Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA1101
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1101, 527 aa
1>>>pF1KA1101 527 - 527 aa - 527 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5943+/-0.00116; mu= 3.4429+/- 0.068
mean_var=247.5485+/-54.325, 0's: 0 Z-trim(109.4): 714 B-trim: 5 in 2/52
Lambda= 0.081516
statistics sampled from 10055 (10873) to 10055 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.682), E-opt: 0.2 (0.334), width: 16
Scan time: 3.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2675.1 OXSR1 gene_id:9943|Hs108|chr3 ( 527) 3426 416.7 3.4e-116
CCDS42770.1 STK39 gene_id:27347|Hs108|chr2 ( 545) 2081 258.5 1.4e-68
CCDS7148.1 MYO3A gene_id:53904|Hs108|chr10 (1616) 653 91.0 1.1e-17
CCDS58707.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 ( 873) 615 86.3 1.6e-16
CCDS1803.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 ( 894) 615 86.3 1.6e-16
CCDS34290.1 STK10 gene_id:6793|Hs108|chr5 ( 968) 612 86.0 2.2e-16
CCDS46446.1 MYO3B gene_id:140469|Hs108|chr2 (1314) 602 85.0 6e-16
CCDS42773.1 MYO3B gene_id:140469|Hs108|chr2 (1341) 602 85.0 6.1e-16
CCDS76334.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10 (1204) 598 84.4 7.9e-16
CCDS7553.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10 (1235) 598 84.5 8e-16
CCDS81582.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11 ( 812) 592 83.6 9.7e-16
CCDS8082.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11 ( 820) 592 83.6 9.8e-16
CCDS13341.1 STK4 gene_id:6789|Hs108|chr20 ( 487) 575 81.3 2.7e-15
CCDS47900.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 491) 565 80.2 6.2e-15
CCDS59108.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 519) 565 80.2 6.4e-15
CCDS42564.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19 ( 821) 559 79.7 1.4e-14
CCDS59385.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19 ( 833) 559 79.7 1.5e-14
CCDS45589.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17 (1303) 554 79.3 3e-14
CCDS45590.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17 (1312) 554 79.3 3e-14
CCDS45588.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17 (1332) 554 79.3 3e-14
CCDS54673.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1268) 543 78.0 7.2e-14
CCDS54674.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1276) 543 78.0 7.2e-14
CCDS54677.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1297) 543 78.0 7.3e-14
CCDS54678.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1305) 543 78.0 7.4e-14
CCDS54675.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1323) 543 78.0 7.4e-14
CCDS54676.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1331) 543 78.0 7.5e-14
CCDS54679.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1352) 543 78.0 7.5e-14
CCDS46956.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1360) 543 78.0 7.6e-14
CCDS82487.1 MAP4K4 gene_id:9448|Hs108|chr2 (1165) 536 77.1 1.2e-13
CCDS56130.1 MAP4K4 gene_id:9448|Hs108|chr2 (1239) 536 77.2 1.3e-13
CCDS74546.1 MAP4K4 gene_id:9448|Hs108|chr2 (1273) 536 77.2 1.3e-13
CCDS66573.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 412) 503 72.8 8.6e-13
CCDS63199.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2 ( 332) 501 72.5 8.7e-13
CCDS32001.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 431) 503 72.8 8.8e-13
CCDS63200.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2 ( 349) 501 72.5 9e-13
CCDS9488.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 443) 503 72.8 9e-13
CCDS11642.1 STRADA gene_id:92335|Hs108|chr17 ( 348) 491 71.3 2e-12
CCDS42367.1 STRADA gene_id:92335|Hs108|chr17 ( 373) 491 71.4 2.1e-12
CCDS32703.1 STRADA gene_id:92335|Hs108|chr17 ( 431) 491 71.4 2.3e-12
CCDS48168.1 STK26 gene_id:51765|Hs108|chrX ( 339) 482 70.3 4.1e-12
CCDS14631.1 STK26 gene_id:51765|Hs108|chrX ( 416) 482 70.3 4.8e-12
CCDS58585.1 STRADA gene_id:92335|Hs108|chr17 ( 314) 478 69.7 5.4e-12
CCDS65305.1 NRK gene_id:203447|Hs108|chrX (1582) 475 70.1 2.2e-11
CCDS54156.1 STRADA gene_id:92335|Hs108|chr17 ( 299) 456 67.1 3.2e-11
CCDS33293.1 MAP3K19 gene_id:80122|Hs108|chr2 ( 510) 459 67.7 3.6e-11
CCDS11162.1 MAP2K4 gene_id:6416|Hs108|chr17 ( 399) 451 66.7 5.8e-11
CCDS62095.1 MAP2K4 gene_id:6416|Hs108|chr17 ( 410) 451 66.7 5.9e-11
CCDS63020.1 MAP3K19 gene_id:80122|Hs108|chr2 (1215) 459 68.1 6.6e-11
CCDS2176.2 MAP3K19 gene_id:80122|Hs108|chr2 (1328) 459 68.1 7e-11
>>CCDS2675.1 OXSR1 gene_id:9943|Hs108|chr3 (527 aa)
initn: 3426 init1: 3426 opt: 3426 Z-score: 2199.6 bits: 416.7 E(32554): 3.4e-116
Smith-Waterman score: 3426; 100.0% identity (100.0% similar) in 527 aa overlap (1-527:1-527)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSEDSSALPWSINRDDYELQEVIGSGATAVVQAAYCAPKKEKVAIKRINLEKCQTSMDEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 MSEDSSALPWSINRDDYELQEVIGSGATAVVQAAYCAPKKEKVAIKRINLEKCQTSMDEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 LKEIQAMSQCHHPNIVSYYTSFVVKDELWLVMKLLSGGSVLDIIKHIVAKGEHKSGVLDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 LKEIQAMSQCHHPNIVSYYTSFVVKDELWLVMKLLSGGSVLDIIKHIVAKGEHKSGVLDE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 STIATILREVLEGLEYLHKNGQIHRDVKAGNILLGEDGSVQIADFGVSAFLATGGDITRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 STIATILREVLEGLEYLHKNGQIHRDVKAGNILLGEDGSVQIADFGVSAFLATGGDITRN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 KVRKTFVGTPCWMAPEVMEQVRGYDFKADIWSFGITAIELATGAAPYHKYPPMKVLMLTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 KVRKTFVGTPCWMAPEVMEQVRGYDFKADIWSFGITAIELATGAAPYHKYPPMKVLMLTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 QNDPPSLETGVQDKEMLKKYGKSFRKMISLCLQKDPEKRPTAAELLRHKFFQKAKNKEFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 QNDPPSLETGVQDKEMLKKYGKSFRKMISLCLQKDPEKRPTAAELLRHKFFQKAKNKEFL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 QEKTLQRAPTISERAKKVRRVPGSSGRLHKTEDGGWEWSDDEFDEESEEGKAAISQLRSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 QEKTLQRAPTISERAKKVRRVPGSSGRLHKTEDGGWEWSDDEFDEESEEGKAAISQLRSP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 RVKESISNSELFPTTDPVGTLLQVPEQISAHLPQPAGQIATQPTQVSLPPTAEPAKTAQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 RVKESISNSELFPTTDPVGTLLQVPEQISAHLPQPAGQIATQPTQVSLPPTAEPAKTAQA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 LSSGSGSQETKIPISLVLRLRNSKKELNDIRFEFTPGRDTAEGVSQELISAGLVDGRDLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 LSSGSGSQETKIPISLVLRLRNSKKELNDIRFEFTPGRDTAEGVSQELISAGLVDGRDLV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KA1 IVAANLQKIVEEPQSNRSVTFKLASGVEGSDIPDDGKLIGFAQLSIS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 IVAANLQKIVEEPQSNRSVTFKLASGVEGSDIPDDGKLIGFAQLSIS
490 500 510 520
>>CCDS42770.1 STK39 gene_id:27347|Hs108|chr2 (545 aa)
initn: 2537 init1: 2076 opt: 2081 Z-score: 1344.6 bits: 258.5 E(32554): 1.4e-68
Smith-Waterman score: 2520; 74.6% identity (88.2% similar) in 524 aa overlap (5-527:51-545)
10 20 30
pF1KA1 MSEDSSALPWSINRDDYELQEVIGSGATAVVQAA
..:. : : :: ::::::::::::::::::
CCDS42 TAAAAAAPAAATAAPAPAAPAAPAPAPAPAAQAVGWPICRDAYELQEVIGSGATAVVQAA
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 YCAPKKEKVAIKRINLEKCQTSMDELLKEIQAMSQCHHPNIVSYYTSFVVKDELWLVMKL
: :..:.:::::::::::::::::::::::::::: :::.:.:::::::::::::::::
CCDS42 LCKPRQERVAIKRINLEKCQTSMDELLKEIQAMSQCSHPNVVTYYTSFVVKDELWLVMKL
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 LSGGSVLDIIKHIVAKGEHKSGVLDESTIATILREVLEGLEYLHKNGQIHRDVKAGNILL
:::::.:::::.:: .::::.:::.:. :::::.::::::.:::.:::::::.:::::::
CCDS42 LSGGSMLDIIKYIVNRGEHKNGVLEEAIIATILKEVLEGLDYLHRNGQIHRDLKAGNILL
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 GEDGSVQIADFGVSAFLATGGDITRNKVRKTFVGTPCWMAPEVMEQVRGYDFKADIWSFG
::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS42 GEDGSVQIADFGVSAFLATGGDVTRNKVRKTFVGTPCWMAPEVMEQVRGYDFKADMWSFG
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 ITAIELATGAAPYHKYPPMKVLMLTLQNDPPSLETGVQDKEMLKKYGKSFRKMISLCLQK
:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::::.:::::::::..::::::
CCDS42 ITAIELATGAAPYHKYPPMKVLMLTLQNDPPTLETGVEDKEMMKKYGKSFRKLLSLCLQK
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 DPEKRPTAAELLRHKFFQKAKNKEFLQEKTLQRAPTISERAKKVRRVPGSSGRLHKTEDG
:: :::::::::. ::::::::.:.: :: : :.: :..:::::::::::::.:::::::
CCDS42 DPSKRPTAAELLKCKFFQKAKNREYLIEKLLTRTPDIAQRAKKVRRVPGSSGHLHKTEDG
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 GWEWSDDEFDEESEEGKAAISQLRSPRVKESISNSELFPTTDPVGTLLQVPEQISAHLPQ
:::::::.::.:::::::.:: .: :::: : :. ... . ::::..
CCDS42 DWEWSDDEMDEKSEEGKAAFSQEKSRRVKE--ENPEIAVSASTI------PEQIQS----
390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 PAGQIATQPTQVSLPPTA-EPAKTAQALSSGSGSQETKIPISLVLRLRNSKKELNDIRFE
.... .: ::.: : . :.. . ..::::::::.:::::::::
CCDS42 ----LSVHDSQG--PPNANEDYREASSCA-----------VNLVLRLRNSRKELNDIRFE
430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 FTPGRDTAEGVSQELISAGLVDGRDLVIVAANLQKIVEEPQSNRSVTFKLASGVEGSDIP
::::::::.::::::.:::::::.:.:::::::::::..:.. ...::::::: .::.::
CCDS42 FTPGRDTADGVSQELFSAGLVDGHDVVIVAANLQKIVDDPKALKTLTFKLASGCDGSEIP
480 490 500 510 520 530
520
pF1KA1 DDGKLIGFAQLSIS
:. :::::::::.:
CCDS42 DEVKLIGFAQLSVS
540
>>CCDS7148.1 MYO3A gene_id:53904|Hs108|chr10 (1616 aa)
initn: 585 init1: 184 opt: 653 Z-score: 431.0 bits: 91.0 E(32554): 1.1e-17
Smith-Waterman score: 653; 38.6% identity (66.0% similar) in 332 aa overlap (15-330:19-331)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MSEDSSALPWSINRDDYELQEVIGSGATAVVQAAYCAPKKEKVAIKRIN-LEKCQT
: .:. :.::.:. . : . . .:.:.: .. .. .
CCDS71 MFPLIGKTIIFDNFPDPSDTWEITETIGKGTYGKVFKVLNKKNGQKAAVKILDPIHDIDE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 SMDELLKEIQAMSQCHHPNIVSYYTSFVVKDE-----LWLVMKLLSGGSVLDIIKHIVAK
.. . ..:.:. :::.: .: . ::. ::::..: ::::: :..: .. .
CCDS71 EIEAEYNILKALSD--HPNVVRFYGIYFKKDKVNGDKLWLVLELCSGGSVTDLVKGFLKR
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 GEHKSGVLDESTIATILREVLEGLEYLHKNGQIHRDVKAGNILLGEDGSVQIADFGVSAF
::. ..: :: ::.:.: ::..::.: ::::::..:::: .:.:...::::::
CCDS71 GER----MSEPLIAYILHEALMGLQHLHNNKTIHRDVKGNNILLTTEGGVKLVDFGVSAQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KA1 LATGGDITRNKVRKTFVGTPCWMAPEVM--EQV--RGYDFKADIWSFGITAIELATGAAP
:.. ::.. :.: :::: ::::::. :: :: . : ::.:::::::. : :
CCDS71 LTS----TRHR-RNTSVGTPFWMAPEVIACEQQLDTTYDARCDTWSLGITAIELGDGDPP
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 YHKYPPMKVLMLTLQNDPPSLETGVQDKEMLKKYGKSFRKMISLCLQKDPEKRPTAAELL
::..:. .: ::.: .. :. .. : .:: :: :: :::::..:::
CCDS71 LADLHPMRALFKIPRNPPPKL----RQPEL---WSAEFNDFISKCLTKDYEKRPTVSELL
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 RHKFFQKAKNKEFLQEKTLQRAPTI------SERAKKVRRVPGSSGRLHKTEDGGWEWSD
.:::. . ..:. . .: : . : .:.:.. .:. ..: ...
CCDS71 QHKFITQIEGKDVMLQKQLTEFIGIHQCMGGTEKARR-ERIHTKKGNFNRPLISNLKDVD
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 DEFDEESEEGKAAISQLRSPRVKESISNSELFPTTDPVGTLLQVPEQISAHLPQPAGQIA
CCDS71 DLATLEILDENTVSEQLEKCYSRDQIYVYVGDILIALNPFQSLGLYSTKHSKLYIGSKRT
350 360 370 380 390 400
>>CCDS58707.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 (873 aa)
initn: 692 init1: 215 opt: 615 Z-score: 410.3 bits: 86.3 E(32554): 1.6e-16
Smith-Waterman score: 669; 42.3% identity (70.1% similar) in 281 aa overlap (14-290:13-272)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSEDSSALPWSINRDDYELQEVIGSGATAVVQAAYCAPKKEKVAIKRINLEKCQTSMDEL
..:.:: . ::::. . : : . : .::: :.:: . .. .
CCDS58 MNPGFDLSRRNPQEDFELIQRIGSGTYGDVYKARNVNTGELAAIKVIKLEPGE-DFAVV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 LKEIQAMSQCHHPNIVSYYTSFVVKDELWLVMKLLSGGSVLDIIKHIVAKGEHKSGVLDE
.:: :..:.:::::.:. :.. .:.::. :.. .:::. :: : .: :.:
CCDS58 QQEIIMMKDCKHPNIVAYFGSYLRRDKLWICMEFCGGGSLQDIY--------HVTGPLSE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 STIATILREVLEGLEYLHKNGQIHRDVKAGNILLGEDGSVQIADFGVSAFLATGGDITRN
:: . ::.:.:: :::..:..:::.:..:::: ..: :..::::::: .. . :..
CCDS58 LQIAYVSRETLQGLYYLHSKGKMHRDIKGANILLTDNGHVKLADFGVSAQIT--ATIAK-
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KA1 KVRKTFVGTPCWMAPEV--MEQVRGYDFKADIWSFGITAIELATGAAPYHKYPPMKVLML
::.:.::: :::::: .:. ::. :.:. :::::::: :. ::..:.:
CCDS58 --RKSFIGTPYWMAPEVAAVERKGGYNQLCDLWAVGITAIELAELQPPMFDLHPMRALFL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 TLQND--PPSLETGVQDKEMLKKYGKSFRKMISLCLQKDPEKRPTAAELLRHKFFQKAKN
... ::.: .:: :...::...... : :.:.::::: .::.: :
CCDS58 MTKSNFQPPKL----KDKM---KWSNSFHHFVKMALTKNPKKRPTAEKLLQHPFVTQHLT
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 KEFLQEKTLQRAPTISERAKKVRRVPGSSGRLHKTEDGGWEWSDDEFDEESEEGKAAISQ
CCDS58 RSLAIELLDKVNNPDHSTYHDFDDDDPEPLVAVPHRIHSTSRNVREEKTRSEITFGQVKF
280 290 300 310 320 330
>>CCDS1803.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 (894 aa)
initn: 692 init1: 215 opt: 615 Z-score: 410.1 bits: 86.3 E(32554): 1.6e-16
Smith-Waterman score: 669; 42.3% identity (70.1% similar) in 281 aa overlap (14-290:13-272)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSEDSSALPWSINRDDYELQEVIGSGATAVVQAAYCAPKKEKVAIKRINLEKCQTSMDEL
..:.:: . ::::. . : : . : .::: :.:: . .. .
CCDS18 MNPGFDLSRRNPQEDFELIQRIGSGTYGDVYKARNVNTGELAAIKVIKLEPGE-DFAVV
10 20 30 40 50
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... ::.: .:: :...::...... : :.:.::::: .::.: :
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. . .. .::
CCDS34 AANRSQKASQSRPNSSALETLGGEKLANGSLEPPAQAAPGPSKRDSDCSSLCTSESMDYG
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:
CCDS76 DTILQTVDLVSQETGEKEANIQAVDSEVGLTKEDTQEKLGEDDKTQKDVISNTSDVIGTC
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pF1KA1 MSEDSSALPWSINRDDYELQEVIGSGATAVVQAAYCAPKKEK--
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CCDS75 MSFFNFRKIFKLGSEKKKKQYEHVKRDLNPEDF--WEIIGELGDGAFGKVYKAQNKETSV
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CCDS75 LAAAKVIDTKSEEELEDYMVEIDILASCDHPNIVKLLDAFYYENNLWILIEFCAGGAVDA
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CCDS75 VMLEL----ERP---LTESQIQVVCKQTLDALNYLHDNKIIHRDLKAGNILFTLDGDIKL
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CCDS75 EMAEIEPPHHELNPMRVLLKIAKSEPPTL---AQP----SRWSSNFKDFLKKCLEKNVDA
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CCDS75 RWTTSQLLQHPFVTVDSNKP-IRELIAEAKAEVTE----------------EVEDGKEE-
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CCDS75 --DE--EEETENSLPIPASKRASSDLSIASSE----EDKLSQNACILESVSEKTERSNSE
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pF1KA1 IATQPTQVSLPPTA-EPAKTAQALSSGSGSQETKIPISLVLRLRNSKKELNDIR--FEFT
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CCDS75 DKLNSKILNEKPTTDEPEKAVEDINEHITDAQLEAMTELHDRTAVIKENEREKRPKLENL
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: . : :. . .: : .. .. . .:.. : :: ..... : :: .. : .
CCDS75 PDTEDQETVDINSVSEGK-ENNIMITLETNIEHNLKSEEEKDQEKQQMFENKLIKSEEIK
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pF1KA1 DIPDDGKLIGFAQLSIS
:
CCDS75 DTILQTVDLVSQETGEKEANIQAVDSEVGLTKEDTQEKLGEDDKTQKDVISNTSDVIGTC
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]