) 534 125.2 4.2e-28
NP_001244307 (OMIM: 612824) SEC14-like protein 3 i ( 323) 475 112.4 2.8e-24
XP_016884277 (OMIM: 612825) PREDICTED: SEC14-like ( 437) 435 103.8 1.5e-21
NP_001191133 (OMIM: 607558) SEC14-like protein 2 i ( 320) 416 99.6 2e-20
XP_016884279 (OMIM: 612825) PREDICTED: SEC14-like ( 247) 369 89.3 1.9e-17
NP_001135877 (OMIM: 616545) PRELI domain containin ( 172) 210 54.8 3.4e-07
NP_006544 (OMIM: 616545) PRELI domain containing p ( 172) 210 54.8 3.4e-07
XP_016865755 (OMIM: 616945) PREDICTED: clavesin-2 ( 327) 185 49.5 2.5e-05
NP_001010852 (OMIM: 616945) clavesin-2 [Homo sapie ( 327) 185 49.5 2.5e-05
NP_001135878 (OMIM: 616545) PRELI domain containin ( 151) 180 48.2 2.7e-05
XP_016868631 (OMIM: 611292) PREDICTED: clavesin-1 ( 354) 170 46.2 0.00025
XP_016868630 (OMIM: 611292) PREDICTED: clavesin-1 ( 354) 170 46.2 0.00025
NP_775790 (OMIM: 611292) clavesin-1 [Homo sapiens] ( 354) 170 46.2 0.00025
>>NP_001137473 (OMIM: 601504) SEC14-like protein 1 isofo (681 aa)
initn: 3082 init1: 1803 opt: 2392 Z-score: 2799.0 bits: 528.3 E(85289): 3.6e-149
Smith-Waterman score: 3117; 66.0% identity (85.7% similar) in 685 aa overlap (35-696:1-681)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD YQSPVRVYKYPFELVMAAYEKRFPTCPQIPVFLGSEVLRESRSPDGAVHVVERSCRLRVD
.:.::... : .: :::.::.:: :.: ::
NP_001 MFVGSDTVNEFKSEDGAIHVIERRCKLDVD
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD APRLLRKIAGVEHVVFVQTNILNWKERTLLIEAHNETFANRVVVNEHCSYTVHPENEDWT
:::::.:::::..: ::: : :: .:::: :::.::::.:::..:::: :::::::::::
NP_001 APRLLKKIAGVDYVYFVQKNSLNSRERTLHIEAYNETFSNRVIINEHCCYTVHPENEDWT
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD CFEQSASLDIRSFFGFENALEKIAMKQYTANVKRGKEVIEHYLNELISQGTSHIPRWTPA
::::::::::.::::::...:::::::::.:.:.:::.::.:: .: .: . .:::.:
NP_001 CFEQSASLDIKSFFGFESTVEKIAMKQYTSNIKKGKEIIEYYLRQLEEEGITFVPRWSPP
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KSD PVREE-DARNQAGPRDPSSLEAHGPRSTL-----GPALEA-------VSMDGDKLDADYI
. .. .... .. .:. . :...: : :: . :. ::::::::
NP_001 SITPSSETSSSSSKKQAASMAVVIPEAALKEGLSGDALSSPSAPEPVVGTPDDKLDADYI
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD ERCLGHLTPMQESCLIQLRHWLQETHKGKIPKDEHILRFLRAHDFHLDKAREMLRQSLSW
.: :: :::.::::::.::.::::::::::::::::::::::.::..:::::.. :::.:
NP_001 KRYLGDLTPLQESCLIRLRQWLQETHKGKIPKDEHILRFLRARDFNIDKAREIMCQSLTW
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD RKQHQVDLLLQTWQPPALLEEFYAGGWHYQDIDGRPLYILRLGQMDTKGLMKAVGEEALL
::::::: .:.:: :: .:...::::::..: ::::::.:::::::::::..:.::::::
NP_001 RKQHQVDYILETWTPPQVLQDYYAGGWHHHDKDGRPLYVLRLGQMDTKGLVRALGEEALL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD RHVLSVNEEGQKRCEGSTRQLGRPISSWTCLLDLEGLNMRHLWRPGVKALLRMIEVVEDN
:.:::.:::: .::: .:. .::::::::::.::::::::::::::::::::.::::: :
NP_001 RYVLSINEEGLRRCEENTKVFGRPISSWTCLVDLEGLNMRHLWRPGVKALLRIIEVVEAN
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD YPETLGRLLIVRAPRVFPVLWTLISPFINENTRRKFLIYSGSNYQGPGGLVDYLDREVIP
::::::::::.::::::::::::.::::..:::::::::.:..:::::::.::.:.:.::
NP_001 YPETLGRLLILRAPRVFPVLWTLVSPFIDDNTRRKFLIYAGNDYQGPGGLLDYIDKEIIP
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KSD DFLGGESVCNVPEGGLVPKSLYMTEEEQEHTDQLWQWSET-YHSASVLRGAPHEVAVEIL
:::.:: .:.:::::::::::: : :: :. : : :.:: :.::::..:::::. ..:.
NP_001 DFLSGECMCEVPEGGLVPKSLYRTAEELENED-LKLWTETIYQSASVFKGAPHEILIQIV
460 470 480 490 500
540 550 560 570 580
pF1KSD EGESVITWDFDILRGDVVFSLYHTKQAPR------LGARE---PGTRASGQLIDKGWVLG
.. ::::::::. .::.::..::.:..:. :::. :: . ::::: : ::
NP_001 DASSVITWDFDVCKGDIVFNIYHSKRSPQPPKKDSLGAHSITSPGGN-NVQLIDKVWQLG
510 520 530 540 550 560
590 600 610 620 630 640
pF1KSD RDYSRVEAPLVCREGESIQGSHVTRWPGVYLLQWQMHSPPSSVACSLPGVDDVLTALHSP
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NP_001 RDYSMVESPLICKEGESVQGSHVTRWPGFYILQWKFHSMPACAASSLPRVDDVLASLQVS
570 580 590 600 610 620
650 660 670 680 690
pF1KSD GPKCKLLYYCEVLASEDFRGSMSSLESCTSGFSQLSAATSSSSSGQSHSSSLVSR
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NP_001 SHKCKVMYYTEVIGSEDFRGSMTSLESSHSGFSQLSAATTSSS--QSHSSSMISR
630 640 650 660 670 680
>>NP_002994 (OMIM: 601504) SEC14-like protein 1 isoform (715 aa)
initn: 3306 init1: 1803 opt: 2392 Z-score: 2798.7 bits: 528.4 E(85289): 3.8e-149
Smith-Waterman score: 3341; 67.0% identity (86.1% similar) in 719 aa overlap (1-696:1-715)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVQRYQSPVRVYKYPFELVMAAYEKRFPTCPQIPVFLGSEVLRESRSPDGAVHVVERSCR
:::.::::::::::::::.:::::.:::::: ::.:.::... : .: :::.::.:: :.
NP_002 MVQKYQSPVRVYKYPFELIMAAYERRFPTCPLIPMFVGSDTVNEFKSEDGAIHVIERRCK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LRVDAPRLLRKIAGVEHVVFVQTNILNWKERTLLIEAHNETFANRVVVNEHCSYTVHPEN
: :::::::.:::::..: ::: : :: .:::: :::.::::.:::..:::: :::::::
NP_002 LDVDAPRLLKKIAGVDYVYFVQKNSLNSRERTLHIEAYNETFSNRVIINEHCCYTVHPEN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD EDWTCFEQSASLDIRSFFGFENALEKIAMKQYTANVKRGKEVIEHYLNELISQGTSHIPR
::::::::::::::.::::::...:::::::::.:.:.:::.::.:: .: .: . .::
NP_002 EDWTCFEQSASLDIKSFFGFESTVEKIAMKQYTSNIKKGKEIIEYYLRQLEEEGITFVPR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220
pF1KSD WTPAPVREE-DARNQAGPRDPSSLEAHGPRSTL-----GPALEA-------VSMDGDKLD
:.: . .. .... .. .:. . :...: : :: . :. ::::
NP_002 WSPPSITPSSETSSSSSKKQAASMAVVIPEAALKEGLSGDALSSPSAPEPVVGTPDDKLD
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KSD ADYIERCLGHLTPMQESCLIQLRHWLQETHKGKIPKDEHILRFLRAHDFHLDKAREMLRQ
::::.: :: :::.::::::.::.::::::::::::::::::::::.::..:::::.. :
NP_002 ADYIKRYLGDLTPLQESCLIRLRQWLQETHKGKIPKDEHILRFLRARDFNIDKAREIMCQ
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KSD SLSWRKQHQVDLLLQTWQPPALLEEFYAGGWHYQDIDGRPLYILRLGQMDTKGLMKAVGE
::.:::::::: .:.:: :: .:...::::::..: ::::::.:::::::::::..:.::
NP_002 SLTWRKQHQVDYILETWTPPQVLQDYYAGGWHHHDKDGRPLYVLRLGQMDTKGLVRALGE
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KSD EALLRHVLSVNEEGQKRCEGSTRQLGRPISSWTCLLDLEGLNMRHLWRPGVKALLRMIEV
:::::.:::.:::: .::: .:. .::::::::::.::::::::::::::::::::.:::
NP_002 EALLRYVLSINEEGLRRCEENTKVFGRPISSWTCLVDLEGLNMRHLWRPGVKALLRIIEV
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KSD VEDNYPETLGRLLIVRAPRVFPVLWTLISPFINENTRRKFLIYSGSNYQGPGGLVDYLDR
:: :::::::::::.::::::::::::.::::..:::::::::.:..:::::::.::.:.
NP_002 VEANYPETLGRLLILRAPRVFPVLWTLVSPFIDDNTRRKFLIYAGNDYQGPGGLLDYIDK
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KSD EVIPDFLGGESVCNVPEGGLVPKSLYMTEEEQEHTDQLWQWSET-YHSASVLRGAPHEVA
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NP_002 EIIPDFLSGECMCEVPEGGLVPKSLYRTAEELENED-LKLWTETIYQSASVFKGAPHEIL
490 500 510 520 530
530 540 550 560 570
pF1KSD VEILEGESVITWDFDILRGDVVFSLYHTKQAPR------LGARE---PGTRASGQLIDKG
..:... ::::::::. .::.::..::.:..:. :::. :: :::::
NP_002 IQIVDASSVITWDFDVCKGDIVFNIYHSKRSPQPPKKDSLGAHSITSPGGNNV-QLIDKV
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KSD WVLGRDYSRVEAPLVCREGESIQGSHVTRWPGVYLLQWQMHSPPSSVACSLPGVDDVLTA
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NP_002 WQLGRDYSMVESPLICKEGESVQGSHVTRWPGFYILQWKFHSMPACAASSLPRVDDVLAS
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KSD LHSPGPKCKLLYYCEVLASEDFRGSMSSLESCTSGFSQLSAATSSSSSGQSHSSSLVSR
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NP_002 LQVSSHKCKVMYYTEVIGSEDFRGSMTSLESSHSGFSQLSAATTSSS--QSHSSSMISR
660 670 680 690 700 710
>>NP_001137470 (OMIM: 601504) SEC14-like protein 1 isofo (715 aa)
initn: 3306 init1: 1803 opt: 2392 Z-score: 2798.7 bits: 528.4 E(85289): 3.8e-149
Smith-Waterman score: 3341; 67.0% identity (86.1% similar) in 719 aa overlap (1-696:1-715)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVQRYQSPVRVYKYPFELVMAAYEKRFPTCPQIPVFLGSEVLRESRSPDGAVHVVERSCR
:::.::::::::::::::.:::::.:::::: ::.:.::... : .: :::.::.:: :.
NP_001 MVQKYQSPVRVYKYPFELIMAAYERRFPTCPLIPMFVGSDTVNEFKSEDGAIHVIERRCK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LRVDAPRLLRKIAGVEHVVFVQTNILNWKERTLLIEAHNETFANRVVVNEHCSYTVHPEN
: :::::::.:::::..: ::: : :: .:::: :::.::::.:::..:::: :::::::
NP_001 LDVDAPRLLKKIAGVDYVYFVQKNSLNSRERTLHIEAYNETFSNRVIINEHCCYTVHPEN
70 80 90 100 110 120
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pF1KSD EDWTCFEQSASLDIRSFFGFENALEKIAMKQYTANVKRGKEVIEHYLNELISQGTSHIPR
::::::::::::::.::::::...:::::::::.:.:.:::.::.:: .: .: . .::
NP_001 EDWTCFEQSASLDIKSFFGFESTVEKIAMKQYTSNIKKGKEIIEYYLRQLEEEGITFVPR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220
pF1KSD WTPAPVREE-DARNQAGPRDPSSLEAHGPRSTL-----GPALEA-------VSMDGDKLD
:.: . .. .... .. .:. . :...: : :: . :. ::::
NP_001 WSPPSITPSSETSSSSSKKQAASMAVVIPEAALKEGLSGDALSSPSAPEPVVGTPDDKLD
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KSD ADYIERCLGHLTPMQESCLIQLRHWLQETHKGKIPKDEHILRFLRAHDFHLDKAREMLRQ
::::.: :: :::.::::::.::.::::::::::::::::::::::.::..:::::.. :
NP_001 ADYIKRYLGDLTPLQESCLIRLRQWLQETHKGKIPKDEHILRFLRARDFNIDKAREIMCQ
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KSD SLSWRKQHQVDLLLQTWQPPALLEEFYAGGWHYQDIDGRPLYILRLGQMDTKGLMKAVGE
::.:::::::: .:.:: :: .:...::::::..: ::::::.:::::::::::..:.::
NP_001 SLTWRKQHQVDYILETWTPPQVLQDYYAGGWHHHDKDGRPLYVLRLGQMDTKGLVRALGE
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KSD EALLRHVLSVNEEGQKRCEGSTRQLGRPISSWTCLLDLEGLNMRHLWRPGVKALLRMIEV
:::::.:::.:::: .::: .:. .::::::::::.::::::::::::::::::::.:::
NP_001 EALLRYVLSINEEGLRRCEENTKVFGRPISSWTCLVDLEGLNMRHLWRPGVKALLRIIEV
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KSD VEDNYPETLGRLLIVRAPRVFPVLWTLISPFINENTRRKFLIYSGSNYQGPGGLVDYLDR
:: :::::::::::.::::::::::::.::::..:::::::::.:..:::::::.::.:.
NP_001 VEANYPETLGRLLILRAPRVFPVLWTLVSPFIDDNTRRKFLIYAGNDYQGPGGLLDYIDK
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KSD EVIPDFLGGESVCNVPEGGLVPKSLYMTEEEQEHTDQLWQWSET-YHSASVLRGAPHEVA
:.:::::.:: .:.:::::::::::: : :: :. : : :.:: :.::::..:::::.
NP_001 EIIPDFLSGECMCEVPEGGLVPKSLYRTAEELENED-LKLWTETIYQSASVFKGAPHEIL
490 500 510 520 530
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pF1KSD VEILEGESVITWDFDILRGDVVFSLYHTKQAPR------LGARE---PGTRASGQLIDKG
..:... ::::::::. .::.::..::.:..:. :::. :: :::::
NP_001 IQIVDASSVITWDFDVCKGDIVFNIYHSKRSPQPPKKDSLGAHSITSPGGNNV-QLIDKV
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KSD WVLGRDYSRVEAPLVCREGESIQGSHVTRWPGVYLLQWQMHSPPSSVACSLPGVDDVLTA
: :::::: ::.::.:.::::.:::::::::: :.:::..:: :. .: ::: :::::..
NP_001 WQLGRDYSMVESPLICKEGESVQGSHVTRWPGFYILQWKFHSMPACAASSLPRVDDVLAS
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KSD LHSPGPKCKLLYYCEVLASEDFRGSMSSLESCTSGFSQLSAATSSSSSGQSHSSSLVSR
:. . :::..:: ::..::::::::.:::: ::::::::::.::: ::::::..::
NP_001 LQVSSHKCKVMYYTEVIGSEDFRGSMTSLESSHSGFSQLSAATTSSS--QSHSSSMISR
660 670 680 690 700 710
>>NP_001137471 (OMIM: 601504) SEC14-like protein 1 isofo (715 aa)
initn: 3306 init1: 1803 opt: 2392 Z-score: 2798.7 bits: 528.4 E(85289): 3.8e-149
Smith-Waterman score: 3341; 67.0% identity (86.1% similar) in 719 aa overlap (1-696:1-715)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVQRYQSPVRVYKYPFELVMAAYEKRFPTCPQIPVFLGSEVLRESRSPDGAVHVVERSCR
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:.: . .. .... .. .:. . :...: : :: . :. ::::
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230 240 250 260 270 280
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290 300 310 320 330 340
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:::::.:::.:::: .::: .:. .::::::::::.::::::::::::::::::::.:::
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NP_001 RFC
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Smith-Waterman score: 3341; 67.0% identity (86.1% similar) in 719 aa overlap (1-696:1-715)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVQRYQSPVRVYKYPFELVMAAYEKRFPTCPQIPVFLGSEVLRESRSPDGAVHVVERSCR
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NP_001 MVQKYQSPVRVYKYPFELIMAAYERRFPTCPLIPMFVGSDTVNEFKSEDGAIHVIERRCK
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pF1KSD LRVDAPRLLRKIAGVEHVVFVQTNILNWKERTLLIEAHNETFANRVVVNEHCSYTVHPEN
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NP_001 LDVDAPRLLKKIAGVDYVYFVQKNSLNSRERTLHIEAYNETFSNRVIINEHCCYTVHPEN
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pF1KSD EDWTCFEQSASLDIRSFFGFENALEKIAMKQYTANVKRGKEVIEHYLNELISQGTSHIPR
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NP_001 EDWTCFEQSASLDIKSFFGFESTVEKIAMKQYTSNIKKGKEIIEYYLRQLEEEGITFVPR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220
pF1KSD WTPAPVREE-DARNQAGPRDPSSLEAHGPRSTL-----GPALEA-------VSMDGDKLD
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NP_001 WSPPSITPSSETSSSSSKKQAASMAVVIPEAALKEGLSGDALSSPSAPEPVVGTPDDKLD
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230 240 250 260 270 280
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pF1KSD SLSWRKQHQVDLLLQTWQPPALLEEFYAGGWHYQDIDGRPLYILRLGQMDTKGLMKAVGE
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NP_001 SLTWRKQHQVDYILETWTPPQVLQDYYAGGWHHHDKDGRPLYVLRLGQMDTKGLVRALGE
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pF1KSD VEDNYPETLGRLLIVRAPRVFPVLWTLISPFINENTRRKFLIYSGSNYQGPGGLVDYLDR
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NP_001 VEANYPETLGRLLILRAPRVFPVLWTLVSPFIDDNTRRKFLIYAGNDYQGPGGLLDYIDK
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470 480 490 500 510 520
pF1KSD EVIPDFLGGESVCNVPEGGLVPKSLYMTEEEQEHTDQLWQWSET-YHSASVLRGAPHEVA
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NP_001 EIIPDFLSGECMCEVPEGGLVPKSLYRTAEELENED-LKLWTETIYQSASVFKGAPHEIL
490 500 510 520 530
530 540 550 560 570
pF1KSD VEILEGESVITWDFDILRGDVVFSLYHTKQAPR------LGARE---PGTRASGQLIDKG
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NP_001 IQIVDASSVITWDFDVCKGDIVFNIYHSKRSPQPPKKDSLGAHSITSPGGNNV-QLIDKV
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KSD WVLGRDYSRVEAPLVCREGESIQGSHVTRWPGVYLLQWQMHSPPSSVACSLPGVDDVLTA
: :::::: ::.::.:.::::.:::::::::: :.:::..:: :. .: ::: :::::..
NP_001 WQLGRDYSMVESPLICKEGESVQGSHVTRWPGFYILQWKFHSMPACAASSLPRVDDVLAS
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KSD LHSPGPKCKLLYYCEVLASEDFRGSMSSLESCTSGFSQLSAATSSSSSGQSHSSSLVSR
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NP_001 LQVSSHKCKVMYYTEVIGSEDFRGSMTSLESSHSGFSQLSAATTSSS--QSHSSSMISRW
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NP_001 RFC
>>NP_203740 (OMIM: 607558) SEC14-like protein 2 isoform (392 aa)
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Smith-Waterman score: 685; 33.3% identity (64.0% similar) in 378 aa overlap (235-594:5-362)
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pF1KSD AHGPRSTLGPALEAVSMDGDKLDADYIERCLGHLTPMQESCLIQLRHWLQETHKG-KIPK
.: :.: :. : ..:. .:.. . :
NP_203 MSGRVGDLSPRQKEALAKFRENVQDVLPALPNPD
10 20 30
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pF1KSD DEHILRFLRAHDFHLDKAREMLRQSLSWRKQHQVDLLLQTWQPPALLEEFYAGGWHYQDI
: .::.:::..: :.:.. :::. . .:::...: .. .:::: ..... .:: :.
NP_203 DYFLLRWLRARSFDLQKSEAMLRKHVEFRKQKDIDNII-SWQPPEVIQQYLSGGMCGYDL
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pF1KSD DGRPLYILRLGQMDTKGLMKAVGEEALLRHVLSVNEEGQKRCEGSTRQLGRPISSWTCLL
:: :.. .: .:.:::. ..... ::: . : ..: .: .::: . . : .
NP_203 DGCPVWYDIIGPLDAKGLLFSASKQDLLRTKMRECELLLQECAHQTTKLGRKVETITIIY
100 110 120 130 140 150
390 400 410 420 430 440
pF1KSD DLEGLNMRHLWRPGVKALLRMIEVVEDNYPETLGRLLIVRAPRVFPVLWTLISPFINENT
: :::...:::.:.:.: ... . :.:::::: ::..:.::..::: ..::.::..:.:
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]