Result of FASTA (ccds) for pFN21AA0853
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0853, 1668 aa
  1>>>pF1KA0853 1668 - 1668 aa - 1668 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.9458+/-0.00116; mu= -9.3475+/- 0.070
 mean_var=477.5432+/-97.790, 0's: 0 Z-trim(114.1): 209  B-trim: 134 in 1/53
 Lambda= 0.058691
 statistics sampled from 14443 (14650) to 14443 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.715), E-opt: 0.2 (0.45), width:  16
 Scan time:  4.670

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS81766.1 ZC3H13 gene_id:23091|Hs108|chr13       (1668) 11134 958.8       0
CCDS9400.1 ZC3H13 gene_id:23091|Hs108|chr13        (1564) 10397 896.4       0
CCDS32113.1 RBM25 gene_id:58517|Hs108|chr14        ( 843)  630 69.2 6.9e-11


>>CCDS81766.1 ZC3H13 gene_id:23091|Hs108|chr13            (1668 aa)
 initn: 11134 init1: 11134 opt: 11134  Z-score: 5111.6  bits: 958.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 11134; 99.9% identity (100.0% similar) in 1668 aa overlap (1-1668:1-1668)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MSKIRRKVTVENTKTISDSTSRRPSVFERLGPSTGSTAETQCRNWLKTGNCLYGNTCRFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MSKIRRKVTVENTKTISDSTSRRPSVFERLGPSTGSTAETQCRNWLKTGNCLYGNTCRFV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 HGPSPRGKGYSSNYRRSPERPTGDLRERMKNKRQDVDTEPQKRNTEESSSPVRKESSRGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 HGPSPRGKGYSSNYRRSPERPTGDLRERMKNKRQDVDTEPQKRNTEESSSPVRKESSRGR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 HREKEDIKITKERTPESEEENVEWETNRDDSDNGDINYDYVHELSLEMKRQKIQRELMKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 HREKEDIKITKERTPESEEENVEWETNRDDSDNGDINYDYVHELSLEMKRQKIQRELMKL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 EQENMEKREEIIIKKEVSPEVVRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKSSSASKKDRKTSAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EQENMEKREEIIIKKEVSPEVVRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKSSSASKKDRKTSAV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 SSPLLDQQRNSKTNQSKKKGPRTPSPPPPIPEDIALGKKYKEKYKVKDRIEEKTRDGKDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SSPLLDQQRNSKTNQSKKKGPRTPSPPPPIPEDIALGKKYKEKYKVKDRIEEKTRDGKDR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 GRDFERQREKRDKPRSTSPAGQHHSPISSRHHSSSSQSGSSIQRHSPSPRRKRTPSPSYQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GRDFERQREKRDKPRSTSPAGQHHSPISSRHHSSSSQSGSSIQRHSPSPRRKRTPSPSYQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 RTLTPPLRRSASPYPSHSLSSPQRKQSPPRHRSPMREKGRHDHERTSQSHDRRHERREDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RTLTPPLRRSASPYPSHSLSSPQRKQSPPRHRSPMREKGRHDHERTSQSHDRRHERREDT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 RGKRDREKDSREEREYEQDQSSSRDHRDDREPRDGRDRRDARDTRDRRELRDSRDMRDSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RGKRDREKDSREEREYEQDQSSSRDHRDDREPRDGRDRRDARDTRDRRELRDSRDMRDSR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 EMRDYSRDTKESRDPRDSRSTRDAHDYRDREGRDTHRKEDTYPEESRSYGRNHLREESSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EMRDYSRDTKESRDPRDSRSTRDAHDYRDREGRDTHRKEDTYPEESRSYGRNHLREESSR
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 TEIRNESRNESRSEIRNDRMGRSRGRVPELPEKGSRGSRGSQIDSHSSNSNYHDSWETRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TEIRNESRNESRSEIRNDRMGRSRGRVPELPEKGSRGSRGSQIDSHSSNSNYHDSWETRS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 SYPERDRYPERDNRDQARDSSFERRHGERDRRDNRERDQRPSSPIRHQGRNDELERDERR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SYPERDRYPERDNRDQARDSSFERRHGERDRRDNRERDQRPSSPIRHQGRNDELERDERR
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 EERRVDRVDDRRDERARERDRERERDRERERERERERDREREKERELERERARERERERE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EERRVDRVDDRRDERARERDRERERDRERERERERERDREREKERELERERARERERERE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 KERDRERDRDRDHDRERERERERDREKEREREREERERERERERERERERERERERARER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KERDRERDRDRDHDRERERERERDREKEREREREERERERERERERERERERERERARER
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 DKERERQRDWEDKDKGRDDRREKREEIREDRNPRDGHDERKSKKRYRNEGSPSPRQSPKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DKERERQRDWEDKDKGRDDRREKREEIREDRNPRDGHDERKSKKRYRNEGSPSPRQSPKR
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 RREHSPDSDAYNSGDDKNEKHRLLSQVVRPQESRSLSPSHLTEDRQGRWKEEDRKPERKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RREHSPDSDAYNSGDDKNEKHRLLSQVVRPQESRSLSPSHLTEDRQGRWKEEDRKPERKE
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 SSRRYEEQELKEKVSSVDKQREQTEILESSRMRAQDIIGHHQSEDRETSDRAHDENKKKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SSRRYEEQELKEKVSSVDKQREQTEILESSRMRAQDIIGHHQSEDRETSDRAHDENKKKA
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 KIQKKPIKKKKEDDVGIERGNIETTSEDGQVFSPKKGQKKKSIEKKRKKSKGDSDISDEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KIQKKPIKKKKEDDVGIERGNIETTSEDGQVFSPKKGQKKKSIEKKRKKSKGDSDISDEE
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 AAQQSKKKRGPRTPPITTKEELVEMCNGKNGILEDSQKKEDTAFSDWSDEDVPDRTEVTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AAQQSKKKRGPRTPPITTKEELVEMCNGKNGILEDSQKKEDTAFSDWSDEDVPDRTEVTE
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA0 AEHTATATTPGSTPSPLSSLLPPPPPVATATATTVPATLAATTAAAATSFSTSAITISTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AEHTATATTPGSTPSPLSSLLPPPPPVATATATTVPATLAATTAAAATSFSTSAITISTS
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA0 ATPTNTTNNTFANEDSHRKCHRTRVEKVETPHVTIEDAQHRKPMDQKRSSSLGSNRSNRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ATPTNTTNNTFANEDSHRKCHRTRVEKVETPHVTIEDAQHRKPMDQKRSSSLGSNRSNRS
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA0 HTSGRLRSPSNDSAHRSGDDQSGRKRVLHSGSRDREKTKSLEITGERKSRIDQLKRGEPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 HTSGRLRSPSNDSAHRSGDDQSGRKRVLHSGSRDREKTKSLEITGERKSRIDQLKRGEPS
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA0 RSTSSDRQDSRSHSSRRSSPESDRQVHSRSGSFDSRDRLQERDRYEHDRERERERRDTRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RSTSSDRQDSRSHSSRRSSPESDRQVHSRSGSFDSRDRLQERDRYEHDRERERERRDTRQ
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KA0 REWDRDADKDWPRNRDRDRLRERERERERDKRRDLDRERERLISDSVERDRDRDRDRTFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 REWDRDADKDWPRNRDRDRLRERERERERDKRRDLDRERERLISDSVERDRDRDRDRTFE
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KA0 SSQIESVKRCEAKLEGEHERDLESTSRDSLALDKERMDKDLGSVQGFEDTNKSERTESLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS81 SSQIESVKRCEAKLEGEHERDLESTSRDSLALDKERMDKDLGSVQGFEETNKSERTESLE
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KA0 GDDESKLDDAHSLGSGAGEGYEPISDDELDEILAGDAEKREDQQDEEKMPDPLDVIDVDW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GDDESKLDDAHSLGSGAGEGYEPISDDELDEILAGDAEKREDQQDEEKMPDPLDVIDVDW
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KA0 SGLMPKHPKEPREPGAALLKFTPGAVMLRVGISKKLAGSELFAKVKETCQRLLEKPKDAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SGLMPKHPKEPREPGAALLKFTPGAVMLRVGISKKLAGSELFAKVKETCQRLLEKPKDAD
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KA0 NLFEHELGALNMAALLRKEERASLLSNLGPCCKALCFRRDSAIRKQLVKNEKGTIKQAYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NLFEHELGALNMAALLRKEERASLLSNLGPCCKALCFRRDSAIRKQLVKNEKGTIKQAYT
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660        
pF1KA0 SAPMVDNELLRLSLRLFKRKTTCHAPGHEKTEDNKLSQSSIQQELCVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SAPMVDNELLRLSLRLFKRKTTCHAPGHEKTEDNKLSQSSIQQELCVS
             1630      1640      1650      1660        

>>CCDS9400.1 ZC3H13 gene_id:23091|Hs108|chr13             (1564 aa)
 initn: 10389 init1: 9630 opt: 10397  Z-score: 4774.7  bits: 896.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10397; 99.9% identity (99.9% similar) in 1558 aa overlap (1-1557:1-1558)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MSKIRRKVTVENTKTISDSTSRRPSVFERLGPSTGSTAETQCRNWLKTGNCLYGNTCRFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MSKIRRKVTVENTKTISDSTSRRPSVFERLGPSTGSTAETQCRNWLKTGNCLYGNTCRFV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 HGPSPRGKGYSSNYRRSPERPTGDLRERMKNKRQDVDTEPQKRNTEESSSPVRKESSRGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 HGPSPRGKGYSSNYRRSPERPTGDLRERMKNKRQDVDTEPQKRNTEESSSPVRKESSRGR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 HREKEDIKITKERTPESEEENVEWETNRDDSDNGDINYDYVHELSLEMKRQKIQRELMKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 HREKEDIKITKERTPESEEENVEWETNRDDSDNGDINYDYVHELSLEMKRQKIQRELMKL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 EQENMEKREEIIIKKEVSPEVVRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKSSSASKKDRKTSAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 EQENMEKREEIIIKKEVSPEVVRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKSSSASKKDRKTSAV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 SSPLLDQQRNSKTNQSKKKGPRTPSPPPPIPEDIALGKKYKEKYKVKDRIEEKTRDGKDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 SSPLLDQQRNSKTNQSKKKGPRTPSPPPPIPEDIALGKKYKEKYKVKDRIEEKTRDGKDR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 GRDFERQREKRDKPRSTSPAGQHHSPISSRHHSSSSQSGSSIQRHSPSPRRKRTPSPSYQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 GRDFERQREKRDKPRSTSPAGQHHSPISSRHHSSSSQSGSSIQRHSPSPRRKRTPSPSYQ
              310       320       330       340       350       360

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pF1KA0 RTLTPPLRRSASPYPSHSLSSPQRKQSPPRHRSPMREKGRHDHERTSQSHDRRHERREDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 RTLTPPLRRSASPYPSHSLSSPQRKQSPPRHRSPMREKGRHDHERTSQSHDRRHERREDT
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pF1KA0 RGKRDREKDSREEREYEQDQSSSRDHRDDREPRDGRDRRDARDTRDRRELRDSRDMRDSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 RGKRDREKDSREEREYEQDQSSSRDHRDDREPRDGRDRRDARDTRDRRELRDSRDMRDSR
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pF1KA0 EMRDYSRDTKESRDPRDSRSTRDAHDYRDREGRDTHRKEDTYPEESRSYGRNHLREESSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 EMRDYSRDTKESRDPRDSRSTRDAHDYRDREGRDTHRKEDTYPEESRSYGRNHLREESSR
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pF1KA0 TEIRNESRNESRSEIRNDRMGRSRGRVPELPEKGSRGSRGSQIDSHSSNSNYHDSWETRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 TEIRNESRNESRSEIRNDRMGRSRGRVPELPEKGSRGSRGSQIDSHSSNSNYHDSWETRS
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pF1KA0 SYPERDRYPERDNRDQARDSSFERRHGERDRRDNRERDQRPSSPIRHQGRNDELERDERR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 SYPERDRYPERDNRDQARDSSFERRHGERDRRDNRERDQRPSSPIRHQGRNDELERDERR
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pF1KA0 EERRVDRVDDRRDERARERDRERERDRERERERERERDREREKERELERERARERERERE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 EERRVDRVDDRRDERARERDRERERDRERERERERERDREREKERELERERARERERERE
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pF1KA0 KERDRERDRDRDHDRERERERERDREKEREREREERERERERERERERERERERERARER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 KERDRERDRDRDHDRERERERERDREKEREREREERERERERERERERERERERERARER
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pF1KA0 DKERERQRDWEDKDKGRDDRREKREEIREDRNPRDGHDERKSKKRYRNEGSPSPRQSPKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 DKERERQRDWEDKDKGRDDRREKREEIREDRNPRDGHDERKSKKRYRNEGSPSPRQSPKR
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pF1KA0 RREHSPDSDAYNSGDDKNEKHRLLSQVVRPQESRSLSPSHLTEDRQGRWKEEDRKPERKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 RREHSPDSDAYNSGDDKNEKHRLLSQVVRPQESRSLSPSHLTEDRQGRWKEEDRKPERKE
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pF1KA0 SSRRYEEQELKEKVSSVDKQREQTEILESSRMRAQDIIGHHQSEDRETSDRAHDENKKKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 SSRRYEEQELKEKVSSVDKQREQTEILESSRMRAQDIIGHHQSEDRETSDRAHDENKKKA
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pF1KA0 KIQKKPIKKKKEDDVGIERGNIETTSEDGQVFSPKKGQKKKSIEKKRKKSKGDSDISDEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 KIQKKPIKKKKEDDVGIERGNIETTSEDGQVFSPKKGQKKKSIEKKRKKSKGDSDISDEE
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pF1KA0 AAQQSKKKRGPRTPPITTKEELVEMCNGKNGILEDSQKKEDTAFSDWSDEDVPDRTEVTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 AAQQSKKKRGPRTPPITTKEELVEMCNGKNGILEDSQKKEDTAFSDWSDEDVPDRTEVTE
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pF1KA0 AEHTATATTPGSTPSPLSSLLPPPPPVATATATTVPATLAATTAAAATSFSTSAITISTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 AEHTATATTPGSTPSPLSSLLPPPPPVATATATTVPATLAATTAAAATSFSTSAITISTS
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

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pF1KA0 ATPTNTTNNTFANEDSHRKCHRTRVEKVETPHVTIEDAQHRKPMDQKRSSSLGSNRSNRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 ATPTNTTNNTFANEDSHRKCHRTRVEKVETPHVTIEDAQHRKPMDQKRSSSLGSNRSNRS
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pF1KA0 HTSGRLRSPSNDSAHRSGDDQSGRKRVLHSGSRDREKTKSLEITGERKSRIDQLKRGEPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 HTSGRLRSPSNDSAHRSGDDQSGRKRVLHSGSRDREKTKSLEITGERKSRIDQLKRGEPS
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

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pF1KA0 RSTSSDRQDSRSHSSRRSSPESDRQVHSRSGSFDSRDRLQERDRYEHDRERERERRDTRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 RSTSSDRQDSRSHSSRRSSPESDRQVHSRSGSFDSRDRLQERDRYEHDRERERERRDTRQ
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pF1KA0 REWDRDADKDWPRNRDRDRLRERERERERDKRRDLDRERERLISDSVERDRDRDRDRTFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 REWDRDADKDWPRNRDRDRLRERERERERDKRRDLDRERERLISDSVERDRDRDRDRTFE
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pF1KA0 SSQIESVKRCEAKLEGEHERDLESTSRDSLALDKERMDKDLGSVQGFEDTNKSERTESLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS94 SSQIESVKRCEAKLEGEHERDLESTSRDSLALDKERMDKDLGSVQGFEETNKSERTESLE
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pF1KA0 -GDDESKLDDAHSLGSGAGEGYEPISDDELDEILAGDAEKREDQQDEEKMPDPLDVIDVD
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 AGDDESKLDDAHSLGSGAGEGYEPISDDELDEILAGDAEKREDQQDEEKMPDPLDVIDVD
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pF1KA0 WSGLMPKHPKEPREPGAALLKFTPGAVMLRVGISKKLAGSELFAKVKETCQRLLEKPKDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::  
CCDS94 WSGLMPKHPKEPREPGAALLKFTPGAVMLRVGISKKLAGSELFAKVKETCQRLLEKPKGS
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pF1KA0 DNLFEHELGALNMAALLRKEERASLLSNLGPCCKALCFRRDSAIRKQLVKNEKGTIKQAY
                                                                   
CCDS94 FILL                                                        
                                                                   

>>CCDS32113.1 RBM25 gene_id:58517|Hs108|chr14             (843 aa)
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              470       480       490        500       510         
pF1KA0 ARDTRDRRELRDSRDMRDSREMRDYSRDTKESRDPRDS-RSTRDAHDYRDREGR-----D
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CCDS32 IRQLLAKCGLVLSWKRVQGASGKLQAFGFCEYKEPESTLRALRLLHDLQIGEKKLLVKVD
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pF1KA0 THRKEDTYPEESRSYGRN-HLREESSRTEIRNESRNESRSEIRNDRMGRSRGRVPELP-E
       .. : .    .... . : . : :.  .. ..   .:..   : :.:   .: .  :  :
CCDS32 AKTKAQLDEWKAKKKASNGNARPETVTNDDEEALDEETK---RRDQM--IKGAIEVLIRE
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pF1KA0 KGSRGSRGSQ-IDSHSSNSNYHDSWETRSSYPERDR--YPERDNRDQARDSSFERRHGER
        .:. .  ::  :::  ... . . .    .:      ::   ..:    ...:    :.
CCDS32 YSSELNAPSQESDSHPRKKKKEKKEDIFRRFPVAPLIPYPLITKEDI---NAIEM---EE
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pF1KA0 DRRDNRERDQRPSSPIRHQGRNDELERDERREERRVDRVDDRRDERARERDRERERDRER
       :.::   :.    : .:   .. : :. ....::.  ... .: :: :::.::::: :::
CCDS32 DKRDLISRE---ISKFRDTHKKLEEEKGKKEKERQ--EIEKERRERERERERERER-RER
             280          290       300         310       320      

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pF1KA0 ERERERERDREREKERELERERAREREREREKERDRERDRDRDHDRERERERERDREKER
       ::::::::.::.::::: :::: :.:.: .:..:::.:.::::.::::  .:..:: . :
CCDS32 EREREREREREKEKERERERERDRDRDRTKERDRDRDRERDRDRDRERSSDRNKDRSRSR
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pF1KA0 EREREERERERERERERERERERERERARERDKERERQRDWEDKDKGRDDRREKREEIRE
       :. :. ::::::::::::::::::::: :::..::::.:. : ::: ::  ::. ::   
CCDS32 EKSRD-RERERERERERERERERERERERERERERERERERE-KDKKRD--REEDEE---
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pF1KA0 DRNPRDGHDERKSKKRYRN-EGSPSPRQSPKRRREHSPDSDAYNSGDDKNEKHRLLSQVV
            :....:: ... :. :.. . : .  . ::..   .  . .. ..:..: ...  
CCDS32 -----DAYERRKLERKLREKEAAYQERLKNWEIRERKKTREYEKEAEREEERRREMAK--
           440       450       460       470       480       490   

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pF1KA0 RPQESRSLSPSHLTEDRQGRWKEEDRKPERKES-SRRYEEQELKEKVSSVDKQREQTEIL
          :.. :.  .. :: .    ..: :  :  . ..: ...: . ...  :..::. :. 
CCDS32 ---EAKRLK--EFLEDYDD--DRDDPKYYRGSALQKRLRDREKEMEADERDRKREKEELE
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pF1KA0 ESSRMRAQDIIGHHQSEDRETSDRAHD-ENKKKAKIQKKPIKKKKEDDVGIERGNIETTS
       :   .: . .   : . : : .   .. : ... .:...: ....:..            
CCDS32 E---IRQRLLAEGHPDPDAELQRMEQEAERRRQPQIKQEPESEEEEEEKQEKEEKREEPM
             550       560       570       580       590       600 

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pF1KA0 EDGQVFSPKKGQKKKSIEKKRKKSKGDSDISDEEAAQQSKKKRGPRTPPITTKEELVEMC
                                                                   
CCDS32 EEEEEPEQKPCLKPTLRPISSAPSVSSASGNATPNTPGDESPCGIIIPHENSPDQQQPEE
             610       620       630       640       650       660 




1668 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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