Result of FASTA (ccds) for
pFN21ASDA0239
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0239, 790 aa
1>>>pF1KSDA0239 790 - 790 aa - 790 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4835+/-0.00101; mu= -5.3298+/- 0.061
mean_var=397.1000+/-81.115, 0's: 0 Z-trim(115.9): 30 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.064361
statistics sampled from 16499 (16529) to 16499 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.798), E-opt: 0.2 (0.508), width: 16
Scan time: 3.850
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4176.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5 ( 790) 5477 523.0 7.4e-148
CCDS75305.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5 ( 791) 5465 521.9 1.6e-147
CCDS78061.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5 ( 834) 3581 347.0 7.6e-95
CCDS14271.1 JADE3 gene_id:9767|Hs108|chrX ( 823) 1810 182.5 2.4e-45
CCDS75191.1 JADE1 gene_id:79960|Hs108|chr4 ( 830) 1707 173.0 1.8e-42
CCDS47134.1 JADE1 gene_id:79960|Hs108|chr4 ( 509) 1372 141.7 2.9e-33
CCDS34062.1 JADE1 gene_id:79960|Hs108|chr4 ( 842) 1372 141.9 4.3e-33
CCDS14080.1 BRD1 gene_id:23774|Hs108|chr22 (1058) 694 79.0 4.5e-14
CCDS77686.1 BRD1 gene_id:23774|Hs108|chr22 (1189) 694 79.0 4.9e-14
CCDS82729.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1119) 643 74.3 1.3e-12
CCDS82730.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1213) 643 74.3 1.3e-12
CCDS2575.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1214) 643 74.3 1.3e-12
CCDS33692.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1220) 643 74.3 1.3e-12
CCDS34437.1 BRPF3 gene_id:27154|Hs108|chr6 (1205) 623 72.4 4.8e-12
>>CCDS4176.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5 (790 aa)
initn: 5477 init1: 5477 opt: 5477 Z-score: 2768.0 bits: 523.0 E(32554): 7.4e-148
Smith-Waterman score: 5477; 99.9% identity (99.9% similar) in 790 aa overlap (1-790:1-790)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEEKRRKYSISSDNSDTTDSHATSTSASRCSKLPSSTKSGWPRQNEKKPSEVFRTDLITA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MEEKRRKYSISSDNSDTTDSHATSTSASRCSKLPSSTKSGWPRQNEKKPSEVFRTDLITA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD MKIPDSYQLSPDDYYILADPWRQEWEKGVQVPAGAEAIPEPVVRILPPLEGPPAQASPSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MKIPDSYQLSPDDYYILADPWRQEWEKGVQVPAGAEAIPEPVVRILPPLEGPPAQASPSS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD TMLGEGSQPDWPGGSRYDLDEIDAYWLELINSELKEMERPELDELTLERVLEELETLCHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TMLGEGSQPDWPGGSRYDLDEIDAYWLELINSELKEMERPELDELTLERVLEELETLCHQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NMARAIETQEGLGIEYDEDVVCDVCRSPEGEDGNEMVFCDKCNVCVHQACYGILKVPTGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NMARAIETQEGLGIEYDEDVVCDVCRSPEGEDGNEMVFCDKCNVCVHQACYGILKVPTGS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD WLCRTCALGVQPKCLLCPKRGGALKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSIGCPEKMEPITKIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 WLCRTCALGVQPKCLLCPKRGGALKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSIGCPEKMEPITKIS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD HIPASRWALSCSLCKECTGTCIQCSMPSCVIAFHVTCAFDHGLEMRTILADNDEVKFKSF
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 HIPASRWALSCSLCKECTGTCIQCSMPSCVTAFHVTCAFDHGLEMRTILADNDEVKFKSF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD CQEHSDGGPRNEPTSEPTEPSQAGEDLEKVTLRKQRLQQLEEDFYELVEPAEVAERLDLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CQEHSDGGPRNEPTSEPTEPSQAGEDLEKVTLRKQRLQQLEEDFYELVEPAEVAERLDLA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EALVDFIYQYWKLKRKANANQPLLTPKTDEVDNLAQQEQDVLYRRLKLFTHLRQDLERVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EALVDFIYQYWKLKRKANANQPLLTPKTDEVDNLAQQEQDVLYRRLKLFTHLRQDLERVR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD NLCYMVTRRERTKHAICKLQEQIFHLQMKLIEQDLCRGLSTSFPIDGTFFNSWLAQSVQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NLCYMVTRRERTKHAICKLQEQIFHLQMKLIEQDLCRGLSTSFPIDGTFFNSWLAQSVQI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD TAENMAMSEWPLNNGHREDPAPGLLSEELLQDEETLLSFMRDPSLRPGDPARKARGRTRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TAENMAMSEWPLNNGHREDPAPGLLSEELLQDEETLLSFMRDPSLRPGDPARKARGRTRL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD PAKKKPPPPPPQDGPGSRTTPDKAPKKTWGQDAGSGKGGQGPPTRKPPRRTSSHLPSSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PAKKKPPPPPPQDGPGSRTTPDKAPKKTWGQDAGSGKGGQGPPTRKPPRRTSSHLPSSPA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD AGDCPILATPESPPPLAPETPDEAASVAADSDVQVPGPAASPKPLGRLRPPRESKVTRRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AGDCPILATPESPPPLAPETPDEAASVAADSDVQVPGPAASPKPLGRLRPPRESKVTRRL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD PGARPDAGMGPPSAVAERPKVSLHFDTETDGYFSDGEMSDSDVEAEDGGVQRGPREAGAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PGARPDAGMGPPSAVAERPKVSLHFDTETDGYFSDGEMSDSDVEAEDGGVQRGPREAGAE
730 740 750 760 770 780
790
pF1KSD EVVRMGVLAS
::::::::::
CCDS41 EVVRMGVLAS
790
>>CCDS75305.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5 (791 aa)
initn: 5463 init1: 3581 opt: 5465 Z-score: 2762.0 bits: 521.9 E(32554): 1.6e-147
Smith-Waterman score: 5465; 99.7% identity (99.7% similar) in 791 aa overlap (1-790:1-791)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEEKRRKYSISSDNSDTTDSHATSTSASRCSKLPSSTKSGWPRQNEKKPSEVFRTDLITA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MEEKRRKYSISSDNSDTTDSHATSTSASRCSKLPSSTKSGWPRQNEKKPSEVFRTDLITA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD MKIPDSYQLSPDDYYILADPWRQEWEKGVQVPAGAEAIPEPVVRILPPLEGPPAQASPSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MKIPDSYQLSPDDYYILADPWRQEWEKGVQVPAGAEAIPEPVVRILPPLEGPPAQASPSS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD TMLGEGSQPDWPGGSRYDLDEIDAYWLELINSELKEMERPELDELTLERVLEELETLCHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TMLGEGSQPDWPGGSRYDLDEIDAYWLELINSELKEMERPELDELTLERVLEELETLCHQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NMARAIETQEGLGIEYDEDVVCDVCRSPEGEDGNEMVFCDKCNVCVHQACYGILKVPTGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NMARAIETQEGLGIEYDEDVVCDVCRSPEGEDGNEMVFCDKCNVCVHQACYGILKVPTGS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD WLCRTCALGVQPKCLLCPKRGGALKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSIGCPEKMEPITKIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 WLCRTCALGVQPKCLLCPKRGGALKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSIGCPEKMEPITKIS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD HIPASRWALSCSLCKECTGTCIQCSMPSCVIAFHVTCAFDHGLEMRTILADNDEVKFKSF
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HIPASRWALSCSLCKECTGTCIQCSMPSCVTAFHVTCAFDHGLEMRTILADNDEVKFKSF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD CQEHSDGGPRNEPTSEPTEPSQAGEDLEKVTLRKQRLQQLEEDFYELVEPAEVAERLDLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 CQEHSDGGPRNEPTSEPTEPSQAGEDLEKVTLRKQRLQQLEEDFYELVEPAEVAERLDLA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EALVDFIYQYWKLKRKANANQPLLTPKTDEVDNLAQQEQDVLYRRLKLFTHLRQDLERVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EALVDFIYQYWKLKRKANANQPLLTPKTDEVDNLAQQEQDVLYRRLKLFTHLRQDLERVR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KSD NLCYMVTRRERTKHAICKLQEQIFHLQMKLIEQDLCR-GLSTSFPIDGTFFNSWLAQSVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS75 NLCYMVTRRERTKHAICKLQEQIFHLQMKLIEQDLCRAGLSTSFPIDGTFFNSWLAQSVQ
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD ITAENMAMSEWPLNNGHREDPAPGLLSEELLQDEETLLSFMRDPSLRPGDPARKARGRTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ITAENMAMSEWPLNNGHREDPAPGLLSEELLQDEETLLSFMRDPSLRPGDPARKARGRTR
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KSD LPAKKKPPPPPPQDGPGSRTTPDKAPKKTWGQDAGSGKGGQGPPTRKPPRRTSSHLPSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LPAKKKPPPPPPQDGPGSRTTPDKAPKKTWGQDAGSGKGGQGPPTRKPPRRTSSHLPSSP
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KSD AAGDCPILATPESPPPLAPETPDEAASVAADSDVQVPGPAASPKPLGRLRPPRESKVTRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AAGDCPILATPESPPPLAPETPDEAASVAADSDVQVPGPAASPKPLGRLRPPRESKVTRR
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KSD LPGARPDAGMGPPSAVAERPKVSLHFDTETDGYFSDGEMSDSDVEAEDGGVQRGPREAGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LPGARPDAGMGPPSAVAERPKVSLHFDTETDGYFSDGEMSDSDVEAEDGGVQRGPREAGA
730 740 750 760 770 780
780 790
pF1KSD EEVVRMGVLAS
:::::::::::
CCDS75 EEVVRMGVLAS
790
>>CCDS78061.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5 (834 aa)
initn: 5463 init1: 3581 opt: 3581 Z-score: 1816.2 bits: 347.0 E(32554): 7.6e-95
Smith-Waterman score: 5310; 94.5% identity (94.5% similar) in 822 aa overlap (1-778:1-822)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEEKRRKYSISSDNSDTTDSHATSTSASRCSKLPSSTKSGWPRQNEKKPSEVFRTDLITA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MEEKRRKYSISSDNSDTTDSHATSTSASRCSKLPSSTKSGWPRQNEKKPSEVFRTDLITA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD MKIPDSYQLSPDDYYILADPWRQEWEKGVQVPAGAEAIPEPVVRILPPLEGPPAQASPSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MKIPDSYQLSPDDYYILADPWRQEWEKGVQVPAGAEAIPEPVVRILPPLEGPPAQASPSS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD TMLGEGSQPDWPGGSRYDLDEIDAYWLELINSELKEMERPELDELTLERVLEELETLCHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 TMLGEGSQPDWPGGSRYDLDEIDAYWLELINSELKEMERPELDELTLERVLEELETLCHQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NMARAIETQEGLGIEYDEDVVCDVCRSPEGEDGNEMVFCDKCNVCVHQACYGILKVPTGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 NMARAIETQEGLGIEYDEDVVCDVCRSPEGEDGNEMVFCDKCNVCVHQACYGILKVPTGS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD WLCRTCALGVQPKCLLCPKRGGALKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSIGCPEKMEPITKIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 WLCRTCALGVQPKCLLCPKRGGALKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSIGCPEKMEPITKIS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD HIPASRWALSCSLCKECTGTCIQCSMPSCVIAFHVTCAFDHGLEMRTILADNDEVKFKSF
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 HIPASRWALSCSLCKECTGTCIQCSMPSCVTAFHVTCAFDHGLEMRTILADNDEVKFKSF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD CQEHSDGGPRNEPTSEPTEPSQAGEDLEKVTLRKQRLQQLEEDFYELVEPAEVAERLDLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 CQEHSDGGPRNEPTSEPTEPSQAGEDLEKVTLRKQRLQQLEEDFYELVEPAEVAERLDLA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EALVDFIYQYWKLKRKANANQPLLTPKTDEVDNLAQQEQDVLYRRLKLFTHLRQDLERVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 EALVDFIYQYWKLKRKANANQPLLTPKTDEVDNLAQQEQDVLYRRLKLFTHLRQDLERVR
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KSD NLCYMVTRRERTKHAICKLQEQIFHLQMKLIEQDLCR-----------------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 NLCYMVTRRERTKHAICKLQEQIFHLQMKLIEQDLCRERSGRRAKGKKSDSKRKGCEGSK
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550
pF1KSD ---------------------GLSTSFPIDGTFFNSWLAQSVQITAENMAMSEWPLNNGH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GSTEKKEKVKAGPDSVLGQLAGLSTSFPIDGTFFNSWLAQSVQITAENMAMSEWPLNNGH
550 560 570 580 590 600
560 570 580 590 600 610
pF1KSD REDPAPGLLSEELLQDEETLLSFMRDPSLRPGDPARKARGRTRLPAKKKPPPPPPQDGPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 REDPAPGLLSEELLQDEETLLSFMRDPSLRPGDPARKARGRTRLPAKKKPPPPPPQDGPG
610 620 630 640 650 660
620 630 640 650 660 670
pF1KSD SRTTPDKAPKKTWGQDAGSGKGGQGPPTRKPPRRTSSHLPSSPAAGDCPILATPESPPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 SRTTPDKAPKKTWGQDAGSGKGGQGPPTRKPPRRTSSHLPSSPAAGDCPILATPESPPPL
670 680 690 700 710 720
680 690 700 710 720 730
pF1KSD APETPDEAASVAADSDVQVPGPAASPKPLGRLRPPRESKVTRRLPGARPDAGMGPPSAVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 APETPDEAASVAADSDVQVPGPAASPKPLGRLRPPRESKVTRRLPGARPDAGMGPPSAVA
730 740 750 760 770 780
740 750 760 770 780 790
pF1KSD ERPKVSLHFDTETDGYFSDGEMSDSDVEAEDGGVQRGPREAGAEEVVRMGVLAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ERPKVSLHFDTETDGYFSDGEMSDSDVEAEDGGVQRGPREAGAEEVVRMGVLAS
790 800 810 820 830
>>CCDS14271.1 JADE3 gene_id:9767|Hs108|chrX (823 aa)
initn: 2148 init1: 1273 opt: 1810 Z-score: 927.6 bits: 182.5 E(32554): 2.4e-45
Smith-Waterman score: 2078; 43.6% identity (67.4% similar) in 803 aa overlap (4-772:2-786)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEEKRRKYSISSDNSDTTDSHATSTSASRCSKLPSSTKSGWPRQNEKKPSEVFRTDLITA
::.. :::.:: .: .:: ... .. :: : .. :::.:::: :::.:
CCDS14 MKRHRPVSSSDSSD--ESPSTSFTSGSMYRI----KSKIPNEH-KKPAEVFRKDLISA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KSD MKIPDSYQLSPDDYYILADPWRQEWEKGVQVPAGAEAIPEPVVRILPP-----LEGPPAQ
::.:::....::.::..:: :..::::::::::. ...:.: .::. : : .
CCDS14 MKLPDSHHINPDSYYLFADTWKEEWEKGVQVPASPDTVPQPSLRIIAEKVKDVLFIRPRK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD ----ASPSSTMLGEGSQPDWPGG-SRYDLDEIDAYWLELINSELKEMERPELDELTLERV
.::..: : . . .. :::::..: .::. .: .: :: .:: .:..
CCDS14 YIHCSSPDTTEPGYINIMELAASVCRYDLDDMDIFWLQELNEDLAEMGCGPVDENLMEKT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD LEELETLCHQNMARAIETQEGLGIEYDEDVVCDVCRSPEGEDGNEMVFCDKCNVCVHQAC
.: :: ::.:: .::::.:::::::::::.:::::::..:.::.:::::::::::::::
CCDS14 VEVLERHCHENMNHAIETEEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGNDMVFCDKCNVCVHQAC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD YGILKVPTGSWLCRTCALGVQPKCLLCPKRGGALKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSIGCP
::::::: ::::::.:.::. :.:.::::.::::: :..::::.:::::::::::::.::
CCDS14 YGILKVPEGSWLCRSCVLGIYPQCVLCPKKGGALKTTKTGTKWAHVSCALWIPEVSIACP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD EKMEPITKISHIPASRWALSCSLCKECTGTCIQCSMPSCVIAFHVTCAFDHGLEMRTILA
:.::::::::::: ::::: :.::: ::.:::::. ::. ::::::::.:::::.:::
CCDS14 ERMEPITKISHIPPSRWALVCNLCKLKTGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEHGLEMKTILD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KSD DNDEVKFKSFCQEHSDG----GPRNEPTSEPTEPSQAGEDLEKVTLRKQRLQQLEEDFYE
..:::::::.: .::.. : . : . : ::: ::..:: :.:..:::.::
CCDS14 EGDEVKFKSYCLKHSQNRQKLGEAEYPHHRAKEQSQAKS--EKTSLRAQKLRELEEEFYS
360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KSD LVEPAEVAERLDLAEALVDFIYQYWKLKRKANANQPLLTPKTDEVDNLAQQEQDVLYRRL
::. .:: .: . :::::.:::::::.: :.::. :: :: ..:.: ... .. :.
CCDS14 LVRVEDVAAELGMPTLAVDFIYNYWKLKRKSNFNKPLFPPKEDEENGLVQPKEESIHTRM
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470 480 490 500 510 520
pF1KSD KLFTHLRQDLERVRNLCYMVTRRERTKHAICKLQEQIFHLQMKLIEQDLCRGLSTSFPID
..: :::::::::::::::..:::. : . :.::::: ::..:..:.. :: . ..
CCDS14 RMFMHLRQDLERVRNLCYMISRREKLKLSHNKIQEQIFGLQVQLLNQEIDAGLPLTNALE
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570
pF1KSD GTFFNSWLAQSVQI-----TAENMAMSEWPLNNG-HREDPAPGLLSEELLQ-DEETLL--
...: .... : :. : .. : : . .. : . .: .:.:
CCDS14 NSLFYPPPRITLKLKMPKSTPEDHRNSSTETDQQPHSPDSSSSVHSIRNMQVPQESLEMR
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:. : : .. . ...: ::.. : :.:. .. : : :
CCDS14 TKSYPRYPLESKNNRLLASLSHSRSEAKESS---PAWRTPSSECYHGQSLGKPLVLQAAL
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640 650 660 670 680 690
pF1KSD SGKGGQGPPTRKPPRR--TSSHLPSSPAAGDCPILATPESPPPLAPETPDEAASVAADSD
:... : .: . :. : .: .:. . : . . : . ......
CCDS14 HGQSSIGNGKSQPNSKFAKSNGLEGS-WSGN--VTQKDSSSEMFCDQEPVFSPHLVSQGS
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. . . . : : :. : ..: .:.: : .: ..
CCDS14 FRKSTVEHFSRSF-KETTNRWVKNTEDLQCYVKPTKNMSPKEQFWGRQVLRRSAGRAPYQ
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750 760 770 780 790
pF1KSD TETDGYFSDGEMSDSDVEAEDGGVQRGPREAGAEEVVRMGVLAS
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CCDS14 -ENDGYCPDLELSDSEAES-DGNKEKVRVRKDSSDRENPPHDSRRDCHGKSKTHPLSHSS
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:: . ::..:: :. . ::. :. :. . .:. :....:::::::::::::
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... ::.: : ::::...:: :::: : :.::: ::::: :.:::
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:::.: :..:: .::::.::::::::::::::::.::.::::::::::::::.::::::
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::::::: :::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::: :
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::::::::.::::.::::: ::::.: :. ::::. .: :::::::::.::::.::::
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.::::::::.: .:: .:.:. : . : :: : :. ..:
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..:::.:::::..:: .:. .::. : : : .:::.:::::::::.: :.::.::: ::
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.::. :. .: .... : : . :: : .. .: :.
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. :..:: .:: .. ::.. . : :. . : .. : . :. .
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..: . ::.. .. . : :. : . ..:: : :. :: .. :: .
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pF1KSD CPI-LATPESPPPLAPETPDEAASVAAD-SDVQVPGPAASP-KPLGRLRPPRESKVTRR-
. ..: . ..:. .: . . :.:: ::: : : .: :.... ..
CCDS75 PGVGQSAPGTRKEIVPKCNGSLIKVNYNQTAVKVPTTPASPVKNWGGFRIPKKGERQQQG
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720 730 740 750 760 770
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:: : :.: : :: : .:. :.:.::: : :::::. :: .
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780 790
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CCDS75 HTSSTISRRTDIIRRSILAS
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..:::.:::::..:: .:. .::. : : : .:::.:::::::::.: :.::.::: ::
CCDS47 SVRKQKLQQLEDEFYTFVNLLDVARALRLPEEVVDFLYQYWKLKRKVNFNKPLITPKKDE
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CCDS47 EDNLAKREQDVLFRRLQLFTHLRQDLERVMIDTDTL
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:: . ::..:: :. . ::. :. :. . .:. :....:::::::::::::
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CCDS34 MKLHDSYQLNPDEYYVLADPWRQEWEKGVQVPVSPGTIPQPVARVVSE-EKSLMFIRPKK
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pF1KSD TMLGEGSQPDWPGG----------SRYDLDEIDAYWLELINSELKEMERPELDELTLERV
... ::.: : ::::...:: :::: : :.::: ::::: :.:::
CCDS34 YIVSSGSEPPELGYVDIRTLADSVCRYDLNDMDAAWLELTNEEFKEMGMPELDEYTMERV
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pF1KSD LEELETLCHQNMARAIETQEGLGIEYDEDVVCDVCRSPEGEDGNEMVFCDKCNVCVHQAC
:::.: :..:: .::::.::::::::::::::::.::.::::::::::::::.::::::
CCDS34 LEEFEQRCYDNMNHAIETEEGLGIEYDEDVVCDVCQSPDGEDGNEMVFCDKCNICVHQAC
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CCDS34 YGILKVPEGSWLCRTCALGVQPKCLLCPKKGGAMKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSIGSP
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CCDS34 ENDEVKFKSYCPKHSSHRKPEESLGKGAAQENGAPECSPRN-PLEPFASLEQNREEAHRV
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CCDS34 SVRKQKLQQLEDEFYTFVNLLDVARALRLPEEVVDFLYQYWKLKRKVNFNKPLITPKKDE
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CCDS34 EDNLAKREQDVLFRRLQLFTHLRQDLERVRNLTYMVTRREKIKRSVCKVQEQIFNLYTKL
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pF1KSD IEQDLCRGLSTSFPIDGTFFNSWL--AQSVQITAENMAMSEW---------------PLN
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CCDS34 LEQERVSGVPSSCS-SSSLENMLLFNSPSVGPDAPKIEDLKWHSAFFRKQMGTSLVHSLK
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. :..:: .:: .. ::.. . : :. . : .. : . :. .
CCDS34 KPHKRDPLQNSPGSEGKTLLKQPD--LCGRREGMVVP----ESFLGLEKTFAEARLISAQ
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CCDS34 QKNG---VVMPDHGKRRDNRFHCDLIKGDLKDKSFKQSHKPLRSTDVSQRHLDNTRAATS
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670 680 690 700 710
pF1KSD CPI-LATPESPPPLAPETPDEAASVAAD-SDVQVPGPAASP-KPLGRLRPPRESKVTRR-
. ..: . ..:. .: . . :.:: ::: : : .: :.... ..
CCDS34 PGVGQSAPGTRKEIVPKCNGSLIKVNYNQTAVKVPTTPASPVKNWGGFRIPKKGERQQQG
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720 730 740 750 760 770
pF1KSD --LPGA------RPDAGMGPPSAVAERPKVSLHFDTETDGYFSDGEMSDSDVEAEDGGVQ
:: : :.: : :: : .:. :.:.::: : :::::. :: .
CCDS34 EAHDGACHQHSDYPYLGLGRVPA-KERAKSKLKSDNENDGYVPDVEMSDSESEASEKKCI
770 780 790 800 810 820
780 790
pF1KSD RGPREAGAEEVVRMGVLAS
CCDS34 HTSSTISRRTDIIRRSILAS
830 840
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CCDS14 ERPPVCLRTKRHKNNRVKKKNEALPSAHGTPASASALPEPKVRIVE--YSPPSAPRRPPV
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pF1KSD STMLGEGSQPDWPGGSRYDLDEIDAYWLELINSELKEMERPELDELTLERVLEELETLCH
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CCDS14 YYKFIEKSAEELDNEVEYDMDEEDYAWLEIVNEKRKGDCVPAVSQSMFEFLMDRFEKESH
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pF1KSD QNMARAIETQEGLGIEYDEDVVCDVCRSPEGEDGNEMVFCDKCNVCVHQACYGILKVPTG
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CCDS14 CENQKQGE-QQSL---IDEDAVCCICMDGECQNSNVILFCDMCNLAVHQECYGVPYIPEG
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pF1KSD SWLCRTCALG-VQPK-CLLCPKRGGALKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSIGCPEKMEPIT
.:::: : . ..: :.:::..:::.: : . .: :: ::::::::... .:::
CCDS14 QWLCRHCLQSRARPADCVLCPNKGGAFKKT-DDDRWGHVVCALWIPEVGFANTVFIEPID
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pF1KSD KISHIPASRWALSCSLCKEC-TGTCIQCSMPSCVIAFHVTCAFDHGLEMR-------TIL
. .:: .:: :.: :::. .:.:::: .: ::::::: :: :. :
CCDS14 GVRNIPPARWKLTCYLCKQKGVGACIQCHKANCYTAFHVTCAQKAGLYMKMEPVKELTGG
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pF1KSD ADNDEVKFKSFCQEHSDGGPRNEPTS-----EPTEPSQAGEDLEKVTLRKQRLQQLEEDF
. . :. ..:. :. : .: . : . :. :.. ..... .
CCDS14 GTTFSVRKTAYCDVHTPPGCTRRPLNIYGDVEMKNGVCRKESSVKTVRSTSKVRKKAKKA
380 390 400 410 420 430
410 420 430 440
pF1KSD YE-LVEPAEV----------AERLD-LA--------EALVDFIYQYWKLKRKANANQPLL
. :.:: : .::. .: . .:. ..:: ::: . . :::
CCDS14 KKALAEPCAVLPTVCAPYIPPQRLNRIANQVAIQRKKQFVERAHSYWLLKRLSRNGAPLL
440 450 460 470 480 490
450 460 470 480 490
pF1KSD TPKTDEVDNL---AQQEQDVLYR----RLKLFTHLRQDLERVRNLCYMVTRRERTKHAIC
. ... :.:.: .. .:: . .::.::::.: : .. .::. :.
CCDS14 RRLQSSLQSQRSSQQRENDEEMKAAKEKLKYWQRLRHDLERARLLIELLRKREKLKREQV
500 510 520 530 540 550
500 510 520 530 540 550
pF1KSD KLQEQIFHLQMKLIEQDLCRGLSTSFPIDGTFFNSWLAQSVQITAENMAMSEWPLNNGHR
:... ..:..
CCDS14 KVEQVAMELRLTPLTVLLRSVLDQLQDKDPARIFAQPVSLKEVPDYLDHIKHPMDFATMR
560 570 580 590 600 610
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]