Result of FASTA (ccds) for
pFN21ASDA0173
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0173, 1199 aa
1>>>pF1KSDA0173 1199 - 1199 aa - 1199 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5223+/-0.000952; mu= 12.2298+/- 0.057
mean_var=131.0190+/-25.956, 0's: 0 Z-trim(109.8): 29 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.112049
statistics sampled from 11107 (11128) to 11107 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.695), E-opt: 0.2 (0.342), width: 16
Scan time: 5.360
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2422.1 TTLL4 gene_id:9654|Hs108|chr2 (1199) 8066 1316.1 0
CCDS32124.1 TTLL5 gene_id:23093|Hs108|chr14 (1281) 1047 181.5 1.2e-44
CCDS45724.1 TTLL6 gene_id:284076|Hs108|chr17 ( 891) 765 135.8 4.5e-31
CCDS690.2 TTLL7 gene_id:79739|Hs108|chr1 ( 887) 700 125.3 6.5e-28
CCDS5301.1 TTLL2 gene_id:83887|Hs108|chr6 ( 592) 513 95.0 5.8e-19
CCDS48012.1 TTLL11 gene_id:158135|Hs108|chr9 ( 800) 474 88.8 5.9e-17
CCDS6834.2 TTLL11 gene_id:158135|Hs108|chr9 ( 538) 371 72.0 4.4e-12
>>CCDS2422.1 TTLL4 gene_id:9654|Hs108|chr2 (1199 aa)
initn: 8066 init1: 8066 opt: 8066 Z-score: 7047.9 bits: 1316.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8066; 99.9% identity (100.0% similar) in 1199 aa overlap (1-1199:1-1199)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASAGTQHYSIGLRQKNSFKQSGPSGTVPATPPQKPSEGRVWPQAHQQVKPIWKLEKKQV
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CCDS24 MASAGTQHYSIGLRQKNSFKQSGPSGTVPATPPEKPSEGRVWPQAHQQVKPIWKLEKKQV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ETLSAGLGPGLLGVPPQPAYFFCPSTLCSSGTTAVIAGHSSSCYLHSLPDLFNSTLLYRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 ETLSAGLGPGLLGVPPQPAYFFCPSTLCSSGTTAVIAGHSSSCYLHSLPDLFNSTLLYRR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SSYRQKPYQQLESFCLRSSPSEKSPFSLPQKSLPVSLTANKATSSMVFSMAQPMASSSTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 SSYRQKPYQQLESFCLRSSPSEKSPFSLPQKSLPVSLTANKATSSMVFSMAQPMASSSTE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD PYLCLAAAGENPSGKSLASAISGKIPSPLSSSYKPMLNNNSFMWPNSTPVPLLQTTQGLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 PYLCLAAAGENPSGKSLASAISGKIPSPLSSSYKPMLNNNSFMWPNSTPVPLLQTTQGLK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PVSPPKIQPVSWHHSGGTGDCAPQPVDHKVPKSIGTVPADASAHIALSTASSHDTSTTSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 PVSPPKIQPVSWHHSGGTGDCAPQPVDHKVPKSIGTVPADASAHIALSTASSHDTSTTSV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ASSWYNRNNLAMRAEPLSCALDDSSDSQDPTKEIRFTEAVRKLTARGFEKMPRQGCQLEQ
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CCDS24 ASSWYNRNNLAMRAEPLSCALDDSSDSQDPTKEIRFTEAVRKLTARGFEKMPRQGCQLEQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SSFLNPSFQWNVLNRSRRWKPPAVNQQFPQEDAGSVRRVLPGASDTLGLDNTVFCTKRIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 SSFLNPSFQWNVLNRSRRWKPPAVNQQFPQEDAGSVRRVLPGASDTLGLDNTVFCTKRIS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD IHLLASHASGLNHNPACESVIDSSAFGEGKAPGPPFPQTLGIANVATRLSSIQLGQSEKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 IHLLASHASGLNHNPACESVIDSSAFGEGKAPGPPFPQTLGIANVATRLSSIQLGQSEKE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD RPEEARELDSSDRDISSATDLQPDQAETEDTEEELVDGLEDCCSRDENEEEEGDSECSSL
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CCDS24 RPEEARELDSSDRDISSATDLQPDQAETEDTEEELVDGLEDCCSRDENEEEEGDSECSSL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SAVSPSESVAMISRSCMEILTKPLSNHEKVVRPALIYSLFPNVPPTIYFGTRDERVEKLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 SAVSPSESVAMISRSCMEILTKPLSNHEKVVRPALIYSLFPNVPPTIYFGTRDERVEKLP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD WEQRKLLRWKMSTVTPNIVKQTIGRSHFKISKRNDDWLGCWGHHMKSPSFRSIREHQKLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 WEQRKLLRWKMSTVTPNIVKQTIGRSHFKISKRNDDWLGCWGHHMKSPSFRSIREHQKLN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD HFPGSFQIGRKDRLWRNLSRMQSRFGKKEFSFFPQSFILPQDAKLLRKAWESSSRQKWIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 HFPGSFQIGRKDRLWRNLSRMQSRFGKKEFSFFPQSFILPQDAKLLRKAWESSSRQKWIV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KPPASARGIGIQVIHKWSQLPKRRPLLVQRYLHKPYLISGSKFDLRIYVYVTSYDPLRIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 KPPASARGIGIQVIHKWSQLPKRRPLLVQRYLHKPYLISGSKFDLRIYVYVTSYDPLRIY
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD LFSDGLVRFASCKYSPSMKSLGNKFMHLTNYSVNKKNAEYQANADEMACQGHKWALKALW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 LFSDGLVRFASCKYSPSMKSLGNKFMHLTNYSVNKKNAEYQANADEMACQGHKWALKALW
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD NYLSQKGVNSDAIWEKIKDVVVKTIISSEPYVTSLLKMYVRRPYSCHELFGFDIMLDENL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 NYLSQKGVNSDAIWEKIKDVVVKTIISSEPYVTSLLKMYVRRPYSCHELFGFDIMLDENL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD KPWVLEVNISPSLHSSSPLDISIKGQMIRDLLNLAGFVLPNAEDIISSPSSCSSSTTSLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 KPWVLEVNISPSLHSSSPLDISIKGQMIRDLLNLAGFVLPNAEDIISSPSSCSSSTTSLP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD TSPGDKCRMAPEHVTAQKMKKAYYLTQKIPDQDFYASVLDVLTPDDVRILVEMEDEFSRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 TSPGDKCRMAPEHVTAQKMKKAYYLTQKIPDQDFYASVLDVLTPDDVRILVEMEDEFSRR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD GQFERIFPSHISSRYLRFFEQPRYFNILTTQWEQKYHGNKLKGVDLLRSWCYKGFHMGVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 GQFERIFPSHISSRYLRFFEQPRYFNILTTQWEQKYHGNKLKGVDLLRSWCYKGFHMGVV
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD SDSAPVWSLPTSLLTISKDDVILNAFSKSETSKLGKQSSCEVSLLLSEDGTTPKSKKTQA
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CCDS24 SDSAPVWSLPTSLLTISKDDVILNAFSKSETSKLGKQSSCEVSLLLSEDGTTPKSKKTQA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD GLSPYPQKPSSSKDSEDTSKEPSLSTQTLPVIKCSGQTSRLSASSTFQSISDSLLAVSP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 GLSPYPQKPSSSKDSEDTSKEPSLSTQTLPVIKCSGQTSRLSASSTFQSISDSLLAVSP
1150 1160 1170 1180 1190
>>CCDS32124.1 TTLL5 gene_id:23093|Hs108|chr14 (1281 aa)
initn: 408 init1: 408 opt: 1047 Z-score: 915.4 bits: 181.5 E(32554): 1.2e-44
Smith-Waterman score: 1047; 37.4% identity (68.9% similar) in 473 aa overlap (591-1054:51-515)
570 580 590 600 610 620
pF1KSD TKPLSNHEKVVRPALIYSLFPNVPPTIYFGTRDERVEKLPWEQRKLLRWKMSTVTPNIVK
:.:. .. . .: : .:. . .:.
CCDS32 VISQEDHPCIMWTGGCRRIPVLVFHADAILTKDNNIRVIG--ERYHLSYKIVRTDSRLVR
30 40 50 60 70
630 640 650 660 670
pF1KSD QTIGRSHF-KISKRNDDWLGCW-GHHMKSPSFRSIREHQKLNHFPGSFQIGRKDRLWRNL
. . : .. . :. : : :.: .:.. : ::.:::: :... :::::..:.
CCDS32 SILTAHGFHEVHPSSTDYNLMWTGSHLKPFLLRTLSEAQKVNHFPRSYELTRKDRLYKNI
80 90 100 110 120 130
680 690 700 710 720 730
pF1KSD SRMQSRFGKKEFSFFPQSFILPQDAKLLRKAWESSSRQKWIVKPPASARGIGIQVIHKWS
::: : : : ..::.:.:: . . ... :..: ::::: ::.:: :. .:.. .
CCDS32 IRMQHTHGFKAFHILPQTFLLPAEYAEFCNSY-SKDRGPWIVKPVASSRGRGVYLINNPN
140 150 160 170 180 190
740 750 760 770 780 790
pF1KSD QLPKRRPLLVQRYLHKPYLISGSKFDLRIYVYVTSYDPLRIYLFSDGLVRFASCKYSPSM
:. .. .::.::...: ::. :::.:.:: ::::::: :::. .::.:::. .:. .
CCDS32 QISLEENILVSRYINNPLLIDDFKFDVRLYVLVTSYDPLVIYLYEEGLARFATVRYDQGA
200 210 220 230 240 250
800 810 820 830 840 850
pF1KSD KSLGNKFMHLTNYSVNKKNAEYQANAD-EMACQGHKWALKALWNYLSQKGVNSDAIWEKI
:.. :.::::::::::::...: . : :. :.::...:. ::.:.: .. :. ..
CCDS32 KNIRNQFMHLTNYSVNKKSGDYVSCDDPEVEDYGNKWSMSAMLRYLKQEGRDTTALMAHV
260 270 280 290 300 310
860 870 880 890 900 910
pF1KSD KDVVVKTIISSEPYVTSLLKMYVRRPYSCHELFGFDIMLDENLKPWVLEVNISPSLHSSS
.:...:::::.: ... : .: . :: ::.:::...: .::::.::::.:::: ..
CCDS32 EDLIIKTIISAELAIATACKTFVPHRSSCFELYGFDVLIDSTLKPWLLEVNLSPSLACDA
320 330 340 350 360 370
920 930 940 950 960 970
pF1KSD PLDISIKGQMIRDLLNLAGFVLPNAEDIISS----PSSCSSSTTSLPTSPGDKCRMAPEH
:::..::..:: :.....::: . . :. :. :: . : . ..:: :
CCDS32 PLDLKIKASMISDMFTVVGFVCQDPAQRASTRPIYPTFESSRRN--PFQKPQRCR--PLS
380 390 400 410 420 430
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD VTAQKMKKAYYLTQKIPDQDFYASVLDVLTPDDVRILVEMEDEFSRRGQFERIFPSHISS
.. .::. ... . .::: :. .....: ....: .::: : ::::. .
CCDS32 ASDAEMKNLVGSAREKGPGKLGGSVLG-LSMEEIKVLRRVKEENDRRGGFIRIFPTSETW
440 450 460 470 480 490
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KSD R-YLRFFEQPRYFN-ILTTQWEQKYHGNKLKGVDLLRSWCYKGFHMGVVSDSAPVWSLPT
. : ..:. .: .:.:. :
CCDS32 EIYGSYLEHKTSMNYMLATRLFQDRMTADGAPELKIESLNSKAKLHAALYERKLLSLEVR
500 510 520 530 540 550
>>CCDS45724.1 TTLL6 gene_id:284076|Hs108|chr17 (891 aa)
initn: 438 init1: 367 opt: 765 Z-score: 671.4 bits: 135.8 E(32554): 4.5e-31
Smith-Waterman score: 765; 27.5% identity (57.7% similar) in 640 aa overlap (585-1199:87-699)
560 570 580 590 600 610
pF1KSD SCMEILTKPLSNHEKVVRPALIYSLFPNVPPTIYFGTRDERVEKLPWEQRKLLRWKMSTV
: : .. . . ...: : ..:.
CCDS45 SQEGENSEEKGDSSKEDPKETVALAFVRENPGAQNGLQNAQQQGKKKRKKKRLVINLSSC
60 70 80 90 100 110
620 630 640 650 660 670
pF1KSD TPNIVKQTIGRSHFKISKRNDDWLGCWGHHMKS-PSFRSIREHQKLNHFPGSFQIGRKDR
. :... . :. . ..::: : . : .. .::.::::: .: :::
CCDS45 RYESVRRAAQQYGFREGGEDDDWTLYWTDYSVSLERVMEMKSYQKINHFPGMSEICRKDL
120 130 140 150 160 170
680 690 700 710 720 730
pF1KSD LWRNLSRMQSRFGKKEFSFFPQSFILPQDAKLLRKAWESSSRQKWIVKPPASARGIGIQV
: ::.::: . : :.: :::... :: : :. .: . . .: :: .. .: :: .
CCDS45 LARNMSRMLKMF-PKDFRFFPRTWCLPADWGDLQTYSRSRKNKTYICKPDSGCQGKGIFI
180 190 200 210 220 230
740 750 760 770 780 790
pF1KSD IHKWSQLPKRRPLLVQRYLHKPYLISGSKFDLRIYVYVTSYDPLRIYLFSDGLVRFASCK
. ... . .. : :. ::..:.: :::::::: ::: :::::.....::.:::. .
CCDS45 TRTVKEIKPGEDMICQLYISKPFIIDGFKFDLRIYVLVTSCDPLRIFVYNEGLARFATTS
240 250 260 270 280 290
800 810 820 830 840 850
pF1KSD YS-PSMKSLGNKFMHLTNYSVNKKNAEYQANADEMACQGHKWALKALWNYLSQKGVNSDA
:: : .: . :::::::.::...... .: .: : :... :: ... : .
CCDS45 YSRPCTDNLDDICMHLTNYSINKHSSNFSRDAH----SGSKRKLSTFSAYLEDHSYNVEQ
300 310 320 330 340 350
860 870 880 890 900
pF1KSD IWEKIKDVVVKTIISSEPYVTSLLKMYVRRPY-----SCHELFGFDIMLDENLKPWVLEV
::. :.::..::.::..: . .... : .: :..::::.::..::::.:::
CCDS45 IWRDIEDVIIKTLISAHPIIRH--NYHTCFPNHTLNSACFEILGFDILLDHKLKPWLLEV
360 370 380 390 400
910 920 930 940 950 960
pF1KSD NISPSLHSSSPLDISIKGQMIRDLLNLAGFVLPNAEDIISSP-------SSCSSSTTSLP
: :::. ..: :: .: .. : : : .. . . .. ..: : .
CCDS45 NHSPSFSTDSRLDKEVKDGLLYDTLVLINLESCDKKKVLEEERQRGQFLQQCCSREMRIE
410 420 430 440 450 460
970 980 990 1000 1010
pF1KSD TSPGDKCRMAPEHVTAQKMK-KAYYLTQKIPDQDFYASVLDVLTPDDVRILVEMEDEFSR
. : . . . : .: . .. : ... : . .. : : .
CCDS45 EAKGFRAVQLKKTETYEKENCGGFRLIYPSLNSEKYEKFFQ-----DNNSLFQNTVASRA
470 480 490 500 510 520
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD RGQFERIFPSHIS-SRYLRFFEQPRYFNILTTQWEQKYHGNKLKGVDLLRSWCYKGFHMG
: .. : . ... .: . :.. . .. : :. . . :: .:.: : .
CCDS45 REEYARQLIQELRLKREKKPFQMKKKVEM---QGESAGEQVRKKG---MRGWQQKQQQKD
530 540 550 560 570
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD VVSDSAPVWSL-PTSLLTISKDDVI-LNAFSKSET-SKLGKQSSCEVSLLLSEDGTTPKS
.. .: . : .:.. . : .. . . :.:: :.:.... .:....
CCDS45 KAATQASKQYIQPLTLVSYTPDLLLSVRGERKNETDSSLNQEAP-------TEEASSVFP
580 590 600 610 620 630
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD KKTQAGLSPYPQKPSSSKDSEDTSK-EPSLSTQTLPVIKCSGQTSRLSASSTFQSI----
: :.: .:. . :. . . ..:: ::: . .. : .. .. .... . :.
CCDS45 KLTSA--KPFSSLPDLRNINLSSSKLEPSKPNFSIKEAKSASAVNVFTGTVHLTSVETTP
640 650 660 670 680
pF1KSD -SDSLLAVSP
: . :..::
CCDS45 ESTTQLSISPKSPPTLAVTASSEYSGPETDRVVSFKCKKQQTPPHLTQKKMLKSFLPTKS
690 700 710 720 730 740
>>CCDS690.2 TTLL7 gene_id:79739|Hs108|chr1 (887 aa)
initn: 585 init1: 286 opt: 700 Z-score: 614.6 bits: 125.3 E(32554): 6.5e-28
Smith-Waterman score: 705; 29.4% identity (59.0% similar) in 642 aa overlap (598-1191:21-630)
570 580 590 600 610
pF1KSD EKVVRPALIYSLFPNVPPTIYFGTRDERVEKLPWE---QRKLLRWKMS-TVTPN------
.::.. .::. . : . :.: :
CCDS69 MPSLPQEGVIQGPSPLDLNTELPYQSTMKRKVRKKKKKGTITANVAGTKF
10 20 30 40 50
620 630 640 650 660 670
pF1KSD -IVKQTIGRSHFKISKRNDDWLGC-W-GHHMKSPSFRSIREHQKLNHFPGSFQIGRKDRL
::. .: . : . .:. . : ... .. ....:..::::: .: ::: :
CCDS69 EIVRLVIDEMGFMKTPDEDETSNLIWCDSAVQQEKISELQNYQRINHFPGMGEICRKDFL
60 70 80 90 100 110
680 690 700 710 720
pF1KSD WRNLSRM-QSRFGKKEFSFFPQSFILPQDAKLLR---KAWESSSRQK-WIVKPPASARGI
::...: .:: ...: :...:.: . .. : ... .:: .:::: .: :
CCDS69 ARNMTKMIKSR--PLDYTFVPRTWIFPAEYTQFQNYVKELKKKRKQKTFIVKPANGAMGH
120 130 140 150 160
730 740 750 760 770 780
pF1KSD GIQVIHKWSQLPKRRPLLVQRYLHKPYLISGSKFDLRIYVYVTSYDPLRIYLFSDGLVRF
::..:.. ..::.. :.::.:..::.:. : :::::::. ::: :::.:.:. :::::.
CCDS69 GISLIRNGDKLPSQDHLIVQEYIEKPFLMEGYKFDLRIYILVTSCDPLKIFLYHDGLVRM
170 180 190 200 210 220
790 800 810 820 830 840
pF1KSD ASCKYSPSMKS-LGNKFMHLTNYSVNKKNAEYQANADEMACQGHKWALKALWNYLSQKGV
.. :: : .: : . .::::::::::.: ... :: .: : ..: . ..:. .
CCDS69 GTEKYIPPNESNLTQLYMHLTNYSVNKHNEHFE--RDETENKGSKRSIKWFTEFLQANQH
230 240 250 260 270 280
850 860 870 880 890 900
pF1KSD NSDAIWEKIKDVVVKTIISSEPYVTSLLKMYV--RRPYS---CHELFGFDIMLDENLKPW
. .: :...::::.: .::.: .: . : : : :..::::.::..::::
CCDS69 DVAKFWSDISELVVKTLIVAEPHVLHAYRMCRPGQPPGSESVCFEVLGFDILLDRKLKPW
290 300 310 320 330 340
910 920 930 940 950
pF1KSD VLEVNISPSLHSSSPLDISIKGQMIRDLLNLAGFVLPNAEDIISSPSSCS--------SS
.::.: .::. ... .: ..: .. . :.: .. . . ... .. . :
CCDS69 LLEINRAPSFGTDQKIDYDVKRGVLLNALKLLNIRTSDKRRNLAKQKAEAQRRLYGQNSI
350 360 370 380 390 400
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD TTSLP-TSPGDKCRMAPEHVTAQKMKKAYYLTQKIPDQDF----YASVLDVLTPDDVRIL
:: .: .. : :. . .. . ..: .. ... . :.: .:
CCDS69 KRLLPGSSDWEQQRHQLERRKEELKERLAQVRKQISREEHENRHMGNYRRIYPPEDKALL
410 420 430 440 450 460
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD VEMEDEFSRRGQFERIFPSHISSRYLRFFEQPRYFNILTTQWEQKYHGNKLKGVDLLRSW
..:. .. : . .:.: : : . : : . :. .:::..
CCDS69 EKYENLLAV------AFQTFLSGRAASF--QRELNNPLKRMKEEDI-------LDLLEQ-
470 480 490 500 510
1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD CYKGFH--MGVVSDS---APVWSLPTSLLTISKDDVILNAFSKSETSKLGKQSSCEVSLL
: . :: .. . :. :.: : ... . .:..: ...:: : .
CCDS69 CEIDDEKLMGKTTKTRGPKPLCSMPESTEIMKRPK-----YCSSDSSYDSSSSSSESDEN
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.:. . : :.. .:.: : :.::: . : .: :.:.:. : ::.:
CCDS69 EKEEYQNKKREKQVTYNLKPSNHYKLIQQPSSIRRS--VSCPRSISAQS-P---SSGDTR
570 580 590 600 610
1180 1190
pF1KSD RLSASSTFQSISDSLLAVSP
.::.. . :.:
CCDS69 PFSAQQMI-SVSRPTSASRSHSLNRASSYMRHLPHSNDACSTNSQVSESLRQLKTKEQED
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: : .... .:: .:.... : ..: .
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: . ..:.: .:..:.: .:.. . .. ..... :: :: .:: :: .. ...
CCDS53 GTSLYQFIPLTFVMPNDYTKFVAEYFQERQMLGTKHSYWICKPAELSRGRGILIFSDFKD
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.:. ::.. : : :.. : :::::::..:.:::::.:::: ::.: .
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:. .: ....:...:
CCDS53 STDVLVKRKLVHDIIDLIYLNGLRNEGREASNATHGNSNIDAAKSDRGGLDAPDCLPYDS
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:.::.: :: : .. ...: .::.: : : ... .. : . : : .
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:. : .. : .:.. : .. ..: .: . .: . .: :. : :
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:. : : . . .. :: . : . . .::: :. : .:... .
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200 210 220 230 240 250
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... :. ..:.::: .. :: : : . ::. : .:..:.:.:.:::..
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.: . : . : . .:::: .. .: :: .:. :.. . :: .::.:.
CCDS48 QLFVAQVQMVKDDDPSWKPTFIVKPDGGCQGDGIYLIKDPSDIRLAGTLQSRPAVVQEYI
320 330 340 350 360 370
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pF1KSD HKPYLISGSKFDLRIYVYVTSYDPLRIYLFSDGLVRFASCKYS-PSMKSLGNKFMHLTNY
:: ::. :::.:.:: . : :::.::. .::: :: . :. :. :.: :::::::
CCDS48 CKPLLIDKLKFDIRLYVLLKSLDPLEIYIAKDGLSRFCTEPYQEPTPKNLHRIFMHLTNY
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:.: ..... ..: : : : ..... ::.:::. .: : .::.::.:. :
CCDS48 SLNIHSGNF-IHSDS-ASTGSKRTFSSILCRLSSKGVDIKKVWSDIISVVIKTVIALTPE
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. . . . :: .: ...::::.: .:::: .:::: .::. : ::
CCDS48 LKVFYQSDIPTGRPGPTCFQILGFDILLMKNLKPILLEVNANPSMRIEHEHELSPGVFEN
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pF1KSD ----LDISIKGQMIRDLLNLAGFVLPNAEDI---ISSPSSCSSSTTSLPTSPGDKCRMAP
.: .: .::: : : . . :. . .: . . .. . . . : :
CCDS48 VPSLVDEEVKVAVIRDTLRLMDPLKKKRENQSQQLEKPFAGKEDALDGELTSAPDCNANP
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: :. . .:... : : : ..: .. .:.:
CCDS48 EAHLPSICLKQVF---PKYAKQFNYLRLVDRMANLFIRFLGIKGTMKLGPTGFRTFIRSC
620 630 640 650 660 670
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CCDS48 KLSSSSLSMAAVDILYIDITRRWNSMTLDQRDSGMCLQAFVEAFFFLAQRKFKMLPLHEQ
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CCDS68 MAAAASVTGRVTWAASPMRSLGLGRRLSLPGPR----LDAV---TA
10 20 30
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RISIHLLASHASGLNHNP---ACESVIDSSAFGEGKAPGPPFPQTLGIANVATRLSSIQL
.. : ..:..::... .: . . .: : : . .:. : ::...
CCDS68 AVNPSL-SDHGNGLGRGTRGSGCSGGSLVADWGGGAAAAAAVALALAPA-----LSTMRR
40 50 60 70 80 90
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CCDS68 GSSESE-------LAARWEAEAVAAAKAAAKAEAEATAETVAEQVRVDAGAAGEPECKAG
100 110 120 130 140
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CCDS68 E-EQPKVLAPAPAQPSAA-EEGNTQVLQRPPPTLPPS-KPKPVQGLCPHGKP------RD
150 160 170 180 190
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CCDS68 KGRSCKRSSGHGSGENGSQRPVTVDSSKARTSLDALKISIRQLKWKEFPFGRRLPCDIYW
200 210 220 230 240 250
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CCDS68 HGVSFHDNDIFSGQVNKFPGMTEMVRKITLSRAVRTMQNLF-PEEYNFYPRSWILPDEFQ
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CCDS68 LFVAQVQMVKDDDPSWKPTFIVKPDGGCQGDGIYLIKDPSDIRLAGTLQSRPAVVQEYIC
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pF1KSD VNKKNAEYQANADEMACQGHKWALKALWNYLSQKGVNSDAIWEKIKDVVVKTIISSEPYV
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CCDS68 LNIHSGNF-IHSDS-ASTGSKRTFSSILCRLSSKGVDIKKVWSDIISVVIKTVIALTPEL
440 450 460 470 480 490
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]