Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA1384
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1384, 628 aa
1>>>pF1KA1384 628 - 628 aa - 628 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6743+/-0.000958; mu= 4.9291+/- 0.058
mean_var=208.4552+/-42.864, 0's: 0 Z-trim(113.1): 96 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.088832
statistics sampled from 13699 (13795) to 13699 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.751), E-opt: 0.2 (0.424), width: 16
Scan time: 3.920
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32813.1 KLHL14 gene_id:57565|Hs108|chr18 ( 628) 4348 570.1 3.1e-162
CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 613) 1188 165.1 2.5e-40
CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 639) 1188 165.1 2.6e-40
CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 655) 1188 165.1 2.6e-40
CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 658) 1188 165.1 2.6e-40
CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9 ( 617) 1180 164.1 5.1e-40
CCDS34478.1 KLHL31 gene_id:401265|Hs108|chr6 ( 634) 985 139.1 1.7e-32
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19 ( 615) 905 128.8 2.1e-29
CCDS10948.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 616) 813 117.1 7.3e-26
CCDS69155.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6 ( 551) 668 98.4 2.6e-20
CCDS69154.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6 ( 584) 668 98.5 2.8e-20
CCDS5038.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6 ( 620) 668 98.5 2.9e-20
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22 ( 634) 659 97.3 6.5e-20
CCDS82975.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 427) 603 90.0 7e-18
CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 496) 603 90.1 7.8e-18
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 505) 603 90.1 7.9e-18
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 593) 603 90.1 9e-18
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 597) 603 90.1 9e-18
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 505) 560 84.6 3.6e-16
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 555) 560 84.6 3.9e-16
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 587) 560 84.6 4.1e-16
CCDS10935.1 GAN gene_id:8139|Hs108|chr16 ( 597) 552 83.6 8.4e-16
CCDS35217.1 KLHL15 gene_id:80311|Hs108|chrX ( 604) 551 83.5 9.2e-16
CCDS53882.1 KLHL33 gene_id:123103|Hs108|chr14 ( 533) 517 79.1 1.7e-14
>>CCDS32813.1 KLHL14 gene_id:57565|Hs108|chr18 (628 aa)
initn: 4348 init1: 4348 opt: 4348 Z-score: 3026.1 bits: 570.1 E(32554): 3.1e-162
Smith-Waterman score: 4348; 100.0% identity (100.0% similar) in 628 aa overlap (1-628:1-628)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSRSGDRTSTFDPSHSDNLLHGLNLLWRKQLFCDVTLTAQGQQFHCHKAVLASCSQYFRS
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CCDS32 MSRSGDRTSTFDPSHSDNLLHGLNLLWRKQLFCDVTLTAQGQQFHCHKAVLASCSQYFRS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 LFSSHPPLGGGVGGQDGLGAPKDQQQPPQQQPSQQQQPPPQEEPGTPSSSPDDKLLTSPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LFSSHPPLGGGVGGQDGLGAPKDQQQPPQQQPSQQQQPPPQEEPGTPSSSPDDKLLTSPR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 AINNLVLQGCSSIGLRLVLEYLYTANVTLSLDTVEEVLSVSKILHIPQVTKLCVQFLNDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AINNLVLQGCSSIGLRLVLEYLYTANVTLSLDTVEEVLSVSKILHIPQVTKLCVQFLNDQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 ISVQNYKQVCKIAALHGLEETKKLANKYLVEDVLLLNFEEMRALLDSLPPPVESELALFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ISVQNYKQVCKIAALHGLEETKKLANKYLVEDVLLLNFEEMRALLDSLPPPVESELALFQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 MSVLWLEHDRETRMQYAPDLMKRLRFALIPAPELVERVQSVDFMRTDPVCQKLLLDAMNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MSVLWLEHDRETRMQYAPDLMKRLRFALIPAPELVERVQSVDFMRTDPVCQKLLLDAMNY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 HLMPFRQHCRQSLASRIRSNKKMLLLVGGLPPGPDRLPSNLVQYYDDEKKTWKILTIMPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HLMPFRQHCRQSLASRIRSNKKMLLLVGGLPPGPDRLPSNLVQYYDDEKKTWKILTIMPY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 NSAHHCVVEVENFLFVLGGEDQWNPNGKHSTNFVSRYDPRFNSWIQLPPMQERRASFYAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NSAHHCVVEVENFLFVLGGEDQWNPNGKHSTNFVSRYDPRFNSWIQLPPMQERRASFYAC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 RLDKHLYVIGGRNETGYLSSVECYNLETNEWRYVSSLPQPLAAHAGAVHNGKIYISGGVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RLDKHLYVIGGRNETGYLSSVECYNLETNEWRYVSSLPQPLAAHAGAVHNGKIYISGGVH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 NGEYVPWLYCYDPVMDVWARKQDMNTKRAIHTLAVMNDRLYAIGGNHLKGFSHLDVMLVE
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CCDS32 NGEYVPWLYCYDPVMDVWARKQDMNTKRAIHTLAVMNDRLYAIGGNHLKGFSHLDVMLVE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 CYDPKGDQWNILQTPILEGRSGPGCAVLDDSIYLVGGYSWSMGAYKSSTICYCPEKGTWT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CYDPKGDQWNILQTPILEGRSGPGCAVLDDSIYLVGGYSWSMGAYKSSTICYCPEKGTWT
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KA1 ELEGDVAEPLAGPACVTVILPSCVPYNK
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ELEGDVAEPLAGPACVTVILPSCVPYNK
610 620
>>CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX (613 aa)
initn: 1028 init1: 692 opt: 1188 Z-score: 837.5 bits: 165.1 E(32554): 2.5e-40
Smith-Waterman score: 1215; 33.8% identity (62.9% similar) in 633 aa overlap (2-621:19-596)
10 20 30 40
pF1KA1 MSRSGDRTSTFDPSHSDNLLHGLNLLWRKQLFCDVTLTA--QG
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CCDS55 MKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTD
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KA1 QQFHCHKAVLASCSQYFRSLFSSHPPLGGGVGGQDGLGAPKDQQQPPQQQPSQQQQPPPQ
. : :....:: :.::...:. ::. ::
CCDS55 DAFPVHRVMMASASDYFKAMFT------GGMKEQD-------------------------
70 80
110 120 130 140 150 160
pF1KA1 EEPGTPSSSPDDKLLTSPRAINNLVLQGCSSIGLRLVLEYLYTANVTLSLDTVEEVLSVS
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CCDS55 --------------------LMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAA
90 100 110 120
170 180 190 200 210
pF1KA1 KILHIPQVTKLCVQFLNDQISVQNYKQVCKIAALHGLEETKKLANKYLVEDV--------
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CCDS55 SFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGE
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 -LLLNFEEMRALLDSLPPPVESELALFQMSVLWLEHDRETRMQYAPDLMKRLRFALIPAP
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CCDS55 FLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLE-EPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQ
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 ELVERVQSVDFMRTDPVCQKLLLDAMNYHLMPFRQHCRQSLASRIRSNKKMLLLVGGLPP
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CCDS55 ELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDTTHLVTLGGVLR
250 260 270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 GPDRLPSNLVQYYDDEKKTWKILTIMPYNSAHHCVVEVENFLFVLGGEDQWNPNGKHSTN
. . :. ...::.. . :: :. : .: .. . :::.:.::..... .:: ...
CCDS55 -QQLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVD
310 320 330 340 350 360
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 FVSRYDPRFNSWIQLPPMQERRASFYACRLDKHLYVIGGRNETGYLSSVECYNLETNEWR
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CCDS55 TVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWT
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 YVSSLPQPLAAHAGAVHNGKIYISGGVHNGEYVPWLYCYDPVMDVWARKQDMNTKRAIHT
::... .: .:::.:..: .:::::. . . :.:.:: : : .: :.: :..:
CCDS55 YVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHC
430 440 450 460 470 480
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 LAVMNDRLYAIGGNHLKGFSHLD-VMLVECYDPKGDQWNILQTPILEGRSGPGCAVLDDS
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CCDS55 MCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPILDQWTPIAA-MLRGQSDVGVAVFENK
490 500 510 520 530 540
580 590 600 610 620
pF1KA1 IYLVGGYSWSMGAYKSSTICYCPEKGTWTELEGDVAEPLAGP-ACVTVILPSCVPYNK
::.::::::. . . : :.: : .. :. : :.: ::. ...:
CCDS55 IYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHKVF-DLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPS
550 560 570 580 590 600
CCDS55 RESPLSAP
610
>>CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX (639 aa)
initn: 1028 init1: 692 opt: 1188 Z-score: 837.3 bits: 165.1 E(32554): 2.6e-40
Smith-Waterman score: 1215; 33.8% identity (62.9% similar) in 633 aa overlap (2-621:45-622)
10 20 30
pF1KA1 MSRSGDRTSTFDPSHSDNLLHGLNLLWRKQL
:..: . .::. .:.:.. : . :
CCDS55 RNRSLVEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGL
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80
pF1KA1 FCDVTLTA--QGQQFHCHKAVLASCSQYFRSLFSSHPPLGGGVGGQDGLGAPKDQQQPPQ
.::::: . : :....:: :.::...:. ::. ::
CCDS55 LCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFT------GGMKEQD-------------
80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KA1 QQPSQQQQPPPQEEPGTPSSSPDDKLLTSPRAINNLVLQGCSSIGLRLVLEYLYTANVTL
. . :.: :..::: .....:::...:
CCDS55 --------------------------------LMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSL
120 130 140
150 160 170 180 190 200
pF1KA1 SLDTVEEVLSVSKILHIPQVTKLCVQFLNDQISVQNYKQVCKIAALHGLEETKKLANKYL
..:.....: ....:.: : .: :: . ....: .: .:: ..: :. : .:...
CCDS55 NMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFV
150 160 170 180 190 200
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 VEDV---------LLLNFEEMRALLDSLPPPVESELALFQMSVLWLEHDRETRMQYAPDL
... : : ::.. .:.: .:: ::. . ::. . : ::..: :
CCDS55 LKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLE-EPRMDFAAKL
210 220 230 240 250 260
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 MKRLRFALIPAPELVERVQSVDFMRTDPVCQKLLLDAMNYHLMPFRQHCRQSLASRIRSN
:: .:: :. ::.. ::.::::::: .: .:::.: ::..::. : :: . :::.
CCDS55 MKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSD
270 280 290 300 310 320
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 KKMLLLVGGLPPGPDRLPSNLVQYYDDEKKTWKILTIMPYNSAHHCVVEVENFLFVLGGE
:. .::. . . :. ...::.. . :: :. : .: .. . :::.:.::.
CCDS55 TTHLVTLGGVLR-QQLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQ
330 340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 DQWNPNGKHSTNFVSRYDPRFNSWIQLPPMQERRASFYACRLDKHLYVIGGRNETGYLSS
.... .:: ... : :.:::.:.:.:. ..:.:. :. : .::..:::: .: : .
CCDS55 SNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPT
390 400 410 420 430 440
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 VECYNLETNEWRYVSSLPQPLAAHAGAVHNGKIYISGGVHNGEYVPWLYCYDPVMDVWAR
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CCDS55 VECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTFQKELMCFDPDTDKWIQ
450 460 470 480 490 500
510 520 530 540 550
pF1KA1 KQDMNTKRAIHTLAVMNDRLYAIGGNHLKGFSHLD-VMLVECYDPKGDQWNILQTPILEG
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CCDS55 KAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPILDQWTPIAA-MLRG
510 520 530 540 550 560
560 570 580 590 600 610
pF1KA1 RSGPGCAVLDDSIYLVGGYSWSMGAYKSSTICYCPEKGTWTELEGDVAEPLAGP-ACVTV
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CCDS55 QSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHKVF-DLPESLGGIRACTLT
570 580 590 600 610
620
pF1KA1 ILPSCVPYNK
..:
CCDS55 VFPPEETTPSPSRESPLSAP
620 630
>>CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX (655 aa)
initn: 1028 init1: 692 opt: 1188 Z-score: 837.2 bits: 165.1 E(32554): 2.6e-40
Smith-Waterman score: 1215; 33.8% identity (62.9% similar) in 633 aa overlap (2-621:61-638)
10 20 30
pF1KA1 MSRSGDRTSTFDPSHSDNLLHGLNLLWRKQL
:..: . .::. .:.:.. : . :
CCDS14 AYISLVEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGL
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80
pF1KA1 FCDVTLTA--QGQQFHCHKAVLASCSQYFRSLFSSHPPLGGGVGGQDGLGAPKDQQQPPQ
.::::: . : :....:: :.::...:. ::. ::
CCDS14 LCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFT------GGMKEQD-------------
100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KA1 QQPSQQQQPPPQEEPGTPSSSPDDKLLTSPRAINNLVLQGCSSIGLRLVLEYLYTANVTL
. . :.: :..::: .....:::...:
CCDS14 --------------------------------LMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSL
140 150
150 160 170 180 190 200
pF1KA1 SLDTVEEVLSVSKILHIPQVTKLCVQFLNDQISVQNYKQVCKIAALHGLEETKKLANKYL
..:.....: ....:.: : .: :: . ....: .: .:: ..: :. : .:...
CCDS14 NMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFV
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 VEDV---------LLLNFEEMRALLDSLPPPVESELALFQMSVLWLEHDRETRMQYAPDL
... : : ::.. .:.: .:: ::. . ::. . : ::..: :
CCDS14 LKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLE-EPRMDFAAKL
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 MKRLRFALIPAPELVERVQSVDFMRTDPVCQKLLLDAMNYHLMPFRQHCRQSLASRIRSN
:: .:: :. ::.. ::.::::::: .: .:::.: ::..::. : :: . :::.
CCDS14 MKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSD
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 KKMLLLVGGLPPGPDRLPSNLVQYYDDEKKTWKILTIMPYNSAHHCVVEVENFLFVLGGE
:. .::. . . :. ...::.. . :: :. : .: .. . :::.:.::.
CCDS14 TTHLVTLGGVLR-QQLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQ
340 350 360 370 380 390
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 DQWNPNGKHSTNFVSRYDPRFNSWIQLPPMQERRASFYACRLDKHLYVIGGRNETGYLSS
.... .:: ... : :.:::.:.:.:. ..:.:. :. : .::..:::: .: : .
CCDS14 SNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPT
400 410 420 430 440 450
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 VECYNLETNEWRYVSSLPQPLAAHAGAVHNGKIYISGGVHNGEYVPWLYCYDPVMDVWAR
::::: .:::: ::... .: .:::.:..: .:::::. . . :.:.:: : : .
CCDS14 VECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTFQKELMCFDPDTDKWIQ
460 470 480 490 500 510
510 520 530 540 550
pF1KA1 KQDMNTKRAIHTLAVMNDRLYAIGGNHLKGFSHLD-VMLVECYDPKGDQWNILQTPILEG
: :.: :..: . ....:::.:::::..: : : :. : :.: :::. . . .:.:
CCDS14 KAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPILDQWTPIAA-MLRG
520 530 540 550 560 570
560 570 580 590 600 610
pF1KA1 RSGPGCAVLDDSIYLVGGYSWSMGAYKSSTICYCPEKGTWTELEGDVAEPLAGP-ACVTV
.: : ::....::.::::::. . . : :.: : .. :. : :.: ::. .
CCDS14 QSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHKVF-DLPESLGGIRACTLT
580 590 600 610 620 630
620
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..:
CCDS14 VFPPEETTPSPSRESPLSAP
640 650
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10 20 30
pF1KA1 MSRSGDRTSTFDPSHSDNLLHGLNLLWRKQL
:..: . .::. .:.:.. : . :
CCDS55 TSGSLVEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGL
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40 50 60 70 80
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.::::: . : :....:: :.::...:. ::. ::
CCDS55 LCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFT------GGMKEQD-------------
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90 100 110 120 130 140
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150 160 170 180 190 200
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..:.....: ....:.: : .: :: . ....: .: .:: ..: :. : .:...
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210 220 230 240 250 260
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... : : ::.. .:.: .:: ::. . ::. . : ::..: :
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270 280 290 300 310 320
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:: .:: :. ::.. ::.::::::: .: .:::.: ::..::. : :: . :::.
CCDS55 MKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSD
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:. .::. . . :. ...::.. . :: :. : .: .. . :::.:.::.
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390 400 410 420 430 440
pF1KA1 DQWNPNGKHSTNFVSRYDPRFNSWIQLPPMQERRASFYACRLDKHLYVIGGRNETGYLSS
.... .:: ... : :.:::.:.:.:. ..:.:. :. : .::..:::: .: : .
CCDS55 SNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPT
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450 460 470 480 490 500
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CCDS55 VECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTFQKELMCFDPDTDKWIQ
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pF1KA1 KQDMNTKRAIHTLAVMNDRLYAIGGNHLKGFSHLD-VMLVECYDPKGDQWNILQTPILEG
: :.: :..: . ....:::.:::::..: : : :. : :.: :::. . . .:.:
CCDS55 KAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPILDQWTPIAA-MLRG
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pF1KA1 RSGPGCAVLDDSIYLVGGYSWSMGAYKSSTICYCPEKGTWTELEGDVAEPLAGP-ACVTV
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CCDS55 QSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHKVF-DLPESLGGIRACTLT
580 590 600 610 620 630
620
pF1KA1 ILPSCVPYNK
..:
CCDS55 VFPPEETTPSPSRESPLSAP
640 650
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10 20 30 40
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50 60 70 80 90 100
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. : :.:..:: :.::...:. ::. ::
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. . :.: ...::. .....:::...:..:.....: ..
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..:.: : .: :: . .:..: .: .:: ..: :. : .:......
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CCDS65 FLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKAACRWLRLE-DPRMDYAAKLMKNIRFPLMTPQ
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. . :. ...::.. . :. :. : .: .. . :::.:.::..... .:: ...
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CCDS65 TVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGHLYAVGGRSAAGELATVECYNPRMNEWS
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::... .: .:::.:..: .:::::. . . :.:.:: : : .: :.: :..:
CCDS65 YVAKMSEPHYGHAGTVYGGLMYISGGITHDTFQNELMCFDPDTDKWMQKAPMTTVRGLHC
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CCDS65 MCTVGDKLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPTLDQWTPIAA-MLRGQSDVGVAVFENK
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pF1KA1 IYLVGGYSWSMGAYKSSTICYCPEKGTWTELEGDVAEPLAGP-ACVTVILPSCVPYNK
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CCDS65 IYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPEKDEWHKVF-DLPESLGGIRACTLTVFPPEENPGSPS
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CCDS65 RESPLSAPSDHS
610
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CCDS34 VEDSPLNKLNALNGLLEGGNGLSCISSELTDASYGPNLLEGLSKMRQENFLCDLVIGTKT
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50 60 70 80 90 100
pF1KA1 QQFHCHKAVLASCSQYFRSLFSSHPPLGGGVGGQDGLGAPKDQQQPPQQQPSQQQQPPPQ
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CCDS34 KSFDVHKSVMASCSEYFYNILKKDP-----------------------------------
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pF1KA1 EEPGTPSSSPDDKLLTSPRAINNLVLQGCSSIGLRLVLEYLYTANVTLSLDTVEEVLSVS
.:. . :. : .:: :. : ::...:::: :. ..:..
CCDS34 -------------------SIQRVDLNDISPLGLATVIAYAYTGKLTLSLYTIGSIISAA
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:.: ..:.: .:: ..::.: : .:: ..:...: :.:.. .. :
CCDS34 VYLQIHTLVKMCSDFLIREMSVENCMYVVNIAETYSLKNAKAAAQKFIRDNFLEFAESDQ
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pF1KA1 ---LNFEEMRALL--DSLPPPVESELALFQMSVLWLEHDRETRMQYAPDLMKRLRFALIP
:.::.. :: :.: : ::.. ::... ::: :.. :..:: ::.. .::. :
CCDS34 FMKLTFEQINELLIDDDLQLP--SEIVAFQIAMKWLEFDQK-RVKYAADLLSNIRFGTIS
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pF1KA1 APELVERVQSVDFMRTDPVCQKLLLDAMNYHLMPFRQHCRQSLASRIRSNKKMLLLVGGL
: .::. :::: : : :..::.:::::::.:..:. :: .:::.. ..:. :::
CCDS34 AQDLVNYVQSVPRMMQDADCHRLLVDAMNYHLLPYHQNTLQSRRTRIRGGCRVLVTVGGR
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CCDS34 PGLTEKSLSRDILYRDPENG-WSKLTEMPAKSFNQCVAVMDGFLYVAGGEDQNDARNQAK
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pF1KA1 HSTNFVSRYDPRFNSWIQLPPMQERRASFYACRLDKHLYVIGGRNETGYLSSVECYNLET
:... :::::::.::.: :...:. : .. .:. :::: : :.:.::: :
CCDS34 HAVSNFCRYDPRFNTWIHLASMNQKRTHFSLSVFNGLVYAAGGRNAEGSLASLECYVPST
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pF1KA1 NEWRYVSSLPQPLAAHAGAVHNGKIYISGGVHNGEYVPWLYCYDPVMDVWARKQDMNTKR
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CCDS34 NQWQPKTPLEVARCCHASAVADGRVLVTGGYIANAYSRSVCAYDPASDSWQELPNLSTPR
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pF1KA1 AIHTLAVMNDRLYAIGGNHL--KGFSHLDVMLVECYDPKGDQWNILQTPILEGRSGPGCA
. : ....::.:..::..: .: ..::. ::::.: ::. .:. : : : .
CCDS34 GWHCAVTLSDRVYVMGGSQLGPRG-ERVDVLTVECYSPATGQWSY-AAPLQVGVSTAGVS
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pF1KA1 VLDDSIYLVGGYSWSMGAYKSSTICYCPEKGTWTELEGDVAEPLAGPACVTVILPSCVPY
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CCDS34 ALHGRAYLVGGWNEGEKKYKKCIQCFSPELNEWTE-DDELPEATVGVSCCTLSMPNNVTR
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pF1KA1 NK
CCDS34 ESRASSVSSVPVSI
630
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10 20 30
pF1KA1 MSRSGDRTSTFD-PSHSDNLLHGLNLLWRKQL
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CCDS12 AESGGSSGGAGGGGAFGAGPGPERPNSTADKNGALKCTFSAPSHSTSLLQGLATLRAQGQ
10 20 30 40 50 60
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pF1KA1 FCDVTLTAQGQQFHCHKAVLASCSQYFRSLFSSHPPLGGGVGGQDGLGAPKDQQQPPQQQ
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CCDS12 LLDVVLTINREAFPAHKVVLAACSDYFRAMFT------GGM-----------------RE
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pF1KA1 PSQQQQPPPQEEPGTPSSSPDDKLLTSPRAINNLVLQGCSSIGLRLVLEYLYTANVTLSL
:: . . :.: :. ::: .... :.:.:::.:
CCDS12 ASQ----------------------------DVIELKGVSARGLRHIIDFAYSAEVTLDL
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: :..::... .:.. :..:: .::. .::.. .. ..:. .: .. .. .
CCDS12 DCVQDVLGAAVFLQMLPVVELCEEFLKAAMSVETCLNIGQMATTFSLASLRESVDAFTFR
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pF1KA1 --------EDVLLLNFEEMRALLDSLPPPVESELALFQMSVLWLEHDRETRMQYAPDLMK
:: : : .:.. .:.: .:. ::. .: ::.:: .: : ..
CCDS12 HFLQIAEEEDFLRLPLERLVFFLQSNRLQSCAEIDLFRAAVRWLQHD-PARRPRASHVLC
200 210 220 230 240
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pF1KA1 RLRFALIPAPELVERVQSVDFMRTDPVCQKLLLDAMNYHLMPFRQHCRQSLASRIRSNKK
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CCDS12 HIRFPLMQSSELVDSVQTLDIMVEDVLCRQYLLEAFNYQVLPFRQHEMQSPRTAVRSDVP
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pF1KA1 MLLLVGGLP-PGPDR-LPSNLVQYYDDEKKTWKILTIMPYNSAHHCVVEVENFLFVLGGE
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CCDS12 SLVTFGGTPYTDSDRSVSSKVYQLPEPGARHFRELTEMEVGCSHTCVAVLDNFVYVAGGQ
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.:. ... ::::..: :..: ::: : .: : .:. ::::..: :.:
CCDS12 HLQYRSGEGAVDACYRYDPHLNRWLRLQAMQESRIQFQLNVLCGMVYATGGRNRAGSLAS
370 380 390 400 410 420
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pF1KA1 VECYNLETNEWRYVSSLPQPLAAHAGAVHNGKIYISGGVHNG-EYVPWLYCYDPVMDVWA
:: : . ::: :. :: . .::::. .:..::::: . : :.::::: : :
CCDS12 VERYCPRRNEWGYACSLKRRTWGHAGAASGGRLYISGGYGISVEDKKALHCYDPVADQWE
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pF1KA1 RKQDMNTKRAIHTLAVMNDRLYAIGGNHLKGFSHLDVMLVECYDPKGDQWNILQTPILEG
: :. :..:... . :.::.:: . .::. :: : :. :::. . .:. :
CCDS12 FKAPMSEPRVLHAMVGAGGRIYALGGRMDHVDRCFDVLAVEYYVPETDQWTSV-SPMRAG
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pF1KA1 RSGPGCAVLDDSIYLVGGYSWSMGAYKSSTICYCPEKGTWTELEGDVAEPLAGPACVTVI
.: :: .:. .::.::::.: .. . . : . : : . : .:: ::. :.
CCDS12 QSEAGCCLLERKIYIVGGYNWRLNNVTGIVQVYNTDTDEW-ERDLHFPESFAGIACAPVL
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CCDS12 LPRAGTRR
610
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CCDS10 MMEGSRQTRVSRPYKISESSKVYRWADHSSTVLQRLNEQRLRGLFCDVVLVADEQRVPAH
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pF1KA1 KAVLASCSQYFRSLFSSHPPLGGGVGGQDGLGAPKDQQQPPQQQPSQQQQPPPQEEPGTP
. .:: ::.:: :.:. .: .... :.:
CCDS10 RNLLAVCSDYFNSMFT--------IGMREAF----------------------QKE----
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pF1KA1 SSSPDDKLLTSPRAINNLVLQGCSSIGLRLVLEYLYTANVTLSLDTVEEVLSVSKILHIP
. : : : :::. :...:: ....:. ... :: ....:.:
CCDS10 -----------------VELIGASYIGLKAVVDFLYGGELVLDGGNIDYVLETAHLLQIW
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pF1KA1 QVTKLCVQFLNDQISVQNYKQVCKIAALHGLEETKKLANKYLVEDVLLLNF---------
:. .: ..:....: .:: . ..:....:.. . . .... :.:
CCDS10 TVVDFCCEYLEQEVSEDNYLYLQELASIYSLKRLDAFIDGFILNHFGTLSFTPDFLQNVS
130 140 150 160 170 180
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pF1KA1 -EEMRALLDSLPPPVESELALFQMSVLWLEHDRETRMQYAPDLMKRLRFALIPAPELVER
... . :.: : : :.: .. :: .. : : .: .... ..: ::: .:..:
CCDS10 MQKLCVYLSSSEVQRECEHDLLQAALQWLTQQPE-REAHARQVLENIHFPLIPKNDLLHR
190 200 210 220 230 240
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