Result of FASTA (ccds) for pFN21ASDA0137
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0137, 766 aa
  1>>>pF1KSDA0137 766 - 766 aa - 766 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3594+/-0.00106; mu= 3.2549+/- 0.063
 mean_var=375.4414+/-86.119, 0's: 0 Z-trim(112.0): 317  B-trim: 0 in 0/54
 Lambda= 0.066192
 statistics sampled from 12468 (12845) to 12468 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.723), E-opt: 0.2 (0.395), width:  16
 Scan time:  3.220

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2241.1 TLK1 gene_id:9874|Hs108|chr2            ( 766) 5105 502.6 9.7e-142
CCDS46447.1 TLK1 gene_id:9874|Hs108|chr2           ( 718) 4784 471.9 1.6e-132
CCDS46448.1 TLK1 gene_id:9874|Hs108|chr2           ( 670) 4392 434.4 2.8e-121
CCDS45753.1 TLK2 gene_id:11011|Hs108|chr17         ( 718) 2411 245.3 2.6e-64
CCDS62283.1 TLK2 gene_id:11011|Hs108|chr17         ( 772) 2298 234.5 4.8e-61
CCDS82182.1 TLK2 gene_id:11011|Hs108|chr17         ( 601) 2287 233.4 8.5e-61
CCDS11633.1 TLK2 gene_id:11011|Hs108|chr17         ( 750) 2287 233.5 9.8e-61


>>CCDS2241.1 TLK1 gene_id:9874|Hs108|chr2                 (766 aa)
 initn: 5105 init1: 5105 opt: 5105  Z-score: 2658.2  bits: 502.6 E(32554): 9.7e-142
Smith-Waterman score: 5105; 100.0% identity (100.0% similar) in 766 aa overlap (1-766:1-766)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSVQSSSGSLEGPPSWSQLSTSPTPGSAAAARSLLNHTPPSGRPREGAMDELHSLDPRRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 MSVQSSSGSLEGPPSWSQLSTSPTPGSAAAARSLLNHTPPSGRPREGAMDELHSLDPRRQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD ELLEARFTGVASGSTGSTGSCSVGAKASTNNESSNHSFGSLGSLSDKESETPEKKQSESS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 ELLEARFTGVASGSTGSTGSCSVGAKASTNNESSNHSFGSLGSLSDKESETPEKKQSESS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD RGRKRKAENQNESSQGKSIGGRGHKISDYFEYQGGNGSSPVRGIPPAIRSPQNSHSHSTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 RGRKRKAENQNESSQGKSIGGRGHKISDYFEYQGGNGSSPVRGIPPAIRSPQNSHSHSTP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD SSSVRPNSPSPTALAFGDHPIVQPKQLSFKIIQTDLTMLKLAALESNKIQDLEKKEGRID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SSSVRPNSPSPTALAFGDHPIVQPKQLSFKIIQTDLTMLKLAALESNKIQDLEKKEGRID
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD DLLRANCDLRRQIDEQQKLLEKYKERLNKCISMSKKLLIEKSTQEKLSSREKSMQDRLRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 DLLRANCDLRRQIDEQQKLLEKYKERLNKCISMSKKLLIEKSTQEKLSSREKSMQDRLRL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD GHFTTVRHGASFTEQWTDGFAFQNLVKQQEWVNQQREDIERQRKLLAKRKPPTANNSQAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 GHFTTVRHGASFTEQWTDGFAFQNLVKQQEWVNQQREDIERQRKLLAKRKPPTANNSQAP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD STNSEPKQRKNKAVNGAENDPFVRPNLPQLLTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKKEEAEIQAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 STNSEPKQRKNKAVNGAENDPFVRPNLPQLLTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKKEEAEIQAE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD LERLERVRNLHIRELKRINNEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLYEQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 LERLERVRNLHIRELKRINNEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLYEQR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD YAAVKIHQLNKSWRDEKKENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDTFCTVLEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 YAAVKIHQLNKSWRDEKKENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDTFCTVLEY
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD CEGNDLDFYLKQHKLMSEKEARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVDGTAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 CEGNDLDFYLKQHKLMSEKEARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVDGTAC
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD GEIKITDFGLSKIMDDDSYGVDGMDLTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 GEIKITDFGLSKIMDDDSYGVDGMDLTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD GVIFFQCLYGRKPFGHNQSQQDILQENTILKATEVQFPVKPVVSSEAKAFIRRCLAYRKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 GVIFFQCLYGRKPFGHNQSQQDILQENTILKATEVQFPVKPVVSSEAKAFIRRCLAYRKE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760      
pF1KSD DRFDVHQLANDPYLLPHMRRSNSSGNLHMAGLTASPTPPSSSIITY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 DRFDVHQLANDPYLLPHMRRSNSSGNLHMAGLTASPTPPSSSIITY
              730       740       750       760      

>>CCDS46447.1 TLK1 gene_id:9874|Hs108|chr2                (718 aa)
 initn: 4784 init1: 4784 opt: 4784  Z-score: 2492.8  bits: 471.9 E(32554): 1.6e-132
Smith-Waterman score: 4784; 100.0% identity (100.0% similar) in 718 aa overlap (49-766:1-718)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KSD LSTSPTPGSAAAARSLLNHTPPSGRPREGAMDELHSLDPRRQELLEARFTGVASGSTGST
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46                               MDELHSLDPRRQELLEARFTGVASGSTGST
                                             10        20        30

       80        90       100       110       120       130        
pF1KSD GSCSVGAKASTNNESSNHSFGSLGSLSDKESETPEKKQSESSRGRKRKAENQNESSQGKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GSCSVGAKASTNNESSNHSFGSLGSLSDKESETPEKKQSESSRGRKRKAENQNESSQGKS
               40        50        60        70        80        90

      140       150       160       170       180       190        
pF1KSD IGGRGHKISDYFEYQGGNGSSPVRGIPPAIRSPQNSHSHSTPSSSVRPNSPSPTALAFGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IGGRGHKISDYFEYQGGNGSSPVRGIPPAIRSPQNSHSHSTPSSSVRPNSPSPTALAFGD
              100       110       120       130       140       150

      200       210       220       230       240       250        
pF1KSD HPIVQPKQLSFKIIQTDLTMLKLAALESNKIQDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HPIVQPKQLSFKIIQTDLTMLKLAALESNKIQDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQK
              160       170       180       190       200       210

      260       270       280       290       300       310        
pF1KSD LLEKYKERLNKCISMSKKLLIEKSTQEKLSSREKSMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LLEKYKERLNKCISMSKKLLIEKSTQEKLSSREKSMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTD
              220       230       240       250       260       270

      320       330       340       350       360       370        
pF1KSD GFAFQNLVKQQEWVNQQREDIERQRKLLAKRKPPTANNSQAPSTNSEPKQRKNKAVNGAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GFAFQNLVKQQEWVNQQREDIERQRKLLAKRKPPTANNSQAPSTNSEPKQRKNKAVNGAE
              280       290       300       310       320       330

      380       390       400       410       420       430        
pF1KSD NDPFVRPNLPQLLTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKKEEAEIQAELERLERVRNLHIRELKRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NDPFVRPNLPQLLTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKKEEAEIQAELERLERVRNLHIRELKRI
              340       350       360       370       380       390

      440       450       460       470       480       490        
pF1KSD NNEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLYEQRYAAVKIHQLNKSWRDEKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NNEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLYEQRYAAVKIHQLNKSWRDEKK
              400       410       420       430       440       450

      500       510       520       530       540       550        
pF1KSD ENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDTFCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDTFCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSE
              460       470       480       490       500       510

      560       570       580       590       600       610        
pF1KSD KEARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVDGTACGEIKITDFGLSKIMDDDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KEARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVDGTACGEIKITDFGLSKIMDDDS
              520       530       540       550       560       570

      620       630       640       650       660       670        
pF1KSD YGVDGMDLTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSVGVIFFQCLYGRKPFGHNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YGVDGMDLTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSVGVIFFQCLYGRKPFGHNQ
              580       590       600       610       620       630

      680       690       700       710       720       730        
pF1KSD SQQDILQENTILKATEVQFPVKPVVSSEAKAFIRRCLAYRKEDRFDVHQLANDPYLLPHM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SQQDILQENTILKATEVQFPVKPVVSSEAKAFIRRCLAYRKEDRFDVHQLANDPYLLPHM
              640       650       660       670       680       690

      740       750       760      
pF1KSD RRSNSSGNLHMAGLTASPTPPSSSIITY
       ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RRSNSSGNLHMAGLTASPTPPSSSIITY
              700       710        

>>CCDS46448.1 TLK1 gene_id:9874|Hs108|chr2                (670 aa)
 initn: 4392 init1: 4392 opt: 4392  Z-score: 2290.8  bits: 434.4 E(32554): 2.8e-121
Smith-Waterman score: 4392; 99.8% identity (100.0% similar) in 657 aa overlap (110-766:14-670)

      80        90       100       110       120       130         
pF1KSD SCSVGAKASTNNESSNHSFGSLGSLSDKESETPEKKQSESSRGRKRKAENQNESSQGKSI
                                     .:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46                  MAVLFLYDLKTTGKTPEKKQSESSRGRKRKAENQNESSQGKSI
                                10        20        30        40   

     140       150       160       170       180       190         
pF1KSD GGRGHKISDYFEYQGGNGSSPVRGIPPAIRSPQNSHSHSTPSSSVRPNSPSPTALAFGDH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GGRGHKISDYFEYQGGNGSSPVRGIPPAIRSPQNSHSHSTPSSSVRPNSPSPTALAFGDH
            50        60        70        80        90       100   

     200       210       220       230       240       250         
pF1KSD PIVQPKQLSFKIIQTDLTMLKLAALESNKIQDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PIVQPKQLSFKIIQTDLTMLKLAALESNKIQDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKL
           110       120       130       140       150       160   

     260       270       280       290       300       310         
pF1KSD LEKYKERLNKCISMSKKLLIEKSTQEKLSSREKSMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LEKYKERLNKCISMSKKLLIEKSTQEKLSSREKSMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDG
           170       180       190       200       210       220   

     320       330       340       350       360       370         
pF1KSD FAFQNLVKQQEWVNQQREDIERQRKLLAKRKPPTANNSQAPSTNSEPKQRKNKAVNGAEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FAFQNLVKQQEWVNQQREDIERQRKLLAKRKPPTANNSQAPSTNSEPKQRKNKAVNGAEN
           230       240       250       260       270       280   

     380       390       400       410       420       430         
pF1KSD DPFVRPNLPQLLTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKKEEAEIQAELERLERVRNLHIRELKRIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DPFVRPNLPQLLTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKKEEAEIQAELERLERVRNLHIRELKRIN
           290       300       310       320       330       340   

     440       450       460       470       480       490         
pF1KSD NEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLYEQRYAAVKIHQLNKSWRDEKKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLYEQRYAAVKIHQLNKSWRDEKKE
           350       360       370       380       390       400   

     500       510       520       530       540       550         
pF1KSD NYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDTFCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDTFCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSEK
           410       420       430       440       450       460   

     560       570       580       590       600       610         
pF1KSD EARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVDGTACGEIKITDFGLSKIMDDDSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVDGTACGEIKITDFGLSKIMDDDSY
           470       480       490       500       510       520   

     620       630       640       650       660       670         
pF1KSD GVDGMDLTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSVGVIFFQCLYGRKPFGHNQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GVDGMDLTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSVGVIFFQCLYGRKPFGHNQS
           530       540       550       560       570       580   

     680       690       700       710       720       730         
pF1KSD QQDILQENTILKATEVQFPVKPVVSSEAKAFIRRCLAYRKEDRFDVHQLANDPYLLPHMR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QQDILQENTILKATEVQFPVKPVVSSEAKAFIRRCLAYRKEDRFDVHQLANDPYLLPHMR
           590       600       610       620       630       640   

     740       750       760      
pF1KSD RSNSSGNLHMAGLTASPTPPSSSIITY
       :::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RSNSSGNLHMAGLTASPTPPSSSIITY
           650       660       670

>>CCDS45753.1 TLK2 gene_id:11011|Hs108|chr17              (718 aa)
 initn: 3333 init1: 1488 opt: 2411  Z-score: 1268.1  bits: 245.3 E(32554): 2.6e-64
Smith-Waterman score: 3423; 73.4% identity (85.3% similar) in 741 aa overlap (49-762:2-715)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KSD LSTSPTPGSAAAARSLLNHTPPSGRPREGAMDELHSLDPRRQELLEARFTGVASGSTGST
                                     :.::::::::::::::::::::.       
CCDS45                              MMEELHSLDPRRQELLEARFTGVGV------
                                            10        20           

       80        90       100       110       120       130        
pF1KSD GSCSVGAKASTNNESSNHSFGSLGSLSDKESETPEKKQSESSRGRKRKAENQNESSQGKS
             .:.  :.::::.:. :.::::::: :::::::... :.::::::   :.::::.
CCDS45 ------SKGPLNSESSNQSLCSVGSLSDKEVETPEKKQNDQ-RNRKRKAE-PYETSQGKG
                30        40        50        60          70       

      140       150             160                      170       
pF1KSD IGGRGHKISDYFEYQ------GGNGSSPVRG------IP---------PAIRSPQNSHSH
          :::::::::: .      : .::.  ..      .:         : . . : ..  
CCDS45 TP-RGHKISDYFERRVEQPLYGLDGSAAKEATEEQSALPTLMSVMLAKPRLDTEQLAQRG
         80        90       100       110       120       130      

          180       190       200         210       220       230  
pF1KSD ST---PSSSVRPNSPSPTALAFGDHPIVQPKQLSF--KIIQTDLTMLKLAALESNKIQDL
       .       :.. :::: :. .  .:   . ::.:.  .  :.:::. :..:::..: .::
CCDS45 AGLCFTFVSAQQNSPSSTGSGNTEHSCSSQKQISIQHRQTQSDLTIEKISALENSKNSDL
        140       150       160       170       180       190      

            240       250       260       270       280       290  
pF1KSD EKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKLLEKYKERLNKCISMSKKLLIEKSTQEKLSSREK
       ::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:..:::::::::: :::.. :.:
CCDS45 EKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKMLEKYKERLNRCVTMSKKLLIEKSKQEKMACRDK
        200       210       220       230       240       250      

            300       310       320       330       340       350  
pF1KSD SMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDGFAFQNLVKQQEWVNQQREDIERQRKLLAKRKPP
       :::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::: .:.:::.::::::.:::::::
CCDS45 SMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDGYAFQNLIKQQERINSQREEIERQRKMLAKRKPP
        260       270       280       290       300       310      

            360       370       380       390       400       410  
pF1KSD TANNSQAPSTNSEPKQRKNKAVNGAENDPFVRPNLPQLLTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKK
       . .  ::: ...: ::::.:. :::::.          ::::::::::::::::::::::
CCDS45 AMG--QAPPATNEQKQRKSKT-NGAENET---------LTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKK
          320       330        340                350       360    

            420       430       440       450       460       470  
pF1KSD EEAEIQAELERLERVRNLHIRELKRINNEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYK
       ::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS45 EEAEIQAELERLERVRNLHIRELKRIHNEDNSQFKDHPTLNDRYLLLHLLGRGGFSEVYK
          370       380       390       400       410       420    

            480       490       500       510       520       530  
pF1KSD AFDLYEQRYAAVKIHQLNKSWRDEKKENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTD
       :::: ::::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AFDLTEQRYVAVKIHQLNKNWRDEKKENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTD
          430       440       450       460       470       480    

            540       550       560       570       580       590  
pF1KSD TFCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSEKEARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNI
       .:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::::::
CCDS45 SFCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSEKEARSIIMQIVNALKYLNEIKPPIIHYDLKPGNI
          490       500       510       520       530       540    

            600       610       620        630       640       650 
pF1KSD LLVDGTACGEIKITDFGLSKIMDDDSYG-VDGMDLTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKI
       :::.:::::::::::::::::::::::. ::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LLVNGTACGEIKITDFGLSKIMDDDSYNSVDGMELTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKI
          550       560       570       580       590       600    

             660       670       680       690       700       710 
pF1KSD SNKVDVWSVGVIFFQCLYGRKPFGHNQSQQDILQENTILKATEVQFPVKPVVSSEAKAFI
       :::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::. ::::::
CCDS45 SNKVDVWSVGVIFYQCLYGRKPFGHNQSQQDILQENTILKATEVQFPPKPVVTPEAKAFI
          610       620       630       640       650       660    

             720       730       740       750       760      
pF1KSD RRCLAYRKEDRFDVHQLANDPYLLPHMRRSNSSGNLHMAGLTASPTPPSSSIITY
       :::::::::::.::.::: :::::::.:.: :...   :.....    ..:    
CCDS45 RRCLAYRKEDRIDVQQLACDPYLLPHIRKSVSTSSPAGAAIASTSGASNNSSSN 
          670       680       690       700       710         

>>CCDS62283.1 TLK2 gene_id:11011|Hs108|chr17              (772 aa)
 initn: 3342 init1: 1487 opt: 2298  Z-score: 1209.4  bits: 234.5 E(32554): 4.8e-61
Smith-Waterman score: 3448; 70.7% identity (81.8% similar) in 786 aa overlap (49-762:2-769)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KSD LSTSPTPGSAAAARSLLNHTPPSGRPREGAMDELHSLDPRRQELLEARFTGVASGSTGST
                                     :.::::::::::::::::::::.       
CCDS62                              MMEELHSLDPRRQELLEARFTGVGV------
                                            10        20           

       80        90       100       110       120       130        
pF1KSD GSCSVGAKASTNNESSNHSFGSLGSLSDKESETPEKKQSESSRGRKRKAENQNESSQGKS
             .:.  :.::::.:. :.::::::: :::::::... :.::::::   :.::::.
CCDS62 ------SKGPLNSESSNQSLCSVGSLSDKEVETPEKKQNDQ-RNRKRKAE-PYETSQGKG
                30        40        50        60          70       

      140       150         160       170        180               
pF1KSD IGGRGHKISDYFEYQGGN--GSSPVRGIPPAIRS-PQNSHSHSTPSSSVRP---------
          ::::::::::. ::.  :.:: :..::. :: ::.: :.  :    .:         
CCDS62 TP-RGHKISDYFEFAGGSAPGTSPGRSVPPVARSSPQHSLSNPLPRRVEQPLYGLDGSAA
         80        90       100       110       120       130      

                                                    190       200  
pF1KSD --------------------------------------------NSPSPTALAFGDHPIV
                                                   :::: :. .  .:   
CCDS62 KEATEEQSALPTLMSVMLAKPRLDTEQLAQRGAGLCFTFVSAQQNSPSSTGSGNTEHSCS
        140       150       160       170       180       190      

              210       220       230       240       250       260
pF1KSD QPKQLSF--KIIQTDLTMLKLAALESNKIQDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKLL
       . ::.:.  .  :.:::. :..:::..: .::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS62 SQKQISIQHRQTQSDLTIEKISALENSKNSDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKML
        200       210       220       230       240       250      

              270       280       290       300       310       320
pF1KSD EKYKERLNKCISMSKKLLIEKSTQEKLSSREKSMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDGF
       ::::::::.:..:::::::::: :::.. :.::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS62 EKYKERLNRCVTMSKKLLIEKSKQEKMACRDKSMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDGY
        260       270       280       290       300       310      

              330       340       350       360       370       380
pF1KSD AFQNLVKQQEWVNQQREDIERQRKLLAKRKPPTANNSQAPSTNSEPKQRKNKAVNGAEND
       :::::.:::: .:.:::.::::::.:::::::. .  ::: ...: ::::.:. :::::.
CCDS62 AFQNLIKQQERINSQREEIERQRKMLAKRKPPAMG--QAPPATNEQKQRKSKT-NGAENE
        320       330       340       350         360        370   

                    390              400       410       420       
pF1KSD -PF-----VRPNLPQL-------LTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKKEEAEIQAELERLERV
        :      .. . : :       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 TPSSGNTELKDTAPALGAHSLLRLTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKKEEAEIQAELERLERV
           380       390       400       410       420       430   

       430       440       450       460       470       480       
pF1KSD RNLHIRELKRINNEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLYEQRYAAVKIH
       :::::::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::: ::::.:::::
CCDS62 RNLHIRELKRIHNEDNSQFKDHPTLNDRYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLTEQRYVAVKIH
           440       450       460       470       480       490   

       490       500       510       520       530       540       
pF1KSD QLNKSWRDEKKENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDTFCTVLEYCEGNDLD
       ::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS62 QLNKNWRDEKKENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDSFCTVLEYCEGNDLD
           500       510       520       530       540       550   

       550       560       570       580       590       600       
pF1KSD FYLKQHKLMSEKEARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVDGTACGEIKITD
       :::::::::::::::::.:::::::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS62 FYLKQHKLMSEKEARSIIMQIVNALKYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVNGTACGEIKITD
           560       570       580       590       600       610   

       610       620        630       640       650       660      
pF1KSD FGLSKIMDDDSYG-VDGMDLTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSVGVIFFQ
       ::::::::::::. ::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS62 FGLSKIMDDDSYNSVDGMELTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSVGVIFYQ
           620       630       640       650       660       670   

        670       680       690       700       710       720      
pF1KSD CLYGRKPFGHNQSQQDILQENTILKATEVQFPVKPVVSSEAKAFIRRCLAYRKEDRFDVH
       :::::::::::::::::::::::::::::::: ::::. :::::::::::::::::.::.
CCDS62 CLYGRKPFGHNQSQQDILQENTILKATEVQFPPKPVVTPEAKAFIRRCLAYRKEDRIDVQ
           680       690       700       710       720       730   

        730       740       750       760      
pF1KSD QLANDPYLLPHMRRSNSSGNLHMAGLTASPTPPSSSIITY
       ::: :::::::.:.: :...   :.....    ..:    
CCDS62 QLACDPYLLPHIRKSVSTSSPAGAAIASTSGASNNSSSN 
           740       750       760       770   

>>CCDS82182.1 TLK2 gene_id:11011|Hs108|chr17              (601 aa)
 initn: 3095 init1: 1488 opt: 2287  Z-score: 1205.0  bits: 233.4 E(32554): 8.5e-61
Smith-Waterman score: 3133; 81.1% identity (91.9% similar) in 583 aa overlap (183-762:28-598)

            160       170       180       190       200         210
pF1KSD QGGNGSSPVRGIPPAIRSPQNSHSHSTPSSSVRPNSPSPTALAFGDHPIVQPKQLSF--K
                                     :.. :::: :. .  .:   . ::.:.  .
CCDS82    MSVMLAKPRLDTEQLAQRGAGLCFTFVSAQQNSPSSTGSGNTEHSCSSQKQISIQHR
                  10        20        30        40        50       

              220       230       240       250       260       270
pF1KSD IIQTDLTMLKLAALESNKIQDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKLLEKYKERLNKC
         :.:::. :..:::..: .::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:
CCDS82 QTQSDLTIEKISALENSKNSDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKMLEKYKERLNRC
        60        70        80        90       100       110       

              280       290       300       310       320       330
pF1KSD ISMSKKLLIEKSTQEKLSSREKSMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDGFAFQNLVKQQE
       ..:::::::::: :::.. :.::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::::
CCDS82 VTMSKKLLIEKSKQEKMACRDKSMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDGYAFQNLIKQQE
       120       130       140       150       160       170       

              340       350       360       370       380       390
pF1KSD WVNQQREDIERQRKLLAKRKPPTANNSQAPSTNSEPKQRKNKAVNGAENDPFVRPNLPQL
        .:.:::.::::::.:::::::.   .::: ...: ::::.:. :::::.          
CCDS82 RINSQREEIERQRKMLAKRKPPAM--GQAPPATNEQKQRKSKT-NGAENET---------
       180       190       200         210        220              

              400       410       420       430       440       450
pF1KSD LTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKKEEAEIQAELERLERVRNLHIRELKRINNEDNSQFKDHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS82 LTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKKEEAEIQAELERLERVRNLHIRELKRIHNEDNSQFKDHP
         230       240       250       260       270       280     

              460       470       480       490       500       510
pF1KSD TLNERYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLYEQRYAAVKIHQLNKSWRDEKKENYHKHACREYR
       :::.:::::::::::::::::::::: ::::.:::::::::.::::::::::::::::::
CCDS82 TLNDRYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLTEQRYVAVKIHQLNKNWRDEKKENYHKHACREYR
         290       300       310       320       330       340     

              520       530       540       550       560       570
pF1KSD IHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDTFCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSEKEARSIVMQIVN
       ::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS82 IHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDSFCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSEKEARSIIMQIVN
         350       360       370       380       390       400     

              580       590       600       610       620          
pF1KSD ALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVDGTACGEIKITDFGLSKIMDDDSYG-VDGMDLTSQ
       ::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::. ::::.::::
CCDS82 ALKYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVNGTACGEIKITDFGLSKIMDDDSYNSVDGMELTSQ
         410       420       430       440       450       460     

     630       640       650       660       670       680         
pF1KSD GAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSVGVIFFQCLYGRKPFGHNQSQQDILQENTI
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSVGVIFYQCLYGRKPFGHNQSQQDILQENTI
         470       480       490       500       510       520     

     690       700       710       720       730       740         
pF1KSD LKATEVQFPVKPVVSSEAKAFIRRCLAYRKEDRFDVHQLANDPYLLPHMRRSNSSGNLHM
       ::::::::: ::::. :::::::::::::::::.::.::: :::::::.:.: :...   
CCDS82 LKATEVQFPPKPVVTPEAKAFIRRCLAYRKEDRIDVQQLACDPYLLPHIRKSVSTSSPAG
         530       540       550       560       570       580     

     750       760      
pF1KSD AGLTASPTPPSSSIITY
       :.....    ..:    
CCDS82 AAIASTSGASNNSSSN 
         590       600  

>>CCDS11633.1 TLK2 gene_id:11011|Hs108|chr17              (750 aa)
 initn: 3380 init1: 1488 opt: 2287  Z-score: 1203.9  bits: 233.5 E(32554): 9.8e-61
Smith-Waterman score: 3453; 71.5% identity (82.4% similar) in 773 aa overlap (49-762:2-747)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KSD LSTSPTPGSAAAARSLLNHTPPSGRPREGAMDELHSLDPRRQELLEARFTGVASGSTGST
                                     :.::::::::::::::::::::.       
CCDS11                              MMEELHSLDPRRQELLEARFTGVGV------
                                            10        20           

       80        90       100       110       120       130        
pF1KSD GSCSVGAKASTNNESSNHSFGSLGSLSDKESETPEKKQSESSRGRKRKAENQNESSQGKS
             .:.  :.::::.:. :.::::::: :::::::... :.::::::   :.::::.
CCDS11 ------SKGPLNSESSNQSLCSVGSLSDKEVETPEKKQNDQ-RNRKRKAE-PYETSQGKG
                30        40        50        60          70       

      140       150         160       170        180               
pF1KSD IGGRGHKISDYFEYQGGN--GSSPVRGIPPAIRS-PQNSHSHSTPSSSVRP---------
          ::::::::::. ::.  :.:: :..::. :: ::.: :.  :    .:         
CCDS11 TP-RGHKISDYFEFAGGSAPGTSPGRSVPPVARSSPQHSLSNPLPRRVEQPLYGLDGSAA
         80        90       100       110       120       130      

                                                    190       200  
pF1KSD --------------------------------------------NSPSPTALAFGDHPIV
                                                   :::: :. .  .:   
CCDS11 KEATEEQSALPTLMSVMLAKPRLDTEQLAQRGAGLCFTFVSAQQNSPSSTGSGNTEHSCS
        140       150       160       170       180       190      

              210       220       230       240       250       260
pF1KSD QPKQLSF--KIIQTDLTMLKLAALESNKIQDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKLL
       . ::.:.  .  :.:::. :..:::..: .::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS11 SQKQISIQHRQTQSDLTIEKISALENSKNSDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKML
        200       210       220       230       240       250      

              270       280       290       300       310       320
pF1KSD EKYKERLNKCISMSKKLLIEKSTQEKLSSREKSMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDGF
       ::::::::.:..:::::::::: :::.. :.::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS11 EKYKERLNRCVTMSKKLLIEKSKQEKMACRDKSMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDGY
        260       270       280       290       300       310      

              330       340       350       360       370       380
pF1KSD AFQNLVKQQEWVNQQREDIERQRKLLAKRKPPTANNSQAPSTNSEPKQRKNKAVNGAEND
       :::::.:::: .:.:::.::::::.:::::::. .  ::: ...: ::::.:. :::::.
CCDS11 AFQNLIKQQERINSQREEIERQRKMLAKRKPPAMG--QAPPATNEQKQRKSKT-NGAENE
        320       330       340       350         360        370   

              390       400       410       420       430       440
pF1KSD PFVRPNLPQLLTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKKEEAEIQAELERLERVRNLHIRELKRINN
                 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS11 T---------LTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKKEEAEIQAELERLERVRNLHIRELKRIHN
                    380       390       400       410       420    

              450       460       470       480       490       500
pF1KSD EDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLYEQRYAAVKIHQLNKSWRDEKKEN
       :::::::::::::.:::::::::::::::::::::: ::::.:::::::::.::::::::
CCDS11 EDNSQFKDHPTLNDRYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLTEQRYVAVKIHQLNKNWRDEKKEN
          430       440       450       460       470       480    

              510       520       530       540       550       560
pF1KSD YHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDTFCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSEKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDSFCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSEKE
          490       500       510       520       530       540    

              570       580       590       600       610       620
pF1KSD ARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVDGTACGEIKITDFGLSKIMDDDSYG
       ::::.:::::::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.
CCDS11 ARSIIMQIVNALKYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVNGTACGEIKITDFGLSKIMDDDSYN
          550       560       570       580       590       600    

               630       640       650       660       670         
pF1KSD -VDGMDLTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSVGVIFFQCLYGRKPFGHNQS
        ::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS11 SVDGMELTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSVGVIFYQCLYGRKPFGHNQS
          610       620       630       640       650       660    

     680       690       700       710       720       730         
pF1KSD QQDILQENTILKATEVQFPVKPVVSSEAKAFIRRCLAYRKEDRFDVHQLANDPYLLPHMR
       ::::::::::::::::::: ::::. :::::::::::::::::.::.::: :::::::.:
CCDS11 QQDILQENTILKATEVQFPPKPVVTPEAKAFIRRCLAYRKEDRIDVQQLACDPYLLPHIR
          670       680       690       700       710       720    

     740       750       760      
pF1KSD RSNSSGNLHMAGLTASPTPPSSSIITY
       .: :...   :.....    ..:    
CCDS11 KSVSTSSPAGAAIASTSGASNNSSSN 
          730       740       750 




766 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 00:10:57 2016 done: Thu Nov  3 00:10:58 2016
 Total Scan time:  3.220 Total Display time:  0.120

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com