Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA0284
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0284, 1519 aa
1>>>pF1KA0284 1519 - 1519 aa - 1519 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.6004+/-0.00104; mu= -3.1154+/- 0.063
mean_var=370.1754+/-75.423, 0's: 0 Z-trim(115.2): 37 B-trim: 169 in 1/55
Lambda= 0.066661
statistics sampled from 15769 (15799) to 15769 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.759), E-opt: 0.2 (0.485), width: 16
Scan time: 7.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45176.2 CEP170B gene_id:283638|Hs108|chr14 (1519) 10255 1001.4 0
CCDS45175.1 CEP170B gene_id:283638|Hs108|chr14 (1554) 8046 788.9 0
CCDS44337.1 CEP170 gene_id:9859|Hs108|chr1 (1486) 960 107.5 3.3e-22
CCDS44339.1 CEP170 gene_id:9859|Hs108|chr1 (1584) 960 107.5 3.5e-22
>>CCDS45176.2 CEP170B gene_id:283638|Hs108|chr14 (1519 aa)
initn: 10255 init1: 10255 opt: 10255 Z-score: 5343.1 bits: 1001.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10255; 100.0% identity (100.0% similar) in 1519 aa overlap (1-1519:1-1519)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MRIPDQKYVTLKLNDVIRFGYDSNMYVLERVQHRVPEEALKHEKYTSQLQVSVKGLAPKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MRIPDQKYVTLKLNDVIRFGYDSNMYVLERVQHRVPEEALKHEKYTSQLQVSVKGLAPKR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 SEALPEHTPYCEASNPRPEKGDRRPGTEAASYRTPLYGQPSWWGEDDGSTLPDAQRQGEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SEALPEHTPYCEASNPRPEKGDRRPGTEAASYRTPLYGQPSWWGEDDGSTLPDAQRQGEP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 YPERPKGPVQQDGELHGFRAPAEPQGCSFRREPSYFEIPTKETPQPSQPPEVPAHEMPTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YPERPKGPVQQDGELHGFRAPAEPQGCSFRREPSYFEIPTKETPQPSQPPEVPAHEMPTK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 DAEAGGGGAAPVVQSHASFTIEFDDCSPGKMKIKDHITKFSLRQRRPPGKEATPGEMVSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DAEAGGGGAAPVVQSHASFTIEFDDCSPGKMKIKDHITKFSLRQRRPPGKEATPGEMVSA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 ETKVADWLVQNDPSLLHRVGPGDDRHSTKSDLPVHTRTLKGHKHEDGTQSDSEDPLAKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ETKVADWLVQNDPSLLHRVGPGDDRHSTKSDLPVHTRTLKGHKHEDGTQSDSEDPLAKAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 SAAGVPLEASGEQVRLQRQIKRDPQELLHNQQAFVIEFFDEDTPRKKRSQSFTHSPSGDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SAAGVPLEASGEQVRLQRQIKRDPQELLHNQQAFVIEFFDEDTPRKKRSQSFTHSPSGDP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 KADKRRGPTPADRDRPSVPAPVQAGGRSSGPQRAGSLKREKTEERLGSPSPASRTPARPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KADKRRGPTPADRDRPSVPAPVQAGGRSSGPQRAGSLKREKTEERLGSPSPASRTPARPF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 GSVGRRSRLAQDFMAQCLRESSPAARPSPEKVPPVLPAPLTPHGTSPVGPPTPPPAPTDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GSVGRRSRLAQDFMAQCLRESSPAARPSPEKVPPVLPAPLTPHGTSPVGPPTPPPAPTDP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 QLTKARKQEEDDSLSDAGTYTIETEAQDTEVEEARKMIDQVFGVLESPELSRASSATFRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QLTKARKQEEDDSLSDAGTYTIETEAQDTEVEEARKMIDQVFGVLESPELSRASSATFRP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 VIRGDRDESDDGGVAQRMALLQEFASRPLGAAPQAEHQGLPVPGSPGGQKWVSRWASLAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VIRGDRDESDDGGVAQRMALLQEFASRPLGAAPQAEHQGLPVPGSPGGQKWVSRWASLAD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 SYSDPGLTEDGLGRRGGEPEGSLPVRMRRRLPQLPSERADSPAGPESSRRSGPGPPELDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SYSDPGLTEDGLGRRGGEPEGSLPVRMRRRLPQLPSERADSPAGPESSRRSGPGPPELDS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 EQPSRLFGQEELDPDSLSDASGSDGGRGPEPGVEPQDSRRRSPQEGPTWSRGRRSPRAPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EQPSRLFGQEELDPDSLSDASGSDGGRGPEPGVEPQDSRRRSPQEGPTWSRGRRSPRAPG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 EPTPASFFIGDQNGDAVLSRKPLAAPGDGEGLGQTAQPSPPARDGVYVSANGRMVIQLRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EPTPASFFIGDQNGDAVLSRKPLAAPGDGEGLGQTAQPSPPARDGVYVSANGRMVIQLRP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 GRSPEPDGPAPAFLRQESFTKEPASGPPAPGKPPHISSHPLLQDLAATRAARMDFHSQDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GRSPEPDGPAPAFLRQESFTKEPASGPPAPGKPPHISSHPLLQDLAATRAARMDFHSQDT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 HLILKETETALAALEARLLSNSVDAECEGGSTPRPPEDALSGDSDVDTASTVSLRSGKSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HLILKETETALAALEARLLSNSVDAECEGGSTPRPPEDALSGDSDVDTASTVSLRSGKSG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 PSPTTPQPLRAQKEMSPSPPAAQDPGGTALVSAREQSSERQHHPLGPTDMGRGEPVRRSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PSPTTPQPLRAQKEMSPSPPAAQDPGGTALVSAREQSSERQHHPLGPTDMGRGEPVRRSA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 IRRGHRPRGSLDWPSEERGPVLAHLPSSDVMASNHETPEATGAGRLGSRRKPAAPPPSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IRRGHRPRGSLDWPSEERGPVLAHLPSSDVMASNHETPEATGAGRLGSRRKPAAPPPSPA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 AREEQSRSSASSQKGPQALTRSNSLSTPRPTRASRLRRARLGDASDTEAADGERGSLGNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AREEQSRSSASSQKGPQALTRSNSLSTPRPTRASRLRRARLGDASDTEAADGERGSLGNP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 EPVGRPAAEQAKKLSRLDILAMPRKRAGSFTGTSDPEAAPARTSFSGRSVELCCASRKPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EPVGRPAAEQAKKLSRLDILAMPRKRAGSFTGTSDPEAAPARTSFSGRSVELCCASRKPT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 MAEARAVSRKAANTATTTGPRQPFSRARSGSARYTSNTRRRQQGSDYTSTSEEEYGSRHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MAEARAVSRKAANTATTTGPRQPFSRARSGSARYTSNTRRRQQGSDYTSTSEEEYGSRHG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 SPKHTRSHTSTATQTPRAGSSSRARSRAPGPRDTDDDEEEPDPYGFIVQTAEIAEIARLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SPKHTRSHTSTATQTPRAGSSSRARSRAPGPRDTDDDEEEPDPYGFIVQTAEIAEIARLS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 QTLVKDVAILAQEIHDVAGDGDTLGSSEPAHSASLSNMPSTPASTISAREELVQRIPEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QTLVKDVAILAQEIHDVAGDGDTLGSSEPAHSASLSNMPSTPASTISAREELVQRIPEAS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 LNFQKVPPGSLNSRDFDQNMNDSCEDALANKTRPRNREEVIFDNLMLNPVSQLSQAIREN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LNFQKVPPGSLNSRDFDQNMNDSCEDALANKTRPRNREEVIFDNLMLNPVSQLSQAIREN
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 TEHLAEKMKILFQNTGRAWEDLEARINAENEVPILKTSNKEISSILKELRRVQKQLEVIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TEHLAEKMKILFQNTGRAWEDLEARINAENEVPILKTSNKEISSILKELRRVQKQLEVIN
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 AIVDPSGSLDLLTGNRSLASSAQPGLGKGRVAAQSPPSPASAEALLPALPLRNFPQRASC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AIVDPSGSLDLLTGNRSLASSAQPGLGKGRVAAQSPPSPASAEALLPALPLRNFPQRASC
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510
pF1KA0 GPPSLPDPTFLPDAERFLI
:::::::::::::::::::
CCDS45 GPPSLPDPTFLPDAERFLI
1510
>>CCDS45175.1 CEP170B gene_id:283638|Hs108|chr14 (1554 aa)
initn: 8046 init1: 8046 opt: 8046 Z-score: 4194.9 bits: 788.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9937; 97.6% identity (97.7% similar) in 1519 aa overlap (1-1519:71-1554)
10 20 30
pF1KA0 MRIPDQKYVTLKLNDVIRFGYDSNMYVLER
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KQHAVINYDQDRDEHWVKDLGSLNGTFVNDMRIPDQKYVTLKLNDVIRFGYDSNMYVLER
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 VQHRVPEEALKHEKYTSQLQVSVKGLAPKRSEALPEHTPYCEASNPRPEKGDRRPGTEAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VQHRVPEEALKHEKYTSQLQVSVKGLAPKRSEALPEHTPYCEASNPRPEKGDRRPGTEAA
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 SYRTPLYGQPSWWGEDDGSTLPDAQRQGEPYPERPKGPVQQDGELHGFRAPAEPQGCSFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SYRTPLYGQPSWWGEDDGSTLPDAQRQGEPYPERPKGPVQQDGELHGFRAPAEPQGCSFR
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 REPSYFEIPTKETPQPSQPPEVPAHEMPTKDAEAGGGGAAPVVQSHASFTIEFDDCSPGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 REPSYFEIPTKETPQPSQPPEVPAHEMPTKDAEAGGGGAAPVVQSHASFTIEFDDCSPGK
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 MKIKDHITKFSLRQRRPPGKEATPGEMVSAETKVADWLVQNDPSLLHRVGPGDDRHSTKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MKIKDHITKFSLRQRRPPGKEATPGEMVSAETKVADWLVQNDPSLLHRVGPGDDRHSTKS
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 DLPVHTRTLKGHKHEDGTQSDSEDPLAKAASAAGVPLEASGEQVRLQRQIKRDPQELLHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DLPVHTRTLKGHKHEDGTQSDSEDPLAKAASAAGVPLEASGEQVRLQRQIKRDPQELLHN
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 QQAFVIEFFDEDTPRKKRSQSFTHSPSGDPKADKRRGPTPADRDRPSVPAPVQAGGRSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QQAFVIEFFDEDTPRKKRSQSFTHSPSGDPKADKRRGPTPADRDRPSVPAPVQAGGRSSG
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 PQRAGSLKREKTEERLGSPSPASRTPARPFGSVGRRSRLAQDFMAQCLRESSPAARPSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PQRAGSLKREKTEERLGSPSPASRTPARPFGSVGRRSRLAQDFMAQCLRESSPAARPSPE
470 480 490 500 510 520
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 KVPPVLPAPLTPHGTSPVGPPTPPPAPTDPQLTKARKQEEDDSLSDAGTYTIETEAQDTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KVPPVLPAPLTPHGTSPVGPPTPPPAPTDPQLTKARKQEEDDSLSDAGTYTIETEAQDTE
530 540 550 560 570 580
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 VEEARKMIDQVFGVLESPELSRASSATFRPVIRGDRDESDDGGVAQRMALLQEFASRPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VEEARKMIDQVFGVLESPELSRASSATFRPVIRGDRDESDDGGVAQRMALLQEFASRPLG
590 600 610 620 630 640
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 AAPQAEHQGLPVPGSPGGQKWVSRWASLADSYSDPGLTEDGLGRRGGEPEGSLPVRMRRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AAPQAEHQGLPVPGSPGGQKWVSRWASLADSYSDPGLTEDGLGRRGGEPEGSLPVRMRRR
650 660 670 680 690 700
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 LPQLPSERADSPAGPESSRRSGPGPPELDSEQPSRLFGQEELDPDSLSDASGSDGGRGPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LPQLPSERADSPAGPESSRRSGPGPPELDSEQPSRLFGQEELDPDSLSDASGSDGGRGPE
710 720 730 740 750 760
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 PGVEPQDSRRRSPQEGPTWSRGRRSPRAPGEPTPASFFIGDQNGDAVLSRKPLAAPGDGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PGVEPQDSRRRSPQEGPTWSRGRRSPRAPGEPTPASFFIGDQNGDAVLSRKPLAAPGDGE
770 780 790 800 810 820
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 GLGQTAQPSPPARDGVYVSANGRMVIQLRPGRSPEPDGPAPAFLRQESFTKEPASGPPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GLGQTAQPSPPARDGVYVSANGRMVIQLRPGRSPEPDGPAPAFLRQESFTKEPASGPPAP
830 840 850 860 870 880
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 GKPPHISSHPLLQDLAATRAARMDFHSQDTHLILKETETALAALEARLLSNSVDAECEGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GKPPHISSHPLLQDLAATRAARMDFHSQDTHLILKETETALAALEARLLSNSVDAECEGG
890 900 910 920 930 940
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 STPRPPEDALSGDSDVDTASTVSLRSGKSGPSPTTPQPLRAQKEMSPSPPAAQDPGGTAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 STPRPPEDALSGDSDVDTASTVSLRSGKSGPSPTTPQPLRAQKEMSPSPPAAQDPGGTAL
950 960 970 980 990 1000
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 VSAREQSSERQHHPLGPTDMGRGEPVRRSAIRRGHRPRGSLDWPSEERGPVLAHLPSSDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VSAREQSSERQHHPLGPTDMGRGEPVRRSAIRRGHRPRGSLDWPSEERGPVLAHLPSSDV
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 MASNHETPEATGAGRLGSRRKPAAPPPSPAAREEQSRSSASSQKGPQALTRSNSLSTPRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MASNHETPEATGAGRLGSRRKPAAPPPSPAAREEQSRSSASSQKGPQALTRSNSLSTPRP
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 TRASRLRRARLGDASDTEAADGERGSLGNPEPVGRPAAEQAKKLSRLDILAMPRKRAGSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TRASRLRRARLGDASDTEAADGERGSLGNPEPVGRPAAEQAKKLSRLDILAMPRKRAGSF
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA0 TGTSDPEAAPARTSFSGRSVELCCASRKPTMAEARAVSRKAANTATTTGPRQPFSRARSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TGTSDPEAAPARTSFSGRSVELCCASRKPTMAEARAVSRKAANTATTTGPRQPFSRARSG
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA0 SARYTSNTRRRQQGSDYTSTSEEEYGSRHGSPKHTRSHTSTATQTPRAGSSSRARSRAPG
::::::.: :::::::::::::::::
CCDS45 SARYTSTT-----------------------------------QTPRAGSSSRARSRAPG
1250 1260
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA0 PRDTDDDEEEPDPYGFIVQTAEIAEIARLSQTLVKDVAILAQEIHDVAGDGDTLGSSEPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PRDTDDDEEEPDPYGFIVQTAEIAEIARLSQTLVKDVAILAQEIHDVAGDGDTLGSSEPA
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KA0 HSASLSNMPSTPASTISAREELVQRIPEASLNFQKVPPGSLNSRDFDQNMNDSCEDALAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HSASLSNMPSTPASTISAREELVQRIPEASLNFQKVPPGSLNSRDFDQNMNDSCEDALAN
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KA0 KTRPRNREEVIFDNLMLNPVSQLSQAIRENTEHLAEKMKILFQNTGRAWEDLEARINAEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KTRPRNREEVIFDNLMLNPVSQLSQAIRENTEHLAEKMKILFQNTGRAWEDLEARINAEN
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KA0 EVPILKTSNKEISSILKELRRVQKQLEVINAIVDPSGSLDLLTGNRSLASSAQPGLGKGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EVPILKTSNKEISSILKELRRVQKQLEVINAIVDPSGSLDLLTGNRSLASSAQPGLGKGR
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1480 1490 1500 1510
pF1KA0 VAAQSPPSPASAEALLPALPLRNFPQRASCGPPSLPDPTFLPDAERFLI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VAAQSPPSPASAEALLPALPLRNFPQRASCGPPSLPDPTFLPDAERFLI
1510 1520 1530 1540 1550
>>CCDS44337.1 CEP170 gene_id:9859|Hs108|chr1 (1486 aa)
initn: 1657 init1: 356 opt: 960 Z-score: 512.2 bits: 107.5 E(32554): 3.3e-22
Smith-Waterman score: 1763; 30.7% identity (56.1% similar) in 1578 aa overlap (1-1515:71-1478)
10 20 30
pF1KA0 MRIPDQKYVTLKLNDVIRFGYDSNMYVLER
.:::.: :.::::.: .:::::.:.... .
CCDS44 KQHAVINYDASTDEHLVKDLGSLNGTFVNDVRIPEQTYITLKLEDKLRFGYDTNLFTVVQ
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80
pF1KA0 VQHRVPEEALKHEKYTSQLQVSVKGLAPKRSEALPEHTPYCEASNPRPE---------KG
. :::::::::::.: :::.: :. . :.. .. .... : :.
CCDS44 GEMRVPEEALKHEKFTIQLQLSQKSSESELSKSASAKSIDSKVADAATEVQHKTTEALKS
110 120 130 140 150 160
90 100 110 120 130
pF1KA0 DRRPGTEAASYR-TPLYGQPSWWGEDDGSTLPDAQRQGEPYPERPKGPVQQDG----ELH
... .: : :::::::::::.:. . . .:.: . .. .. : ...
CCDS44 EEKAMDISAMPRGTPLYGQPSWWGDDEVDEKRAFKTNGKPEEKNHEAGTSGCGIDAKQVE
170 180 190 200 210 220
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 GFRAPA-EPQGCSFRREPSYFEIPTKETPQPSQPPEVPAHEMPTKDAEAGGGGAAPVVQS
: : : : :::::::::::: :::: : ::.::::. .. .: .
CCDS44 EQSAAANEEVLFPFCREPSYFEIPTKEFQQPSQITESTIHEIPTKDTPSSHITGA----G
230 240 250 260 270
200 210 220 230 240
pF1KA0 HASFTIEFDDCSPGKMKIKDHITKFSLRQRRPPGKEATPGE---------MVSAETKVAD
:::::::::: .:::. :.::.:::. ::. .:...:: :.. :.::::
CCDS44 HASFTIEFDDSTPGKVTIRDHVTKFTSDQRHK-SKKSSPGTQDLLGIQTGMMAPENKVAD
280 290 300 310 320 330
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 WLVQNDPSLLHRVGPGDDRHSTKSDLPVHTRTLKGHKHEDGTQSDSEDPLAKAASAAGVP
::.::.: . .: .: :::.::. . :::.::.::::::::. ::.
CCDS44 WLAQNNPPQMLWERTEEDSKSIKSDVPVYLKRLKGNKHDDGTQSDSEN--------AGAH
340 350 360 370 380
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 LEASGEQVRLQRQIKRDPQELLHNQQAFVIEFFDEDTPRKKRSQSFTHSPSGDPKADKRR
. : ... :.....: .: . :.. . : :...:. . . : . : :
CCDS44 RRCS-KRATLEEHLRRHHSEHKKLQKVQATE--------KHQDQAVVFGV--DDNQDYNR
390 400 410 420 430
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 GPTPADRDRPSVPAPVQAGGRSSGPQRAGSLKREKTEERLGSPSPASRTPARPFGSVGRR
:. .. . . . ... . .: . . :. : .:. . ..:..
CCDS44 -PVINEKHKDLIKDWALSSAAAVMEERKPLTTSGFHHSEEGTSSSGSKRWVSQWASLAA-
440 450 460 470 480 490
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 SRLAQDFMAQCLRESSPAARPSPEKVPPVLPAPLTPHGTSPVGPPTPPPAPTDPQLTKAR
.. .: . .. :.: . .. . . ... .. : ::: . .
CCDS44 NHTRHDQEERIMEFSAPLPLENETEISESGMTVRSTGSATSLASQGERRRRTLPQLPNEE
500 510 520 530 540 550
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 KQEEDDSLSDAGTYTIETEAQDTEVEEARKMIDQVFGVLESPELSRASSATFRPVIRGDR
:. :. . . . : ::::..: .. ::. ..
CCDS44 KSLESHRAKVVTQRSEIGEKQDTELQE-KETPTQVY----------------------QK
560 570 580 590
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 DESDDGGVAQRMALLQEFASRPLGAAPQAEHQGLPVPGSPGGQKWVSRWASLADSYSDPG
:..: :.:::. .: . : . . : .: . . .: : ::
CCDS44 DKQD--------------ADRPLSKMNRAVN-GETLK-TGGDNKTLLHLGS-----SAPG
600 610 620 630
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LTEDGLGRRGGEPEGSLPVRMRRRLPQLPSERADSPAGPES-SRRSGPGPPELDSEQPSR
.. . : :: . .: : .: .. : . : .. : . :.
CCDS44 KEKSETDK-----ETSLVKQTLAKLQQ-QEQREEAQWTPTKLSSKNVSGQTDKCREET--
640 650 660 670 680
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 LFGQEELDPDSLSDASGSDGGRGPEPGVEPQDSRRRSPQEGPTWSRGRRSPRAPGEPTPA
: :: :.. : : : : : : ..:.::. .: ::
CCDS44 -FKQESQPPEKNSGHSTSKGDR-----VAQSESKRRKAEE------------ILKSQTP-
690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 SFFIGDQNGDAVLSRKPLAAPGDGEGLGQTAQPSPPARDGVYVSANGRMVIQLRPGRSPE
..:: : : :. .: .::: . :.: :
CCDS44 ------KGGDKKESSKSLVR----QGSFTIEKPSP------------NIPIELIP-----
730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 PDGPAPAFLRQESFTKEPASGPPAPGKPPHISSHPLLQDLAATRAARMDFHSQ-DTHLIL
..:. .: : . . ..: ... :. .: :. :: :::
CCDS44 ------------HINKQTSSTPSSLA----LTSASRIRE----RSESLDPDSSMDTTLIL
760 770 780 790
850 860 870 880 890
pF1KA0 KETETALAALEARLL-SNSVDAECEGGSTPRPPED-ALSGDSDVDTASTVSLRSG----K
:.::...: :::.: .:..: :: .:: .: ..: .::::::::.:: .: :
CCDS44 KDTEAVMAFLEAKLREDNKTD---EGPDTPSYNRDNSISPESDVDTASTISLVTGETERK
800 810 820 830 840 850
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 SGPSPTTPQPLRAQKEMSPSPPAAQDPGGTALVSAREQSSERQHHPLGPTDMGRGEPVRR
: . . : .. . :: ..: .. .:::. .. . ::.: :.
CCDS44 STQKRKSFTSLYKDRCSTGSP--SKDVTKSSSSGAREKMEKKTKSR--STDVGSRADGRK
860 870 880 890 900
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 SAIRRGHRPRGSLDWPSEERGPVLAHLPSSDVMASNHETPEATGAGRLGSRRKPAAPPPS
. :. . :.: .... . : ::.:.:..:: :: : .
CCDS44 FVQSSGRIRQPSVDLTDDDQTSSVPHSAISDIMSSDQETYSCKPHGRT-----PLTSADE
910 920 930 940 950 960
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 PAAREEQSRSSASSQKGP---QALTRSNSLSTPRPTRASRLRRARLGDASDTEAADGERG
. . .. . ..:. .: . ..:..: :::::.: :::::::.:::.: ::....
CCDS44 HVHSKLEGSKVTKSKTSPVVSGSSSKSTTLPRPRPTRTSLLRRARLGEASDSELADADKA
970 980 990 1000 1010 1020
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 SLGNP----EPVGRPAAEQAKKLSRLDILAMPRK-RAGSFTGTSDPEAAPARTSFSGRSV
:... ...: . . ...::.:.::.::. : ::... :: ::. .:.: :.:..
CCDS44 SVASEVSTTSSTSKPPTGR-RNISRIDLLAQPRRTRLGSLSARSDSEATISRSSASSRTA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1140 1150 1160 1170 1180
pF1KA0 ELCCASRKPTMAEARAVSRKAANTATTTGPRQPFSRARS-GSARYTSNTRRRQQGSDYTS
: : . . : ::. . . . : . . ::: . :.: :. .::.:
CCDS44 EAIIRSGARLVPSDKFSPRIRANSISRLSDSKVKSMTSAHGSA--SVNSRWRRFPTDYAS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KA0 TSEEEYGSRHGSPKHTRSHTSTATQTPRAGSSSRARSRAPGPRDTDDDEEEPDPYGFIVQ
:::.:.:: ..:::::: .:: : .: : :.. : . . . ..:. .: .
CCDS44 TSEDEFGSNRNSPKHTRLRTSPALKTTRLQSAGSAMPTSSSFKHRIKEQED-----YIRD
1150 1160 1170 1180 1190
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KA0 -TAEIAEIARLSQTLVKDVAILAQEIHDVAGDGDTLGSSEPAHSASLSNMPSTPASTISA
::. ::::.:: :.:..:.::.::::. :.. :: : :...:. .::.:.:..
CCDS44 WTAHREEIARISQ----DLALIAREINDVAGEIDSVTSSGTAPSTTVSTAATTPGSAIDT
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1310 1320 1330 1340 1350
pF1KA0 REELVQRIPEASLNFQKVPPGSLNSRDFDQNMNDSCE---------DALA-NKTRPRNRE
:::::.:. . ::::.:.:: ..:. . : . : . : :. .. : .:.
CCDS44 REELVDRVFDESLNFRKIPP-LVHSKTPEGNNGRSGDPRPQAAEPPDHLTITRRRTWSRD
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KA0 EVIFDNLMLNPVSQLSQAIRENTEHLAEKMKILFQNTGRAWEDLEARINAENEVPILKTS
::. :::.:. : :.:. ::.. .. : :..:::.. : :.:.:... ::.::::.:::
CCDS44 EVMGDNLLLSSVFQFSKKIRQSIDKTAGKIRILFKDKDRNWDDIESKLRAESEVPIVKTS
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KA0 NKEISSILKELRRVQKQLEVINAIVDPSGSLDLLTGNRSLASSAQPGLGKGRVAA----Q
. ::::::.::.::.:::..:::..::.:.:. :. : .. :. :. : . . .
CCDS44 SMEISSILQELKRVEKQLQAINAMIDPDGTLEALN-NMGFPSAMLPSPPKQKSSPVNNHH
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1480 1490 1500 1510
pF1KA0 SP-PSPA----SAEALLPAL--PLRNFPQRASCGPPSLPDPTFLPDAERFLI
:: .:. :.:: :: .: . : . :. : ::.:
CCDS44 SPGQTPTLGQPEARALHPAAVSAAAEFENAESEADFSIHFNRFNPDGEEEDVTVQE
1440 1450 1460 1470 1480
>>CCDS44339.1 CEP170 gene_id:9859|Hs108|chr1 (1584 aa)
initn: 1728 init1: 356 opt: 960 Z-score: 511.8 bits: 107.5 E(32554): 3.5e-22
Smith-Waterman score: 2058; 32.7% identity (57.6% similar) in 1652 aa overlap (1-1515:71-1576)
10 20 30
pF1KA0 MRIPDQKYVTLKLNDVIRFGYDSNMYVLER
.:::.: :.::::.: .:::::.:.... .
CCDS44 KQHAVINYDASTDEHLVKDLGSLNGTFVNDVRIPEQTYITLKLEDKLRFGYDTNLFTVVQ
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80
pF1KA0 VQHRVPEEALKHEKYTSQLQVSVKGLAPKRSEALPEHTPYCEASNPRPE---------KG
. :::::::::::.: :::.: :. . :.. .. .... : :.
CCDS44 GEMRVPEEALKHEKFTIQLQLSQKSSESELSKSASAKSIDSKVADAATEVQHKTTEALKS
110 120 130 140 150 160
90 100 110 120 130
pF1KA0 DRRPGTEAASYR-TPLYGQPSWWGEDDGSTLPDAQRQGEPYPERPKGPVQQDG----ELH
... .: : :::::::::::.:. . . .:.: . .. .. : ...
CCDS44 EEKAMDISAMPRGTPLYGQPSWWGDDEVDEKRAFKTNGKPEEKNHEAGTSGCGIDAKQVE
170 180 190 200 210 220
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 GFRAPA-EPQGCSFRREPSYFEIPTKETPQPSQPPEVPAHEMPTKDAEAGGGGAAPVVQS
: : : : :::::::::::: :::: : ::.::::. .. .: .
CCDS44 EQSAAANEEVLFPFCREPSYFEIPTKEFQQPSQITESTIHEIPTKDTPSSHITGA----G
230 240 250 260 270
200 210 220 230 240
pF1KA0 HASFTIEFDDCSPGKMKIKDHITKFSLRQRRPPGKEATPGE---------MVSAETKVAD
:::::::::: .:::. :.::.:::. ::. .:...:: :.. :.::::
CCDS44 HASFTIEFDDSTPGKVTIRDHVTKFTSDQRHK-SKKSSPGTQDLLGIQTGMMAPENKVAD
280 290 300 310 320 330
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 WLVQNDPSLLHRVGPGDDRHSTKSDLPVHTRTLKGHKHEDGTQSDSEDPLAKAASAAGVP
::.::.: . .: .: :::.::. . :::.::.::::::::. ::.
CCDS44 WLAQNNPPQMLWERTEEDSKSIKSDVPVYLKRLKGNKHDDGTQSDSEN--------AGAH
340 350 360 370 380
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 LEASGEQVRLQRQIKRDPQELLHNQQAFVIEFFDEDTPRKKRSQSFTHSPSGDPKADKRR
. : ... :.....: .: . :.. . : :...:. : : : .:
CCDS44 RRCS-KRATLEEHLRRHHSEHKKLQKVQATE--------KHQDQAVTSS------AHHRG
390 400 410 420 430
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 GPTPADRDRPSVPAPVQAGGRSSGPQRAGSLKREKTEERLGSPSPASRTPARPFGSVGRR
: .:: :.: ..:.:: :: . ::
CCDS44 GH--------GVPH--------------GKLLKQKSEE----PSVSI-----PF------
440 450
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 SRLAQDFMAQCLRES-SPAARPSPEKVPPVLPAPLTPHGTSPVGPPTPPPAPTDPQLTKA
... :: : : . ::: : . : ..:: ..
CCDS44 ------LQTALLRSSGSLGHRPSQE-----MDKMLKNQATSATS----------------
460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 RKQEEDDSLSDAGTYTIETEAQDTEVEEARKMIDQVFGVLESPELSRASSATFRPVI-RG
....::. :: :::::: : ..: :::::::.:::: .. . .: ::: .
CCDS44 -EKDNDDDQSDKGTYTIELENPNSEEVEARKMIDKVFGVDDNQDYNR-------PVINEK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 DRDESDDGGVAQRMALLQEFASRPLGAAPQAEHQGLPVPGSPGGQKWVSRWASLADS---
.: : .... :...: .:: .. . :.. .: :...:::.::::: .
CCDS44 HKDLIKDWALSSAAAVMEE--RKPLTTS--GFHHSEEGTSSSGSKRWVSQWASLAANHTR
550 560 570 580 590
610 620 630 640
pF1KA0 ---------YSDP-------GLTEDGLGRRGGEPEGSLPV---RMRRRLPQLPSERA--D
.: : ..:.:. :. :: : :: :::::.:. .
CCDS44 HDQEERIMEFSAPLPLENETEISESGMTVRSTGSATSLASQGERRRRTLPQLPNEEKSLE
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680
pF1KA0 SPAGPESSRRSGPGPP---EL-DSEQPSRLFGQEELDPD--------SLSDASGSDGGRG
: . ..:: : :: ..: :.... ... : : ... . . :: .
CCDS44 SHRAKVVTQRSEIGEKQDTELQEKETPTQVYQKDKQDADRPLSKMNRAVNGETLKTGGDN
660 670 680 690 700 710
690 700 710 720 730
pF1KA0 PE--------PGVEPQDSRRRSPQEGPTWSR-GRRSPRAPGEPTPASFFIGDQNGDAVLS
:: : ... ... : .. .. : .. ::... . .:..
CCDS44 KTLLHLGSSAPGKEKSETDKETSLVKQTLAKLQQQEQREEAQWTPTKLSSKNVSGQTDKC
720 730 740 750 760 770
740 750 760 770 780
pF1KA0 RKPLAAPGDGEGLGQTAQPSPPARDGVYVSANGRMVIQLRPGR--------SPEPDG---
:. : . : .: :: ... . ...: : : . : : : :
CCDS44 RE--------ETFKQESQ--PPEKNSGHSTSKGDRVAQSESKRRKAEEILKSQTPKGGDK
780 790 800 810 820
790 800 810 820 830
pF1KA0 --PAPAFLRQESFTKEPASGPPAPGKP----PHI----SSHPLLQDLAATRAARMDFHSQ
. ...:: ::: : :.:. : ::: :: : ..:: : :.:. .:.
CCDS44 KESSKSLVRQGSFTIEK----PSPNIPIELIPHINKQTSSTP--SSLALTSASRIRERSE
830 840 850 860 870 880
840 850 860 870 880
pF1KA0 --------DTHLILKETETALAALEARLL-SNSVDAECEGGSTPRPPED-ALSGDSDVDT
:: ::::.::...: :::.: .:..: :: .:: .: ..: .:::::
CCDS44 SLDPDSSMDTTLILKDTEAVMAFLEAKLREDNKTD---EGPDTPSYNRDNSISPESDVDT
890 900 910 920 930
890 900 910 920 930 940
pF1KA0 ASTVSLRSG----KSGPSPTTPQPLRAQKEMSPSPPAAQDPGGTALVSAREQSSERQHHP
:::.:: .: :: . . : .. . :: ..: .. .:::. .. .
CCDS44 ASTISLVTGETERKSTQKRKSFTSLYKDRCSTGSP--SKDVTKSSSSGAREKMEKKTKSR
940 950 960 970 980 990
950 960 970 980 990 1000
pF1KA0 LGPTDMGRGEPVRRSAIRRGHRPRGSLDWPSEERGPVLAHLPSSDVMASNHETPEATGAG
::.: :. . :. . :.: .... . : ::.:.:..:: :
CCDS44 --STDVGSRADGRKFVQSSGRIRQPSVDLTDDDQTSSVPHSAISDIMSSDQETYSCKPHG
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA0 RLGSRRKPAAPPPSPAAREEQSRSSASSQKGP---QALTRSNSLSTPRPTRASRLRRARL
: : . . . .. . ..:. .: . ..:..: :::::.: ::::::
CCDS44 RT-----PLTSADEHVHSKLEGSKVTKSKTSPVVSGSSSKSTTLPRPRPTRTSLLRRARL
1060 1070 1080 1090 1100
1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 GDASDTEAADGERGSLGNP----EPVGRPAAEQAKKLSRLDILAMPRK-RAGSFTGTSDP
:.:::.: ::....:... ...: . . ...::.:.::.::. : ::... ::
CCDS44 GEASDSELADADKASVASEVSTTSSTSKPPTGR-RNISRIDLLAQPRRTRLGSLSARSDS
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA0 EAAPARTSFSGRSVELCCASRKPTMAEARAVSRKAANTATTTGPRQPFSRARS-GSARYT
::. .:.: :.:..: : . . : ::. . . . : . . ::: .
CCDS44 EATISRSSASSRTAEAIIRSGARLVPSDKFSPRIRANSISRLSDSKVKSMTSAHGSA--S
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA0 SNTRRRQQGSDYTSTSEEEYGSRHGSPKHTRSHTSTATQTPRAGSSSRARSRAPGPRDTD
:.: :. .::.::::.:.:: ..:::::: .:: : .: : :.. : . . .
CCDS44 VNSRWRRFPTDYASTSEDEFGSNRNSPKHTRLRTSPALKTTRLQSAGSAMPTSSSFKHRI
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA0 DDEEEPDPYGFIVQ-TAEIAEIARLSQTLVKDVAILAQEIHDVAGDGDTLGSSEPAHSAS
..:. .: . ::. ::::.:: :.:..:.::.::::. :.. :: : :..
CCDS44 KEQED-----YIRDWTAHREEIARISQ----DLALIAREINDVAGEIDSVTSSGTAPSTT
1290 1300 1310 1320 1330
1300 1310 1320 1330 1340
pF1KA0 LSNMPSTPASTISAREELVQRIPEASLNFQKVPPGSLNSRDFDQNMNDSCE---------
.:. .::.:.:..:::::.:. . ::::.:.:: ..:. . : . : .
CCDS44 VSTAATTPGSAIDTREELVDRVFDESLNFRKIPP-LVHSKTPEGNNGRSGDPRPQAAEPP
1340 1350 1360 1370 1380 1390
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KA0 DALA-NKTRPRNREEVIFDNLMLNPVSQLSQAIRENTEHLAEKMKILFQNTGRAWEDLEA
: :. .. : .:.::. :::.:. : :.:. ::.. .. : :..:::.. : :.:.:.
CCDS44 DHLTITRRRTWSRDEVMGDNLLLSSVFQFSKKIRQSIDKTAGKIRILFKDKDRNWDDIES
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KA0 RINAENEVPILKTSNKEISSILKELRRVQKQLEVINAIVDPSGSLDLLTGNRSLASSAQP
.. ::.::::.:::. ::::::.::.::.:::..:::..::.:.:. :. : .. :. :
CCDS44 KLRAESEVPIVKTSSMEISSILQELKRVEKQLQAINAMIDPDGTLEALN-NMGFPSAMLP
1460 1470 1480 1490 1500 1510
1470 1480 1490 1500 1510
pF1KA0 GLGKGRVAA----QSP-PSPA----SAEALLPAL--PLRNFPQRASCGPPSLPDPTFLPD
. : . . .:: .:. :.:: :: .: . : . :. : ::
CCDS44 SPPKQKSSPVNNHHSPGQTPTLGQPEARALHPAAVSAAAEFENAESEADFSIHFNRFNPD
1520 1530 1540 1550 1560 1570
pF1KA0 AERFLI
.:
CCDS44 GEEEDVTVQE
1580
1519 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 18:28:42 2016 done: Wed Nov 2 18:28:43 2016
Total Scan time: 7.380 Total Display time: 0.430
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]