Result of FASTA (omim) for
pFN21AB3816
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3816, 2012 aa
1>>>pF1KB3816 2012 - 2012 aa - 2012 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6631+/-0.000711; mu= 3.0635+/- 0.043
mean_var=371.9236+/-78.727, 0's: 0 Z-trim(112.0): 627 B-trim: 33 in 1/55
Lambda= 0.066504
statistics sampled from 20140 (20832) to 20140 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.575), E-opt: 0.2 (0.244), width: 16
Scan time: 15.750
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001380 (OMIM: 602523) Down syndrome cell adhesi (2012) 13294 1293.0 0
NP_001258463 (OMIM: 602523) Down syndrome cell adh (1994) 12532 1219.8 0
XP_016883770 (OMIM: 602523) PREDICTED: Down syndro (1776) 11733 1143.1 0
NP_065744 (OMIM: 611782) Down syndrome cell adhesi (2113) 8228 806.9 0
XP_011541220 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (1977) 7227 710.9 3.5e-203
XP_011541219 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (2065) 7227 710.9 3.6e-203
XP_011541221 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (1626) 6487 639.8 7.3e-182
XP_011541222 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (1543) 6117 604.2 3.4e-171
XP_011541223 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (1344) 4801 477.9 3.2e-133
XP_011541226 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (1270) 4779 475.8 1.3e-132
XP_011541227 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (1264) 4760 473.9 4.7e-132
XP_011523218 (OMIM: 607217) PREDICTED: protein sid (1142) 1176 130.0 1.4e-28
XP_011532070 (OMIM: 601325) PREDICTED: contactin-3 (1028) 859 99.5 1.9e-19
XP_005264814 (OMIM: 601325) PREDICTED: contactin-3 (1028) 852 98.9 3.1e-19
XP_016861996 (OMIM: 601325) PREDICTED: contactin-3 (1028) 852 98.9 3.1e-19
NP_065923 (OMIM: 601325) contactin-3 precursor [Ho (1028) 852 98.9 3.1e-19
XP_011507621 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1347) 826 96.5 2e-18
XP_011507616 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1418) 826 96.5 2.1e-18
XP_011507622 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1443) 826 96.5 2.1e-18
XP_016877727 (OMIM: 601907) PREDICTED: neogenin is (1381) 820 95.9 3.1e-18
XP_016877720 (OMIM: 601907) PREDICTED: neogenin is (1434) 820 96.0 3.2e-18
XP_016861997 (OMIM: 601325) PREDICTED: contactin-3 ( 970) 810 94.8 4.8e-18
NP_001180513 (OMIM: 601581) neuronal cell adhesion (1180) 806 94.5 7.1e-18
NP_001180512 (OMIM: 601581) neuronal cell adhesion (1192) 806 94.5 7.2e-18
XP_016867746 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1192) 806 94.5 7.2e-18
XP_016867738 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1195) 806 94.5 7.2e-18
XP_016867736 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1196) 806 94.5 7.2e-18
XP_016867739 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1199) 806 94.5 7.2e-18
XP_016867731 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1273) 806 94.6 7.5e-18
XP_016867729 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1285) 806 94.6 7.5e-18
XP_016867728 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1286) 806 94.6 7.5e-18
XP_016867727 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1288) 806 94.6 7.5e-18
XP_016867730 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1289) 806 94.6 7.5e-18
XP_011514564 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1292) 806 94.6 7.5e-18
XP_016867744 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1189) 757 89.8 1.9e-16
XP_011507618 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1364) 757 89.9 2e-16
XP_011507614 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1435) 757 89.9 2.1e-16
XP_011507620 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1460) 757 89.9 2.1e-16
XP_016860311 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (33101) 787 94.4 2.1e-16
NP_596869 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60880 (33423) 787 94.4 2.2e-16
XP_016860310 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (34087) 787 94.4 2.2e-16
XP_016860309 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (34088) 787 94.4 2.2e-16
NP_001243779 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (34350) 787 94.4 2.2e-16
XP_016856226 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1133) 754 89.5 2.2e-16
XP_016860308 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (35622) 787 94.5 2.2e-16
NP_001254479 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (35991) 787 94.5 2.3e-16
NP_001153803 (OMIM: 609145) neurofascin isoform 2 (1189) 754 89.5 2.3e-16
XP_011507627 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1190) 754 89.5 2.3e-16
XP_011507626 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1195) 754 89.5 2.3e-16
XP_005245046 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1266) 754 89.6 2.4e-16
>>NP_001380 (OMIM: 602523) Down syndrome cell adhesion m (2012 aa)
initn: 13294 init1: 13294 opt: 13294 Z-score: 6914.6 bits: 1293.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 13294; 100.0% identity (100.0% similar) in 2012 aa overlap (1-2012:1-2012)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MWILALSLFQSFANVFSEDLHSSLYFVNASLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MWILALSLFQSFANVFSEDLHSSLYFVNASLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWYL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 ATGEEIYDVPGIRHVHPNGTLQIFPFPPSSFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATGEEIYDVPGIRHVHPNGTLQIFPFPPSSFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VLREPYTVRVEDQKTMRGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLREPYTVRVEDQKTMRGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTGA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 LYIKDVQNEDGLYNYRCITRHRYTGETRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFEHRKAMAGQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
NP_001 LYIKDVQNEDGLYNYRCITRHRYTGETRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFDHRKAMAGQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 RVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLELSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLELSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 TAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 RITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 AEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 VYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 SNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFIQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 PFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNLS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 LMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 IVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVLSNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVLSNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSM
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 YLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPEMARYLVSTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPEMARYLVSTK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 EVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKART
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKART
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 ITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRM
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 YAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGY
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB3 QIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEII
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB3 TTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEI
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB3 KNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB3 SASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVW
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB3 VVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWM
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB3 KDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPP
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB3 DQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLEN
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB3 LKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWN
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB3 DGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQ
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB3 ANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRR
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KB3 REQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTSDTLSKQQQTLRMHIDIPRAQLLIEERDTMETIDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTSDTLSKQQQTLRMHIDIPRAQLLIEERDTMETIDD
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KB3 RSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTVHYQSVSQATGPLVDVSDARPGTNPTTRRNAKAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTVHYQSVSQATGPLVDVSDARPGTNPTTRRNAKAGP
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KB3 TARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTTDWRLPTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQDTDRARSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTTDWRLPTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQDTDRARSS
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KB3 MVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQLRHAKFTITECFISDTSSEQLTAGTNEYTDSLTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQLRHAKFTITECFISDTSSEQLTAGTNEYTDSLTS
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KB3 STPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMNMAVPKAHRPGDLIHLPPYLRMDFLLNRGGPGTSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMNMAVPKAHRPGDLIHLPPYLRMDFLLNRGGPGTSR
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KB3 DLSLGQACLEPQKSRTLKRPTVLEPIPMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLSLGQACLEPQKSRTLKRPTVLEPIPMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELG
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010
pF1KB3 QAAKMSSSQESLLDSRGHLKGNNPYAKSYTLV
::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QAAKMSSSQESLLDSRGHLKGNNPYAKSYTLV
1990 2000 2010
>>NP_001258463 (OMIM: 602523) Down syndrome cell adhesio (1994 aa)
initn: 12528 init1: 12528 opt: 12532 Z-score: 6519.5 bits: 1219.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 13120; 99.1% identity (99.1% similar) in 2012 aa overlap (1-2012:1-1994)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MWILALSLFQSFANVFSEDLHSSLYFVNASLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MWILALSLFQSFANVFSEDLHSSLYFVNASLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWYL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 ATGEEIYDVPGIRHVHPNGTLQIFPFPPSSFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATGEEIYDVPGIRHVHPNGTLQIFPFPPSSFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VLREPYTVRVEDQKTMRGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLREPYTVRVEDQKTMRGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTGA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 LYIKDVQNEDGLYNYRCITRHRYTGETRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFEHRKAMAGQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
NP_001 LYIKDVQNEDGLYNYRCITRHRYTGETRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFDHRKAMAGQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 RVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLELSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLELSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 TAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 RITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 AEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 VYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 SNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFIQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 PFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNLS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 LMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 IVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVLSNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVLSNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSM
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 YLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPEMARYLVSTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPEMARYLVSTK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 EVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKART
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKART
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 ITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRM
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 YAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGY
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB3 QIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEII
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB3 TTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEI
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB3 KNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB3 SASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVW
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB3 VVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWM
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB3 KDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPP
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB3 DQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLEN
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB3 LKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWN
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB3 DGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQ
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB3 ANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRR
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KB3 REQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTSDTLSKQQQTLRMHIDIPRAQLLIEERDTMETIDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTSDTLSKQQQTLRMHIDIPRAQLLIEERDTMETIDD
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KB3 RSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTVHYQSVSQATGPLVDVSDARPGTNPTTRRNAKAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTVHYQSVSQATGPLVDVSDARPGTNPTTRRNAKAGP
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KB3 TARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTTDWRLPTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQDTDRARSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTTDWRLPTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQDTDRARSS
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KB3 MVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQLRHAKFTITECFISDTSSEQLTAGTNEYTDSLTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQLRHAKFTITECFISDTSSEQLTAGTNEYTDSLTS
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KB3 STPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMNMAVPKAHRPGDLIHLPPYLRMDFLLNRGGPGTSR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
NP_001 STPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMNMAVPKAHRPG------------------GPGTSR
1870 1880 1890 1900
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KB3 DLSLGQACLEPQKSRTLKRPTVLEPIPMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLSLGQACLEPQKSRTLKRPTVLEPIPMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELG
1910 1920 1930 1940 1950 1960
1990 2000 2010
pF1KB3 QAAKMSSSQESLLDSRGHLKGNNPYAKSYTLV
::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QAAKMSSSQESLLDSRGHLKGNNPYAKSYTLV
1970 1980 1990
>>XP_016883770 (OMIM: 602523) PREDICTED: Down syndrome c (1776 aa)
initn: 11733 init1: 11733 opt: 11733 Z-score: 6105.8 bits: 1143.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 11733; 100.0% identity (100.0% similar) in 1776 aa overlap (237-2012:1-1776)
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 TRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFEHRKAMAGQRVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLE
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MAGQRVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLE
10 20 30
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 LSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYGTAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYGTAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSS
40 50 60 70 80 90
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 VGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNVRITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNVRITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCF
100 110 120 130 140 150
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 VRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSPAEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSPAEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDP
160 170 180 190 200 210
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 ILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGGVYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGGVYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPAS
220 230 240 250 260 270
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 IRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKNSNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKNSNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQK
280 290 300 310 320 330
570 580 590 600 610 620
pF1KB3 EVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFIQPFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFIQPFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPI
340 350 360 370 380 390
630 640 650 660 670 680
pF1KB3 TITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNLSLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNLSLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIV
400 410 420 430 440 450
690 700 710 720 730 740
pF1KB3 RVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPTIVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPTIVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVL
460 470 480 490 500 510
750 760 770 780 790 800
pF1KB3 SNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKE
520 530 540 550 560 570
810 820 830 840 850 860
pF1KB3 MSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPEMARYLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPEMARYLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCH
580 590 600 610 620 630
870 880 890 900 910 920
pF1KB3 AINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKARTITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKARTITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKS
640 650 660 670 680 690
930 940 950 960 970 980
pF1KB3 DSWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DSWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDG
700 710 720 730 740 750
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KB3 PPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDS
760 770 780 790 800 810
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KB3 EVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEIITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEIITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESIS
820 830 840 850 860 870
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KB3 ISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVL
880 890 900 910 920 930
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KB3 AFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFC
940 950 960 970 980 990
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KB3 SHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPA
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KB3 RILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFII
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KB3 RTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPPDQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPPDQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGG
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KB3 SSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLENLKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLENLKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEII
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KB3 EAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWNDGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWNDGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQR
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1530 1540 1550 1560 1570 1580
pF1KB3 TSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEG
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1590 1600 1610 1620 1630 1640
pF1KB3 LTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRRREQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRRREQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTS
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1650 1660 1670 1680 1690 1700
pF1KB3 DTLSKQQQTLRMHIDIPRAQLLIEERDTMETIDDRSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DTLSKQQQTLRMHIDIPRAQLLIEERDTMETIDDRSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTV
1420 1430 1440 1450 1460 1470
1710 1720 1730 1740 1750 1760
pF1KB3 HYQSVSQATGPLVDVSDARPGTNPTTRRNAKAGPTARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HYQSVSQATGPLVDVSDARPGTNPTTRRNAKAGPTARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTT
1480 1490 1500 1510 1520 1530
1770 1780 1790 1800 1810 1820
pF1KB3 DWRLPTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQDTDRARSSMVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DWRLPTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQDTDRARSSMVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQ
1540 1550 1560 1570 1580 1590
1830 1840 1850 1860 1870 1880
pF1KB3 LRHAKFTITECFISDTSSEQLTAGTNEYTDSLTSSTPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LRHAKFTITECFISDTSSEQLTAGTNEYTDSLTSSTPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMN
1600 1610 1620 1630 1640 1650
1890 1900 1910 1920 1930 1940
pF1KB3 MAVPKAHRPGDLIHLPPYLRMDFLLNRGGPGTSRDLSLGQACLEPQKSRTLKRPTVLEPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MAVPKAHRPGDLIHLPPYLRMDFLLNRGGPGTSRDLSLGQACLEPQKSRTLKRPTVLEPI
1660 1670 1680 1690 1700 1710
1950 1960 1970 1980 1990 2000
pF1KB3 PMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELGQAAKMSSSQESLLDSRGHLKGNNPYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELGQAAKMSSSQESLLDSRGHLKGNNPYA
1720 1730 1740 1750 1760 1770
2010
pF1KB3 KSYTLV
::::::
XP_016 KSYTLV
>>NP_065744 (OMIM: 611782) Down syndrome cell adhesion m (2113 aa)
initn: 4633 init1: 2653 opt: 8228 Z-score: 4287.5 bits: 806.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8230; 60.9% identity (84.2% similar) in 1991 aa overlap (1-1974:61-2032)
10 20
pF1KB3 MWILA-LSLFQSFANVFSEDLHSSLYFVNA
::... : :..:. .. ::. .::::::
NP_065 GGWERAERGRGAAARPATGPPPRRIGPLYGMWLVTFLLLLDSLHKARPEDVGTSLYFVND
40 50 60 70 80 90
30 40 50 60 70 80
pF1KB3 SLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWYLATGEEIYDVPGIRHVHPNGTLQIFPFPPS
:::.:.:.:..:..::::::: : ..::::::::..::::: ::::: :::::..:: ::
NP_065 SLQQVTFSSSVGVVVPCPAAGSPSAALRWYLATGDDIYDVPHIRHVHANGTLQLYPFSPS
100 110 120 130 140 150
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 SFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKAVLREPYTVRVEDQKTMRGNVAVFKCIIPS
.:...:::: :.::::: .::::: ....:::.:::::::::::..::::::::::.:::
NP_065 AFNSFIHDNDYFCTAENAAGKIRSPNIRVKAVFREPYTVRVEDQRSMRGNVAVFKCLIPS
160 170 180 190 200 210
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 SVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTGALYIKDVQNEDGLYNYRCITRHRYTGETRQ
::. :..::::::::::.. ::.:: :.:::.:::.::.: .:::::.:.:.:::::
NP_065 SVQEYVSVVSWEKDTVSIIPEHRFFITYHGGLYISDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQ
220 230 240 250 260 270
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 SNSARLFVSDPANSAPSILDGFEHRKAMAGQRVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLELSG
::.::: :.:::.: :.:::::. ... ::. ::::: : :.: : :::::. :: ..
NP_065 SNGARLSVTDPAESIPTILDGFHSQEVWAGHTVELPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADS
280 290 300 310 320 330
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 RFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYGTAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGS
:. : .::: : ..: :::.:.:::.: .:.:.. : :.: .::..:..:.:.:...::
NP_065 RWTKRITGLTISDLRTEDSGTYICEVTNTFGSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGS
340 350 360 370 380 390
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 QVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNVRITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCFVRK
: :::..::. . . :::: :.. : . . : :...:.:.. :: .::::::. .
NP_065 TVILSCALTGSPEFTIRWYRNTELVLPDEAISIRGLSNETLLITSAQKSHSGAYQCFATR
400 410 420 430 440 450
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 DKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSPAEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILK
.:::.. ..::::::.:.:.::::::.:.: :::: .::.: ::.::.:::.::..
NP_065 KAQTAQDFAIIALEDGTPRIVSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVR
460 470 480 490 500 510
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 GGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGGVYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRP
:::: .:. :.:...:..:... :.:::::::::: : .: . :::::::::: :::
NP_065 DGSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRA
520 530 540 550 560 570
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 MKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKNSNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVD
:.::::.::::: :.:::::::::::::::.. ::: :::::.::: :::::.:::: .:
NP_065 MRNITAVAGRDTLINCRVIGYPYYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFEN-GTLKLTDVQKGMD
580 590 600 610 620
570 580 590 600 610 620
pF1KB3 EGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFIQPFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITIT
:::: :.::.::::: ::::::.:::::.::::::: :::: ..::::: :::.:: ::
NP_065 EGEYLCSVLIQPQLSISQSVHVAVKVPPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRIT
630 640 650 660 670 680
630 640 650 660 670 680
pF1KB3 WQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNLSLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVP
:.:::. : .. ::::.. .: :::.::..:: ::::::::: : ::.: .. :::::::
NP_065 WRKDGQVIISGSGVTIESKEFMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVP
690 700 710 720 730 740
690 700 710 720 730 740
pF1KB3 PKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPTIVWKFSKGAGVPQ-FQPIALNGRIQVLSN
:.::::: .:::::::: .::::..::: : ..:: .::.: :: ..:. :.::::.: :
NP_065 PRFVVQPNNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPN
750 760 770 780 790 800
750 760 770 780 790 800
pF1KB3 GSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMS
.::::.::.::: :::::..:: ::.:.::::.:::::::::::.::::.: .:. ::..
NP_065 SSLLIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELN
810 820 830 840 850 860
810 820 830 840 850 860
pF1KB3 CTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPE-MARYLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHA
:::.::.:::.:::: : .:.:. . :: ..::. :.::.:::.. :. : :: ::::::
NP_065 CTARGERPIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHA
870 880 890 900 910 920
870 880 890 900 910 920
pF1KB3 INSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKARTITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSD
:::::::::.:::::::::::::.::..::::...::::. ::::: :::.::: :::::
NP_065 INSYGEDRGLIQLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSD
930 940 950 960 970 980
930 940 950 960 970 980
pF1KB3 SWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGP
::: : :...:: .:.:.:.:.::.:.::::::. :.::.::::.::::...:::::::
NP_065 SWDFKQSTRNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGP
990 1000 1010 1020 1030 1040
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KB3 PQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSE
:..: :.:..::::.::::::::.::::.:::::::::: : :.: :..:. . ..::::
NP_065 PMDVTLQPVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSE
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KB3 VYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEIITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISI
:::::::.::.:::.:::: :::::::::.:: .:::::::: :::::.:.. . . :
NP_065 VYTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVI
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KB3 SWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLA
::: . .:::.:.:.:::.:. .::: ::..:::::. .:: :.::.::::.::::
NP_065 SWSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLA
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KB3 FTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCS
.:.::::::: .. .:::::::::::.::. .::: : :::::: : ::.:::::.:::
NP_065 YTQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCS
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KB3 HP---YPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKA
: :. ::.:.::... ::: .:.:..:: .::.:::::::::::: .:.:: .::
NP_065 SPGSGQPAP-SEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKA
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KB3 PARILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSF
::.:..:.::::::::::. :::..::::.::::: :::. . :..::.: : .::..
NP_065 PAKIISFGGTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTL
1350 1360 1370 1380 1390 1400
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KB3 IIRTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPPDQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDN
..:.:::::::::.: :.:. : : ::.:: :::::::::::::::..:::::.:.::::
NP_065 LLRAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDN
1410 1420 1430 1440 1450 1460
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KB3 GGSSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLENLKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISE
:::::::..:::: ::::.: . :: ::::..:..:::::::: :.:.:.:: :::::
NP_065 GGSSIRGFVLQYSVDNSEEWKDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISE
1470 1480 1490 1500 1510 1520
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KB3 IIEAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWNDGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTA
:::::: :.::.:::.:.::. ::.:..:::: :::.::::::...::::: :: .: .
NP_065 IIEAKTHGREPSFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQ-G
1530 1540 1550 1560 1570 1580
1530 1540 1550 1560 1570 1580
pF1KB3 QRTSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNE
:.. : .: .:.:::::::.::.::::::... :.::::.:::::::: :::. :.:
NP_065 LRANSSGEVFLTELREATWYELRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPP-IKSA-QGE
1590 1600 1610 1620 1630 1640
1590 1600 1610 1620 1630 1640
pF1KB3 EGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRRREQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTR
.. .: : ::.: .. . : .::..::..:.:.:::::::::::::::.:::.:
NP_065 -----GDDVKKLFTIGCPVILATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNR
1650 1660 1670 1680 1690 1700
1650 1660 1670 1680 1690 1700
pF1KB3 TSDTLSK-QQQTLRMHIDIPRAQLLIEERDTMETI-DDRSTVLLTDADFGEAAKQKSLTV
. :: : : :.::::::.:::::... .. . ::..:. .:::.:..:.. .:. .
NP_065 SFDTPVKGPPQGPRLHIDIPRVQLLIEDKEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCT
1710 1720 1730 1740 1750 1760
1710 1720 1730 1740 1750 1760
pF1KB3 THTVHYQSVSQATGPLVDVSDARPGTNPTTRRNAKAGPTARNRYASQWTLNRPHPTISAH
..:. .. :.::::.:.:: ::::::..:.:.:.. ..::::.:::::.. . . :.
NP_065 GVSLHHPTLIQSTGPLIDMSDIRPGTNPVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPAR
1770 1780 1790 1800 1810 1820
1770 1780 1790 1800 1810 1820
pF1KB3 TLTTDWRLPTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQDTDRARSSMVSTESASSTYEELARAYEHAK
:::.::: . : . ::::::.: :::::..:.:::::::::::::::::::::::
NP_065 TLTSDWRT-VGSQHGVTVTESDSYSASLSQDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAK
1830 1840 1850 1860 1870
1830 1840 1850 1860 1870 1880
pF1KB3 MEEQLRHAKFTITECFISDTSSEQLTAGTNEYTDSLTS-STPSESGICRFTASPPKPQDG
.::::.:::: ::::::::.::.:.:.:::: .::.:: ::::: ::::::::::::::.
NP_065 LEEQLQHAKFEITECFISDSSSDQMTTGTNENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDA
1880 1890 1900 1910 1920 1930
1890 1900 1910 1920 1930
pF1KB3 GRVMNMAVPKAHRPG--DLIHLPPYLRMDFLLNRGGPGTSRDLSLGQAC--LEPQKS--R
: :.::: :: . : .:: : . . .. : . : . : . :... :
NP_065 DRGKNVAVPIPHRANKSDYCNLPLYAKSEAFF-RKADGR-------EPCPVVPPREASIR
1940 1950 1960 1970 1980 1990
1940 1950 1960 1970 1980 1990
pF1KB3 TLKRP--TVLEPIPMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELGQAAKMSSSQESLL
.: : : . . .. ::.. . . . ...::::::
NP_065 NLARTYHTQARHLTLDPASKSLGLPHPGAPAAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPT
2000 2010 2020 2030 2040 2050
2000 2010
pF1KB3 DSRGHLKGNNPYAKSYTLV
NP_065 PAEPPTAPSAAPPAPSTEPPRAGGPHTKMGGSRDSLLEMSTSGVGRSQKQGAGAYSKSYT
2060 2070 2080 2090 2100 2110
>>XP_011541220 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndrome c (1977 aa)
initn: 5296 init1: 1862 opt: 7227 Z-score: 3768.8 bits: 710.9 E(85289): 3.5e-203
Smith-Waterman score: 7806; 60.5% identity (83.5% similar) in 1911 aa overlap (92-1974:5-1896)
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 TGEEIYDVPGIRHVHPNGTLQIFPFPPSSFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKAV
:..:::: :.::::: .::::: ....:::
XP_011 MTPCSSFIHDNDYFCTAENAAGKIRSPNIRVKAV
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 LREPYTVRVEDQKTMRGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTGAL
.:::::::::::..::::::::::.:::::. :..::::::::::.. ::.:: :.:
XP_011 FREPYTVRVEDQRSMRGNVAVFKCLIPSSVQEYVSVVSWEKDTVSIIPEHRFFITYHGGL
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220
pF1KB3 YIKDVQNEDGLYNYRCITRHRYTGETRQSNSARLFVS------------DPANSAPSILD
::.:::.::.: .:::::.:.:.:::::::.::: :. :::.: :.:::
XP_011 YISDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQSNGARLSVTGLARAADPLCLPDPAESIPTILD
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 GFEHRKAMAGQRVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLELSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSG
::. ... ::. ::::: : :.: : :::::. :: ..:. : .::: : ..: :::
XP_011 GFHSQEVWAGHTVELPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADSRWTKRITGLTISDLRTEDSG
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 SYVCEVSNRYGTAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYR
.:.:::.: .:.:.. : :.: .::..:..:.:.:...:: : :::..::. . . :::
XP_011 TYICEVTNTFGSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGSTVILSCALTGSPEFTIRWYR
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 NGEILNPGKNVRITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKI
: :.. : . . : :...:.:.. :: .::::::. . .:::.. ..::::::.:
XP_011 NTELVLPDEAISIRGLSNETLLITSAQKSHSGAYQCFATRKAQTAQDFAIIALEDGTPRI
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 ISAFSEKVVSPAEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVSYL
.:.::::::.:.: :::: .::.: ::.::.:::.::.. :::: .:. :.:...:..
XP_011 VSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVRDGSHRTNQYTMSDGTTISHM
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 NISSSQVRDGGVYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIG
:... :.:::::::::: : .: . :::::::::: ::: :.::::.::::: :.:::::
XP_011 NVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRAMRNITAVAGRDTLINCRVIG
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 YPYYSIKWYKNSNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSV
::::::::::.. ::: :::::.::: :::::.:::: .::::: :.::.::::: ::::
XP_011 YPYYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFEN-GTLKLTDVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQSV
460 470 480 490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 HVTVKVPPFIQPFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNID
::.:::::.::::::: :::: ..::::: :::.:: :::.:::. : .. ::::.. .
XP_011 HVAVKVPPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESKE
520 530 540 550 560 570
650 660 670 680 690 700
pF1KB3 FTSSLRISNLSLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVIL
: :::.::..:: ::::::::: : ::.: .. ::::::::.::::: .:::::::: .:
XP_011 FMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGVL
580 590 600 610 620 630
710 720 730 740 750 760
pF1KB3 NCSAEGYPVPTIVWKFSKGAGVPQ-FQPIALNGRIQVLSNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKV
:::..::: : ..:: .::.: :: ..:. :.::::.: :.::::.::.::: :::::..
XP_011 NCSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLCQA
640 650 660 670 680 690
770 780 790 800 810 820
pF1KB3 SNDVGADVSKSMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRII
:: ::.:.::::.:::::::::::.::::.: .:. ::..:::.::.:::.:::: : .:
XP_011 SNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEKGDTVI
700 710 720 730 740 750
830 840 850 860 870 880
pF1KB3 NPE-MARYLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEPPD
.:. . :: ..::. :.::.:::.. :. : :: :::::::::::::::.::::::::::
XP_011 DPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQEPPD
760 770 780 790 800 810
890 900 910 920 930 940
pF1KB3 PPEIEIKDVKARTITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQRTKDVSPQLNSATI
:::.::..::::...::::. ::::: :::.::: :::::::: : :...:: .:.:.:
XP_011 PPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNISPTINQANI
820 830 840 850 860 870
950 960 970 980 990 1000
pF1KB3 IDIHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKA
.:.::.:.::::::. :.::.::::.::::...::::::::..: :.:..::::.:::::
XP_011 VDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQPVTSQSIQVTWKA
880 890 900 910 920 930
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB3 PKKHLQNGIIRGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQAC
:::.::::.:::::::::: : :.: :..:. . ..:::::::::::.::.:::.::::
XP_011 PKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNLKKFAQYGVVVQAF
940 950 960 970 980 990
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KB3 NRAGTGPSSQEIITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALNGILQGFRVI
:::::::::.:: .:::::::: :::::.:.. . . :::: . .:::.:.:.:::
XP_011 NRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPRSTLNGVLKGYRVI
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KB3 YWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKED
.:. .::: ::..:::::. .:: :.::.::::.::::.:.::::::: .. .::::
XP_011 FWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTKED
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KB3 VPGPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHP---YPTVISEFEASPDSF
:::::::.::. .::: : :::::: : ::.:::::.::: : :. ::.:.::...
XP_011 VPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQPAP-SEYETSPEQL
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KB3 SYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARILTFSGTVTTPWMKDIV
::: .:.:..:: .::.:::::::::::: .:.:: .::::.:..:.::::::::::.
XP_011 FYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFGGTVTTPWMKDVR
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KB3 LPCKAVGDPSPAVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSGYYSCIANNN
:::..::::.::::: :::. . :..::.: : .::....:.:::::::::.: :.:.
XP_011 LPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAEDSGYYTCTATNT
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KB3 WGSDEIILNLQVQVPPDQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSEQW
: : ::.:: :::::::::::::::..:::::.:.:::::::::::..:::: ::::.:
XP_011 GGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGFVLQYSVDNSEEW
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KB3 GSFPISPSERSYRLENLKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQELF
. :: ::::..:..:::::::: :.:.:.:: ::::::::::: :.::.:::.:.::
XP_011 KDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHGREPSFSKDQHLF
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1490 1500 1510 1520 1530 1540
pF1KB3 ASINTTRVRLNLIGWNDGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYILYDLQEATWY
. ::.:..:::: :::.::::::...::::: :: .: . :.. : .: .:.:::::
XP_011 THINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQ-GLRANSSGEVFLTELREATWY
1420 1430 1440 1450 1460 1470
1550 1560 1570 1580 1590 1600
pF1KB3 ELQMRVCNSAGCAEKQANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKMLVTISCILV
::.::.::::::... :.::::.:::::::: :::. :.: .. .: : ::.: ..
XP_011 ELRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPP-IKSA-QGE-----GDDVKKLFTIGCPVI
1480 1490 1500 1510 1520
1610 1620 1630 1640 1650 1660
pF1KB3 GVLLLFVLLLVVRRRRREQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTSDTLSK-QQQTLRMHIDIP
. : .::..::..:.:.:::::::::::::::.:::.:. :: : : :.:::::
XP_011 LATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPPQGPRLHIDIP
1530 1540 1550 1560 1570 1580
1670 1680 1690 1700 1710 1720
pF1KB3 RAQLLIEERDTMETI-DDRSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTVHYQSVSQATGPLVDVS
:.:::::... .. . ::..:. .:::.:..:.. .:. . ..:. .. :.::::.:.:
XP_011 RVQLLIEDKEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLIQSTGPLIDMS
1590 1600 1610 1620 1630 1640
1730 1740 1750 1760 1770 1780
pF1KB3 DARPGTNPTTRRNAKAGPTARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTTDWRLPTPRAAGSVDKE
: ::::::..:.:.:.. ..::::.:::::.. . . :.:::.::: . : . :
XP_011 DIRPGTNPVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRT-VGSQHGVTVTE
1650 1660 1670 1680 1690 1700
1790 1800 1810 1820 1830 1840
pF1KB3 SDSYSVSPSQDTDRARSSMVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQLRHAKFTITECFISDT
:::::.: :::::..:.:::::::::::::::::::::::.::::.:::: ::::::::.
XP_011 SDSYSASLSQDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFEITECFISDS
1710 1720 1730 1740 1750 1760
1850 1860 1870 1880 1890
pF1KB3 SSEQLTAGTNEYTDSLTS-STPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMNMAVPKAHRPG--DLI
::.:.:.:::: .::.:: ::::: ::::::::::::::. : :.::: :: . :
XP_011 SSDQMTTGTNENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIPHRANKSDYC
1770 1780 1790 1800 1810 1820
1900 1910 1920 1930 1940 1950
pF1KB3 HLPPYLRMDFLLNRGGPGTSRDLSLGQAC--LEPQKS--RTLKRP--TVLEPIPMEAASS
.:: : . . .. : . : . : . :... :.: : : . . .. ::.
XP_011 NLPLYAKSEAFF-RKADGR-------EPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPASK
1830 1840 1850 1860 1870
1960 1970 1980 1990 2000 2010
pF1KB3 ASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELGQAAKMSSSQESLLDSRGHLKGNNPYAKSYTLV
. . . . ...::::::
XP_011 SLGLPHPGAPAAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPPAPSTEPP
1880 1890 1900 1910 1920 1930
>>XP_011541219 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndrome c (2065 aa)
initn: 5665 init1: 1862 opt: 7227 Z-score: 3768.6 bits: 710.9 E(85289): 3.6e-203
Smith-Waterman score: 8196; 60.5% identity (83.7% similar) in 2003 aa overlap (1-1974:1-1984)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MWILA-LSLFQSFANVFSEDLHSSLYFVNASLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWY
::... : :..:. .. ::. .:::::: :::.:.:.:..:..::::::: : ..::::
XP_011 MWLVTFLLLLDSLHKARPEDVGTSLYFVNDSLQQVTFSSSVGVVVPCPAAGSPSAALRWY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 LATGEEIYDVPGIRHVHPNGTLQIFPFPPSSFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIK
::::..::::: ::::: :::::..:: ::.:...:::: :.::::: .::::: ....:
XP_011 LATGDDIYDVPHIRHVHANGTLQLYPFSPSAFNSFIHDNDYFCTAENAAGKIRSPNIRVK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 AVLREPYTVRVEDQKTMRGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTG
::.:::::::::::..::::::::::.:::::. :..::::::::::.. ::.:: :
XP_011 AVFREPYTVRVEDQRSMRGNVAVFKCLIPSSVQEYVSVVSWEKDTVSIIPEHRFFITYHG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KB3 ALYIKDVQNEDGLYNYRCITRHRYTGETRQSNSARLFVS------------DPANSAPSI
.:::.:::.::.: .:::::.:.:.:::::::.::: :. :::.: :.:
XP_011 GLYISDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQSNGARLSVTGLARAADPLCLPDPAESIPTI
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 LDGFEHRKAMAGQRVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLELSGRFQKTVTGLLIENIRPSD
::::. ... ::. ::::: : :.: : :::::. :: ..:. : .::: : ..: :
XP_011 LDGFHSQEVWAGHTVELPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADSRWTKRITGLTISDLRTED
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 SGSYVCEVSNRYGTAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSW
::.:.:::.: .:.:.. : :.: .::..:..:.:.:...:: : :::..::. . . :
XP_011 SGTYICEVTNTFGSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGSTVILSCALTGSPEFTIRW
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 YRNGEILNPGKNVRITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTP
::: :.. : . . : :...:.:.. :: .::::::. . .:::.. ..::::::
XP_011 YRNTELVLPDEAISIRGLSNETLLITSAQKSHSGAYQCFATRKAQTAQDFAIIALEDGTP
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 KIISAFSEKVVSPAEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVS
.:.:.::::::.:.: :::: .::.: ::.::.:::.::.. :::: .:. :.:...:
XP_011 RIVSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVRDGSHRTNQYTMSDGTTIS
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 YLNISSSQVRDGGVYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRV
..:... :.:::::::::: : .: . :::::::::: ::: :.::::.::::: :.:::
XP_011 HMNVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRAMRNITAVAGRDTLINCRV
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 IGYPYYSIKWYKNSNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQ
::::::::::::.. ::: :::::.::: :::::.:::: .::::: :.::.::::: ::
XP_011 IGYPYYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFEN-GTLKLTDVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQ
550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 SVHVTVKVPPFIQPFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDN
::::.:::::.::::::: :::: ..::::: :::.:: :::.:::. : .. ::::..
XP_011 SVHVAVKVPPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIES
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KB3 IDFTSSLRISNLSLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAV
.: :::.::..:: ::::::::: : ::.: .. ::::::::.::::: .::::::::
XP_011 KEFMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAG
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KB3 ILNCSAEGYPVPTIVWKFSKGAGVPQ-FQPIALNGRIQVLSNGSLLIKHVVEEDSGYYLC
.::::..::: : ..:: .::.: :: ..:. :.::::.: :.::::.::.::: :::::
XP_011 VLNCSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLC
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KB3 KVSNDVGADVSKSMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDR
..:: ::.:.::::.:::::::::::.::::.: .:. ::..:::.::.:::.:::: :
XP_011 QASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEKGDT
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KB3 IINPE-MARYLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEP
.:.:. . :: ..::. :.::.:::.. :. : :: :::::::::::::::.::::::::
XP_011 VIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQEP
840 850 860 870 880 890
890 900 910 920 930 940
pF1KB3 PDPPEIEIKDVKARTITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQRTKDVSPQLNSA
:::::.::..::::...::::. ::::: :::.::: :::::::: : :...:: .:.:
XP_011 PDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNISPTINQA
900 910 920 930 940 950
950 960 970 980 990 1000
pF1KB3 TIIDIHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISSQSIRVTW
.:.:.::.:.::::::. :.::.::::.::::...::::::::..: :.:..::::.:::
XP_011 NIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQPVTSQSIQVTW
960 970 980 990 1000 1010
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB3 KAPKKHLQNGIIRGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQ
:::::.::::.:::::::::: : :.: :..:. . ..:::::::::::.::.:::.:::
XP_011 KAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNLKKFAQYGVVVQ
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KB3 ACNRAGTGPSSQEIITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALNGILQGFR
: :::::::::.:: .:::::::: :::::.:.. . . :::: . .:::.:.:.:
XP_011 AFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPRSTLNGVLKGYR
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KB3 VIYWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSEQIFTRTK
::.:. .::: ::..:::::. .:: :.::.::::.::::.:.::::::: .. .::
XP_011 VIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTK
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KB3 EDVPGPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHP---YPTVISEFEASPD
:::::::::.::. .::: : :::::: : ::.:::::.::: : :. ::.:.::.
XP_011 EDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQPAP-SEYETSPE
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KB3 SFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARILTFSGTVTTPWMKD
.. ::: .:.:..:: .::.:::::::::::: .:.:: .::::.:..:.::::::::::
XP_011 QLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFGGTVTTPWMKD
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KB3 IVLPCKAVGDPSPAVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSGYYSCIAN
. :::..::::.::::: :::. . :..::.: : .::....:.:::::::::.: :.
XP_011 VRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAEDSGYYTCTAT
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KB3 NNWGSDEIILNLQVQVPPDQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSE
:. : : ::.:: :::::::::::::::..:::::.:.:::::::::::..:::: ::::
XP_011 NTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGFVLQYSVDNSE
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KB3 QWGSFPISPSERSYRLENLKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQE
.: . :: ::::..:..:::::::: :.:.:.:: ::::::::::: :.::.:::.:.
XP_011 EWKDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHGREPSFSKDQH
1440 1450 1460 1470 1480 1490
1490 1500 1510 1520 1530 1540
pF1KB3 LFASINTTRVRLNLIGWNDGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYILYDLQEAT
::. ::.:..:::: :::.::::::...::::: :: .: . :.. : .: .:.:::
XP_011 LFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQ-GLRANSSGEVFLTELREAT
1500 1510 1520 1530 1540 1550
1550 1560 1570 1580 1590 1600
pF1KB3 WYELQMRVCNSAGCAEKQANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKMLVTISCI
::::.::.::::::... :.::::.:::::::: :::. :.: .. .: : ::.:
XP_011 WYELRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPP-IKSA-QGE-----GDDVKKLFTIGCP
1560 1570 1580 1590 1600 1610
1610 1620 1630 1640 1650 1660
pF1KB3 LVGVLLLFVLLLVVRRRRREQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTSDTLSK-QQQTLRMHID
.. . : .::..::..:.:.:::::::::::::::.:::.:. :: : : :.:::
XP_011 VILATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPPQGPRLHID
1620 1630 1640 1650 1660 1670
1670 1680 1690 1700 1710 1720
pF1KB3 IPRAQLLIEERDTMETI-DDRSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTVHYQSVSQATGPLVD
:::.:::::... .. . ::..:. .:::.:..:.. .:. . ..:. .. :.::::.:
XP_011 IPRVQLLIEDKEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLIQSTGPLID
1680 1690 1700 1710 1720 1730
1730 1740 1750 1760 1770 1780
pF1KB3 VSDARPGTNPTTRRNAKAGPTARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTTDWRLPTPRAAGSVD
.:: ::::::..:.:.:.. ..::::.:::::.. . . :.:::.::: . : .
XP_011 MSDIRPGTNPVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRT-VGSQHGVTV
1740 1750 1760 1770 1780
1790 1800 1810 1820 1830 1840
pF1KB3 KESDSYSVSPSQDTDRARSSMVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQLRHAKFTITECFIS
::::::.: :::::..:.:::::::::::::::::::::::.::::.:::: :::::::
XP_011 TESDSYSASLSQDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFEITECFIS
1790 1800 1810 1820 1830 1840
1850 1860 1870 1880 1890
pF1KB3 DTSSEQLTAGTNEYTDSLTS-STPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMNMAVPKAHRPG--D
:.::.:.:.:::: .::.:: ::::: ::::::::::::::. : :.::: :: . :
XP_011 DSSSDQMTTGTNENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIPHRANKSD
1850 1860 1870 1880 1890 1900
1900 1910 1920 1930 1940 1950
pF1KB3 LIHLPPYLRMDFLLNRGGPGTSRDLSLGQAC--LEPQKS--RTLKRP--TVLEPIPMEAA
.:: : . . .. : . : . : . :... :.: : : . . .. :
XP_011 YCNLPLYAKSEAFF-RKADGR-------EPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPA
1910 1920 1930 1940 1950 1960
1960 1970 1980 1990 2000 2010
pF1KB3 SSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELGQAAKMSSSQESLLDSRGHLKGNNPYAKSYTL
:.. . . . ...::::::
XP_011 SKSLGLPHPGAPAAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPPAPSTE
1970 1980 1990 2000 2010 2020
>>XP_011541221 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndrome c (1626 aa)
initn: 3842 init1: 1862 opt: 6487 Z-score: 3386.1 bits: 639.8 E(85289): 7.3e-182
Smith-Waterman score: 6489; 61.9% identity (84.3% similar) in 1563 aa overlap (427-1974:1-1545)
400 410 420 430 440 450
pF1KB3 YVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSPAEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRIS
:: .::.: ::.::.:::.::.. :::: .
XP_011 MCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVRDGSHRTN
10 20 30
460 470 480 490 500 510
pF1KB3 QMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGGVYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAI
:. :.:...:..:... :.:::::::::: : .: . :::::::::: ::: :.::::.
XP_011 QYTMSDGTTISHMNVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRAMRNITAV
40 50 60 70 80 90
520 530 540 550 560 570
pF1KB3 AGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKNSNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVDEGEYTCN
::::: :.:::::::::::::::.. ::: :::::.::: :::::.:::: .::::: :.
XP_011 AGRDTLINCRVIGYPYYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFEN-GTLKLTDVQKGMDEGEYLCS
100 110 120 130 140
580 590 600 610 620 630
pF1KB3 VLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFIQPFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRP
::.::::: ::::::.:::::.::::::: :::: ..::::: :::.:: :::.:::.
XP_011 VLIQPQLSISQSVHVAVKVPPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQV
150 160 170 180 190 200
640 650 660 670 680 690
pF1KB3 IPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNLSLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQP
: .. ::::.. .: :::.::..:: ::::::::: : ::.: .. ::::::::.:::::
XP_011 IISGSGVTIESKEFMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQP
210 220 230 240 250 260
700 710 720 730 740 750
pF1KB3 RDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPTIVWKFSKGAGVPQ-FQPIALNGRIQVLSNGSLLIKH
.:::::::: .::::..::: : ..:: .::.: :: ..:. :.::::.: :.::::.:
XP_011 NNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRH
270 280 290 300 310 320
760 770 780 790 800 810
pF1KB3 VVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEK
:.::: :::::..:: ::.:.::::.:::::::::::.::::.: .:. ::..:::.::.
XP_011 VLEEDIGYYLCQASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGER
330 340 350 360 370 380
820 830 840 850 860 870
pF1KB3 PIIVRWEKEDRIINPE-MARYLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGED
:::.:::: : .:.:. . :: ..::. :.::.:::.. :. : :: :::::::::::::
XP_011 PIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGED
390 400 410 420 430 440
880 890 900 910 920 930
pF1KB3 RGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKARTITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQR
::.:::::::::::::.::..::::...::::. ::::: :::.::: :::::::: :
XP_011 RGLIQLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQS
450 460 470 480 490 500
940 950 960 970 980 990
pF1KB3 TKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLE
:...:: .:.:.:.:.::.:.::::::. :.::.::::.::::...::::::::..: :.
XP_011 TRNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQ
510 520 530 540 550 560
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB3 PISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNL
:..::::.::::::::.::::.:::::::::: : :.: :..:. . ..:::::::::::
XP_011 PVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNL
570 580 590 600 610 620
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KB3 NKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEIITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSK
.::.:::.:::: :::::::::.:: .:::::::: :::::.:.. . . :::: .
XP_011 KKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPR
630 640 650 660 670 680
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KB3 EALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDG
.:::.:.:.:::.:. .::: ::..:::::. .:: :.::.::::.::::.:.::::
XP_011 STLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDG
690 700 710 720 730 740
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KB3 VRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHPYP--T
::: .. .:::::::::::.::. .::: : :::::: : ::.:::::.::: :
XP_011 VRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQP
750 760 770 780 790 800
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KB3 VISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARILTFS
. ::.:.::... ::: .:.:..:: .::.:::::::::::: .:.:: .::::.:..:.
XP_011 APSEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFG
810 820 830 840 850 860
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KB3 GTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAE
::::::::::. :::..::::.::::: :::. . :..::.: : .::....:.::::
XP_011 GTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAE
870 880 890 900 910 920
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KB3 DSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPPDQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGY
:::::.: :.:. : : ::.:: :::::::::::::::..:::::.:.:::::::::::.
XP_011 DSGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGF
930 940 950 960 970 980
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KB3 ILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLENLKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLG
.:::: ::::.: . :: ::::..:..:::::::: :.:.:.:: ::::::::::: :
XP_011 VLQYSVDNSEEWKDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHG
990 1000 1010 1020 1030 1040
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KB3 KEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWNDGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKS
.::.:::.:.::. ::.:..:::: :::.::::::...::::: :: .: . :.. :
XP_011 REPSFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQ-GLRANSSGE
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KB3 YILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEG
.: .:.:::::::.::.::::::... :.::::.:::::::: :::. :.: ..
XP_011 VFLTELREATWYELRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPP-IKSA-QGE-----GDD
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1600 1610 1620 1630 1640 1650
pF1KB3 LKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRRREQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTSDTLSK-
.: : ::.: .. . : .::..::..:.:.:::::::::::::::.:::.:. :: :
XP_011 VKKLFTIGCPVILATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKG
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1660 1670 1680 1690 1700 1710
pF1KB3 QQQTLRMHIDIPRAQLLIEERDTMETI-DDRSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTVHYQS
: :.::::::.:::::... .. . ::..:. .:::.:..:.. .:. . ..:. .
XP_011 PPQGPRLHIDIPRVQLLIEDKEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPT
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1720 1730 1740 1750 1760 1770
pF1KB3 VSQATGPLVDVSDARPGTNPTTRRNAKAGPTARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTTDWRL
. :.::::.:.:: ::::::..:.:.:.. ..::::.:::::.. . . :.:::.:::
XP_011 LIQSTGPLIDMSDIRPGTNPVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRT
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1780 1790 1800 1810 1820 1830
pF1KB3 PTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQDTDRARSSMVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQLRHA
. : . ::::::.: :::::..:.:::::::::::::::::::::::.::::.::
XP_011 -VGSQHGVTVTESDSYSASLSQDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHA
1350 1360 1370 1380 1390 1400
1840 1850 1860 1870 1880
pF1KB3 KFTITECFISDTSSEQLTAGTNEYTDSLTS-STPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMNMAV
:: ::::::::.::.:.:.:::: .::.:: ::::: ::::::::::::::. : :.::
XP_011 KFEITECFISDSSSDQMTTGTNENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAV
1410 1420 1430 1440 1450 1460
1890 1900 1910 1920 1930 1940
pF1KB3 PKAHRPG--DLIHLPPYLRMDFLLNRGGPGTSRDLSLGQAC--LEPQKS--RTLKRP--T
: :: . : .:: : . . .. : . : . : . :... :.: : :
XP_011 PIPHRANKSDYCNLPLYAKSEAFF-RKADGR-------EPCPVVPPREASIRNLARTYHT
1470 1480 1490 1500 1510
1950 1960 1970 1980 1990 2000
pF1KB3 VLEPIPMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELGQAAKMSSSQESLLDSRGHLKG
. . .. ::.. . . . ...::::::
XP_011 QARHLTLDPASKSLGLPHPGAPAAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAP
1520 1530 1540 1550 1560 1570
2010
pF1KB3 NNPYAKSYTLV
XP_011 SAAPPAPSTEPPRAGGPHTKMGGSRDSLLEMSTSGVGRSQKQGAGAYSKSYTLV
1580 1590 1600 1610 1620
>>XP_011541222 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndrome c (1543 aa)
initn: 4685 init1: 1862 opt: 6117 Z-score: 3194.5 bits: 604.2 E(85289): 3.4e-171
Smith-Waterman score: 6119; 62.1% identity (84.3% similar) in 1481 aa overlap (510-1974:1-1462)
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 GVYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYK
:.::::.::::: :.:::::::::::::::
XP_011 MRNITAVAGRDTLINCRVIGYPYYSIKWYK
10 20 30
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 NSNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFI
.. ::: :::::.::: :::::.:::: .::::: :.::.::::: ::::::.:::::.:
XP_011 DALLLPDNHRQVVFEN-GTLKLTDVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQSVHVAVKVPPLI
40 50 60 70 80
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 QPFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNL
:::::: :::: ..::::: :::.:: :::.:::. : .. ::::.. .: :::.::..
XP_011 QPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESKEFMSSLQISSV
90 100 110 120 130 140
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 SLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVP
:: ::::::::: : ::.: .. ::::::::.::::: .:::::::: .::::..::: :
XP_011 SLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPP
150 160 170 180 190 200
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 TIVWKFSKGAGVPQ-FQPIALNGRIQVLSNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSK
..:: .::.: :: ..:. :.::::.: :.::::.::.::: :::::..:: ::.:.::
XP_011 KVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDISK
210 220 230 240 250 260
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 SMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPE-MARYLV
::.:::::::::::.::::.: .:. ::..:::.::.:::.:::: : .:.:. . :: .
XP_011 SMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAI
270 280 290 300 310 320
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 STKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVK
.::. :.::.:::.. :. : :: :::::::::::::::.:::::::::::::.::..::
XP_011 ATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQEPPDPPELEIREVK
330 340 350 360 370 380
900 910 920 930 940 950
pF1KB3 ARTITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYS
::...::::. ::::: :::.::: :::::::: : :...:: .:.:.:.:.::.:.::
XP_011 ARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNISPTINQANIVDLHPASVYS
390 400 410 420 430 440
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB3 IRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGII
::::. :.::.::::.::::...::::::::..: :.:..::::.::::::::.::::.:
XP_011 IRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQPVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVI
450 460 470 480 490 500
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB3 RGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQ
::::::::: : :.: :..:. . ..:::::::::::.::.:::.:::: :::::::::.
XP_011 RGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSS
510 520 530 540 550 560
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB3 EIITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGEL
:: .:::::::: :::::.:.. . . :::: . .:::.:.:.:::.:. .:::
XP_011 EINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEW
570 580 590 600 610 620
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KB3 GEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKA
::..:::::. .:: :.::.::::.::::.:.::::::: .. .:::::::::::.::
XP_011 GEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKA
630 640 650 660 670 680
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KB3 AAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHP---YPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRN
. .::: : :::::: : ::.:::::.::: : :. ::.:.::... ::: .:.:.
XP_011 VPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQPAP-SEYETSPEQLFYRIAHLNRG
690 700 710 720 730 740
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KB3 RQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPS
.:: .::.:::::::::::: .:.:: .::::.:..:.::::::::::. :::..::::.
XP_011 QQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFGGTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPA
750 760 770 780 790 800
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KB3 PAVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNL
::::: :::. . :..::.: : .::....:.:::::::::.: :.:. : : ::.::
XP_011 PAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDTIIVNL
810 820 830 840 850 860
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KB3 QVQVPPDQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSER
:::::::::::::::..:::::.:.:::::::::::..:::: ::::.: . :: :::
XP_011 LVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGFVLQYSVDNSEEWKDVFISSSER
870 880 890 900 910 920
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KB3 SYRLENLKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRL
:..:..:::::::: :.:.:.:: ::::::::::: :.::.:::.:.::. ::.:..::
XP_011 SFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHGREPSFSKDQHLFTHINSTHARL
930 940 950 960 970 980
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KB3 NLIGWNDGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSA
:: :::.::::::...::::: :: .: . :.. : .: .:.:::::::.::.::::
XP_011 NLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQ-GLRANSSGEVFLTELREATWYELRMRACNSA
990 1000 1010 1020 1030 1040
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KB3 GCAEKQANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLL
::... :.::::.:::::::: :::. :.: .. .: : ::.: .. . : .::.
XP_011 GCGNETAQFATLDYDGSTIPP-IKSA-QGE-----GDDVKKLFTIGCPVILATLGVALLF
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KB3 VVRRRRREQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTSDTLSK-QQQTLRMHIDIPRAQLLIEERD
.::..:.:.:::::::::::::::.:::.:. :: : : :.::::::.:::::...
XP_011 IVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPPQGPRLHIDIPRVQLLIEDKE
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1680 1690 1700 1710 1720 1730
pF1KB3 TMETI-DDRSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTVHYQSVSQATGPLVDVSDARPGTNPTT
.. . ::..:. .:::.:..:.. .:. . ..:. .. :.::::.:.:: ::::::..
XP_011 GIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLIQSTGPLIDMSDIRPGTNPVS
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1740 1750 1760 1770 1780 1790
pF1KB3 RRNAKAGPTARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTTDWRLPTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQ
:.:.:.. ..::::.:::::.. . . :.:::.::: . : . ::::::.: ::
XP_011 RKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRT-VGSQHGVTVTESDSYSASLSQ
1230 1240 1250 1260 1270
1800 1810 1820 1830 1840 1850
pF1KB3 DTDRARSSMVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQLRHAKFTITECFISDTSSEQLTAGTN
:::..:.:::::::::::::::::::::::.::::.:::: ::::::::.::.:.:.:::
XP_011 DTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFEITECFISDSSSDQMTTGTN
1280 1290 1300 1310 1320 1330
1860 1870 1880 1890 1900
pF1KB3 EYTDSLTS-STPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMNMAVPKAHRPG--DLIHLPPYLRMDF
: .::.:: ::::: ::::::::::::::. : :.::: :: . : .:: : . .
XP_011 ENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIPHRANKSDYCNLPLYAKSEA
1340 1350 1360 1370 1380 1390
1910 1920 1930 1940 1950 1960
pF1KB3 LLNRGGPGTSRDLSLGQAC--LEPQKS--RTLKRP--TVLEPIPMEAASSASSTREGQSW
.. : . : . : . :... :.: : : . . .. ::.. . . .
XP_011 FF-RKADGR-------EPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPASKSLGLPHPGAP
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1970 1980 1990 2000 2010
pF1KB3 QPGAVATLPQREGAELGQAAKMSSSQESLLDSRGHLKGNNPYAKSYTLV
...::::::
XP_011 AAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPPAPSTEPPRAGGPHTKMG
1460 1470 1480 1490 1500 1510
>>XP_011541223 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndrome c (1344 aa)
initn: 3842 init1: 1862 opt: 4801 Z-score: 2512.8 bits: 477.9 E(85289): 3.2e-133
Smith-Waterman score: 4803; 58.6% identity (81.8% similar) in 1260 aa overlap (734-1974:26-1263)
710 720 730 740 750 760
pF1KB3 GKAVILNCSAEGYPVPTIVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVLSNGSLLIKHVVEEDSGY
: :. . : ::.: :. . .
XP_011 MDYAFPDAPQSKLMSPNPLMKHSSDFPPVHVAGAATECSNSS----PVTVTSRNP
10 20 30 40 50
770 780 790 800 810
pF1KB3 YLCKVSNDVGADVSK-SMY---LTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIV
.:. : :..:: .: : ..::::::.::::.: .:. ::..:::.::.:::.
XP_011 RICSHHITVIANISKYHLYAALLQDHVPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIII
60 70 80 90 100 110
820 830 840 850 860 870
pF1KB3 RWEKEDRIINPE-MARYLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGII
:::: : .:.:. . :: ..::. :.::.:::.. :. : :: :::::::::::::::.:
XP_011 RWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLI
120 130 140 150 160 170
880 890 900 910 920 930
pF1KB3 QLTVQEPPDPPEIEIKDVKARTITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQRTKDV
::::::::::::.::..::::...::::. ::::: :::.::: :::::::: : :...
XP_011 QLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNI
180 190 200 210 220 230
940 950 960 970 980 990
pF1KB3 SPQLNSATIIDIHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISS
:: .:.:.:.:.::.:.::::::. :.::.::::.::::...::::::::..: :.:..:
XP_011 SPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQPVTS
240 250 260 270 280 290
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB3 QSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFT
:::.::::::::.::::.:::::::::: : :.: :..:. . ..:::::::::::.::.
XP_011 QSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNLKKFA
300 310 320 330 340 350
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KB3 QYGLVVQACNRAGTGPSSQEIITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALN
:::.:::: :::::::::.:: .:::::::: :::::.:.. . . :::: . .::
XP_011 QYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPRSTLN
360 370 380 390 400 410
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KB3 GILQGFRVIYWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSE
:.:.:.:::.:. .::: ::..:::::. .:: :.::.::::.::::.:.:::::::
XP_011 GVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSS
420 430 440 450 460 470
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KB3 QIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHP---YPTVIS
.. .:::::::::::.::. .::: : :::::: : ::.:::::.::: : :. :
XP_011 VLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQPAP-S
480 490 500 510 520 530
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KB3 EFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARILTFSGTV
:.:.::... ::: .:.:..:: .::.:::::::::::: .:.:: .::::.:..:.:::
XP_011 EYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFGGTV
540 550 560 570 580 590
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KB3 TTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSG
:::::::. :::..::::.::::: :::. . :..::.: : .::....:.:::::::
XP_011 TTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAEDSG
600 610 620 630 640 650
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KB3 YYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPPDQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGYILQ
::.: :.:. : : ::.:: :::::::::::::::..:::::.:.:::::::::::..::
XP_011 YYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGFVLQ
660 670 680 690 700 710
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KB3 YSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLENLKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEP
:: ::::.: . :: ::::..:..:::::::: :.:.:.:: ::::::::::: :.::
XP_011 YSVDNSEEWKDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHGREP
720 730 740 750 760 770
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KB3 QFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWNDGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYIL
.:::.:.::. ::.:..:::: :::.::::::...::::: :: .: . :.. : .:
XP_011 SFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQ-GLRANSSGEVFL
780 790 800 810 820
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KB3 YDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKM
.:.:::::::.::.::::::... :.::::.:::::::: :::. :.: .. .:
XP_011 TELREATWYELRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPP-IKSA-QGE-----GDDVKK
830 840 850 860 870 880
1600 1610 1620 1630 1640 1650
pF1KB3 LVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRRREQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTSDTLSK-QQQ
: ::.: .. . : .::..::..:.:.:::::::::::::::.:::.:. :: : :
XP_011 LFTIGCPVILATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPPQ
890 900 910 920 930 940
1660 1670 1680 1690 1700 1710
pF1KB3 TLRMHIDIPRAQLLIEERDTMETI-DDRSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTVHYQSVSQ
:.::::::.:::::... .. . ::..:. .:::.:..:.. .:. . ..:. .. :
XP_011 GPRLHIDIPRVQLLIEDKEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLIQ
950 960 970 980 990 1000
1720 1730 1740 1750 1760 1770
pF1KB3 ATGPLVDVSDARPGTNPTTRRNAKAGPTARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTTDWRLPTP
.::::.:.:: ::::::..:.:.:.. ..::::.:::::.. . . :.:::.:::
XP_011 STGPLIDMSDIRPGTNPVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVGS
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1780 1790 1800 1810 1820 1830
pF1KB3 RAAGSVDKESDSYSVSPSQDTDRARSSMVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQLRHAKFT
. . .: ::::::.: :::::..:.:::::::::::::::::::::::.::::.::::
XP_011 QHGVTVT-ESDSYSASLSQDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFE
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1840 1850 1860 1870 1880 1890
pF1KB3 ITECFISDTSSEQLTAGTNEYTDSLTS-STPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMNMAVPKA
::::::::.::.:.:.:::: .::.:: ::::: ::::::::::::::. : :.:::
XP_011 ITECFISDSSSDQMTTGTNENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIP
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1900 1910 1920 1930 1940
pF1KB3 HRPG--DLIHLPPYLRMDFLLNRGGPGTSRDLSLGQAC--LEPQKS--RTLKRP--TVLE
:: . : .:: : . . .. : . : . : . :... :.: : : .
XP_011 HRANKSDYCNLPLYAKSEAFF-RKADGR-------EPCPVVPPREASIRNLARTYHTQAR
1190 1200 1210 1220 1230
1950 1960 1970 1980 1990 2000
pF1KB3 PIPMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELGQAAKMSSSQESLLDSRGHLKGNNP
. .. ::.. . . . ...::::::
XP_011 HLTLDPASKSLGLPHPGAPAAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAA
1240 1250 1260 1270 1280 1290
>>XP_011541226 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndrome c (1270 aa)
initn: 3842 init1: 1862 opt: 4779 Z-score: 2501.6 bits: 475.8 E(85289): 1.3e-132
Smith-Waterman score: 4781; 60.1% identity (83.4% similar) in 1203 aa overlap (786-1974:4-1189)
760 770 780 790 800 810
pF1KB3 VVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEK
.::::::.::::.: .:. ::..:::.::.
XP_011 MESVPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGER
10 20 30
820 830 840 850 860 870
pF1KB3 PIIVRWEKEDRIINPE-MARYLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGED
:::.:::: : .:.:. . :: ..::. :.::.:::.. :. : :: :::::::::::::
XP_011 PIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGED
40 50 60 70 80 90
880 890 900 910 920 930
pF1KB3 RGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKARTITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQR
::.:::::::::::::.::..::::...::::. ::::: :::.::: :::::::: :
XP_011 RGLIQLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQS
100 110 120 130 140 150
940 950 960 970 980 990
pF1KB3 TKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLE
:...:: .:.:.:.:.::.:.::::::. :.::.::::.::::...::::::::..: :.
XP_011 TRNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQ
160 170 180 190 200 210
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB3 PISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNL
:..::::.::::::::.::::.:::::::::: : :.: :..:. . ..:::::::::::
XP_011 PVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNL
220 230 240 250 260 270
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KB3 NKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEIITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSK
.::.:::.:::: :::::::::.:: .:::::::: :::::.:.. . . :::: .
XP_011 KKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPR
280 290 300 310 320 330
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KB3 EALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDG
.:::.:.:.:::.:. .::: ::..:::::. .:: :.::.::::.::::.:.::::
XP_011 STLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDG
340 350 360 370 380 390
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KB3 VRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHPYP--T
::: .. .:::::::::::.::. .::: : :::::: : ::.:::::.::: :
XP_011 VRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQP
400 410 420 430 440 450
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KB3 VISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARILTFS
. ::.:.::... ::: .:.:..:: .::.:::::::::::: .:.:: .::::.:..:.
XP_011 APSEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFG
460 470 480 490 500 510
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KB3 GTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAE
::::::::::. :::..::::.::::: :::. . :..::.: : .::....:.::::
XP_011 GTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAE
520 530 540 550 560 570
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KB3 DSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPPDQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGY
:::::.: :.:. : : ::.:: :::::::::::::::..:::::.:.:::::::::::.
XP_011 DSGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGF
580 590 600 610 620 630
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KB3 ILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLENLKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLG
.:::: ::::.: . :: ::::..:..:::::::: :.:.:.:: ::::::::::: :
XP_011 VLQYSVDNSEEWKDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHG
640 650 660 670 680 690
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KB3 KEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWNDGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKS
.::.:::.:.::. ::.:..:::: :::.::::::...::::: :: .: . :.. :
XP_011 REPSFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQ-GLRANSSGE
700 710 720 730 740 750
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KB3 YILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEG
.: .:.:::::::.::.::::::... :.::::.:::::::: :::. :.: ..
XP_011 VFLTELREATWYELRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPP-IKSA-QGE-----GDD
760 770 780 790 800
1600 1610 1620 1630 1640 1650
pF1KB3 LKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRRREQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTSDTLSK-
.: : ::.: .. . : .::..::..:.:.:::::::::::::::.:::.:. :: :
XP_011 VKKLFTIGCPVILATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKG
810 820 830 840 850 860
1660 1670 1680 1690 1700 1710
pF1KB3 QQQTLRMHIDIPRAQLLIEERDTMETI-DDRSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTVHYQS
: :.::::::.:::::... .. . ::..:. .:::.:..:.. .:. . ..:. .
XP_011 PPQGPRLHIDIPRVQLLIEDKEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPT
870 880 890 900 910 920
1720 1730 1740 1750 1760 1770
pF1KB3 VSQATGPLVDVSDARPGTNPTTRRNAKAGPTARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTTDWRL
. :.::::.:.:: ::::::..:.:.:.. ..::::.:::::.. . . :.:::.:::
XP_011 LIQSTGPLIDMSDIRPGTNPVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRT
930 940 950 960 970 980
1780 1790 1800 1810 1820 1830
pF1KB3 PTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQDTDRARSSMVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQLRHA
. : . ::::::.: :::::..:.:::::::::::::::::::::::.::::.::
XP_011 -VGSQHGVTVTESDSYSASLSQDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHA
990 1000 1010 1020 1030 1040
1840 1850 1860 1870 1880
pF1KB3 KFTITECFISDTSSEQLTAGTNEYTDSLTS-STPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMNMAV
:: ::::::::.::.:.:.:::: .::.:: ::::: ::::::::::::::. : :.::
XP_011 KFEITECFISDSSSDQMTTGTNENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAV
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1890 1900 1910 1920 1930 1940
pF1KB3 PKAHRPG--DLIHLPPYLRMDFLLNRGGPGTSRDLSLGQAC--LEPQKS--RTLKRP--T
: :: . : .:: : . . .. : . : . : . :... :.: : :
XP_011 PIPHRANKSDYCNLPLYAKSEAFF-RKADGR-------EPCPVVPPREASIRNLARTYHT
1110 1120 1130 1140 1150
1950 1960 1970 1980 1990 2000
pF1KB3 VLEPIPMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELGQAAKMSSSQESLLDSRGHLKG
. . .. ::.. . . . ...::::::
XP_011 QARHLTLDPASKSLGLPHPGAPAAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAP
1160 1170 1180 1190 1200 1210
2010
pF1KB3 NNPYAKSYTLV
XP_011 SAAPPAPSTEPPRAGGPHTKMGGSRDSLLEMSTSGVGRSQKQGAGAYSKSYTLV
1220 1230 1240 1250 1260 1270
2012 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 22:49:29 2016 done: Wed Nov 2 22:49:32 2016
Total Scan time: 15.750 Total Display time: 1.240
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]