Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA1116
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1116, 1271 aa
1>>>pF1KA1116 1271 - 1271 aa - 1271 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.1900+/-0.00136; mu= -15.9272+/- 0.082
mean_var=608.8143+/-125.498, 0's: 0 Z-trim(114.8): 39 B-trim: 170 in 1/54
Lambda= 0.051979
statistics sampled from 15283 (15314) to 15283 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.754), E-opt: 0.2 (0.47), width: 16
Scan time: 4.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5247.1 SCAF8 gene_id:22828|Hs108|chr6 (1271) 8658 665.4 2.6e-190
CCDS75541.1 SCAF8 gene_id:22828|Hs108|chr6 (1349) 8658 665.4 2.7e-190
CCDS69226.1 SCAF8 gene_id:22828|Hs108|chr6 (1337) 8599 661.0 5.8e-189
CCDS54482.1 SCAF4 gene_id:57466|Hs108|chr21 (1132) 1325 115.5 8.2e-25
CCDS33537.1 SCAF4 gene_id:57466|Hs108|chr21 (1147) 1325 115.5 8.3e-25
CCDS46644.1 SCAF4 gene_id:57466|Hs108|chr21 (1125) 1273 111.5 1.2e-23
>>CCDS5247.1 SCAF8 gene_id:22828|Hs108|chr6 (1271 aa)
initn: 8658 init1: 8658 opt: 8658 Z-score: 3530.2 bits: 665.4 E(32554): 2.6e-190
Smith-Waterman score: 8658; 99.9% identity (100.0% similar) in 1271 aa overlap (1-1271:1-1271)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 PGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 PGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 NVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 NVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 QITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 QITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 TAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 TAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 HQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 HQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 NLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 NLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 GSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 GSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLW
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 VGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 VGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 SKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 TVKSSEPVKETVQTTQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 TVKSSEPVKETVQTTQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 VSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 VSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 SMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 SMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 GENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 GENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 IAAQPPNILNNSGILGIQPPSVSNNSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQ
::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 IAAQPPNILNNSGILGIQPPSVSNSSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 PPAGPQNLPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 PPAGPQNLPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 ALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 ALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 IETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 IETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 RRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 RRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 FGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 FGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 GATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPIPVQNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 GATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPIPVQNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270
pF1KA1 PVVESTETEGT
:::::::::::
CCDS52 PVVESTETEGT
1270
>>CCDS75541.1 SCAF8 gene_id:22828|Hs108|chr6 (1349 aa)
initn: 8658 init1: 8658 opt: 8658 Z-score: 3529.8 bits: 665.4 E(32554): 2.7e-190
Smith-Waterman score: 8658; 99.9% identity (100.0% similar) in 1271 aa overlap (1-1271:79-1349)
10 20 30
pF1KA1 MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQIT
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PRSSPRLALPTQCSGRRLFRRRARGLRSDNMEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQIT
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 KAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSN
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 NIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLAST
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 TTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTL
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 QIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFG
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 EDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIFHQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIFHQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATP
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 QDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEVNLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEVNLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQE
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 AKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSER
470 480 490 500 510 520
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 RAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIP
530 540 550 560 570 580
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 PRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTY
590 600 610 620 630 640
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 IPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQTTQSPTPVEKETVVTTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQTTQSPTPVEKETVVTTQ
650 660 670 680 690 700
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 AEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFPVSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFPVSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPP
710 720 730 740 750 760
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 GFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSLSMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSLSMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSA
770 780 790 800 810 820
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 LPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNS
830 840 850 860 870 880
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 GILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQPPNILNNSGILGIQPPSVSNNSGLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS75 GILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQPPNILNNSGILGIQPPSVSNSSGLLG
890 900 910 920 930 940
880 890 900 910 920 930
pF1KA1 VLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQNLPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQNLPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGL
950 960 970 980 990 1000
940 950 960 970 980 990
pF1KA1 IPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQS
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 VDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPG
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 RPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVY
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA1 GGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFC
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA1 REMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPIPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 REMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPIPV
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1240 1250 1260 1270
pF1KA1 QNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESEPVVESTETEGT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESEPVVESTETEGT
1310 1320 1330 1340
>>CCDS69226.1 SCAF8 gene_id:22828|Hs108|chr6 (1337 aa)
initn: 8599 init1: 8599 opt: 8599 Z-score: 3506.0 bits: 661.0 E(32554): 5.8e-189
Smith-Waterman score: 8606; 98.3% identity (98.4% similar) in 1292 aa overlap (1-1271:46-1337)
10
pF1KA1 MEAVKTFNSE--------------------
::::::::::
CCDS69 SGAGSCGPSGGECSGRRLFRRRARGLRSDNMEAVKTFNSEDCASTPACTDCFSSSMDTRS
20 30 40 50 60 70
20 30 40 50 60
pF1KA1 -LYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ILYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSI
80 90 100 110 120 130
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 VRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 VRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQ
140 150 160 170 180 190
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 PLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVSQITNTDTLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 PLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVSQITNTDTLA
200 210 220 230 240 250
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 AVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 AVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANT
260 270 280 290 300 310
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 LTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIFHQIAEQLQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIFHQIAEQLQQ
320 330 340 350 360 370
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 QNLEHLRQQLLEQQQPQKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEVNLDDSIDIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 QNLEHLRQQLLEQQQPQKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEVNLDDSIDIQ
380 390 400 410 420 430
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 QQDMDIDEGQDGVEEEVFEQEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 QQDMDIDEGQDGVEEEVFEQEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRK
440 450 460 470 480 490
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 RSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 RSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKAT
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pF1KA1 QQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 QQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWA
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550 560 570 580 590 600
pF1KA1 LNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVK
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pF1KA1 ETVQTTQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFPVSMPVPPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ETVQTTQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFPVSMPVPPPG
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pF1KA1 FSPIPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSLSMTPETVKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 FSPIPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSLSMTPETVKD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 VGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSGENTRSVIP
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pF1KA1 NDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQPPNIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 NDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQPPNIL
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:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 NNSGILGIQPPSVSNSSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQNLP
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pF1KA1 PLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 PLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGP
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pF1KA1 FPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 FPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISR
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pF1KA1 PPPVDVRDVVGRPIDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 PPPVDVRDVVGRPIDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNP
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pF1KA1 EKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 EKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDF
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pF1KA1 DDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 DDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGD
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pF1KA1 NVPQVNGENTERHAQPPPIPVQNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESEPVVESTETE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 NVPQVNGENTERHAQPPPIPVQNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESEPVVESTETE
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1270
pF1KA1 GT
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CCDS69 GT
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:::::::::::::::::: .::::.::::.:: .::: :: ::..:::::::::::::::
CCDS54 PGLYVIDSIVRQSRHQFGTDKDVFGPRFSKNITATFQYLYLCPSEDKSKIVRVLNLWQKN
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: : ..: :: .: : . : :. . ..: :. . .
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: :: . ::.:. .: ...::: ::::..::::: : ::. .:: :::::::.
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:.:.: :: :.::: ::.:.::..:::: .. .: :::::::::::.::..::::...:.
CCDS54 RRRHSPRSRSQERRDREKERERRQKGLPQVKPETASVCSTTLWVGQLDKRTTQQDVASLL
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pF1KA1 EEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWALNKGVKTE
:::: ::::::::::::::. :::::::.::::::: :.::...: ::::::::::.:..
CCDS54 EEFGPIESINMIPPRGCAYIVMVHRQDAYRALQKLSRGNYKVNQKSIKIAWALNKGIKAD
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pF1KA1 YKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQT---
:::.:::.::::::::.::: ..::.: ::::.:..:.: .:. . . .: .:..:.
CCDS54 YKQYWDVELGVTYIPWDKVKPEELESFCEGGMLDSDTLNPDWKGIPK-KPENEVAQNGGA
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:. .:. : : . : :... :.: :. :.: .: :::: . .:
CCDS54 ETSHTEPVSPIPKPLPVPVPPIPVPAPITVPPPQVPPHQPGPPVVGALQPPAFTPPLGIP
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::::.: ::::::: .::: . ::::.:: :::..:: .::: . : :. . .
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.. .. .:.::...:. : .: .. .:: ..: .. .
CCDS54 IAGINEDTTKDLSIGN-----------------PIPTVVSGARGNAESGDSV-KMYGSAV
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. : : ... ...:: : .. . ..:.: :... .::.::
CCDS54 PPAAPTNLPTP-PVTQPVSLLGTQG---VAPGPVIGLQAPSTG----LLGARP-------
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:.: : :: :. :: .. . ..:: : .. :: :. :: .
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. :: : .. .:: . : : :: : :: : .: : . : :: ::
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: .. .::: :: . .::.. : .::. .. . :. : .:: ..
CCDS54 PQQPQQQQQQQPPPSQQPPPTQ--QQPQQ-FRNDNRQQFNSGRDQERFGRRSFGNRVEND
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.. :.: : . :: : : : ::. : . : . : :.::. .:
CCDS54 RERYGNRNDDRDNSNRDRREWGRRSPDRDRHRDLEER--NRRSSGHRDRERDSRDRESR-
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::. : .. :. : : : : .. :. :
CCDS54 ----REKEEARGKEKPEVTDRAGGNKTVEPPISQVGNVDTASELEKGVSEAAVLKPSEEL
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pF1KA1 RFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRD
CCDS54 PAEATSSVEPEKDSGSAAEAPR
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CCDS33 PGLYVIDSIVRQSRHQFGTDKDVFGPRFSKNITATFQYLYLCPSEDKSKIVRVLNLWQKN
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.::: :::::::::::: ..:: : ..: ..: :: :. .:. :. :
CCDS33 GVFKIEIIQPLLDMAAGTSN--AAPV-AENVTNNEGSPPPPVK-VSSEPPTQATPNSVPA
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CCDS33 VPQLPSSDAFAAVAQLFQTTQGQQLQQILQTFQ-QPPKPQSP---ALDNAVMAQVQAITA
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pF1KA1 QL----TAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKE------------
:: : . .. : :: ..:.:::.::::. .. : :: :::
CCDS33 QLKTTPTQPSEQKAAFPPPEQKTAFDKKLLDRFDYDDEPEAVEESKKEDTTAVTTTAPAA
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.: . . : .. . : .. .:: ::..... ... ::.:
CCDS33 AVPPAPTATVPAAAAPAAASPPPPQAPFGFPGDGMQQPAYTQHQNMDQFQPRMMGIQQDP
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: : ..: :: .: : . : :. . ..: :. . .
CCDS33 MHHQVPLPPNGQMPGFGLL--PTPPFPPMAQPVIPPTPPVQQPFQASFQAQNEPLTQKPH
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390 400 410 420 430
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: :: . ::.:. .: ...::: ::::..::::: : ::. .:: :::::::.
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:.:.: :: :.::: ::.:.::..:::: .. .: :::::::::::.::..::::...:.
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:::: ::::::::::::::. :::::::.::::::: :.::...: ::::::::::.:..
CCDS33 EEFGPIESINMIPPRGCAYIVMVHRQDAYRALQKLSRGNYKVNQKSIKIAWALNKGIKAD
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:::.:::.::::::::.::: ..::.: ::::.:..:.: .:. . . .: .:..:.
CCDS33 YKQYWDVELGVTYIPWDKVKPEELESFCEGGMLDSDTLNPDWKGIPK-KPENEVAQNGGA
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pF1KA1 ----TQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAML--QIPV-APAVPTV-SLVPPAFPVSMPVP
:. .:. : : . : :... :.: :. :.: .: :::: . .:
CCDS33 ETSHTEPVSPIPKPLPVPVPPIPVPAPITVPPPQVPPHQPGPPVVGALQPPAFTPPLGIP
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pF1KA1 PPGFSP-----IPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPP--VVPTSLVQPS
::::.: ::::::: .::: . ::::.:: :::..:: .::: . : :. . .
CCDS33 PPGFGPGVPPPPPPPPFLRPGFNPMHLPPGFLPPGPPPPITPPVSIPPPHTPPISIPNST
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720 730 740 750 760 770
pF1KA1 LS-MTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQI
.. .. .:.::...:. : .: .. .:: ..: .. .
CCDS33 IAGINEDTTKDLSIGN-----------------PIPTVVSGARGNAESGDSV-KMYGSAV
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780 790 800 810 820 830
pF1KA1 SSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSS
. : : ... ...:: : .. . ..:.: :... .::.::
CCDS33 PPAAPTNLPTP-PVTQPVSLLGTQG---VAPGPVIGLQAPSTG----LLGARP-------
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840 850 860 870 880 890
pF1KA1 GIIAAQ-PPNILNNSGILGIQPPSVSNNSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLL
:.: : :: :. :: .. . ..:: : .. :: :. :: .
CCDS33 GLIPLQRPP---------GMPPPHLQR----FPLMPPR-PMPPHMMHRGPP--PG-PGGF
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. :: : .. .:: . : : :: : :: : .: : . : :: ::
CCDS33 AMPPPHGMKGPFPPHG-PFVRPGGMPGLG-GPGPGPGGPEDRDGRQQPPQQPQQQPQPQA
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pF1KA1 PPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEK--RIPLGN---DN
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CCDS33 PQQPQQQQQQQPPPSQQPPPTQ--QQPQQ-FRNDNRQQFNSGRDQERFGRRSFGNRVEND
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CCDS33 RERYGNRNDDRDNSNRDRREWGRRSPDRDRHRDLEER--NRRSSGHRDRERDSRDRESR-
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::. : .. :. : : : : .. :. :
CCDS33 ----REKEEARGKEKPEVTDRAGGNKTVEPPISQVGNVDTASELEKGVSEAAVLKPSEEL
1070 1080 1090 1100 1110 1120
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pF1KA1 RFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRD
CCDS33 PAEATSSVEPEKDSGSAAEAPR
1130 1140
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]