Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9670
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9670, 3230 aa
1>>>pF1KE9670 3230 - 3230 aa - 3230 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.6704+/-0.00123; mu= -12.1574+/- 0.074
mean_var=683.0692+/-140.712, 0's: 0 Z-trim(116.5): 163 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.049073
statistics sampled from 16999 (17154) to 16999 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.767), E-opt: 0.2 (0.527), width: 16
Scan time: 10.720
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10689.2 SRCAP gene_id:10847|Hs108|chr16 (3230) 21602 1546.9 0
CCDS31929.2 EP400 gene_id:57634|Hs108|chr12 (3123) 1609 131.4 8.9e-29
CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4 (1052) 919 82.1 2.1e-14
CCDS14612.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1054) 916 81.9 2.4e-14
CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1058) 916 81.9 2.4e-14
CCDS76019.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1070) 916 81.9 2.4e-14
CCDS34978.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1572) 848 77.3 9e-13
CCDS34977.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1590) 848 77.3 9.1e-13
CCDS54218.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1613) 822 75.5 3.3e-12
CCDS54217.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1614) 822 75.5 3.3e-12
CCDS45973.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1616) 822 75.5 3.3e-12
CCDS45972.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1617) 822 75.5 3.3e-12
CCDS12253.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1647) 822 75.5 3.3e-12
>>CCDS10689.2 SRCAP gene_id:10847|Hs108|chr16 (3230 aa)
initn: 21602 init1: 21602 opt: 21602 Z-score: 8279.6 bits: 1546.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 21602; 100.0% identity (100.0% similar) in 3230 aa overlap (1-3230:1-3230)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MQSSPSPAHPQLPVLQTQMVSDGMTGSNPVSPASSSSPASSGAGGISPQHIAQDSSLDGP
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CCDS10 MQSSPSPAHPQLPVLQTQMVSDGMTGSNPVSPASSSSPASSGAGGISPQHIAQDSSLDGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 PGPPDGATVPLEGFSLSQAADLANKGPKWEKSHAEIAEQAKHEAEIETRIAELRKEGFWS
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CCDS10 PGPPDGATVPLEGFSLSQAADLANKGPKWEKSHAEIAEQAKHEAEIETRIAELRKEGFWS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LKRLPKVPEPPRPKGHWDYLCEEMQWLSADFAQERRWKRGVARKVVRMVIRHHEEQRQKE
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CCDS10 LKRLPKVPEPPRPKGHWDYLCEEMQWLSADFAQERRWKRGVARKVVRMVIRHHEEQRQKE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 ERARREEQAKLRRIASTMAKDVRQFWSNVEKVVQFKQQSRLEEKRKKALDLHLDFIVGQT
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CCDS10 ERARREEQAKLRRIASTMAKDVRQFWSNVEKVVQFKQQSRLEEKRKKALDLHLDFIVGQT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 EKYSDLLSQSLNQPLTSSKAGSSPCLGSSSAASSPPPPASRLDDEDGDFQPQEDEEEDDE
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CCDS10 EKYSDLLSQSLNQPLTSSKAGSSPCLGSSSAASSPPPPASRLDDEDGDFQPQEDEEEDDE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 ETIEVEEQQEGNDAEAQRREIELLRREGELPLEELLRSLPPQLLEGPSSPSQTPSSHDSD
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CCDS10 ETIEVEEQQEGNDAEAQRREIELLRREGELPLEELLRSLPPQLLEGPSSPSQTPSSHDSD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 TRDGPEEGAEEEPPQVLEIKPPPSAVTQRNKQPWHPDEDDEEFTANEEEAEDEEDTIAAE
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CCDS10 TRDGPEEGAEEEPPQVLEIKPPPSAVTQRNKQPWHPDEDDEEFTANEEEAEDEEDTIAAE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 EQLEGEVDHAMELSELAREGELSMEELLQQYAGAYAPGSGSSEDEDEDEVDANSSDCEPE
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CCDS10 EQLEGEVDHAMELSELAREGELSMEELLQQYAGAYAPGSGSSEDEDEDEVDANSSDCEPE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 GPVEAEEPPQEDSSSQSDSVEDRSEDEEDEHSEEEETSGSSASEESESEESEDAQSQSQA
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CCDS10 GPVEAEEPPQEDSSSQSDSVEDRSEDEEDEHSEEEETSGSSASEESESEESEDAQSQSQA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 DEEEEDDDFGVEYLLARDEEQSEADAGSGPPTPGPTTLGPKKEITDIAAAAESLQPKGYT
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CCDS10 DEEEEDDDFGVEYLLARDEEQSEADAGSGPPTPGPTTLGPKKEITDIAAAAESLQPKGYT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 LATTQVKTPIPLLLRGQLREYQHIGLDWLVTMYEKKLNGILADEMGLGKTIQTISLLAHL
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CCDS10 LATTQVKTPIPLLLRGQLREYQHIGLDWLVTMYEKKLNGILADEMGLGKTIQTISLLAHL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 ACEKGNWGPHLIIVPTSVMLNWEMELKRWCPSFKILTYYGAQKERKLKRQGWTKPNAFHV
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CCDS10 ACEKGNWGPHLIIVPTSVMLNWEMELKRWCPSFKILTYYGAQKERKLKRQGWTKPNAFHV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 CITSYKLVLQDHQAFRRKNWRYLILDEAQNIKNFKSQRWQSLLNFNSQRRLLLTGTPLQN
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CCDS10 CITSYKLVLQDHQAFRRKNWRYLILDEAQNIKNFKSQRWQSLLNFNSQRRLLLTGTPLQN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 SLMELWSLMHFLMPHVFQSHREFKEWFSNPLTGMIEGSQEYNEGLVKRLHKVLRPFLLRR
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CCDS10 SLMELWSLMHFLMPHVFQSHREFKEWFSNPLTGMIEGSQEYNEGLVKRLHKVLRPFLLRR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 VKVDVEKQMPKKYEHVIRCRLSKRQRCLYDDFMAQTTTKETLATGHFMSVINILMQLRKV
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CCDS10 VKVDVEKQMPKKYEHVIRCRLSKRQRCLYDDFMAQTTTKETLATGHFMSVINILMQLRKV
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE9 CNHPNLFDPRPVTSPFITPGICFSTASLVLRATDVHPLQRIDMGRFDLIGLEGRVSRYEA
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CCDS10 CNHPNLFDPRPVTSPFITPGICFSTASLVLRATDVHPLQRIDMGRFDLIGLEGRVSRYEA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE9 DTFLPRHRLSRRVLLEVATAPDPPPRPKPVKMKVNRMLQPVPKQEGRTVVVVNNPRAPLG
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CCDS10 DTFLPRHRLSRRVLLEVATAPDPPPRPKPVKMKVNRMLQPVPKQEGRTVVVVNNPRAPLG
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE9 PVPVRPPPGPELSAQPTPGPVPQVLPASLMVSASPAGPPLIPASRPPGPVLLPPLQPNSG
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CCDS10 PVPVRPPPGPELSAQPTPGPVPQVLPASLMVSASPAGPPLIPASRPPGPVLLPPLQPNSG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE9 SLPQVLPSPLGVLSGTSRPPTPTLSLKPTPPAPVRLSPAPPPGSSSLLKPLTVPPGYTFP
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CCDS10 SLPQVLPSPLGVLSGTSRPPTPTLSLKPTPPAPVRLSPAPPPGSSSLLKPLTVPPGYTFP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE9 PAAATTTSTTTATATTTAVPAPTPAPQRLILSPDMQARLPSGEVVSIGQLASLAQRPVAN
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CCDS10 PAAATTTSTTTATATTTAVPAPTPAPQRLILSPDMQARLPSGEVVSIGQLASLAQRPVAN
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE9 AGGSKPLTFQIQGNKLTLTGAQVRQLAVGQPRPLQRNVVHLVSAGGQHHLISQPAHVALI
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CCDS10 AGGSKPLTFQIQGNKLTLTGAQVRQLAVGQPRPLQRNVVHLVSAGGQHHLISQPAHVALI
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE9 QAVAPTPGPTPVSVLPSSTPSTTPAPTGLSLPLAANQVPPTMVNNTGVVKIVVRQAPRDG
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CCDS10 QAVAPTPGPTPVSVLPSSTPSTTPAPTGLSLPLAANQVPPTMVNNTGVVKIVVRQAPRDG
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE9 LTPVPPLAPAPRPPSSGLPAVLNPRPTLTPGRLPTPTLGTARAPMPTPTLVRPLLKLVHS
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CCDS10 LTPVPPLAPAPRPPSSGLPAVLNPRPTLTPGRLPTPTLGTARAPMPTPTLVRPLLKLVHS
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE9 PSPEVSASAPGAAPLTISSPLHVPSSLPGPASSPMPIPNSSPLASPVSSTVSVPLSSSLP
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CCDS10 PSPEVSASAPGAAPLTISSPLHVPSSLPGPASSPMPIPNSSPLASPVSSTVSVPLSSSLP
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE9 ISVPTTLPAPASAPLTIPISAPLTVSASGPALLTSVTPPLAPVVPAAPGPPSLAPSGASP
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CCDS10 ISVPTTLPAPASAPLTIPISAPLTVSASGPALLTSVTPPLAPVVPAAPGPPSLAPSGASP
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE9 SASALTLGLATAPSLSSSQTPGHPLLLAPTSSHVPGLNSTVAPACSPVLVPASALASPFP
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CCDS10 SASALTLGLATAPSLSSSQTPGHPLLLAPTSSHVPGLNSTVAPACSPVLVPASALASPFP
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE9 SAPNPAPAQASLLAPASSASQALATPLAPMAAPQTAILAPSPAPPLAPLPVLAPSPGAAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SAPNPAPAQASLLAPASSASQALATPLAPMAAPQTAILAPSPAPPLAPLPVLAPSPGAAP
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE9 VLASSQTPVPVMAPSSTPGTSLASASPVPAPTPVLAPSSTQTMLPAPVPSPLPSPASTQT
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CCDS10 VLASSQTPVPVMAPSSTPGTSLASASPVPAPTPVLAPSSTQTMLPAPVPSPLPSPASTQT
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE9 LALAPALAPTLGGSSPSQTLSLGTGNPQGPFPTQTLSLTPASSLVPTPAQTLSLAPGPPL
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CCDS10 LALAPALAPTLGGSSPSQTLSLGTGNPQGPFPTQTLSLTPASSLVPTPAQTLSLAPGPPL
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE9 GPTQTLSLAPAPPLAPASPVGPAPAHTLTLAPASSSASLLAPASVQTLTLSPAPVPTLGP
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CCDS10 GPTQTLSLAPAPPLAPASPVGPAPAHTLTLAPASSSASLLAPASVQTLTLSPAPVPTLGP
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE9 AAAQTLALAPASTQSPASQASSLVVSASGAAPLPVTMVSRLPVSKDEPDTLTLRSGPPSP
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CCDS10 AAAQTLALAPASTQSPASQASSLVVSASGAAPLPVTMVSRLPVSKDEPDTLTLRSGPPSP
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE9 PSTATSFGGPRPRRQPPPPPRSPFYLDSLEEKRKRQRSERLERIFQLSEAHGALAPVYGT
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CCDS10 PSTATSFGGPRPRRQPPPPPRSPFYLDSLEEKRKRQRSERLERIFQLSEAHGALAPVYGT
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE9 EVLDFCTLPQPVASPIGPRSPGPSHPTFWTYTEAAHRAVLFPQQRLDQLSEIIERFIFVM
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CCDS10 EVLDFCTLPQPVASPIGPRSPGPSHPTFWTYTEAAHRAVLFPQQRLDQLSEIIERFIFVM
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KE9 PPVEAPPPSLHACHPPPWLAPRQAAFQEQLASELWPRARPLHRIVCNMRTQFPDLRLIQY
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CCDS10 PPVEAPPPSLHACHPPPWLAPRQAAFQEQLASELWPRARPLHRIVCNMRTQFPDLRLIQY
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KE9 DCGKLQTLAVLLRQLKAEGHRVLIFTQMTRMLDVLEQFLTYHGHLYLRLDGSTRVEQRQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DCGKLQTLAVLLRQLKAEGHRVLIFTQMTRMLDVLEQFLTYHGHLYLRLDGSTRVEQRQA
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KE9 LMERFNADKRIFCFILSTRSGGVGVNLTGADTVVFYDSDWNPTMDAQAQDRCHRIGQTRD
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CCDS10 LMERFNADKRIFCFILSTRSGGVGVNLTGADTVVFYDSDWNPTMDAQAQDRCHRIGQTRD
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KE9 VHIYRLISERTVEENILKKANQKRMLGDMAIEGGNFTTAYFKQQTIRELFDMPLEEPSSS
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CCDS10 VHIYRLISERTVEENILKKANQKRMLGDMAIEGGNFTTAYFKQQTIRELFDMPLEEPSSS
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KE9 SVPSAPEEEEETVASKQTHILEQALCRAEDEEDIRAATQAKAEQVAELAEFNENDGFPAG
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CCDS10 SVPSAPEEEEETVASKQTHILEQALCRAEDEEDIRAATQAKAEQVAELAEFNENDGFPAG
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KE9 EGEEAGRPGAEDEEMSRAEQEIAALVEQLTPIERYAMKFLEASLEEVSREELKQAEEQVE
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CCDS10 EGEEAGRPGAEDEEMSRAEQEIAALVEQLTPIERYAMKFLEASLEEVSREELKQAEEQVE
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KE9 AARKDLDQAKEEVFRLPQEEEEGPGAGDESSCGTGGGTHRRSKKAKAPERPGTRVSERLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AARKDLDQAKEEVFRLPQEEEEGPGAGDESSCGTGGGTHRRSKKAKAPERPGTRVSERLR
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KE9 GARAETQGANHTPVISAHQTRSTTTPPRCSPARERVPRPAPRPRPTPASAPAAIPALVPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GARAETQGANHTPVISAHQTRSTTTPPRCSPARERVPRPAPRPRPTPASAPAAIPALVPV
2410 2420 2430 2440 2450 2460
2470 2480 2490 2500 2510 2520
pF1KE9 PVSAPVPISAPNPITILPVHILPSPPPPSQIPPCSSPACTPPPACTPPPAHTPPPAQTCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PVSAPVPISAPNPITILPVHILPSPPPPSQIPPCSSPACTPPPACTPPPAHTPPPAQTCL
2470 2480 2490 2500 2510 2520
2530 2540 2550 2560 2570 2580
pF1KE9 VTPSSPLLLGPPSVPISASVTNLPLGLRPEAELCAQALASPESLELASVASSETSSLSLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VTPSSPLLLGPPSVPISASVTNLPLGLRPEAELCAQALASPESLELASVASSETSSLSLV
2530 2540 2550 2560 2570 2580
2590 2600 2610 2620 2630 2640
pF1KE9 PPKDLLPVAVEILPVSEKNLSLTPSAPSLTLEAGSIPNGQEQEAPDSAEGTTLTVLPEGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PPKDLLPVAVEILPVSEKNLSLTPSAPSLTLEAGSIPNGQEQEAPDSAEGTTLTVLPEGE
2590 2600 2610 2620 2630 2640
2650 2660 2670 2680 2690 2700
pF1KE9 ELPLCVSESNGLELPPSAASDEPLQEPLEADRTSEELTEAKTPTSSPEKPQELVTAEVAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ELPLCVSESNGLELPPSAASDEPLQEPLEADRTSEELTEAKTPTSSPEKPQELVTAEVAA
2650 2660 2670 2680 2690 2700
2710 2720 2730 2740 2750 2760
pF1KE9 PSTSSSATSSPEGPSPARPPRRRTSADVEIRGQGTGRPGQPPGPKVLRKLPGRLVTVVEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PSTSSSATSSPEGPSPARPPRRRTSADVEIRGQGTGRPGQPPGPKVLRKLPGRLVTVVEE
2710 2720 2730 2740 2750 2760
2770 2780 2790 2800 2810 2820
pF1KE9 KELVRRRRQQRGAASTLVPGVSETSASPGSPSVRSMSGPESSPPIGGPCEAAPSSSLPTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KELVRRRRQQRGAASTLVPGVSETSASPGSPSVRSMSGPESSPPIGGPCEAAPSSSLPTP
2770 2780 2790 2800 2810 2820
2830 2840 2850 2860 2870 2880
pF1KE9 PQQPFIARRHIELGVTGGGSPENGDGALLAITPPAVKRRRGRPPKKNRSPADAGRGVDEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PQQPFIARRHIELGVTGGGSPENGDGALLAITPPAVKRRRGRPPKKNRSPADAGRGVDEA
2830 2840 2850 2860 2870 2880
2890 2900 2910 2920 2930 2940
pF1KE9 PSSTLKGKTNGADPVPGPETLIVADPVLEPQLIPGPQPLGPQPVHRPNPLLSPVEKRRRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PSSTLKGKTNGADPVPGPETLIVADPVLEPQLIPGPQPLGPQPVHRPNPLLSPVEKRRRG
2890 2900 2910 2920 2930 2940
2950 2960 2970 2980 2990 3000
pF1KE9 RPPKARDLPIPGTISSAGDGNSESRTQPPPHPSPLTPLPPLLVCPTATVANTVTTVTIST
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.. . : :. :.:.:..:.::.. ::: . .::.:: : :: : ::
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..::..::... : .. ..: .:.... :.. :.::.:::.. :... : ..
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: : ::.: : .. . .:: : ::: . ..: . : ......:
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.. .: .. . .. . ..:: :.. :.:: :. .:....
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CCDS31 EKKALADQQKAQQ---PAVAQPP--------PPQPQPPPPPQQPPPPLPQPQAAGS----
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CCDS31 RSLVPQVSQATGVQLPGKTITPAHFQLLRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQTT
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CCDS31 TTSQVQVPQIQGQAQSPAQIKAVGKLTPEHLIKMQKQKLQMPPQ-PPPPQAQSAPPQPTA
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CCDS31 QVQVQTS------QPPQQQSPQLTTVTAPRPGALLTGTTVANLQVA--RLTRVPTSQLQA
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CCDS31 --QGQMQTQAPQPAQVALAKPPVVSVPAAVVSS---PGVTTLPMNVAGISVAIGQPQKAA
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: : ..:
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:: :: : : :.. ..: ... .
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:. : .. ...:.. ..: :: .::. .: . .: : .
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:::: . : .. .. :: .: . : : : .. .... . : .
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:.::::::... .. :::...:: :.. :: :.::: :... . : ...:
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. :. . ::.:::.........:.. :::::..:::. ::: ::. . . .:..
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:::::::::::.: :::::..::.: ::.: .: ::. :. :.:. ::.::
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: :::::::::.:.::::..: : : : ::: :: : .: . .. . :
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..:::::::: :::: ::: :. :
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..... . . .. . .::.: . . . . .::. .. :.:: . : .
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. :::...:: :.. :: :.::: ::.... . : . : . :. . ::.::
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:..:......:.. .::::..:::. ::: ::. . . .:.: :::::::::::.: :
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::.:..::.: ::.: .: ::. : :.:. ::.::: ::.::::::.:.:
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:::..: : : : ::: :: : .. . ..: ..:.. : ..:::::::: :
CCDS14 VEKSLPPKKEIKIYLGLSKMQREWYTKILMKDI--DVLNSSGKMDKMRLLNILMQLRKCC
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::: ::: :. :
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..... . . .. . .::.: . . . . .::. .. :.:: . : .
CCDS76 KKKEKNVSSFQLKLAAKAPKSEKEMDPEYEEKMKADRAKR-----FEFLLKQTELFAHFI
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. :::...:: :.. :: :.::: ::.... . : . : . :. . ::.::
CCDS76 NIPGPHMVLVPKSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAFIRDEMMPGEWDVCVTS
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:..:......:.. .::::..:::. ::: ::. . . .:.: :::::::::::.: :
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::.:..::.: ::.: .: ::. : :.:. ::.::: ::.::::::.:.:
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CCDS76 KKKEKNVSSFQLKLAAKAPKSEKEMDPEYEEKMKADRAKR-----FEFLLKQTELFAHFI
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CCDS76 RFEVSPSYVKGGPLRDYQIRGLNWLISLYENGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYLKHYR
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pF1KE9 GNWGPHLIIVPTSVMLNWEMELKRWCPSFKILTYYGAQKERKLKRQGWTKPNAFHVCITS
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CCDS76 NIPGPHMVLVPKSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAFIRDEMMPGEWDVCVTS
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CCDS76 YEMVIKEKSVFKKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHE
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CCDS34 Q--LRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTHYVAP
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CCDS34 RRILLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGERVDLNEEETILI
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pF1KE9 VKRLHKVLRPFLLRRVKVDVEKQMPKKYEHVIRCRLSKRQRCLYDDFMAQT------TTK
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CCDS34 IRRLHKVLRPFLLRRLKKEVESQLPEKVEYVIKCDMSALQKILYRHMQAKGILLTDGSEK
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pF1KE9 ETLATGHFMSVINILMQLRKVCNHPNLFDPRPVTSPFITPGICFSTASLVLRATDVHPLQ
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CCDS34 DKKGKGGAKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFAEHLGYSNGVINGAELYRASGKFEL
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CCDS34 TDEYVANLTNLVWEHKQAQAAKEKKKRRRRKKKAEENAEGGESALGPDGEPIDESSQ--M
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CCDS34 SDLPVKVTHTETGKVLFGPEAPKASQLDAWLEMNPGYEVAPRSDSEESDSDYEEEDEEEE
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pF1KE9 SQADEEEEDDDFGVEYLL-ARDEEQSEADAGSGPPTPGPTTLGPKKEITD---IAAAAES
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CCDS34 SSRQETEE------KILLDPNSEEVSEKDAKQIIETA-------KQDVDDEYSMQYSARG
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CCDS34 SQSY-YTVAHAISERVEKQSALLINGTLKHYQLQGLEWMVSLYNNNLNGILADEMGLGKT
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CCDS34 IQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIVPLSTLSNWTYEFDKWAPSVVKISYKGTPAMRRSLVP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]