Result of FASTA (omim) for
pFN21ASDA0326
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0326, 869 aa
1>>>pF1KSDA0326 869 - 869 aa - 869 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9360+/-0.000404; mu= 12.2055+/- 0.025
mean_var=287.2455+/-59.152, 0's: 0 Z-trim(121.2): 2040 B-trim: 190 in 2/58
Lambda= 0.075674
statistics sampled from 35225 (37541) to 35225 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.743), E-opt: 0.2 (0.44), width: 16
Scan time: 12.370
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_009084 (OMIM: 603977) zinc finger protein 208 i (1280) 2043 237.6 2.8e-61
XP_016882746 (OMIM: 603977) PREDICTED: zinc finger (1168) 2003 233.2 5.5e-60
NP_001305822 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 675) 1845 215.6 6.1e-55
XP_011513163 (OMIM: 602277) PREDICTED: zinc finger ( 675) 1845 215.6 6.1e-55
NP_001305821 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 1845 215.7 6.5e-55
NP_009080 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 i ( 751) 1845 215.7 6.5e-55
NP_001305820 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 1845 215.7 6.5e-55
NP_001159354 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 864) 1840 215.2 1e-54
NP_003406 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 i ( 947) 1840 215.3 1.1e-54
NP_001159353 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 947) 1840 215.3 1.1e-54
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1831 214.0 1.7e-54
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1831 214.1 1.7e-54
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1831 214.1 1.7e-54
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1831 214.1 1.7e-54
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1831 214.1 1.7e-54
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1831 214.1 1.8e-54
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1831 214.1 1.8e-54
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1831 214.1 1.8e-54
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1831 214.1 1.8e-54
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1831 214.1 1.8e-54
XP_016870103 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1796 210.5 3.3e-53
NP_149350 (OMIM: 616290) zinc finger protein 658 [ (1059) 1796 210.5 3.3e-53
XP_005272572 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1796 210.5 3.3e-53
NP_001304845 (OMIM: 616290) zinc finger protein 65 (1059) 1796 210.5 3.3e-53
XP_011543981 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1796 210.5 3.3e-53
XP_005272399 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 542) 1788 209.3 4e-53
NP_008889 (OMIM: 601262) zinc finger protein 16 [H ( 682) 1788 209.4 4.6e-53
NP_001025147 (OMIM: 601262) zinc finger protein 16 ( 682) 1788 209.4 4.6e-53
XP_011515600 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1788 209.4 4.6e-53
XP_005272398 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1788 209.4 4.6e-53
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1786 209.3 5.8e-53
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1786 209.3 5.8e-53
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1786 209.3 5.8e-53
NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1786 209.3 6e-53
NP_942596 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 1786 209.3 6e-53
XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 1786 209.3 6e-53
NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1786 209.3 6e-53
NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1786 209.3 6e-53
NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1786 209.3 6e-53
NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1786 209.3 6e-53
NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1786 209.3 6e-53
NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1786 209.3 6e-53
NP_001309064 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1786 209.3 6e-53
NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1786 209.3 6e-53
NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1786 209.3 6e-53
NP_150630 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 1786 209.3 6e-53
XP_016882934 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 837) 1786 209.3 6.1e-53
NP_001311081 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 1781 208.7 7.9e-53
NP_001311074 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 1781 208.7 7.9e-53
NP_001311068 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 1781 208.7 7.9e-53
>>NP_009084 (OMIM: 603977) zinc finger protein 208 isofo (1280 aa)
initn: 1663 init1: 1663 opt: 2043 Z-score: 1221.1 bits: 237.6 E(85289): 2.8e-61
Smith-Waterman score: 2071; 43.9% identity (62.7% similar) in 747 aa overlap (144-869:492-1196)
120 130 140 150 160 170
pF1KSD WQWGALTTWNSPPVVPANEPSLRELVQGRPAGAEKPYICNECGKSFSQWSKLLRHQRIHT
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pF1KSD GERPNTCSECGKSFTQSSHLVQHQRTHTGEKPYKCPDCGKCFSWSSNLVQHQRTHTGEKP
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NP_009 GEKPYKCEECGKSFSTFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKWSSTLSYHKKIHTVEKP
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pF1KSD YKCTECEKAFTQSTNLIKHQRSHTGEKPYKCGECRRAFYRSSDLIQHQATHTGEKPYKCP
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NP_009 YKCEECGKAFNQSAILIKHKRIHTGEKPYKCEECGKTFSKVSTLTTHKAIHAGEKPYKCK
590 600 610 620 630 640
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NP_009 ECGKTFIKVSTLTTHKAIHAGEKPYKCKECGKAFSKFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGK
650 660 670 680 690 700
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pF1KSD SFGHSSTLIKHQRTHLREDPFKCPVCGKTFTLSATLLRHQRTHTGERPYKCPECGKSFSV
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pF1KSD IQHRRTHTGEKPYKCPECGKSFSQSSNLITHVRTHMDENLFVCSDCGKAFLEAHELEQHR
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:: :. : . . . :.. :.:: : ::.:: :::.:. ..: .:..
NP_009 KIHT-GEKPYKCEECGK--GFSMFSILTKHEVIHTGEKPYKCEECGKAFSWLSVFSKHKK
890 900 910 920 930
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: ::. :: .: : . : :: . . .. .: : : .:
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pF1KSD FSQRRGLLSSKT-------YICSHCGESFLDRSVLLQHQLTHGNEKPFLFPDYRIGLGEG
:: : . :. : : .::..: : :..:. : .: :. . ..
NP_009 FSTFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSNLMEHKKIHTGETPYKCEECDKAF---
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pF1KSD AGPSPFL------SG-KPFKCPECKQSFGLSSELLLHQKVHAGGKSSQKSPELGKS---S
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NP_009 SWPSSLTEHKATHAGEKPYKCEECGKAFSWPSRLTEHKATHAG-EEPYKCEECGKAFNWS
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pF1KSD SVLLEHLRSPLGARPYRCSDCRASFLDRVALTRHQETHTQEKPPNPEDPPPEAVTLSTDQ
: :.:: : : .::.: .: :: ::.:. :: ::: . ..
NP_009 SNLMEHKRIHTGEKPYKCEECGKSFSTFSILTKHKVIHTGEKP------------YKCEE
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pF1KSD EGEGETPTPTESSSHGEGQNPKTLVEEKPYLCPECGAGFTEVAALLLHRSCHPGVSL
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NP_009 CGKAYKWSSTLS------YHKKIHTVEKPYKCEECGKGFVMFSILAKHKVIHTGEKLYKC
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>--
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Smith-Waterman score: 1318; 53.0% identity (72.9% similar) in 336 aa overlap (159-494:154-489)
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pF1KSD PANEPSLRELVQGRPAGAEKPYICNECGKSFSQWSKLLRHQRIHTGERPNTCSECGKSFT
: . :. ::. :::.. :.: .::
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pF1KSD QSSHLVQHQRTHTGEKPYKCPDCGKCFSWSSNLVQHQRTHTGEKPYKCTECEKAFTQSTN
. ::: ::.: .: :. ::: . :: :.:::.:. .. .:::::::.: :: :::.. .
NP_009 MLSHLSQHKRIYTRENSYKCEEGGKAFNWSSTLTYYKSAHTGEKPYRCKECGKAFSKFSI
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pF1KSD LIKHQRSHTGEKPYKCGECRRAFYRSSDLIQHQATHTGEKPYKCPECGKRFGQNHNLLKH
: ::. ::::: ::: :: .:: .:. : .:. :::::: :: :::: :.. .: :
NP_009 LTKHKVIHTGEKSYKCEECGKAFNQSAILTKHKIIHTGEKPNKCEECGKAFSKVSTLTTH
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pF1KSD QKIHAGEKPYRCTECGKSFIQSSELTQHQRTHTGEKPYECLECGKSFGHSSTLIKHQRTH
. ::::::::.: ::::.: . : : :. :.:::::.: ::::.:.. : : ::. :
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pF1KSD LREDPFKCPVCGKTFTLSATLLRHQRTHTGERPYKCPECGKSFSVSSNLINHQRIHRGER
: :.:: :::.. .:: :.. ::::.:::: ::::.::. : : .:. :: ::.
NP_009 TGEKPYKCEECGKAYKWPSTLSYHKKIHTGEKPYKCEECGKGFSMFSILTKHEVIHTGEK
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:: : .:::.: ::.:..:..::::: :::: .:::.: : : .:. :.:::::::
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pF1KSD PECGKSFSQSSNLITHVRTHMDENLFVCSDCGKAFLEAHELEQHRVIHERGKTPARRAQG
:: :.
NP_009 EECDKATHAGEKPYKCEECGKAFNWSSNLMEHKRIHTGEKPYKCEECGKSFSTFSILTKH
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>--
initn: 359 init1: 359 opt: 362 Z-score: 229.3 bits: 54.1 E(85289): 4.9e-06
Smith-Waterman score: 362; 56.0% identity (77.4% similar) in 84 aa overlap (150-232:1197-1279)
120 130 140 150 160 170
pF1KSD TTWNSPPVVPANEPSLRELVQGRPAGAEKPYICNECGKSFSQWSKLLR-HQRIHTGERPN
: :.::::.. .: . :: :..:::::.:
NP_009 KPYKCEECGKGFVMFSILAKHKVIHTGEKLYKCEECGKAY-KWPSTLRYHKKIHTGEKPY
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pF1KSD TCSECGKSFTQSSHLVQHQRTHTGEKPYKCPDCGKCFSWSSNLVQHQRTHTGEKPYKCTE
: ::::.:. : :..:. ::::::::: .::: ::: : . .:.. :::::
NP_009 KCEECGKAFSTFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAFSWLSVFSKHKKIHTGEKL
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pF1KSD CEKAFTQSTNLIKHQRSHTGEKPYKCGECRRAFYRSSDLIQHQATHTGEKPYKCPECGKR
>>XP_016882746 (OMIM: 603977) PREDICTED: zinc finger pro (1168 aa)
initn: 3280 init1: 1663 opt: 2003 Z-score: 1198.0 bits: 233.2 E(85289): 5.5e-60
Smith-Waterman score: 2037; 42.2% identity (63.6% similar) in 767 aa overlap (147-869:422-1168)
120 130 140 150 160 170
pF1KSD GALTTWNSPPVVPANEPSLRELVQGRPAGAEKPYICNECGKSFSQWSKLLRHQRIHTGER
:::: :.::::.:. :.:..:..:::::
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: : ::::.:.. : :..:. ::.::::::: .::: :.::::
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pF1KSD LVQHQRTHTGEKPYKCTECEKAFTQSTNLIKHQRSHTGEKPYKCGECRRAFYRSSDLIQH
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XP_016 LMEHKRIHTGEKPYKCEECGKSFSTFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKWSSTLSYH
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. :: :::::: :::: :.:. :.::..::.:::::.: ::::.: . : :: :. :
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pF1KSD TGEKPYECLECGKSFGHSSTLIKHQRTHLREDPFKCPVCGKTFTLSATLLRHQRTHTGER
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:::: ::::.:. ::::..:.::: ::.:: : .::::: :.: .:. ::::::::::
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pF1KSD SDCGKSFIRSSHLIQHRRTHTGEKPYKCPECGKSFSQSSNLITHVRTHMDENLFVCSDCG
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:.: .. : :..:: :. : . . : .. . :.:: : ::.:: ::
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:... . . :..:: ::.::: . : .. : : . . : . :
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:. .. ::... .. : : : ::... . :.: :. : .:::. . .
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:.: . .:. ::.:: :: ..:. ::.:. :.:.:.: .. :
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: :. : : :: . : .::.: .: .: ::.:. ::. :.: . :.
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.: . :.. .: . :: : : :. . . :.. . :::: : ::: .:.
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860
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.... :.. : : .:
XP_016 WLSVFSKHKKIHTGEKL
1160
>--
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10 20 30
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pF1KSD EKPFLFPDYRIGLGEGAGPSPFLSGKPFKCPECKQSFGLSSELLLHQKVHAGGKSSQKSP
NP_001 I
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10 20 30
pF1KSD MEPETALWGPDLQGPEQSPN---DAHRGAES--ENEEES
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XP_011 WEYEGSLERQ-QANQQTLPKEIKVTEKTI------PSWEKGPVNNEFGKSVNVSSNLVTQ
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XP_011 STHLTQHQKIHTGEKTYKCNECGKAFNGPSTFIRHHMIHTGEKPYECNECGKAFSQHSNL
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pF1KSD FVCSDCGKAFLEAHELEQHRVIHERGKTPARRAQGDSLLGLGDPSLLTPPPGAKPHKCLV
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XP_011 YECAECGKAFRHCSSLAQHQKTHTE---------------------------EKPYQCNK
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pF1KSD CGKGFNDEGIFMQHQRIHIGENPYKNADGLIAHAAPKPPQLRSPRLPFRGNSYPGAAEGR
: : :.. . . :::::: ::.::: . : . :: .: . :.. :
XP_011 CEKTFSQSSHLTQHQRIHTGEKPYKCNECDKAFS-------RSTHLTEHQNTHTGE----
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pF1KSD AEAPGQPLKPPEGQEGFSQRRGLLSS-------KTYICSHCGESFLDRSVLLQHQLTHGN
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XP_011 -----KPYNCNECRKTFSQSTYLIQHQRIHSGEKPFGCNDCGKSFRYRSALNKHQRLHPG
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pF1KSD EKPFLFPDYRIGLGEGAGPSPFLSGKPFKCPECKQSFGLSSELLLHQKVHAGGKSSQKSP
XP_011 I
>>NP_001305821 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 is (751 aa)
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10 20 30
pF1KSD MEPETALWGPDLQGPEQSPN---DAHRGAES--ENEEES
::.. : ::. . :. .: : ::
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pF1KSD PRQESSGEEIIMGDPAQSPESKDSTEMSLERSSQDPSVPQNP-PTPLGHSNPLDHQIPLD
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NP_001 WEYEGSLERQ-QANQQTLPKEIKVTEKTI------PSWEKGPVNNEFGKSVNVSSNLVTQ
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pF1KSD PPAPEVVPTPSDWTKACEASWQWGALTTWNSPPVVPANEPSLRELVQGRPAGAEKPYICN
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NP_001 EPSPEETSTKRSIKQNSNPVKKEKSCKCNECGKAFSYCSALIR---HQRTHTGEKPYKCN
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NP_001 ECEKAFSRSENLINHQRIHTGDKPYKCDQCGKGFIEGPSLTQHQRIHTGEKPYKCDECGK
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pF1KSD CFSWSSNLVQHQRTHTGEKPYKCTECEKAFTQSTNLIKHQRSHTGEKPYKCGECRRAFYR
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NP_001 AFSQRTHLVQHQRIHTGEKPYTCNECGKAFSQRGHFMEHQKIHTGEKPFKCDECDKTFTR
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pF1KSD SSDLIQHQATHTGEKPYKCPECGKRFGQNHNLLKHQKIHAGEKPYRCTECGKSFIQSSEL
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NP_001 STHLTQHQKIHTGEKTYKCNECGKAFNGPSTFIRHHMIHTGEKPYECNECGKAFSQHSNL
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pF1KSD TQHQRTHTGEKPYECLECGKSFGHSSTLIKHQRTHLREDPFKCPVCGKTFTLSATLLRHQ
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NP_001 RIHTREKPFECSECGKAFSYLSNLNQHQKTHTQEKAYECKECGKAFIRSSSLAKHERIHT
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pF1KSD GEKPYKCSDCGKSFIRSSHLIQHRRTHTGEKPYKCPECGKSFSQSSNLITHVRTHMDENL
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NP_001 GEKPYQCHECGKTFSYGSSLIQHRKIHTGERPYKCNECGRAFNQNIHLTQHKRIHTGAKP
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pF1KSD FVCSDCGKAFLEAHELEQHRVIHERGKTPARRAQGDSLLGLGDPSLLTPPPGAKPHKCLV
. :..::::: . : ::. : . ::..:
NP_001 YECAECGKAFRHCSSLAQHQKTHTE---------------------------EKPYQCNK
620 630 640
580 590 600 610 620 630
pF1KSD CGKGFNDEGIFMQHQRIHIGENPYKNADGLIAHAAPKPPQLRSPRLPFRGNSYPGAAEGR
: : :.. . . :::::: ::.::: . : . :: .: . :.. :
NP_001 CEKTFSQSSHLTQHQRIHTGEKPYKCNECDKAFS-------RSTHLTEHQNTHTGE----
650 660 670 680 690
640 650 660 670 680
pF1KSD AEAPGQPLKPPEGQEGFSQRRGLLSS-------KTYICSHCGESFLDRSVLLQHQLTHGN
.: . : .. ::: :.. : . :. ::.:: ::.: .:: :
NP_001 -----KPYNCNECRKTFSQSTYLIQHQRIHSGEKPFGCNDCGKSFRYRSALNKHQRLHPG
700 710 720 730 740 750
690 700 710 720 730 740
pF1KSD EKPFLFPDYRIGLGEGAGPSPFLSGKPFKCPECKQSFGLSSELLLHQKVHAGGKSSQKSP
NP_001 I
>>NP_009080 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 isofo (751 aa)
initn: 6671 init1: 1739 opt: 1845 Z-score: 1106.8 bits: 215.7 E(85289): 6.5e-55
Smith-Waterman score: 1871; 42.3% identity (62.9% similar) in 688 aa overlap (10-684:114-748)
10 20 30
pF1KSD MEPETALWGPDLQGPEQSPN---DAHRGAES--ENEEES
::.. : ::. . :. .: : ::
NP_009 TEPWIMEPSIPVGTCADWETRLENSVSAPEPDISEEELSPEVIVEKHKRDDSWSSNLLES
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: : :.. . . :::::: ::.::: . : . :: .: . :.. :
NP_009 CEKTFSQSSHLTQHQRIHTGEKPYKCNECDKAFS-------RSTHLTEHQNTHTGE----
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NP_009 -----KPYNCNECRKTFSQSTYLIQHQRIHSGEKPFGCNDCGKSFRYRSALNKHQRLHPG
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NP_009 I
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NP_001 TEPWIMEPSIPVGTCADWETRLENSVSAPEPDISEEELSPEVIVEKHKRDDSWSSNLLES
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. :.: :. ... :. :: .. :: ..: . .:.: .. .. .
NP_001 WEYEGSLERQ-QANQQTLPKEIKVTEKTI------PSWEKGPVNNEFGKSVNVSSNLVTQ
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NP_001 EPSPEETSTKRSIKQNSNPVKKEKSCKCNECGKAFSYCSALIR---HQRTHTGEKPYKCN
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NP_001 AFSQRTHLVQHQRIHTGEKPYTCNECGKAFSQRGHFMEHQKIHTGEKPFKCDECDKTFTR
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NP_001 STHLTQHQKIHTGEKTYKCNECGKAFNGPSTFIRHHMIHTGEKPYECNECGKAFSQHSNL
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pF1KSD TQHQRTHTGEKPYECLECGKSFGHSSTLIKHQRTHLREDPFKCPVCGKTFTLSATLLRHQ
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NP_001 YECAECGKAFRHCSSLAQHQKTHTE---------------------------EKPYQCNK
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580 590 600 610 620 630
pF1KSD CGKGFNDEGIFMQHQRIHIGENPYKNADGLIAHAAPKPPQLRSPRLPFRGNSYPGAAEGR
: : :.. . . :::::: ::.::: . : . :: .: . :.. :
NP_001 CEKTFSQSSHLTQHQRIHTGEKPYKCNECDKAFS-------RSTHLTEHQNTHTGE----
650 660 670 680 690
640 650 660 670 680
pF1KSD AEAPGQPLKPPEGQEGFSQRRGLLSS-------KTYICSHCGESFLDRSVLLQHQLTHGN
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NP_001 -----KPYNCNECRKTFSQSTYLIQHQRIHSGEKPFGCNDCGKSFRYRSALNKHQRLHPG
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pF1KSD EKPFLFPDYRIGLGEGAGPSPFLSGKPFKCPECKQSFGLSSELLLHQKVHAGGKSSQKSP
NP_001 I
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470 480 490 500 510 520
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pF1KSD ELEQHRVIHERGKTPARRAQGDSLLG--LGDPSLLT----PPPGAKPHKCLVCGKGFNDE
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pF1KSD GIFMQHQRIHIGENPYKNADGLIAHAAPKPPQLRSPRLPFRGNSYPGAAE-GRAEAPGQP
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pF1KSD LKPPEGQEGFSQRRGLLSSKTYICSHCGESFLDRSVLLQHQLTHGNEKPFLFPD----YR
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NP_001 L--------IIHMRTHSGEKPYECNECGKAFIWKSLLIVHERTHAGVNPYKCSQCEKSFS
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pF1KSD VLLEHLRSPLGARPYRCSDCRASFLDRVALTRHQETHTQEKPPNPEDPPPEAVTLSTDQE
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NP_001 ILSAHQRTHTGEKPCKCTECGKAFCWKSQLIMHQRTHVDDKH
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820 830 840 850 860
pF1KSD GEGETPTPTESSSHGEGQNPKTLVEEKPYLCPECGAGFTEVAALLLHRSCHPGVSL
>>NP_003406 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 isofo (947 aa)
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pF1KSD KACEASWQWGALTTWNSPPVVPANEPSLRELVQGRPAGAEKPYICNECGKSFSQWSKLLR
::. . . :::: ::::::.::. : :.
NP_003 SQLMCQQMYMGEKPFGCSCCEKAFSSKSYLLVHQQTHAEEKPYGCNECGKDFSSKSYLIV
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pF1KSD HQRIHTGERPNTCSECGKSFTQSSHLVQHQRTHTGEKPYKCPDCGKCFSWSSNLVQHQRT
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NP_003 HQRIHTGEKLHECSECRKTFSFHSQLVIHQRIHTGENPYECCECGKVFSRKDQLVSHQKT
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pF1KSD HTGEKPYKCTECEKAFTQSTNLIKHQRSHTGEKPYKCGECRRAFYRSSDLIQHQATHTGE
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NP_003 HSGQKPYVCNECGKAFGLKSQLIIHERIHTGEKPYECNECQKAFNTKSNLMVHQRTHTGE
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pF1KSD KPYKCPECGKRFGQNHNLLKHQKIHAGEKPYRCTECGKSFIQSSELTQHQRTHTGEKPYE
::: : .::: : . .:. :: ::.: ::: : .:::.: .:.: :::.::: :::
NP_003 KPYVCSDCGKAFTFKSQLIVHQGIHTGVKPYGCIQCGKGFSLKSQLIVHQRSHTGMKPYV
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pF1KSD CLECGKSFGHSSTLIKHQRTHLREDPFKCPVCGKTFTLSATLLRHQRTHTGERPYKCPEC
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NP_003 CNECGKAFRSKSYLIIHTRTHTGEKLHECNNCGKAFSFKSQLIIHQRIHTGENPYECHEC
510 520 530 540 550 560
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pF1KSD GKSFSVSSNLINHQRIHRGERPYICADCGKSFIMSSTLIRHQRIHTGEKPYKCSDCGKSF
::.:: . .::.::: : ::.:: :.::::.: ..: :: ::: ::::::..::.: :.:
NP_003 GKAFSRKYQLISHQRTHAGEKPYECTDCGKAFGLKSQLIIHQRTHTGEKPFECSECQKAF
570 580 590 600 610 620
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pF1KSD IRSSHLIQHRRTHTGEKPYKCPECGKSFSQSSNLITHVRTHMDENLFVCSDCGKAFLEAH
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NP_003 NTKSNLIVHQRTHTGEKPYSCNECGKAFTFKSQLIVHKGVHTGVKPYGCSQCAKTF----
630 640 650 660 670
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pF1KSD ELEQHRVIHERGKTPARRAQGDSLLG--LGDPSLLT----PPPGAKPHKCLVCGKGFNDE
:... ..:.:..: .. : : : . . : : : :::.: :::.:. .
NP_003 SLKSQLIVHQRSHTGVK-PYGCSECGKAFRSKSYLIIHMRTHTGEKPHECRECGKSFSFN
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pF1KSD GIFMQHQRIHIGENPYKNADGLIAHAAPKPPQLRSPRLPFRGNSYPGAAE-GRAEAPGQP
. .. ::::: :::::. .. ..: . :: : . :.. : .: :.: . .
NP_003 SQLIVHQRIHTGENPYECSE--CGKAFNRKDQLISHQRTHAGEKPYGCSECGKAFSSKSY
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650 660 670 680 690
pF1KSD LKPPEGQEGFSQRRGLLSSKTYICSHCGESFLDRSVLLQHQLTHGNEKPFLFPD----YR
: . . : . : : :..::..:. .:.:. :. ::.. .:. . .
NP_003 L--------IIHMRTHSGEKPYECNECGKAFIWKSLLIVHERTHAGVNPYKCSQCEKSFS
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pF1KSD IGLGEGAGPSPFLSGKPFKCPECKQSFGLSSELLLHQKVHAGGKSSQKSPELGKS---SS
: . ::..: :: ..: .:.:..::..:.: : : ::. .:
NP_003 GKLRLLVHQRMHTREKPYECSECGKAFIRNSQLIVHQRTHSGEKP-YGCNECGKTFSQKS
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pF1KSD VLLEHLRSPLGARPYRCSDCRASFLDRVALTRHQETHTQEKPPNPEDPPPEAVTLSTDQE
.: : :. : .: .:..: .: . : ::.::...:
NP_003 ILSAHQRTHTGEKPCKCTECGKAFCWKSQLIMHQRTHVDDKH
910 920 930 940
820 830 840 850 860
pF1KSD GEGETPTPTESSSHGEGQNPKTLVEEKPYLCPECGAGFTEVAALLLHRSCHPGVSL
>>NP_001159353 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 is (947 aa)
initn: 4844 init1: 1646 opt: 1840 Z-score: 1102.8 bits: 215.3 E(85289): 1.1e-54
Smith-Waterman score: 1974; 45.2% identity (68.6% similar) in 671 aa overlap (138-794:292-946)
110 120 130 140 150 160
pF1KSD KACEASWQWGALTTWNSPPVVPANEPSLRELVQGRPAGAEKPYICNECGKSFSQWSKLLR
::. . . :::: ::::::.::. : :.
NP_001 SQLMCQQMYMGEKPFGCSCCEKAFSSKSYLLVHQQTHAEEKPYGCNECGKDFSSKSYLIV
270 280 290 300 310 320
170 180 190 200 210 220
pF1KSD HQRIHTGERPNTCSECGKSFTQSSHLVQHQRTHTGEKPYKCPDCGKCFSWSSNLVQHQRT
::::::::. . :::: :.:. :.:: ::: ::::.::.: .::: :: ...::.::.:
NP_001 HQRIHTGEKLHECSECRKTFSFHSQLVIHQRIHTGENPYECCECGKVFSRKDQLVSHQKT
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