Result of FASTA (ccds) for pFN21AA0363
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0363, 1469 aa
  1>>>pF1KA0363 1469 - 1469 aa - 1469 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.8440+/-0.00131; mu= -15.0229+/- 0.079
 mean_var=499.4726+/-103.918, 0's: 0 Z-trim(114.1): 69  B-trim: 157 in 1/53
 Lambda= 0.057388
 statistics sampled from 14640 (14693) to 14640 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.451), width:  16
 Scan time:  6.170

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS47582.1 NACAD gene_id:23148|Hs108|chr7         (1562) 9664 816.0       0
CCDS44925.2 NACA gene_id:4666|Hs108|chr12          ( 925)  936 93.3 3.7e-18
CCDS31837.1 NACA gene_id:4666|Hs108|chr12          ( 215)  790 80.7 5.1e-15
CCDS11630.1 NACA2 gene_id:342538|Hs108|chr17       ( 215)  722 75.1 2.5e-13


>>CCDS47582.1 NACAD gene_id:23148|Hs108|chr7              (1562 aa)
 initn: 9664 init1: 9664 opt: 9664  Z-score: 4341.5  bits: 816.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9664; 99.9% identity (99.9% similar) in 1469 aa overlap (1-1469:94-1562)

                                             10        20        30
pF1KA0                               MLLPEGLSSQALSTEAPLPATLEPRIVMGE
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RPQPEGASWDAGPGGAPSAWADPGEGGPSPMLLPEGLSSQALSTEAPLPATLEPRIVMGE
            70        80        90       100       110       120   

               40        50        60        70        80        90
pF1KA0 ETCQALLSPRAARTALRDQEGGHASPDPPPELCSQGDLSVPSPPPDPDSFFTPPSTPTKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ETCQALLSPRAARTALRDQEGGHASPDPPPELCSQGDLSVPSPPPDPDSFFTPPSTPTKT
           130       140       150       160       170       180   

              100       110       120       130       140       150
pF1KA0 TYALLPACGPHGDARDSEAELRDELLDSPPASPSGSYITADGDSWASSPSCSLSLLAPAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TYALLPACGPHGDARDSEAELRDELLDSPPASPSGSYITADGDSWASSPSCSLSLLAPAE
           190       200       210       220       230       240   

              160       170       180       190       200       210
pF1KA0 GLDFPSGWGLSPQGSMVDERELHPAGTPEPPSSESSLSADSSSSWGQEGHFFDLDFLAND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GLDFPSGWGLSPQGSMVDERELHPAGTPEPPSSESSLSADSSSSWGQEGHFFDLDFLAND
           250       260       270       280       290       300   

              220       230       240       250       260       270
pF1KA0 PMIPAALLPFQGSLIFQVEAVEVTPLSPEEEEEEAVADPDPGGDLAGEGEEDSTSASFLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PMIPAALLPFQGSLIFQVEAVEVTPLSPEEEEEEAVADPDPGGDLAGEGEEDSTSASFLQ
           310       320       330       340       350       360   

              280       290       300       310       320       330
pF1KA0 SLSDLSITEGMDEAFAFRDDTSAASSDSDSASYAEADDERLYSGEPHAQATLLQDSVQKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SLSDLSITEGMDEAFAFRDDTSAASSDSDSASYAEADDERLYSGEPHAQATLLQDSVQKT
           370       380       390       400       410       420   

              340       350       360       370       380       390
pF1KA0 EEESGGGAKGLQAQDGTVSWAVEAAPQTSDRGAYLSQRQELISEVTEEGLALGQESTATV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EEESGGGAKGLQAQDGTVSWAVEAAPQTSDRGAYLSQRQELISEVTEEGLALGQESTATV
           430       440       450       460       470       480   

              400       410       420       430       440       450
pF1KA0 TPHTLQVAPGLQVEVATRVTPQAGEEETDSTAGQESAAMAMPQPSQEGISEILGQESVTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TPHTLQVAPGLQVEVATRVTPQAGEEETDSTAGQESAAMAMPQPSQEGISEILGQESVTA
           490       500       510       520       530       540   

              460       470       480       490       500       510
pF1KA0 EKLPTPQEETSLTLCPDSPQNLKEEGGLDLPSGRKPVAAATIVPRQAKEDLTLPQDSAMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EKLPTPQEETSLTLCPDSPQNLKEEGGLDLPSGRKPVAAATIVPRQAKEDLTLPQDSAMT
           550       560       570       580       590       600   

              520       530       540       550       560       570
pF1KA0 PPLPLQDTDLSSAPKPVAAATIVSQQAEEGLTLPQDSVMTPPLPLQDTELSSAPKPVAAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PPLPLQDTDLSSAPKPVAAATIVSQQAEEGLTLPQDSVMTPPLPLQDTELSSAPKPVAAA
           610       620       630       640       650       660   

              580       590       600       610       620       630
pF1KA0 TLVSQQAEEGLTLPQDSAMTPPLPLQDTDLSSAPKPVAAATLVSQQAEEGLTLPQDSAMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TLVSQQAEEGLTLPQDSAMTPPLPLQDTDLSSAPKPVAAATLVSQQAEEGLTLPQDSAMT
           670       680       690       700       710       720   

              640       650       660       670       680       690
pF1KA0 PPLPLQDTDLSSAPKPVAAATLVSQQAEEGLTLPQDSAMTPPLPLQDTDLSSAPKPVAAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PPLPLQDTDLSSAPKPVAAATLVSQQAEEGLTLPQDSAMTPPLPLQDTDLSSAPKPVAAA
           730       740       750       760       770       780   

              700       710       720       730       740       750
pF1KA0 TIVSQQAEEGLTLPQDSAMTPPLPLQDTDLSSAPKPVAAATIVSQQAEEGLTLPQDSAMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TIVSQQAEEGLTLPQDSAMTPPLPLQDTDLSSAPKPVAAATIVSQQAEEGLTLPQDSAMT
           790       800       810       820       830       840   

              760       770       780       790       800       810
pF1KA0 PPLPLQDTDLSSAPKPVAAATPVSQQAEEGLTLPQDSAMTPPLPLQDTDLSSAPKPVAAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PPLPLQDTDLSSAPKPVAAATPVSQQAEEGLTLPQDSAMTPPLPLQDTDLSSAPKPVAAA
           850       860       870       880       890       900   

              820       830       840       850       860       870
pF1KA0 TPVSQQAEEGLTLPQDSAMTAPLPLQDTGPTSGPEPLAVATPQTLQAEAGCAPGTEPVAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TPVSQQAEEGLTLPQDSAMTAPLPLQDTGPTSGPEPLAVATPQTLQAEAGCAPGTEPVAT
           910       920       930       940       950       960   

              880       890       900       910       920       930
pF1KA0 MAQQEVGEALGPRPAPEEKNAALPTVPEPAALDQVQQDDPQPAAEAGTPWAAQEDADSTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MAQQEVGEALGPRPAPEEKNAALPTVPEPAALDQVQQDDPQPAAEAGTPWAAQEDADSTL
           970       980       990      1000      1010      1020   

              940       950       960       970       980       990
pF1KA0 GMEALSLPEPASGAGEEIAEALSRPGREACLEARAHTGDGAKPDSPQKETLEVENQQEGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GMEALSLPEPASGAGEEIAEALSRPGREACLEARAHTGDGAKPDSPQKETLEVENQQEGG
          1030      1040      1050      1060      1070      1080   

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KA0 LKLLAQEHGPRSALGGAREVPDAPPAACPEVSQARLLSPAREERGLSGKSTPEPTLPSAV
       :: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LKPLAQEHGPRSALGGAREVPDAPPAACPEVSQARLLSPAREERGLSGKSTPEPTLPSAV
          1090      1100      1110      1120      1130      1140   

             1060      1070      1080      1090      1100      1110
pF1KA0 ATEASLDSCPESSVGAVSSLDRGCPDAPAPTSAPTSQQPEPVLGLGSVEQPHEVPSVLGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ATEASLDSCPESSVGAVSSLDRGCPDAPAPTSAPTSQQPEPVLGLGSVEQPHEVPSVLGT
          1150      1160      1170      1180      1190      1200   

             1120      1130      1140      1150      1160      1170
pF1KA0 PLLQPPENLAKGQPSTPVDRPLGPDPSAPGTLAGAALPPLEPPAPCLCQDPQEDSVEDEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PLLQPPENLAKGQPSTPVDRPLGPDPSAPGTLAGAALPPLEPPAPCLCQDPQEDSVEDEE
          1210      1220      1230      1240      1250      1260   

             1180      1190      1200      1210      1220      1230
pF1KA0 PPGSLGLPPPQAGVQPAAAAVSGTTQPLGTGPRVSLSPHSPLLSPKVASMDAKDLALQIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PPGSLGLPPPQAGVQPAAAAVSGTTQPLGTGPRVSLSPHSPLLSPKVASMDAKDLALQIL
          1270      1280      1290      1300      1310      1320   

             1240      1250      1260      1270      1280      1290
pF1KA0 PPCQVPPPSGPQSPAGPQGLSAPEQQEDEDSLEEDSPRALGSGQHSDSHGESSAELDEQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PPCQVPPPSGPQSPAGPQGLSAPEQQEDEDSLEEDSPRALGSGQHSDSHGESSAELDEQD
          1330      1340      1350      1360      1370      1380   

             1300      1310      1320      1330      1340      1350
pF1KA0 ILAPQTVQCPAQAPAGGSEETIAKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQIQGVTRITIQKSKNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ILAPQTVQCPAQAPAGGSEETIAKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQIQGVTRITIQKSKNI
          1390      1400      1410      1420      1430      1440   

             1360      1370      1380      1390      1400      1410
pF1KA0 LFVIAKPDVFKSPASDTYVVFGEAKIEDLSQQVHKAAAEKFKVPSEPSALVPESAPRPRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LFVIAKPDVFKSPASDTYVVFGEAKIEDLSQQVHKAAAEKFKVPSEPSALVPESAPRPRV
          1450      1460      1470      1480      1490      1500   

             1420      1430      1440      1450      1460         
pF1KA0 RLECKEEEEEEEEEVDEAGLELRDIELVMAQANVSRAKAVRALRDNHSDIVNAIMELTM
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RLECKEEEEEEEEEVDEAGLELRDIELVMAQANVSRAKAVRALRDNHSDIVNAIMELTM
          1510      1520      1530      1540      1550      1560  

>>CCDS44925.2 NACA gene_id:4666|Hs108|chr12               (925 aa)
 initn: 604 init1: 546 opt: 936  Z-score: 439.4  bits: 93.3 E(32554): 3.7e-18
Smith-Waterman score: 1037; 31.2% identity (52.0% similar) in 1116 aa overlap (385-1469:4-925)

          360       370       380       390       400       410    
pF1KA0 APQTSDRGAYLSQRQELISEVTEEGLALGQESTATVTPHTLQVAPGLQVEVATRVTPQAG
                                     :.: :: : : :  :  :.:.:  : :...
CCDS44                            MPGEATETV-PATEQELPQPQAETA--VLPMSS
                                           10        20          30

          420       430       440       450       460       470    
pF1KA0 EEETDSTAGQESAAMAMPQPSQEGISEILGQESVTAEKLPTPQEETSLTLCPDSPQNLKE
          . .. :: . ..  : : . . ..   . .  :  .:.:.  .:  :    ::.   
CCDS44 ALSVTAALGQPGPTL--PPPCSPAPQQCPLSAANQASPFPSPSTIASTPLEVPFPQS---
               40          50        60        70        80        

          480       490       500       510          520       530 
pF1KA0 EGGLDLPSGRKPVAAATIVPRQAKEDLTLPQDSAMTPPL--P-LQDTDLSSAPKPVAAAT
        .:  :: :  :  : :..:      .. :   :.. :.  : :. :  :::  :.: ..
CCDS44 SSGTALPLGTAP-EAPTFLPNLIGPPIS-PAALALASPMIAPTLKGTPSSSA--PLALVA
          90        100       110        120       130         140 

             540       550            560       570       580      
pF1KA0 IVSQQAEEGLTLPQDSVMTPP-LPLQDT----ELSSAPKPVAAATLVSQQAEEGLTLPQD
       .. ...... ..: . . .:: . . ..     ::.   :    : ...   : .  :. 
CCDS44 LAPHSVQKSSAFPPNLLTSPPSVAVAESGSVITLSAPIAPSEPKTNLNKVPSEVVPNPKG
             150       160       170       180       190       200 

        590       600       610       620        630       640     
pF1KA0 SAMTPPLPLQDTDLSSAPKPVAAATLVSQQAEEGLTLPQDS-AMTPPLPLQDTDLSSAPK
       .  .::  .. .    .  :.:  .. :  :    : :  . :.. :  ..:: .::.  
CCDS44 TP-SPPCIVSTVPYHCVT-PMA--SIQSGVASLPQTTPTTTLAIASP-QVKDTTISSV--
              210        220         230       240        250      

         650       660       670       680       690       700     
pF1KA0 PVAAATLVSQQAEEGLTLPQDSAMTPPLPLQDTDLSSAPKPVAAATIVSQQAEEGLTLPQ
             :.: :   .:.:   . ..::  :.   ::.   ::    ..:.:   : . : 
CCDS44 ------LISPQNPGSLSL--KGPVSPPAALS---LSTQSLPV----VTSSQKTAGPNTPP
                260         270          280           290         

            710       720              730          740       750  
pF1KA0 D---SAMTPPLPLQDTDLSSA-------PKPVAAATIVS---QQAEEGLTLPQDSAMTPP
       :   :  .   ::......:.       :. ..  :. .   ...  : . :.. .. ::
CCDS44 DFPISLGSHLAPLHQSSFGSVQLLGQTGPSALSDPTVKTISVDHSSTGASYPSQRSVIPP
     300       310       320       330       340       350         

            760       770       780       790       800        810 
pF1KA0 LPLQDTDLSSAPKPVAAATPVSQQAEEGLTLPQDSAMTPPLPLQDTDLSSAPK-PVAAAT
       :: ..     .:  :::   :. ....:             :   .... .:.  . .::
CCDS44 LPSRNE---VVPATVAAFPVVAPSVDKG-------------PSTISSITCSPSGSLNVAT
     360          370       380                    390       400   

             820       830       840         850       860         
pF1KA0 PVSQQAEEGLTLPQDSAMTAPLPLQDTGPTS--GPEPLAVATPQTLQAEAGCAPGTEPVA
         : .   .: : ..   :   ::    :.:  :  ::.:..:        :. .. :..
CCDS44 SFSLSPTTSLILKSSPNATYHYPLVAQMPVSSVGTTPLVVTNP--------CTIAAAPTT
           410       420       430       440               450     

     870       880       890       900       910        920        
pF1KA0 TMAQQEVGEALGPRPAPEEKNAALPTVPEPAALDQVQQDDP-QPAAEAGTPWAAQEDADS
       :.   ::.  ..:                : .   ... .: .::: . .: : .:   :
CCDS44 TF---EVATCVSP----------------PMSSGPISNIEPTSPAALVMAPVAPKE--PS
            460                       470       480       490      

      930       940       950       960       970       980        
pF1KA0 TLGMEALSLPEPASGAGEEIAEALSRPGREACLEARAHTGDGAKPDSPQKETLEVENQQE
       :    .: .:         ..  :  :     : . . .     :   ::.   :  . :
CCDS44 TQVATTLRIP---------VSPPLPDPEDLKNLPSSVLV---KFP--TQKDLQTVPASLE
          500                510       520            530       540

      990      1000       1010      1020      1030      1040       
pF1KA0 GGLKLLAQEHGPRS-ALGGAREVPDAPPAACPEVSQARLLSPAREERGLSGKSTPE-PTL
       :.         : : : .:     :  :.. : :. :   ::. .    : .:.:: :  
CCDS44 GA---------PFSPAQAGLTTKKD--PTVLPLVQAAPKNSPSFQ----STSSSPEIPLS
                       550         560       570           580     

       1050      1060      1070      1080      1090      1100      
pF1KA0 PSAVATEASLDSCPESSVGAVSSLDRGCPDAPAPTSAPTSQQPEPVLGLGSVEQPHEVPS
       : :. .. ::   :   :.:   :. . : . :::.: ..   : ::             
CCDS44 PEATLAKKSLGE-PLPIVAAFP-LESADPAGVAPTTAKAAAF-EKVL-------------
         590        600        610       620                       

       1110      1120      1130      1140      1150         1160   
pF1KA0 VLGTPLLQPPENLAKGQPSTPVDRPLGPDPSAPGTLAGAALPPLE---PPAPCLCQDPQE
           :  .:    ... :: ::. ::.:.: .:      .::: .   : .: :  .   
CCDS44 ----P--KPESASVSAAPSPPVSLPLAPSP-VP------TLPPKQQFLPSSPGLVLESPS
         630         640       650              660       670      

          1170      1180      1190      1200      1210      1220   
pF1KA0 DSVEDEEPPGSLGLPPPQAGVQPAAAAVSGTTQPLGTGPRVSLSPHSPLLSPKVASMDAK
         .   .    : : ::.    : ...:          :  :.  . :  .:: :..   
CCDS44 KPLAPADEDELLPLIPPE----PISGGV----------PFQSVLVNMP--TPKSAGI---
        680       690           700                 710            

          1230      1240      1250      1260      1270      1280   
pF1KA0 DLALQILPPCQVPPPSGPQSPAGPQGLSAPEQQEDEDSLEEDSPRALGSGQHSDSHGESS
              :   :: ::. :          :  ....           ::: .:::  :: 
CCDS44 -------P---VPTPSAKQ----------PVTKNNK-----------GSGTESDSD-ESV
                 720                 730                  740      

          1290      1300      1310      1320      1330      1340   
pF1KA0 AELDEQDILAPQTVQCPAQAPAGGSEETIAKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQIQGVTRIT
        ::.:::     : :    : :  .:: ..::::::::::::::::::::::. ::::.:
CCDS44 PELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVT
         750       760       770       780       790       800     

          1350      1360      1370      1380      1390      1400   
pF1KA0 IQKSKNILFVIAKPDVFKSPASDTYVVFGEAKIEDLSQQVHKAAAEKFKVPSEPSALVPE
       :.:::::::::.::::.::::::::.:::::::::::::.. :::::::: .:  . . :
CCDS44 IRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAAEKFKVQGEAVSNIQE
         810       820       830       840       850       860     

          1410      1420      1430      1440      1450      1460   
pF1KA0 SAPRPRVRLECKEEEEEEEEEVDEAGLELRDIELVMAQANVSRAKAVRALRDNHSDIVNA
       ..  : :      .:: :::::::.:.:..::::::.:::::::::::::..: .:::::
CCDS44 NTQTPTV------QEESEEEEVDETGVEVKDIELVMSQANVSRAKAVRALKNNSNDIVNA
         870             880       890       900       910         

             
pF1KA0 IMELTM
       ::::::
CCDS44 IMELTM
     920     

>>CCDS31837.1 NACA gene_id:4666|Hs108|chr12               (215 aa)
 initn: 587 init1: 546 opt: 790  Z-score: 383.1  bits: 80.7 E(32554): 5.1e-15
Smith-Waterman score: 790; 66.3% identity (80.3% similar) in 208 aa overlap (1263-1469:15-215)

           1240      1250      1260       1270      1280      1290 
pF1KA0 CQVPPPSGPQSPAGPQGLSAPEQQEDEDSLEEDSPRA-LGSGQHSDSHGESSAELDEQDI
                                     :  .:.:  ::: .:::  ::  ::.::: 
CCDS31                 MPGEATETVPATEQELPQPQAETGSGTESDSD-ESVPELEEQDS
                               10        20        30         40   

            1300      1310      1320      1330      1340      1350 
pF1KA0 LAPQTVQCPAQAPAGGSEETIAKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQIQGVTRITIQKSKNIL
           : :    : :  .:: ..::::::::::::::::::::::. ::::.::.::::::
CCDS31 TQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNIL
            50        60        70        80        90       100   

            1360      1370      1380      1390      1400      1410 
pF1KA0 FVIAKPDVFKSPASDTYVVFGEAKIEDLSQQVHKAAAEKFKVPSEPSALVPESAPRPRVR
       :::.::::.::::::::.:::::::::::::.. :::::::: .:  . . :..  : : 
CCDS31 FVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAAEKFKVQGEAVSNIQENTQTPTV-
           110       120       130       140       150       160   

            1420      1430      1440      1450      1460         
pF1KA0 LECKEEEEEEEEEVDEAGLELRDIELVMAQANVSRAKAVRALRDNHSDIVNAIMELTM
            .:: :::::::.:.:..::::::.:::::::::::::..: .:::::::::::
CCDS31 -----QEESEEEEVDETGVEVKDIELVMSQANVSRAKAVRALKNNSNDIVNAIMELTM
                 170       180       190       200       210     

>>CCDS11630.1 NACA2 gene_id:342538|Hs108|chr17            (215 aa)
 initn: 764 init1: 489 opt: 722  Z-score: 352.7  bits: 75.1 E(32554): 2.5e-13
Smith-Waterman score: 722; 58.4% identity (76.3% similar) in 219 aa overlap (1254-1469:4-215)

          1230      1240      1250      1260         1270      1280
pF1KA0 DLALQILPPCQVPPPSGPQSPAGPQGLSAPEQQEDEDSLEEDSPRA---LGSGQHSDSHG
                                     :  :   . :.. :..    :::  ::: :
CCDS11                            MPGEATETVPATEQELPQSQAETGSGTASDS-G
                                          10        20        30   

             1290      1300      1310      1320      1330      1340
pF1KA0 ESSAELDEQDILAPQTVQCPAQAPAGGSEETIAKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQIQGVT
       ::   ..:::     : .    : :  .:: ..:::::::::.:::::::::: :. :::
CCDS11 ESVPGIEEQDSTQTTTQKAWLVAAAEIDEEPVGKAKQSRSEKRARKAMSKLGLLQVTGVT
             40        50        60        70        80        90  

             1350      1360      1370      1380      1390      1400
pF1KA0 RITIQKSKNILFVIAKPDVFKSPASDTYVVFGEAKIEDLSQQVHKAAAEKFKVPSEPSAL
       :.:: :::::::::.: ::.::::::.:.:::::::.:::::.. ::::::.: .:  . 
CCDS11 RVTIWKSKNILFVITKLDVYKSPASDAYIVFGEAKIQDLSQQAQLAAAEKFRVQGEAVGN
            100       110       120       130       140       150  

             1410      1420      1430      1440      1450      1460
pF1KA0 VPESAPRPRVRLECKEEEEEEEEEVDEAGLELRDIELVMAQANVSRAKAVRALRDNHSDI
       . :..  : :      .:: :::::::.:.:..:..:::.:::::::::::::..: .::
CCDS11 IQENTQTPTV------QEESEEEEVDETGVEVKDVKLVMSQANVSRAKAVRALKNNSNDI
            160             170       180       190       200      

                
pF1KA0 VNAIMELTM
       ::::::::.
CCDS11 VNAIMELTV
        210     




1469 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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 start: Wed Nov  2 18:43:58 2016 done: Wed Nov  2 18:43:59 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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