Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA0925
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0925, 475 aa
1>>>pF1KA0925 475 - 475 aa - 475 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7511+/-0.00111; mu= 10.6341+/- 0.066
mean_var=111.6075+/-23.735, 0's: 0 Z-trim(105.4): 124 B-trim: 242 in 1/52
Lambda= 0.121402
statistics sampled from 8276 (8416) to 8276 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.626), E-opt: 0.2 (0.259), width: 16
Scan time: 2.180
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS53952.1 CORO2B gene_id:10391|Hs108|chr15 ( 475) 3229 577.0 1.5e-164
CCDS10229.2 CORO2B gene_id:10391|Hs108|chr15 ( 480) 3229 577.0 1.5e-164
CCDS6735.1 CORO2A gene_id:7464|Hs108|chr9 ( 525) 2039 368.6 9.1e-102
CCDS61236.1 CORO1C gene_id:23603|Hs108|chr12 ( 527) 1433 262.4 8.2e-70
CCDS9120.1 CORO1C gene_id:23603|Hs108|chr12 ( 474) 1429 261.7 1.2e-69
CCDS11252.2 CORO6 gene_id:84940|Hs108|chr17 ( 472) 1394 255.6 8.5e-68
CCDS8164.1 CORO1B gene_id:57175|Hs108|chr11 ( 489) 1385 254.0 2.6e-67
CCDS10673.1 CORO1A gene_id:11151|Hs108|chr16 ( 461) 1381 253.3 4e-67
CCDS55982.1 CORO7 gene_id:79585|Hs108|chr16 ( 840) 758 144.3 4.6e-34
CCDS58417.1 CORO7 gene_id:79585|Hs108|chr16 ( 907) 758 144.3 4.9e-34
CCDS10513.1 CORO7 gene_id:79585|Hs108|chr16 ( 925) 758 144.4 5e-34
CCDS58418.1 PAM16 gene_id:100529144|Hs108|chr16 (1048) 758 144.4 5.6e-34
>>CCDS53952.1 CORO2B gene_id:10391|Hs108|chr15 (475 aa)
initn: 3229 init1: 3229 opt: 3229 Z-score: 3067.6 bits: 577.0 E(32554): 1.5e-164
Smith-Waterman score: 3229; 100.0% identity (100.0% similar) in 475 aa overlap (1-475:1-475)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSWRPQYRSSKFRNVYGKVANREHCFDGIPITKNVHDNHFCAVNTRFLAIVTESAGGGSF
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CCDS53 MSWRPQYRSSKFRNVYGKVANREHCFDGIPITKNVHDNHFCAVNTRFLAIVTESAGGGSF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVLDIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEGGLKRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVLDIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEGGLKRN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 MTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNNILFSAGYDYKVLIWNLDVGEPVKMIDCHTDVILC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNNILFSAGYDYKVLIWNLDVGEPVKMIDCHTDVILC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 MSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIEPRSGRVLQEANCKNHRVNRVVFLGNMKRLLTTGVSRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIEPRSGRVLQEANCKNHRVNRVVFLGNMKRLLTTGVSRW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 NTRQIALWDQEDLSMPLIEEEIDGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYYEISTEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NTRQIALWDQEDLSMPLIEEEIDGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYYEISTEKP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 YLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPKHGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPISMIVPRRSDSYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPKHGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPISMIVPRRSDSYQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 EDIYPMTPGTEPALTPDEWLGGINRDPVLMSLKEGYKKSSKMVFKAPIKEKKSVVVNGID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EDIYPMTPGTEPALTPDEWLGGINRDPVLMSLKEGYKKSSKMVFKAPIKEKKSVVVNGID
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KA0 LLENVPPRTENELLRMFFRQQDEIRRLKEELAQKDIRIRQLQLELKNLRNSPKNC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LLENVPPRTENELLRMFFRQQDEIRRLKEELAQKDIRIRQLQLELKNLRNSPKNC
430 440 450 460 470
>>CCDS10229.2 CORO2B gene_id:10391|Hs108|chr15 (480 aa)
initn: 3229 init1: 3229 opt: 3229 Z-score: 3067.5 bits: 577.0 E(32554): 1.5e-164
Smith-Waterman score: 3229; 100.0% identity (100.0% similar) in 475 aa overlap (1-475:6-480)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MSWRPQYRSSKFRNVYGKVANREHCFDGIPITKNVHDNHFCAVNTRFLAIVTESA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MTVTKMSWRPQYRSSKFRNVYGKVANREHCFDGIPITKNVHDNHFCAVNTRFLAIVTESA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 GGGSFLVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVLDIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GGGSFLVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVLDIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 GLKRNMTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNNILFSAGYDYKVLIWNLDVGEPVKMIDCHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GLKRNMTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNNILFSAGYDYKVLIWNLDVGEPVKMIDCHT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 DVILCMSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIEPRSGRVLQEANCKNHRVNRVVFLGNMKRLLTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DVILCMSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIEPRSGRVLQEANCKNHRVNRVVFLGNMKRLLTT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 GVSRWNTRQIALWDQEDLSMPLIEEEIDGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYYEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GVSRWNTRQIALWDQEDLSMPLIEEEIDGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYYEI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 STEKPYLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPKHGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPISMIVPRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 STEKPYLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPKHGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPISMIVPRR
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 SDSYQEDIYPMTPGTEPALTPDEWLGGINRDPVLMSLKEGYKKSSKMVFKAPIKEKKSVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SDSYQEDIYPMTPGTEPALTPDEWLGGINRDPVLMSLKEGYKKSSKMVFKAPIKEKKSVV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 VNGIDLLENVPPRTENELLRMFFRQQDEIRRLKEELAQKDIRIRQLQLELKNLRNSPKNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VNGIDLLENVPPRTENELLRMFFRQQDEIRRLKEELAQKDIRIRQLQLELKNLRNSPKNC
430 440 450 460 470 480
>>CCDS6735.1 CORO2A gene_id:7464|Hs108|chr9 (525 aa)
initn: 2354 init1: 1181 opt: 2039 Z-score: 1940.5 bits: 368.6 E(32554): 9.1e-102
Smith-Waterman score: 2170; 61.1% identity (82.4% similar) in 512 aa overlap (1-462:1-512)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSWRPQYRSSKFRNVYGKVANREHCFDGIPITKNVHDNHFCAVNTRFLAIVTESAGGGSF
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CCDS67 MSWHPQYRSSKFRHVFGKPASKENCYDSVPITRSVHDNHFCAVNPHFIAVVTECAGGGAF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVLDIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEGGLKRN
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CCDS67 LVIPLHQTGKLDPHYPKVCGHRGNVLDVKWNPFDDFEIASCSEDATIKIWSIPKQLLTRN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KA0 MTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNNILFSAGYDYKVLIWNLDVGE-----PVKMIDCHT
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CCDS67 LTAYRKELVGHARRVGLVEWHPTAANILFSAGYDYKVMIWNLDTKESVITSPMSTISCHQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 DVILCMSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIEPRSGRVLQEANCKNHRVNRVVFLGNMKRLLTT
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CCDS67 DVILSMSFNTNGSLLATTCKDRKIRVIDPRAGTVLQEASYKGHRASKVLFLGNLKKLMST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 GVSRWNTRQIALWDQEDLSMPLIEEEIDGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYYEI
:.::::.::.:::::..::.::.::..:: ::.::::::::: :::..:::::::::::.
CCDS67 GTSRWNNRQVALWDQDNLSVPLMEEDLDGSSGVLFPFYDADTSMLYVVGKGDGNIRYYEV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 STEKPYLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPKHGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPISMIVPRR
:..::.:::: :.:: ::::.:::::.:::::.::.::::::.: :.::::::::::::
CCDS67 SADKPHLSYLTEYRSYNPQKGIGVMPKRGLDVSSCEIFRFYKLITTKSLIEPISMIVPRR
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390
pF1KA0 SDSYQEDIYPMTPGTEPALTPDEWLGGINRDPVLMSLK----------------------
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CCDS67 SESYQEDIYPPTAGAQPSLTAQEWLSGMNRDPILVSLRPGSELLRPHPLPAERPIFNSMA
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430
pF1KA0 ----------------EGYKKSSKMVFKAP-------IKEKKSVVVNGIDLLENVPPRTE
.:...:: . : : ..:::. ..::.:..: ::.::
CCDS67 PASPRLLNQTEKLAAEDGWRSSSLLEEKMPRWAAEHRLEEKKTWLTNGFDVFECPPPKTE
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470
pF1KA0 NELLRMFFRQQDEIRRLKEELAQKDIRIRQLQLELKNLRNSPKNC
::::.::.:::.:::::.: :.:.... .::.
CCDS67 NELLQMFYRQQEEIRRLRELLTQREVQAKQLELEIKNLRMGSEQL
490 500 510 520
>>CCDS61236.1 CORO1C gene_id:23603|Hs108|chr12 (527 aa)
initn: 690 init1: 690 opt: 1433 Z-score: 1366.9 bits: 262.4 E(32554): 8.2e-70
Smith-Waterman score: 1433; 44.9% identity (72.5% similar) in 483 aa overlap (1-468:48-525)
10 20
pF1KA0 MSWRPQYR----SSKFRNVYGKVANREHCF
: :. .: .::::.:.:.... ..:.
CCDS61 KERGCSIACQGSLTSARLHAPSIGERPLSHMRWKDTMRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCY
20 30 40 50 60 70
30 40 50 60 70 80
pF1KA0 DGIPITKNVHDNHFCAVNTRFLAIVTESAGGGSFLVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVL
: : ... . :. ::::: ::.::. :..:::.:::.::..::::. .:: :::: : ::
CCDS61 DDIRVSRVTWDSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAFLVLPLHKTGRIDKSYPTVCGHTGPVL
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KA0 DIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEGGLKRNMTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNN
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CCDS61 DIDWCPHNDQVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLSLTEPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARN
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 ILFSAGYDYKVLIWNLDVGEP-VKMIDCHTDVILCMSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIEPR
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CCDS61 VLLSAGCDNAIIIWNVGTGEALINLDDMHSDMIYNVSWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPR
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 SGRVLQEANCKNH---RVNRVVFLGNMKRLLTTGVSRWNTRQIALWDQEDLSMPLIEEEI
. ... : . : : : :..::.. . ..::: :: . ::.:::. .... :. .:.
CCDS61 KQEIVAEKE-KAHEGARPMRAIFLADGN-VFTTGFSRMSERQLALWNPKNMQEPIALHEM
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 DGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYYEISTEKPYLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPK
: .:.:.:::: :: ..:: ::::..:::.::. :.::. :: : : ::.:.: :::
CCDS61 DTSNGVLLPFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDESPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPK
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 HGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPISMIVPRRSDSYQEDIYPMTPGTEPALTPDEWLGG
.::::. ::. ::.:: : ::: : :::.:: .:.:.:: : : : :: .::. :
CCDS61 RGLDVNKCEIARFFKLHERK--CEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWFEG
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430
pF1KA0 INRDPVLMSLKEGY---KKSSKMVFKAPIKEKKSVVVNGIDLLENVPPRTENELLRMFFR
: ::.:.:::.:: :. . : : : ..: .. . ::. ..: .: . .
CCDS61 KNADPILISLKHGYIPGKNRDLKVVKKNILDSKPTANKKCDLI-SIPKKTTDTASVQNEA
440 450 460 470 480 490
440 450 460 470
pF1KA0 QQDEI----RRLKEELAQKDIRIRQLQLELKNLRNSPKNC
. ::: . .:. . ..: :: .:. .. ..
CCDS61 KLDEILKEIKSIKDTICNQDERISKLEQQMAKIAA
500 510 520
>>CCDS9120.1 CORO1C gene_id:23603|Hs108|chr12 (474 aa)
initn: 690 init1: 690 opt: 1429 Z-score: 1363.8 bits: 261.7 E(32554): 1.2e-69
Smith-Waterman score: 1429; 45.6% identity (73.1% similar) in 472 aa overlap (8-468:6-472)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSWRPQYRSSKFRNVYGKVANREHCFDGIPITKNVHDNHFCAVNTRFLAIVTESAGGGSF
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CCDS91 MRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCYDDIRVSRVTWDSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVLDIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEGGLKRN
::.::..::::. .:: :::: : :::: : : :..::: ::: .: .:.:::.:: .
CCDS91 LVLPLHKTGRIDKSYPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDQVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KA0 MTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNNILFSAGYDYKVLIWNLDVGEP-VKMIDCHTDVIL
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CCDS91 LTEPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARNVLLSAGCDNAIIIWNVGTGEALINLDDMHSDMIY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 CMSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIEPRSGRVLQEANCKNH---RVNRVVFLGNMKRLLTTG
.:.: .:::. :. ::::.:::.::. ... : . : : : :..::.. ..:::
CCDS91 NVSWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPRKQEIVAEKE-KAHEGARPMRAIFLAD-GNVFTTG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 VSRWNTRQIALWDQEDLSMPLIEEEIDGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYYEIS
:: . ::.:::. .... :. .:.: .:.:.:::: :: ..:: ::::..:::.::.
CCDS91 FSRMSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEIT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 TEKPYLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPKHGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPISMIVPRRS
:.::. :: : : ::.:.: :::.::::. ::. ::.:: : ::: : :::.:
CCDS91 DESPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHERK--CEPIIMTVPRKS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 DSYQEDIYPMTPGTEPALTPDEWLGGINRDPVLMSLKEGY---KKSSKMVFKAPIKEKKS
: .:.:.:: : : : :: .::. : : ::.:.:::.:: :. . : : : ..:
CCDS91 DLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRDLKVVKKNILDSKP
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KA0 VVVNGIDLLENVPPRTENELLRMFFRQQDEI----RRLKEELAQKDIRIRQLQLELKNLR
.. . ::. ..: .: . . . ::: . .:. . ..: :: .:. .. ..
CCDS91 TANKKCDLI-SIPKKTTDTASVQNEAKLDEILKEIKSIKDTICNQDERISKLEQQMAKIA
420 430 440 450 460 470
470
pF1KA0 NSPKNC
CCDS91 A
>>CCDS11252.2 CORO6 gene_id:84940|Hs108|chr17 (472 aa)
initn: 664 init1: 664 opt: 1394 Z-score: 1330.7 bits: 255.6 E(32554): 8.5e-68
Smith-Waterman score: 1396; 45.1% identity (71.2% similar) in 468 aa overlap (8-470:7-462)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSWRPQYRSSKFRNVYGKVANREHCFDGIPITKNVHDNHFCAVNTRFLAIVTESAGGGSF
:.::::.:.:..:. .. .. : ..: . :. ::::: .::::..:..:::.:
CCDS11 MSRRVVRQSKFRHVFGQAAKADQAYEDIRVSKVTWDSSFCAVNPKFLAIIVEAGGGGAF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVLDIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEGGLKRN
.:.:: .:::.. ::: : :: . :::: : : ::.::: :.::.. .:.::. ::
CCDS11 IVLPLAKTGRVDKNYPLVTGHTAPVLDIDWCPHNDNVIASASDDTTIMVWQIPDYTPMRN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KA0 MTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNNILFSAGYDYKVLIWNLDVGEPV-KMIDCHTDVIL
.:: .. :.:::.:::.. ::::. :.:.::: : ..:::. .:: . .. : : :::
CCDS11 ITEPIITLEGHSKRVGILSWHPTARNVLLSAGGDNVIIIWNVGTGEVLLSLDDMHPDVIH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 CMSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIEPRSGRVLQE--ANCKNHRVNRVVFLGNMKRLLTTGV
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CCDS11 SVCWNSNGSLLATTCKDKTLRIIDPRKGQVVAERFAAHEGMRPMRAVFT-RQGHIFTTGF
180 190 200 210 220 230
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pF1KA0 SRWNTRQIALWDQEDLSMPLIEEEIDGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYYEIST
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CCDS11 TRMSQRELGLWDPNNFEEPVALQEMDTSNGVLLPFYDPDSSIVYLCGKGDSSIRYFEITD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 EKPYLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPKHGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPISMIVPRRSD
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CCDS11 EPPFVHYLNTFSSKEPQRGMGFMPKRGLDVSKCEIARFYKLHERK--CEPIIMTVPRKSD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 SYQEDIYPMTPGTEPALTPDEWLGGINRDPVLMSLKEGYKKSSKMVFKAPIKEKKSVVV-
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CCDS11 LFQDDLYPDTPGPEPALEADEWLSGQDAEPVLISLRDGY---------VPPKHRELRVTK
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pF1KA0 -NGIDLLENVPPRTENELLRMFFRQQDEIRRLKEELAQKDIRIRQLQLELKNLRNSPKNC
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CCDS11 RNILDVRPPSGPRRSQSASDAPLSQQHTLETLLEEIKALRERVQAQEQRITALENMLCEL
410 420 430 440 450 460
CCDS11 VDGTD
470
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10 20 30 40 50 60
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10 20 30 40 50 60
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CCDS81 LVLPLSKTGRIDKAYPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDEVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTSP
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pF1KA0 MTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNNILFSAGYDYKVLIWNLDVGEPVKMIDC-HTDVIL
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CCDS81 LTEPVVVLEGHTKRVGIIAWHPTARNVLLSAGCDNVVLIWNVGTAEELYRLDSLHPDLIY
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pF1KA0 CMSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIEPRSGRVLQEANCKNH---RVNRVVFLGNMKRLLTTG
.:.: .:::. ..::::..:.:.:: : .. : . : : : :..::.. : ..:::
CCDS81 NVSWNHNGSLFCSACKDKSVRIIDPRRGTLVAERE-KAHEGARPMRAIFLADGK-VFTTG
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pF1KA0 VSRWNTRQIALWDQEDLSMPLIEEEIDGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYYEIS
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CCDS81 FSRMSERQLALWDPENLEEPMALQELDSSNGALLPFYDPDTSVVYVCGKGDSSIRYFEIT
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pF1KA0 TEKPYLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPKHGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPISMIVPRRS
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CCDS81 EEPPYIHFLNTFTSKEPQRGMGSMPKRGLEVSKCEIARFYKLHERK--CEPIVMTVPRKS
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pF1KA0 DSYQEDIYPMTPGTEPALTPDEWLGGINRDPVLMSLKEGYKKSSKMVFKAPIKEKKSVVV
: .:.:.:: : : : :: .::..: . ::.:.::.:.: :.. .:
CCDS81 DLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWVSGRDADPILISLREAYVPSKQRDLKISRRNVLSDSR
360 370 380 390 400 410
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pF1KA0 NGIDLLENVPPRTENELLRMFFRQQDEIRRLKEELAQKDIRIRQLQLELKNLRNSPKNC
CCDS81 PAMAPGSSHLGAPASTTTAADATPSGSLARAGEAGKLEEVMQELRALRALVKEQGDRICR
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pF1KA0 LVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVLDIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEGGLKRN
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CCDS10 LVLPLGKTGRVDKNAPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLMLP
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pF1KA0 MTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNNILFSAGYDYKVLIWNLDVGEPVKMI----DCHTD
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CCDS10 LREPVVTLEGHTKRVGIVAWHTTAQNVLLSAGCDNVIMVW--DVGTGAAMLTLGPEVHPD
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pF1KA0 VILCMSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIEPRSGRVLQEANCKNH---RVNRVVFLGNMKRLL
.: .... ::.:. :.:.::..:.::::.: :. : . . : : :.::... : .:
CCDS10 TIYSVDWSRDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVVAEKD-RPHEGTRPVRAVFVSEGK-IL
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pF1KA0 TTGVSRWNTRQIALWDQEDLSMPLIEEEIDGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYY
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CCDS10 TTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYF
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CCDS10 EITSEAPFLHYLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERR--CEPIAMTVP
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pF1KA0 RRSDSYQEDIYPMTPGTEPALTPDEWLGGINRDPVLMSLKEGYKKSSKMVFKAPIKEKKS
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CCDS10 RKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGY---------VPPKSREL
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pF1KA0 VVVNGIDL-LENVPPRTENELLRMFFRQQDEIRRLKEELAQKDIRIRQLQLELKNLRNSP
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CCDS10 RVNRGLDTGRRRAAPEASGT------PSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETV
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pF1KA0 KNC
CCDS10 QAK
460
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pF1KA0 NIIASCSEDTSVRIWEIPEGGLKRNMTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNNILFSAGYDY
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CCDS55 HRLAVAGEDARIRLWRVPAEGLEEVLTTPETVLTGHTEKICSLRFHPLAANVLASSSYDL
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: ::.:..: .. : : :. .... ::. :.:.::: ..:: .:::: . :::.
CCDS55 TVRIWDLQAGADRLKLQGHQDQIFSLAWSPDGQQLATVCKDGRVRVYRPRSGPEPLQEGP
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pF1KA0 NCKNHRVNRVVFLGNMKRLLTTGVSRWNTRQIALWDQEDLSM-PLIEEEIDGLSGLLFPF
. :. : :.:.. . . ::..: . . ::. :.. : :. :: .: . :.:
CCDS55 GPKGGRGARIVWVCDGRCLLVSGFDSQSERQLLLYEAEALAGGPLAVLGLDVAPSTLLPS
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pF1KA0 YDADTHMLYLAGKGDGNIRYYEISTEKPYLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPKHGLDVSACEV
:: :: .. :.:::: . ::. :.:.. : :: :.::: ..:: :: :.
CCDS55 YDPDTGLVLLTGKGDTRVFLYELLPESPFFLECNSFTSPDPHKGLVLLPKTECDVREVEL
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pF1KA0 FRFYKLVTLKGLIEPISMIVPR-RSDSYQEDIYPMTPGT-EPALTPDEWLGGINRDPVLM
.: .: .. .::... .:: :.. .:.:..: : ::.:. . :: : : .: :.
CCDS55 MRCLRLR--QSSLEPVAFRLPRVRKEFFQDDVFPDTAVIWEPVLSAEAWLQGANGQPWLL
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pF1KA0 SLKE-GYKKSSKMVFKAPIKEKKSVVVNGIDLLENVPPRTENELLRMFFRQQDEIRRLKE
::. .. :. .:: .. :
CCDS55 SLQPPDMSPVSQAPREAPARRAPSSAQYLEEKSDQQKKEELLNAMVAKLGNREDPLPQDS
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>--
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pF1KA0 TNNILFSAGYDYKVLIWNLDVGEPVKMIDCHTDVILCMSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIE
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CCDS55 PGVLGIVPLQGQGEDKRRVAHLGCHSELAAHGDLVQSAVWSRDGALVGTACKDKQLRIFD
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pF1KA0 PRSG-RVLQEANC-KNHRVNRVVFLGNMKRLLTTGVSRWNTRQIALWDQEDLSMPLIEEE
::. :. : .. .: : .:....:. ..:..:: .. :.. ::: . .: :
CCDS55 PRTKPRASQSTQAHENSRDSRLAWMGTWEHLVSTGFNQMREREVKLWDTRFFSSALASLT
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pF1KA0 IDGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYYEISTEKPYLSYLMEFRSPAPQKGLGVMP
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CCDS55 LDTSLGCLVPLLDPDSGLLVLAGKGERQLYCYEVVPQQPALSPVTQCVLESVLRGAALVP
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pF1KA0 KHGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPISMIVPRRSDSYQEDIYPMTPGTEPALTPDEWLG
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CCDS55 RQALAVMSCEVLRVLQLSDTA--IVPIGYHVPRKAVEFHEDLFPDTAGCVPATDPHSWWA
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pF1KA0 GINRDPVLMSLKEGYKKSSKMVFKAPIKEKKSVVVNGIDLLENVPPRTENELLRMFFRQQ
: :.. .::
CCDS55 GDNQQVQKVSLNPACRPHPSFTSCLVPPAEPLPDTAQPAVMETPVGDADASEGFSSPPSS
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10 20 30
pF1KA0 MSWRPQYRSSKFRNVYGKVANRE-HCFD--GIPITKNV
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CCDS58 TPSSLGPSLSSTSGIGTSPSLRSLQSLLGPSSKFRHAQGTVLHRDSHITNLKGLNLTTPG
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pF1KA0 HDNHFCAVNTRFLAIVTESAGGGSFLVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVLDIKWNPFID
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CCDS58 ESDGFCANKLR-VAVPLLSSGG-QVAVLELRKPGRLPDTALPTLQNGAAVTDLAWDPFDP
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pF1KA0 NIIASCSEDTSVRIWEIPEGGLKRNMTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNNILFSAGYDY
. .: .::. .:.:..: ::.. .: : ::.... ...:: . :.: :..::
CCDS58 HRLAVAGEDARIRLWRVPAEGLEEVLTTPETVLTGHTEKICSLRFHPLAANVLASSSYDL
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CCDS58 TVRIWDLQAGADRLKLQGHQDQIFSLAWSPDGQQLATVCKDGRVRVYRPRSGPEPLQEGP
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. :. : :.:.. . . ::..: . . ::. :.. : :. :: .: . :.:
CCDS58 GPKGGRGARIVWVCDGRCLLVSGFDSQSERQLLLYEAEALAGGPLAVLGLDVAPSTLLPS
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pF1KA0 YDADTHMLYLAGKGDGNIRYYEISTEKPYLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPKHGLDVSACEV
:: :: .. :.:::: . ::. :.:.. : :: :.::: ..:: :: :.
CCDS58 YDPDTGLVLLTGKGDTRVFLYELLPESPFFLECNSFTSPDPHKGLVLLPKTECDVREVEL
720 730 740 750 760 770
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pF1KA0 FRFYKLVTLKGLIEPISMIVPR-RSDSYQEDIYPMTPGT-EPALTPDEWLGGINRDPVLM
.: .: .. .::... .:: :.. .:.:..: : ::.:. . :: : : .: :.
CCDS58 MRCLRLR--QSSLEPVAFRLPRVRKEFFQDDVFPDTAVIWEPVLSAEAWLQGANGQPWLL
780 790 800 810 820 830
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pF1KA0 SLKE-GYKKSSKMVFKAPIKEKKSVVVNGIDLLENVPPRTENELLRMFFRQQDEIRRLKE
::. .. :. .:: .. :
CCDS58 SLQPPDMSPVSQAPREAPARRAPSSAQYLEEKSDQQKKEELLNAMVAKLGNREDPLPQDS
840 850 860 870 880 890
>--
initn: 397 init1: 212 opt: 541 Z-score: 519.1 bits: 106.3 E(32554): 1.4e-22
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..: ::::.. .. :: .. : : .: : . :.. :. .:
CCDS58 MNRFRVSKFRHTEARPPRRESWISDIRAGTAPSCRN-HIKSSCSL------IAFNSD
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pF1KA0 GGGSFLVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVLDIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEG
: . ..::. :. . .. :.: : : .:..:..:
CCDS58 RPGVLGIVPLQGQGEDKRRVAHLGCHSG------------------SADRTVKLWRLPGP
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pF1KA0 GLKRNMTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNNILFSAGYDYKVLIWNLDVGEPVKMIDCHT
: . ... : .. : ....:::...:: ::. : .:. .:. . :
CCDS58 GQALPSAPGVV-LGPEDLPVEVLQFHPTSDGILVSAA-GTTVKVWDAAKQQPLTELAAHG
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pF1KA0 DVILCMSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIEPRSG-RVLQEANC-KNHRVNRVVFLGNMKRLL
:.. .. ::.:. :.::::.::...::. :. : .. .: : .:....:. ..:.
CCDS58 DLVQSAVWSRDGALVGTACKDKQLRIFDPRTKPRASQSTQAHENSRDSRLAWMGTWEHLV
160 170 180 190 200 210
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pF1KA0 TTGVSRWNTRQIALWDQEDLSMPLIEEEIDGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYY
.:: .. :.. ::: . .: : .: : : :. : :. .: :::::. .. :
CCDS58 STGFNQMREREVKLWDTRFFSSALASLTLDTSLGCLVPLLDPDSGLLVLAGKGERQLYCY
220 230 240 250 260 270
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pF1KA0 EISTEKPYLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPKHGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPISMIVP
:. ..: :: . . . .: ...:...: : .:::.: .: : ::.. ::
CCDS58 EVVPQQPALSPVTQCVLESVLRGAALVPRQALAVMSCEVLRVLQLSDTA--IVPIGYHVP
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pF1KA0 RRSDSYQEDIYPMTPGTEPALTPDEWLGGINRDPVLMSLKEGYKKSSKMVFKAPIKEKKS
:.. ..::..: : : :: : : .: :.. .::
CCDS58 RKAVEFHEDLFPDTAGCVPATDPHSWWAGDNQQVQKVSLNPACRPHPSFTSCLVPPAEPL
330 340 350 360 370 380
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pF1KA0 VVVNGIDLLENVPPRTENELLRMFFRQQDEIRRLKEELAQKDIRIRQLQLELKNLRNSPK
CCDS58 PDTAQPAVMETPVGDADASEGFSSPPSSLTSPSTPSSLGPSLSSTSGIGTSPSLRSLQSL
390 400 410 420 430 440
475 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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