Result of FASTA (omim) for
pFN21AB4196
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4196, 957 aa
1>>>pF1KB4196 957 - 957 aa - 957 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6182+/-0.000404; mu= 10.9458+/- 0.025
mean_var=149.9415+/-29.667, 0's: 0 Z-trim(116.8): 133 B-trim: 72 in 3/52
Lambda= 0.104740
statistics sampled from 28064 (28241) to 28064 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.685), E-opt: 0.2 (0.331), width: 16
Scan time: 13.260
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001930 (OMIM: 300052) dystrophin-related protei ( 957) 6406 980.7 0
NP_001164655 (OMIM: 300052) dystrophin-related pro ( 879) 5833 894.1 0
XP_016884823 (OMIM: 300052) PREDICTED: dystrophin- ( 611) 4033 622.0 2.9e-177
XP_016884822 (OMIM: 300052) PREDICTED: dystrophin- ( 932) 3586 554.5 8.9e-157
NP_004013 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) dyst (1230) 3291 510.0 2.9e-143
XP_016884817 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) P (3672) 3290 510.2 7.7e-143
XP_006724533 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) P (3690) 3290 510.2 7.7e-143
XP_016866733 (OMIM: 128240) PREDICTED: utrophin is (3456) 3029 470.8 5.5e-131
NP_004005 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) dyst ( 956) 2709 422.0 7.1e-117
NP_004004 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) dyst (1225) 2709 422.1 8.6e-117
NP_004012 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) dyst (1243) 2709 422.1 8.7e-117
XP_016884820 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) P (1761) 2708 422.1 1.3e-116
NP_004003 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) dyst (2341) 2709 422.3 1.4e-116
NP_004002 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) dyst (2344) 2709 422.3 1.4e-116
NP_004001 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) dyst (3562) 2709 422.4 2e-116
NP_000100 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) dyst (3677) 2709 422.4 2.1e-116
NP_004000 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) dyst (3681) 2709 422.4 2.1e-116
NP_003997 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) dyst (3685) 2709 422.4 2.1e-116
XP_006724536 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) P (3657) 2708 422.3 2.3e-116
XP_011543769 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) P (3662) 2708 422.3 2.3e-116
XP_006724532 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) P (3695) 2708 422.3 2.3e-116
XP_006724531 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) P (3703) 2708 422.3 2.3e-116
NP_004011 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) dyst (1115) 2650 413.2 3.9e-114
NP_004014 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) dyst (1133) 2650 413.2 3.9e-114
XP_006724538 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) P (3575) 2649 413.3 1.1e-113
XP_006724537 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) P (3593) 2649 413.3 1.1e-113
XP_006715623 (OMIM: 128240) PREDICTED: utrophin is ( 957) 2527 394.5 1.3e-108
XP_011534411 (OMIM: 128240) PREDICTED: utrophin is ( 988) 2527 394.5 1.4e-108
XP_005267190 (OMIM: 128240) PREDICTED: utrophin is (3424) 2527 394.9 3.7e-108
XP_011534409 (OMIM: 128240) PREDICTED: utrophin is (3424) 2527 394.9 3.7e-108
XP_011534408 (OMIM: 128240) PREDICTED: utrophin is (3433) 2527 394.9 3.7e-108
XP_005267187 (OMIM: 128240) PREDICTED: utrophin is (3433) 2527 394.9 3.7e-108
NP_009055 (OMIM: 128240) utrophin [Homo sapiens] (3433) 2527 394.9 3.7e-108
XP_005267184 (OMIM: 128240) PREDICTED: utrophin is (3438) 2527 394.9 3.7e-108
XP_016866732 (OMIM: 128240) PREDICTED: utrophin is (3468) 2527 394.9 3.8e-108
XP_011534404 (OMIM: 128240) PREDICTED: utrophin is (3469) 2527 394.9 3.8e-108
XP_011534403 (OMIM: 128240) PREDICTED: utrophin is (3469) 2527 394.9 3.8e-108
NP_004008 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) dyst ( 604) 2281 357.2 1.4e-97
NP_004009 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) dyst ( 622) 2281 357.2 1.5e-97
XP_011543770 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) P (3295) 1953 308.2 4.6e-82
NP_004006 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) dyst ( 617) 1699 269.3 4.4e-71
NP_004007 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) dyst ( 635) 1699 269.3 4.5e-71
NP_004010 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) dyst ( 340) 1635 259.4 2.2e-68
XP_016881073 (OMIM: 601239,604169) PREDICTED: dyst ( 686) 575 99.5 6.4e-20
NP_116757 (OMIM: 601239,604169) dystrobrevin alpha ( 686) 575 99.5 6.4e-20
XP_016881065 (OMIM: 601239,604169) PREDICTED: dyst ( 727) 575 99.5 6.7e-20
XP_016881080 (OMIM: 601239,604169) PREDICTED: dyst ( 683) 571 98.9 9.7e-20
NP_001185869 (OMIM: 601239,604169) dystrobrevin al ( 683) 571 98.9 9.7e-20
XP_016881078 (OMIM: 601239,604169) PREDICTED: dyst ( 683) 571 98.9 9.7e-20
XP_016881077 (OMIM: 601239,604169) PREDICTED: dyst ( 683) 571 98.9 9.7e-20
>>NP_001930 (OMIM: 300052) dystrophin-related protein 2 (957 aa)
initn: 6406 init1: 6406 opt: 6406 Z-score: 5238.5 bits: 980.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6406; 100.0% identity (100.0% similar) in 957 aa overlap (1-957:1-957)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MQPMVMQGCPYTLPRCHDWQAADQFHHSSSLRSTCPHPQVRAAVTSPAPPQDGAGVPCLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MQPMVMQGCPYTLPRCHDWQAADQFHHSSSLRSTCPHPQVRAAVTSPAPPQDGAGVPCLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LKLLNGSVGASGPLEPPAMNLCWNEIKKKSHNLRARLEAFSDHSGKLQLPLQEIIDWLSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKLLNGSVGASGPLEPPAMNLCWNEIKKKSHNLRARLEAFSDHSGKLQLPLQEIIDWLSQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 KDEELSAQLPLQGDVALVQQEKETHAAFMEEVKSRGPYIYSVLESAQAFLSQHPFEELEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDEELSAQLPLQGDVALVQQEKETHAAFMEEVKSRGPYIYSVLESAQAFLSQHPFEELEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 PHSESKDTSPKQRIQNLSRFVWKQATVASELWEKLTARCVDQHRHIERTLEQLLEIQGAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PHSESKDTSPKQRIQNLSRFVWKQATVASELWEKLTARCVDQHRHIERTLEQLLEIQGAM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 EELSTTLSQAEGVRATWEPIGDLFIDSLPEHIQAIKLFKEEFSPMKDGVKLVNDLAHQLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EELSTTLSQAEGVRATWEPIGDLFIDSLPEHIQAIKLFKEEFSPMKDGVKLVNDLAHQLA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 ISDVHLSMENSQALEQINVRWKQLQASVSERLKQLQDAHRDFGPGSQHFLSSSVQVPWER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ISDVHLSMENSQALEQINVRWKQLQASVSERLKQLQDAHRDFGPGSQHFLSSSVQVPWER
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 AISPNKVPYYINHQAQTTCWDHPKMTELYQTLADLNNIKFSAYRTAMKLRRVQKALRLDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AISPNKVPYYINHQAQTTCWDHPKMTELYQTLADLNNIKFSAYRTAMKLRRVQKALRLDL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 VTLTTALEIFNEHDLQASEHVMDVVEVIHCLTALYERLEEERGILVNVPLCVDMSLNWLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VTLTTALEIFNEHDLQASEHVMDVVEVIHCLTALYERLEEERGILVNVPLCVDMSLNWLL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 NVFDSGRSGKMRALSFKTGIACLCGTEVKEKLQYLFSQVANSGSQCDQRHLGVLLHEAIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NVFDSGRSGKMRALSFKTGIACLCGTEVKEKLQYLFSQVANSGSQCDQRHLGVLLHEAIQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 VPRQLGEVAAFGGSNVEPSVRSCFRFSTGKPVIEASQFLEWVNLEPQSMVWLAVLHRVTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VPRQLGEVAAFGGSNVEPSVRSCFRFSTGKPVIEASQFLEWVNLEPQSMVWLAVLHRVTI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 AEQVKHQTKCSICRQCPIKGFRYRSLKQFNVDICQTCFLTGRASKGNKLHYPIMEYYTPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AEQVKHQTKCSICRQCPIKGFRYRSLKQFNVDICQTCFLTGRASKGNKLHYPIMEYYTPT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 TSSENMRDFATTLKNKFRSKHYFSKHPQRGYLPVQSVLEADYSETPASSPMWPHADTHSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSSENMRDFATTLKNKFRSKHYFSKHPQRGYLPVQSVLEADYSETPASSPMWPHADTHSR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 IEHFASRLAEMESQNCSFFNDSLSPDDSIDEDQYLLRHSSPITDREPAFGQQAPCSVATE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IEHFASRLAEMESQNCSFFNDSLSPDDSIDEDQYLLRHSSPITDREPAFGQQAPCSVATE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 SKGELQKILAHLEDENRILQGELRRLKWQHEEAAEAPSLADGSTEAATDHRNEELLAEAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SKGELQKILAHLEDENRILQGELRRLKWQHEEAAEAPSLADGSTEAATDHRNEELLAEAR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 ILRQHKSRLETRMQILEDHNKQLESQLQRLRELLLQPPTESDGSGSAGSSLASSPQQSEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ILRQHKSRLETRMQILEDHNKQLESQLQRLRELLLQPPTESDGSGSAGSSLASSPQQSEG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950
pF1KB4 SHPREKGQTTPDTEAADDVGSKSQDVSLCLEDIMEKLRHAFPSVRSSDVTANTLLAS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SHPREKGQTTPDTEAADDVGSKSQDVSLCLEDIMEKLRHAFPSVRSSDVTANTLLAS
910 920 930 940 950
>>NP_001164655 (OMIM: 300052) dystrophin-related protein (879 aa)
initn: 5833 init1: 5833 opt: 5833 Z-score: 4771.1 bits: 894.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5833; 100.0% identity (100.0% similar) in 879 aa overlap (79-957:1-879)
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 PPQDGAGVPCLSLKLLNGSVGASGPLEPPAMNLCWNEIKKKSHNLRARLEAFSDHSGKLQ
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MNLCWNEIKKKSHNLRARLEAFSDHSGKLQ
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 LPLQEIIDWLSQKDEELSAQLPLQGDVALVQQEKETHAAFMEEVKSRGPYIYSVLESAQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPLQEIIDWLSQKDEELSAQLPLQGDVALVQQEKETHAAFMEEVKSRGPYIYSVLESAQA
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 FLSQHPFEELEEPHSESKDTSPKQRIQNLSRFVWKQATVASELWEKLTARCVDQHRHIER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLSQHPFEELEEPHSESKDTSPKQRIQNLSRFVWKQATVASELWEKLTARCVDQHRHIER
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 TLEQLLEIQGAMEELSTTLSQAEGVRATWEPIGDLFIDSLPEHIQAIKLFKEEFSPMKDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TLEQLLEIQGAMEELSTTLSQAEGVRATWEPIGDLFIDSLPEHIQAIKLFKEEFSPMKDG
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 VKLVNDLAHQLAISDVHLSMENSQALEQINVRWKQLQASVSERLKQLQDAHRDFGPGSQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VKLVNDLAHQLAISDVHLSMENSQALEQINVRWKQLQASVSERLKQLQDAHRDFGPGSQH
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 FLSSSVQVPWERAISPNKVPYYINHQAQTTCWDHPKMTELYQTLADLNNIKFSAYRTAMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLSSSVQVPWERAISPNKVPYYINHQAQTTCWDHPKMTELYQTLADLNNIKFSAYRTAMK
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 LRRVQKALRLDLVTLTTALEIFNEHDLQASEHVMDVVEVIHCLTALYERLEEERGILVNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRRVQKALRLDLVTLTTALEIFNEHDLQASEHVMDVVEVIHCLTALYERLEEERGILVNV
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 PLCVDMSLNWLLNVFDSGRSGKMRALSFKTGIACLCGTEVKEKLQYLFSQVANSGSQCDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLCVDMSLNWLLNVFDSGRSGKMRALSFKTGIACLCGTEVKEKLQYLFSQVANSGSQCDQ
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KB4 RHLGVLLHEAIQVPRQLGEVAAFGGSNVEPSVRSCFRFSTGKPVIEASQFLEWVNLEPQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RHLGVLLHEAIQVPRQLGEVAAFGGSNVEPSVRSCFRFSTGKPVIEASQFLEWVNLEPQS
460 470 480 490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KB4 MVWLAVLHRVTIAEQVKHQTKCSICRQCPIKGFRYRSLKQFNVDICQTCFLTGRASKGNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVWLAVLHRVTIAEQVKHQTKCSICRQCPIKGFRYRSLKQFNVDICQTCFLTGRASKGNK
520 530 540 550 560 570
650 660 670 680 690 700
pF1KB4 LHYPIMEYYTPTTSSENMRDFATTLKNKFRSKHYFSKHPQRGYLPVQSVLEADYSETPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LHYPIMEYYTPTTSSENMRDFATTLKNKFRSKHYFSKHPQRGYLPVQSVLEADYSETPAS
580 590 600 610 620 630
710 720 730 740 750 760
pF1KB4 SPMWPHADTHSRIEHFASRLAEMESQNCSFFNDSLSPDDSIDEDQYLLRHSSPITDREPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPMWPHADTHSRIEHFASRLAEMESQNCSFFNDSLSPDDSIDEDQYLLRHSSPITDREPA
640 650 660 670 680 690
770 780 790 800 810 820
pF1KB4 FGQQAPCSVATESKGELQKILAHLEDENRILQGELRRLKWQHEEAAEAPSLADGSTEAAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FGQQAPCSVATESKGELQKILAHLEDENRILQGELRRLKWQHEEAAEAPSLADGSTEAAT
700 710 720 730 740 750
830 840 850 860 870 880
pF1KB4 DHRNEELLAEARILRQHKSRLETRMQILEDHNKQLESQLQRLRELLLQPPTESDGSGSAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DHRNEELLAEARILRQHKSRLETRMQILEDHNKQLESQLQRLRELLLQPPTESDGSGSAG
760 770 780 790 800 810
890 900 910 920 930 940
pF1KB4 SSLASSPQQSEGSHPREKGQTTPDTEAADDVGSKSQDVSLCLEDIMEKLRHAFPSVRSSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSLASSPQQSEGSHPREKGQTTPDTEAADDVGSKSQDVSLCLEDIMEKLRHAFPSVRSSD
820 830 840 850 860 870
950
pF1KB4 VTANTLLAS
:::::::::
NP_001 VTANTLLAS
>>XP_016884823 (OMIM: 300052) PREDICTED: dystrophin-rela (611 aa)
initn: 4033 init1: 4033 opt: 4033 Z-score: 3303.3 bits: 622.0 E(85289): 2.9e-177
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330 340 350 360 370 380
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..::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 METTTASVQVPWERAISPNKVPYYINHQAQTTCW
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390 400 410 420 430 440
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DHPKMTELYQTLADLNNIKFSAYRTAMKLRRVQKALRLDLVTLTTALEIFNEHDLQASEH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VMDVVEVIHCLTALYERLEEERGILVNVPLCVDMSLNWLLNVFDSGRSGKMRALSFKTGI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ACLCGTEVKEKLQYLFSQVANSGSQCDQRHLGVLLHEAIQVPRQLGEVAAFGGSNVEPSV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RSCFRFSTGKPVIEASQFLEWVNLEPQSMVWLAVLHRVTIAEQVKHQTKCSICRQCPIKG
220 230 240 250 260 270
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FRYRSLKQFNVDICQTCFLTGRASKGNKLHYPIMEYYTPTTSSENMRDFATTLKNKFRSK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DSLSPDDSIDEDQYLLRHSSPITDREPAFGQQAPCSVATESKGELQKILAHLEDENRILQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GELRRLKWQHEEAAEAPSLADGSTEAATDHRNEELLAEARILRQHKSRLETRMQILEDHN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KQLESQLQRLRELLLQPPTESDGSGSAGSSLASSPQQSEGSHPREKGQTTPDTEAADDVG
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SKSQDVSLCLEDIMEKLRHAFPSVRSSDVTANTLLAS
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>>XP_016884822 (OMIM: 300052) PREDICTED: dystrophin-rela (932 aa)
initn: 3583 init1: 3583 opt: 3586 Z-score: 2935.7 bits: 554.5 E(85289): 8.9e-157
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MQPMVMQGCPYTLPRCHDWQAADQFHHSSSLRSTCPHPQVRAAVTSPAPPQDGAGVPCLS
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LKLLNGSVGASGPLEPPAMNLCWNEIKKKSHNLRARLEAFSDHSGKLQLPLQEIIDWLSQ
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KDEELSAQLPLQGDVALVQQEKETHAAFMEEVKSRGPYIYSVLESAQAFLSQHPFEELEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PHSESKDTSPKQRIQNLSRFVWKQATVASELWEKLTARCVDQHRHIERTLEQLLEIQGAM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 EELSTTLSQAEGVRATWEPIGDLFIDSLPEHIQAIKLFKEEFSPMKDGVKLVNDLAHQLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EELSTTLSQAEGVRATWEPIGDLFIDSLPEHIQAIKLFKEEFSPMKDGVKLVNDLAHQLA
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ISDVHLSMENSQALEQINVRWKQLQASVSERLKQLQDAHRDFGPGSQHFLSSSVQVPWER
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:::::::::::::::::::::::::::::::: .::
XP_016 AISPNKVPYYINHQAQTTCWDHPKMTELYQTL-------------------------VDL
370 380 390
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VTLTTALEIFNEHDLQASEHVMDVVEVIHCLTALYERLEEERGILVNVPLCVDMSLNWLL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NVFDSGRSGKMRALSFKTGIACLCGTEVKEKLQYLFSQVANSGSQCDQRHLGVLLHEAIQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VPRQLGEVAAFGGSNVEPSVRSCFRFSTGKPVIEASQFLEWVNLEPQSMVWLAVLHRVTI
520 530 540 550 560 570
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pF1KB4 AEQVKHQTKCSICRQCPIKGFRYRSLKQFNVDICQTCFLTGRASKGNKLHYPIMEYYTPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AEQVKHQTKCSICRQCPIKGFRYRSLKQFNVDICQTCFLTGRASKGNKLHYPIMEYYTPT
580 590 600 610 620 630
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TSSENMRDFATTLKNKFRSKHYFSKHPQRGYLPVQSVLEADYSETPASSPMWPHADTHSR
640 650 660 670 680 690
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IEHFASRLAEMESQNCSFFNDSLSPDDSIDEDQYLLRHSSPITDREPAFGQQAPCSVATE
700 710 720 730 740 750
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SKGELQKILAHLEDENRILQGELRRLKWQHEEAAEAPSLADGSTEAATDHRNEELLAEAR
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pF1KB4 ILRQHKSRLETRMQILEDHNKQLESQLQRLRELLLQPPTESDGSGSAGSSLASSPQQSEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ILRQHKSRLETRMQILEDHNKQLESQLQRLRELLLQPPTESDGSGSAGSSLASSPQQSEG
820 830 840 850 860 870
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pF1KB4 SHPREKGQTTPDTEAADDVGSKSQDVSLCLEDIMEKLRHAFPSVRSSDVTANTLLAS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SHPREKGQTTPDTEAADDVGSKSQDVSLCLEDIMEKLRHAFPSVRSSDVTANTLLAS
880 890 900 910 920 930
>>NP_004013 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) dystroph (1230 aa)
initn: 3361 init1: 2890 opt: 3291 Z-score: 2693.0 bits: 510.0 E(85289): 2.9e-143
Smith-Waterman score: 3392; 56.2% identity (83.6% similar) in 884 aa overlap (79-949:322-1202)
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 PPQDGAGVPCLSLKLLNGSVGASGPLEPPAMNLCWNEIKKKSHNLRARLEAFSDHSGKLQ
::. :.:..::: :.:..::: ::. .:.
NP_004 YHNLDENSQKILRSLEGSDDAVLLQRRLDNMNFKWSELRKKSLNIRSHLEASSDQWKRLH
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pF1KB4 LPLQEIIDWLSQKDEELSAQLPLQGDVALVQQEKETHAAFMEEVKSRGPYIYSVLESAQA
: :::.. ::. ::.::: : :. :: ::.....: :: .:.:.. : :.:.::...
NP_004 LSLQELLVWLQLKDDELSRQAPIGGDFPAVQKQNDVHRAFKRELKTKEPVIMSTLETVRI
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pF1KB4 FLSQHPFEELEEPHSESKDTSPKQRIQNLSRFVWKQATVASELWEKLTARCVDQHRHIER
::...:.: ::. ..: .. :..: ::..:.. ::: .. ::::. . .: .:.:..
NP_004 FLTEQPLEGLEKLYQEPRELPPEERAQNVTRLLRKQAEEVNTEWEKLNLHSADWQRKIDE
420 430 440 450 460 470
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 TLEQLLEIQGAMEELSTTLSQAEGVRATWEPIGDLFIDSLPEHIQAIKLFKEEFSPMKDG
:::.: :.: : .::. : ::: ....:.:.:::.:::: .:.. .: .. :..:.:..
NP_004 TLERLQELQEATDELDLKLRQAEVIKGSWQPVGDLLIDSLQDHLEKVKALRGEIAPLKEN
480 490 500 510 520 530
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 VKLVNDLAHQLAISDVHLSMENSQALEQINVRWKQLQASVSERLKQLQDAHRDFGPGSQH
:. :::::.::. ..:: : ..::..:.::: ::..: .:..::..:::::::.:::
NP_004 VSHVNDLARQLTTLGIQLSPYNLSTLEDLNTRWKLLQVAVEDRVRQLHEAHRDFGPASQH
540 550 560 570 580 590
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pF1KB4 FLSSSVQVPWERAISPNKVPYYINHQAQTTCWDHPKMTELYQTLADLNNIKFSAYRTAMK
:::.::: :::::::::::::::::..:::::::::::::::.::::::..:::::::::
NP_004 FLSTSVQGPWERAISPNKVPYYINHETQTTCWDHPKMTELYQSLADLNNVRFSAYRTAMK
600 610 620 630 640 650
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pF1KB4 LRRVQKALRLDLVTLTTALEIFNEHDLQASEHVMDVVEVIHCLTALYERLEEERGILVNV
:::.:::: :::..:..: . ...:.:. ... ::....:.:::..:.:::.:.. ::::
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660 670 680 690 700 710
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pF1KB4 PLCVDMSLNWLLNVFDSGRSGKMRALSFKTGIACLCGTEVKEKLQYLFSQVANSGSQCDQ
:::::: :::::::.:.::.:..:.::::::: :: .....: .:::.:::.: . :::
NP_004 PLCVDMCLNWLLNVYDTGRTGRIRVLSFKTGIISLCKAHLEDKYRYLFKQVASSTGFCDQ
720 730 740 750 760 770
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pF1KB4 RHLGVLLHEAIQVPRQLGEVAAFGGSNVEPSVRSCFRFSTGKPVIEASQFLEWVNLEPQS
:.::.:::..::.::::::::.:::::.::::::::.:...:: :::. ::.:. :::::
NP_004 RRLGLLLHDSIQIPRQLGEVASFGGSNIEPSVRSCFQFANNKPEIEAALFLDWMRLEPQS
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pF1KB4 MVWLAVLHRVTIAEQVKHQTKCSICRQCPIKGFRYRSLKQFNVDICQTCFLTGRASKGNK
:::: :::::. :: .:::.::.::..::: ::::::::.:: ::::.::..::..::.:
NP_004 MVWLPVLHRVAAAETAKHQAKCNICKECPIIGFRYRSLKHFNYDICQSCFFSGRVAKGHK
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pF1KB4 LHYPIMEYYTPTTSSENMRDFATTLKNKFRSKHYFSKHPQRGYLPVQSVLEADYSETPAS
.:::..:: :::::.:..:::: .::::::.:.::.:::. ::::::.:::.: :::::
NP_004 MHYPMVEYCTPTTSGEDVRDFAKVLKNKFRTKRYFAKHPRMGYLPVQTVLEGDNMETPAS
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pF1KB4 SPMWPHADTHSRIEHFASRLAEMESQNCSFFNDSLSPDDSIDEDQYLLRH-------SSP
::. : ::::::::.::::::::..: :..:::.::..:::... :..: .::
NP_004 SPQLSHDDTHSRIEHYASRLAEMENSNGSYLNDSISPNESIDDEHLLIQHYCQSLNQDSP
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pF1KB4 ITD-REPAFGQQAPCSVATESKGELQKILAHLEDENRILQGELRRLKWQHEEAAEAP--S
... : :: : :. .: .:::..::: ::.::: ::.: ::: :::. . .: :
NP_004 LSQPRSPA---QILISLESEERGELERILADLEEENRNLQAEYDRLKQQHEHKGLSPLPS
1020 1030 1040 1050 1060
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pF1KB4 LADGSTEAATDHRNEELLAEARILRQHKSRLETRMQILEDHNKQLESQLQRLRELLLQPP
. . . :. ::.:::..:::::.:::.::::::::::::::::.:::.:: ::
NP_004 PPEMMPTSPQSPRDAELIAEAKLLRQHKGRLEARMQILEDHNKQLESQLHRLRQLLEQPQ
1070 1080 1090 1100 1110 1120
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pF1KB4 TESDGSGSAGSSLASSPQQSEGSHP---REKGQTTPDTEAADDVGSKSQDVSLCLEDIME
.:. .:.. :: ..: :.:..:.: : :. : :. . .:. : ::.: ::..::
NP_004 AEAKVNGTTVSSPSTSLQRSDSSQPMLLRVVGSQTSDSMGEEDLLSPPQDTSTGLEEVME
1130 1140 1150 1160 1170 1180
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pF1KB4 KLRHAFPSVRSSDVTANTLLAS
.: ..::: :. .:
NP_004 QLNNSFPSSRGHNVGSLFHMADDLGRAMESLVSVMTDEEGAE
1190 1200 1210 1220 1230
>>XP_016884817 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) PREDI (3672 aa)
initn: 3356 init1: 2889 opt: 3290 Z-score: 2685.4 bits: 510.2 E(85289): 7.7e-143
Smith-Waterman score: 3387; 55.8% identity (83.5% similar) in 889 aa overlap (79-954:2782-3667)
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 PPQDGAGVPCLSLKLLNGSVGASGPLEPPAMNLCWNEIKKKSHNLRARLEAFSDHSGKLQ
::. :.:..::: :.:..::: ::. .:.
XP_016 YHNLDENSQKILRSLEGSDDAVLLQRRLDNMNFKWSELRKKSLNIRSHLEASSDQWKRLH
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pF1KB4 LPLQEIIDWLSQKDEELSAQLPLQGDVALVQQEKETHAAFMEEVKSRGPYIYSVLESAQA
: :::.. ::. ::.::: : :. :: ::.....: :: .:.:.. : :.:.::...
XP_016 LSLQELLVWLQLKDDELSRQAPIGGDFPAVQKQNDVHRAFKRELKTKEPVIMSTLETVRI
2820 2830 2840 2850 2860 2870
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 FLSQHPFEELEEPHSESKDTSPKQRIQNLSRFVWKQATVASELWEKLTARCVDQHRHIER
::...:.: ::. ..: .. :..: ::..:.. ::: .. ::::. . .: .:.:..
XP_016 FLTEQPLEGLEKLYQEPRELPPEERAQNVTRLLRKQAEEVNTEWEKLNLHSADWQRKIDE
2880 2890 2900 2910 2920 2930
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 TLEQLLEIQGAMEELSTTLSQAEGVRATWEPIGDLFIDSLPEHIQAIKLFKEEFSPMKDG
:::.: :.: : .::. : ::: ....:.:.:::.:::: .:.. .: .. :..:.:..
XP_016 TLERLRELQEATDELDLKLRQAEVIKGSWQPVGDLLIDSLQDHLEKVKALRGEIAPLKEN
2940 2950 2960 2970 2980 2990
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 VKLVNDLAHQLAISDVHLSMENSQALEQINVRWKQLQASVSERLKQLQDAHRDFGPGSQH
:. :::::.::. ..:: : ..::..:.::: ::..: .:..::..:::::::.:::
XP_016 VSHVNDLARQLTTLGIQLSPYNLSTLEDLNTRWKLLQVAVEDRVRQLHEAHRDFGPASQH
3000 3010 3020 3030 3040 3050
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pF1KB4 FLSSSVQVPWERAISPNKVPYYINHQAQTTCWDHPKMTELYQTLADLNNIKFSAYRTAMK
:::.::: :::::::::::::::::..:::::::::::::::.::::::..:::::::::
XP_016 FLSTSVQGPWERAISPNKVPYYINHETQTTCWDHPKMTELYQSLADLNNVRFSAYRTAMK
3060 3070 3080 3090 3100 3110
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 LRRVQKALRLDLVTLTTALEIFNEHDLQASEHVMDVVEVIHCLTALYERLEEERGILVNV
:::.:::: :::..:..: . ...:.:. ... ::....:.:::..:.:::.:.. ::::
XP_016 LRRLQKALCLDLLSLSAACDALDQHNLKQNDQPMDILQIINCLTTIYDRLEQEHNNLVNV
3120 3130 3140 3150 3160 3170
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 PLCVDMSLNWLLNVFDSGRSGKMRALSFKTGIACLCGTEVKEKLQYLFSQVANSGSQCDQ
:::::: :::::::.:.::.:..:.::::::: :: .....: .:::.:::.: . :::
XP_016 PLCVDMCLNWLLNVYDTGRTGRIRVLSFKTGIISLCKAHLEDKYRYLFKQVASSTGFCDQ
3180 3190 3200 3210 3220 3230
530 540 550 560 570 580
pF1KB4 RHLGVLLHEAIQVPRQLGEVAAFGGSNVEPSVRSCFRFSTGKPVIEASQFLEWVNLEPQS
:.::.:::..::.::::::::.:::::.::::::::.:...:: :::. ::.:. :::::
XP_016 RRLGLLLHDSIQIPRQLGEVASFGGSNIEPSVRSCFQFANNKPEIEAALFLDWMRLEPQS
3240 3250 3260 3270 3280 3290
590 600 610 620 630 640
pF1KB4 MVWLAVLHRVTIAEQVKHQTKCSICRQCPIKGFRYRSLKQFNVDICQTCFLTGRASKGNK
:::: :::::. :: .:::.::.::..::: ::::::::.:: ::::.::..::..::.:
XP_016 MVWLPVLHRVAAAETAKHQAKCNICKECPIIGFRYRSLKHFNYDICQSCFFSGRVAKGHK
3300 3310 3320 3330 3340 3350
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pF1KB4 LHYPIMEYYTPTTSSENMRDFATTLKNKFRSKHYFSKHPQRGYLPVQSVLEADYSETPAS
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