Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB4514
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4514, 1620 aa
1>>>pF1KB4514 1620 - 1620 aa - 1620 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1133+/-0.00109; mu= 7.6797+/- 0.065
mean_var=352.1804+/-81.869, 0's: 0 Z-trim(111.9): 361 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.068343
statistics sampled from 12347 (12790) to 12347 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.713), E-opt: 0.2 (0.393), width: 16
Scan time: 5.830
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33172.1 ALK gene_id:238|Hs108|chr2 (1620) 11178 1118.2 0
CCDS10077.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 864) 2626 274.7 9.4e-73
CCDS10078.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 803) 2142 226.9 2.1e-58
CCDS45237.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 734) 1510 164.6 1.1e-39
CCDS5116.1 ROS1 gene_id:6098|Hs108|chr6 (2347) 1024 117.3 6.2e-25
CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1366) 939 108.6 1.5e-22
CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1367) 939 108.6 1.5e-22
CCDS1160.1 INSRR gene_id:3645|Hs108|chr1 (1297) 910 105.7 1e-21
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1370) 899 104.7 2.3e-21
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1382) 899 104.7 2.3e-21
CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 822) 793 93.9 2.3e-18
CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 838) 793 93.9 2.3e-18
CCDS30890.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 760) 792 93.8 2.4e-18
CCDS30891.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 790) 792 93.8 2.4e-18
CCDS1161.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 796) 792 93.8 2.4e-18
CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 817) 781 92.7 5.2e-18
CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 825) 781 92.7 5.2e-18
CCDS12574.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 885) 764 91.1 1.8e-17
CCDS62677.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 626) 758 90.3 2.1e-17
CCDS12575.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 894) 758 90.5 2.7e-17
CCDS626.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1 ( 937) 726 87.4 2.4e-16
CCDS4887.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1014) 722 87.0 3.4e-16
CCDS4886.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 ( 940) 715 86.3 5.2e-16
CCDS4885.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1030) 715 86.4 5.5e-16
CCDS4884.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1070) 715 86.4 5.6e-16
CCDS59021.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1078) 715 86.4 5.6e-16
CCDS2094.1 MERTK gene_id:10461|Hs108|chr2 ( 999) 710 85.8 7.6e-16
CCDS81866.1 TYRO3 gene_id:7301|Hs108|chr15 ( 845) 692 84.0 2.3e-15
CCDS10080.1 TYRO3 gene_id:7301|Hs108|chr15 ( 890) 692 84.0 2.4e-15
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3 ( 984) 672 82.1 1e-14
CCDS3354.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 694) 668 81.5 1.1e-14
CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 806) 668 81.6 1.2e-14
CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 808) 668 81.6 1.2e-14
CCDS78389.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9 ( 976) 662 81.1 2e-14
CCDS82777.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1294) 664 81.5 2.1e-14
CCDS58833.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1351) 664 81.5 2.1e-14
CCDS2807.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1400) 664 81.5 2.2e-14
CCDS78096.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 734) 656 80.4 2.5e-14
CCDS4411.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 762) 656 80.4 2.6e-14
CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 802) 656 80.4 2.6e-14
CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 731) 655 80.3 2.7e-14
CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 733) 655 80.3 2.7e-14
CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 812) 655 80.3 2.9e-14
CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 655 80.3 2.9e-14
CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 655 80.3 2.9e-14
CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 822) 655 80.3 2.9e-14
CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 853) 655 80.3 2.9e-14
CCDS75825.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9 (1081) 651 80.1 4.5e-14
CCDS6519.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9 (1124) 651 80.1 4.6e-14
CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 ( 986) 642 79.1 7.8e-14
>>CCDS33172.1 ALK gene_id:238|Hs108|chr2 (1620 aa)
initn: 11178 init1: 11178 opt: 11178 Z-score: 5973.7 bits: 1118.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 11178; 99.8% identity (100.0% similar) in 1620 aa overlap (1-1620:1-1620)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGAIGLLWLLPLLLSTAAVGSGMGTGQRAGSPAAGPPLQPREPLSYSRLQRKSLAVDFVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MGAIGLLWLLPLLLSTAAVGSGMGTGQRAGSPAAGPPLQPREPLSYSRLQRKSLAVDFVV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 PSLFRVYARDLLLPPSSSELKAGRPEARGSLALDCAPLLRLLGPAPGVSWTAGSPAPAEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PSLFRVYARDLLLPPSSSELKAGRPEARGSLALDCAPLLRLLGPAPGVSWTAGSPAPAEA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 RTLSRVLKGGSVRKLRRAKQLVLELGEEAILEGCVGPPGEAAVGLLQFNLSELFSWWIRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RTLSRVLKGGSVRKLRRAKQLVLELGEEAILEGCVGPPGEAAVGLLQFNLSELFSWWIRQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 GEGRLRIRLMPEKKASEVGREGRLSAAIRASQPRLLFQIFGTGHSSLESPTNMPSPSPDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GEGRLRIRLMPEKKASEVGREGRLSAAIRASQPRLLFQIFGTGHSSLESPTNMPSPSPDY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 FTWNLTWIMKDSFPFLSHRSRYGLECSFDFPCELEYSPPLHDLRNQSWSWRRIPSEEASQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FTWNLTWIMKDSFPFLSHRSRYGLECSFDFPCELEYSPPLHDLRNQSWSWRRIPSEEASQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 MDLLDGPGAERSKEMPRGSFLLLNTSADSKHTILSPWMRSSSEHCTLAVSVHRHLQPSGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MDLLDGPGAERSKEMPRGSFLLLNTSADSKHTILSPWMRSSSEHCTLAVSVHRHLQPSGR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 YIAQLLPHNEAAREILLMPTPGKHGWTVLQGRIGRPDNPFRVALEYISSGNRSLSAVDFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YIAQLLPHNEAAREILLMPTPGKHGWTVLQGRIGRPDNPFRVALEYISSGNRSLSAVDFF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 ALKNCSEGTSPGSKMALQSSFTCWNGTVLQLGQACDFHQDCAQGEDESQMCRKLPVGFYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ALKNCSEGTSPGSKMALQSSFTCWNGTVLQLGQACDFHQDCAQGEDESQMCRKLPVGFYC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 NFEDGFCGWTQGTLSPHTPQWQVRTLKDARFQDHQDHALLLSTTDVPASESATVTSATFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NFEDGFCGWTQGTLSPHTPQWQVRTLKDARFQDHQDHALLLSTTDVPASESATVTSATFP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 APIKSSPCELRMSWLIRGVLRGNVSLVLVENKTGKEQGRMVWHVAAYEGLSLWQWMVLPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 APIKSSPCELRMSWLIRGVLRGNVSLVLVENKTGKEQGRMVWHVAAYEGLSLWQWMVLPL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 LDVSDRFWLQMVAWWGQGSRAIVAFDNISISLDCYLTISGEDKILQNTAPKSRNLFERNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LDVSDRFWLQMVAWWGQGSRAIVAFDNISISLDCYLTISGEDKILQNTAPKSRNLFERNP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 NKELKPGENSPRQTPIFDPTVHWLFTTCGASGPHGPTQAQCNNAYQNSNLSVEVGSEGPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NKELKPGENSPRQTPIFDPTVHWLFTTCGASGPHGPTQAQCNNAYQNSNLSVEVGSEGPL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 KGIQIWKVPATDTYSISGYGAAGGKGGKNTMMRSHGVSVLGIFNLEKDDMLYILVGQQGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KGIQIWKVPATDTYSISGYGAAGGKGGKNTMMRSHGVSVLGIFNLEKDDMLYILVGQQGE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 DACPSTNQLIQKVCIGENNVIEEEIRVNRSVHEWAGGGGGGGGATYVFKMKDGVPVPLII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DACPSTNQLIQKVCIGENNVIEEEIRVNRSVHEWAGGGGGGGGATYVFKMKDGVPVPLII
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 AAGGGGRAYGAKTDTFHPERLENNSSVLGLNGNSGAAGGGGGWNDNTSLLWAGKSLQEGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AAGGGGRAYGAKTDTFHPERLENNSSVLGLNGNSGAAGGGGGWNDNTSLLWAGKSLQEGA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 TGGHSCPQAMKKWGWETRGGFGGGGGGCSSGGGGGGYIGGNAASNNDPEMDGEDGVSFIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TGGHSCPQAMKKWGWETRGGFGGGGGGCSSGGGGGGYIGGNAASNNDPEMDGEDGVSFIS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 PLGILYTPALKVMEGHGEVNIKHYLNCSHCEVDECHMDPESHKVICFCDHGTVLAEDGVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PLGILYTPALKVMEGHGEVNIKHYLNCSHCEVDECHMDPESHKVICFCDHGTVLAEDGVS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 CIVSPTPEPHLPLSLILSVVTSALVAALVLAFSGIMIVYRRKHQELQAMQMELQSPEYKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CIVSPTPEPHLPLSLILSVVTSALVAALVLAFSGIMIVYRRKHQELQAMQMELQSPEYKL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB4 SKLRTSTIMTDYNPNYCFAGKTSSISDLKEVPRKNITLIRGLGHGAFGEVYEGQVSGMPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SKLRTSTIMTDYNPNYCFAGKTSSISDLKEVPRKNITLIRGLGHGAFGEVYEGQVSGMPN
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB4 DPSPLQVAVKTLPEVCSEQDELDFLMEALIISKFNHQNIVRCIGVSLQSLPRFILLELMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DPSPLQVAVKTLPEVCSEQDELDFLMEALIISKFNHQNIVRCIGVSLQSLPRFILLELMA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB4 GGDLKSFLRETRPRPSQPSSLAMLDLLHVARDIACGCQYLEENHFIHRDIAARNCLLTCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GGDLKSFLRETRPRPSQPSSLAMLDLLHVARDIACGCQYLEENHFIHRDIAARNCLLTCP
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB4 GPGRVAKIGDFGMARDIYRASYYRKGGCAMLPVKWMPPEAFMEGIFTSKTDTWSFGVLLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GPGRVAKIGDFGMARDIYRASYYRKGGCAMLPVKWMPPEAFMEGIFTSKTDTWSFGVLLW
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB4 EIFSLGYMPYPSKSNQEVLEFVTSGGRMDPPKNCPGPVYRIMTQCWQHQPEDRPNFAIIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EIFSLGYMPYPSKSNQEVLEFVTSGGRMDPPKNCPGPVYRIMTQCWQHQPEDRPNFAIIL
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB4 ERIEYCTQDPDVINTALPIEYGPLVEEEEKVPVRPKDPEGVPPLLVSQQAKREEERSPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ERIEYCTQDPDVINTALPIEYGPLVEEEEKVPVRPKDPEGVPPLLVSQQAKREEERSPAA
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB4 PPPLPTTSSGKAAKKPTAAEVSVRVPRGPAVEGGHVNMAFSQSNPPSELHRVHGSRNKPT
::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS33 PPPLPTTSSGKAAKKPTAAEISVRVPRGPAVEGGHVNMAFSQSNPPSELHKVHGSRNKPT
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB4 SLWNPTYGSWFTEKPTKKNNPIAKKEPHERGNLGLEGSCTVPPNVATGRLPGASLLLEPS
::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SLWNPTYGSWFTEKPTKKNNPIAKKEPHDRGNLGLEGSCTVPPNVATGRLPGASLLLEPS
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB4 SLTANMKEVPLFRLRHFPCGNVNYGYQQQGLPLEAATAPGAGHYEDTILKSKNSMNQPGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SLTANMKEVPLFRLRHFPCGNVNYGYQQQGLPLEAATAPGAGHYEDTILKSKNSMNQPGP
1570 1580 1590 1600 1610 1620
>>CCDS10077.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 (864 aa)
initn: 2767 init1: 2275 opt: 2626 Z-score: 1419.7 bits: 274.7 E(32554): 9.4e-73
Smith-Waterman score: 3136; 55.5% identity (76.0% similar) in 859 aa overlap (608-1450:4-843)
580 590 600 610 620 630
pF1KB4 GRMVWHVAAYEGLSLWQWMVLPLLDVSDRFWLQMVAWWGQGSRAIVAFDNISISLDCYLT
: :...:.: .. . . . : . .:
CCDS10 MGCWGQLLVWFGAAGAILCSSPG---SQETFLR
10 20 30
640 650 660 670 680 690
pF1KB4 ISGEDKILQNTAPKSRNLFERNPNKELKPGENSPRQTPIFDPTVHWLFTTCGASGPHGPT
: : ..:. :. : . :.:. :: ..: . . :::.:::::: ::::
CCDS10 SSP----LPLASPSPRDPKVSAPPSILEPA--SPLNSPGTEGS--WLFSTCGASGRHGPT
40 50 60 70 80
700 710 720 730 740 750
pF1KB4 QAQCNNAYQNSNLSVEVGSEGPLKGIQIWKVPATDTYSISGYGAAGGKGGKNTMMRSHGV
:.::..:: .... : ::. : :.:.:.:.::. : ::.::::::::.:: . :.:::
CCDS10 QTQCDGAYAGTSVVVTVGAAGQLRGVQLWRVPGPGQYLISAYGAAGGKGAKNHLSRAHGV
90 100 110 120 130 140
760 770 780 790 800 810
pF1KB4 SVLGIFNLEKDDMLYILVGQQGEDACPSTNQLIQKVCIGENNVIEEEIRVNRS-----VH
: .::.: . ::::::::::::::. . : ::.::. ..::. .. : .
CCDS10 FVSAIFSLGLGESLYILVGQQGEDACPGGSPESQLVCLGESRAVEEHAAMDGSEGVPGSR
150 160 170 180 190 200
820 830 840 850 860
pF1KB4 EWAGGGGGGGGATYVFKMKDGVPVPLIIAAGGGGRAYGAKTDTFH----PERLENNSSVL
.:::::::::::::::... : ::..::::::::: : . ::.::: : .
CCDS10 RWAGGGGGGGGATYVFRVRAGELEPLLVAAGGGGRAYLRPRDRGRTQASPEKLENRSEAP
210 220 230 240 250 260
870 880 890 900 910 920
pF1KB4 GLNGNSGAAGGGGGWNDNTSLLWAGKSLQEGATGGHSCPQAMKKWGWETRGGFGGGGGGC
: .: .:::::::::.. . ::.:::::: ::..: .: :: . ::::::::.:
CCDS10 GSGGRGGAAGGGGGWTSRAPSPQAGRSLQEGAEGGQGCSEAWATLGWAAAGGFGGGGGAC
270 280 290 300 310 320
930 940 950 960 970 980
pF1KB4 SSGGGGGGYIGGNAASNNDPEMDGEDGVSFISPLGILYTPALKVMEGHGEVNIKHYLNCS
..::::::: ::.:. ... ::::::::: : . :. : : :.::::.:...::::
CCDS10 TAGGGGGGYRGGDASETDNLWADGEDGVSFIHPSSELFLQPLAVTENHGEVEIRRHLNCS
330 340 350 360 370 380
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KB4 HCEVDECHMDPESHKVICFCDHGTVLAEDGVSCIVSPTPEPHLPLSLILSVVTSALVAAL
:: . .:. . : . . :.: .: :: :.:.:. .: :: :...::... .. :
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pF1KB4 HCEVDECHMDPESHKVICFCDHGTVLAEDGVSCIVSPTPEPHLPLSLILSVVTSALVAAL
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CCDS10 YRRGDRALLPVKWMPPEAFLEGIFTSKTDSWSFGVLLWEIFSLGYMPYPGRTNQEVLDFV
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CCDS45 HCPLRDCQWQAELQLAECLCPEGMELAVDNVTCM--DLHKPPGPLVLMVAVVATSTLSLL
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pF1KB4 EKVPVRPKDPEGV-PPLLVSQQAKREEERSPAAPPPLPTTSSGKAAKKPTAAEVSVRVPR
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CCDS45 GTSGLGNRSLECLRPPQ--PQELSPEKLKSWGGSPLGPWLSSGLKPLKSRGLQPQNLWNP
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CCDS45 TYRS
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pF1KB4 MDPESHKVICFCDHGTVLAEDGVSCIVSPTPEPHLPLSLILSVVTSALVAALVLAFSGIM
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CCDS51 FRVVAANNLGFGEYSGISENIILVGDDFWIPETSFILTIIVGIF---LVVTIPLTF----
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CCDS51 VWHRRLKNQKSAKEGVTVLINEDKELAELRGLAAGVGLA-NACYAIHTLPTQEEIENLPA
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CCDS51 FPREKLTLRLLLGSGAFGEVYEGTAVDILGVGSGEIKVAVKTLKKGSTDQEKIEFLKEAH
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pF1KB4 IISKFNHQNIVRCIGVSLQSLPRFILLELMAGGDLKSFLRETRPRPSQPSSLAMLDLLHV
..::::: ::.. .:: : . :..:.:::: :::: ..::..: :...::. .
CCDS51 LMSKFNHPNILKQLGVCLLNEPQYIILELMEGGDLLTYLRKARMATFYGPLLTLVDLVDL
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::. :: :::. ::::::.::::::.. .: :..::::::.:::::. .::::
CCDS51 CVDISKGCVYLERMHFIHRDLAARNCLVSVKDYTSP-RIVKIGDFGLARDIYKNDYYRKR
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pF1KB4 GCAMLPVKWMPPEAFMEGIFTSKTDTWSFGVLLWEIFSLGYMPYPSKSNQEVLEFVTSGG
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CCDS51 GEGLLPVRWMAPESLMDGIFTTQSDVWSFGILIWEILTLGHQPYPAHSNLDVLNYVQTGG
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pF1KB4 RMDPPKNCPGPVYRIMTQCWQHQPEDRPNFAIILERIE----------YCTQDP----DV
:..::.::: .. .::::: ..:..::.: : .... : ..: :
CCDS51 RLEPPRNCPDDLWNLMTQCWAQEPDQRPTFHRIQDQLQLFRNFFLNSIYKSRDEANNSGV
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pF1KB4 INTALPIEYGPLV--EEEEKVPV---RPKDPEGVPPLLVSQQAKREEERSPAAPPPLPTT
:: .. : : .. . .. .:: . :. ::. .... . . ::.: . .
CCDS51 INESFEGEDGDVICLNSDDIMPVALMETKNREGLNYMVLATECGQGEEKSEGPLGSQESE
2240 2250 2260 2270 2280 2290
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pF1KB4 SSG--KAAKKPTAAEVSVRVPRGPAVEGGHVNMAFSQSNPPSELHRVHGSRNKPTSLWNP
: : : :.: :
CCDS51 SCGLRKEEKEPHADKDFCQEKQVAYCPSGKPEGLNYACLTHSGYGDGSD
2300 2310 2320 2330 2340
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pF1KB4 AFSGIMIVYRRKHQELQAMQMELQSPEYKLSKLRTSTIMTDYNPNYCFAGKTSSISDLKE
:.: ....... ::.: :.. . : :
CCDS73 HLIIALPVAVLLIVGGLVIMLYVFHRKRNNSRLGNGVLYASVNPEY-FSAADVYVPDEWE
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1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KB4 VPRKNITLIRGLGHGAFGEVYEGQVSGMPNDPSPLQVAVKTLPEVCSEQDELDFLMEALI
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CCDS73 VAREKITMSRELGQGSFGMVYEGVAKGVVKDEPETRVAIKTVNEAASMRERIEFLNEASV
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CCDS73 MKEFNCHHVVRLLGVVSQGQPTLVIMELMTRGDLKSYLRSLRPEMENNPVLAPPSLSKMI
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CCDS10 PEELDLEPENMESVP----------LDPSASSSSLPLPDRHSGHKAENGPGPGVLVLRAS
1290 1300 1310 1320 1330
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CCDS10 FDERQPYAHMNGGRKNERALPLPQSSTC
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CCDS11 PREQISIIRELGQGSFGMVYEGLARGLEAGEESTPVALKTVNELASPRECIEFLKEASVM
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CCDS11 KAFKCHHVVRLLGVVSQGQPTLVIMELMTRGDLKSHLRSLRPEAENNPGLPQP-ALGEMI
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CCDS11 QMAGEIADGMAYLAANKFVHRDLAARNCMVS---QDFTVKIGDFGMTRDVYETDYYRKGG
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pF1KB4 CAMLPVKWMPPEAFMEGIFTSKTDTWSFGVLLWEIFSLGYMPYPSKSNQEVLEFVTSGGR
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CCDS11 KGLLPVRWMAPESLKDGIFTTHSDVWSFGVVLWEIVTLAEQPYQGLSNEQVLKFVMDGGV
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CCDS11 LEELEGCPLQLQELMSRCWQPNPRLRPSFTHILDSIQEELR-PSF--RLLSFYYSPECRG
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pF1KB4 EE-KVPVRPKDPEGVP-PLLVSQQAKREEERSPAAPPPLPTTSSGKAAKKPTAAEVSVRV
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CCDS11 ARGSLPTTDAEPDSSPTPRDCSPQNGGPGH
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CCDS42 NCPERVTDLMRMCWQFNPKMRPTF---LEIVNLLKDD---LHPSFP-EVSFFHSEENKAP
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pF1KB4 ------VRPKDPEGVPPLLVSQQAKREEERSPAAPPPLPTTSSGKAAKKPTAAEVSVRVP
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CCDS42 ESEELEMEFEDMENVP-LDRSSHCQREEAGGRDGGSSLGFKRSYEEHIPYTHMNGGKKNG
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pF1KB4 VICFCDHGTVLAEDGVSCIVSPTPEPHLPLSLILSVVTSALVAALVLAFS---GIMIVYR
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CCDS12 SVRIRATSLAGNGSWTEPTYFYVTDYLDVPSNIAKIIIGPLI--FVFLFSVVIGSIYLFL
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pF1KB4 RKHQELQAMQMELQSPEYKLSKLRTSTIMTDYNPNYCFAGK----TSSISDLKEVPRKNI
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CCDS12 RKRQ-----------PDGPLGPLYASS-----NPEYLSASDVFPCSVYVPDEWEVSREKI
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pF1KB4 TLIRGLGHGAFGEVYEGQVSGMPNDPSPLQVAVKTLPEVCSEQDELDFLMEALIISKFNH
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CCDS12 TLLRELGQGSFGMVYEGNARDIIKGEAETRVAVKTVNESASLRERIEFLNEASVMKGFTC
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CCDS12 HHVVRLLGVVSKGQPTLVVMELMAHGDLKSYLRSLRPEAENNPGRPPP-TLQEMIQMAAE
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CCDS12 IADGMAYLNAKKFVHRDLAARNCMVA---HDFTVKIGDFGMTRDIYETDYYRKGGKGLLP
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pF1KB4 NCPGPVYRIMTQCWQHQPEDRPNFAIILERIEYCTQDPDVINTALPIEYGPLVEEEEKVP
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CCDS12 NCPERVTDLMRMCWQFNPKMRPTF---LEIVNLLKDD---LHPSFP-EVSFFHSEENKAP
1260 1270 1280 1290 1300 1310
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pF1KB4 ------VRPKDPEGVPPLLVSQQAKREEERSPAAPPPLPTTSSGKAAKKPTAAEVSVRVP
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CCDS12 ESEELEMEFEDMENVP-LDRSSHCQREEAGGRDGGSSLGFKRSYEEHIPYTHMNGGKKNG
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1620 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 22:55:53 2016 done: Wed Nov 2 22:55:54 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]