Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA0996
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0996, 848 aa
1>>>pF1KA0996 848 - 848 aa - 848 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9142+/- 0.001; mu= -0.0585+/- 0.060
mean_var=235.0653+/-49.893, 0's: 0 Z-trim(111.8): 48 B-trim: 98 in 1/50
Lambda= 0.083653
statistics sampled from 12610 (12644) to 12610 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.72), E-opt: 0.2 (0.388), width: 16
Scan time: 3.780
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9477.1 DZIP1 gene_id:22873|Hs108|chr13 ( 848) 5569 685.7 9e-197
CCDS9478.1 DZIP1 gene_id:22873|Hs108|chr13 ( 867) 3029 379.2 1.7e-104
CCDS54645.1 DZIP1L gene_id:199221|Hs108|chr3 ( 539) 964 129.8 1.2e-29
CCDS3096.1 DZIP1L gene_id:199221|Hs108|chr3 ( 767) 964 129.9 1.7e-29
>>CCDS9477.1 DZIP1 gene_id:22873|Hs108|chr13 (848 aa)
initn: 5569 init1: 5569 opt: 5569 Z-score: 3646.1 bits: 685.7 E(32554): 9e-197
Smith-Waterman score: 5569; 100.0% identity (100.0% similar) in 848 aa overlap (1-848:1-848)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MQAEAADWFSSMPFQKHVYYPLASGPEGPDVAVAAAAAGAASMACAPPSAASGPLPFFQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MQAEAADWFSSMPFQKHVYYPLASGPEGPDVAVAAAAAGAASMACAPPSAASGPLPFFQF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 RPRLESVDWRRLSAIDVDKVAGAVDVLTLQENIMNITFCKLEDEKCPHCQSGVDPVLLKL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 IRLAQFTIEYLLHSQEFLTSQLHTLEERLRLSHCDGEQSKKLLTKQAGEIKTLKEECKRR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 KKMISTQQLMIEAKANYYQCHFCDKAFMNQAFLQSHIQRRHTEENSHFEYQKNAQIEKLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 KKMISTQQLMIEAKANYYQCHFCDKAFMNQAFLQSHIQRRHTEENSHFEYQKNAQIEKLR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SEIVVLKEELQLTRSELEAAHHASAVRFSKEYEMQKTKEEDFLKLFDRWKEEEKEKLVDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 SEIVVLKEELQLTRSELEAAHHASAVRFSKEYEMQKTKEEDFLKLFDRWKEEEKEKLVDE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MEKVKEMFMKEFKELTSKNSALEYQLSEIQKSNMQIKSNIGTLKDAHEFKEDRSPYPQDF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 HNVMQLLDSQESKWTARVQAIHQEHKKEKGRLLSHIEKLRTSMIDDLNASNVFYKKRIEE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 LGQRLQEQNELIITQRQQIKDFTCNPLNSISEPKVNAPALHTLETKSSLPMVHEQAFSSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 LGQRLQEQNELIITQRQQIKDFTCNPLNSISEPKVNAPALHTLETKSSLPMVHEQAFSSH
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490 500 510 520 530 540
pF1KA0 ILEPIEELSEEEKGRENEQKLNNNKMHLRKALKSNSSLTKGLRTMVEQNLMEKLETLGIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 ILEPIEELSEEEKGRENEQKLNNNKMHLRKALKSNSSLTKGLRTMVEQNLMEKLETLGIN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 ADIRGISSDQLHRVLKSVESERHKQEREIPNFHQIREFLEHQVSCKIEEKALLSSDQCSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 ADIRGISSDQLHRVLKSVESERHKQEREIPNFHQIREFLEHQVSCKIEEKALLSSDQCSV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 SQMDTLSTGEVPKMIQLPSKNRQLIRQKAVSTDRTSVPKIKKNVMEDPFPRKSSTITTPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 SQMDTLSTGEVPKMIQLPSKNRQLIRQKAVSTDRTSVPKIKKNVMEDPFPRKSSTITTPP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 FSSEEEQEDDDLIRAYASPGPLPVPPPQNKGSFGKNTVKSDADGTEGSEIEDTDDSPKPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 FSSEEEQEDDDLIRAYASPGPLPVPPPQNKGSFGKNTVKSDADGTEGSEIEDTDDSPKPA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 GVAVKTPTEKVEKMFPHRKNVNKPVGGTNVPEMFIKKEELQELKCADVEDEDWDISSLEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 GVAVKTPTEKVEKMFPHRKNVNKPVGGTNVPEMFIKKEELQELKCADVEDEDWDISSLEE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 EISLGKKSGKEQKEPPPAKNEPHFAHVLNAWGAFNPKGPKGEGLQENESSTLKSSLVTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 EISLGKKSGKEQKEPPPAKNEPHFAHVLNAWGAFNPKGPKGEGLQENESSTLKSSLVTVT
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 DWSDTSDV
::::::::
CCDS94 DWSDTSDV
>>CCDS9478.1 DZIP1 gene_id:22873|Hs108|chr13 (867 aa)
initn: 3026 init1: 3026 opt: 3029 Z-score: 1989.3 bits: 379.2 E(32554): 1.7e-104
Smith-Waterman score: 5517; 97.7% identity (97.8% similar) in 867 aa overlap (1-848:1-867)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MQAEAADWFSSMPFQKHVYYPLASGPEGPDVAVAAAAAGAASMACAPPSAASGPLPFFQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MQAEAADWFSSMPFQKHVYYPLASGPEGPDVAVAAAAAGAASMACAPPSAASGPLPFFQF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 RPRLESVDWRRLSAIDVDKVAGAVDVLTLQENIMNITFCKLEDEKCPHCQSGVDPVLLKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 RPRLESVDWRRLSAIDVDKVAGAVDVLTLQENIMNITFCKLEDEKCPHCQSGVDPVLLKL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 IRLAQFTIEYLLHSQEFLTSQLHTLEERLRLSHCDGEQSKKLLTKQAGEIKTLKEECKRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 IRLAQFTIEYLLHSQEFLTSQLHTLEERLRLSHCDGEQSKKLLTKQAGEIKTLKEECKRR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 KKMISTQQLMIEAKANYYQCHFCDKAFMNQAFLQSHIQRRHTEENSHFEYQKNAQIEKLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 KKMISTQQLMIEAKANYYQCHFCDKAFMNQAFLQSHIQRRHTEENSHFEYQKNAQIEKLR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SEIVVLKEELQLTRSELEAAHHASAVRFSKEYEMQKTKEEDFLKLFDRWKEEEKEKLVDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 SEIVVLKEELQLTRSELEAAHHASAVRFSKEYEMQKTKEEDFLKLFDRWKEEEKEKLVDE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 MEKVKEMFMKEFKELTSKNSALEYQLSEIQKSNMQIKSNIGTLKDAHEFKEDRSPYPQDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MEKVKEMFMKEFKELTSKNSALEYQLSEIQKSNMQIKSNIGTLKDAHEFKEDRSPYPQDF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 HNVMQLLDSQESKWTARVQAIHQEHKKEKGRLLSHIEKLRTSMIDDLNASNVFYKKRIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 HNVMQLLDSQESKWTARVQAIHQEHKKEKGRLLSHIEKLRTSMIDDLNASNVFYKKRIEE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KA0 LGQRLQEQNELIITQRQQIKDFTCNPLNSISEPK-------------------VNAPALH
:::::::::::::::::::::::::::::::::: .::::::
CCDS94 LGQRLQEQNELIITQRQQIKDFTCNPLNSISEPKGNPLAWQAFESQPAAPAVPMNAPALH
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 TLETKSSLPMVHEQAFSSHILEPIEELSEEEKGRENEQKLNNNKMHLRKALKSNSSLTKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 TLETKSSLPMVHEQAFSSHILEPIEELSEEEKGRENEQKLNNNKMHLRKALKSNSSLTKG
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 LRTMVEQNLMEKLETLGINADIRGISSDQLHRVLKSVESERHKQEREIPNFHQIREFLEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 LRTMVEQNLMEKLETLGINADIRGISSDQLHRVLKSVESERHKQEREIPNFHQIREFLEH
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 QVSCKIEEKALLSSDQCSVSQMDTLSTGEVPKMIQLPSKNRQLIRQKAVSTDRTSVPKIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 QVSCKIEEKALLSSDQCSVSQMDTLSTGEVPKMIQLPSKNRQLIRQKAVSTDRTSVPKIK
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 KNVMEDPFPRKSSTITTPPFSSEEEQEDDDLIRAYASPGPLPVPPPQNKGSFGKNTVKSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 KNVMEDPFPRKSSTITTPPFSSEEEQEDDDLIRAYASPGPLPVPPPQNKGSFGKNTVKSD
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 ADGTEGSEIEDTDDSPKPAGVAVKTPTEKVEKMFPHRKNVNKPVGGTNVPEMFIKKEELQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 ADGTEGSEIEDTDDSPKPAGVAVKTPTEKVEKMFPHRKNVNKPVGGTNVPEMFIKKEELQ
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 ELKCADVEDEDWDISSLEEEISLGKKSGKEQKEPPPAKNEPHFAHVLNAWGAFNPKGPKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 ELKCADVEDEDWDISSLEEEISLGKKSGKEQKEPPPAKNEPHFAHVLNAWGAFNPKGPKG
790 800 810 820 830 840
830 840
pF1KA0 EGLQENESSTLKSSLVTVTDWSDTSDV
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 EGLQENESSTLKSSLVTVTDWSDTSDV
850 860
>>CCDS54645.1 DZIP1L gene_id:199221|Hs108|chr3 (539 aa)
initn: 727 init1: 611 opt: 964 Z-score: 645.5 bits: 129.8 E(32554): 1.2e-29
Smith-Waterman score: 1067; 35.8% identity (67.4% similar) in 567 aa overlap (52-609:12-539)
30 40 50 60 70
pF1KA0 LASGPEGPDVAVAAAAAGAASMACAPPSAASGPL------PFFQFRPRLESVDWRRLSAI
:::: : :.:.:: .:.::::.:..
CCDS54 MQSPAATAEGLSGPLFGAYTFPTFKFQPRHDSMDWRRISTL
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 DVDKVAGAVDVLTLQENIMNITFCKLEDEKCPHCQSGVDPVLLKLIRLAQFTIEYLLHSQ
:::.:: .:: :::::: .::::.:. : : .: . :::.:::..::::. :::::: :
CCDS54 DVDRVARELDVATLQENIAGITFCNLDREVCSRCGQPVDPALLKVLRLAQLIIEYLLHCQ
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 EFLTSQLHTLEERLRLSHCDGEQSKKLLTKQAGEIKTLKEECKRRKKMIST-QQLMIEAK
. :.... :: ::. : . ..... : .:: :.: ..:: .::.::::: :::....
CCDS54 DCLSASVAQLEARLQTSLGQQQRGQQELGRQADELKGVREESRRRRKMISTLQQLLMQTG
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200 210 220 230 240 250
pF1KA0 AN-YYQCHFCDKAFMNQAFLQSHIQRRHTEENSHFEYQKNAQ-IEKLRSEIVVLKEELQL
.. :. ::.:::.::: .::..::::::. . .:. : .:.. : :. .:.
CCDS54 THSYHTCHLCDKTFMNATFLRGHIQRRHAGVAEGGKQKKQEQPVEEVLEE---LRAKLKW
170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 TRSELEAAHHASAVRFSKEYEMQKTKEEDFLKLFDRWKEEEKEKLVDEMEKVKEMFMKEF
:..:::: ..: : .: :. . .: . : ::.:::.: :: :..:.:..: ::
CCDS54 TQGELEAQREAERQRQLQEAELIHQREIEAKKEFDKWKEQEWTKLYGEIDKLKKLFWDEF
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 KELTSKNSALEYQLSEIQKSNMQIKSNIGTLKDAHEFKEDRSPYPQDFHNVMQLLDSQES
:.....::.:: .: .:. .. ..:..:.:.: : .:. .... . . . :..
CCDS54 KNVAKQNSTLEEKLRALQSHSV-MESKLGSLRD--EESEEWLRQARELQALREKTEIQKT
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 KWTARVQAIHQEHKKEKGRLLSHIEKLRTSMIDDLNASNVFYKKRIEELGQRLQEQNELI
.: .:. .:.:: :: .: . ..:..:. .: . . . . .: : .:::: ..:
CCDS54 EWKRKVKELHEEHMAEKKELQEENQRLQASLSQDQKKAAAQSQCQISTLRAQLQEQARII
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 ITQRQQIKDFTCNPLNSISEPKVNAPALHTLETKSSLPMVHEQAFSSHILEPIEELSEEE
.:...:. :.: ::.. .: ..: .: .. :: : ::
CCDS54 ASQEEMIQ--------SLSLRKVEG--IH------KVP----KAVDT------EEDSPEE
400 410 420
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 KGRENEQKLNNNKMHLRKALKSNSSLTKGLRTMVEQNLMEKLETLGINADIRGISSDQLH
. :. : ... .. ::. : .: : .: ..:..: ::::..:: : .::: . :.
CCDS54 E-MEDSQ---DEQHKVLAALRRNPTLLKHFRPILEDTLEEKLESMGIRKDAKGISIQTLR
430 440 450 460 470 480
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 RVLKSVESERHKQEREIPNFHQIREFLEHQVSCKIEEKALLSSDQCSVSQMDTLSTGEVP
.. . .. .:... :.. .: ..: : ..:. . .:. . . ::: : .:
CCDS54 HLESLLRVQREQKARKFSEFLSLRGKLVKEVTSRAKER---QENGAVVSQPDGQPSG
490 500 510 520 530
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 KMIQLPSKNRQLIRQKAVSTDRTSVPKIKKNVMEDPFPRKSSTITTPPFSSEEEQEDDDL
>>CCDS3096.1 DZIP1L gene_id:199221|Hs108|chr3 (767 aa)
initn: 800 init1: 611 opt: 964 Z-score: 643.2 bits: 129.9 E(32554): 1.7e-29
Smith-Waterman score: 1208; 34.3% identity (64.9% similar) in 767 aa overlap (52-780:12-729)
30 40 50 60 70
pF1KA0 LASGPEGPDVAVAAAAAGAASMACAPPSAASGPL------PFFQFRPRLESVDWRRLSAI
:::: : :.:.:: .:.::::.:..
CCDS30 MQSPAATAEGLSGPLFGAYTFPTFKFQPRHDSMDWRRISTL
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 DVDKVAGAVDVLTLQENIMNITFCKLEDEKCPHCQSGVDPVLLKLIRLAQFTIEYLLHSQ
:::.:: .:: :::::: .::::.:. : : .: . :::.:::..::::. :::::: :
CCDS30 DVDRVARELDVATLQENIAGITFCNLDREVCSRCGQPVDPALLKVLRLAQLIIEYLLHCQ
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 EFLTSQLHTLEERLRLSHCDGEQSKKLLTKQAGEIKTLKEECKRRKKMIST-QQLMIEAK
. :.... :: ::. : . ..... : .:: :.: ..:: .::.::::: :::....
CCDS30 DCLSASVAQLEARLQTSLGQQQRGQQELGRQADELKGVREESRRRRKMISTLQQLLMQTG
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 AN-YYQCHFCDKAFMNQAFLQSHIQRRHTEENSHFEYQKNAQ-IEKLRSEIVVLKEELQL
.. :. ::.:::.::: .::..::::::. . .:. : .:.. : :. .:.
CCDS30 THSYHTCHLCDKTFMNATFLRGHIQRRHAGVAEGGKQKKQEQPVEEVLEE---LRAKLKW
170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 TRSELEAAHHASAVRFSKEYEMQKTKEEDFLKLFDRWKEEEKEKLVDEMEKVKEMFMKEF
:..:::: ..: : .: :. . .: . : ::.:::.: :: :..:.:..: ::
CCDS30 TQGELEAQREAERQRQLQEAELIHQREIEAKKEFDKWKEQEWTKLYGEIDKLKKLFWDEF
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 KELTSKNSALEYQLSEIQKSNMQIKSNIGTLKDAHEFKEDRSPYPQDFHNVMQLLDSQES
:.....::.:: .: .:. .. ..:..:.:.: : .:. .... . . . :..
CCDS30 KNVAKQNSTLEEKLRALQSHSV-MESKLGSLRD--EESEEWLRQARELQALREKTEIQKT
280 290 300 310 320 330
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pF1KA0 KWTARVQAIHQEHKKEKGRLLSHIEKLRTSMIDDLNASNVFYKKRIEELGQRLQEQNELI
.: .:. .:.:: :: .: . ..:..:. .: . . . . .: : .:::: ..:
CCDS30 EWKRKVKELHEEHMAEKKELQEENQRLQASLSQDQKKAAAQSQCQISTLRAQLQEQARII
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 ITQRQQIKDFTCNPLNSISEPKVNAPALHTLETKSSLPMVHEQAFSSHILEPIEELSEEE
.:...:. :.: ::.. .: ..: .: .. :: : ::
CCDS30 ASQEEMIQ--------SLSLRKVEG--IH------KVP----KAVDT------EEDSPEE
400 410 420
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 KGRENEQKLNNNKMHLRKALKSNSSLTKGLRTMVEQNLMEKLETLGINADIRGISSDQLH
. :. : ... .. ::. : .: : .: ..:..: ::::..:: : .::: . :.
CCDS30 E-MEDSQ---DEQHKVLAALRRNPTLLKHFRPILEDTLEEKLESMGIRKDAKGISIQTLR
430 440 450 460 470 480
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pF1KA0 RVLKSVESERHKQEREIPNFHQIREFLEHQVSCKIEEK----ALLSSD--QCSV-SQMDT
.. . .. .:... :.. .: ..: : ..:. . .:. :..:. : :: ::..:
CCDS30 HLESLLRVQREQKARKFSEFLSLRGKLVKEVTSRAKERQENGAVVSQPDGQPSVKSQQST
490 500 510 520 530 540
610 620 630 640 650
pF1KA0 LSTGEV-PK----MIQLPSK-------NRQLIRQKAVSTDRTSVPKIKKNVMEDPF---P
: : :. :: .. ::: .:: ... : ..:.: . . .. : :
CCDS30 LVTREAQPKTRTLQVALPSTPAEPPPPTRQSHGSHGSSLTQVSAPAPRPG-LHGPSSTPP
550 560 570 580 590 600
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