Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB3816
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3816, 2012 aa
1>>>pF1KB3816 2012 - 2012 aa - 2012 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6731+/-0.00161; mu= 8.2996+/- 0.094
mean_var=251.7406+/-52.931, 0's: 0 Z-trim(104.4): 212 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.080835
statistics sampled from 7670 (7888) to 7670 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.582), E-opt: 0.2 (0.242), width: 16
Scan time: 4.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42929.1 DSCAM gene_id:1826|Hs108|chr21 (2012) 13294 1566.5 0
CCDS8384.1 DSCAML1 gene_id:57453|Hs108|chr11 (2113) 8228 975.7 0
CCDS33790.1 CNTN3 gene_id:5067|Hs108|chr3 (1028) 852 115.2 1.4e-24
CCDS55153.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1192) 806 109.9 6.3e-23
CCDS54424.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (33423) 787 109.2 3e-21
CCDS74610.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (34350) 787 109.2 3.1e-21
CCDS59435.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (35991) 787 109.2 3.2e-21
CCDS53957.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1408) 744 102.8 1.1e-20
CCDS58378.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1450) 744 102.8 1.1e-20
CCDS10247.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1461) 744 102.8 1.1e-20
CCDS75652.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1211) 715 99.3 1e-19
CCDS47686.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1304) 715 99.4 1e-19
CCDS14734.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1253) 669 94.0 4.2e-18
CCDS14733.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1257) 669 94.0 4.2e-18
CCDS48192.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1248) 665 93.5 5.8e-18
CCDS12140.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1910) 636 90.3 8.1e-17
CCDS43109.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3 (1378) 622 88.5 2e-16
CCDS54609.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3 (1394) 622 88.5 2e-16
CCDS490.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1898) 621 88.6 2.7e-16
CCDS44755.1 ROBO3 gene_id:64221|Hs108|chr11 (1386) 594 85.3 1.9e-15
CCDS489.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1907) 530 78.0 4.3e-13
CCDS53461.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 ( 619) 514 75.6 7.1e-13
CCDS53460.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 (1240) 514 75.9 1.2e-12
CCDS5751.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1183) 507 75.1 2e-12
CCDS3160.1 IGSF10 gene_id:285313|Hs108|chr3 (2623) 502 74.8 5.1e-12
CCDS11952.1 DCC gene_id:1630|Hs108|chr18 (1447) 488 72.9 1.1e-11
>>CCDS42929.1 DSCAM gene_id:1826|Hs108|chr21 (2012 aa)
initn: 13294 init1: 13294 opt: 13294 Z-score: 8393.0 bits: 1566.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 13294; 100.0% identity (100.0% similar) in 2012 aa overlap (1-2012:1-2012)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MWILALSLFQSFANVFSEDLHSSLYFVNASLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MWILALSLFQSFANVFSEDLHSSLYFVNASLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWYL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 ATGEEIYDVPGIRHVHPNGTLQIFPFPPSSFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ATGEEIYDVPGIRHVHPNGTLQIFPFPPSSFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VLREPYTVRVEDQKTMRGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VLREPYTVRVEDQKTMRGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTGA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 LYIKDVQNEDGLYNYRCITRHRYTGETRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFEHRKAMAGQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS42 LYIKDVQNEDGLYNYRCITRHRYTGETRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFDHRKAMAGQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 RVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLELSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLELSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 TAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 RITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 AEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 VYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 SNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFIQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 PFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNLS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 LMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 IVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVLSNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVLSNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSM
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 YLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPEMARYLVSTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 YLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPEMARYLVSTK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 EVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKART
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKART
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 ITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRM
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 YAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 YAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGY
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB3 QIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEII
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB3 TTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEI
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB3 KNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB3 SASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVW
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB3 VVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWM
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB3 KDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPP
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB3 DQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLEN
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB3 LKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWN
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB3 DGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQ
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB3 ANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRR
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KB3 REQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTSDTLSKQQQTLRMHIDIPRAQLLIEERDTMETIDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 REQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTSDTLSKQQQTLRMHIDIPRAQLLIEERDTMETIDD
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KB3 RSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTVHYQSVSQATGPLVDVSDARPGTNPTTRRNAKAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTVHYQSVSQATGPLVDVSDARPGTNPTTRRNAKAGP
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KB3 TARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTTDWRLPTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQDTDRARSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTTDWRLPTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQDTDRARSS
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KB3 MVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQLRHAKFTITECFISDTSSEQLTAGTNEYTDSLTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQLRHAKFTITECFISDTSSEQLTAGTNEYTDSLTS
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KB3 STPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMNMAVPKAHRPGDLIHLPPYLRMDFLLNRGGPGTSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 STPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMNMAVPKAHRPGDLIHLPPYLRMDFLLNRGGPGTSR
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KB3 DLSLGQACLEPQKSRTLKRPTVLEPIPMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DLSLGQACLEPQKSRTLKRPTVLEPIPMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELG
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010
pF1KB3 QAAKMSSSQESLLDSRGHLKGNNPYAKSYTLV
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QAAKMSSSQESLLDSRGHLKGNNPYAKSYTLV
1990 2000 2010
>>CCDS8384.1 DSCAML1 gene_id:57453|Hs108|chr11 (2113 aa)
initn: 4633 init1: 2653 opt: 8228 Z-score: 5199.8 bits: 975.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8230; 60.9% identity (84.2% similar) in 1991 aa overlap (1-1974:61-2032)
10 20
pF1KB3 MWILA-LSLFQSFANVFSEDLHSSLYFVNA
::... : :..:. .. ::. .::::::
CCDS83 GGWERAERGRGAAARPATGPPPRRIGPLYGMWLVTFLLLLDSLHKARPEDVGTSLYFVND
40 50 60 70 80 90
30 40 50 60 70 80
pF1KB3 SLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWYLATGEEIYDVPGIRHVHPNGTLQIFPFPPS
:::.:.:.:..:..::::::: : ..::::::::..::::: ::::: :::::..:: ::
CCDS83 SLQQVTFSSSVGVVVPCPAAGSPSAALRWYLATGDDIYDVPHIRHVHANGTLQLYPFSPS
100 110 120 130 140 150
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 SFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKAVLREPYTVRVEDQKTMRGNVAVFKCIIPS
.:...:::: :.::::: .::::: ....:::.:::::::::::..::::::::::.:::
CCDS83 AFNSFIHDNDYFCTAENAAGKIRSPNIRVKAVFREPYTVRVEDQRSMRGNVAVFKCLIPS
160 170 180 190 200 210
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 SVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTGALYIKDVQNEDGLYNYRCITRHRYTGETRQ
::. :..::::::::::.. ::.:: :.:::.:::.::.: .:::::.:.:.:::::
CCDS83 SVQEYVSVVSWEKDTVSIIPEHRFFITYHGGLYISDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQ
220 230 240 250 260 270
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 SNSARLFVSDPANSAPSILDGFEHRKAMAGQRVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLELSG
::.::: :.:::.: :.:::::. ... ::. ::::: : :.: : :::::. :: ..
CCDS83 SNGARLSVTDPAESIPTILDGFHSQEVWAGHTVELPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADS
280 290 300 310 320 330
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 RFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYGTAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGS
:. : .::: : ..: :::.:.:::.: .:.:.. : :.: .::..:..:.:.:...::
CCDS83 RWTKRITGLTISDLRTEDSGTYICEVTNTFGSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGS
340 350 360 370 380 390
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 QVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNVRITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCFVRK
: :::..::. . . :::: :.. : . . : :...:.:.. :: .::::::. .
CCDS83 TVILSCALTGSPEFTIRWYRNTELVLPDEAISIRGLSNETLLITSAQKSHSGAYQCFATR
400 410 420 430 440 450
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 DKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSPAEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILK
.:::.. ..::::::.:.:.::::::.:.: :::: .::.: ::.::.:::.::..
CCDS83 KAQTAQDFAIIALEDGTPRIVSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVR
460 470 480 490 500 510
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 GGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGGVYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRP
:::: .:. :.:...:..:... :.:::::::::: : .: . :::::::::: :::
CCDS83 DGSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRA
520 530 540 550 560 570
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 MKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKNSNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVD
:.::::.::::: :.:::::::::::::::.. ::: :::::.::: :::::.:::: .:
CCDS83 MRNITAVAGRDTLINCRVIGYPYYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFEN-GTLKLTDVQKGMD
580 590 600 610 620
570 580 590 600 610 620
pF1KB3 EGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFIQPFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITIT
:::: :.::.::::: ::::::.:::::.::::::: :::: ..::::: :::.:: ::
CCDS83 EGEYLCSVLIQPQLSISQSVHVAVKVPPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRIT
630 640 650 660 670 680
630 640 650 660 670 680
pF1KB3 WQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNLSLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVP
:.:::. : .. ::::.. .: :::.::..:: ::::::::: : ::.: .. :::::::
CCDS83 WRKDGQVIISGSGVTIESKEFMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVP
690 700 710 720 730 740
690 700 710 720 730 740
pF1KB3 PKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPTIVWKFSKGAGVPQ-FQPIALNGRIQVLSN
:.::::: .:::::::: .::::..::: : ..:: .::.: :: ..:. :.::::.: :
CCDS83 PRFVVQPNNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPN
750 760 770 780 790 800
750 760 770 780 790 800
pF1KB3 GSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMS
.::::.::.::: :::::..:: ::.:.::::.:::::::::::.::::.: .:. ::..
CCDS83 SSLLIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELN
810 820 830 840 850 860
810 820 830 840 850 860
pF1KB3 CTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPE-MARYLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHA
:::.::.:::.:::: : .:.:. . :: ..::. :.::.:::.. :. : :: ::::::
CCDS83 CTARGERPIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHA
870 880 890 900 910 920
870 880 890 900 910 920
pF1KB3 INSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKARTITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSD
:::::::::.:::::::::::::.::..::::...::::. ::::: :::.::: :::::
CCDS83 INSYGEDRGLIQLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSD
930 940 950 960 970 980
930 940 950 960 970 980
pF1KB3 SWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGP
::: : :...:: .:.:.:.:.::.:.::::::. :.::.::::.::::...:::::::
CCDS83 SWDFKQSTRNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGP
990 1000 1010 1020 1030 1040
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KB3 PQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSE
:..: :.:..::::.::::::::.::::.:::::::::: : :.: :..:. . ..::::
CCDS83 PMDVTLQPVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSE
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KB3 VYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEIITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISI
:::::::.::.:::.:::: :::::::::.:: .:::::::: :::::.:.. . . :
CCDS83 VYTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVI
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KB3 SWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLA
::: . .:::.:.:.:::.:. .::: ::..:::::. .:: :.::.::::.::::
CCDS83 SWSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLA
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KB3 FTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCS
.:.::::::: .. .:::::::::::.::. .::: : :::::: : ::.:::::.:::
CCDS83 YTQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCS
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KB3 HP---YPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKA
: :. ::.:.::... ::: .:.:..:: .::.:::::::::::: .:.:: .::
CCDS83 SPGSGQPAP-SEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKA
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KB3 PARILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSF
::.:..:.::::::::::. :::..::::.::::: :::. . :..::.: : .::..
CCDS83 PAKIISFGGTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTL
1350 1360 1370 1380 1390 1400
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KB3 IIRTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPPDQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDN
..:.:::::::::.: :.:. : : ::.:: :::::::::::::::..:::::.:.::::
CCDS83 LLRAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDN
1410 1420 1430 1440 1450 1460
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KB3 GGSSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLENLKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISE
:::::::..:::: ::::.: . :: ::::..:..:::::::: :.:.:.:: :::::
CCDS83 GGSSIRGFVLQYSVDNSEEWKDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISE
1470 1480 1490 1500 1510 1520
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KB3 IIEAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWNDGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTA
:::::: :.::.:::.:.::. ::.:..:::: :::.::::::...::::: :: .: .
CCDS83 IIEAKTHGREPSFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQ-G
1530 1540 1550 1560 1570 1580
1530 1540 1550 1560 1570 1580
pF1KB3 QRTSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNE
:.. : .: .:.:::::::.::.::::::... :.::::.:::::::: :::. :.:
CCDS83 LRANSSGEVFLTELREATWYELRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPP-IKSA-QGE
1590 1600 1610 1620 1630 1640
1590 1600 1610 1620 1630 1640
pF1KB3 EGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRRREQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTR
.. .: : ::.: .. . : .::..::..:.:.:::::::::::::::.:::.:
CCDS83 -----GDDVKKLFTIGCPVILATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNR
1650 1660 1670 1680 1690 1700
1650 1660 1670 1680 1690 1700
pF1KB3 TSDTLSK-QQQTLRMHIDIPRAQLLIEERDTMETI-DDRSTVLLTDADFGEAAKQKSLTV
. :: : : :.::::::.:::::... .. . ::..:. .:::.:..:.. .:. .
CCDS83 SFDTPVKGPPQGPRLHIDIPRVQLLIEDKEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCT
1710 1720 1730 1740 1750 1760
1710 1720 1730 1740 1750 1760
pF1KB3 THTVHYQSVSQATGPLVDVSDARPGTNPTTRRNAKAGPTARNRYASQWTLNRPHPTISAH
..:. .. :.::::.:.:: ::::::..:.:.:.. ..::::.:::::.. . . :.
CCDS83 GVSLHHPTLIQSTGPLIDMSDIRPGTNPVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPAR
1770 1780 1790 1800 1810 1820
1770 1780 1790 1800 1810 1820
pF1KB3 TLTTDWRLPTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQDTDRARSSMVSTESASSTYEELARAYEHAK
:::.::: . : . ::::::.: :::::..:.:::::::::::::::::::::::
CCDS83 TLTSDWRT-VGSQHGVTVTESDSYSASLSQDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAK
1830 1840 1850 1860 1870
1830 1840 1850 1860 1870 1880
pF1KB3 MEEQLRHAKFTITECFISDTSSEQLTAGTNEYTDSLTS-STPSESGICRFTASPPKPQDG
.::::.:::: ::::::::.::.:.:.:::: .::.:: ::::: ::::::::::::::.
CCDS83 LEEQLQHAKFEITECFISDSSSDQMTTGTNENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDA
1880 1890 1900 1910 1920 1930
1890 1900 1910 1920 1930
pF1KB3 GRVMNMAVPKAHRPG--DLIHLPPYLRMDFLLNRGGPGTSRDLSLGQAC--LEPQKS--R
: :.::: :: . : .:: : . . .. : . : . : . :... :
CCDS83 DRGKNVAVPIPHRANKSDYCNLPLYAKSEAFF-RKADGR-------EPCPVVPPREASIR
1940 1950 1960 1970 1980 1990
1940 1950 1960 1970 1980 1990
pF1KB3 TLKRP--TVLEPIPMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELGQAAKMSSSQESLL
.: : : . . .. ::.. . . . ...::::::
CCDS83 NLARTYHTQARHLTLDPASKSLGLPHPGAPAAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPT
2000 2010 2020 2030 2040 2050
2000 2010
pF1KB3 DSRGHLKGNNPYAKSYTLV
CCDS83 PAEPPTAPSAAPPAPSTEPPRAGGPHTKMGGSRDSLLEMSTSGVGRSQKQGAGAYSKSYT
2060 2070 2080 2090 2100 2110
>>CCDS33790.1 CNTN3 gene_id:5067|Hs108|chr3 (1028 aa)
initn: 437 init1: 190 opt: 852 Z-score: 554.9 bits: 115.2 E(32554): 1.4e-24
Smith-Waterman score: 956; 25.2% identity (54.3% similar) in 1016 aa overlap (306-1287:25-1000)
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 TGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYGTAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGSQVSLSC
: ...:.: . .: : .: ....: :
CCDS33 MMFPWKQLILLSFIGCLGGELLLQGPVFIKEP-SNSIFP---VGSEDKKITLHC
10 20 30 40 50
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 SVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNVRITGINHENLIMDHMVKS-DGGAYQCFVRKDK---
. :. . . : :: .. . . : .: ::.. . .. : :.::::. ..
CCDS33 EARGNPSPHYRWQLNGSDIDMSMEHRYK-LNGGNLVVINPNRNWDTGTYQCFATNSLGTI
60 70 80 90 100
400 410 420 430 440
pF1KB3 LSAQDYVQVV-LEDGTPKIISAFSEKVVSPAEPVSLMCNVKGTPLP-----TITWTLDDD
.: . .: . ::. :. :. : : .. : :.: : : : . .: ...
CCDS33 VSREAKLQFAYLENFKTKMRSTVS---VREGQGVVLLC---GPP-PHSGELSYAWIFNEY
110 120 130 140 150 160
450 460 470 480 490
pF1KB3 P-ILKGGSHR-ISQ----MITSE---GNVVSYLNISSSQVRDGGVYRCTAN---NSAGVV
: ... :.: .:: . :. ..: .: . .:.: .. : . : ::.
CCDS33 PSFVEEDSRRFVSQETGHLYISKVEPSDVGNYTCVVTSMVTNARVLGSPTPLVLRSDGVM
170 180 190 200 210 220
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 -LYQARINVRGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKNSNLLPFNHRQVA
:. .:.:. : .. : : : . ..: ..: : .:.: . :. :::. .
CCDS33 GEYEPKIEVQFPETL-P-----AAKGSTVKLECFALGNPIPQINW-RRSDGLPFSSKIKL
230 240 250 260 270
560 570 580 590 600 610
pF1KB3 FENNGTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFIQPFEFPRFSIGQR
. .:.:.. . :.: : : : : . . ..... . : ..: .. .... .
CCDS33 RKFSGVLEIPNFQQE-DAGSYECIAENSRGKNVARGRLTYYAKPHWVQLIKDVEIAVEDS
280 290 300 310 320 330
620 630 640 650 660 670
pF1KB3 VFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNLSLMHNGNYTCIAR
.. : . :: . : :.: . . :.: ..: :::::. .: . :::.
CCDS33 LYWECRA-SGKPKPSYRWLKNGAALVLEERTQIEN----GALTISNLSVTDSGMFQCIAE
340 350 360 370 380
680 690 700 710 720
pF1KB3 NEAAAVEHQSQL-IVRVPPKFVVQPRDQ--DGIYGKAVILNCSAEGYPVPTIVWKFSKGA
:. . : ...: .: : : .: . . :. : :.:. .. : :: ::
CCDS33 NKHGLVYSSAELKVVASAPDFSKNPMKKLVQVQVGSLVSLDCKPRASPRALSSWK--KGD
390 400 410 420 430 440
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 GVPQFQPIALNGRIQVLSNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSMYLTVKIPAM
: . ::..:..:.: : .:.. :.: : : . :. : .. . .:.: :.
CCDS33 VSVQEHE-----RISLLNDGGLKIANVTKADAGTYTCMAENQFGK-ANGTTHLVVTEPTR
450 460 470 480 490 500
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 ITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEK--PIIVRWEKEDRIINPEMARYLVSTKEVGEEVI
:: :.. .. :.. . : .. . :: : . . . . . ..::
CCDS33 ITLAPSNMDVSVGESVILPCQVQHDPLLDIIFTWYFNGALAD--FKKDGSHFEKVGGSSS
510 520 530 540 550
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 STLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPE-IEIKDVKARTITLRWT
. :.: . :: . : . .. . .: :. : ::: ... .. : : :
CCDS33 GDLMIRNIQLKHSGKYVCMVQTGVDSVSSAADLIVRGSPGPPENVKVDEITDTTAQLSWK
560 570 580 590 600 610
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 MGFDGNSPITGYDIECKNK-SDSWDSAQRTKDV-SPQLNSATIIDIHPSSTYSIRMYAKN
: :..::. .:.:. .. : .:... . .: . . ..::.....: : .:. :.:
CCDS33 EGKDNHSPVISYSIQARTPFSVGWQTVTTVPEVIDGKTHTATVVELNPWVEYEFRVVASN
620 630 640 650 660 670
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 RIGKSEPS-NELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGYQIG
.:: .::: . ..::.:. ::.::. : . . .:: ..:::: :: ..
CCDS33 KIGGGEPSLPSEKVRTEEAVPEVPPSEVNGGGGSRSELVITWDPVPEELQNGEGFGYVVA
680 690 700 710 720 730
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB3 YREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEIITTT
.: .. .: . : :: :. ... .. : . : . : : :: : . .
CCDS33 FRPLGVTTWIQTVVTSPDT--PRYVFRNESIVPYSPYEVKVGVYNNKGEGPFSPVTTVFS
740 750 760 770 780 790
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB3 LEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEIKNI
:. :. : .:.: . : : .::.:. . :: : :..: :: . : . ..
CCDS33 AEEEPTVAPSQVSANSLSSSEIEVSWNTIPWKLSNGHLLGYEVRYWNGGGKEESSSKMKV
800 810 820 830 840 850
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB3 TTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAASAS
. .. : .: ::.. : : :.. :: : : . . ::. :. : : . :. .
CCDS33 AGNETSARLRGLKSNLAYYTAVRAYNSAGAGPFSATVNVTTKKTPPSQPPGNVVWNATDT
860 870 880 890 900 910
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB3 MVFVSW--LPPLKLNGIIRKYTVFCSHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWV
:...: . .. .. . : :: . .. .... : .: ...: . :
CCDS33 KVLLNWEQVKAMENESEVTGYKVFYRTSSQNNVQVLNTNKTSAELVLPI---KEDYIIEV
920 930 940 950 960 970
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB3 VAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWMK
:.:..: :.::: : . ... ::
CCDS33 KATTDGGDGTSSEQIRIPRITSMDARGSTSAISNVHPMSSYMPIVLFLIVYVLW
980 990 1000 1010 1020
>>CCDS55153.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1192 aa)
initn: 522 init1: 139 opt: 806 Z-score: 525.1 bits: 109.9 E(32554): 6.3e-23
Smith-Waterman score: 913; 25.1% identity (52.4% similar) in 1025 aa overlap (310-1277:43-1027)
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 IENIRPSDSGSYVCEVSNRYGTAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTG
:. : . ::. . .. ..: . :
CCDS55 SAGRVPLILFLCQMISALEVPLDPKLLEDLVQPPTITQQSPKDYIIDPRENIVIQCEAKG
20 30 40 50 60 70
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 TEDQELSWYRNGEILNPGKNVRIT-----GINHENLIMDHMVKSDGGAYQCFVRKDKLSA
.:: ::: .. :. .: : :.. . ... :.::: .:... .:
CCDS55 KPPPSFSWTRNGTHFDIDKDPLVTMKPGTGTLIINIMSEGKAETYEGVYQCTARNERGAA
80 90 100 110 120 130
400 410 420 430 440 450
pF1KB3 QDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKV-VSPAEPVSLMCNVK-GTPLPTITWTLDDDPILKGGS
. :: . .: . : . .. .. . : : : : : : : .:.. :
CCDS55 VSNNIVVRPSRSPLWTKEKLEPITLQSGQSLVLPCRPPIGLPPPIIFW-MDNSFQRLPQS
140 150 160 170 180 190
460 470 480 490 500
pF1KB3 HRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGGVYRCTAN-NSAGVVLYQARINV----------
.:.:: .... . . :. ..:. : : : : . .. . :.:
CCDS55 ERVSQGLNGD---LYFSNVLPEDTRED--YICYARFNHTQTIQQKQPISVKVISAKSSRE
200 210 220 230 240
510 520 530 540 550
pF1KB3 RGPASIRPMKNITA---IAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKNSNLLPFNHRQVAFENNGT
: :. . : : . . : ..: . : : : : :....:: : : : . . :
CCDS55 RPPTFLTPEGNASNKEELRGNVLSLECIAEGLPTPIIYWAKEDGMLPKN-RTVYKNFEKT
250 260 270 280 290 300
560 570 580 590 600 610
pF1KB3 LKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLST-SQSVHVTVKVPPF-IQPFEFPRFSIGQRVFIP
:.. :. :.: :.: : ... :.. ... : ::. :. : . .: :. .
CCDS55 LQIIHVS-EADSGNYQC--IAKNALGAIHHTISVRVKAAPYWITAPQNLVLSPGEDGTLI
310 320 330 340 350 360
620 630 640 650 660 670
pF1KB3 CVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNLSLMHNGNYTCIARNEAA
: . .:. :.: .: :: . .:: ... .::.. .. : : : :: .
CCDS55 CRA-NGNPKPRISWLTNGVPIEIAPDDPSRKID-GDTIIFSNVQERSSAVYQCNASNEYG
370 380 390 400 410 420
680 690 700 710 720 730
pF1KB3 AVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQ--DGIYGKAVILNCSAEGYPVPTIVW-KFSKGAGVPQ
. .. . : . : .. : . . : .. ..:.:. : :.::: : : .::.
CCDS55 YLLANAFVNVLAEPPRILTPANTLYQVIANRPALLDCAFFGSPLPTIEWFKGAKGS----
430 440 450 460 470
740 750 760 770 780 790
pF1KB3 FQPIALNGRIQVLS-NGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSMYLTVKIPAMITS
::. : :: ::.: : . ....: : : . : .: ... ..: .: :. :..
CCDS55 ----ALHEDIYVLHENGTLEIPVAQKDSTGTYTCVARNKLGM-AKNEVHLEIKDPTWIVK
480 490 500 510 520 530
800 810 820 830 840 850
pF1KB3 YPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPI--IVRWEKEDRIINPEMARYLVSTKEVGEEVISTL
:. ... .:. . : .. .. . : : :..: . : :. :. . :
CCDS55 QPEYAVVQRGSMVSFECKVKHDHTLSLTVLWLKDNREL-PSDERFTVDKDH--------L
540 550 560 570 580
860 870 880 890
pF1KB3 QILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEP----------PDPP-EIEIKDVKAR
. . .::: ..: : .. . :.: : :.:: ..:. : .
CCDS55 VVADVSDDDSGTYTCVANTTLDSVSASAVLSVVAPTPTPAPVYDVPNPPFDLELTDQLDK
590 600 610 620 630 640
900 910 920 930 940 950
pF1KB3 TITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIR
.. : :: : :.::::: . :: .. . .. .:: ..: . . : .::.:
CCDS55 SVQLSWTPGDDNNSPITKFIIEYEDAMHKPGLWHHQTEVSGTQTTAQL-KLSPYVNYSFR
650 660 670 680 690 700
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB3 MYAKNRIGKSEPSNELTITADEAA-PDGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIR
..: : :::: ::. .:. :: : :. ... .::: . .::
CCDS55 VMAVNSIGKSLPSEASEQYLTKASEPDKNPTAVEGLGSEPDNLVITWKPLNGFESNGPGL
710 720 730 740 750 760
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB3 GYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQE
:....:. . : . ... ...: : ... :. : . ::: : : .:
CCDS55 QYKVSWRQ-KDGDDEWTSVVVANVSK----YIVSGTPTFVPYLIKVQALNDMGFAPEPAV
770 780 790 800 810
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB3 IITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELG
.. . ::.: : ::.. ... . :. . ... : :::.:. :: . ... .
CCDS55 VMGHSGEDLPMVAPGNVRVNVVNSTLAEVHWDPVPLKSIRGHLQGYRIYYWKTQSSSKRN
820 830 840 850 860 870
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KB3 EI---KNITTTQPSLE---LDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPP
. :.: : : : : ::: ...:...: . . :.: : . : : ::. :
CCDS55 RRHIEKKILTFQGSKTHGMLPGLEPFSHYTLNVRVVNGKGEGPASPDRVFNTPEGVPSAP
880 890 900 910 920 930
1200 1210 1220 1230 1240
pF1KB3 AGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHPYPTVISEFEASP--------DSF
...: . . . . . : :: . :::. .::. : . : : .: ..
CCDS55 SSLKIVNPTLDSLTLEWDPPSHPNGILTEYTL----KYQPINSTHELGPLVDLKIPANKT
940 950 960 970 980 990
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KB3 SYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGN--SSEIITVEPLAKAPARILTFSGTVTTPWMKD
. . ::. . .:. . : :::: :. . : .:
CCDS55 RWTLKNLNFSTRYKFYFYAQTSAGSGSQITEEAVTTVDEAGILPPDVGAGKAMASRQVDI
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KB3 IVLPCKAVGDPSPAVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSGYYSCIAN
CCDS55 ATQGWFIGLMCAVALLILILLIVCFIRRNKGGKYPVKEKEDAHADPEIQPMKEDDGTFGE
1060 1070 1080 1090 1100 1110
>>CCDS54424.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (33423 aa)
initn: 482 init1: 218 opt: 787 Z-score: 494.9 bits: 109.2 E(32554): 3e-21
Smith-Waterman score: 1007; 23.3% identity (52.4% similar) in 1589 aa overlap (50-1563:5918-7393)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 LHSSLYFVNASLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWYLATGEEIY-DVPGIRHVHPN
: :: . :. .. : . : .:
CCDS54 TVQEPPSFVKEPEPLEVLPGKNVTFTSVIRGTPPFKVNWFRGARELVKGDRCNIYFEDTV
5890 5900 5910 5920 5930 5940
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 GTLQIFPFPPSSFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKAVLREP--YTVRVEDQKTM
. :..: . : ... : :.. : .:. . . ..:: . :. :...
CCDS54 AELELFNIDIS------QSGEYTCVVSNNAGQ---ASCTTRLFVKEPAAFLKRLSDHSVE
5950 5960 5970 5980 5990
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 RGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTGALYIKDVQN--EDGLYN
:. ... ... .: :.:: ..... . :..: : .. : . .
CCDS54 PGKSIILESTYTGTLPISVT---WKKDGFNITTSEKCNIVTTEKTCILEILNSTKRDAGQ
6000 6010 6020 6030 6040 6050
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 YRCITRHRYTGETRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFEHRKAMAGQRVELPCKALGHPEP
: : ... .: :. .: . . .: : .. .: .: .:. : : :.. : ::
CCDS54 YSCEIENE-AG--RDVCGALVSTLEP----PYFVTELEPLEAAVGDSVSLQCQVAGTPEI
6060 6070 6080 6090 6100
260 270 280 290 300
pF1KB3 DYRWLKDNMPL----ELSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYGTA--KVIGRL
: : . : : : ..:. :..... .::: :.:.. : ::: :.. :.
CCDS54 TVSWYKGDTKLRPTPEYRTYFTNNVATLVFNKVNINDSGEYTCKAENSIGTASSKTVFRI
6110 6120 6130 6140 6150 6160
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 YVKQ-PLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNVRITGINH
.: : . . . . ....:: :.:.: ..:. .. :::.: .: .:.. . .
CCDS54 QERQLPPSFARQLKDIEQTVGLPVTLTCRLNGSAPIQVCWYRDGVLLRDDENLQTSFV--
6170 6180 6190 6200 6210 6220
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 ENLIMDHMVKSD---GGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVS----P
.:. .....: .: :.: . . .:.. .... .. :: :. : ::
CCDS54 DNVATLKILQTDLSHSGQYSCSASNPLGTASSSARLTARE--PKKSPFFDIKPVSIDVIA
6230 6240 6250 6260 6270 6280
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 AEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGG
.: ... :.: :. :::. :. : ::.. : : ::. .: : . :.:
CCDS54 GESADFECHVTGAQPMRITWSKDNKEIRPGGNYTI----TCVGNT-PHLRILKVGKGDSG
6290 6300 6310 6320 6330
490 500 510 520 530
pF1KB3 VYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIA--GRDTYIHCRVIGYPYYSIKWY
: : :.:..: . .:...:. : .. . . .: :.. ..:.. : : ...:.
CCDS54 QYTCQATNDVGKDMCSAQLSVKEPPKFVKKLEASKVAKQGESIQLECKISGSPEIKVSWF
6340 6350 6360 6370 6380 6390
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 KNSNLLPFNHR-QVAFENN-GTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVP
.:.. : . . ...: :. . : ..... : : :.: :.. . ..: :. .:::.:
CCDS54 RNDSELHESWKYNMSFINSVALLTINEASAE-DSGDYICEAH-NGVGDASCSTALTVKAP
6400 6410 6420 6430 6440 6450
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 PFIQPFEFPRFSI-GQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLR
: . : .. :. :.. : . :: :. ..: :: . . .: : . : .::.
CCDS54 PVFTQKPSPVGALKGSDVILQCEI-SGTPPFEVVWVKDRKQVRNSKKFKITSKHFDTSLH
6460 6470 6480 6490 6500 6510
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 ISNLSLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEG
: :: :.: : : ::... . .. . ::.:: . : . . : :: : .::
CCDS54 ILNLEASDVGEYHCKATNEVGSDTCSCSVKFKEPPRFVKKLSDTSTLIGDAVELRAIVEG
6520 6530 6540 6550 6560 6570
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 YPVPTIVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVLSN-GSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGA
. ..:: ..: . . . : ::. ..: ..: . .:: :.:...::.:
CCDS54 FQPISVVWLKDRGEVIRESE----NTRISFIDNIATLQLGSPEASNSGKYICQIKNDAGM
6580 6590 6600 6610 6620 6630
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 DVSKSMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPEMAR
: ::: :: : :. .: :. . :.. : . ..: :. : .. . .
CCDS54 R-ECSAVLTVLEPARIIEKPEPMTVTTGNPFALECVVTGTPELSAKWFKDGRELSADSKH
6640 6650 6660 6670 6680 6690
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 YLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEI--E
... ..: ..:.: . :.:..: .. :: :.. ... :.. :: . .
CCDS54 HITFINKV-----ASLKIPCAEMSDKGLYSFEVKNSVGKSNCTVSVHVSDRIVPPSFIRK
6700 6710 6720 6730 6740
900 910 920 930 940
pF1KB3 IKDVKA---RTITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQRTKDVSPQLNSATIID
.:::.: ...:. .. :..::. .. :. : . : . : .. . ..
CCDS54 LKDVNAILGASVVLECRVS--GSAPISVGWFQDGNEIVSGPKCQSS--FSENVCTLNLSL
6750 6760 6770 6780 6790 6800
950 960 970 980 990 1000
pF1KB3 IHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPK
..::.: : : :..: : ::. . . . :. :.. : .. .:. .
CCDS54 LEPSDTGIYTCVAANVAGSDECSAVLTVQ-EPPSFEQTPDSVEVLP----GMSLTFTSVI
6810 6820 6830 6840 6850
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB3 KHLQNGIIRGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNR
. .. .. : :: : . :: : . :.. .. :.. .:. .: :
CCDS54 RGTPPFKVKWFK-GSRELVPGESC--NISLEDFVTELELFEVQPLES-GDYSCLVT--ND
6860 6870 6880 6890 6900 6910
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KB3 AGTGPSSQEIITTT-------LED--VPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALNGI
::.. . .... : : : . : ..: :. ::.:: .. : : :
CCDS54 AGSASCTTHLFVKEPATFVKRLADFSVETGSPIVLEATYTGTPPISVSW--IKDEYL--I
6920 6930 6940 6950 6960
1130 1140 1150 1160 1170
pF1KB3 LQGFRVIYWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGLEK----YTNYSIQVLAFTRAGDGVR
:. : .:: :. : :. ::. :..:: : ..::. .
CCDS54 SQSERC---------------SITMTEKSTILEILESTIEDYAQYS--CLIENEAGQDIC
6970 6980 6990 7000 7010
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KB3 SEQI-------FTRTKEDVP---GPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFC
. : . : : : :: .. . .. . .:: ...: .
CCDS54 EALVSVLEPPYFIEPLEHVEAVIGEPATLQCKVDGTPEIRISWY---------KEHTKLR
7020 7030 7040 7050 7060
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KB3 SHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAP-
: : . .:. . :. . : .:: : .:.: :: ..... :
CCDS54 SAPAYKM--QFKNNVASLVINKVDHSDVGEYSCK--ADNSVGAVASSAVLVIKARKLPPF
7070 7080 7090 7100 7110
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KB3 -ARILT-FSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWMKDSNGTPSLVTIDGR-RSIFSNG
:: : :. : ... :. :. :.:.:: :. :. :. .. : ..
CCDS54 FARKLKDVHETLGFP----VAFECRINGSEPLQVSWYKD--GV--LLKDDANLQTSFVHN
7120 7130 7140 7150 7160
1350 1360 1370 1380 1390
pF1KB3 SFIIRTVKAEDS--GYYSCIANNNWG----SDEIILNLQVQVPP--DQPRLTVSKTTSSS
.. .....: : :.: :.: : : ..::. . .::: : ..:. . . :
CCDS54 VATLQILQTDQSHIGQYNCSASNPLGTASSSAKLILSEH-EVPPFFDLKPVSVDLALGES
7170 7180 7190 7200 7210 7220
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KB3 ITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSE--QWGSFPISPSERSYRLENLKCGTWY--KFT
:.. .: . :. . ...:: : :.. .. : . : :: : ..:
CCDS54 GTFK--CHVTGTAPIK---ITWAKDNREIRPGGNYKMTLVENTATLTVLKVGKGDAGQYT
7230 7240 7250 7260 7270 7280
1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB3 LTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQE---LFASINTTRVRLNLIGWNDGGCPIT
:.: .: : . .. . :.: :. : . . . :: . .. :: :
CCDS54 CYASNIAGKDSCSAQLGVQ---EPPRFIKKLEPSRIVKQDEFTRYECKI-----GGSPEI
7290 7300 7310 7320 7330
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB3 SFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVC---NSAGCAEKQANFA
. .: :. .. : :. : . .... . . .: :.:: : .....
CCDS54 K-VLWYKDETEIQESSKFRMSFVDSVAVLEMHNLSVEDSGDYTCEAHNAAGSASSSTSLK
7340 7350 7360 7370 7380 7390
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB3 TLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRRREQR
CCDS54 VKEPPIFRKKPHPIETLKGADVHLECELQGTPPFHVSWYKDKRELRSGKKYKIMSENFLT
7400 7410 7420 7430 7440 7450
>--
initn: 482 init1: 218 opt: 847 Z-score: 532.7 bits: 116.2 E(32554): 2.4e-23
Smith-Waterman score: 960; 24.0% identity (51.1% similar) in 1586 aa overlap (46-1560:3572-5026)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 FSEDLHSSLYFVNASLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWYLATGEEIYDVPGIRHV
: ..: : . : : . :. : .
CCDS54 TLTVTEAYPPTFLSRPKSLTTFVGKAAKFICTVTGTPVIETIWQ-KDGAALSPSPNWR-I
3550 3560 3570 3580 3590
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 HPNGTLQIFPFPPSSFSTLIHD-NTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKAVLREPYTVR-VEDQ
. .:. . :... :.: ..: : : : : : : .. .:. .. .:
CCDS54 SDAENKHILEL--SNLT--IQDRGVYSCKASNKFGADICQAELI--IIDKPHFIKELEPV
3600 3610 3620 3630 3640 3650
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 KTMRGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLIT---STGALYIKDVQNED
.. .. . ..: . : ..:.: :: .: :. . : . ..: : .. .:
CCDS54 QSAINKKVHLECQVD---EDRKVTVTWSKDGQKLPPGKDYKICFEDKIATLEIPLAKLKD
3660 3670 3680 3690 3700 3710
200 210 220 230 240
pF1KB3 GLYNYRCITRHRYTGETRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFEHRKAM-AGQRVELPCKAL
. .: : : .: . : :: . : .: ::.. . : :. ..: ::
CCDS54 S-GTYVC-TASNEAGSS--SCSATVTVREP----PSFVKKVDPSYLMLPGESARLHCKLK
3720 3730 3740 3750 3760
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 GHPEPDYRWLKDNMPLELSGR----FQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYGTAKVI
: : . :.:.: : :. : .. . : : ... ::::: ::. : :. .
CCDS54 GSPVIQVTWFKNNKELSESNTVRMYFVNSEAILDITDVKVEDSGSYSCEAVNDVGSDSCS
3770 3780 3790 3800 3810 3820
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 GRLYVKQP--LKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNVRIT
.. .:.: . :. : . :... :.: :.:: :.::... . . .:. :.
CCDS54 TEIVIKEPPSFIKTLEPADIVR--GTNALLQCEVSGTGPFEISWFKDKKQIRSSKKYRL-
3830 3840 3850 3860 3870
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 GINHENLIMDHMVK---SDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSP
.....:. .. . .: : :.: : .. . .. .:.. : ... .. ..
CCDS54 -FSQKSLVCLEIFSFNSADVGEYECVVANEVGKCGCMATHLLKE-PPTFVKKVDDLIALG
3880 3890 3900 3910 3920 3930
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 AEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGG
.. :.:. :.:. ..:: .. : . :. ..: :.: :. : : . :. ::
CCDS54 GQTVTLQAAVRGSEPISVTWMKGQEVIREDGKIKMS---FSNG--VAVLIIPDVQISFGG
3940 3950 3960 3970 3980 3990
490 500 510 520 530
pF1KB3 VYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAI-AGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYK
: : :.: :: ... :. ::.: .. . :: . .. : : : . ::::
CCDS54 KYTCLAENEAGSQTSVGELIVKEPAKIIERAELIQVTAGDPATLEYTVAGTPELKPKWYK
4000 4010 4020 4030 4040 4050
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 NSN-LLPFNHRQVAFENN-GTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVK---
.. :. .. ...:.:: . ::. ... . : :.:: .. . :. ... ...
CCDS54 DGRPLVASKKYRISFKNNVAQLKFYSAELH-DSGQYTFEISNEVGSSSCETTFTVLDRDI
4060 4070 4080 4090 4100 4110
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 VPPFIQPFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSL
.: : .:.. .. . : . .:.::. ..: :::. : .: : .. :.::
CCDS54 APFFTKPLRNVDSVVNGTCRLDCKI-AGSLPMRVSWFKDGKEIAASDRYRIAFVEGTASL
4120 4130 4140 4150 4160 4170
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 RISNLSLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAE
.: ... ::.:: : : ... . .. :::. ::.::..: ..: . :.:: :. . .
CCDS54 EIIRVDMNDAGNFTCRATNSVGSKDSSGALIVQEPPSFVTKPGSKDVLPGSAVCLKSTFQ
4180 4190 4200 4210 4220 4230
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 GYPVPTIVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVLSNG---SLLIKHVVEEDSGYYLCKVSND
: :: : : :: . .. .: . ... :: . : ::: : :::::
CCDS54 GSTPLTIRW-F-KGN-----KELVSGGSCYITKEALESSLELYLVKTSDSGTYTCKVSN-
4240 4250 4260 4270 4280
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 VGADVSKSMYLTVKIPA-MITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINP
:.. : : : :: :: .. . . : .:. ...: . : :: . : .:: :.
CCDS54 VAGGVECSANLFVKEPATFVEKLEPSQLLKKGDATQLACKVTGTPPIKITWFANDREIK-
4290 4300 4310 4320 4330 4340
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 EMARYLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPE
: ... .: : ..:.. . :::: . :.: : : :. . :.: : .
CCDS54 ESSKHRMSF----VESTAVLRLTDVGIEDSGEYMCEAQNEAGSDHCSSIVIVKESPYFTK
4350 4360 4370 4380 4390
900 910 920 930 940
pF1KB3 IEIKDVKA-RTITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQRTKD-VSPQLNSATII
:.: ... . . :. : ..: . . :... : .. .: : :.
CCDS54 -EFKPIEVLKEYDVMLLAEVAGTPP---FEITWFKDNTILRSGRKYKTFIQDHLVSLQIL
4400 4410 4420 4430 4440 4450
950 960 970 980 990 1000
pF1KB3 DIHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAP
. ... . . :..:.: : ..:. ::. .. . :..:.: :
CCDS54 KFVAADAGEYQCRVTNEVGSSICSARVTLRE-------PPSFIK-KIESTSSLRGGTAAF
4460 4470 4480 4490 4500
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB3 KKHLQNG--IIRGYQIGYREYSTGGN----FQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGL
. :... : . : . : :. :. :. :: . . .:.
CCDS54 QATLKGSLPITVTWLKDSDEITEDDNIRMTFENNVASLYLSG----IEVKHDGKY-----
4510 4520 4530 4540 4550
1070 1080 1090 1100 1110
pF1KB3 VVQACNRAGTGPSS-----QEIITTTLE----DVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLS
: :: : :: : .: : : : :: . : ..:. .. . :. .: .
CCDS54 VCQAKNDAGIQRCSALLSVKEPATITEEAVSIDVTQGDPATLQVKFSGTKEITAKWFKDG
4560 4570 4580 4590 4600 4610
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KB3 KEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGD
.: : . : .... : :. .. : .. . :.:: :
CCDS54 QELTLGSKYKISVTDTVSILKIISTEKKDSGEYTFEVQNDVGRSSCKARINVL------D
4620 4630 4640 4650 4660 4670
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KB3 GVRSEQIFTRTK--EDVPGPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHPYP
. .. . : ... : .. .:.. . ..:. . . .:: : :
CCDS54 LIIPPSFTKKLKKMDSIKGSFIDLECIVAGSHPISIQWFKDDQEISASEKYK-FSFHDNT
4680 4690 4700 4710 4720
1240 1250 1260 1270 1280
pF1KB3 TV--ISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARIL
. ::..:.. :: .: :...::... : .:: : : .
CCDS54 AFLEISQLEGT-DSGTYTCS-------------ATNKAGHNQCSGHLTV----KEPPYF-
4730 4740 4750 4760 4770
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KB3 TFSGTVTTPWMKDIV----LPCKA-VGDPSP-AVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNG-
: : .:. . :: :: .: ..::.::.. : . ::....
CCDS54 -----VEKPQSQDVNPNTRVQLKALVGGTAPMTIKWFKDNKELHS----GAARSVWKDDT
4780 4790 4800 4810 4820
1350 1360 1370 1380 1390
pF1KB3 --SFIIRTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPPD-----QPRLTVSKTTSSS-
:. . ..:: ::: : : .:. :. .: :. ::. .: :.. . :..
CCDS54 STSLELFAAKATDSGTYICQLSNDVGTATSKATLFVKEPPQFIKKPSPVLVLRNGQSTTF
4830 4840 4850 4860 4870 4880
1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB3 ---------ITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLENLKCGT
: .:: : ..:. . ... . ..: :: . :.:: ::
CCDS54 ECQITGTPKIRVSWYLDGNEITAIQKHGISFIDG----LATFQISGA----RVEN--SGT
4890 4900 4910 4920 4930
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB3 WYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWNDGGCP
.. :.: .: . : :: : . . : : .: . .. . :.:. :
CCDS54 ---YVCEARNDAGTASCS--IELK-VKEPPTFIRELKPVEVVKYSDVELE--------CE
4940 4950 4960 4970
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB3 ITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRT-SLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQANFA
.:. :: .: : .: ::.: : : ... ..:.. :. . .: :
CCDS54 VTGTP----PFEVT-WLKNNREIRSSKKYTLTD--RVSVFNLHITKCDPSDTGEYQCIVS
4980 4990 5000 5010 5020 5030
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB3 TLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRRREQR
CCDS54 NEGGSCSCSTRVALKEPPSFIKKIENTTTVLKSSATFQSTVAGSPPISITWLKDDQILDE
5040 5050 5060 5070 5080 5090
>--
initn: 330 init1: 221 opt: 714 Z-score: 448.9 bits: 100.6 E(32554): 1.1e-18
Smith-Waterman score: 714; 25.9% identity (56.6% similar) in 680 aa overlap (46-707:5258-5910)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 FSEDLHSSLYFVNASLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWYLATGEEIYDVPGIRHV
: ..: :.. .:. :.:: : :
CCDS54 LRVLDQNIPPSFTKKLTKMDKVLGSSIHMECKVSGSLPISAQWF-KDGKEISTSAKYRLV
5230 5240 5250 5260 5270 5280
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 -HPNG-TLQIFPFPPSSFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKAVLREP--YTVRVE
: . .:.. . : .: : . : .: . . ...:: . :.
CCDS54 CHERSVSLEVNNLE------LEDTANYTCKVSNVAGDDACSGI---LTVKEPPSFLVKPG
5290 5300 5310 5320 5330
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 DQKTMRGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTGALYIKDVQNEDG
:... ... :: :. .. : .: :: : :::: . .: :. . .. . :.
CCDS54 RQQAIPDSTVEFKAILKGTPPFKI---KWFKDDVELVSGPKCFIGLEGSTSFLNLYSVDA
5340 5350 5360 5370 5380 5390
200 210 220 230 240
pF1KB3 --LYNYRCITRHRYTGETRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFEHRKAM-AGQRVELPCKA
.: : : . .: .. :.:..: :... .: : . ::. .: ::
CCDS54 SKTGQYTC---HVTNDVGSDSCTTMLLVTEP----PKFVKKLEASKIVKAGDSSRLECKI
5400 5410 5420 5430 5440
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 LGHPEPDYRWLKDNMPLELSGRFQKT----VTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYGTAKV
: :: :.... : : ... : :. . ..:. :::...::..: :...
CCDS54 AGSPEIRVVWFRNEHELPASDKYRMTFIDSVAVIQMNNLSTEDSGDFICEAQNPAGSTSC
5450 5460 5470 5480 5490 5500
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 IGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNVRITG
.. ::.: . : :.. ...::: : ..:: :. ::.. . : .:. .:..
CCDS54 STKVIVKEPPVFSSFPPIVETLKNAEVSLECELSGTPPFEVVWYKDKRQLRSSKKYKIAS
5510 5520 5530 5540 5550 5560
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 IN-HENLIMDHMVKSDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSPAEP
: : .. . .. :: : :.: .... : : :.. :...: .. .: .::
CCDS54 KNFHTSIHILNVDTSDIGEYHCKAQNEVGSDTCVCTVKLKE-PPRFVSKLNSLTVVAGEP
5570 5580 5590 5600 5610 5620
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 VSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGGVYR
. :. ...:. . : . . ... :. : :: ::.. :...... ..: :
CCDS54 AELQASIEGAQPIFVQWLKEKEEVIRE-SENIR--ITFVENVAT-LQFAKAEPANAGKYI
5630 5640 5650 5660 5670 5680
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 CTANNSAGVVLYQARINVRGPASI-RPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKNSN
: .:..:. .: . : :: : . .:. .:. ..:.: : : :..:::...
CCDS54 CQIKNDGGMRENMATLMVLEPAVIVEKAGPMTVTVGETCTLECKVAGTPELSVEWYKDGK
5690 5700 5710 5720 5730 5740
550 560 570 580 590
pF1KB3 LLPFNHR-QVAFENN-GTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQ-PQLSTSQSVHVTVK-VPP-
:: ... . .: :. ..:.. .:... : : :: .: . . : . : :. . :::
CCDS54 LLTSSQKHKFSFYNKISSLRILSVERQ-DAGTYTFQVQNNVGKSSCTAVVDVSDRAVPPS
5750 5760 5770 5780 5790 5800
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 FIQPFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRIS
: . .. .: .. : : .:. ::...: .. : .. : . .:...
CCDS54 FTRRLKNTGGVLGASCILECKV-AGSSPISVAWFHEKTKIVSGAKYQTTFSDNVCTLQLN
5810 5820 5830 5840 5850 5860
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 NLSLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYP
.:. :::::.: : :.. : .. : :. ::.:: .:. . . :: :
CCDS54 SLDSSDMGNYTCVAANVAGSDECRAVLTVQEPPSFVKEPEPLEVLPGKNVTFTSVIRGTP
5870 5880 5890 5900 5910 5920
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 VPTIVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVLSNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVS
CCDS54 PFKVNWFRGARELVKGDRCNIYFEDTVAELELFNIDISQSGEYTCVVSNNAGQASCTTRL
5930 5940 5950 5960 5970 5980
>>CCDS74610.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (34350 aa)
initn: 482 init1: 218 opt: 787 Z-score: 494.7 bits: 109.2 E(32554): 3.1e-21
Smith-Waterman score: 1007; 23.3% identity (52.4% similar) in 1589 aa overlap (50-1563:6845-8320)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 LHSSLYFVNASLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWYLATGEEIY-DVPGIRHVHPN
: :: . :. .. : . : .:
CCDS74 TVQEPPSFVKEPEPLEVLPGKNVTFTSVIRGTPPFKVNWFRGARELVKGDRCNIYFEDTV
6820 6830 6840 6850 6860 6870
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 GTLQIFPFPPSSFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKAVLREP--YTVRVEDQKTM
. :..: . : ... : :.. : .:. . . ..:: . :. :...
CCDS74 AELELFNIDIS------QSGEYTCVVSNNAGQ---ASCTTRLFVKEPAAFLKRLSDHSVE
6880 6890 6900 6910 6920
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 RGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTGALYIKDVQN--EDGLYN
:. ... ... .: :.:: ..... . :..: : .. : . .
CCDS74 PGKSIILESTYTGTLPISVT---WKKDGFNITTSEKCNIVTTEKTCILEILNSTKRDAGQ
6930 6940 6950 6960 6970 6980
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 YRCITRHRYTGETRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFEHRKAMAGQRVELPCKALGHPEP
: : ... .: :. .: . . .: : .. .: .: .:. : : :.. : ::
CCDS74 YSCEIENE-AG--RDVCGALVSTLEP----PYFVTELEPLEAAVGDSVSLQCQVAGTPEI
6990 7000 7010 7020 7030
260 270 280 290 300
pF1KB3 DYRWLKDNMPL----ELSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYGTA--KVIGRL
: : . : : : ..:. :..... .::: :.:.. : ::: :.. :.
CCDS74 TVSWYKGDTKLRPTPEYRTYFTNNVATLVFNKVNINDSGEYTCKAENSIGTASSKTVFRI
7040 7050 7060 7070 7080 7090
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 YVKQ-PLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNVRITGINH
.: : . . . . ....:: :.:.: ..:. .. :::.: .: .:.. . .
CCDS74 QERQLPPSFARQLKDIEQTVGLPVTLTCRLNGSAPIQVCWYRDGVLLRDDENLQTSFV--
7100 7110 7120 7130 7140 7150
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 ENLIMDHMVKSD---GGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVS----P
.:. .....: .: :.: . . .:.. .... .. :: :. : ::
CCDS74 DNVATLKILQTDLSHSGQYSCSASNPLGTASSSARLTARE--PKKSPFFDIKPVSIDVIA
7160 7170 7180 7190 7200 7210
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 AEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGG
.: ... :.: :. :::. :. : ::.. : : ::. .: : . :.:
CCDS74 GESADFECHVTGAQPMRITWSKDNKEIRPGGNYTI----TCVGNT-PHLRILKVGKGDSG
7220 7230 7240 7250 7260
490 500 510 520 530
pF1KB3 VYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIA--GRDTYIHCRVIGYPYYSIKWY
: : :.:..: . .:...:. : .. . . .: :.. ..:.. : : ...:.
CCDS74 QYTCQATNDVGKDMCSAQLSVKEPPKFVKKLEASKVAKQGESIQLECKISGSPEIKVSWF
7270 7280 7290 7300 7310 7320
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 KNSNLLPFNHR-QVAFENN-GTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVP
.:.. : . . ...: :. . : ..... : : :.: :.. . ..: :. .:::.:
CCDS74 RNDSELHESWKYNMSFINSVALLTINEASAE-DSGDYICEAH-NGVGDASCSTALTVKAP
7330 7340 7350 7360 7370 7380
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 PFIQPFEFPRFSI-GQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLR
: . : .. :. :.. : . :: :. ..: :: . . .: : . : .::.
CCDS74 PVFTQKPSPVGALKGSDVILQCEI-SGTPPFEVVWVKDRKQVRNSKKFKITSKHFDTSLH
7390 7400 7410 7420 7430 7440
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 ISNLSLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEG
: :: :.: : : ::... . .. . ::.:: . : . . : :: : .::
CCDS74 ILNLEASDVGEYHCKATNEVGSDTCSCSVKFKEPPRFVKKLSDTSTLIGDAVELRAIVEG
7450 7460 7470 7480 7490 7500
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 YPVPTIVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVLSN-GSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGA
. ..:: ..: . . . : ::. ..: ..: . .:: :.:...::.:
CCDS74 FQPISVVWLKDRGEVIRESE----NTRISFIDNIATLQLGSPEASNSGKYICQIKNDAGM
7510 7520 7530 7540 7550
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 DVSKSMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPEMAR
: ::: :: : :. .: :. . :.. : . ..: :. : .. . .
CCDS74 R-ECSAVLTVLEPARIIEKPEPMTVTTGNPFALECVVTGTPELSAKWFKDGRELSADSKH
7560 7570 7580 7590 7600 7610
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 YLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEI--E
... ..: ..:.: . :.:..: .. :: :.. ... :.. :: . .
CCDS74 HITFINKV-----ASLKIPCAEMSDKGLYSFEVKNSVGKSNCTVSVHVSDRIVPPSFIRK
7620 7630 7640 7650 7660 7670
900 910 920 930 940
pF1KB3 IKDVKA---RTITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQRTKDVSPQLNSATIID
.:::.: ...:. .. :..::. .. :. : . : . : .. . ..
CCDS74 LKDVNAILGASVVLECRVS--GSAPISVGWFQDGNEIVSGPKCQSS--FSENVCTLNLSL
7680 7690 7700 7710 7720
950 960 970 980 990 1000
pF1KB3 IHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPK
..::.: : : :..: : ::. . . . :. :.. : .. .:. .
CCDS74 LEPSDTGIYTCVAANVAGSDECSAVLTVQ-EPPSFEQTPDSVEVLP----GMSLTFTSVI
7730 7740 7750 7760 7770 7780
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB3 KHLQNGIIRGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNR
. .. .. : :: : . :: : . :.. .. :.. .:. .: :
CCDS74 RGTPPFKVKWFK-GSRELVPGESC--NISLEDFVTELELFEVQPLES-GDYSCLVT--ND
7790 7800 7810 7820 7830
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KB3 AGTGPSSQEIITTT-------LED--VPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALNGI
::.. . .... : : : . : ..: :. ::.:: .. : : :
CCDS74 AGSASCTTHLFVKEPATFVKRLADFSVETGSPIVLEATYTGTPPISVSW--IKDEYL--I
7840 7850 7860 7870 7880 7890
1130 1140 1150 1160 1170
pF1KB3 LQGFRVIYWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGLEK----YTNYSIQVLAFTRAGDGVR
:. : .:: :. : :. ::. :..:: : ..::. .
CCDS74 SQSERC---------------SITMTEKSTILEILESTIEDYAQYS--CLIENEAGQDIC
7900 7910 7920 7930
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KB3 SEQI-------FTRTKEDVP---GPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFC
. : . : : : :: .. . .. . .:: ...: .
CCDS74 EALVSVLEPPYFIEPLEHVEAVIGEPATLQCKVDGTPEIRISWY---------KEHTKLR
7940 7950 7960 7970 7980
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KB3 SHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAP-
: : . .:. . :. . : .:: : .:.: :: ..... :
CCDS74 SAPAYKM--QFKNNVASLVINKVDHSDVGEYSCK--ADNSVGAVASSAVLVIKARKLPPF
7990 8000 8010 8020 8030 8040
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KB3 -ARILT-FSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWMKDSNGTPSLVTIDGR-RSIFSNG
:: : :. : ... :. :. :.:.:: :. :. :. .. : ..
CCDS74 FARKLKDVHETLGFP----VAFECRINGSEPLQVSWYKD--GV--LLKDDANLQTSFVHN
8050 8060 8070 8080 8090
1350 1360 1370 1380 1390
pF1KB3 SFIIRTVKAEDS--GYYSCIANNNWG----SDEIILNLQVQVPP--DQPRLTVSKTTSSS
.. .....: : :.: :.: : : ..::. . .::: : ..:. . . :
CCDS74 VATLQILQTDQSHIGQYNCSASNPLGTASSSAKLILSEH-EVPPFFDLKPVSVDLALGES
8100 8110 8120 8130 8140 8150
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KB3 ITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSE--QWGSFPISPSERSYRLENLKCGTWY--KFT
:.. .: . :. . ...:: : :.. .. : . : :: : ..:
CCDS74 GTFK--CHVTGTAPIK---ITWAKDNREIRPGGNYKMTLVENTATLTVLKVGKGDAGQYT
8160 8170 8180 8190 8200 8210
1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB3 LTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQE---LFASINTTRVRLNLIGWNDGGCPIT
:.: .: : . .. . :.: :. : . . . :: . .. :: :
CCDS74 CYASNIAGKDSCSAQLGVQ---EPPRFIKKLEPSRIVKQDEFTRYECKI-----GGSPEI
8220 8230 8240 8250 8260
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB3 SFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVC---NSAGCAEKQANFA
. .: :. .. : :. : . .... . . .: :.:: : .....
CCDS74 K-VLWYKDETEIQESSKFRMSFVDSVAVLEMHNLSVEDSGDYTCEAHNAAGSASSSTSLK
8270 8280 8290 8300 8310 8320
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB3 TLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRRREQR
CCDS74 VKEPPIFRKKPHPIETLKGADVHLECELQGTPPFHVSWYKDKRELRSGKKYKIMSENFLT
8330 8340 8350 8360 8370 8380
>--
initn: 482 init1: 218 opt: 847 Z-score: 532.6 bits: 116.2 E(32554): 2.4e-23
Smith-Waterman score: 960; 24.0% identity (51.1% similar) in 1586 aa overlap (46-1560:4499-5953)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 FSEDLHSSLYFVNASLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWYLATGEEIYDVPGIRHV
: ..: : . : : . :. : .
CCDS74 TLTVTEAYPPTFLSRPKSLTTFVGKAAKFICTVTGTPVIETIWQ-KDGAALSPSPNWR-I
4470 4480 4490 4500 4510 4520
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 HPNGTLQIFPFPPSSFSTLIHD-NTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKAVLREPYTVR-VEDQ
. .:. . :... :.: ..: : : : : : : .. .:. .. .:
CCDS74 SDAENKHILEL--SNLT--IQDRGVYSCKASNKFGADICQAELI--IIDKPHFIKELEPV
4530 4540 4550 4560 4570 4580
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 KTMRGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLIT---STGALYIKDVQNED
.. .. . ..: . : ..:.: :: .: :. . : . ..: : .. .:
CCDS74 QSAINKKVHLECQVD---EDRKVTVTWSKDGQKLPPGKDYKICFEDKIATLEIPLAKLKD
4590 4600 4610 4620 4630
200 210 220 230 240
pF1KB3 GLYNYRCITRHRYTGETRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFEHRKAM-AGQRVELPCKAL
. .: : : .: . : :: . : .: ::.. . : :. ..: ::
CCDS74 S-GTYVC-TASNEAGSS--SCSATVTVREP----PSFVKKVDPSYLMLPGESARLHCKLK
4640 4650 4660 4670 4680
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 GHPEPDYRWLKDNMPLELSGR----FQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYGTAKVI
: : . :.:.: : :. : .. . : : ... ::::: ::. : :. .
CCDS74 GSPVIQVTWFKNNKELSESNTVRMYFVNSEAILDITDVKVEDSGSYSCEAVNDVGSDSCS
4690 4700 4710 4720 4730 4740
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 GRLYVKQP--LKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNVRIT
.. .:.: . :. : . :... :.: :.:: :.::... . . .:. :.
CCDS74 TEIVIKEPPSFIKTLEPADIVR--GTNALLQCEVSGTGPFEISWFKDKKQIRSSKKYRL-
4750 4760 4770 4780 4790 4800
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 GINHENLIMDHMVK---SDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSP
.....:. .. . .: : :.: : .. . .. .:.. : ... .. ..
CCDS74 -FSQKSLVCLEIFSFNSADVGEYECVVANEVGKCGCMATHLLKE-PPTFVKKVDDLIALG
4810 4820 4830 4840 4850 4860
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 AEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGG
.. :.:. :.:. ..:: .. : . :. ..: :.: :. : : . :. ::
CCDS74 GQTVTLQAAVRGSEPISVTWMKGQEVIREDGKIKMS---FSNG--VAVLIIPDVQISFGG
4870 4880 4890 4900 4910
490 500 510 520 530
pF1KB3 VYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAI-AGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYK
: : :.: :: ... :. ::.: .. . :: . .. : : : . ::::
CCDS74 KYTCLAENEAGSQTSVGELIVKEPAKIIERAELIQVTAGDPATLEYTVAGTPELKPKWYK
4920 4930 4940 4950 4960 4970
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 NSN-LLPFNHRQVAFENN-GTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVK---
.. :. .. ...:.:: . ::. ... . : :.:: .. . :. ... ...
CCDS74 DGRPLVASKKYRISFKNNVAQLKFYSAELH-DSGQYTFEISNEVGSSSCETTFTVLDRDI
4980 4990 5000 5010 5020 5030
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 VPPFIQPFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSL
.: : .:.. .. . : . .:.::. ..: :::. : .: : .. :.::
CCDS74 APFFTKPLRNVDSVVNGTCRLDCKI-AGSLPMRVSWFKDGKEIAASDRYRIAFVEGTASL
5040 5050 5060 5070 5080 5090
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 RISNLSLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAE
.: ... ::.:: : : ... . .. :::. ::.::..: ..: . :.:: :. . .
CCDS74 EIIRVDMNDAGNFTCRATNSVGSKDSSGALIVQEPPSFVTKPGSKDVLPGSAVCLKSTFQ
5100 5110 5120 5130 5140 5150
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 GYPVPTIVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVLSNG---SLLIKHVVEEDSGYYLCKVSND
: :: : : :: . .. .: . ... :: . : ::: : :::::
CCDS74 GSTPLTIRW-F-KGN-----KELVSGGSCYITKEALESSLELYLVKTSDSGTYTCKVSN-
5160 5170 5180 5190 5200
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 VGADVSKSMYLTVKIPA-MITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINP
:.. : : : :: :: .. . . : .:. ...: . : :: . : .:: :.
CCDS74 VAGGVECSANLFVKEPATFVEKLEPSQLLKKGDATQLACKVTGTPPIKITWFANDREIK-
5210 5220 5230 5240 5250 5260
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 EMARYLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPE
: ... .: : ..:.. . :::: . :.: : : :. . :.: : .
CCDS74 ESSKHRMSF----VESTAVLRLTDVGIEDSGEYMCEAQNEAGSDHCSSIVIVKESPYFTK
5270 5280 5290 5300 5310 5320
900 910 920 930 940
pF1KB3 IEIKDVKA-RTITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQRTKD-VSPQLNSATII
:.: ... . . :. : ..: . . :... : .. .: : :.
CCDS74 -EFKPIEVLKEYDVMLLAEVAGTPP---FEITWFKDNTILRSGRKYKTFIQDHLVSLQIL
5330 5340 5350 5360 5370 5380
950 960 970 980 990 1000
pF1KB3 DIHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAP
. ... . . :..:.: : ..:. ::. .. . :..:.: :
CCDS74 KFVAADAGEYQCRVTNEVGSSICSARVTLRE-------PPSFIK-KIESTSSLRGGTAAF
5390 5400 5410 5420 5430
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB3 KKHLQNG--IIRGYQIGYREYSTGGN----FQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGL
. :... : . : . : :. :. :. :: . . .:.
CCDS74 QATLKGSLPITVTWLKDSDEITEDDNIRMTFENNVASLYLSG----IEVKHDGKY-----
5440 5450 5460 5470 5480
1070 1080 1090 1100 1110
pF1KB3 VVQACNRAGTGPSS-----QEIITTTLE----DVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLS
: :: : :: : .: : : : :: . : ..:. .. . :. .: .
CCDS74 VCQAKNDAGIQRCSALLSVKEPATITEEAVSIDVTQGDPATLQVKFSGTKEITAKWFKDG
5490 5500 5510 5520 5530 5540
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KB3 KEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGD
.: : . : .... : :. .. : .. . :.:: :
CCDS74 QELTLGSKYKISVTDTVSILKIISTEKKDSGEYTFEVQNDVGRSSCKARINVL------D
5550 5560 5570 5580 5590
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KB3 GVRSEQIFTRTK--EDVPGPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHPYP
. .. . : ... : .. .:.. . ..:. . . .:: : :
CCDS74 LIIPPSFTKKLKKMDSIKGSFIDLECIVAGSHPISIQWFKDDQEISASEKYK-FSFHDNT
5600 5610 5620 5630 5640 5650
1240 1250 1260 1270 1280
pF1KB3 TV--ISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARIL
. ::..:.. :: .: :...::... : .:: : : .
CCDS74 AFLEISQLEGT-DSGTYTCS-------------ATNKAGHNQCSGHLTV----KEPPYF-
5660 5670 5680 5690
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KB3 TFSGTVTTPWMKDIV----LPCKA-VGDPSP-AVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNG-
: : .:. . :: :: .: ..::.::.. : . ::....
CCDS74 -----VEKPQSQDVNPNTRVQLKALVGGTAPMTIKWFKDNKELHS----GAARSVWKDDT
5700 5710 5720 5730 5740
1350 1360 1370 1380 1390
pF1KB3 --SFIIRTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPPD-----QPRLTVSKTTSSS-
:. . ..:: ::: : : .:. :. .: :. ::. .: :.. . :..
CCDS74 STSLELFAAKATDSGTYICQLSNDVGTATSKATLFVKEPPQFIKKPSPVLVLRNGQSTTF
5750 5760 5770 5780 5790 5800
1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB3 ---------ITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLENLKCGT
: .:: : ..:. . ... . ..: :: . :.:: ::
CCDS74 ECQITGTPKIRVSWYLDGNEITAIQKHGISFIDG----LATFQISGA----RVEN--SGT
5810 5820 5830 5840 5850
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB3 WYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWNDGGCP
.. :.: .: . : :: : . . : : .: . .. . :.:. :
CCDS74 ---YVCEARNDAGTASCS--IELK-VKEPPTFIRELKPVEVVKYSDVELE--------CE
5860 5870 5880 5890 5900
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB3 ITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRT-SLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQANFA
.:. :: .: : .: ::.: : : ... ..:.. :. . .: :
CCDS74 VTGTP----PFEVT-WLKNNREIRSSKKYTLTD--RVSVFNLHITKCDPSDTGEYQCIVS
5910 5920 5930 5940 5950
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB3 TLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRRREQR
CCDS74 NEGGSCSCSTRVALKEPPSFIKKIENTTTVLKSSATFQSTVAGSPPISITWLKDDQILDE
5960 5970 5980 5990 6000 6010
>--
initn: 330 init1: 221 opt: 714 Z-score: 448.7 bits: 100.7 E(32554): 1.1e-18
Smith-Waterman score: 714; 25.9% identity (56.6% similar) in 680 aa overlap (46-707:6185-6837)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 FSEDLHSSLYFVNASLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWYLATGEEIYDVPGIRHV
: ..: :.. .:. :.:: : :
CCDS74 LRVLDQNIPPSFTKKLTKMDKVLGSSIHMECKVSGSLPISAQWF-KDGKEISTSAKYRLV
6160 6170 6180 6190 6200 6210
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 -HPNG-TLQIFPFPPSSFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKAVLREP--YTVRVE
: . .:.. . : .: : . : .: . . ...:: . :.
CCDS74 CHERSVSLEVNNLE------LEDTANYTCKVSNVAGDDACSGI---LTVKEPPSFLVKPG
6220 6230 6240 6250 6260
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 DQKTMRGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTGALYIKDVQNEDG
:... ... :: :. .. : .: :: : :::: . .: :. . .. . :.
CCDS74 RQQAIPDSTVEFKAILKGTPPFKI---KWFKDDVELVSGPKCFIGLEGSTSFLNLYSVDA
6270 6280 6290 6300 6310 6320
200 210 220 230 240
pF1KB3 --LYNYRCITRHRYTGETRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFEHRKAM-AGQRVELPCKA
.: : : . .: .. :.:..: :... .: : . ::. .: ::
CCDS74 SKTGQYTC---HVTNDVGSDSCTTMLLVTEP----PKFVKKLEASKIVKAGDSSRLECKI
6330 6340 6350 6360 6370
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 LGHPEPDYRWLKDNMPLELSGRFQKT----VTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYGTAKV
: :: :.... : : ... : :. . ..:. :::...::..: :...
CCDS74 AGSPEIRVVWFRNEHELPASDKYRMTFIDSVAVIQMNNLSTEDSGDFICEAQNPAGSTSC
6380 6390 6400 6410 6420 6430
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 IGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNVRITG
.. ::.: . : :.. ...::: : ..:: :. ::.. . : .:. .:..
CCDS74 STKVIVKEPPVFSSFPPIVETLKNAEVSLECELSGTPPFEVVWYKDKRQLRSSKKYKIAS
6440 6450 6460 6470 6480 6490
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 IN-HENLIMDHMVKSDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSPAEP
: : .. . .. :: : :.: .... : : :.. :...: .. .: .::
CCDS74 KNFHTSIHILNVDTSDIGEYHCKAQNEVGSDTCVCTVKLKE-PPRFVSKLNSLTVVAGEP
6500 6510 6520 6530 6540 6550
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 VSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGGVYR
. :. ...:. . : . . ... :. : :: ::.. :...... ..: :
CCDS74 AELQASIEGAQPIFVQWLKEKEEVIRE-SENIR--ITFVENVAT-LQFAKAEPANAGKYI
6560 6570 6580 6590 6600
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 CTANNSAGVVLYQARINVRGPASI-RPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKNSN
: .:..:. .: . : :: : . .:. .:. ..:.: : : :..:::...
CCDS74 CQIKNDGGMRENMATLMVLEPAVIVEKAGPMTVTVGETCTLECKVAGTPELSVEWYKDGK
6610 6620 6630 6640 6650 6660
550 560 570 580 590
pF1KB3 LLPFNHR-QVAFENN-GTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQ-PQLSTSQSVHVTVK-VPP-
:: ... . .: :. ..:.. .:... : : :: .: . . : . : :. . :::
CCDS74 LLTSSQKHKFSFYNKISSLRILSVERQ-DAGTYTFQVQNNVGKSSCTAVVDVSDRAVPPS
6670 6680 6690 6700 6710 6720
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 FIQPFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRIS
: . .. .: .. : : .:. ::...: .. : .. : . .:...
CCDS74 FTRRLKNTGGVLGASCILECKV-AGSSPISVAWFHEKTKIVSGAKYQTTFSDNVCTLQLN
6730 6740 6750 6760 6770 6780
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 NLSLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYP
.:. :::::.: : :.. : .. : :. ::.:: .:. . . :: :
CCDS74 SLDSSDMGNYTCVAANVAGSDECRAVLTVQEPPSFVKEPEPLEVLPGKNVTFTSVIRGTP
6790 6800 6810 6820 6830 6840
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 VPTIVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVLSNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVS
CCDS74 PFKVNWFRGARELVKGDRCNIYFEDTVAELELFNIDISQSGEYTCVVSNNAGQASCTTRL
6850 6860 6870 6880 6890 6900
>>CCDS59435.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (35991 aa)
initn: 482 init1: 218 opt: 787 Z-score: 494.5 bits: 109.2 E(32554): 3.2e-21
Smith-Waterman score: 1007; 23.3% identity (52.4% similar) in 1589 aa overlap (50-1563:7162-8637)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 LHSSLYFVNASLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWYLATGEEIY-DVPGIRHVHPN
: :: . :. .. : . : .:
CCDS59 TVQEPPSFVKEPEPLEVLPGKNVTFTSVIRGTPPFKVNWFRGARELVKGDRCNIYFEDTV
7140 7150 7160 7170 7180 7190
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 GTLQIFPFPPSSFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKAVLREP--YTVRVEDQKTM
. :..: . : ... : :.. : .:. . . ..:: . :. :...
CCDS59 AELELFNIDIS------QSGEYTCVVSNNAGQ---ASCTTRLFVKEPAAFLKRLSDHSVE
7200 7210 7220 7230 7240
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 RGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTGALYIKDVQN--EDGLYN
:. ... ... .: :.:: ..... . :..: : .. : . .
CCDS59 PGKSIILESTYTGTLPISVT---WKKDGFNITTSEKCNIVTTEKTCILEILNSTKRDAGQ
7250 7260 7270 7280 7290
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 YRCITRHRYTGETRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFEHRKAMAGQRVELPCKALGHPEP
: : ... .: :. .: . . .: : .. .: .: .:. : : :.. : ::
CCDS59 YSCEIENE-AG--RDVCGALVSTLEP----PYFVTELEPLEAAVGDSVSLQCQVAGTPEI
7300 7310 7320 7330 7340 7350
260 270 280 290 300
pF1KB3 DYRWLKDNMPL----ELSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYGTA--KVIGRL
: : . : : : ..:. :..... .::: :.:.. : ::: :.. :.
CCDS59 TVSWYKGDTKLRPTPEYRTYFTNNVATLVFNKVNINDSGEYTCKAENSIGTASSKTVFRI
7360 7370 7380 7390 7400 7410
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 YVKQ-PLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNVRITGINH
.: : . . . . ....:: :.:.: ..:. .. :::.: .: .:.. . .
CCDS59 QERQLPPSFARQLKDIEQTVGLPVTLTCRLNGSAPIQVCWYRDGVLLRDDENLQTSFV--
7420 7430 7440 7450 7460 7470
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 ENLIMDHMVKSD---GGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVS----P
.:. .....: .: :.: . . .:.. .... .. :: :. : ::
CCDS59 DNVATLKILQTDLSHSGQYSCSASNPLGTASSSARLTARE--PKKSPFFDIKPVSIDVIA
7480 7490 7500 7510 7520
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 AEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGG
.: ... :.: :. :::. :. : ::.. : : ::. .: : . :.:
CCDS59 GESADFECHVTGAQPMRITWSKDNKEIRPGGNYTI----TCVGNT-PHLRILKVGKGDSG
7530 7540 7550 7560 7570 7580
490 500 510 520 530
pF1KB3 VYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIA--GRDTYIHCRVIGYPYYSIKWY
: : :.:..: . .:...:. : .. . . .: :.. ..:.. : : ...:.
CCDS59 QYTCQATNDVGKDMCSAQLSVKEPPKFVKKLEASKVAKQGESIQLECKISGSPEIKVSWF
7590 7600 7610 7620 7630 7640
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 KNSNLLPFNHR-QVAFENN-GTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVP
.:.. : . . ...: :. . : ..... : : :.: :.. . ..: :. .:::.:
CCDS59 RNDSELHESWKYNMSFINSVALLTINEASAE-DSGDYICEAH-NGVGDASCSTALTVKAP
7650 7660 7670 7680 7690 7700
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 PFIQPFEFPRFSI-GQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLR
: . : .. :. :.. : . :: :. ..: :: . . .: : . : .::.
CCDS59 PVFTQKPSPVGALKGSDVILQCEI-SGTPPFEVVWVKDRKQVRNSKKFKITSKHFDTSLH
7710 7720 7730 7740 7750 7760
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 ISNLSLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEG
: :: :.: : : ::... . .. . ::.:: . : . . : :: : .::
CCDS59 ILNLEASDVGEYHCKATNEVGSDTCSCSVKFKEPPRFVKKLSDTSTLIGDAVELRAIVEG
7770 7780 7790 7800 7810 7820
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 YPVPTIVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVLSN-GSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGA
. ..:: ..: . . . : ::. ..: ..: . .:: :.:...::.:
CCDS59 FQPISVVWLKDRGEVIRESE----NTRISFIDNIATLQLGSPEASNSGKYICQIKNDAGM
7830 7840 7850 7860 7870
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 DVSKSMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPEMAR
: ::: :: : :. .: :. . :.. : . ..: :. : .. . .
CCDS59 R-ECSAVLTVLEPARIIEKPEPMTVTTGNPFALECVVTGTPELSAKWFKDGRELSADSKH
7880 7890 7900 7910 7920 7930
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 YLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEI--E
... ..: ..:.: . :.:..: .. :: :.. ... :.. :: . .
CCDS59 HITFINKV-----ASLKIPCAEMSDKGLYSFEVKNSVGKSNCTVSVHVSDRIVPPSFIRK
7940 7950 7960 7970 7980 7990
900 910 920 930 940
pF1KB3 IKDVKA---RTITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQRTKDVSPQLNSATIID
.:::.: ...:. .. :..::. .. :. : . : . : .. . ..
CCDS59 LKDVNAILGASVVLECRVS--GSAPISVGWFQDGNEIVSGPKCQSS--FSENVCTLNLSL
8000 8010 8020 8030 8040
950 960 970 980 990 1000
pF1KB3 IHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPK
..::.: : : :..: : ::. . . . :. :.. : .. .:. .
CCDS59 LEPSDTGIYTCVAANVAGSDECSAVLTVQ-EPPSFEQTPDSVEVLP----GMSLTFTSVI
8050 8060 8070 8080 8090 8100
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB3 KHLQNGIIRGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNR
. .. .. : :: : . :: : . :.. .. :.. .:. .: :
CCDS59 RGTPPFKVKWFK-GSRELVPGESC--NISLEDFVTELELFEVQPLES-GDYSCLVT--ND
8110 8120 8130 8140 8150
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KB3 AGTGPSSQEIITTT-------LED--VPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALNGI
::.. . .... : : : . : ..: :. ::.:: .. : : :
CCDS59 AGSASCTTHLFVKEPATFVKRLADFSVETGSPIVLEATYTGTPPISVSW--IKDEYL--I
8160 8170 8180 8190 8200 8210
1130 1140 1150 1160 1170
pF1KB3 LQGFRVIYWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGLEK----YTNYSIQVLAFTRAGDGVR
:. : .:: :. : :. ::. :..:: : ..::. .
CCDS59 SQSERC---------------SITMTEKSTILEILESTIEDYAQYS--CLIENEAGQDIC
8220 8230 8240 8250
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KB3 SEQI-------FTRTKEDVP---GPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFC
. : . : : : :: .. . .. . .:: ...: .
CCDS59 EALVSVLEPPYFIEPLEHVEAVIGEPATLQCKVDGTPEIRISWY---------KEHTKLR
8260 8270 8280 8290 8300
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KB3 SHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAP-
: : . .:. . :. . : .:: : .:.: :: ..... :
CCDS59 SAPAYKM--QFKNNVASLVINKVDHSDVGEYSCK--ADNSVGAVASSAVLVIKARKLPPF
8310 8320 8330 8340 8350 8360
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KB3 -ARILT-FSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWMKDSNGTPSLVTIDGR-RSIFSNG
:: : :. : ... :. :. :.:.:: :. :. :. .. : ..
CCDS59 FARKLKDVHETLGFP----VAFECRINGSEPLQVSWYKD--GV--LLKDDANLQTSFVHN
8370 8380 8390 8400 8410
1350 1360 1370 1380 1390
pF1KB3 SFIIRTVKAEDS--GYYSCIANNNWG----SDEIILNLQVQVPP--DQPRLTVSKTTSSS
.. .....: : :.: :.: : : ..::. . .::: : ..:. . . :
CCDS59 VATLQILQTDQSHIGQYNCSASNPLGTASSSAKLILSEH-EVPPFFDLKPVSVDLALGES
8420 8430 8440 8450 8460 8470
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KB3 ITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSE--QWGSFPISPSERSYRLENLKCGTWY--KFT
:.. .: . :. . ...:: : :.. .. : . : :: : ..:
CCDS59 GTFK--CHVTGTAPIK---ITWAKDNREIRPGGNYKMTLVENTATLTVLKVGKGDAGQYT
8480 8490 8500 8510 8520
1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB3 LTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQE---LFASINTTRVRLNLIGWNDGGCPIT
:.: .: : . .. . :.: :. : . . . :: . .. :: :
CCDS59 CYASNIAGKDSCSAQLGVQ---EPPRFIKKLEPSRIVKQDEFTRYECKI-----GGSPEI
8530 8540 8550 8560 8570
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB3 SFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVC---NSAGCAEKQANFA
. .: :. .. : :. : . .... . . .: :.:: : .....
CCDS59 K-VLWYKDETEIQESSKFRMSFVDSVAVLEMHNLSVEDSGDYTCEAHNAAGSASSSTSLK
8580 8590 8600 8610 8620 8630
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB3 TLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRRREQR
CCDS59 VKEPPIFRKKPHPIETLKGADVHLECELQGTPPFHVSWYKDKRELRSGKKYKIMSENFLT
8640 8650 8660 8670 8680 8690
>--
initn: 482 init1: 218 opt: 847 Z-score: 532.3 bits: 116.2 E(32554): 2.5e-23
Smith-Waterman score: 960; 24.0% identity (51.1% similar) in 1586 aa overlap (46-1560:4816-6270)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 FSEDLHSSLYFVNASLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWYLATGEEIYDVPGIRHV
: ..: : . : : . :. : .
CCDS59 TLTVTEAYPPTFLSRPKSLTTFVGKAAKFICTVTGTPVIETIWQ-KDGAALSPSPNWR-I
4790 4800 4810 4820 4830 4840
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 HPNGTLQIFPFPPSSFSTLIHD-NTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKAVLREPYTVR-VEDQ
. .:. . :... :.: ..: : : : : : : .. .:. .. .:
CCDS59 SDAENKHILEL--SNLT--IQDRGVYSCKASNKFGADICQAELI--IIDKPHFIKELEPV
4850 4860 4870 4880 4890
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 KTMRGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLIT---STGALYIKDVQNED
.. .. . ..: . : ..:.: :: .: :. . : . ..: : .. .:
CCDS59 QSAINKKVHLECQVD---EDRKVTVTWSKDGQKLPPGKDYKICFEDKIATLEIPLAKLKD
4900 4910 4920 4930 4940 4950
200 210 220 230 240
pF1KB3 GLYNYRCITRHRYTGETRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFEHRKAM-AGQRVELPCKAL
. .: : : .: . : :: . : .: ::.. . : :. ..: ::
CCDS59 S-GTYVC-TASNEAGSS--SCSATVTVREP----PSFVKKVDPSYLMLPGESARLHCKLK
4960 4970 4980 4990 5000
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 GHPEPDYRWLKDNMPLELSGR----FQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYGTAKVI
: : . :.:.: : :. : .. . : : ... ::::: ::. : :. .
CCDS59 GSPVIQVTWFKNNKELSESNTVRMYFVNSEAILDITDVKVEDSGSYSCEAVNDVGSDSCS
5010 5020 5030 5040 5050 5060
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 GRLYVKQP--LKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNVRIT
.. .:.: . :. : . :... :.: :.:: :.::... . . .:. :.
CCDS59 TEIVIKEPPSFIKTLEPADIVR--GTNALLQCEVSGTGPFEISWFKDKKQIRSSKKYRL-
5070 5080 5090 5100 5110 5120
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 GINHENLIMDHMVK---SDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSP
.....:. .. . .: : :.: : .. . .. .:.. : ... .. ..
CCDS59 -FSQKSLVCLEIFSFNSADVGEYECVVANEVGKCGCMATHLLKE-PPTFVKKVDDLIALG
5130 5140 5150 5160 5170 5180
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 AEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGG
.. :.:. :.:. ..:: .. : . :. ..: :.: :. : : . :. ::
CCDS59 GQTVTLQAAVRGSEPISVTWMKGQEVIREDGKIKMS---FSNG--VAVLIIPDVQISFGG
5190 5200 5210 5220 5230
490 500 510 520 530
pF1KB3 VYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAI-AGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYK
: : :.: :: ... :. ::.: .. . :: . .. : : : . ::::
CCDS59 KYTCLAENEAGSQTSVGELIVKEPAKIIERAELIQVTAGDPATLEYTVAGTPELKPKWYK
5240 5250 5260 5270 5280 5290
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 NSN-LLPFNHRQVAFENN-GTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVK---
.. :. .. ...:.:: . ::. ... . : :.:: .. . :. ... ...
CCDS59 DGRPLVASKKYRISFKNNVAQLKFYSAELH-DSGQYTFEISNEVGSSSCETTFTVLDRDI
5300 5310 5320 5330 5340 5350
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 VPPFIQPFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSL
.: : .:.. .. . : . .:.::. ..: :::. : .: : .. :.::
CCDS59 APFFTKPLRNVDSVVNGTCRLDCKI-AGSLPMRVSWFKDGKEIAASDRYRIAFVEGTASL
5360 5370 5380 5390 5400 5410
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 RISNLSLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAE
.: ... ::.:: : : ... . .. :::. ::.::..: ..: . :.:: :. . .
CCDS59 EIIRVDMNDAGNFTCRATNSVGSKDSSGALIVQEPPSFVTKPGSKDVLPGSAVCLKSTFQ
5420 5430 5440 5450 5460 5470
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 GYPVPTIVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVLSNG---SLLIKHVVEEDSGYYLCKVSND
: :: : : :: . .. .: . ... :: . : ::: : :::::
CCDS59 GSTPLTIRW-F-KGN-----KELVSGGSCYITKEALESSLELYLVKTSDSGTYTCKVSN-
5480 5490 5500 5510 5520
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 VGADVSKSMYLTVKIPA-MITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINP
:.. : : : :: :: .. . . : .:. ...: . : :: . : .:: :.
CCDS59 VAGGVECSANLFVKEPATFVEKLEPSQLLKKGDATQLACKVTGTPPIKITWFANDREIK-
5530 5540 5550 5560 5570 5580
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 EMARYLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPE
: ... .: : ..:.. . :::: . :.: : : :. . :.: : .
CCDS59 ESSKHRMSF----VESTAVLRLTDVGIEDSGEYMCEAQNEAGSDHCSSIVIVKESPYFTK
5590 5600 5610 5620 5630 5640
900 910 920 930 940
pF1KB3 IEIKDVKA-RTITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQRTKD-VSPQLNSATII
:.: ... . . :. : ..: . . :... : .. .: : :.
CCDS59 -EFKPIEVLKEYDVMLLAEVAGTPP---FEITWFKDNTILRSGRKYKTFIQDHLVSLQIL
5650 5660 5670 5680 5690
950 960 970 980 990 1000
pF1KB3 DIHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAP
. ... . . :..:.: : ..:. ::. .. . :..:.: :
CCDS59 KFVAADAGEYQCRVTNEVGSSICSARVTLRE-------PPSFIK-KIESTSSLRGGTAAF
5700 5710 5720 5730 5740
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB3 KKHLQNG--IIRGYQIGYREYSTGGN----FQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGL
. :... : . : . : :. :. :. :: . . .:.
CCDS59 QATLKGSLPITVTWLKDSDEITEDDNIRMTFENNVASLYLSG----IEVKHDGKY-----
5750 5760 5770 5780 5790 5800
1070 1080 1090 1100 1110
pF1KB3 VVQACNRAGTGPSS-----QEIITTTLE----DVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLS
: :: : :: : .: : : : :: . : ..:. .. . :. .: .
CCDS59 VCQAKNDAGIQRCSALLSVKEPATITEEAVSIDVTQGDPATLQVKFSGTKEITAKWFKDG
5810 5820 5830 5840 5850 5860
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KB3 KEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGD
.: : . : .... : :. .. : .. . :.:: :
CCDS59 QELTLGSKYKISVTDTVSILKIISTEKKDSGEYTFEVQNDVGRSSCKARINVL------D
5870 5880 5890 5900 5910
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KB3 GVRSEQIFTRTK--EDVPGPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHPYP
. .. . : ... : .. .:.. . ..:. . . .:: : :
CCDS59 LIIPPSFTKKLKKMDSIKGSFIDLECIVAGSHPISIQWFKDDQEISASEKYK-FSFHDNT
5920 5930 5940 5950 5960 5970
1240 1250 1260 1270 1280
pF1KB3 TV--ISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARIL
. ::..:.. :: .: :...::... : .:: : : .
CCDS59 AFLEISQLEGT-DSGTYTCS-------------ATNKAGHNQCSGHLTV----KEPPYF-
5980 5990 6000 6010
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KB3 TFSGTVTTPWMKDIV----LPCKA-VGDPSP-AVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNG-
: : .:. . :: :: .: ..::.::.. : . ::....
CCDS59 -----VEKPQSQDVNPNTRVQLKALVGGTAPMTIKWFKDNKELHS----GAARSVWKDDT
6020 6030 6040 6050 6060
1350 1360 1370 1380 1390
pF1KB3 --SFIIRTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPPD-----QPRLTVSKTTSSS-
:. . ..:: ::: : : .:. :. .: :. ::. .: :.. . :..
CCDS59 STSLELFAAKATDSGTYICQLSNDVGTATSKATLFVKEPPQFIKKPSPVLVLRNGQSTTF
6070 6080 6090 6100 6110 6120
1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB3 ---------ITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLENLKCGT
: .:: : ..:. . ... . ..: :: . :.:: ::
CCDS59 ECQITGTPKIRVSWYLDGNEITAIQKHGISFIDG----LATFQISGA----RVEN--SGT
6130 6140 6150 6160 6170
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB3 WYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWNDGGCP
.. :.: .: . : :: : . . : : .: . .. . :.:. :
CCDS59 ---YVCEARNDAGTASCS--IELK-VKEPPTFIRELKPVEVVKYSDVELE--------CE
6180 6190 6200 6210 6220
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB3 ITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRT-SLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQANFA
.:. :: .: : .: ::.: : : ... ..:.. :. . .: :
CCDS59 VTGTP----PFEVT-WLKNNREIRSSKKYTLTD--RVSVFNLHITKCDPSDTGEYQCIVS
6230 6240 6250 6260 6270
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB3 TLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRRREQR
CCDS59 NEGGSCSCSTRVALKEPPSFIKKIENTTTVLKSSATFQSTVAGSPPISITWLKDDQILDE
6280 6290 6300 6310 6320 6330
>--
initn: 330 init1: 221 opt: 714 Z-score: 448.5 bits: 100.7 E(32554): 1.2e-18
Smith-Waterman score: 714; 25.9% identity (56.6% similar) in 680 aa overlap (46-707:6502-7154)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 FSEDLHSSLYFVNASLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWYLATGEEIYDVPGIRHV
: ..: :.. .:. :.:: : :
CCDS59 LRVLDQNIPPSFTKKLTKMDKVLGSSIHMECKVSGSLPISAQWF-KDGKEISTSAKYRLV
6480 6490 6500 6510 6520 6530
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 -HPNG-TLQIFPFPPSSFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKAVLREP--YTVRVE
: . .:.. . : .: : . : .: . . ...:: . :.
CCDS59 CHERSVSLEVNNLE------LEDTANYTCKVSNVAGDDACSGI---LTVKEPPSFLVKPG
6540 6550 6560 6570 6580
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 DQKTMRGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTGALYIKDVQNEDG
:... ... :: :. .. : .: :: : :::: . .: :. . .. . :.
CCDS59 RQQAIPDSTVEFKAILKGTPPFKI---KWFKDDVELVSGPKCFIGLEGSTSFLNLYSVDA
6590 6600 6610 6620 6630
200 210 220 230 240
pF1KB3 --LYNYRCITRHRYTGETRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFEHRKAM-AGQRVELPCKA
.: : : . .: .. :.:..: :... .: : . ::. .: ::
CCDS59 SKTGQYTC---HVTNDVGSDSCTTMLLVTEP----PKFVKKLEASKIVKAGDSSRLECKI
6640 6650 6660 6670 6680 6690
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 LGHPEPDYRWLKDNMPLELSGRFQKT----VTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYGTAKV
: :: :.... : : ... : :. . ..:. :::...::..: :...
CCDS59 AGSPEIRVVWFRNEHELPASDKYRMTFIDSVAVIQMNNLSTEDSGDFICEAQNPAGSTSC
6700 6710 6720 6730 6740 6750
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 IGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNVRITG
.. ::.: . : :.. ...::: : ..:: :. ::.. . : .:. .:..
CCDS59 STKVIVKEPPVFSSFPPIVETLKNAEVSLECELSGTPPFEVVWYKDKRQLRSSKKYKIAS
6760 6770 6780 6790 6800 6810
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 IN-HENLIMDHMVKSDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSPAEP
: : .. . .. :: : :.: .... : : :.. :...: .. .: .::
CCDS59 KNFHTSIHILNVDTSDIGEYHCKAQNEVGSDTCVCTVKLKE-PPRFVSKLNSLTVVAGEP
6820 6830 6840 6850 6860 6870
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 VSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGGVYR
. :. ...:. . : . . ... :. : :: ::.. :...... ..: :
CCDS59 AELQASIEGAQPIFVQWLKEKEEVIRE-SENIR--ITFVENVAT-LQFAKAEPANAGKYI
6880 6890 6900 6910 6920
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 CTANNSAGVVLYQARINVRGPASI-RPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKNSN
: .:..:. .: . : :: : . .:. .:. ..:.: : : :..:::...
CCDS59 CQIKNDGGMRENMATLMVLEPAVIVEKAGPMTVTVGETCTLECKVAGTPELSVEWYKDGK
6930 6940 6950 6960 6970 6980
550 560 570 580 590
pF1KB3 LLPFNHR-QVAFENN-GTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQ-PQLSTSQSVHVTVK-VPP-
:: ... . .: :. ..:.. .:... : : :: .: . . : . : :. . :::
CCDS59 LLTSSQKHKFSFYNKISSLRILSVERQ-DAGTYTFQVQNNVGKSSCTAVVDVSDRAVPPS
6990 7000 7010 7020 7030 7040
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 FIQPFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRIS
: . .. .: .. : : .:. ::...: .. : .. : . .:...
CCDS59 FTRRLKNTGGVLGASCILECKV-AGSSPISVAWFHEKTKIVSGAKYQTTFSDNVCTLQLN
7050 7060 7070 7080 7090 7100
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 NLSLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYP
.:. :::::.: : :.. : .. : :. ::.:: .:. . . :: :
CCDS59 SLDSSDMGNYTCVAANVAGSDECRAVLTVQEPPSFVKEPEPLEVLPGKNVTFTSVIRGTP
7110 7120 7130 7140 7150 7160
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 VPTIVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVLSNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVS
CCDS59 PFKVNWFRGARELVKGDRCNIYFEDTVAELELFNIDISQSGEYTCVVSNNAGQASCTTRL
7170 7180 7190 7200 7210 7220
>>CCDS53957.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1408 aa)
initn: 353 init1: 188 opt: 744 Z-score: 485.1 bits: 102.8 E(32554): 1.1e-20
Smith-Waterman score: 942; 25.4% identity (55.4% similar) in 1044 aa overlap (507-1470:57-1051)
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 RDGGVYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIK
..:. ... . : .. ..: . . : .:.
CCDS53 RAPGAAAARSGSAPQSPGASIRTFTPFYFLVEPVDTLS-VRGSSVILNCSAYSEPSPKIE
30 40 50 60 70 80
540 550 560 570 580
pF1KB3 WYKNS---NLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDV----QKEVDEGEYTCNVLVQPQLST--SQ
: :.. ::. ..::. .:.: .:.: ... ::: : : . :. .:.: :.
CCDS53 WKKDGTFLNLVSDDRRQLL--PDGSLFISNVVHSKHNKPDEGYYQCVATVE-SLGTIISR
90 100 110 120 130 140
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 SVHVTVK-VPPFIQPFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTID
.... : .: : . : :. ... : : ..:: . :... .:. .:
CCDS53 TAKLIVAGLPRFTSQPEPSSVYAGNNAILNCEV-NADLVPFVRWEQNRQPL------LLD
150 160 170 180 190
650 660 670 680 690
pF1KB3 N--IDFTSS-LRISNLSLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPK--------FVVQ
. : . :. : ::: . .: : :.... .. ...... ..: : :. :
CCDS53 DRVIKLPSGMLVISNATEGDGGLYRCVVES-GGPPKYSDEVELKVLPDPEVISDLVFLKQ
200 210 220 230 240 250
700 710 720 730 740 750
pF1KB3 PRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPTIVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVLSNGSLLIKH
: . :. :.: : : : :.::: : .. : . :. .:..::: :.
CCDS53 PSPLVRVIGQDVVLPCVASGLPTPTIKWMKNEEA-----LDTESSERLVLLAGGSLEISD
260 270 280 290 300
760 770 780 790 800 810
pF1KB3 VVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEK
:.:.:.: :.: .... . . . :::. . . :.. : ... . : . :.
CCDS53 VTEDDAGTYFC-IADNGNETIEAQAELTVQAQPEFLKQPTNIYAHESMDIVFECEVTGKP
310 320 330 340 350 360
820 830 840 850 860 870
pF1KB3 PIIVRWEKEDRIINPEMARYLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDR
:.: :. .. : . :. .:: .::.: :. : ::..: : :. :. .
CCDS53 TPTVKWVKNGDMVIP--SDYFKIVKE------HNLQVLGLVKSDEGFYQCIAENDVGNAQ
370 380 390 400 410 420
880 890 900 910 920
pF1KB3 GIIQLTVQE---------PPDPPEIEIKDVKARTITLRW-TMGFDGNSPITGYDIECKNK
. :: . : : : .. . :..: : : : : . : .. :.. ..
CCDS53 AGAQLIILEHAPATTGPLPSAPRDVVASLVSTRFIKLTWRTPASDPHGDNLTYSVFYTKE
430 440 450 460 470 480
930 940 950 960 970 980
pF1KB3 SDSWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTI-TADEAAP
. . . .. :. : ..:: .. :...: .:..:.:. :..: : : . : :.
CCDS53 GIARERVENTS--HPGEMQVTIQNLMPATVYIFRVMAQNKHGSGESSAPLRVETQPEVQL
490 500 510 520 530
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KB3 DGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSG
:: ... : :: :::..: . :: :..:.. : : .: . : .::.:.
CCDS53 PGPAPNLRAYAASPTSITVTWETPVS--GNGEIQNYKLYYMEKGTDKE-Q----DVDVSS
540 550 560 570 580 590
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KB3 DSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEIITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPES
: ::...:.:.:.:.. : : :. : : :. .. . :: :::: :.:.. . . .:
CCDS53 HS--YTINGLKKYTEYSFRVVAYNKHGPGVSTPDVAVRTLSDVPSAAPQNLSLEVRNSKS
600 610 620 630 640
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KB3 ISISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQ
: : :. . . :: . :... : ... : .. :: : ..::.. :.:...
CCDS53 IMIHWQPPAPATQNGQITGYKIRYRKASRKSDVTETL-VSGTQLSQLIEGLDRGTEYNFR
650 660 670 680 690 700
1170 1180 1190 1200 1210
pF1KB3 VLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKED------VPGPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGI
: :.: : : .. . ..: :. :: :..... .:.: ::: :: . : .
CCDS53 VAALTINGTGPATDWLSAETFESDLDETRVPEVPSSLHVRPLVTSIV-VSWTPPENQNIV
710 720 730 740 750 760
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KB3 IRKYTVFCSHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRG--------
.: :.. . : . . .... . : : ::. . .: . . : ...:.:
CCDS53 VRGYAIGYGIGSPHA-QTIKVDYKQRYYTIENLDPSSHYVITLKAFNNVGEGIPLYESAV
770 780 790 800 810 820
1280 1290 1300
pF1KB3 -----NSSEI---ITVEPLAKAP------------ARILTFSGTVTTPWMKDIVLPC-KA
..::. . : . .: : ::. . :. : : :: .
CCDS53 TRPHTDTSEVDLFVINAPYTPVPDPTPMMPPVGVQASILSHD-TIRITWA-DNSLPKHQK
830 840 850 860 870 880
1310 1320 1330 1340 1350
pF1KB3 VGDPSP-AVKW---------MKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSGYYSC
. : .:.: .:..:.: . : . . : . ..:.. :. .:
CCDS53 ITDSRYYTVRWKTNIPANTKYKNANATTLSYLVTGLKPN-TLYEFSVMVTKGRRSSTWSM
890 900 910 920 930 940
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KB3 IANNNWGSDEIILNLQVQVPPDQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSED
:... ..: :: . .. .. ..: ..: : ......: :::. :: :
CCDS53 TAHGT------TFELVPTSPPKDVTVVSKEGKPKTIIVNWQPPSEANGKITGYIIYYSTD
950 960 970 980 990
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KB3 -NSE--QWGSFPISPSERSYRLENLKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQ
:.: .: :. .. ......: : : : . :.:. : : .:: .. .:
CCDS53 VNAEIHDWVIEPVVGNRLTHQIQELTLDTPYYFKIQARNSKGMGPMSEAVQFRTPKADSS
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KB3 FSKEQELFASINTTRVRLNLIGWNDGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYILY
CCDS53 DKMPNDQASGSGGKGSRLPDLGSDYKPPMSGSNSPHGSPTSPLDSNMLLVIIVSVGVITI
1060 1070 1080 1090 1100 1110
>>CCDS58378.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1450 aa)
initn: 353 init1: 188 opt: 744 Z-score: 484.9 bits: 102.8 E(32554): 1.1e-20
Smith-Waterman score: 942; 25.4% identity (55.4% similar) in 1044 aa overlap (507-1470:57-1051)
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 RDGGVYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIK
..:. ... . : .. ..: . . : .:.
CCDS58 RAPGAAAARSGSAPQSPGASIRTFTPFYFLVEPVDTLS-VRGSSVILNCSAYSEPSPKIE
30 40 50 60 70 80
540 550 560 570 580
pF1KB3 WYKNS---NLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDV----QKEVDEGEYTCNVLVQPQLST--SQ
: :.. ::. ..::. .:.: .:.: ... ::: : : . :. .:.: :.
CCDS58 WKKDGTFLNLVSDDRRQLL--PDGSLFISNVVHSKHNKPDEGYYQCVATVE-SLGTIISR
90 100 110 120 130 140
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 SVHVTVK-VPPFIQPFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTID
.... : .: : . : :. ... : : ..:: . :... .:. .:
CCDS58 TAKLIVAGLPRFTSQPEPSSVYAGNNAILNCEV-NADLVPFVRWEQNRQPL------LLD
150 160 170 180 190
650 660 670 680 690
pF1KB3 N--IDFTSS-LRISNLSLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPK--------FVVQ
. : . :. : ::: . .: : :.... .. ...... ..: : :. :
CCDS58 DRVIKLPSGMLVISNATEGDGGLYRCVVES-GGPPKYSDEVELKVLPDPEVISDLVFLKQ
200 210 220 230 240 250
700 710 720 730 740 750
pF1KB3 PRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPTIVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVLSNGSLLIKH
: . :. :.: : : : :.::: : .. : . :. .:..::: :.
CCDS58 PSPLVRVIGQDVVLPCVASGLPTPTIKWMKNEEA-----LDTESSERLVLLAGGSLEISD
260 270 280 290 300
760 770 780 790 800 810
pF1KB3 VVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEK
:.:.:.: :.: .... . . . :::. . . :.. : ... . : . :.
CCDS58 VTEDDAGTYFC-IADNGNETIEAQAELTVQAQPEFLKQPTNIYAHESMDIVFECEVTGKP
310 320 330 340 350 360
820 830 840 850 860 870
pF1KB3 PIIVRWEKEDRIINPEMARYLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDR
:.: :. .. : . :. .:: .::.: :. : ::..: : :. :. .
CCDS58 TPTVKWVKNGDMVIP--SDYFKIVKE------HNLQVLGLVKSDEGFYQCIAENDVGNAQ
370 380 390 400 410 420
880 890 900 910 920
pF1KB3 GIIQLTVQE---------PPDPPEIEIKDVKARTITLRW-TMGFDGNSPITGYDIECKNK
. :: . : : : .. . :..: : : : : . : .. :.. ..
CCDS58 AGAQLIILEHAPATTGPLPSAPRDVVASLVSTRFIKLTWRTPASDPHGDNLTYSVFYTKE
430 440 450 460 470 480
930 940 950 960 970 980
pF1KB3 SDSWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTI-TADEAAP
. . . .. :. : ..:: .. :...: .:..:.:. :..: : : . : :.
CCDS58 GIARERVENTS--HPGEMQVTIQNLMPATVYIFRVMAQNKHGSGESSAPLRVETQPEVQL
490 500 510 520 530
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KB3 DGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSG
:: ... : :: :::..: . :: :..:.. : : .: . : .::.:.
CCDS58 PGPAPNLRAYAASPTSITVTWETPVS--GNGEIQNYKLYYMEKGTDKE-Q----DVDVSS
540 550 560 570 580 590
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KB3 DSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEIITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPES
: ::...:.:.:.:.. : : :. : : :. .. . :: :::: :.:.. . . .:
CCDS58 HS--YTINGLKKYTEYSFRVVAYNKHGPGVSTPDVAVRTLSDVPSAAPQNLSLEVRNSKS
600 610 620 630 640
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KB3 ISISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQ
: : :. . . :: . :... : ... : .. :: : ..::.. :.:...
CCDS58 IMIHWQPPAPATQNGQITGYKIRYRKASRKSDVTETL-VSGTQLSQLIEGLDRGTEYNFR
650 660 670 680 690 700
1170 1180 1190 1200 1210
pF1KB3 VLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKED------VPGPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGI
: :.: : : .. . ..: :. :: :..... .:.: ::: :: . : .
CCDS58 VAALTINGTGPATDWLSAETFESDLDETRVPEVPSSLHVRPLVTSIV-VSWTPPENQNIV
710 720 730 740 750 760
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KB3 IRKYTVFCSHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRG--------
.: :.. . : . . .... . : : ::. . .: . . : ...:.:
CCDS58 VRGYAIGYGIGSPHA-QTIKVDYKQRYYTIENLDPSSHYVITLKAFNNVGEGIPLYESAV
770 780 790 800 810 820
1280 1290 1300
pF1KB3 -----NSSEI---ITVEPLAKAP------------ARILTFSGTVTTPWMKDIVLPC-KA
..::. . : . .: : ::. . :. : : :: .
CCDS58 TRPHTDTSEVDLFVINAPYTPVPDPTPMMPPVGVQASILSHD-TIRITWA-DNSLPKHQK
830 840 850 860 870 880
1310 1320 1330 1340 1350
pF1KB3 VGDPSP-AVKW---------MKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSGYYSC
. : .:.: .:..:.: . : . . : . ..:.. :. .:
CCDS58 ITDSRYYTVRWKTNIPANTKYKNANATTLSYLVTGLKPN-TLYEFSVMVTKGRRSSTWSM
890 900 910 920 930 940
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KB3 IANNNWGSDEIILNLQVQVPPDQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSED
:... ..: :: . .. .. ..: ..: : ......: :::. :: :
CCDS58 TAHGT------TFELVPTSPPKDVTVVSKEGKPKTIIVNWQPPSEANGKITGYIIYYSTD
950 960 970 980 990
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KB3 -NSE--QWGSFPISPSERSYRLENLKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQ
:.: .: :. .. ......: : : : . :.:. : : .:: .. .:
CCDS58 VNAEIHDWVIEPVVGNRLTHQIQELTLDTPYYFKIQARNSKGMGPMSEAVQFRTPKASGS
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KB3 FSKEQELFASINTTRVRLNLIGWNDGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYILY
CCDS58 GGKGSRLPDLGSDYKPPMSGSNSPHGSPTSPLDSNMLLVIIVSVGVITIVVVVIIAVFCT
1060 1070 1080 1090 1100 1110
>>CCDS10247.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1461 aa)
initn: 353 init1: 188 opt: 744 Z-score: 484.9 bits: 102.8 E(32554): 1.1e-20
Smith-Waterman score: 942; 25.4% identity (55.4% similar) in 1044 aa overlap (507-1470:57-1051)
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 RDGGVYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIK
..:. ... . : .. ..: . . : .:.
CCDS10 RAPGAAAARSGSAPQSPGASIRTFTPFYFLVEPVDTLS-VRGSSVILNCSAYSEPSPKIE
30 40 50 60 70 80
540 550 560 570 580
pF1KB3 WYKNS---NLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDV----QKEVDEGEYTCNVLVQPQLST--SQ
: :.. ::. ..::. .:.: .:.: ... ::: : : . :. .:.: :.
CCDS10 WKKDGTFLNLVSDDRRQLL--PDGSLFISNVVHSKHNKPDEGYYQCVATVE-SLGTIISR
90 100 110 120 130 140
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 SVHVTVK-VPPFIQPFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTID
.... : .: : . : :. ... : : ..:: . :... .:. .:
CCDS10 TAKLIVAGLPRFTSQPEPSSVYAGNNAILNCEV-NADLVPFVRWEQNRQPL------LLD
150 160 170 180 190
650 660 670 680 690
pF1KB3 N--IDFTSS-LRISNLSLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPK--------FVVQ
. : . :. : ::: . .: : :.... .. ...... ..: : :. :
CCDS10 DRVIKLPSGMLVISNATEGDGGLYRCVVES-GGPPKYSDEVELKVLPDPEVISDLVFLKQ
200 210 220 230 240 250
700 710 720 730 740 750
pF1KB3 PRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPTIVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVLSNGSLLIKH
: . :. :.: : : : :.::: : .. : . :. .:..::: :.
CCDS10 PSPLVRVIGQDVVLPCVASGLPTPTIKWMKNEEA-----LDTESSERLVLLAGGSLEISD
260 270 280 290 300
760 770 780 790 800 810
pF1KB3 VVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEK
:.:.:.: :.: .... . . . :::. . . :.. : ... . : . :.
CCDS10 VTEDDAGTYFC-IADNGNETIEAQAELTVQAQPEFLKQPTNIYAHESMDIVFECEVTGKP
310 320 330 340 350 360
820 830 840 850 860 870
pF1KB3 PIIVRWEKEDRIINPEMARYLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDR
:.: :. .. : . :. .:: .::.: :. : ::..: : :. :. .
CCDS10 TPTVKWVKNGDMVIP--SDYFKIVKE------HNLQVLGLVKSDEGFYQCIAENDVGNAQ
370 380 390 400 410 420
880 890 900 910 920
pF1KB3 GIIQLTVQE---------PPDPPEIEIKDVKARTITLRW-TMGFDGNSPITGYDIECKNK
. :: . : : : .. . :..: : : : : . : .. :.. ..
CCDS10 AGAQLIILEHAPATTGPLPSAPRDVVASLVSTRFIKLTWRTPASDPHGDNLTYSVFYTKE
430 440 450 460 470 480
930 940 950 960 970 980
pF1KB3 SDSWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTI-TADEAAP
. . . .. :. : ..:: .. :...: .:..:.:. :..: : : . : :.
CCDS10 GIARERVENTS--HPGEMQVTIQNLMPATVYIFRVMAQNKHGSGESSAPLRVETQPEVQL
490 500 510 520 530
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KB3 DGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSG
:: ... : :: :::..: . :: :..:.. : : .: . : .::.:.
CCDS10 PGPAPNLRAYAASPTSITVTWETPVS--GNGEIQNYKLYYMEKGTDKE-Q----DVDVSS
540 550 560 570 580 590
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KB3 DSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEIITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPES
: ::...:.:.:.:.. : : :. : : :. .. . :: :::: :.:.. . . .:
CCDS10 HS--YTINGLKKYTEYSFRVVAYNKHGPGVSTPDVAVRTLSDVPSAAPQNLSLEVRNSKS
600 610 620 630 640
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KB3 ISISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQ
: : :. . . :: . :... : ... : .. :: : ..::.. :.:...
CCDS10 IMIHWQPPAPATQNGQITGYKIRYRKASRKSDVTETL-VSGTQLSQLIEGLDRGTEYNFR
650 660 670 680 690 700
1170 1180 1190 1200 1210
pF1KB3 VLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKED------VPGPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGI
: :.: : : .. . ..: :. :: :..... .:.: ::: :: . : .
CCDS10 VAALTINGTGPATDWLSAETFESDLDETRVPEVPSSLHVRPLVTSIV-VSWTPPENQNIV
710 720 730 740 750 760
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KB3 IRKYTVFCSHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRG--------
.: :.. . : . . .... . : : ::. . .: . . : ...:.:
CCDS10 VRGYAIGYGIGSPHA-QTIKVDYKQRYYTIENLDPSSHYVITLKAFNNVGEGIPLYESAV
770 780 790 800 810 820
1280 1290 1300
pF1KB3 -----NSSEI---ITVEPLAKAP------------ARILTFSGTVTTPWMKDIVLPC-KA
..::. . : . .: : ::. . :. : : :: .
CCDS10 TRPHTDTSEVDLFVINAPYTPVPDPTPMMPPVGVQASILSHD-TIRITWA-DNSLPKHQK
830 840 850 860 870 880
1310 1320 1330 1340 1350
pF1KB3 VGDPSP-AVKW---------MKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSGYYSC
. : .:.: .:..:.: . : . . : . ..:.. :. .:
CCDS10 ITDSRYYTVRWKTNIPANTKYKNANATTLSYLVTGLKPN-TLYEFSVMVTKGRRSSTWSM
890 900 910 920 930 940
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KB3 IANNNWGSDEIILNLQVQVPPDQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSED
:... ..: :: . .. .. ..: ..: : ......: :::. :: :
CCDS10 TAHGT------TFELVPTSPPKDVTVVSKEGKPKTIIVNWQPPSEANGKITGYIIYYSTD
950 960 970 980 990
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KB3 -NSE--QWGSFPISPSERSYRLENLKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQ
:.: .: :. .. ......: : : : . :.:. : : .:: .. .:
CCDS10 VNAEIHDWVIEPVVGNRLTHQIQELTLDTPYYFKIQARNSKGMGPMSEAVQFRTPKADSS
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KB3 FSKEQELFASINTTRVRLNLIGWNDGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYILY
CCDS10 DKMPNDQASGSGGKGSRLPDLGSDYKPPMSGSNSPHGSPTSPLDSNMLLVIIVSVGVITI
1060 1070 1080 1090 1100 1110
2012 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 22:49:28 2016 done: Wed Nov 2 22:49:29 2016
Total Scan time: 4.350 Total Display time: 1.500
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]