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# NO CUT ENZYMES ( 204 enzymes) #
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AatII Acc65I AccI AccII AccIII
AciI AclI AcyI AfaI AflII
AflIII AgeI AhdI Alw44I AlwI
AlwNI AocI Aor51HI ApaI ApaLI
AscI AseI AsnI Asp718I AspEI
AspI AvaI AviII AvrII BalI
BamHI BanI BbeI BbrPI BbsI
BbvCI BclI BcnI BfrI BglI
BglII BlnI BlpI Bpu1102I BpuAI
BsaAI BsaBI BsaHI BsaI BsaWI
BseAI BseRI BsgI BsiEI BsiWI
BsmAI BsmBI BsmFI BsmI BsoBI
Bsp1407I BspDI BspEI BspHI BspLU11I
BspMI BsrBI BsrDI BsrFI BsrGI
BssHII BssKI BssSI Bst1107I BstAPI
BstBI BstEII BstF5I BstNI BstPI
BstUI BstXI BstYI BstZ17I Bsu36I
Cac8I CelII CfoI Cfr10I ClaI
CpoI DraI DraII DraIII DrdI
EaeI EagI Eam1105I EarI EclXI
Eco47III Eco52I Eco81I EcoNI EcoO109I
EcoO65I EcoRII EcoRV EcoT22I FauI
FbaI FokI FseI FspI HaeII
HaeIII HapII HhaI Hin1I HinP1I
HincII HindII HpaI HpaII HphI
KasI KpnI Ksp632I KspI MaeII
MaeIII MamI MflI MluI MluNI
MroI MscI MslI MspA1I MspI
MvaI MvnI NaeI NarI NciI
NcoI NdeI NgoMIV NheI NotI
NruI NsiI NspI NspV PacI
PaeR7I PflFI PflMI PinAI PleI
PmaCI PmeI PmlI PpuMI PshAI
PshBI Psp1406I PstI PvuI PvuII
RcaI RsaI RsrII SacII SalI
SapI SbfI ScaI ScrFI SexAI
SfaNI SfcI SfiI SfoI SfuI
SgrAI SmaI SnaBI SpeI SphI
Sse8387I SspBI SspI StuI SwaI
Tsp45I Tth111I Van91I XbaI XcmI
XhoI XhoII XmaCI XmaI
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# ONE CUT ENZYMES ( 40 enzymes) #
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AcsI 149 GAATTC [GA]^AATT[CT]
ApoI 149 GAATTC [GA]^AATT[CT]
Asp700I 281 GAAGTTCTTC GAA[ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]TTC
AspHI 114 GAGCTC G[AT]GC[AT]^C
AvaII 231 GGACC G^G[AT]CC
BanII 114 GAGCTC G[GA]GC[CT]^C
BcgI 14 CGACATCTCTGC (10/12)CGA[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]TGC(12/10)
BciVI 248 GGATAC GTATCC(6/5)
BfaI 131 CTAG C^TAG
BmyI 114 GAGCTC G[AGT]GC[ACT]^C
BsiHKAI 114 GAGCTC G[AT]GC[AT]^C
BsiYI 55 CCAGTCCAAGG CC[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]GG
BslI 55 CCAGTCCAAGG CC[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]GG
Bsp1286I 114 GAGCTC G[AGT]GC[ACT]^C
Cfr13I 231 GGACC G^G[ACGT]CC
DdeI 117 CTCAG C^T[ACGT]AG
DpnII 145 GATC ^GATC
DsaI 165 CCGTGG C^C[GA][CT]GG
EcoRI 149 GAATTC G^AATTC
EcoT14I 60 CCAAGG C^C[AT][AT]GG
HgaI 134 GACGC GACGC(5/10)
HindIII 87 AAGCTT A^AGCTT
HinfI 321 GATTC G^A[ACGT]TC
MaeI 131 CTAG C^TAG
MboI 145 GATC ^GATC
MfeI 218 CAATTG C^AATTG
MseI 311 TTAA T^TAA
MunI 218 CAATTG C^AATTG
MwoI 24 GCTTCTCATGC GC[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]GC
NdeII 145 GATC ^GATC
NlaIII 30 CATG CATG^
NlaIV 231 GGACCC GG[ACGT]^[ACGT]CC
SacI 114 GAGCTC GAGCT^C
Sau3AI 145 GATC ^GATC
Sau96I 231 GGACC G^G[ACGT]CC
StyI 60 CCAAGG C^C[AT][AT]GG
TfiI 321 GATTC G^A[AT]TC
Tru9I 311 TTAA T^TAA
TspRI 305 CAGTG CA[GC]TG[ACGT][ACGT]^
XmnI 281 GAAGTTCTTC GAA[ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]TTC
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# TWO CUT ENZYMES ( 10 enzymes) #
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BbvI 44 GCAGC GCAGC(8/12)
33 GCTGC
BpmI 53 CTCCAG CTGGAG(16/14)
70 CTGGAG
BsaJI 60 CCAAGG C^C[ACGT][ACGT]GG
165 CCGTGG
Fnu4HI 33 GCTGC GC^[ACGT]GC
44 GCAGC
ItaI 33 GCTGC GC^[ACGT]GC
44 GCAGC
SmlI 90 CTTGAG C^T[CT][GA]AG
236 CTCAAG
TaqI 13 TCGA T^CGA
147 TCGA
TseI 33 GCTGC G^C[AT]GC
44 GCAGC
Tsp509I 150 AATT ^AATT
219 AATT
TthHB8I 13 TCGA T^CGA
147 TCGA
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# 3 OR MORE CUT ENZYMES ( 4 enzymes) #
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AluI BsrI MboII MnlI