Result of FASTA (omim) for
pFN21AA1384
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1384, 628 aa
1>>>pF1KA1384 628 - 628 aa - 628 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7709+/-0.000366; mu= 4.4667+/- 0.023
mean_var=225.0090+/-48.184, 0's: 0 Z-trim(120.9): 164 B-trim: 2092 in 1/56
Lambda= 0.085502
statistics sampled from 36657 (36845) to 36657 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.747), E-opt: 0.2 (0.432), width: 16
Scan time: 8.510
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_065856 (OMIM: 613772) kelch-like protein 14 [Ho ( 628) 4348 549.4 1.3e-155
XP_011524411 (OMIM: 613772) PREDICTED: kelch-like ( 367) 2403 309.3 1.5e-83
NP_001161775 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 613) 1188 159.6 2.9e-38
XP_016885439 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 639) 1188 159.7 3e-38
NP_001161774 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 639) 1188 159.7 3e-38
NP_001161773 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 639) 1188 159.7 3e-38
NP_001161772 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 649) 1188 159.7 3e-38
NP_277030 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 iso ( 655) 1188 159.7 3e-38
XP_011529713 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 655) 1188 159.7 3e-38
NP_001161771 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 658) 1188 159.7 3e-38
XP_011529711 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 661) 1188 159.7 3e-38
XP_011529712 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 661) 1188 159.7 3e-38
NP_061335 (OMIM: 611201) kelch-like protein 9 [Hom ( 617) 1180 158.7 5.7e-38
XP_005249164 (OMIM: 610749) PREDICTED: kelch-like ( 634) 985 134.6 1e-30
NP_001003760 (OMIM: 610749) kelch-like protein 31 ( 634) 985 134.6 1e-30
XP_016866347 (OMIM: 610749) PREDICTED: kelch-like ( 634) 985 134.6 1e-30
NP_001317952 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 427) 603 87.4 1.2e-16
XP_011529878 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 496) 603 87.4 1.3e-16
NP_001317953 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 496) 603 87.4 1.3e-16
NP_001154994 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 505) 603 87.4 1.3e-16
XP_016863165 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 505) 603 87.4 1.3e-16
XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 555) 603 87.4 1.4e-16
NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593) 603 87.5 1.5e-16
NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 597) 603 87.5 1.5e-16
XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 633) 603 87.5 1.6e-16
NP_001244124 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 505) 560 82.1 5.2e-15
NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 555) 560 82.1 5.6e-15
NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein ( 587) 560 82.2 5.8e-15
NP_071324 (OMIM: 256850,605379) gigaxonin [Homo sa ( 597) 552 81.2 1.2e-14
XP_006724581 (OMIM: 300980,300982) PREDICTED: kelc ( 604) 551 81.1 1.3e-14
NP_085127 (OMIM: 300980,300982) kelch-like protein ( 604) 551 81.1 1.3e-14
XP_016857484 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 471) 465 70.4 1.7e-11
XP_011508138 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 526) 465 70.4 1.8e-11
XP_016863164 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 415) 458 69.5 2.7e-11
NP_001290038 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 467) 430 66.0 3.3e-10
XP_011508139 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 522) 430 66.1 3.6e-10
XP_005260230 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 407 63.3 2.9e-09
NP_036421 (OMIM: 606016) kelch-like ECH-associated ( 624) 407 63.3 2.9e-09
NP_987096 (OMIM: 606016) kelch-like ECH-associated ( 624) 407 63.3 2.9e-09
XP_005260231 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 407 63.3 2.9e-09
XP_011526754 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 407 63.3 2.9e-09
XP_016876168 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 525) 403 62.8 3.6e-09
XP_016876167 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 575) 403 62.8 3.9e-09
NP_001273654 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 i ( 687) 403 62.9 4.4e-09
NP_065917 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 isof ( 748) 403 62.9 4.7e-09
NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 568) 390 61.2 1.2e-08
NP_950240 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 694) 390 61.3 1.4e-08
NP_001007076 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 709) 390 61.3 1.4e-08
NP_057074 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 755) 390 61.3 1.4e-08
XP_011512003 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 390 61.3 1.5e-08
>>NP_065856 (OMIM: 613772) kelch-like protein 14 [Homo s (628 aa)
initn: 4348 init1: 4348 opt: 4348 Z-score: 2914.5 bits: 549.4 E(85289): 1.3e-155
Smith-Waterman score: 4348; 100.0% identity (100.0% similar) in 628 aa overlap (1-628:1-628)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSRSGDRTSTFDPSHSDNLLHGLNLLWRKQLFCDVTLTAQGQQFHCHKAVLASCSQYFRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MSRSGDRTSTFDPSHSDNLLHGLNLLWRKQLFCDVTLTAQGQQFHCHKAVLASCSQYFRS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 LFSSHPPLGGGVGGQDGLGAPKDQQQPPQQQPSQQQQPPPQEEPGTPSSSPDDKLLTSPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 LFSSHPPLGGGVGGQDGLGAPKDQQQPPQQQPSQQQQPPPQEEPGTPSSSPDDKLLTSPR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 AINNLVLQGCSSIGLRLVLEYLYTANVTLSLDTVEEVLSVSKILHIPQVTKLCVQFLNDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 AINNLVLQGCSSIGLRLVLEYLYTANVTLSLDTVEEVLSVSKILHIPQVTKLCVQFLNDQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 ISVQNYKQVCKIAALHGLEETKKLANKYLVEDVLLLNFEEMRALLDSLPPPVESELALFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ISVQNYKQVCKIAALHGLEETKKLANKYLVEDVLLLNFEEMRALLDSLPPPVESELALFQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 MSVLWLEHDRETRMQYAPDLMKRLRFALIPAPELVERVQSVDFMRTDPVCQKLLLDAMNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MSVLWLEHDRETRMQYAPDLMKRLRFALIPAPELVERVQSVDFMRTDPVCQKLLLDAMNY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 HLMPFRQHCRQSLASRIRSNKKMLLLVGGLPPGPDRLPSNLVQYYDDEKKTWKILTIMPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 HLMPFRQHCRQSLASRIRSNKKMLLLVGGLPPGPDRLPSNLVQYYDDEKKTWKILTIMPY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 NSAHHCVVEVENFLFVLGGEDQWNPNGKHSTNFVSRYDPRFNSWIQLPPMQERRASFYAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 NSAHHCVVEVENFLFVLGGEDQWNPNGKHSTNFVSRYDPRFNSWIQLPPMQERRASFYAC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 RLDKHLYVIGGRNETGYLSSVECYNLETNEWRYVSSLPQPLAAHAGAVHNGKIYISGGVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RLDKHLYVIGGRNETGYLSSVECYNLETNEWRYVSSLPQPLAAHAGAVHNGKIYISGGVH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 NGEYVPWLYCYDPVMDVWARKQDMNTKRAIHTLAVMNDRLYAIGGNHLKGFSHLDVMLVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 NGEYVPWLYCYDPVMDVWARKQDMNTKRAIHTLAVMNDRLYAIGGNHLKGFSHLDVMLVE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 CYDPKGDQWNILQTPILEGRSGPGCAVLDDSIYLVGGYSWSMGAYKSSTICYCPEKGTWT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 CYDPKGDQWNILQTPILEGRSGPGCAVLDDSIYLVGGYSWSMGAYKSSTICYCPEKGTWT
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KA1 ELEGDVAEPLAGPACVTVILPSCVPYNK
::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ELEGDVAEPLAGPACVTVILPSCVPYNK
610 620
>>XP_011524411 (OMIM: 613772) PREDICTED: kelch-like prot (367 aa)
initn: 2403 init1: 2403 opt: 2403 Z-score: 1621.0 bits: 309.3 E(85289): 1.5e-83
Smith-Waterman score: 2403; 100.0% identity (100.0% similar) in 356 aa overlap (1-356:1-356)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSRSGDRTSTFDPSHSDNLLHGLNLLWRKQLFCDVTLTAQGQQFHCHKAVLASCSQYFRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSRSGDRTSTFDPSHSDNLLHGLNLLWRKQLFCDVTLTAQGQQFHCHKAVLASCSQYFRS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 LFSSHPPLGGGVGGQDGLGAPKDQQQPPQQQPSQQQQPPPQEEPGTPSSSPDDKLLTSPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LFSSHPPLGGGVGGQDGLGAPKDQQQPPQQQPSQQQQPPPQEEPGTPSSSPDDKLLTSPR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 AINNLVLQGCSSIGLRLVLEYLYTANVTLSLDTVEEVLSVSKILHIPQVTKLCVQFLNDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AINNLVLQGCSSIGLRLVLEYLYTANVTLSLDTVEEVLSVSKILHIPQVTKLCVQFLNDQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 ISVQNYKQVCKIAALHGLEETKKLANKYLVEDVLLLNFEEMRALLDSLPPPVESELALFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ISVQNYKQVCKIAALHGLEETKKLANKYLVEDVLLLNFEEMRALLDSLPPPVESELALFQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 MSVLWLEHDRETRMQYAPDLMKRLRFALIPAPELVERVQSVDFMRTDPVCQKLLLDAMNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSVLWLEHDRETRMQYAPDLMKRLRFALIPAPELVERVQSVDFMRTDPVCQKLLLDAMNY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 HLMPFRQHCRQSLASRIRSNKKMLLLVGGLPPGPDRLPSNLVQYYDDEKKTWKILTIMPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HLMPFRQHCRQSLASRIRSNKKMLLLVGGLPPGPDRLPSNLVQYYDDEKKTWKILTNTLF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 NSAHHCVVEVENFLFVLGGEDQWNPNGKHSTNFVSRYDPRFNSWIQLPPMQERRASFYAC
XP_011 CKTERGN
>>NP_001161775 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 isof (613 aa)
initn: 1028 init1: 692 opt: 1188 Z-score: 808.0 bits: 159.6 E(85289): 2.9e-38
Smith-Waterman score: 1215; 33.8% identity (62.9% similar) in 633 aa overlap (2-621:19-596)
10 20 30 40
pF1KA1 MSRSGDRTSTFDPSHSDNLLHGLNLLWRKQLFCDVTLTA--QG
:..: . .::. .:.:.. : . :.:::::
NP_001 MKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTD
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KA1 QQFHCHKAVLASCSQYFRSLFSSHPPLGGGVGGQDGLGAPKDQQQPPQQQPSQQQQPPPQ
. : :....:: :.::...:. ::. ::
NP_001 DAFPVHRVMMASASDYFKAMFT------GGMKEQD-------------------------
70 80
110 120 130 140 150 160
pF1KA1 EEPGTPSSSPDDKLLTSPRAINNLVLQGCSSIGLRLVLEYLYTANVTLSLDTVEEVLSVS
. . :.: :..::: .....:::...:..:.....: ..
NP_001 --------------------LMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAA
90 100 110 120
170 180 190 200 210
pF1KA1 KILHIPQVTKLCVQFLNDQISVQNYKQVCKIAALHGLEETKKLANKYLVEDV--------
..:.: : .: :: . ....: .: .:: ..: :. : .:......
NP_001 SFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGE
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 -LLLNFEEMRALLDSLPPPVESELALFQMSVLWLEHDRETRMQYAPDLMKRLRFALIPAP
: : ::.. .:.: .:: ::. . ::. . : ::..: ::: .:: :.
NP_001 FLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLE-EPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQ
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 ELVERVQSVDFMRTDPVCQKLLLDAMNYHLMPFRQHCRQSLASRIRSNKKMLLLVGGLPP
::.. ::.::::::: .: .:::.: ::..::. : :: . :::. :. .::.
NP_001 ELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDTTHLVTLGGVLR
250 260 270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 GPDRLPSNLVQYYDDEKKTWKILTIMPYNSAHHCVVEVENFLFVLGGEDQWNPNGKHSTN
. . :. ...::.. . :: :. : .: .. . :::.:.::..... .:: ...
NP_001 -QQLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVD
310 320 330 340 350 360
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 FVSRYDPRFNSWIQLPPMQERRASFYACRLDKHLYVIGGRNETGYLSSVECYNLETNEWR
: :.:::.:.:.:. ..:.:. :. : .::..:::: .: : .::::: .::::
NP_001 TVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWT
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 YVSSLPQPLAAHAGAVHNGKIYISGGVHNGEYVPWLYCYDPVMDVWARKQDMNTKRAIHT
::... .: .:::.:..: .:::::. . . :.:.:: : : .: :.: :..:
NP_001 YVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHC
430 440 450 460 470 480
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 LAVMNDRLYAIGGNHLKGFSHLD-VMLVECYDPKGDQWNILQTPILEGRSGPGCAVLDDS
. ....:::.:::::..: : : :. : :.: :::. . . .:.:.: : ::....
NP_001 MCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPILDQWTPIAA-MLRGQSDVGVAVFENK
490 500 510 520 530 540
580 590 600 610 620
pF1KA1 IYLVGGYSWSMGAYKSSTICYCPEKGTWTELEGDVAEPLAGP-ACVTVILPSCVPYNK
::.::::::. . . : :.: : .. :. : :.: ::. ...:
NP_001 IYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHKVF-DLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPS
550 560 570 580 590 600
NP_001 RESPLSAP
610
>>XP_016885439 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like prot (639 aa)
initn: 1028 init1: 692 opt: 1188 Z-score: 807.8 bits: 159.7 E(85289): 3e-38
Smith-Waterman score: 1215; 33.8% identity (62.9% similar) in 633 aa overlap (2-621:45-622)
10 20 30
pF1KA1 MSRSGDRTSTFDPSHSDNLLHGLNLLWRKQL
:..: . .::. .:.:.. : . :
XP_016 RNRSLVEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGL
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80
pF1KA1 FCDVTLTA--QGQQFHCHKAVLASCSQYFRSLFSSHPPLGGGVGGQDGLGAPKDQQQPPQ
.::::: . : :....:: :.::...:. ::. ::
XP_016 LCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFT------GGMKEQD-------------
80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KA1 QQPSQQQQPPPQEEPGTPSSSPDDKLLTSPRAINNLVLQGCSSIGLRLVLEYLYTANVTL
. . :.: :..::: .....:::...:
XP_016 --------------------------------LMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSL
120 130 140
150 160 170 180 190 200
pF1KA1 SLDTVEEVLSVSKILHIPQVTKLCVQFLNDQISVQNYKQVCKIAALHGLEETKKLANKYL
..:.....: ....:.: : .: :: . ....: .: .:: ..: :. : .:...
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NP_277 VECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTFQKELMCFDPDTDKWIQ
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628 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]